Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6168
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6168, 603 aa
1>>>pF1KB6168 603 - 603 aa - 603 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9397+/-0.00116; mu= 7.5829+/- 0.068
mean_var=220.2914+/-48.380, 0's: 0 Z-trim(110.3): 702 B-trim: 350 in 1/51
Lambda= 0.086412
statistics sampled from 10704 (11529) to 10704 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.697), E-opt: 0.2 (0.354), width: 16
Scan time: 3.240
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10616.1 PLK1 gene_id:5347|Hs108|chr16 ( 603) 4020 514.7 1.4e-145
CCDS515.1 PLK3 gene_id:1263|Hs108|chr1 ( 646) 1146 156.4 1e-37
CCDS75250.1 PLK2 gene_id:10769|Hs108|chr5 ( 671) 1131 154.6 3.9e-37
CCDS3974.1 PLK2 gene_id:10769|Hs108|chr5 ( 685) 1125 153.8 6.6e-37
CCDS3735.1 PLK4 gene_id:10733|Hs108|chr4 ( 970) 687 99.4 2.3e-20
CCDS54804.1 PLK4 gene_id:10733|Hs108|chr4 ( 929) 639 93.4 1.4e-18
CCDS54803.1 PLK4 gene_id:10733|Hs108|chr4 ( 938) 594 87.8 7e-17
CCDS13451.1 AURKA gene_id:6790|Hs108|chr20 ( 403) 558 82.9 8.8e-16
CCDS13610.1 HUNK gene_id:30811|Hs108|chr21 ( 714) 543 81.3 4.7e-15
CCDS31892.1 NUAK1 gene_id:9891|Hs108|chr12 ( 661) 534 80.1 9.8e-15
CCDS55947.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 713) 519 78.3 3.8e-14
CCDS41993.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 729) 519 78.3 3.8e-14
CCDS45166.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 744) 519 78.3 3.9e-14
CCDS45165.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 753) 519 78.3 3.9e-14
CCDS60974.1 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1261) 517 78.3 6.6e-14
CCDS73034.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 780) 513 77.6 6.7e-14
CCDS31029.2 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 795) 513 77.6 6.8e-14
CCDS73033.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 796) 513 77.6 6.8e-14
CCDS8379.2 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1321) 517 78.3 6.8e-14
CCDS53651.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 709) 511 77.3 7.5e-14
CCDS53650.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 719) 511 77.3 7.6e-14
CCDS8051.2 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 724) 511 77.3 7.6e-14
CCDS41665.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 745) 511 77.3 7.7e-14
CCDS53649.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 788) 511 77.3 8.1e-14
CCDS1453.2 NUAK2 gene_id:81788|Hs108|chr1 ( 672) 506 76.7 1.1e-13
CCDS11134.1 AURKB gene_id:9212|Hs108|chr17 ( 344) 500 75.6 1.2e-13
CCDS58514.1 AURKB gene_id:9212|Hs108|chr17 ( 303) 498 75.3 1.3e-13
CCDS12658.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 ( 688) 504 76.4 1.3e-13
CCDS56097.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 ( 752) 504 76.5 1.4e-13
CCDS67162.1 AURKB gene_id:9212|Hs108|chr17 ( 345) 494 74.9 2e-13
CCDS14197.1 RPS6KA3 gene_id:6197|Hs108|chrX ( 740) 499 75.8 2.2e-13
CCDS59123.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 610) 497 75.5 2.3e-13
CCDS6606.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 651) 497 75.5 2.4e-13
CCDS58411.1 PDPK1 gene_id:5170|Hs108|chr16 ( 454) 494 75.0 2.4e-13
CCDS9994.1 AKT1 gene_id:207|Hs108|chr14 ( 480) 493 74.9 2.7e-13
CCDS10472.1 PDPK1 gene_id:5170|Hs108|chr16 ( 556) 494 75.1 2.8e-13
CCDS3943.1 NIM1K gene_id:167359|Hs108|chr5 ( 436) 492 74.7 2.8e-13
CCDS12552.1 AKT2 gene_id:208|Hs108|chr19 ( 481) 491 74.6 3.2e-13
CCDS3932.2 PRKAA1 gene_id:5562|Hs108|chr5 ( 559) 491 74.7 3.6e-13
CCDS33128.1 AURKC gene_id:6795|Hs108|chr19 ( 309) 485 73.7 4e-13
CCDS75150.1 PRKG2 gene_id:5593|Hs108|chr4 ( 342) 485 73.7 4.3e-13
CCDS44399.1 PRKG1 gene_id:5592|Hs108|chr10 ( 671) 490 74.7 4.4e-13
CCDS7244.1 PRKG1 gene_id:5592|Hs108|chr10 ( 686) 490 74.7 4.5e-13
