Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6184
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6184, 700 aa
1>>>pF1KB6184 700 - 700 aa - 700 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9032+/-0.000895; mu= 7.7644+/- 0.054
mean_var=129.6395+/-26.264, 0's: 0 Z-trim(110.4): 36 B-trim: 39 in 1/49
Lambda= 0.112643
statistics sampled from 11549 (11577) to 11549 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.714), E-opt: 0.2 (0.356), width: 16
Scan time: 3.780
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13322.1 MYBL2 gene_id:4605|Hs108|chr20 ( 700) 4709 776.8 0
CCDS63276.1 MYBL2 gene_id:4605|Hs108|chr20 ( 676) 4271 705.6 5.9e-203
CCDS55062.1 MYB gene_id:4602|Hs108|chr6 ( 605) 984 171.4 3.4e-42
CCDS55241.1 MYBL1 gene_id:4603|Hs108|chr8 ( 692) 975 170.0 1.1e-41
CCDS47867.1 MYBL1 gene_id:4603|Hs108|chr8 ( 752) 975 170.0 1.1e-41
CCDS55061.1 MYB gene_id:4602|Hs108|chr6 ( 555) 968 168.8 1.9e-41
CCDS55060.1 MYB gene_id:4602|Hs108|chr6 ( 603) 968 168.8 2.1e-41
CCDS47482.1 MYB gene_id:4602|Hs108|chr6 ( 637) 968 168.8 2.2e-41
CCDS5174.1 MYB gene_id:4602|Hs108|chr6 ( 640) 968 168.8 2.2e-41
CCDS55059.1 MYB gene_id:4602|Hs108|chr6 ( 745) 968 168.9 2.5e-41
CCDS55058.1 MYB gene_id:4602|Hs108|chr6 ( 758) 968 168.9 2.5e-41
CCDS47481.1 MYB gene_id:4602|Hs108|chr6 ( 761) 968 168.9 2.5e-41
>>CCDS13322.1 MYBL2 gene_id:4605|Hs108|chr20 (700 aa)
initn: 4709 init1: 4709 opt: 4709 Z-score: 4141.6 bits: 776.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4709; 100.0% identity (100.0% similar) in 700 aa overlap (1-700:1-700)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSRRTRCEDLDELHYQDTDSDVPEQRDSKCKVKWTHEEDEQLRALVRQFGQQDWKFLASH
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CCDS13 MSRRTRCEDLDELHYQDTDSDVPEQRDSKCKVKWTHEEDEQLRALVRQFGQQDWKFLASH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 FPNRTDQQCQYRWLRVLNPDLVKGPWTKEEDQKVIELVKKYGTKQWTLIAKHLKGRLGKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FPNRTDQQCQYRWLRVLNPDLVKGPWTKEEDQKVIELVKKYGTKQWTLIAKHLKGRLGKQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 CRERWHNHLNPEVKKSCWTEEEDRIICEAHKVLGNRWAEIAKMLPGRTDNAVKNHWNSTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CRERWHNHLNPEVKKSCWTEEEDRIICEAHKVLGNRWAEIAKMLPGRTDNAVKNHWNSTI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 KRKVDTGGFLSESKDCKPPVYLLLELEDKDGLQSAQPTEGQGSLLTNWPSVPPTIKEEEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KRKVDTGGFLSESKDCKPPVYLLLELEDKDGLQSAQPTEGQGSLLTNWPSVPPTIKEEEN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 SEEELAAATTSKEQEPIGTDLDAVRTPEPLEEFPKREDQEGSPPETSLPYKWVVEAANLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SEEELAAATTSKEQEPIGTDLDAVRTPEPLEEFPKREDQEGSPPETSLPYKWVVEAANLL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 IPAVGSSLSEALDLIESDPDAWCDLSKFDLPEEPSAEDSINNSLVQLQASHQQQVLPPRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IPAVGSSLSEALDLIESDPDAWCDLSKFDLPEEPSAEDSINNSLVQLQASHQQQVLPPRQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 PSALVPSVTEYRLDGHTISDLSRSSRGELIPISPSTEVGGSGIGTPPSVLKRQRKRRVAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PSALVPSVTEYRLDGHTISDLSRSSRGELIPISPSTEVGGSGIGTPPSVLKRQRKRRVAL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 SPVTENSTSLSFLDSCNSLTPKSTPVKTLPFSPSQFLNFWNKQDTLELESPSLTSTPVCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SPVTENSTSLSFLDSCNSLTPKSTPVKTLPFSPSQFLNFWNKQDTLELESPSLTSTPVCS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 QKVVVTTPLHRDKTPLHQKHAAFVTPDQKYSMDNTPHTPTPFKNALEKYGPLKPLPQTPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QKVVVTTPLHRDKTPLHQKHAAFVTPDQKYSMDNTPHTPTPFKNALEKYGPLKPLPQTPH
