Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6203
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6203, 663 aa
1>>>pF1KB6203 663 - 663 aa - 663 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2173+/-0.000865; mu= 14.6450+/- 0.052
mean_var=75.7180+/-14.930, 0's: 0 Z-trim(107.2): 24 B-trim: 3 in 1/50
Lambda= 0.147392
statistics sampled from 9393 (9411) to 9393 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.66), E-opt: 0.2 (0.289), width: 16
Scan time: 3.740
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS180.1 PADI4 gene_id:23569|Hs108|chr1 ( 663) 4514 969.5 0
CCDS178.1 PADI1 gene_id:29943|Hs108|chr1 ( 663) 2592 560.8 2.1e-159
CCDS179.1 PADI3 gene_id:51702|Hs108|chr1 ( 664) 2495 540.2 3.4e-153
CCDS177.1 PADI2 gene_id:11240|Hs108|chr1 ( 665) 2276 493.6 3.6e-139
CCDS72715.1 PADI6 gene_id:353238|Hs108|chr1 ( 694) 1504 329.5 9.8e-90
>>CCDS180.1 PADI4 gene_id:23569|Hs108|chr1 (663 aa)
initn: 4514 init1: 4514 opt: 4514 Z-score: 5184.0 bits: 969.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4514; 99.4% identity (100.0% similar) in 663 aa overlap (1-663:1-663)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAQGTLIRVTPEQPTHAVCVLGTLTQLDICSSAPEDCTSFSINASPGVVVDIAHSPPAKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS18 MAQGTLIRVTPEQPTHAVCVLGTLTQLDICSSAPEDCTSFSINASPGVVVDIAHGPPAKK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 KSTGSSTWPLDPGVEVTLTMKAASGSTGDQKVQISYYGPKTPPVKALLYLTAVEISLCAD
:::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS18 KSTGSSTWPLDPGVEVTLTMKVASGSTGDQKVQISYYGPKTPPVKALLYLTGVEISLCAD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 ITRTGKVKPTRAVKDQRTWTWGPCGQGAILLVNCDRDNLESSAMDCEDDEVLDSEDLQDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 ITRTGKVKPTRAVKDQRTWTWGPCGQGAILLVNCDRDNLESSAMDCEDDEVLDSEDLQDM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 SLMTLSTKTPKDFFTNHTLVLHVARSEMDKVRVFQATRGKLSSKCSVVLGPKWPSHYLMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 SLMTLSTKTPKDFFTNHTLVLHVARSEMDKVRVFQATRGKLSSKCSVVLGPKWPSHYLMV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 PGGKHNMDFYVEALAFPDTNFPGLITLTISLLDTSNLELPEAVVFQDSVVFRVAPWIMTP
:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 PGGKHNMDFYVEALAFPDTDFPGLITLTISLLDTSNLELPEAVVFQDSVVFRVAPWIMTP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 NTQPPQEVYACSIFENEDFLKSVTTLAMKAKCKLTICPEEENMDDQWMQDEMEIGYIQAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 NTQPPQEVYACSIFENEDFLKSVTTLAMKAKCKLTICPEEENMDDQWMQDEMEIGYIQAP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 HKTLPVVFDSPRNRGLKEFPIKRVMGPDFGYVTRGPQTGGISGLDSFGNLEVSPPVTVRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 HKTLPVVFDSPRNRGLKEFPIKRVMGPDFGYVTRGPQTGGISGLDSFGNLEVSPPVTVRG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 KEYPLGRILFGDSCYPSNDSRQMHQALQDFLSAQQVQAPVKLYSDWLSVGHVDEFLSFVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 KEYPLGRILFGDSCYPSNDSRQMHQALQDFLSAQQVQAPVKLYSDWLSVGHVDEFLSFVP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 