Result of FASTA (ccds) for pF1KB6175
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6175, 653 aa
  1>>>pF1KB6175 653 - 653 aa - 653 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.9061+/-0.000853; mu= 1.6468+/- 0.052
 mean_var=273.1473+/-55.300, 0's: 0 Z-trim(116.9): 22  B-trim: 175 in 1/52
 Lambda= 0.077603
 statistics sampled from 17534 (17554) to 17534 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.813), E-opt: 0.2 (0.539), width:  16
 Scan time:  4.230

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS10972.1 CBFA2T3 gene_id:863|Hs108|chr16        ( 653) 4514 518.4 1.2e-146
CCDS10973.1 CBFA2T3 gene_id:863|Hs108|chr16        ( 567) 3635 420.0 4.5e-117
CCDS56544.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8         ( 615) 1341 163.2   1e-39
CCDS6256.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8          ( 604) 1320 160.8   5e-39
CCDS75767.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8         ( 584) 1318 160.6 5.7e-39
CCDS47891.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8         ( 577) 1316 160.3 6.6e-39
CCDS75766.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8         ( 663) 1314 160.2 8.6e-39
CCDS6257.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8          ( 567) 1312 159.9 8.9e-39
CCDS13221.1 CBFA2T2 gene_id:9139|Hs108|chr20       ( 604) 1053 130.9   5e-30
CCDS46590.1 CBFA2T2 gene_id:9139|Hs108|chr20       ( 595) 1051 130.7 5.8e-30


>>CCDS10972.1 CBFA2T3 gene_id:863|Hs108|chr16             (653 aa)
 initn: 4514 init1: 4514 opt: 4514  Z-score: 2746.2  bits: 518.4 E(32554): 1.2e-146
Smith-Waterman score: 4514; 100.0% identity (100.0% similar) in 653 aa overlap (1-653:1-653)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MPASRLRDRAASSASGSTCGSMSQTHPVLESGLLASAGCSAPRGPRKGGPAPVDRKAKAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MPASRLRDRAASSASGSTCGSMSQTHPVLESGLLASAGCSAPRGPRKGGPAPVDRKAKAS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 AMPDSPAEVKTQPRSTPPSMPPPPPAASQGATRPPSFTPHTHREDGPATLPHGRFHGCLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AMPDSPAEVKTQPRSTPPSMPPPPPAASQGATRPPSFTPHTHREDGPATLPHGRFHGCLK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 WSMVCLLMNGSSHSPTAINGAPCTPNGFSNGPATSSTASLSTQHLPPACGARQLSKLKRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 WSMVCLLMNGSSHSPTAINGAPCTPNGFSNGPATSSTASLSTQHLPPACGARQLSKLKRF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 LTTLQQFGSDISPEIGERVRTLVLGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLKANL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LTTLQQFGSDISPEIGERVRTLVLGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLKANL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 PLLQRELLHCARLAKQTPAQYLAQHEQLLLDASASSPIDSSELLLEVNENGKRRTPDRTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PLLQRELLHCARLAKQTPAQYLAQHEQLLLDASASSPIDSSELLLEVNENGKRRTPDRTK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 ENGSDRDPLHPEHLSKRPCTLNPAQRYSPSNGPPQPTPPPHYRLEDIAMAHHFRDAYRHP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ENGSDRDPLHPEHLSKRPCTLNPAQRYSPSNGPPQPTPPPHYRLEDIAMAHHFRDAYRHP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 DPRELRERHRPLVVPGSRQEEVIDHKLTEREWAEEWKHLNNLLNCIMDMVEKTRRSLTVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DPRELRERHRPLVVPGSRQEEVIDHKLTEREWAEEWKHLNNLLNCIMDMVEKTRRSLTVL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 RRCQEADREELNHWARRYSDAEDTKKGPAPAAARPRSSSAGPEGPQLDVPREFLPRTLTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RRCQEADREELNHWARRYSDAEDTKKGPAPAAARPRSSSAGPEGPQLDVPREFLPRTLTG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB6 YVPEDIWRKAEEAVNEVKRQAMSELQKAVSDAERKAHELITTERAKMERALAEAKRQASE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YVPEDIWRKAEEAVNEVKRQAMSELQKAVSDAERKAHELITTERAKMERALAEAKRQASE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB6 DALTVINQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCNAARYCGSFCQHRDWEKHHHVCGQSLQGPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DALTVINQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCNAARYCGSFCQHRDWEKHHHVCGQSLQGPT
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650   
pF1KB6 AVVADPVPGPPEAAHSLGPSLPVGAASPSEAGSAGPSRPGSPSPPGPLDTVPR
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AVVADPVPGPPEAAHSLGPSLPVGAASPSEAGSAGPSRPGSPSPPGPLDTVPR
              610       620       630       640       650   