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 LEEDLKEVLRSEAGIELIIEDDIRPEKQKRKPGLRRSPIKKVRKSLALDIVDEDVKLMMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LEEDLKEVLRSEAGIELIIEDDIRPEKQKRKPGLRRSPIKKVRKSLALDIVDEDVKLMMS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 TLPKSLSLPTTAPSNSSSLTLSGIKEDNSLLNQGFLQAKPEKAAVAQKPRSHFTTPAPMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TLPKSLSLPTTAPSNSSSLTLSGIKEDNSLLNQGFLQAKPEKAAVAQKPRSHFTTPAPMS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KB6 SAWKTVACGGTRDQLFMQEKARQLLGRLKPSHTSRTLILS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SAWKTVACGGTRDQLFMQEKARQLLGRLKPSHTSRTLILS
670 680 690 700
>>CCDS63276.1 MYBL2 gene_id:4605|Hs108|chr20 (676 aa)
initn: 4271 init1: 4271 opt: 4271 Z-score: 3757.1 bits: 705.6 E(32554): 5.9e-203
Smith-Waterman score: 4479; 96.6% identity (96.6% similar) in 700 aa overlap (1-700:1-676)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSRRTRCEDLDELHYQDTDSDVPEQRDSKCKVKWTHEEDEQLRALVRQFGQQDWKFLASH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 MSRRTRCEDLDELHYQDTDSDVPEQRDSKCKVKWTHEE----------------------
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 FPNRTDQQCQYRWLRVLNPDLVKGPWTKEEDQKVIELVKKYGTKQWTLIAKHLKGRLGKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 --NRTDQQCQYRWLRVLNPDLVKGPWTKEEDQKVIELVKKYGTKQWTLIAKHLKGRLGKQ
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 CRERWHNHLNPEVKKSCWTEEEDRIICEAHKVLGNRWAEIAKMLPGRTDNAVKNHWNSTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 CRERWHNHLNPEVKKSCWTEEEDRIICEAHKVLGNRWAEIAKMLPGRTDNAVKNHWNSTI
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 KRKVDTGGFLSESKDCKPPVYLLLELEDKDGLQSAQPTEGQGSLLTNWPSVPPTIKEEEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 KRKVDTGGFLSESKDCKPPVYLLLELEDKDGLQSAQPTEGQGSLLTNWPSVPPTIKEEEN
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 SEEELAAATTSKEQEPIGTDLDAVRTPEPLEEFPKREDQEGSPPETSLPYKWVVEAANLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 SEEELAAATTSKEQEPIGTDLDAVRTPEPLEEFPKREDQEGSPPETSLPYKWVVEAANLL
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 IPAVGSSLSEALDLIESDPDAWCDLSKFDLPEEPSAEDSINNSLVQLQASHQQQVLPPRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 IPAVGSSLSEALDLIESDPDAWCDLSKFDLPEEPSAEDSINNSLVQLQASHQQQVLPPRQ
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 PSALVPSVTEYRLDGHTISDLSRSSRGELIPISPSTEVGGSGIGTPPSVLKRQRKRRVAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 PSALVPSVTEYRLDGHTISDLSRSSRGELIPISPSTEVGGSGIGTPPSVLKRQRKRRVAL
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 SPVTENSTSLSFLDSCNSLTPKSTPVKTLPFSPSQFLNFWNKQDTLELESPSLTSTPVCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 SPVTENSTSLSFLDSCNSLTPKSTPVKTLPFSPSQFLNFWNKQDTLELESPSLTSTPVCS
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 QKVVVTTPLHRDKTPLHQKHAAFVTPDQKYSMDNTPHTPTPFKNALEKYGPLKPLPQTPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 QKVVVTTPLHRDKTPLHQKHAAFVTPDQKYSMDNTPHTPTPFKNALEKYGPLKPLPQTPH
