FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB6175, 653 aa 1>>>pF1KB6175 653 - 653 aa - 653 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.9061+/-0.000853; mu= 1.6468+/- 0.052 mean_var=273.1473+/-55.300, 0's: 0 Z-trim(116.9): 22 B-trim: 175 in 1/52 Lambda= 0.077603 statistics sampled from 17534 (17554) to 17534 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.813), E-opt: 0.2 (0.539), width: 16 Scan time: 4.230 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS10972.1 CBFA2T3 gene_id:863|Hs108|chr16 ( 653) 4514 518.4 1.2e-146 CCDS10973.1 CBFA2T3 gene_id:863|Hs108|chr16 ( 567) 3635 420.0 4.5e-117 CCDS56544.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8 ( 615) 1341 163.2 1e-39 CCDS6256.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8 ( 604) 1320 160.8 5e-39 CCDS75767.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8 ( 584) 1318 160.6 5.7e-39 CCDS47891.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8 ( 577) 1316 160.3 6.6e-39 CCDS75766.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8 ( 663) 1314 160.2 8.6e-39 CCDS6257.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8 ( 567) 1312 159.9 8.9e-39 CCDS13221.1 CBFA2T2 gene_id:9139|Hs108|chr20 ( 604) 1053 130.9 5e-30 CCDS46590.1 CBFA2T2 gene_id:9139|Hs108|chr20 ( 595) 1051 130.7 5.8e-30 >>CCDS10972.1 CBFA2T3 gene_id:863|Hs108|chr16 (653 aa) initn: 4514 init1: 4514 opt: 4514 Z-score: 2746.2 bits: 518.4 E(32554): 1.2e-146 Smith-Waterman score: 4514; 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CCDS75 RPCTISPGQRYSPNNGLSYQPNGLPHPTPPPPQHYRLDDMAIAHHYRDSYRHPSHRDLRD 250 260 270 280 290 300 370 380 390 400 410 420 pF1KB6 RHRPLVVPGSRQEEVIDHKLTEREWAEEWKHLNNLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEAD :.::. . :.::::.:::.::.::::::::::..:::::::::::::::::::::::::: CCDS75 RNRPMGLHGTRQEEMIDHRLTDREWAEEWKHLDHLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEAD 310 320 330 340 350 360 430 440 450 460 470 480 pF1KB6 REELNHWARRYSDAEDTKKGPAPAAARPRSSS-AGPEGPQLDVPREFLPRTLTGYVPEDI :::::.: :::::::: ::: . .... :..: ..:. ::. :::: : .:::::.: CCDS75 REELNYWIRRYSDAEDLKKGGGSSSSHSRQQSPVNPDPVALDAHREFLHRPASGYVPEEI 370 380 390 400 410 420 490 500 510 520 530 540 pF1KB6 WRKAEEAVNEVKRQAMSELQKAVSDAERKAHELITTERAKMERALAEAKRQASEDALTVI :.::::::::::::::.:::::::.::::::..::::::::::..:::::::.::::.:: CCDS75 WKKAEEAVNEVKRQAMTELQKAVSEAERKAHDMITTERAKMERTVAEAKRQAAEDALAVI 430 440 450 460 470 480 550 560 570 580 590 600 pF1KB6 NQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCNAARYCGSFCQHRDWEKHHHVCGQSLQGPTAVVADP :::::::::::::::::::::::::.::::::::::.:::::::.:::.:: :. 