>>CCDS10973.1 CBFA2T3 gene_id:863|Hs108|chr16             (567 aa)
 initn: 3896 init1: 3617 opt: 3635  Z-score: 2215.2  bits: 420.0 E(32554): 4.5e-117
Smith-Waterman score: 3850; 95.8% identity (95.8% similar) in 592 aa overlap (62-653:1-567)

              40        50        60        70        80        90 
pF1KB6 GLLASAGCSAPRGPRKGGPAPVDRKAKASAMPDSPAEVKTQPRSTPPSMPPPPPAASQGA
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10                               MPDSPAEVKTQPRSTPPSMPPPPPAASQGA
                                             10        20        30

             100       110       120       130       140       150 
pF1KB6 TRPPSFTPHTHREDGPATLPHGRFHGCLKWSMVCLLMNGSSHSPTAINGAPCTPNGFSNG
       ::::::::::                         :::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TRPPSFTPHT-------------------------LMNGSSHSPTAINGAPCTPNGFSNG
               40                                 50        60     

             160       170       180       190       200       210 
pF1KB6 PATSSTASLSTQHLPPACGARQLSKLKRFLTTLQQFGSDISPEIGERVRTLVLGLVNSTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PATSSTASLSTQHLPPACGARQLSKLKRFLTTLQQFGSDISPEIGERVRTLVLGLVNSTL
          70        80        90       100       110       120     

             220       230       240       250       260       270 
pF1KB6 TIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLKANLPLLQRELLHCARLAKQTPAQYLAQHEQLLLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLKANLPLLQRELLHCARLAKQTPAQYLAQHEQLLLD
         130       140       150       160       170       180     

             280       290       300       310       320       330 
pF1KB6 ASASSPIDSSELLLEVNENGKRRTPDRTKENGSDRDPLHPEHLSKRPCTLNPAQRYSPSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ASASSPIDSSELLLEVNENGKRRTPDRTKENGSDRDPLHPEHLSKRPCTLNPAQRYSPSN
         190       200       210       220       230       240     

             340       350       360       370       380       390 
pF1KB6 GPPQPTPPPHYRLEDIAMAHHFRDAYRHPDPRELRERHRPLVVPGSRQEEVIDHKLTERE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GPPQPTPPPHYRLEDIAMAHHFRDAYRHPDPRELRERHRPLVVPGSRQEEVIDHKLTERE
         250       260       270       280       290       300     

             400       410       420       430       440       450 
pF1KB6 WAEEWKHLNNLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNHWARRYSDAEDTKKGPAPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 WAEEWKHLNNLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNHWARRYSDAEDTKKGPAPA
         310       320       330       340       350       360     

             460       470       480       490       500       510 
pF1KB6 AARPRSSSAGPEGPQLDVPREFLPRTLTGYVPEDIWRKAEEAVNEVKRQAMSELQKAVSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AARPRSSSAGPEGPQLDVPREFLPRTLTGYVPEDIWRKAEEAVNEVKRQAMSELQKAVSD
         370       380       390       400       410       420     

             520       530       540       550       560       570 
pF1KB6 AERKAHELITTERAKMERALAEAKRQASEDALTVINQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AERKAHELITTERAKMERALAEAKRQASEDALTVINQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCN
         430       440       450       460       470       480     

             580       590       600       610       620       630 
pF1KB6 AARYCGSFCQHRDWEKHHHVCGQSLQGPTAVVADPVPGPPEAAHSLGPSLPVGAASPSEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AARYCGSFCQHRDWEKHHHVCGQSLQGPTAVVADPVPGPPEAAHSLGPSLPVGAASPSEA
         490       500       510       520       530       540     

             640       650   
pF1KB6 GSAGPSRPGSPSPPGPLDTVPR
       ::::::::::::::::::::::
CCDS10 GSAGPSRPGSPSPPGPLDTVPR
         550       560       

>>CCDS56544.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8              (615 aa)
 initn: 2832 init1: 1224 opt: 1341  Z-score: 826.7  bits: 163.2 E(32554): 1e-39
Smith-Waterman score: 2901; 70.1% identity (84.2% similar) in 622 aa overlap (42-653:30-615)

              20        30        40        50        60        70 
pF1KB6 SSASGSTCGSMSQTHPVLESGLLASAGCSAPRGPRKGGPAPVDRKAKASAMPDSPAEVKT
                                     :: : . .: : ::  : :.:::::..:::
CCDS56  MCHPDKAFTSDKLQCVFNEYKAAVWVPPRPR-PLSRAPLPEDRTEKHSTMPDSPVDVKT
                10        20        30         40        50        

              80        90       100       110       120       130 
pF1KB6 QPRSTPPSMPPPPPAASQGATRPPSFTPHTHREDGPATLPHGRFHGCLKWSMVCLLMNGS
       : : :::.:::::  ..::: :  :::: :                         : ::.
CCDS56 QSRLTPPTMPPPP--TTQGAPRTSSFTPTT-------------------------LTNGT
       60        70          80                                 90 