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 LEEDLKEVLRSEAGIELIIEDDIRPEKQKRKPGLRRSPIKKVRKSLALDIVDEDVKLMMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 LEEDLKEVLRSEAGIELIIEDDIRPEKQKRKPGLRRSPIKKVRKSLALDIVDEDVKLMMS
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 TLPKSLSLPTTAPSNSSSLTLSGIKEDNSLLNQGFLQAKPEKAAVAQKPRSHFTTPAPMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 TLPKSLSLPTTAPSNSSSLTLSGIKEDNSLLNQGFLQAKPEKAAVAQKPRSHFTTPAPMS
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700
pF1KB6 SAWKTVACGGTRDQLFMQEKARQLLGRLKPSHTSRTLILS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 SAWKTVACGGTRDQLFMQEKARQLLGRLKPSHTSRTLILS
640 650 660 670
>>CCDS55062.1 MYB gene_id:4602|Hs108|chr6 (605 aa)
initn: 1279 init1: 919 opt: 984 Z-score: 871.0 bits: 171.4 E(32554): 3.4e-42
Smith-Waterman score: 1205; 36.4% identity (59.9% similar) in 719 aa overlap (1-699:1-605)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSRRTRC------EDLDELHYQDTDSD--VPEQ-RDSKCKVKWTHEEDEQLRALVRQFGQ
:.:: : :: ..... : : : .:.. . :..::.::::.:. ::.: :
CCDS55 MARRPRHSIYSSDEDDEDFEMCDHDYDGLLPKSGKRHLGKTRWTREEDEKLKKLVEQNGT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 QDWKFLASHFPNRTDQQCQYRWLRVLNPDLVKGPWTKEEDQKVIELVKKYGTKQWTLIAK
.::: .:...::::: :::.:: .::::.:.::::::::::.:::::.::: :.:..:::
CCDS55 DDWKVIANYLPNRTDVQCQHRWQKVLNPELIKGPWTKEEDQRVIELVQKYGPKRWSVIAK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 HLKGRLGKQCRERWHNHLNPEVKKSCWTEEEDRIICEAHKVLGNRWAEIAKMLPGRTDNA
:::::.::::::::::::::::::. ::::::::: .::: ::::::::::.::::::::
CCDS55 HLKGRIGKQCRERWHNHLNPEVKKTSWTEEEDRIIYQAHKRLGNRWAEIAKLLPGRTDNA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KB6 VKNHWNSTIKRKVDTGGFLSES-KDCKPPVYLLLELEDKD-GLQSAQPTEGQGSLLTNWP
.:::::::..:::. :.:.:: : .: : .. ... :. .: :: . :. :
CCDS55 IKNHWNSTMRRKVEQEGYLQESSKASQPAVATSFQKNSHLMGFAQAPPTAQLPA--TGQP
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 SVPPTIKEEENSEEELAAATTSKEQEPIGTDLDAVRTPEPLEEFPKREDQEGSPPETSLP
.: . . :: : ..:. :.. .. : .:.: . ... : :
CCDS55 TVNNDYSYYHISE---AQNVSSHVPYPVALHVNIVNVPQPAAAAIQTQNHTCSYP-----
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 YKWVVEAANLLIPAVGSSLSEALDLIESDPDAWCDLSKFDLPEEPSAEDSINNSLVQLQA
.: ... . :
CCDS55 -------------------------------GW------------------HSTTI---A
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 SHQQQVLPPRQPSALVPSVTEYRLDGHTISDLSRSSRGELIPISPSTEVGGSGIGTPPSV
.: . :. :: : . :. :. .: : .: :. :
CCDS55 DHTR----PHGDSAPVSCLGEH----HSTPSL---------PADP---------GSLP--
300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KB6 LKRQRKRRVALSPVTENSTSLSFLDSCNSLTPKSTPVKTLPFSPSQFLNFWNKQDTLELE
... : .....: .::. ..: . .:: : : ::: ..... .::
CCDS55 ---EESASPARCMIVHQGT---ILDNVKNLLEFA---ETLQFIDS-FLNTSSNHENSDLE
340 350 360 370 380
470 480 490 500 510 520
pF1KB6 SPSLTSTPVCSQKVVVTTPLHRDKTPLHQK-HAAFVTPDQKYS-MDNTPHTPTPFKNALE
:::::::. ..:..::::.:::.: :: ...: :: : : ....:.::::::.::
CCDS55 MPSLTSTPLIGHKLTVTTPFHRDQTVKTQKENTVFRTPAIKRSILESSPRTPTPFKHALA
390 400 410 420 430 440
530 540 550 560 570 580
pF1KB6 ----KYGPLKPLPQTP-HLEEDLKEVLRSEAGIELIIEDDIRPEKQKRKPGLRRSPIKKV
:::::: ::::: :: :::..:...:. :. : : :. : : .::.
