Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6190
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6190, 659 aa
1>>>pF1KB6190 659 - 659 aa - 659 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8802+/-0.00243; mu= 19.5163+/- 0.145
mean_var=333.5572+/-60.135, 0's: 0 Z-trim(103.4): 950 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.070225
statistics sampled from 6343 (7381) to 6343 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.539), E-opt: 0.2 (0.227), width: 16
Scan time: 3.400
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12950.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 659) 4690 491.0 2.2e-138
CCDS74462.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 617) 4413 462.9 6e-130
CCDS77365.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 706) 4350 456.6 5.3e-128
CCDS82405.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 ( 664) 2210 239.8 9.5e-63
CCDS42636.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 ( 662) 2196 238.3 2.5e-62
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 2102 228.9 1.9e-59
CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 2009 219.5 1.4e-56
CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 769) 2007 219.3 1.6e-56
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19 ( 706) 1988 217.3 5.7e-56
CCDS46212.1 ZNF814 gene_id:730051|Hs108|chr19 ( 855) 1961 214.8 4.1e-55
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1949 213.7 1e-54
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1949 213.7 1.1e-54
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1936 212.0 2.2e-54
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1931 211.6 3.2e-54
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 1921 210.6 6.6e-54
CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 816) 1915 210.1 1e-53
CCDS35066.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 852) 1915 210.1 1e-53
CCDS59136.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 854) 1915 210.1 1e-53
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 1913 210.1 1.3e-53
CCDS2717.1 ZNF197 gene_id:10168|Hs108|chr3 (1029) 1909 209.6 1.7e-53
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1904 208.9 2.1e-53
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1901 208.4 2.4e-53
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1901 208.5 2.5e-53
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1901 208.5 2.5e-53
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1901 208.5 2.5e-53
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 1897 208.5 4.2e-53
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 1897 208.5 4.2e-53
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 1886 207.0 7.4e-53
CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19 ( 970) 1880 206.7 1.3e-52
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 1868 205.1 2.6e-52
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 1864 204.9 3.7e-52
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 1864 204.9 3.7e-52
CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12 ( 947) 1857 204.3 6.4e-52
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 1852 203.7 8.8e-52
CCDS33026.2 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 641) 1850 203.3 8.9e-52
CCDS46079.1 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 642) 1846 202.9 1.2e-51
CCDS42495.1 ZNF699 gene_id:374879|Hs108|chr19 ( 642) 1838 202.0 2.1e-51
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX ( 779) 1839 202.3 2.1e-51