             140       150       160       170       180       190 
pF1KB6 SHSPTAINGAPCTPNGFSNGPATSSTASLSTQHLPPACGARQLSKLKRFLTTLQQFGSDI
       ::::::.::::  ::::::::..::..::..:.::::::::::::::::::::::::.::
CCDS56 SHSPTALNGAPSPPNGFSNGPSSSSSSSLANQQLPPACGARQLSKLKRFLTTLQQFGNDI
             100       110       120       130       140       150 

             200       210       220       230       240       250 
pF1KB6 SPEIGERVRTLVLGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLKANLPLLQRELLHCA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SPEIGERVRTLVLGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLKANLPLLQRELLHCA
             160       170       180       190       200       210 

             260       270       280       290       300       310 
pF1KB6 RLAKQTPAQYLAQHEQLLLDASASSPIDSSELLLEVNENGKRRTPDRTKENGSDRDPLHP
       :::::.::::::::::::::::..::.:::::::.::::::::::::::::: ::.::: 
CCDS56 RLAKQNPAQYLAQHEQLLLDASTTSPVDSSELLLDVNENGKRRTPDRTKENGFDREPLHS
             220       230       240       250       260       270 

             320       330              340         350       360  
pF1KB6 EHLSKRPCTLNPAQRYSPSNG----P---PQPTPPP--HYRLEDIAMAHHFRDAYRHPDP
       :: ::::::..:.:::::.::    :   :.:::::  ::::.:.:.:::.::.::::. 
CCDS56 EHPSKRPCTISPGQRYSPNNGLSYQPNGLPHPTPPPPQHYRLDDMAIAHHYRDSYRHPSH
             280       290       300       310       320       330 

            370       380       390       400       410       420  
pF1KB6 RELRERHRPLVVPGSRQEEVIDHKLTEREWAEEWKHLNNLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRR
       :.::.:.::. . :.::::.:::.::.::::::::::..:::::::::::::::::::::
CCDS56 RDLRDRNRPMGLHGTRQEEMIDHRLTDREWAEEWKHLDHLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRR
             340       350       360       370       380       390 

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pF1KB6 CQEADREELNHWARRYSDAEDTKKGPAPAAARPRSSS-AGPEGPQLDVPREFLPRTLTGY
       ::::::::::.: :::::::: ::: . .... :..: ..:.   ::. :::: :  .::
CCDS56 CQEADREELNYWIRRYSDAEDLKKGGGSSSSHSRQQSPVNPDPVALDAHREFLHRPASGY
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pF1KB6 VPEDIWRKAEEAVNEVKRQAMSELQKAVSDAERKAHELITTERAKMERALAEAKRQASED
       :::.::.::::::::::::::.:::::::.::::::..::::::::::..:::::::.::
CCDS56 VPEEIWKKAEEAVNEVKRQAMTELQKAVSEAERKAHDMITTERAKMERTVAEAKRQAAED
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pF1KB6 ALTVINQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCNAARYCGSFCQHRDWEKHHHVCGQSLQGPTA
       ::.:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.:::::::.:::.::    
CCDS56 ALAVINQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCNTARYCGSFCQHKDWEKHHHICGQTLQ----
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pF1KB6 VVADPVPGPPEAAHSLGPSLPVGAASPSEAGSAGPSRPGSPSPPGPLDTVPR
         :.     : .. :. :.   ::.:: ..  :.  :  .:. :. ..:.::
CCDS56 --AQQQGDTPAVSSSVTPN--SGAGSPMDTPPAATPRSTTPGTPSTIETTPR
         570       580         590       600       610     

>>CCDS6256.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8               (604 aa)
 initn: 2817 init1: 1224 opt: 1320  Z-score: 814.1  bits: 160.8 E(32554): 5e-39
Smith-Waterman score: 2877; 70.7% identity (84.8% similar) in 610 aa overlap (54-653:30-604)