CCDS55 AQEIKYGPLKMLPQTPSHLVEDLQDVIKQESD-----ESGIVAEFQENGPPL----LKKI
450 460 470 480 490
590 600 610 620 630 640
pF1KB6 RKSLALDIVDEDVKLMMSTLPKSLSLPTTAPSNSSSLTLSGIKEDNSLLNQGFLQAKPE-
.. . . .:.. ... : .. :: : ...: .. . .:.: . . .
CCDS55 KQEVE-SPTDKSGNFFCSHHWEGDSLNTQLFTQTSPVADAPNILTSSVLMAPASEDEDNV
500 510 520 530 540 550
650 660 670 680 690 700
pF1KB6 -KAAVAQKPRSHFTTPAPMSSAWKTVACGGTRDQLFMQEKARQLLGRLKPSHTSRTLILS
:: .. : :: . : ::.:. ..:: ..:. . .::. .. . ..:::..
CCDS55 LKAFTVPKNRSLASPLQPCSSTWEPASCGKMEEQMTSSSQARKYVN----AFSARTLVM
560 570 580 590 600
>>CCDS55241.1 MYBL1 gene_id:4603|Hs108|chr8 (692 aa)
initn: 1270 init1: 902 opt: 975 Z-score: 862.2 bits: 170.0 E(32554): 1.1e-41
Smith-Waterman score: 1532; 40.8% identity (63.6% similar) in 763 aa overlap (1-699:1-692)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSRRTRCEDLDE-LHYQDTDSDVPEQRDSK---CKVKWTHEEDEQLRALVRQFGQQDWKF
:..:.: :: :. :.: : : .::.:. : .::::..::..:. ::.: : .:: .
CCDS55 MAKRSRSEDEDDDLQYADHDYEVPQQKGLKKLWNRVKWTRDEDDKLKKLVEQHGTDDWTL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 LASHFPNRTDQQCQYRWLRVLNPDLVKGPWTKEEDQKVIELVKKYGTKQWTLIAKHLKGR
.:::. ::.: :::.:: .::::.:.::::::::::.:::::.::: :.:.:::::::::
CCDS55 IASHLQNRSDFQCQHRWQKVLNPELIKGPWTKEEDQRVIELVQKYGPKRWSLIAKHLKGR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 LGKQCRERWHNHLNPEVKKSCWTEEEDRIICEAHKVLGNRWAEIAKMLPGRTDNAVKNHW
.::::::::::::::::::: ::::::::: :::: ::::::::::.:::::::..::::
CCDS55 IGKQCRERWHNHLNPEVKKSSWTEEEDRIIYEAHKRLGNRWAEIAKLLPGRTDNSIKNHW
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210
pF1KB6 NSTIKRKVDTGGFL--------SESKDCKPPVYLLLELEDKD---------GLQSAQPTE
:::..:::. :.: : :: . : . ... .. : : ..:
CCDS55 NSTMRRKVEQEGYLQDGIKSERSSSKLQHKPCAAMDHMQTQNQFYIPVQIPGYQYVSP--
190 200 210 220 230
220 230 240 250
pF1KB6 GQGSLLTN-WPSVP----PTIKEEENSEE---ELAAATTSKEQE------PI--GT----
.:. . . :. : : :. ..:. :: : :.: : :.
CCDS55 -EGNCIEHVQPTSAFIQQPFIDEDPDKEKKIKELEMLLMSAENEVRRKRIPSQPGSFSSW
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300
pF1KB6 ------DLDAVRTPEPLEE-----FPKREDQEGSPPETSLPYKWVVEAANLLIPAVGS--
: . : . :.: . :.: : ..: : :... :: .. .. .