APDRKGFRLLLASPRSCYKLFQEQQNEGHGEALLFEGIKKKKQQKIKNILSNKTLREHNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 APDRKGFRLLLASPRSCYKLFQEQQNEGHGEALLFEGIKKKKQQKIKNILSNKTLREHNS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 FVERCIDWNRELLKRELGLAESDIIDIPQLFKLKEFSKAEAFFPNMVNMLVLGKHLGIPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 FVERCIDWNRELLKRELGLAESDIIDIPQLFKLKEFSKAEAFFPNMVNMLVLGKHLGIPK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 PFGPVINGRCCLEEKVCSLLEPLGLQCTFINDFFTYHIRHGEVHCGTNVRRKPFSFKWWN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 PFGPVINGRCCLEEKVCSLLEPLGLQCTFINDFFTYHIRHGEVHCGTNVRRKPFSFKWWN
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 MVP
:::
CCDS18 MVP
>>CCDS178.1 PADI1 gene_id:29943|Hs108|chr1 (663 aa)
initn: 762 init1: 762 opt: 2592 Z-score: 2975.2 bits: 560.8 E(32554): 2.1e-159
Smith-Waterman score: 2592; 56.7% identity (81.3% similar) in 669 aa overlap (1-663:1-663)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAQGTLIRVTPEQPTHAVCVLGTLTQLDICSSAPEDCTSFSINASPGVVVDIAHSPPAKK
:: ..... ..:::::::.:. ...:: :..:. .:: ...: :: : .... :
CCDS17 MAPKRVVQLSLKMPTHAVCVVGVEAHVDIHSDVPKGANSFRVSGSSGVEVFMVYNRTRVK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB6 KSTGSSTWPLDPGVEVTLTMKAASGSTGDQKVQISYYGPKTPPV--KALLYLTAVEISLC
. :.. :::: ....... .:: : ::..::.: . . ...::::.:.:::
CCDS17 EPIGKARWPLDTDADMVVSVGTASKELKDFKVRVSYFGEQEDQALGRSVLYLTGVDISLE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 ADITRTGKVKPTRAVKDQRTWTWGPCGQGAILLVNCDRDNLESSAMDCEDDEVLDSEDLQ
.: :::::: :. :..:: ::: : :::::::::::: .:. : . ... :::
CCDS17 VDTGRTGKVK--RSQGDKKTWRWGPEGYGAILLVNCDRDNHRSAEPDLTHSWLMSLADLQ
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 DMSLMTLSTKTPKDFFTNHTLVLHVARSEMDKVRVFQATRGKLSSKCSVVLGPKWPSHYL
::: : :: . : .: .: :::.: :. .:::: : :. : . ::::. :. .
CCDS17 DMSPMLLSCNGPDKLFDSHKLVLNVPFSDSKRVRVFCARGGNSLSDYKQVLGPQCLSYEV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 MVPGGKHNMDFYVEALAFPDTNFPGLITLTISLLDTSNLELPEAVVFQDSVVFRVAPWIM
:.... ::::.:.:::..: ::..:..::.: .. :::...: :.: ::.:::::
CCDS17 ERQPGEQEIKFYVEGLTFPDADFLGLVSLSVSLVDPGT--LPEVTLFTDTVGFRMAPWIM
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 TPNTQPPQEVYACSIFE----NEDFLKSVTTLAMKAKCKLTICPEEENMDDQWMQDEMEI
:::::::.:.:.: ... :: ::.... :..::.:::::::. :: .:.:.:::::.
CCDS17 TPNTQPPEELYVCRVMDTHGSNEKFLEDMSYLTLKANCKLTICPQVENRNDRWIQDEMEF
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 GYIQAPHKTLPVVFDSPRNRGLKEFPIKRVMGPDFGYVTRGPQTGGISGLDSFGNLEVSP
:::.::::..:::::::::::::.:: ::..::::::::: : :.:::::::.:::
CCDS17 GYIEAPHKSFPVVFDSPRNRGLKDFPYKRILGPDFGYVTREIPLPGPSSLDSFGNLDVSP
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 PVTVRGKEYPLGRILFGDSCYPSNDSRQMHQALQDFLSAQQVQAPVKLYSDWLSVGHVDE
:::: : ::::::::.:.: .:.. .::: .:...::.::::::::.:::::::::::::
CCDS17 PVTVGGTEYPLGRILIGSS-FPKSGGRQMARAVRNFLKAQQVQAPVELYSDWLSVGHVDE
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 FLSFVPAPDRKGFRLLLASPRSCYKLFQEQQNEGHGEALLFEGIKKKKQQKIKNILSNKT
::.:::. :.:::::::::: .: :::::...::.::: :.:.:.. ...:...:...