            30        40        50        60        70        80   
pF1KB6 QTHPVLESGLLASAGCSAPRGPRKGGPAPVDRKAKASAMPDSPAEVKTQPRSTPPSMPPP
                                     ::  : :.:::::..:::: : :::.::::
CCDS62  MISVKRNTWRALSLVIGDCRKKGNFEYCQDRTEKHSTMPDSPVDVKTQSRLTPPTMPPP
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pF1KB6 PPAASQGATRPPSFTPHTHREDGPATLPHGRFHGCLKWSMVCLLMNGSSHSPTAINGAPC
       :  ..::: :  :::: :                         : ::.::::::.:::: 
CCDS62 P--TTQGAPRTSSFTPTT-------------------------LTNGTSHSPTALNGAPS
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pF1KB6 TPNGFSNGPATSSTASLSTQHLPPACGARQLSKLKRFLTTLQQFGSDISPEIGERVRTLV
        ::::::::..::..::..:.::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS62 PPNGFSNGPSSSSSSSLANQQLPPACGARQLSKLKRFLTTLQQFGNDISPEIGERVRTLV
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pF1KB6 LGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLKANLPLLQRELLHCARLAKQTPAQYLA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS62 LGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLKANLPLLQRELLHCARLAKQNPAQYLA
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pF1KB6 QHEQLLLDASASSPIDSSELLLEVNENGKRRTPDRTKENGSDRDPLHPEHLSKRPCTLNP
       ::::::::::..::.:::::::.::::::::::::::::: ::.::: :: ::::::..:
CCDS62 QHEQLLLDASTTSPVDSSELLLDVNENGKRRTPDRTKENGFDREPLHSEHPSKRPCTISP
            220       230       240       250       260       270  

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pF1KB6 AQRYSPSNG----P---PQPTPPP--HYRLEDIAMAHHFRDAYRHPDPRELRERHRPLVV
       .:::::.::    :   :.:::::  ::::.:.:.:::.::.::::. :.::.:.::. .
CCDS62 GQRYSPNNGLSYQPNGLPHPTPPPPQHYRLDDMAIAHHYRDSYRHPSHRDLRDRNRPMGL
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pF1KB6 PGSRQEEVIDHKLTEREWAEEWKHLNNLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNHW
        :.::::.:::.::.::::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS62 HGTRQEEMIDHRLTDREWAEEWKHLDHLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNYW
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pF1KB6 ARRYSDAEDTKKGPAPAAARPRSSS-AGPEGPQLDVPREFLPRTLTGYVPEDIWRKAEEA
        :::::::: ::: . .... :..: ..:.   ::. :::: :  .:::::.::.:::::
CCDS62 IRRYSDAEDLKKGGGSSSSHSRQQSPVNPDPVALDAHREFLHRPASGYVPEEIWKKAEEA
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pF1KB6 VNEVKRQAMSELQKAVSDAERKAHELITTERAKMERALAEAKRQASEDALTVINQQEDSS
       :::::::::.:::::::.::::::..::::::::::..:::::::.::::.:::::::::
CCDS62 VNEVKRQAMTELQKAVSEAERKAHDMITTERAKMERTVAEAKRQAAEDALAVINQQEDSS
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pF1KB6 ESCWNCGRKASETCSGCNAARYCGSFCQHRDWEKHHHVCGQSLQGPTAVVADPVPGPPEA
       ::::::::::::::::::.::::::::::.:::::::.:::.::      :.     : .
CCDS62 ESCWNCGRKASETCSGCNTARYCGSFCQHKDWEKHHHICGQTLQ------AQQQGDTPAV
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pF1KB6 AHSLGPSLPVGAASPSEAGSAGPSRPGSPSPPGPLDTVPR
       . :. :.   ::.:: ..  :.  :  .:. :. ..:.::
CCDS62 SSSVTPN--SGAGSPMDTPPAATPRSTTPGTPSTIETTPR
        570         580       590       600    

>>CCDS75767.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8              (584 aa)
 initn: 2809 init1: 1224 opt: 1318  Z-score: 813.1  bits: 160.6 E(32554): 5.7e-39
Smith-Waterman score: 2875; 70.2% identity (84.4% similar) in 617 aa overlap (48-653:3-584)

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pF1KB6 TCGSMSQTHPVLESGLLASAGCSAPRGPRKGGPAPVD-RKAKASAMPDSPAEVKTQPRST
                                     :  .::. :  : :.:::::..:::: : :
CCDS75                             MVGLSGPVQYRTEKHSTMPDSPVDVKTQSRLT
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pF1KB6 PPSMPPPPPAASQGATRPPSFTPHTHREDGPATLPHGRFHGCLKWSMVCLLMNGSSHSPT
       ::.:::::  ..::: :  :::: :                         : ::.:::::
CCDS75 PPTMPPPP--TTQGAPRTSSFTPTT-------------------------LTNGTSHSPT
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pF1KB6 AINGAPCTPNGFSNGPATSSTASLSTQHLPPACGARQLSKLKRFLTTLQQFGSDISPEIG
       :.::::  ::::::::..::..::..:.::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS75 ALNGAPSPPNGFSNGPSSSSSSSLANQQLPPACGARQLSKLKRFLTTLQQFGNDISPEIG
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pF1KB6 ERVRTLVLGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLKANLPLLQRELLHCARLAKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ERVRTLVLGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLKANLPLLQRELLHCARLAKQ
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pF1KB6 TPAQYLAQHEQLLLDASASSPIDSSELLLEVNENGKRRTPDRTKENGSDRDPLHPEHLSK
       .::::::::::::::::..::.:::::::.::::::::::::::::: ::.::: :: ::
CCDS75 NPAQYLAQHEQLLLDASTTSPVDSSELLLDVNENGKRRTPDRTKENGFDREPLHSEHPSK
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pF1KB6 RPCTLNPAQRYSPSNG----P---PQPTPPP--HYRLEDIAMAHHFRDAYRHPDPRELRE
       ::::..:.:::::.::    :   :.:::::  ::::.:.:.:::.::.::::. :.::.
CCDS75 RPCTISPGQRYSPNNGLSYQPNGLPHPTPPPPQHYRLDDMAIAHHYRDSYRHPSHRDLRD
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pF1KB6 RHRPLVVPGSRQEEVIDHKLTEREWAEEWKHLNNLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEAD
       :.::. . :.::::.:::.::.::::::::::..::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RNRPMGLHGTRQEEMIDHRLTDREWAEEWKHLDHLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEAD
         310       320       330       340       350       360     