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1834 201.6 2.6e-51
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1834 201.6 2.7e-51
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1835 201.9 2.8e-51
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1835 201.9 2.8e-51
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1831 201.2 3.1e-51
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1831 201.4 3.5e-51
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 1830 201.4 4e-51
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 1830 201.4 4e-51
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 1830 201.4 4e-51
CCDS46077.1 ZNF780B gene_id:163131|Hs108|chr19 ( 833) 1824 200.9 6.2e-51
CCDS12846.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 731) 1820 200.3 7.7e-51
CCDS82387.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 736) 1820 200.3 7.8e-51
>>CCDS12950.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 (659 aa)
initn: 4690 init1: 4690 opt: 4690 Z-score: 2597.9 bits: 491.0 E(32554): 2.2e-138
Smith-Waterman score: 4690; 99.8% identity (100.0% similar) in 659 aa overlap (1-659:1-659)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAAAVLMDRVQSCVTFEDVFVYFSREEWELLEEAQRFLYRDVMLENFALVATLGFWCEAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MAAAVLMDRVQSCVTFEDVFVYFSREEWELLEEAQRFLYRDVMLENFALVATLGFWCEAE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 HEAPSEQSVSVEGVSQVRTAESGLFQKAHPCEMCDPLLKDILHLAEHQGSHLTQKLCTRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HEAPSEQSVSVEGVSQVRTAESGLFQKAHPCEMCDPLLKDILHLAEHQGSHLTQKLCTRG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 LCRRRFSFSANFYQHQKQHNGENCFRGDDGGASFVKSCTVHMLGRSFTCREEGMDLPDSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LCRRRFSFSANFYQHQKQHNGENCFRGDDGGASFVKSCTVHMLGRSFTCREEGMDLPDSS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 GLFQHQTTYNRVSPCRRTECMESFPHSSSLRQHQGDYDGQMLFSCGDEGKAFLDTFTLLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GLFQHQTTYNRVSPCRRTECMESFPHSSSLRQHQGDYDGQMLFSCGDEGKAFLDTFTLLD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 SQMTHAEVRPFRCLPCGNVFKEKSALINHRKIHSGEISHVCKECGKAFIHLHHLKMHQKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SQMTHAEVRPFRCLPCGNVFKEKSALINHRKIHSGEISHVCKECGKAFIHLHHLKMHQKF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 HTGKRHYTCSECGKAFSRKDTLVQHQRVHTGERSYDCSECGKAYSRSSHLVQHQRIHTGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HTGKRHYTCSECGKAFSRKDTLVQHQRVHTGERSYDCSECGKAYSRSSHLVQHQRIHTGE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 RPYKCNECGKAFSRKDTLVQHQRFHTGERPYECSECGKFFSQSSHLIEHWRIHTGARPYE
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RPYKCNKCGKAFSRKDTLVQHQRFHTGERPYECSECGKFFSQSSHLIEHWRIHTGARPYE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 CIECGKFFSHNSSLIKHRRVHTGARSYVCSKCGKAFGCKDTLVQHQIIHTGARPYECSEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CIECGKFFSHNSSLIKHRRVHTGARSYVCSKCGKAFGCKDTLVQHQIIHTGARPYECSEC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 GKAFSRKDTLVQHQKIHTGERPYECGECGKFFSHSSNLIVHQRIHTGAKPYECNECGKCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GKAFSRKDTLVQHQKIHTGERPYECGECGKFFSHSSNLIVHQRIHTGAKPYECNECGKCF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 SHNSSLILHQRVHTGARPYVCSECGKAYISSSHLVQHKKVHTGARPYECSECGKFFSRNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SHNSSLILHQRVHTGARPYVCSECGKAYISSSHLVQHKKVHTGARPYECSECGKFFSRNS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650