CCDS81350.1 PKN2 gene_id:5586|Hs108|chr1 ( 936) 492 75.1 4.7e-13
CCDS714.1 PKN2 gene_id:5586|Hs108|chr1 ( 984) 492 75.1 4.8e-13
CCDS81286.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 719) 487 74.3 6e-13
CCDS284.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 735) 487 74.3 6.1e-13
CCDS30649.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 744) 487 74.3 6.2e-13
CCDS62271.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 451) 482 73.5 6.7e-13
CCDS62273.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 472) 482 73.5 6.9e-13
>>CCDS10616.1 PLK1 gene_id:5347|Hs108|chr16 (603 aa)
initn: 4020 init1: 4020 opt: 4020 Z-score: 2727.2 bits: 514.7 E(32554): 1.4e-145
Smith-Waterman score: 4020; 100.0% identity (100.0% similar) in 603 aa overlap (1-603:1-603)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSAAVTAGKLARAPADPGKAGVPGVAAPGAPAAAPPAKEIPEVLVDPRSRRRYVRGRFLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MSAAVTAGKLARAPADPGKAGVPGVAAPGAPAAAPPAKEIPEVLVDPRSRRRYVRGRFLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 KGGFAKCFEISDADTKEVFAGKIVPKSLLLKPHQREKMSMEISIHRSLAHQHVVGFHGFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KGGFAKCFEISDADTKEVFAGKIVPKSLLLKPHQREKMSMEISIHRSLAHQHVVGFHGFF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 EDNDFVFVVLELCRRRSLLELHKRRKALTEPEARYYLRQIVLGCQYLHRNRVIHRDLKLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EDNDFVFVVLELCRRRSLLELHKRRKALTEPEARYYLRQIVLGCQYLHRNRVIHRDLKLG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 NLFLNEDLEVKIGDFGLATKVEYDGERKKTLCGTPNYIAPEVLSKKGHSFEVDVWSIGCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NLFLNEDLEVKIGDFGLATKVEYDGERKKTLCGTPNYIAPEVLSKKGHSFEVDVWSIGCI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 MYTLLVGKPPFETSCLKETYLRIKKNEYSIPKHINPVAASLIQKMLQTDPTARPTINELL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MYTLLVGKPPFETSCLKETYLRIKKNEYSIPKHINPVAASLIQKMLQTDPTARPTINELL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 NDEFFTSGYIPARLPITCLTIPPRFSIAPSSLDPSNRKPLTVLNKGLENPLPERPREKEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NDEFFTSGYIPARLPITCLTIPPRFSIAPSSLDPSNRKPLTVLNKGLENPLPERPREKEE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 PVVRETGEVVDCHLSDMLQQLHSVNASKPSERGLVRQEEAEDPACIPIFWVSKWVDYSDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PVVRETGEVVDCHLSDMLQQLHSVNASKPSERGLVRQEEAEDPACIPIFWVSKWVDYSDK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 YGLGYQLCDNSVGVLFNDSTRLILYNDGDSLQYIERDGTESYLTVSSHPNSLMKKITLLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YGLGYQLCDNSVGVLFNDSTRLILYNDGDSLQYIERDGTESYLTVSSHPNSLMKKITLLK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 YFRNYMSEHLLKAGANITPREGDELARLPYLRTWFRTRSAIILHLSNGSVQINFFQDHTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YFRNYMSEHLLKAGANITPREGDELARLPYLRTWFRTRSAIILHLSNGSVQINFFQDHTK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 LILCPLMAAVTYIDEKRDFRTYRLSLLEEYGCCKELASRLRYARTMVDKLLSSRSASNRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LILCPLMAAVTYIDEKRDFRTYRLSLLEEYGCCKELASRLRYARTMVDKLLSSRSASNRL
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 KAS
:::
CCDS10 KAS
>>CCDS515.1 PLK3 gene_id:1263|Hs108|chr1 (646 aa)
initn: 1380 init1: 1100 opt: 1146 Z-score: 790.5 bits: 156.4 E(32554): 1e-37
Smith-Waterman score: 1526; 40.7% identity (65.7% similar) in 632 aa overlap (9-589:15-643)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSAAVTAGKLARAPADPGKAGVPGVAAPGAPA---AAPPAKEIPEVLVDPRSRR
. : ::: :. : : : : :. :... ....:::: :
CCDS51 MEPAAGFLSPRPFQRAAAAPAPPAGPGPPPSALRGPELEMLAGLPTSDPGRLITDPRSGR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 RYVRGRFLGKGGFAKCFEISDADTKEVFAGKIVPKSLLLKPHQREKMSMEISIHRSLAHQ
:..::.:::::::.:.: .:..: ..: :..:.: . :::::::. :: .::.: :.