CCDS17 FLTFVPTSDQKGFRLLLASPSACLKLFQEKKEEGYGEAAQFDGLKHQAKRSINEMLADRH
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 LREHNSFVERCIDWNRELLKRELGLAESDIIDIPQLFKLKEFSKAEAFFPNMVNMLVLGK
:.. : ...::::::..::::::::::::.:::::: ::.: ::::::.::::.::::
CCDS17 LQRDNLHAQKCIDWNRNVLKRELGLAESDIVDIPQLFFLKNFY-AEAFFPDMVNMVVLGK
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB6 HLGIPKPFGPVINGRCCLEEKVCSLLEPLGLQCTFINDFFTYHIRHGEVHCGTNVRRKPF
.::::::.::.::::::::::: ::::::::.: ::.:...:: .::.:::::::::::
CCDS17 YLGIPKPYGPIINGRCCLEEKVQSLLEPLGLHCIFIDDYLSYHELQGEIHCGTNVRRKPF
600 610 620 630 640 650
660
pF1KB6 SFKWWNMVP
::::::::
CCDS17 PFKWWNMVP
660
>>CCDS179.1 PADI3 gene_id:51702|Hs108|chr1 (664 aa)
initn: 2042 init1: 1290 opt: 2495 Z-score: 2863.7 bits: 540.2 E(32554): 3.4e-153
Smith-Waterman score: 2495; 56.1% identity (77.5% similar) in 672 aa overlap (1-663:1-664)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAQGTLIRVTPEQPTHAVCVLGTLTQLDICSSAPEDCTSFSINASPGVVVDIAHSPPAKK
:. ..::. :.:: :::: :. : .:: .:.:: : . ..::: . :. . .
CCDS17 MSLQRIVRVSLEHPTSAVCVAGVETLVDIYGSVPEGTEMFEVYGTPGVDIYISPNMERGR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB6 KSTGSSTWPLDPGVEVTLTMKAASGSTGDQKVQISYYGPKTP-PVK-ALLYLTAVEISLC
. . . : .: .:. ..:.. :.. .:..:::::.. . : :. :.:::: :.:::
CCDS17 ERADTRRWRFDATLEIIVVMNSPSNDLNDSHVQISYHSSHEPLPLAYAVLYLTCVDISLD
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 ADITRTGKVKPTRAVKDQRTWTWGPCGQGAILLVNCDRDNLESSAMDCEDDEVLDSEDLQ
:.. :. : :.: :.::: : :.:::::::::. ...: :..: .::.
CCDS17 CDLNCEGR--QDRNFVDKRQWVWGPSGYGGILLVNCDRDDPSCDVQDNCDQHVHCLQDLE
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 DMSLMTLSTKTPKDFFTNHTLVLHVARSEMDKVRVFQATRGKLSSKCSV---VLGPKWPS
:::.:.: :. : .: .: ::::.. . ...::. : . : . ::: :
CCDS17 DMSVMVLRTQGPAALFDDHKLVLHTSSYDAKRAQVFHIC-GP-EDVCEAYRHVLGQDKVS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 HYLMVPGGKHNMD-FYVEALAFPDTNFPGLITLTISLLDTSNLELPEAVVFQDSVVFRVA
. :: . . . :.::.:.:::..: :::.. ..::: :: .. . .: :.::::::
CCDS17 YE--VPRLHGDEERFFVEGLSFPDAGFTGLISFHVTLLDDSNEDFSASPIFTDTVVFRVA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 PWIMTPNTQPPQEVYACSIFENEDFLKSVTTLAMKAKCKLTICPEEENMDDQWMQDEMEI
::::::.: :: :::.: . .: :. .:. :: :: :::::::. :: .:.:.:::::.