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CCDS47 ESCWNCGRKASETCSGCNTARYCGSFCQHKDWEKHHHICGQTLQ------AQQQGDTPAV 490 500 510 520 530 620 630 640 650 pF1KB6 AHSLGPSLPVGAASPSEAGSAGPSRPGSPSPPGPLDTVPR . :. :. ::.:: .. :. : .:. :. ..:.:: CCDS47 SSSVTPN--SGAGSPMDTPPAATPRSTTPGTPSTIETTPR 540 550 560 570 >>CCDS75766.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8 (663 aa) initn: 2817 init1: 1224 opt: 1314 Z-score: 809.9 bits: 160.2 E(32554): 8.6e-39 Smith-Waterman score: 2877; 70.7% identity (84.8% similar) in 610 aa overlap (54-653:89-663) 30 40 50 60 70 80 pF1KB6 QTHPVLESGLLASAGCSAPRGPRKGGPAPVDRKAKASAMPDSPAEVKTQPRSTPPSMPPP :: : :.:::::..:::: : :::.:::: CCDS75 PFVVWGEEEASTPGLDAISHHLCYPDRTHRDRTEKHSTMPDSPVDVKTQSRLTPPTMPPP 60 70 80 90 100 110 90 100 110 120 130 140 pF1KB6 PPAASQGATRPPSFTPHTHREDGPATLPHGRFHGCLKWSMVCLLMNGSSHSPTAINGAPC : ..::: : :::: : : ::.::::::.:::: CCDS75 P--TTQGAPRTSSFTPTT-------------------------LTNGTSHSPTALNGAPS 120 130 140 150 150 160 170 180 190 200 pF1KB6 TPNGFSNGPATSSTASLSTQHLPPACGARQLSKLKRFLTTLQQFGSDISPEIGERVRTLV ::::::::..::..::..:.::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::: CCDS75 PPNGFSNGPSSSSSSSLANQQLPPACGARQLSKLKRFLTTLQQFGNDISPEIGERVRTLV 160 170 180 190 200 210 210 220 230 240 250 260 pF1KB6 LGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLKANLPLLQRELLHCARLAKQTPAQYLA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::: CCDS75 LGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLKANLPLLQRELLHCARLAKQNPAQYLA 220 230 240 250 260 270 270 280 290 300 310 320 pF1KB6 QHEQLLLDASASSPIDSSELLLEVNENGKRRTPDRTKENGSDRDPLHPEHLSKRPCTLNP ::::::::::..::.:::::::.::::::::::::::::: ::.::: :: ::::::..: CCDS75 QHEQLLLDASTTSPVDSSELLLDVNENGKRRTPDRTKENGFDREPLHSEHPSKRPCTISP 280 290 300 310 320 330 330 340 350 360 370 pF1KB6 AQRYSPSNG----P---PQPTPPP--HYRLEDIAMAHHFRDAYRHPDPRELRERHRPLVV .:::::.:: : :.::::: ::::.:.:.:::.::.::::. :.::.:.::. . CCDS75 GQRYSPNNGLSYQPNGLPHPTPPPPQHYRLDDMAIAHHYRDSYRHPSHRDLRDRNRPMGL 340 350 360 370 380 390 380 390 400 410 420 430 pF1KB6 PGSRQEEVIDHKLTEREWAEEWKHLNNLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNHW :.::::.:::.::.::::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::.: CCDS75 HGTRQEEMIDHRLTDREWAEEWKHLDHLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNYW 400 410 420 430 440 450 440 450 460 470 480 490 pF1KB6 ARRYSDAEDTKKGPAPAAARPRSSS-AGPEGPQLDVPREFLPRTLTGYVPEDIWRKAEEA :::::::: ::: . .... :..: ..:. ::. :::: : .:::::.::.::::: CCDS75 IRRYSDAEDLKKGGGSSSSHSRQQSPVNPDPVALDAHREFLHRPASGYVPEEIWKKAEEA 460 470 480 490 500 510 500 510 520 530 540 550 pF1KB6 