CCDS51 TYLKGRLLGKGGFARCYEATDTETGSAYAVKVIPQSRVAKPHQREKILNEIELHRDLQHR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 HVVGFHGFFEDNDFVFVVLELCRRRSLLELHKRRKALTEPEARYYLRQIVLGCQYLHRNR
:.: : ::: : ... :::: :.:: .. : :..: :::.:::::::. : .:::.
CCDS51 HIVRFSHHFEDADNIYIFLELCSRKSLAHIWKARHTLLEPEVRYYLRQILSGLKYLHQRG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 VIHRDLKLGNLFLNEDLEVKIGDFGLATKVEYDGERKKTLCGTPNYIAPEVLSKKGHSFE
..::::::::.:..:..:.:.::::::...: .::::.::::::.::::: ..::. :
CCDS51 ILHRDLKLGNFFITENMELKVGDFGLAARLEPPEQRKKTICGTPNYVAPEVLLRQGHGPE
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 VDVWSIGCIMYTLLVGKPPFETSCLKETYLRIKKNEYSIPKHINPVAASLIQKMLQTDPT
.::::.::.::::: :.:::::. ::::: ::. .:..: .. : .:. .:...:
CCDS51 ADVWSLGCVMYTLLCGSPPFETADLKETYRCIKQVHYTLPASLSLPARQLLAAILRASPR
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340
pF1KB6 ARPTINELLNDEFFTSGYIPARLPIT-CLTIPPRFSIAPS-SLDPSNRKPLTVLNKGLEN
::.:...: .:::.:: : ::::. :.:.: :. :: . : : .: .:
CCDS51 DRPSIDQILRHDFFTKGYTPDRLPISSCVTVPDLTPPNPARSLFAKVTKSLFGRKKKSKN
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380
pF1KB6 PLPERPR------------------EKEEPVVRETGEV--VDCHLSDMLQQLHSVNASKP
:: . . : :.. . : :. : . ....
CCDS51 HAQERDEVSGLVSGLMRTSVGHQDARPEAPAASGPAPVSLVETAPEDSSPRGTLASSGDG
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420
pF1KB6 SERGLVRQEEAEDPACI----------------------PIFWVSKWVDYSDKYGLGYQL
:.::. .:. : :. :::::::::.:.:.::::
CCDS51 FEEGLTVATVVESALCALRNCIAFMPPAEQNPAPLAQPEPLVWVSKWVDYSNKFGFGYQL
430 440 450 460 470 480
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 CDNSVGVLFNDSTRLILYNDGDSLQYIERDGTESYLTVSSHPNSLMKKITLLKYFRNYMS
. :.:::::.:.. : . ...: . . ..:.. : .:. .. .:.:: .::
CCDS51 SSRRVAVLFNDGTHMALSANRKTVHYNPTSTKHFSFSVGAVPRALQPQLGILRYFASYME
490 500 510 520 530 540
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 EHLLKAGANITPREGDELARLPYLRTWFRTRSAIILHLSNGSVQINFFQDHTKLILC---
.::.:.: .. : :. : : : .: .:... .:.:.::.::. :::::::
CCDS51 QHLMKGG-DLPSVEEVEVPAPPLLLQWVKTDQALLMLFSDGTVQVNFYGDHTKLILSGWE
550 560 570 580 590
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 PLMAAVTYIDEKRDFRTYRLSLLEEYGCCKELASRLRYA-RTMVDKLLSSRSASNRLKAS
::. ::.. ..:. :: : :.. :: .: .::::: : . :.