CCDS17 PWIMTPSTLPPLEVYVCRVRNNTCFVDAVAELARKAGCKLTICPQAENRNDRWIQDEMEL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 GYIQAPHKTLPVVFDSPRNRGLKEFPIKRVMGPDFGYVTRGPQTGGISGLDSFGNLEVSP
::.:::::::::::::::: :..:: ::..::::::::: :. ..:::::::::::::
CCDS17 GYVQAPHKTLPVVFDSPRNGELQDFPYKRILGPDFGYVTREPRDRSVSGLDSFGNLEVSP
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 PVTVRGKEYPLGRILFGDSCYPSNDSRQMHQALQDFLSAQQVQAPVKLYSDWLSVGHVDE
::.. ::::::::::.: . :....:.. :...::: ::.:: ::.:. :::.::::::
CCDS17 PVVANGKEYPLGRILIGGN-LPGSSGRRVTQVVRDFLHAQKVQPPVELFVDWLAVGHVDE
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 FLSFVPAPDRKGFRLLLASPRSCYKLFQEQQNEGHGEALLFEGIKKKKQQK---IKNILS
::::::::: ::::.::::: .:.:::::.:. :::.::::.:. .: : :...::
CCDS17 FLSFVPAPDGKGFRMLLASPGACFKLFQEKQKCGHGRALLFQGVVDDEQVKTISINQVLS
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 NKTLREHNSFVERCIDWNRELLKRELGLAESDIIDIPQLFKLKEFSKAEAFFPNMVNMLV
:: : ..:.::. :::::::.::::::::: :::::::::: : .:: ::::..:::::
CCDS17 NKDLINYNKFVQSCIDWNREVLKRELGLAECDIIDIPQLFKT-ERKKATAFFPDLVNMLV
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB6 LGKHLGIPKPFGPVINGRCCLEEKVCSLLEPLGLQCTFINDFFTYHIRHGEVHCGTNVRR
:::::::::::::.::: ::::::: ::::::::.::::.:: ::. :::::::::: :
CCDS17 LGKHLGIPKPFGPIINGCCCLEEKVRSLLEPLGLHCTFIDDFTPYHMLHGEVHCGTNVCR
600 610 620 630 640 650
660
pF1KB6 KPFSFKWWNMVP
::::::::::::
CCDS17 KPFSFKWWNMVP
660
>>CCDS177.1 PADI2 gene_id:11240|Hs108|chr1 (665 aa)
initn: 2210 init1: 1062 opt: 2276 Z-score: 2612.0 bits: 493.6 E(32554): 3.6e-139
Smith-Waterman score: 2276; 50.6% identity (76.3% similar) in 668 aa overlap (1-663:1-665)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAQGTLIRVTPEQPTHAVCVLGTLTQLDICSSAPEDCTSFSINASPGVVVDIAHSPPAKK
: . .:. . ..:: :::: :. :.:: .::.. : : :..... :..
CCDS17 MLRERTVRLQYGSRVEAVYVLGTYLWTDVYSAAPAGAQTFSLKHSEHVWVEVVRDGEAEE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB6 KST-GSSTWPLDPGVEVTLTMKAASGSTGDQKVQISYYGPK-TPPV-KALLYLTAVEISL
.: :.. : :.:.. . .::. :: ....:: ..:: . . :. .: :.:::.::::
CCDS17 VATNGKQRWLLSPSTTLRVTMSQASTEASSDKVTVNYYDEEGSIPIDQAGLFLTAIEISL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 CADITRTGKVKPTRAVKDQRTWTWGPCGQGAILLVNCDRDNLESSAMDCEDDEVLDSEDL
.: : : :. . : .::::: ::::::::::::.. ::.:..: ..:::
CCDS17 DVDADRDGVVEKNNPKKA--SWTWGPEGQGAILLVNCDRETPWLPKEDCRDEKVYSKEDL
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 QDMSLMTLSTKTPKDFFTNHTLVLHVARSEMDKVRVFQATRGKLSSKCSVVLGPKWPSHY
.::: : : :: : . ... .::... :. ::: :: . .... .:: . :
CCDS17 KDMSQMILRTKGPDRLPAGYEIVLYISMSDSDKVGVFYVENPFFGQRYIHILGRRKLYHV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 LMVPGGKHNMDFYVEALAFPDTNFPGLITLTISLLDTSNLELPEAVVFQDSVVFRVAPWI