VNEVKRQAMSELQKAVSDAERKAHELITTERAKMERALAEAKRQASEDALTVINQQEDSS :::::::::.:::::::.::::::..::::::::::..:::::::.::::.::::::::: CCDS75 VNEVKRQAMTELQKAVSEAERKAHDMITTERAKMERTVAEAKRQAAEDALAVINQQEDSS 520 530 540 550 560 570 560 570 580 590 600 610 pF1KB6 ESCWNCGRKASETCSGCNAARYCGSFCQHRDWEKHHHVCGQSLQGPTAVVADPVPGPPEA ::::::::::::::::::.::::::::::.:::::::.:::.:: :. : . CCDS75 ESCWNCGRKASETCSGCNTARYCGSFCQHKDWEKHHHICGQTLQ------AQQQGDTPAV 580 590 600 610 620 620 630 640 650 pF1KB6 AHSLGPSLPVGAASPSEAGSAGPSRPGSPSPPGPLDTVPR . :. :. ::.:: .. :. : .:. :. ..:.:: CCDS75 SSSVTPN--SGAGSPMDTPPAATPRSTTPGTPSTIETTPR 630 640 650 660 >>CCDS6257.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8 (567 aa) initn: 2795 init1: 1224 opt: 1312 Z-score: 809.7 bits: 159.9 E(32554): 8.9e-39 Smith-Waterman score: 2855; 70.9% identity (85.0% similar) in 602 aa overlap (62-653:1-567) 40 50 60 70 80 90 pF1KB6 GLLASAGCSAPRGPRKGGPAPVDRKAKASAMPDSPAEVKTQPRSTPPSMPPPPPAASQGA :::::..:::: : :::.::::: ..::: CCDS62 MPDSPVDVKTQSRLTPPTMPPPP--TTQGA 10 20 100 110 120 130 140 150 pF1KB6 TRPPSFTPHTHREDGPATLPHGRFHGCLKWSMVCLLMNGSSHSPTAINGAPCTPNGFSNG : :::: : : ::.::::::.:::: ::::::: CCDS62 PRTSSFTPTT-------------------------LTNGTSHSPTALNGAPSPPNGFSNG 30 40 50 60 160 170 180 190 200 210 pF1KB6 PATSSTASLSTQHLPPACGARQLSKLKRFLTTLQQFGSDISPEIGERVRTLVLGLVNSTL :..::..::..:.::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::: CCDS62 PSSSSSSSLANQQLPPACGARQLSKLKRFLTTLQQFGNDISPEIGERVRTLVLGLVNSTL 70 80 90 100 110 120 220 230 240 250 260 270 pF1KB6 TIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLKANLPLLQRELLHCARLAKQTPAQYLAQHEQLLLD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::: CCDS62 TIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLKANLPLLQRELLHCARLAKQNPAQYLAQHEQLLLD 130 140 150 160 170 180 280 290 300 310 320 330 pF1KB6 ASASSPIDSSELLLEVNENGKRRTPDRTKENGSDRDPLHPEHLSKRPCTLNPAQRYSPSN ::..::.:::::::.::::::::::::::::: ::.::: :: ::::::..:.:::::.: CCDS62 ASTTSPVDSSELLLDVNENGKRRTPDRTKENGFDREPLHSEHPSKRPCTISPGQRYSPNN 190 200 210 220 230 240 340 350 360 370 380 pF1KB6 G----P---PQPTPPP--HYRLEDIAMAHHFRDAYRHPDPRELRERHRPLVVPGSRQEEV : : :.::::: ::::.:.:.:::.::.::::. :.::.:.::. . :.::::. CCDS62 GLSYQPNGLPHPTPPPPQHYRLDDMAIAHHYRDSYRHPSHRDLRDRNRPMGLHGTRQEEM 250 260 270 280 290 300 390 400 410 420 430 440 pF1KB6 IDHKLTEREWAEEWKHLNNLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNHWARRYSDAE :::.::.::::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::.: ::::::: CCDS62 IDHRLTDREWAEEWKHLDHLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNYWIRRYSDAE 310 320 330 340 350 360 450 460 470 480 490 500 