CCDS51 PLL--VTFVARNRSACTYLASHLRQLGCSPDLRQRLRYALRLLRDRSPA
600 610 620 630 640
>>CCDS75250.1 PLK2 gene_id:10769|Hs108|chr5 (671 aa)
initn: 1493 init1: 1081 opt: 1131 Z-score: 780.2 bits: 154.6 E(32554): 3.9e-37
Smith-Waterman score: 1469; 38.9% identity (65.9% similar) in 628 aa overlap (12-571:33-650)
10 20 30 40
pF1KB6 MSAAVTAGKLARAPADPGKAGVPGVAAPGAPAAAPPAKEIP
. : .: . . : : . : .::: :
CCDS75 LLRTITYQPAASTKMCEQALGKGCGADSKKKRPPQPPEESQP----PQSQAQVPPA--IS
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 EVLVDPRSRRRYVRGRFLGKGGFAKCFEISDADTKEVFAGKIVPKSLLLKPHQREKMSME
...::: . .:: ::. :::::::::.:..: ...:.:.::.:.: . :::::::.. :
CCDS75 RIIVDPTTGKRYCRGKVLGKGGFAKCYEMTDLTNNKVYAAKIIPHSRVAKPHQREKIDKE
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 ISIHRSLAHQHVVGFHGFFEDNDFVFVVLELCRRRSLLELHKRRKALTEPEARYYLRQIV
: .:: : :.::: :. .:::.. ....:: : :::. .. : ::.:::::.::::::::
CCDS75 IELHRILHHKHVVQFYHYFEDKENIYILLEYCSRRSMAHILKARKVLTEPEVRYYLRQIV
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 LGCQYLHRNRVIHRDLKLGNLFLNEDLEVKIGDFGLATKVEYDGERKKTLCGTPNYIAPE
: .:::.....::::::::.:.:: .:.:.::::::...: .:..:.::::::..::
CCDS75 SGLKYLHEQEILHRDLKLGNFFINEAMELKVGDFGLAARLEPLEHRRRTICGTPNYLSPE
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 VLSKKGHSFEVDVWSIGCIMYTLLVGKPPFETSCLKETYLRIKKNEYSIPKHINPVAASL
::.:.::. : :.:..::.:::.:.:.:::::. ::::: :.. .:..:. . : :
CCDS75 VLNKQGHGCESDIWALGCVMYTMLLGRPPFETTNLKETYRCIREARYTMPSSLLAPAKHL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KB6 IQKMLQTDPTARPTINELLNDEFFTSGYIPARLPITCLTIPPRFSIA-PSS---------
: .::. .: ::...... .:: .:. : :: .: : : .. :..
CCDS75 IASMLSKNPEDRPSLDDIIRHDFFLQGFTPDRLSSSCCHTVPDFHLSSPAKNFFKKAAAA
300 310 320 330 340 350
340 350 360
pF1KB6 -----------LDPSNR-----KPLTVLNKGL------ENPLPERPREKEEP----VVRE
.: :: . . : . : ..: .: :. .: :.:
CCDS75 LFGGKKDKARYIDTHNRVSKEDEDIYKLRHDLKKTSITQQPSKHRTDEELQPPTTTVARS
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400
pF1KB6 TGEVVDC--HLSDMLQQ-----LHSVNAS----KPSERGLVRQ----------EEAEDPA
.:. ...: ... : : ..: . : : : . :. .
CCDS75 GTPAVENKQQIGDAIRMIVRGTLGSCSSSSECLEDSTMGSVADTVARVLRGCLENMPEAD
420 430 440 450 460 470
410 420 430 440 450
pF1KB6 CIP-------IFWVSKWVDYSDKYGLGYQLCDNSVGVLFNDSTRLILYNDGDSLQYIERD
::: . ::.::::::.:::.:::: :..::::::..... : : ...: .
CCDS75 CIPKEQLSTSFQWVTKWVDYSNKYGFGYQLSDHTVGVLFNNGAHMSLLPDKKTVHYYAEL
480 490 500 510 520 530
460 470 480 490 500 510
pF1KB6 GTESYLTVSSHPNSLMKKITLLKYFRNYMSEHLLKAGANITPREGDELARLP--YLRTWF
: : . ... :.......:.:::: .:: :.:. .: : : : : :: :.
CCDS75 GQCSVFPATDAPEQFISQVTVLKYFSHYMEENLMDGGD--LPSVTD--IRRPRLYLLQWL
540 550 560 570 580 590
520 530 540 550 560 570
pF1KB6 RTRSAIILHLSNGSVQINFFQDHTKLILCPLMAA--VTYIDEKRDFRTYRLSLLEEYGCC
.. .:... ...:. :.::..::::.:.: .:::.: : :.::. : :
CCDS75 KSDKALMMLFNDGTFQVNFYHDHTKIIICSQNEEYLLTYINEDRISTTFRLTTLLMSGCS
600 610 620 630 640 650
580 590 600
pF1KB6 KELASRLRYARTMVDKLLSSRSASNRLKAS
CCDS75 SELKNRMEYALNMLLQRCN
660 670
>>CCDS3974.1 PLK2 gene_id:10769|Hs108|chr5 (685 aa)
initn: 1511 init1: 1099 opt: 1125 Z-score: 776.0 bits: 153.8 E(32554): 6.6e-37
Smith-Waterman score: 1463; 38.4% identity (65.3% similar) in 636 aa overlap (12-571:33-664)
10 20 30
pF1KB6 MSAAVTAGKLARAPADPGKAGVPGVAAPGAPAAAP------
. : .: . . : . .: :::
CCDS39 LLRTITYQPAASTKMCEQALGKGCGADSKKKRPPQPPEESQPPQSQAQVPPAAPHHHHHH
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 --PAKEIPEVLVDPRSRRRYVRGRFLGKGGFAKCFEISDADTKEVFAGKIVPKSLLLKPH
. :: ...::: . .:: ::. :::::::::.:..: ...:.:.::.:.: . :::
CCDS39 SHSGPEISRIIVDPTTGKRYCRGKVLGKGGFAKCYEMTDLTNNKVYAAKIIPHSRVAKPH
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 QREKMSMEISIHRSLAHQHVVGFHGFFEDNDFVFVVLELCRRRSLLELHKRRKALTEPEA
::::.. :: .:: : :.::: :. .:::.. ....:: : :::. .. : ::.:::::.