. ::. .. :.::.: ::: .: ::... .:::. ..: . .: :.:.::.::::
CCDS17 VKYTGGSAELLFFVEGLCFPDEGFSGLVSIHVSLLEYMAQDIPLTPIFTDTVIFRIAPWI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 MTPNTQPPQEVYACSIFENEDFLKSVTTLAMKAKCKLTICPEEENMDDQWMQDEMEIGYI
:::: :: :..: . .: ::: : .:. :..:.: .: . : :.:.:::.:.:::
CCDS17 MTPNILPPVSVFVCCMKDNYLFLKEVKNLVEKTNCELKVCFQYLNRGDRWIQDEIEFGYI
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 QAPHKTLPVVFDSPRNRGLKEFPIKRVMGPDFGYVTRGPQTGGISGLDSFGNLEVSPPVT
.:::: .:::.::::. .::.::.:...::::::::: : ....::::::::::::::
CCDS17 EAPHKGFPVVLDSPRDGNLKDFPVKELLGPDFGYVTREPLFESVTSLDSFGNLEVSPPVT
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 VRGKEYPLGRILFGDSCYPSNDSRQMHQALQDFLSAQQVQAPVKLYSDWLSVGHVDEFLS
: :: :::::::.:.: .: . .:.: ....:::.::::::::.::::::.:::::::.:
CCDS17 VNGKTYPLGRILIGSS-FPLSGGRRMTKVVRDFLKAQQVQAPVELYSDWLTVGHVDEFMS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 FVPAPDRKGFRLLLASPRSCYKLFQEQQNEGHGEALLFEGIK--KKKQQKIKNILSNKTL
::: : : : ::.:: .:::::.:.:..:::::..:.:. ..:. :..::::..:
CCDS17 FVPIPGTKKFLLLMASTSACYKLFREKQKDGHGEAIMFKGLGGMSSKRITINKILSNESL
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 REHNSFVERCIDWNRELLKRELGLAESDIIDIPQLFKLKEFSKAEAFFPNMVNMLVLGKH
..: . .::.::::..::.::::.:.::::.: :::. : .:.:::::::::.:: :
CCDS17 VQENLYFQRCLDWNRDILKKELGLTEQDIIDLPALFKMDEDHRARAFFPNMVNMIVLDKD
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB6 LGIPKPFGPVINGRCCLEEKVCSLLEPLGLQCTFINDFFTYHIRHGEVHCGTNVRRKPFS
::::::::: .. .:::: .: .:::::::.::::.:. .:: ::::::::::::::.
CCDS17 LGIPKPFGPQVEEECCLEMHVRGLLEPLGLECTFIDDISAYHKFLGEVHCGTNVRRKPFT
600 610 620 630 640 650
660
pF1KB6 FKWWNMVP
::::.:::
CCDS17 FKWWHMVP
660
>>CCDS72715.1 PADI6 gene_id:353238|Hs108|chr1 (694 aa)
initn: 1875 init1: 945 opt: 1504 Z-score: 1724.5 bits: 329.5 E(32554): 9.8e-90
Smith-Waterman score: 2045; 44.6% identity (73.7% similar) in 688 aa overlap (1-663:9-694)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MAQGTLIRVTPEQPTHAVCVLGTLTQLDICSSAPEDCTSFSINASPGVVVDI
:. ..:... ..:.:::::::: ::. . ::. : :.:..: :..:.
CCDS72 MVSVEGRAMSFQSIIHLSLDSPVHAVCVLGTEICLDLSGCAPQKCQCFTIHGSGRVLIDV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 AHSPPAKKKSTGSSTWPLDPGVEVTLTMKAASGSTGDQKVQISYYGP-KTPPV-KALLYL
:.. ..:... . :::. . .:. : . : :. .::...:::: . :: :.:::
CCDS72 ANTVISEKEDA-TIWWPLSDPTYATVKMTSPSPSVDADKVSVTYYGPNEDAPVGTAVLYL
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 TAVEISLCADITRTGKVKPTRAVKDQRTWTWGPCGQGAILLVNCDRDNLESSAMDCEDDE
:..:.:: .:: :.:.:. . . .. : ::: : ::::::::. .. .. : . .