pF1KB6 GLILHQRVHTGEKPYVCSECGKAYSRSSHLVRHQKAHTGERAHECNSFGGPLAASLKLV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GLILHQRVHTGEKPYVCSECGKAYSRSSHLVRHQKAHTGERAHECNSFGGPLAASLKLV
610 620 630 640 650
>>CCDS74462.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 (617 aa)
initn: 4413 init1: 4413 opt: 4413 Z-score: 2446.5 bits: 462.9 E(32554): 6e-130
Smith-Waterman score: 4413; 99.8% identity (100.0% similar) in 617 aa overlap (43-659:1-617)
20 30 40 50 60 70
pF1KB6 CVTFEDVFVYFSREEWELLEEAQRFLYRDVMLENFALVATLGFWCEAEHEAPSEQSVSVE
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MLENFALVATLGFWCEAEHEAPSEQSVSVE
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB6 GVSQVRTAESGLFQKAHPCEMCDPLLKDILHLAEHQGSHLTQKLCTRGLCRRRFSFSANF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GVSQVRTAESGLFQKAHPCEMCDPLLKDILHLAEHQGSHLTQKLCTRGLCRRRFSFSANF
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB6 YQHQKQHNGENCFRGDDGGASFVKSCTVHMLGRSFTCREEGMDLPDSSGLFQHQTTYNRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 YQHQKQHNGENCFRGDDGGASFVKSCTVHMLGRSFTCREEGMDLPDSSGLFQHQTTYNRV
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB6 SPCRRTECMESFPHSSSLRQHQGDYDGQMLFSCGDEGKAFLDTFTLLDSQMTHAEVRPFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SPCRRTECMESFPHSSSLRQHQGDYDGQMLFSCGDEGKAFLDTFTLLDSQMTHAEVRPFR
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 CLPCGNVFKEKSALINHRKIHSGEISHVCKECGKAFIHLHHLKMHQKFHTGKRHYTCSEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 CLPCGNVFKEKSALINHRKIHSGEISHVCKECGKAFIHLHHLKMHQKFHTGKRHYTCSEC
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 GKAFSRKDTLVQHQRVHTGERSYDCSECGKAYSRSSHLVQHQRIHTGERPYKCNECGKAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS74 GKAFSRKDTLVQHQRVHTGERSYDCSECGKAYSRSSHLVQHQRIHTGERPYKCNKCGKAF
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KB6 SRKDTLVQHQRFHTGERPYECSECGKFFSQSSHLIEHWRIHTGARPYECIECGKFFSHNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SRKDTLVQHQRFHTGERPYECSECGKFFSQSSHLIEHWRIHTGARPYECIECGKFFSHNS
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KB6 SLIKHRRVHTGARSYVCSKCGKAFGCKDTLVQHQIIHTGARPYECSECGKAFSRKDTLVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SLIKHRRVHTGARSYVCSKCGKAFGCKDTLVQHQIIHTGARPYECSECGKAFSRKDTLVQ
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KB6 HQKIHTGERPYECGECGKFFSHSSNLIVHQRIHTGAKPYECNECGKCFSHNSSLILHQRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 HQKIHTGERPYECGECGKFFSHSSNLIVHQRIHTGAKPYECNECGKCFSHNSSLILHQRV
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600 610
pF1KB6 HTGARPYVCSECGKAYISSSHLVQHKKVHTGARPYECSECGKFFSRNSGLILHQRVHTGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 HTGARPYVCSECGKAYISSSHLVQHKKVHTGARPYECSECGKFFSRNSGLILHQRVHTGE
520 530 540 550 560 570
620 630 640 650
pF1KB6 KPYVCSECGKAYSRSSHLVRHQKAHTGERAHECNSFGGPLAASLKLV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KPYVCSECGKAYSRSSHLVRHQKAHTGERAHECNSFGGPLAASLKLV
580 590 600 610
>>CCDS77365.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 (706 aa)
initn: 4350 init1: 4350 opt: 4350 Z-score: 2411.6 bits: 456.6 E(32554): 5.3e-128
Smith-Waterman score: 4492; 93.1% identity (93.2% similar) in 691 aa overlap (16-659:16-706)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MAAAVLMDRVQSCVTFEDVFVYFSREEWELLEEAQRFLYRDVMLENFALVATL-------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MAAAVLMDRVQSCVTFEDVFVYFSREEWELLEEAQRFLYRDVMLENFALVATLAFIFPVP
10 20 30 40 50 60
60 70
pF1KB6 ----------------------------------------GFWCEAEHEAPSEQSVSVEG
::::::::::::::::::::
CCDS77 CSCAVGGGRKPWVPDRADITAATVKETYRGHGPAEWELEEGFWCEAEHEAPSEQSVSVEG
70 80 90 100 110 120