CCDS39 QREKIDKEIELHRILHHKHVVQFYHYFEDKENIYILLEYCSRRSMAHILKARKVLTEPEV
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 RYYLRQIVLGCQYLHRNRVIHRDLKLGNLFLNEDLEVKIGDFGLATKVEYDGERKKTLCG
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CCDS39 RYYLRQIVSGLKYLHEQEILHRDLKLGNFFINEAMELKVGDFGLAARLEPLEHRRRTICG
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 TPNYIAPEVLSKKGHSFEVDVWSIGCIMYTLLVGKPPFETSCLKETYLRIKKNEYSIPKH
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CCDS39 TPNYLSPEVLNKQGHGCESDIWALGCVMYTMLLGRPPFETTNLKETYRCIREARYTMPSS
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 INPVAASLIQKMLQTDPTARPTINELLNDEFFTSGYIPARLPITCLTIPPRFSIA-PSS-
. : :: .::. .: ::...... .:: .:. : :: .: : : .. :..
CCDS39 LLAPAKHLIASMLSKNPEDRPSLDDIIRHDFFLQGFTPDRLSSSCCHTVPDFHLSSPAKN
310 320 330 340 350 360
340 350 360
pF1KB6 -------------------LDPSNR-----KPLTVLNKGL------ENPLPERPREKEEP
.: :: . . : . : ..: .: :. .:
CCDS39 FFKKAAAALFGGKKDKARYIDTHNRVSKEDEDIYKLRHDLKKTSITQQPSKHRTDEELQP
370 380 390 400 410 420
370 380 390
pF1KB6 ----VVRETGEVVDC--HLSDMLQQ-----LHSVNAS----KPSERGLVRQ---------
:.: .:. ...: ... : : ..: . : : : .
CCDS39 PTTTVARSGTPAVENKQQIGDAIRMIVRGTLGSCSSSSECLEDSTMGSVADTVARVLRGC
430 440 450 460 470 480
400 410 420 430 440
pF1KB6 -EEAEDPACIP-------IFWVSKWVDYSDKYGLGYQLCDNSVGVLFNDSTRLILYNDGD
:. . ::: . ::.::::::.:::.:::: :..::::::..... : :
CCDS39 LENMPEADCIPKEQLSTSFQWVTKWVDYSNKYGFGYQLSDHTVGVLFNNGAHMSLLPDKK
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450 460 470 480 490 500
pF1KB6 SLQYIERDGTESYLTVSSHPNSLMKKITLLKYFRNYMSEHLLKAGANITPREGDELARLP
...: . : : . ... :.......:.:::: .:: :.:. .: : : : :
CCDS39 TVHYYAELGQCSVFPATDAPEQFISQVTVLKYFSHYMEENLMDGGD--LPSVTD--IRRP
550 560 570 580 590
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pF1KB6 --YLRTWFRTRSAIILHLSNGSVQINFFQDHTKLILCPLMAA--VTYIDEKRDFRTYRLS
:: :... .:... ...:. :.::..::::.:.: .:::.: : :.::.
CCDS39 RLYLLQWLKSDKALMMLFNDGTFQVNFYHDHTKIIICSQNEEYLLTYINEDRISTTFRLT
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570 580 590 600
pF1KB6 LLEEYGCCKELASRLRYARTMVDKLLSSRSASNRLKAS
: :
CCDS39 TLLMSGCSSELKNRMEYALNMLLQRCN
660 670 680
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Smith-Waterman score: 687; 37.7% identity (76.2% similar) in 252 aa overlap (56-306:15-266)
30 40 50 60 70 80
pF1KB6 AAPGAPAAAPPAKEIPEVLVDPRSRRRYVRGRFLGKGGFAKCFEISDADTKEVFAGKIVP
: .::::.:: .. . : : :..