pF1KB6 DTKKGPAPAAARPRSSS-AGPEGPQLDVPREFLPRTLTGYVPEDIWRKAEEAVNEVKRQA : ::: . .... :..: ..:. ::. :::: : .:::::.::.::::::::::::: CCDS62 DLKKGGGSSSSHSRQQSPVNPDPVALDAHREFLHRPASGYVPEEIWKKAEEAVNEVKRQA 370 380 390 400 410 420 510 520 530 540 550 560 pF1KB6 MSELQKAVSDAERKAHELITTERAKMERALAEAKRQASEDALTVINQQEDSSESCWNCGR :.:::::::.::::::..::::::::::..:::::::.::::.::::::::::::::::: CCDS62 MTELQKAVSEAERKAHDMITTERAKMERTVAEAKRQAAEDALAVINQQEDSSESCWNCGR 430 440 450 460 470 480 570 580 590 600 610 620 pF1KB6 KASETCSGCNAARYCGSFCQHRDWEKHHHVCGQSLQGPTAVVADPVPGPPEAAHSLGPSL ::::::::::.::::::::::.:::::::.:::.:: :. : .. :. :. CCDS62 KASETCSGCNTARYCGSFCQHKDWEKHHHICGQTLQ------AQQQGDTPAVSSSVTPN- 490 500 510 520 530 630 640 650 pF1KB6 PVGAASPSEAGSAGPSRPGSPSPPGPLDTVPR ::.:: .. :. : .:. :. ..:.:: CCDS62 -SGAGSPMDTPPAATPRSTTPGTPSTIETTPR 540 550 560 >>CCDS13221.1 CBFA2T2 gene_id:9139|Hs108|chr20 (604 aa) initn: 2274 init1: 999 opt: 1053 Z-score: 652.6 bits: 130.9 E(32554): 5e-30 Smith-Waterman score: 2278; 57.5% identity (77.7% similar) in 609 aa overlap (53-650:21-601) 30 40 50 60 70 80 pF1KB6 SQTHPVLESGLLASAGCSAPRGPRKGGPAPVDRKAKASAMPDSPAEVKTQPRSTPPSMPP : . .. ::: ::.::: : ::.::.::: CCDS13 MAKESGISLKEIQVLARQWKVGPEKRVPAMPGSPVEVKIQSRSSPPTMPP 10 20 30 40 50 90 100 110 120 130 140 pF1KB6 PPPAASQGATRPPSFTPHTHREDGPATLPHGRFHGCLKWSMVCLLMNGSSHSPTAINGAP :: . :. :: :::: . : :: .::: ..:::: CCDS13 LPPI-NPGGPRPVSFTPTA-------------------------LSNGINHSPPTLNGAP 60 70 80 150 160 170 180 190 200 pF1KB6 CTPNGFSNGPATSSTASLSTQHLPPACGARQLSKLKRFLTTLQQFGSDISPEIGERVRTL :. ::::::.:....:..:.:: .::::::::::::::::::::.::::::::.:::: CCDS13 SPPQRFSNGPASSTSSALTNQQLPATCGARQLSKLKRFLTTLQQFGNDISPEIGEKVRTL 90 100 110 120 130 140 210 220 230 240 250 260 pF1KB6 VLGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLKANLPLLQRELLHCARLAKQTPAQYL ::.:::::.:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::.::: CCDS13 VLALVNSTVTIEEFHCKLQEATNFPLRPFVIPFLKANLPLLQRELLHCARAAKQTPSQYL 150 160 170 180 190 200 270 280 290 300 310 320 pF1KB6 AQHEQLLLDASASSPIDSSELLLEVNENGKRRTPDRTKENGSDRDPLHPEHLSKRPCTLN ::::.:::..: .:: ::::::.::. :::: .:.: .::. ::: . :: .:: ::.. CCDS13 AQHEHLLLNTSIASPADSSELLMEVHGNGKRPSPERREENSFDRDTIAPEPPAKRVCTIS 210 220 230 240 250 260 330 340 350 360 370 pF1KB6 PAQRYSPS--------NGPPQPTPPP--HYRLEDIAMAHHFRDAYRHPDPRELRERHRPL :: :.::. .: .::::: :: ::::: .: .:. . . ::.:.::. : CCDS13 PAPRHSPALTVPLMNPGGQFHPTPPPLQHYTLEDIATSHLYREPNKMLEHREVRDRHHSL 270 280 290 300 310 320 380 390 400 410 420 430 pF1KB6 VVPGSRQEEVIDHKLTEREWAEEWKHLNNLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELN . :. :.:..::.:::::::.:::::.. :::::.::::::::..:::::::.:::::: CCDS13 GLNGGYQDELVDHRLTEREWADEWKHLDHALNCIMEMVEKTRRSMAVLRRCQESDREELN 330 340 350 360 370 380 440 450 460 470 480 490 pF1KB6 HWARRYSDAEDTKKGPAPAAARPRSSSAGPEGPQLDVPREFLPRTLTGYVPEDIWRKAEE .: :::.. . .: . ..: .: ... .. . : ::: : ::::: ..:.:.:: CCDS13 YWKRRYNENTELRKTGTELVSRQHSPGSA-DSLSNDSQREFNSRPGTGYVPVEFWKKTEE 390 400 410 420 430 440 500 510 520 530 540 550 pF1KB6 AVNEVKRQAMSELQKAVSDAERKAHELITTERAKMERALAEAKRQASEDALTVINQQEDS :::.:: :::::.::::..::.:: :.:.::::.::...:..::::.:::. :::.::.: CCDS13 AVNKVKIQAMSEVQKAVAEAEQKAFEVIATERARMEQTIADVKRQAAEDAFLVINEQEES 450 460 470 480 490 500 560 570 580 590 600 610 pF1KB6 SESCWNCGRKASETCSGCNAARYCGSFCQHRDWEKHHHVCGQSLQGPTAVVADPVPGPPE .:.:::::::::::::::: ::::::::::.:::.::..:::.:.: . .. : : CCDS13 TENCWNCGRKASETCSGCNIARYCGSFCQHKDWERHHRLCGQNLHGQSPH-GQGRPLLPV 510 520 530 540 550 560 620 630 640 650 pF1KB6 AAHSLGPSLPVGAASPS-EAGSAGPSRPGSPSPPGPLDTVPR . : . : .. ::. . :: :: ..:. .:: CCDS13 GRGSSARSADCSVPSPALDKTSATTSRSSTPASVTAIDTNGL 570 580 590 600 >>CCDS46590.1 CBFA2T2 gene_id:9139|Hs108|chr20 (595 aa) initn: 2273 init1: 999 opt: 1051 Z-score: 651.4 bits: 130.7 E(32554): 5.8e-30 Smith-Waterman score: 2277; 57.8% identity (78.0% similar) in 604 aa overlap (58-650:17-592) 30 40 50 60 70 80 pF1KB6 VLESGLLASAGCSAPRGPRKGGPAPVDRKAKASAMPDSPAEVKTQPRSTPPSMPPPPPAA .. ::: ::.::: : ::.::.::: :: CCDS46 MVGVPGAAAFQLGPEKRVPAMPGSPVEVKIQSRSSPPTMPPLPPI- 10 20 30 40 90 100 110 120 130 140 pF1KB6 SQGATRPPSFTPHTHREDGPATLPHGRFHGCLKWSMVCLLMNGSSHSPTAINGAPCTPNG . :. :: :::: . : :: .::: ..:::: :. CCDS46 NPGGPRPVSFTPTA-------------------------LSNGINHSPPTLNGAPSPPQR 50 60 70 80 150 160 170 180 190 200 pF1KB6 FSNGPATSSTASLSTQHLPPACGARQLSKLKRFLTTLQQFGSDISPEIGERVRTLVLGLV ::::::.:....:..:.:: .::::::::::::::::::::.::::::::.::::::.:: CCDS46 FSNGPASSTSSALTNQQLPATCGARQLSKLKRFLTTLQQFGNDISPEIGEKVRTLVLALV 90 100 110 120 130 140 210 220 230 240 250 260 pF1KB6 NSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLKANLPLLQRELLHCARLAKQTPAQYLAQHEQ :::.:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::.:::::::. CCDS46 NSTVTIEEFHCKLQEATNFPLRPFVIPFLKANLPLLQRELLHCARAAKQTPSQYLAQHEH 150 160 170 180 190 200 270 280 290 300 310 320 pF1KB6 LLLDASASSPIDSSELLLEVNENGKRRTPDRTKENGSDRDPLHPEHLSKRPCTLNPAQRY :::..: .:: ::::::.::. :::: .:.: .::. ::: . :: .:: ::..:: :. CCDS46 LLLNTSIASPADSSELLMEVHGNGKRPSPERREENSFDRDTIAPEPPAKRVCTISPAPRH 210 220 230 240 250 260 330 340 350 360 370 pF1KB6 SPS--------NGPPQPTPPP--HYRLEDIAMAHHFRDAYRHPDPRELRERHRPLVVPGS ::. .: .::::: :: ::::: .: .:. . . ::.:.::. : . :. 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