CCDS55 SGSFLMDDNMSNTLNSLDEHTSEFYSMDENQPVSAQQNS-PTKFLAVEANAVLSSLQTIP
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 SLSEALDLIESDPDAWCDLSKFDLPEEPSAEDSINNSLVQL-QASHQQQVLPPRQPSALV
..:.:.:::::: :: :...::. . .: . :... :.: . .:.. .. . .::
CCDS55 EFAETLELIESDPVAWSDVTSFDISD--AAASPIKSTPVKLMRIQHNEGAMECQFNVSLV
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 PSVTEYRLDGHTISDLSRSSRGELIPI-SPSTEVGGSGIGTPPSVLKRQRKRRVALSPVT
:.:. .. .. .: .:. ::. . ..:::..:...:: ::. :: .
CCDS55 -------LEGK--KNTCNGGNSEAVPLTSPNI----AKFSTPPAILRKKRKMRVGHSPGS
420 430 440 450 460
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 ENSTSLSFLDSCNSLTPKSTPVKTLPFSPSQFLNFWNKQDTLELESPSLTSTPVCSQKVV
: . :. :. : .. : ::.::::::::::.: .. :..:.::.::::.:.::..
CCDS55 ELRDG-SLNDGGN-MALKHTPLKTLPFSPSQFFNTCPGNEQLNIENPSFTSTPICGQKAL
470 480 490 500 510
490 500 510 520 530
pF1KB6 VTTPLHRDKTPLHQK-HAAFVTPDQKYS-MDNTPHTPTPFKNAL----EKYGPLKPLPQT
.:::::.. :: :: ...: :: . : . .::.::::::::: .:::::: . :
CCDS55 ITTPLHKETTPKDQKENVGFRTPTIRRSILGTTPRTPTPFKNALAAQEKKYGPLKIVSQP
520 530 540 550 560 570
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 -PHLEEDLKEVLRSEAGIELIIEDDIRPEKQKRKPGLRRSPIKKVRKSLALDIVDEDVKL
::::..:::. :.: .:..... .: .. : : :::::::.:: ...
CCDS55 LAFLEEDIREVLKEETGTDLFLKEEDEPAYKSCKQENTASG-KKVRKSLVLDNWEKE---
580 590 600 610 620 630
600 610 620 630 640 650
pF1KB6 MMSTLPKSLSLPTTAPSNSSSLTLSGIKEDNSLLNQGFLQAKPEKAAVAQKPRSHFTTPA
:... :: :: : . :.. :
CCDS55 ---------------ESGTQLLT-----EDISDM-----QSNCE----------------
640 650
660 670 680 690 700
pF1KB6 PMSSAWKTVACGGTRDQLFMQEKARQLLGRLKP-SHTSRTLILS
:.::. : :.:::.: :.::. :. : :::.:::
CCDS55 -----WETVVYGKTEDQLIMTEQARRYLSTYTATSSTSRALIL
660 670 680 690
>>CCDS47867.1 MYBL1 gene_id:4603|Hs108|chr8 (752 aa)
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.:. . . :. : : :. ..:. :: : :.: : :.
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260 270 280 290 300
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: . : . :.: . :.: : ..: : :... :: .. .. .
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310 320 330 340 350 360
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..:.:.:::::: :: :...::. . .: . :... :.: . .:.. .. . .::
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370 380 390 400 410 420
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430 440 450 460 470 480
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490 500 510 520 530
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540 550 560 570 580
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590 600 610 620 630 640
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.. ::.. :.: . :: . ... .: :.: . :. . .: .
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650 660 670 680 690 700
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..: .. . :.::. : :.:::.: :.::.
CCDS47 TSKV-VKLEKNLQSNCEWETVVYGKTEDQLIMTEQARRYLSTYTATSSTSRALIL
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CCDS55 EVE-SPTDKSGNFFCSHHWEGDSLNTQLFTQTSPVADAPNILTSSVLMAPASEDEDNVLK
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: .. : :: . : ::.:. ..:: ..:. . .::. .. . ..:::..