CCDS37 MATCIGEKIEDFKVGNLLGKGSFAGVYRAESIHTGLEVAIKMID
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pF1KB6 KSLLLKPHQREKMSMEISIHRSLAHQHVVGFHGFFEDNDFVFVVLELCRRRSLLE-LHKR
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CCDS37 KKAMYKAGMVQRVQNEVKIHCQLKHPSILELYNYFEDSNYVYLVLEMCHNGEMNRYLKNR
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pF1KB6 RKALTEPEARYYLRQIVLGCQYLHRNRVIHRDLKLGNLFLNEDLEVKIGDFGLATKVEYD
: ..: :::....::. : ::: . ..:::: :.::.:......::.::::::....
CCDS37 VKPFSENEARHFMHQIITGMLYLHSHGILHRDLTLSNLLLTRNMNIKIADFGLATQLKMP
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pF1KB6 GERKKTLCGTPNYIAPEVLSKKGHSFEVDVWSIGCIMYTLLVGKPPFETSCLKETYLRIK
:.. :::::::::.::. ....:..: ::::.::..::::.:.:::.:. .:.: ..
CCDS37 HEKHYTLCGTPNYISPEIATRSAHGLESDVWSLGCMFYTLLIGRPPFDTDTVKNTLNKVV
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pF1KB6 KNEYSIPKHINPVAASLIQKMLQTDPTARPTINELLNDEFFTSGYIPARLPITCLTIPPR
.: .:. .. : .::...:. .:. : ... .:. :..
CCDS37 LADYEMPSFLSIEAKDLIHQLLRRNPADRLSLSSVLDHPFMSRNSSTKSKDLGTVEDSID
230 240 250 260 270 280
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pF1KB6 FSIAPSSLDPSNRKPLTVLNKGLENPLPERPREKEEPVVRETGEVVDCHLSDMLQQLHSV
CCDS37 SGHATISTAITASSSTSISGSLFDKRRLLIGQPLPNKMTVFPKNKSSTDFSSSGDGNSFY
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pF1KB6 YVRGRFLGKGGFAKCFEISDADTKEVFAGKIVPKSLLLKPHQREKMSMEISIHRSLAHQH
.. :. . : . .... :..:: .: :
CCDS54 MIDKKAMYKAGMVQRVQNEVKIHCQLKHPS
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.. ....:::...:..:::.:. . . :..: : ..: :::....::. : ::: .
CCDS54 ILELYNYFEDSNYVYLVLEMCHNGEMNRYLKNRVKPFSENEARHFMHQIITGMLYLHSHG
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pF1KB6 VIHRDLKLGNLFLNEDLEVKIGDFGLATKVEYDGERKKTLCGTPNYIAPEVLSKKGHSFE
..:::: :.::.:......::.::::::.... :.. :::::::::.::. ....:..:
CCDS54 ILHRDLTLSNLLLTRNMNIKIADFGLATQLKMPHEKHYTLCGTPNYISPEIATRSAHGLE
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pF1KB6 VDVWSIGCIMYTLLVGKPPFETSCLKETYLRIKKNEYSIPKHINPVAASLIQKMLQTDPT
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pF1KB6 ARPTINELLNDEFFTSGYIPARLPITCLTIPPRFSIAPSSLDPSNRKPLTVLNKGLENPL
: ... .:. :..
CCDS54 DRLSLSSVLDHPFMSRNSSTKSKDLGTVEDSIDSGHATISTAITASSSTSISGSLFDKRR
220 230 240 250 260 270
>>CCDS54803.1 PLK4 gene_id:10733|Hs108|chr4 (938 aa)
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Smith-Waterman score: 594; 40.0% identity (79.5% similar) in 205 aa overlap (103-306:31-234)
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pF1KB6 ADTKEVFAGKIVPKSLLLKPHQREKMSMEISIHRSLAHQHVVGFHGFFEDNDFVFVVLEL
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CCDS54 MATCIGEKIEDFKVGNLLGKGSFAGVYRAESIHTGL-EVAIKMLYNYFEDSNYVYLVLEM
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pF1KB6 CRRRSLLE-LHKRRKALTEPEARYYLRQIVLGCQYLHRNRVIHRDLKLGNLFLNEDLEVK
:. . . :..: : ..: :::....::. : ::: . ..:::: :.::.:......:
CCDS54 CHNGEMNRYLKNRVKPFSENEARHFMHQIITGMLYLHSHGILHRDLTLSNLLLTRNMNIK
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pF1KB6 IGDFGLATKVEYDGERKKTLCGTPNYIAPEVLSKKGHSFEVDVWSIGCIMYTLLVGKPPF
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CCDS54 IADFGLATQLKMPHEKHYTLCGTPNYISPEIATRSAHGLESDVWSLGCMFYTLLIGRPPF
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pF1KB6 ETSCLKETYLRIKKNEYSIPKHINPVAASLIQKMLQTDPTARPTINELLNDEFFTSGYIP
.:. .:.: .. .: .:. .. : .::...:. .:. : ... .:. :..