       430       440       450        460       470       480      
pF1KB6 REELNHWARRYSDAEDTKKGPAPAAARPRSSS-AGPEGPQLDVPREFLPRTLTGYVPEDI
       :::::.: :::::::: ::: . .... :..: ..:.   ::. :::: :  .:::::.:
CCDS75 REELNYWIRRYSDAEDLKKGGGSSSSHSRQQSPVNPDPVALDAHREFLHRPASGYVPEEI
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pF1KB6 WRKAEEAVNEVKRQAMSELQKAVSDAERKAHELITTERAKMERALAEAKRQASEDALTVI
       :.::::::::::::::.:::::::.::::::..::::::::::..:::::::.::::.::
CCDS75 WKKAEEAVNEVKRQAMTELQKAVSEAERKAHDMITTERAKMERTVAEAKRQAAEDALAVI
         430       440       450       460       470       480     

        550       560       570       580       590       600      
pF1KB6 NQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCNAARYCGSFCQHRDWEKHHHVCGQSLQGPTAVVADP
       :::::::::::::::::::::::::.::::::::::.:::::::.:::.::      :. 
CCDS75 NQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCNTARYCGSFCQHKDWEKHHHICGQTLQ------AQQ
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        610       620       630       640       650   
pF1KB6 VPGPPEAAHSLGPSLPVGAASPSEAGSAGPSRPGSPSPPGPLDTVPR
           : .. :. :.   ::.:: ..  :.  :  .:. :. ..:.::
CCDS75 QGDTPAVSSSVTPN--SGAGSPMDTPPAATPRSTTPGTPSTIETTPR
     540       550         560       570       580    

>>CCDS47891.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8              (577 aa)
 initn: 2817 init1: 1224 opt: 1316  Z-score: 812.0  bits: 160.3 E(32554): 6.6e-39
Smith-Waterman score: 2877; 70.7% identity (84.8% similar) in 610 aa overlap (54-653:3-577)

            30        40        50        60        70        80   
pF1KB6 QTHPVLESGLLASAGCSAPRGPRKGGPAPVDRKAKASAMPDSPAEVKTQPRSTPPSMPPP
                                     ::  : :.:::::..:::: : :::.::::
CCDS47                             MPDRTEKHSTMPDSPVDVKTQSRLTPPTMPPP
                                           10        20        30  

            90       100       110       120       130       140   
pF1KB6 PPAASQGATRPPSFTPHTHREDGPATLPHGRFHGCLKWSMVCLLMNGSSHSPTAINGAPC
       :  ..::: :  :::: :                         : ::.::::::.:::: 
CCDS47 P--TTQGAPRTSSFTPTT-------------------------LTNGTSHSPTALNGAPS
               40                                 50        60     

           150       160       170       180       190       200   
pF1KB6 TPNGFSNGPATSSTASLSTQHLPPACGARQLSKLKRFLTTLQQFGSDISPEIGERVRTLV
        ::::::::..::..::..:.::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS47 PPNGFSNGPSSSSSSSLANQQLPPACGARQLSKLKRFLTTLQQFGNDISPEIGERVRTLV
          70        80        90       100       110       120     

           210       220       230       240       250       260   
pF1KB6 LGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLKANLPLLQRELLHCARLAKQTPAQYLA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS47 LGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLKANLPLLQRELLHCARLAKQNPAQYLA
         130       140       150       160       170       180     

           270       280       290       300       310       320   
pF1KB6 QHEQLLLDASASSPIDSSELLLEVNENGKRRTPDRTKENGSDRDPLHPEHLSKRPCTLNP
       ::::::::::..::.:::::::.::::::::::::::::: ::.::: :: ::::::..:
CCDS47 QHEQLLLDASTTSPVDSSELLLDVNENGKRRTPDRTKENGFDREPLHSEHPSKRPCTISP
         190       200       210       220       230       240     