CCDS55 AFTVPKNRSLASPLQPCSSTWEPASCGKMEEQMTSSSQARKYVN----AFSARTLVM
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>>CCDS55060.1 MYB gene_id:4602|Hs108|chr6 (603 aa)
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CCDS55 HLKGRIGKQCRERWHNHLNPEVKKTSWTEEEDRIIYQAHKRLGNRWAEIAKLLPGRTDNA
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CCDS55 TVNNDYSYYHISE---AQNVSSHVPYPVALHVNIVNVPQPAAAAIQRHYNDEDPEKE---
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: .. . : ... .::. ..: . .:: : : ::: ..... .:
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CCDS55 EMPSLTSTPLIGHKLTVTTPFHRDQTVKTQKENTVFRTPAIKRSILESSPRTPTPFKHAL
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pF1KB6 E----KYGPLKPLPQTP-HLEEDLKEVLRSEAGIELIIEDDIRPEKQKRKPGLRRSPIKK
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CCDS55 KAFTVPKNRSLASPLQPCSSTWEPASCGKMEEQMTSSSQARKYVN----AFSARTLVM
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CCDS47 HLKGRIGKQCRERWHNHLNPEVKKTSWTEEEDRIIYQAHKRLGNRWAEIAKLLPGRTDNA
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pF1KB6 VKNHWNSTIKRKVDTGGFLSES-KDCKPPVYLLLELEDKD-GLQSAQPTEGQGSLLTNWP
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CCDS47 IKNHWNSTMRRKVEQEGYLQESSKASQPAVATSFQKNSHLMGFAQAPPTAQLPA--TGQP
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CCDS47 TVNNDYSYYHISE---AQNVSSHVPYPVALHVNIVNVPQPAAAAIQRHYNDEDPEKE---
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pF1KB6 YKWVVEAANLLIPAVGSSLSEALDLIESDPDAWCDLSKFDLPEEPSAEDSINNSLVQLQA
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CCDS47 -KRIKELELLLM---------------------------------STENELKG-----QQ
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.... : :. . . :. . :. .: :.. .: .: :. :
CCDS47 TQNHTCSYPGWHSTTIADHTRPHGDSAPVSCLGEHHSTPSLPADP---------GSLP--
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CCDS47 ---EESASPARCMIVHQGT---ILDNVKNLLEFA---ETLQFIDS-FLNTSSNHENSDLE
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pF1KB6 SPSLTSTPVCSQKVVVTTPLHRDKTPLHQK-HAAFVTPDQKYS-MDNTPHTPTPFKNALE
:::::::. ..:..::::.:::.: :: ...: :: : : ....:.::::::.::
CCDS47 MPSLTSTPLIGHKLTVTTPFHRDQTVKTQKENTVFRTPAIKRSILESSPRTPTPFKHALA
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pF1KB6 ----KYGPLKPLPQTP-HLEEDLKEVLRSEAGIELIIEDDIRPEKQKRKPGLRRSPIKKV
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CCDS47 AQEIKYGPLKMLPQTPSHLVEDLQDVIKQESD-----ESGIVAEFQENGPPL----LKKI
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pF1KB6 RKSLALDIVDEDVKLMMSTLPKSLSLPTTAPSNSSSLTLSGIKEDNSLLNQGFLQAKPE-
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CCDS47 KQEVE-SPTDKSGNFFCSHHWEGDSLNTQLFTQTSPVADAPNILTSSVLMAPASEDEDNV
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pF1KB6 -KAAVAQKPRSHFTTPAPMSSAWKTVACGGTRDQLFMQEKARQLLGRLKPSHTSRTLILS
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CCDS47 LKAFTVPKNRSLASPLQPCSSTWEPASCGKMEEQMTSSSQARKYVN----AFSARTLVM
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CCDS51 MARRPRHSIYSSDEDDEDFEMCDHDYDGLLPKSGKRHLGKTRWTREEDEKLKKLVEQNGT
10 20 30 40 50 60
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pF1KB6 QDWKFLASHFPNRTDQQCQYRWLRVLNPDLVKGPWTKEEDQKVIELVKKYGTKQWTLIAK
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CCDS51 DDWKVIANYLPNRTDVQCQHRWQKVLNPELIKGPWTKEEDQRVIELVQKYGPKRWSVIAK
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120 130 140 150 160 170
pF1KB6 HLKGRLGKQCRERWHNHLNPEVKKSCWTEEEDRIICEAHKVLGNRWAEIAKMLPGRTDNA
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CCDS51 HLKGRIGKQCRERWHNHLNPEVKKTSWTEEEDRIIYQAHKRLGNRWAEIAKLLPGRTDNA
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pF1KB6 VKNHWNSTIKRKVDTGGFLSES-KDCKPPVYLLLELEDKD-GLQSAQPTEGQGSLLTNWP
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CCDS51 IKNHWNSTMRRKVEQEGYLQESSKASQPAVATSFQKNSHLMGFAQAPPTAQLPA--TGQP
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pF1KB6 SVPPTIKEEENSEEELAAATTSKEQEPIGTDLDAVRTPEPLEEFPKREDQEGSPPETSLP
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