CCDS54 DTDTVKNTLNKVVLADYEMPSFLSIEAKDLIHQLLRRNPADRLSLSSVLDHPFMSRNSST
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pF1KB6 ARLPITCLTIPPRFSIAPSSLDPSNRKPLTVLNKGLENPLPERPREKEEPVVRETGEVVD
CCDS54 KSKDLGTVEDSIDSGHATISTAITASSSTSISGSLFDKRRLLIGQPLPNKMTVFPKNKSS
240 250 260 270 280 290
>>CCDS13451.1 AURKA gene_id:6790|Hs108|chr20 (403 aa)
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pF1KB6 MSAAVTAGKLARAPADPGKAGVPGVAAPGAPAAAPPAKEIPEVLVDPRSRRR-----
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CCDS13 NQKQKQLQATSVPHPVSRPLNNTQKSKQPLPSAPENNPE-EELASKQKNEESKKRQWALE
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pF1KB6 -YVRGRFLGKGGFAKCFEISDADTKEVFAGKIVPKSLLLKPHQREKMSMEISIHRSLAHQ
. :: :::: :.. . . ..: ..: :.. :. : : .... :. :. : :
CCDS13 DFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKQSKFILALKVLFKAQLEKAGVEHQLRREVEIQSHLRHP
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pF1KB6 HVVGFHGFFEDNDFVFVVLELCRRRSLL-ELHKRRKALTEPEARYYLRQIVLGCQYLHRN
... ..:.:.: :...:: .. ::.: : . : .. :. ... . .: : .
CCDS13 NILRLYGYFHDATRVYLILEYAPLGTVYRELQKLSK-FDEQRTATYITELANALSYCHSK
200 210 220 230 240 250
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pF1KB6 RVIHRDLKLGNLFLNEDLEVKIGDFGLATKVEYDGERKKTLCGTPNYIAPEVLSKKGHSF
::::::.: ::.:. :.::.::: . :. . :. ::::: .:. ::.. . :.
CCDS13 RVIHRDIKPENLLLGSAGELKIADFGWS--VHAPSSRRTTLCGTLDYLPPEMIEGRMHDE
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240 250 260 270 280 290
pF1KB6 EVDVWSIGCIMYTLLVGKPPFETSCLKETYLRIKKNEYSIPKHINPVAASLIQKMLQTDP
.::.::.: . : .::::::::.. .::: ::.. :...: .. : .::...:. .:
CCDS13 KVDLWSLGVLCYEFLVGKPPFEANTYQETYKRISRVEFTFPDFVTEGARDLISRLLKHNP
310 320 330 340 350 360
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 TARPTINELLNDEFFTSGYIPARLPITCLTIPPRFSIAPSSLDPSNRKPLTVLNKGLENP
. :: . :.:. ..:.. . : .:
CCDS13 SQRPMLREVLEHPWITAN---SSKPSNCQNKESASKQS
370 380 390 400
>>CCDS13610.1 HUNK gene_id:30811|Hs108|chr21 (714 aa)
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pF1KB6 MSAAVTAGKLARAPADPGKAGVPGVAAPGAPAAAPPAKEIPEVLVD-PRSRRR-------
: ::. : :.. :: :: .: :. . :::: .. .: . :: : :
CCDS13 MPAAAGDGLLGE-PAAPGGGG--GAEDAARPAAACEGSFLPAWVSGVPRERLRDFQHHKR
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pF1KB6 ---YVRG-RFLGKGGFAKCFEISDADTKEVFAGKIVPKSLLLKPHQREK-MSMEISIHRS
:. : : ::.:.::: : . : : : :.. :. : : . : .:..
CCDS13 VGNYLIGSRKLGEGSFAKVREGLHVLTGEKVAIKVIDKKRAKKDTYVTKNLRREGQIQQM
60 70 80 90 100 110
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pF1KB6 LAHQHVVGFHGFFEDNDFVFVVLELCRRRSLLELHKRRKALTEPEARYYLRQIVLGCQYL
. : ... . ..: .. ..:.::: .:.. ..: : : ::: :.::.. . ..:
CCDS13 IRHPNITQLLDILETENSYYLVMELCPGGNLMHKIYEKKRLEESEARRYIRQLISAVEHL
120 130 140 150 160 170
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pF1KB6 HRNRVIHRDLKLGNLFLNEDLEVKIGDFGLATKVEYDGERK--KTLCGTPNYIAPEVLSK
:: :.:::::. ::.:.:: ..:. ::::.. . : .: ::.: : :::.:..