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pF1KB6 AQRYSPSNG----P---PQPTPPP--HYRLEDIAMAHHFRDAYRHPDPRELRERHRPLVV
       .:::::.::    :   :.:::::  ::::.:.:.:::.::.::::. :.::.:.::. .
CCDS47 GQRYSPNNGLSYQPNGLPHPTPPPPQHYRLDDMAIAHHYRDSYRHPSHRDLRDRNRPMGL
         250       260       270       280       290       300     

          380       390       400       410       420       430    
pF1KB6 PGSRQEEVIDHKLTEREWAEEWKHLNNLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNHW
        :.::::.:::.::.::::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS47 HGTRQEEMIDHRLTDREWAEEWKHLDHLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNYW
         310       320       330       340       350       360     

          440       450        460       470       480       490   
pF1KB6 ARRYSDAEDTKKGPAPAAARPRSSS-AGPEGPQLDVPREFLPRTLTGYVPEDIWRKAEEA
        :::::::: ::: . .... :..: ..:.   ::. :::: :  .:::::.::.:::::
CCDS47 IRRYSDAEDLKKGGGSSSSHSRQQSPVNPDPVALDAHREFLHRPASGYVPEEIWKKAEEA
         370       380       390       400       410       420     

           500       510       520       530       540       550   
pF1KB6 VNEVKRQAMSELQKAVSDAERKAHELITTERAKMERALAEAKRQASEDALTVINQQEDSS
       :::::::::.:::::::.::::::..::::::::::..:::::::.::::.:::::::::
CCDS47 VNEVKRQAMTELQKAVSEAERKAHDMITTERAKMERTVAEAKRQAAEDALAVINQQEDSS
         430       440       450       460       470       480     

           560       570       580       590       600       610   
pF1KB6 ESCWNCGRKASETCSGCNAARYCGSFCQHRDWEKHHHVCGQSLQGPTAVVADPVPGPPEA
       ::::::::::::::::::.::::::::::.:::::::.:::.::      :.     : .
CCDS47 ESCWNCGRKASETCSGCNTARYCGSFCQHKDWEKHHHICGQTLQ------AQQQGDTPAV
         490       500       510       520             530         

           620       630       640       650   
pF1KB6 AHSLGPSLPVGAASPSEAGSAGPSRPGSPSPPGPLDTVPR
       . :. :.   ::.:: ..  :.  :  .:. :. ..:.::
CCDS47 SSSVTPN--SGAGSPMDTPPAATPRSTTPGTPSTIETTPR
     540         550       560       570       

>>CCDS75766.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8              (663 aa)
 initn: 2817 init1: 1224 opt: 1314  Z-score: 809.9  bits: 160.2 E(32554): 8.6e-39
Smith-Waterman score: 2877; 70.7% identity (84.8% similar) in 610 aa overlap (54-653:89-663)

            30        40        50        60        70        80   
pF1KB6 QTHPVLESGLLASAGCSAPRGPRKGGPAPVDRKAKASAMPDSPAEVKTQPRSTPPSMPPP
                                     ::  : :.:::::..:::: : :::.::::
CCDS75 PFVVWGEEEASTPGLDAISHHLCYPDRTHRDRTEKHSTMPDSPVDVKTQSRLTPPTMPPP
       60        70        80        90       100       110        

            90       100       110       120       130       140   
pF1KB6 PPAASQGATRPPSFTPHTHREDGPATLPHGRFHGCLKWSMVCLLMNGSSHSPTAINGAPC
       :  ..::: :  :::: :                         : ::.::::::.:::: 
CCDS75 P--TTQGAPRTSSFTPTT-------------------------LTNGTSHSPTALNGAPS
        120       130                                140       150 

           150       160       170       180       190       200   
pF1KB6 TPNGFSNGPATSSTASLSTQHLPPACGARQLSKLKRFLTTLQQFGSDISPEIGERVRTLV
        ::::::::..::..::..:.::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS75 PPNGFSNGPSSSSSSSLANQQLPPACGARQLSKLKRFLTTLQQFGNDISPEIGERVRTLV
             160       170       180       190       200       210 

           210       220       230       240       250       260   
pF1KB6 LGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLKANLPLLQRELLHCARLAKQTPAQYLA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS75 LGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLKANLPLLQRELLHCARLAKQNPAQYLA
             220       230       240       250       260       270 

           270       280       290       300       310       320   
pF1KB6 QHEQLLLDASASSPIDSSELLLEVNENGKRRTPDRTKENGSDRDPLHPEHLSKRPCTLNP
       ::::::::::..::.:::::::.::::::::::::::::: ::.::: :: ::::::..:
CCDS75 QHEQLLLDASTTSPVDSSELLLDVNENGKRRTPDRTKENGFDREPLHSEHPSKRPCTISP
             280       290       300       310       320       330 