80 90 100 110 120 130
pF1KB6 VSQVRTAESGLFQKAHPCEMCDPLLKDILHLAEHQGSHLTQKLCTRGLCRRRFSFSANFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VSQVRTAESGLFQKAHPCEMCDPLLKDILHLAEHQGSHLTQKLCTRGLCRRRFSFSANFY
130 140 150 160 170 180
140 150 160 170 180 190
pF1KB6 QHQKQHNGENCFRGDDGGASFVKSCTVHMLGRSFTCREEGMDLPDSSGLFQHQTTYNRVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 QHQKQHNGENCFRGDDGGASFVKSCTVHMLGRSFTCREEGMDLPDSSGLFQHQTTYNRVS
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240 250
pF1KB6 PCRRTECMESFPHSSSLRQHQGDYDGQMLFSCGDEGKAFLDTFTLLDSQMTHAEVRPFRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PCRRTECMESFPHSSSLRQHQGDYDGQMLFSCGDEGKAFLDTFTLLDSQMTHAEVRPFRC
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 LPCGNVFKEKSALINHRKIHSGEISHVCKECGKAFIHLHHLKMHQKFHTGKRHYTCSECG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LPCGNVFKEKSALINHRKIHSGEISHVCKECGKAFIHLHHLKMHQKFHTGKRHYTCSECG
310 320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 KAFSRKDTLVQHQRVHTGERSYDCSECGKAYSRSSHLVQHQRIHTGERPYKCNECGKAFS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS77 KAFSRKDTLVQHQRVHTGERSYDCSECGKAYSRSSHLVQHQRIHTGERPYKCNKCGKAFS
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420 430
pF1KB6 RKDTLVQHQRFHTGERPYECSECGKFFSQSSHLIEHWRIHTGARPYECIECGKFFSHNSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 RKDTLVQHQRFHTGERPYECSECGKFFSQSSHLIEHWRIHTGARPYECIECGKFFSHNSS
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470 480 490
pF1KB6 LIKHRRVHTGARSYVCSKCGKAFGCKDTLVQHQIIHTGARPYECSECGKAFSRKDTLVQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LIKHRRVHTGARSYVCSKCGKAFGCKDTLVQHQIIHTGARPYECSECGKAFSRKDTLVQH
490 500 510 520 530 540
500 510 520 530 540 550
pF1KB6 QKIHTGERPYECGECGKFFSHSSNLIVHQRIHTGAKPYECNECGKCFSHNSSLILHQRVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 QKIHTGERPYECGECGKFFSHSSNLIVHQRIHTGAKPYECNECGKCFSHNSSLILHQRVH
550 560 570 580 590 600
560 570 580 590 600 610
pF1KB6 TGARPYVCSECGKAYISSSHLVQHKKVHTGARPYECSECGKFFSRNSGLILHQRVHTGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TGARPYVCSECGKAYISSSHLVQHKKVHTGARPYECSECGKFFSRNSGLILHQRVHTGEK
610 620 630 640 650 660
620 630 640 650
pF1KB6 PYVCSECGKAYSRSSHLVRHQKAHTGERAHECNSFGGPLAASLKLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PYVCSECGKAYSRSSHLVRHQKAHTGERAHECNSFGGPLAASLKLV
670 680 690 700
>>CCDS82405.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 (664 aa)
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CCDS12 KSYICMKCGLAFIRKAHLITHQIIHTGEKPYKCGHCGKLFTSKSQLHVHKRIHTGEKPYV
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CCDS12 CNKCGKAFTNRSNLITHQKTHTGEKSYICSKCGKAFTQRSDLITHQRIHTGEKPYECNTC
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CCDS12 GKAFTQKSNLNIHQKIHTGERQYECHECGKAFNQKSILIVHQKIHTGEKPYVCTECGRAF
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CCDS12 IRKSNFITHQRIHTGEKPYECSDCGKSFTSKSQLLVHQPVHTGEKPYVCAECGKAFSGRS
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CCDS74 MPANWTSPQKSSALAPEDHGSSYEGSVSFRDVAIDFSREEWRHLDPSQRNLYRDVMLETY
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CCDS74 SHLLSVGYQVPEAEVVMLEQGKEPWALQGERPRQSCPGEKLWDHNQCRKILSYKQVSSQP
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CCDS74 QKMYPGEKAYECAKFEKIFTQKSQLKVHLKVLAGEKLYVCIECGKAFVQKPEFIIHQKTH
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CCDS74 MREKPFKCNECGKSFFQVSSLFRHQRIHTGEKLYEC--SQCGKGFSYNSDLSIHEKIHTG
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340 350 360 370 380 390
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640 650
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]