CCDS72 TGIEVSLEVDIYRNGQVEMSSDKQAKKKWIWGPSGWGAILLVNCNPADVGQQLEDKKTKK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 VLDSEDLQDMSLMTLSTKTPKDFFTNHTLVLHVARSEMDKVRVFQATRGKLSSKCSVVLG
:. ::.. ..: :::... :. .. .. ::::... : :.::. . . :: .:::
CCDS72 VIFSEEITNLSQMTLNVQGPSCILKKYRLVLHTSKEESKKARVYWPQKDN-SSTFELVLG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB6 PKWPSHYLMVPGGKHNMDFYVEALAFPDTNFPGLITLTISLLDTS-NLELPEAVVFQDSV
: .. : . :.. . :::::.:::...: :::. ..::.. : . .::.:...:.:
CCDS72 PDQHAYTLALLGNHLKETFYVEAIAFPSAEFSGLISYSVSLVEESQDPSIPETVLYKDTV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 VFRVAPWIMTPNTQPPQEVYACSIFENEDFLKSVTTLAMKAKCKLTICPEEENMDDQWMQ
:::::: .. : :: : ::: : .. . :. .:: :. :.. ... :. : .:.:
CCDS72 VFRVAPCVFIPCTQVPLEVYLCRELQLQGFVDTVTKLSEKSNSQVASVYEDPNRLGRWLQ
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 DEMEIGYIQAPHKTLPVVFDSPRNRGLKEFPIKRVMGPDFGYVTRGPQTGGISGLDSFGN
::: . : :::::: ...:.:. : :::.: ..: .::. . . ....::.::
CCDS72 DEMAFCYTQAPHKTTSLILDTPQAADLDEFPMKYSLSPGIGYMIQDTEDHKVASMDSIGN
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB6 LEVSPPVTVRGKEYPLGRILFGDSCYPSNDSRQMHQALQDFLSAQQVQAPVKLYSDWLSV
: ::::: :.::::::::.:.:.: ::: ..: : ..:.::: ::::::::.:::::: .
CCDS72 LMVSPPVKVQGKEYPLGRVLIGSSFYPSAEGRAMSKTLRDFLYAQQVQAPVELYSDWLMT
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB6 GHVDEFLSFVPAPDR----KGFRLLLASPRSCYKLFQEQQNEGHGEALLFEGIKK-----
::::::. :.:. :. ::: :::::: .:::::.:.:.::.:.::::. ..
CCDS72 GHVDEFMCFIPTDDKNEGKKGFLLLLASPSACYKLFREKQKEGYGDALLFDELRADQLLS
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570
pF1KB6 --KKQQKIKNILSNKTLREHNSFVERCIDWNRELLKRELGLAESDIIDIPQLFKLKEFSK
.. . : ..:....:...: .::.:: ::..:: ::::.:.:::.::::: :.....
CCDS72 NGREAKTIDQLLADESLKKQNEYVEKCIHLNRDILKTELGLVEQDIIEIPQLFCLEKLTN
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620
pF1KB6 -----------AEAFFPNMVNMLVLGKHLGIPKPFGPVINGRCCLEEKVCSLLEPLGLQC
:. .::... :.:.::.::::::::: :.: ::::::.: ::::::..:
CCDS72 IPSDQQPKRSFARPYFPDLLRMIVMGKNLGIPKPFGPQIKGTCCLEEKICCLLEPLGFKC
600 610 620 630 640 650
630 640 650 660
pF1KB6 TFINDFFTYHIRHGEVHCGTNVRRKPFSFKWWNMVP
:::::: : . :.. .:.:: ::.::::.:::
CCDS72 TFINDFDCYLTEVGDICACANIRRVPFAFKWWKMVP
660 670 680 690
663 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 14:11:52 2016 done: Sat Nov 5 14:11:52 2016
Total Scan time: 3.740 Total Display time: 0.090
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]