           330              340         350       360       370    
pF1KB6 AQRYSPSNG----P---PQPTPPP--HYRLEDIAMAHHFRDAYRHPDPRELRERHRPLVV
       .:::::.::    :   :.:::::  ::::.:.:.:::.::.::::. :.::.:.::. .
CCDS75 GQRYSPNNGLSYQPNGLPHPTPPPPQHYRLDDMAIAHHYRDSYRHPSHRDLRDRNRPMGL
             340       350       360       370       380       390 

          380       390       400       410       420       430    
pF1KB6 PGSRQEEVIDHKLTEREWAEEWKHLNNLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNHW
        :.::::.:::.::.::::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS75 HGTRQEEMIDHRLTDREWAEEWKHLDHLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNYW
             400       410       420       430       440       450 

          440       450        460       470       480       490   
pF1KB6 ARRYSDAEDTKKGPAPAAARPRSSS-AGPEGPQLDVPREFLPRTLTGYVPEDIWRKAEEA
        :::::::: ::: . .... :..: ..:.   ::. :::: :  .:::::.::.:::::
CCDS75 IRRYSDAEDLKKGGGSSSSHSRQQSPVNPDPVALDAHREFLHRPASGYVPEEIWKKAEEA
             460       470       480       490       500       510 

           500       510       520       530       540       550   
pF1KB6 VNEVKRQAMSELQKAVSDAERKAHELITTERAKMERALAEAKRQASEDALTVINQQEDSS
       :::::::::.:::::::.::::::..::::::::::..:::::::.::::.:::::::::
CCDS75 VNEVKRQAMTELQKAVSEAERKAHDMITTERAKMERTVAEAKRQAAEDALAVINQQEDSS
             520       530       540       550       560       570 

           560       570       580       590       600       610   
pF1KB6 ESCWNCGRKASETCSGCNAARYCGSFCQHRDWEKHHHVCGQSLQGPTAVVADPVPGPPEA
       ::::::::::::::::::.::::::::::.:::::::.:::.::      :.     : .
CCDS75 ESCWNCGRKASETCSGCNTARYCGSFCQHKDWEKHHHICGQTLQ------AQQQGDTPAV
             580       590       600       610             620     

           620       630       640       650   
pF1KB6 AHSLGPSLPVGAASPSEAGSAGPSRPGSPSPPGPLDTVPR
       . :. :.   ::.:: ..  :.  :  .:. :. ..:.::
CCDS75 SSSVTPN--SGAGSPMDTPPAATPRSTTPGTPSTIETTPR
         630         640       650       660   

>>CCDS6257.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8               (567 aa)
 initn: 2795 init1: 1224 opt: 1312  Z-score: 809.7  bits: 159.9 E(32554): 8.9e-39
Smith-Waterman score: 2855; 70.9% identity (85.0% similar) in 602 aa overlap (62-653:1-567)

              40        50        60        70        80        90 
pF1KB6 GLLASAGCSAPRGPRKGGPAPVDRKAKASAMPDSPAEVKTQPRSTPPSMPPPPPAASQGA
                                     :::::..:::: : :::.:::::  ..:::
CCDS62                               MPDSPVDVKTQSRLTPPTMPPPP--TTQGA
                                             10        20          

             100       110       120       130       140       150 
pF1KB6 TRPPSFTPHTHREDGPATLPHGRFHGCLKWSMVCLLMNGSSHSPTAINGAPCTPNGFSNG
        :  :::: :                         : ::.::::::.::::  :::::::
CCDS62 PRTSSFTPTT-------------------------LTNGTSHSPTALNGAPSPPNGFSNG
       30                                 40        50        60   

             160       170       180       190       200       210 
pF1KB6 PATSSTASLSTQHLPPACGARQLSKLKRFLTTLQQFGSDISPEIGERVRTLVLGLVNSTL
       :..::..::..:.::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS62 PSSSSSSSLANQQLPPACGARQLSKLKRFLTTLQQFGNDISPEIGERVRTLVLGLVNSTL
            70        80        90       100       110       120   

             220       230       240       250       260       270 
pF1KB6 TIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLKANLPLLQRELLHCARLAKQTPAQYLAQHEQLLLD
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS62 TIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLKANLPLLQRELLHCARLAKQNPAQYLAQHEQLLLD
           130       140       150       160       170       180   

             280       290       300       310       320       330 
pF1KB6 ASASSPIDSSELLLEVNENGKRRTPDRTKENGSDRDPLHPEHLSKRPCTLNPAQRYSPSN
       ::..::.:::::::.::::::::::::::::: ::.::: :: ::::::..:.:::::.:
CCDS62 ASTTSPVDSSELLLDVNENGKRRTPDRTKENGFDREPLHSEHPSKRPCTISPGQRYSPNN
           190       200       210       220       230       240   