CCDS13 HRAGVVHRDLKIENLLLDEDNNIKLIDFGLSNCAGILGYSDPFSTQCGSPAYAAPELLAR
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pF1KB6 KGHSFEVDVWSIGCIMYTLLVGKPPF--ETSCLKETYLRIKKNEYS-IPKHINPVAASLI
: .. ..:::::: ::..:.: :: : :. : .. .:.. .: ... : :..
CCDS13 KKYGPKIDVWSIGVNMYAMLTGTLPFTVEPFSLRALYQKMVDKEMNPLPTQLSTGAISFL
240 250 260 270 280 290
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pF1KB6 QKMLQTDPTARPTINELLNDEFFTSGYIPARLPITC-LTIPPRFSIAPSSLDPSNRKPLT
...:. ::. ::.:.. : ..... .: ...: : .: : :.:. .:.:: .
CCDS13 RSLLEPDPVKRPNIQQALANRWLNENYT-GKVP--CNVTYPNRISLE--DLSPS-----V
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pF1KB6 VLNKGLENPLPERPREKEEPVVRETGEVVDCHLSDMLQQLHSVNASKPSERGLVRQEEAE
::. . :. :. :. . ::. . :. : :: : . . .
CCDS13 VLH------MTEKLGYKNSDVINTVLSNRACHILAIYFLLN-----KKLERYLSGKSDIQ
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pF1KB6 DPACIP--IFWVSKWVDYSDKYGLGYQLCDNSVGVLFNDSTRLILYNDGDSLQYIERDGT
: : .. . :. ...:
CCDS13 DSLCYKTRLYQIEKYRAPKESYEASLDTWTRDLEFHAVQDKKPKEQEKRGDFLHRPFSKK
400 410 420 430 440 450
>>CCDS31892.1 NUAK1 gene_id:9891|Hs108|chr12 (661 aa)
initn: 437 init1: 386 opt: 534 Z-score: 378.0 bits: 80.1 E(32554): 9.8e-15
Smith-Waterman score: 534; 32.6% identity (62.0% similar) in 316 aa overlap (2-309:4-310)
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pF1KB6 MSAAVTAGKLARAPADPGKAGVPGVAAPGAPAAAPPAKE--IPEVLVDPRSRRRYVRG
.:: .:: : : : : :. :: :: : : . . ..::
CCDS31 MEGAAAPVAGD--RPDLGLGAPGSPREAVAGATAALEPRKPHGVKRHHHKHNLKHRYELQ
10 20 30 40 50
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pF1KB6 RFLGKGGFAKCFEISDADTKEVFAGKIVPKSLLLKPHQREKMSM-----EISIHRSLAHQ
. :::: ..: . . : :.:..: . . : . .....: :: : :: :
CCDS31 ETLGKGTYGKVKRAT-----ERFSGRVVAIKSIRKDKIKDEQDMVHIRREIEIMSSLNHP
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pF1KB6 HVVGFHGFFEDNDFVFVVLELCRRRSLLELHKRRKALTEPEARYYLRQIVLGCQYLHRNR
:..... ::..: . ...: . : . ..:. :.: :.:...:::: . .: :.:
CCDS31 HIISIYEVFENKDKIVIIMEYASKGELYDYISERRRLSERETRHFFRQIVSAVHYCHKNG
120 130 140 150 160 170
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pF1KB6 VIHRDLKLGNLFLNEDLEVKIGDFGLATKVEYDGERKKTLCGTPNYIAPEVLSKKGH-SF
:.:::::: :..:... ..::.::::.. . : . .:.::.: : .::... . . .
CCDS31 VVHRDLKLENILLDDNCNIKIADFGLSNLYQKD-KFLQTFCGSPLYASPEIVNGRPYRGP
180 190 200 210 220 230
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pF1KB6 EVDVWSIGCIMYTLLVGKPPFETSCLKETYLRIKKNEYSIPKHINPVAASLIQKMLQTDP
::: :..: ..:::. : ::. :. .:...:: : . . : .::. ::...:
CCDS31 EVDSWALGVLLYTLVYGTMPFDGFDHKNLIRQISSGEYREPTQPSD-ARGLIRWMLMVNP
240 250 260 270 280 290
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pF1KB6 TARPTINELLNDEFFTSGYIPARLPITCLTIPPRFSIAPSSLDPSNRKPLTVLNKGLENP
: ::... : . . ::
CCDS31 DRRATIEDIANHWWVNWGYKSSVCDCDALHDSESPLLARIIDWHHRSTGLQADTEAKMKG
300 310 320 330 340 350
603 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 13:39:38 2016 done: Sat Nov 5 13:39:38 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]