                    340         350       360       370       380  
pF1KB6 G----P---PQPTPPP--HYRLEDIAMAHHFRDAYRHPDPRELRERHRPLVVPGSRQEEV
       :    :   :.:::::  ::::.:.:.:::.::.::::. :.::.:.::. . :.::::.
CCDS62 GLSYQPNGLPHPTPPPPQHYRLDDMAIAHHYRDSYRHPSHRDLRDRNRPMGLHGTRQEEM
           250       260       270       280       290       300   

            390       400       410       420       430       440  
pF1KB6 IDHKLTEREWAEEWKHLNNLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNHWARRYSDAE
       :::.::.::::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::.: :::::::
CCDS62 IDHRLTDREWAEEWKHLDHLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNYWIRRYSDAE
           310       320       330       340       350       360   

            450        460       470       480       490       500 
pF1KB6 DTKKGPAPAAARPRSSS-AGPEGPQLDVPREFLPRTLTGYVPEDIWRKAEEAVNEVKRQA
       : ::: . .... :..: ..:.   ::. :::: :  .:::::.::.:::::::::::::
CCDS62 DLKKGGGSSSSHSRQQSPVNPDPVALDAHREFLHRPASGYVPEEIWKKAEEAVNEVKRQA
           370       380       390       400       410       420   

             510       520       530       540       550       560 
pF1KB6 MSELQKAVSDAERKAHELITTERAKMERALAEAKRQASEDALTVINQQEDSSESCWNCGR
       :.:::::::.::::::..::::::::::..:::::::.::::.:::::::::::::::::
CCDS62 MTELQKAVSEAERKAHDMITTERAKMERTVAEAKRQAAEDALAVINQQEDSSESCWNCGR
           430       440       450       460       470       480   

             570       580       590       600       610       620 
pF1KB6 KASETCSGCNAARYCGSFCQHRDWEKHHHVCGQSLQGPTAVVADPVPGPPEAAHSLGPSL
       ::::::::::.::::::::::.:::::::.:::.::      :.     : .. :. :. 
CCDS62 KASETCSGCNTARYCGSFCQHKDWEKHHHICGQTLQ------AQQQGDTPAVSSSVTPN-
           490       500       510             520       530       

             630       640       650   
pF1KB6 PVGAASPSEAGSAGPSRPGSPSPPGPLDTVPR
         ::.:: ..  :.  :  .:. :. ..:.::
CCDS62 -SGAGSPMDTPPAATPRSTTPGTPSTIETTPR
         540       550       560       

>>CCDS13221.1 CBFA2T2 gene_id:9139|Hs108|chr20            (604 aa)
 initn: 2274 init1: 999 opt: 1053  Z-score: 652.6  bits: 130.9 E(32554): 5e-30
Smith-Waterman score: 2278; 57.5% identity (77.7% similar) in 609 aa overlap (53-650:21-601)

             30        40        50        60        70        80  
pF1KB6 SQTHPVLESGLLASAGCSAPRGPRKGGPAPVDRKAKASAMPDSPAEVKTQPRSTPPSMPP
                                     :  . .. ::: ::.::: : ::.::.:::
CCDS13           MAKESGISLKEIQVLARQWKVGPEKRVPAMPGSPVEVKIQSRSSPPTMPP
                         10        20        30        40        50

             90       100       110       120       130       140  
pF1KB6 PPPAASQGATRPPSFTPHTHREDGPATLPHGRFHGCLKWSMVCLLMNGSSHSPTAINGAP
        ::  . :. :: :::: .                         : :: .::: ..::::
CCDS13 LPPI-NPGGPRPVSFTPTA-------------------------LSNGINHSPPTLNGAP
                60                                 70        80    

            150       160       170       180       190       200  
pF1KB6 CTPNGFSNGPATSSTASLSTQHLPPACGARQLSKLKRFLTTLQQFGSDISPEIGERVRTL
         :. ::::::.:....:..:.:: .::::::::::::::::::::.::::::::.::::
CCDS13 SPPQRFSNGPASSTSSALTNQQLPATCGARQLSKLKRFLTTLQQFGNDISPEIGEKVRTL
           90       100       110       120       130       140    

            210       220       230       240       250       260  
pF1KB6 VLGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLKANLPLLQRELLHCARLAKQTPAQYL
       ::.:::::.:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::.:::
CCDS13 VLALVNSTVTIEEFHCKLQEATNFPLRPFVIPFLKANLPLLQRELLHCARAAKQTPSQYL
          150       160       170       180       190       200    

            270       280       290       300       310       320  
pF1KB6 AQHEQLLLDASASSPIDSSELLLEVNENGKRRTPDRTKENGSDRDPLHPEHLSKRPCTLN
       ::::.:::..: .:: ::::::.::. :::: .:.: .::. ::: . ::  .:: ::..
CCDS13 AQHEHLLLNTSIASPADSSELLMEVHGNGKRPSPERREENSFDRDTIAPEPPAKRVCTIS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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