Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6207
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6207, 665 aa
1>>>pF1KB6207 665 - 665 aa - 665 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9175+/-0.00155; mu= 13.3484+/- 0.093
mean_var=234.7953+/-44.583, 0's: 0 Z-trim(108.3): 985 B-trim: 44 in 1/50
Lambda= 0.083701
statistics sampled from 9069 (10150) to 9069 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.662), E-opt: 0.2 (0.312), width: 16
Scan time: 3.730
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12316.1 ZNF333 gene_id:84449|Hs108|chr19 ( 665) 4642 574.8 1.4e-163
CCDS74298.1 ZNF333 gene_id:84449|Hs108|chr19 ( 303) 2043 260.5 2.6e-69
CCDS7195.1 ZNF25 gene_id:219749|Hs108|chr10 ( 456) 1422 185.7 1.2e-46
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 1407 184.0 4.5e-46
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1398 183.0 1.1e-45
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1398 183.0 1.1e-45
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1398 183.0 1.1e-45
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1398 183.1 1.2e-45
CCDS14278.1 ZNF157 gene_id:7712|Hs108|chrX ( 506) 1378 180.5 5.2e-45
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 1364 178.7 1.6e-44
CCDS74349.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 647) 1331 174.9 3.1e-43
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1325 174.0 4.2e-43
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1325 174.3 5.5e-43
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1325 174.3 5.5e-43
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1323 173.9 5.6e-43
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1323 174.0 6e-43
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 1322 173.9 6.6e-43
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 1322 173.9 6.6e-43
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 1322 173.9 6.8e-43
CCDS82413.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 687) 1316 173.2 1.1e-42
CCDS12973.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 715) 1316 173.2 1.1e-42
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1313 172.6 1.2e-42
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX ( 779) 1315 173.1 1.3e-42
CCDS6787.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 630) 1313 172.7 1.4e-42
CCDS65109.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 631) 1313 172.7 1.4e-42
CCDS65110.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 645) 1313 172.8 1.4e-42
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1313 172.8 1.4e-42
CCDS75078.1 ZNF718 gene_id:255403|Hs108|chr4 ( 478) 1308 172.0 1.8e-42
CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9 ( 699) 1307 172.1 2.4e-42
CCDS42495.1 ZNF699 gene_id:374879|Hs108|chr19 ( 642) 1304 171.7 2.9e-42
CCDS12945.1 ZNF471 gene_id:57573|Hs108|chr19 ( 626) 1302 171.4 3.4e-42
CCDS42504.1 ZNF709 gene_id:163051|Hs108|chr19 ( 641) 1299 171.1 4.4e-42
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1293 170.3 6.9e-42
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1293 170.3 7.3e-42
CCDS45983.1 ZNF433 gene_id:163059|Hs108|chr19 ( 673) 1293 170.4 7.5e-42
CCDS12495.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 616) 1292 170.2 7.8e-42
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1292 170.3 8.7e-42
CCDS12409.1 ZNF14 gene_id:7561|Hs108|chr19 ( 642) 1290 170.0 9.4e-42
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 1293 170.6 9.8e-42
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 1287 169.6 1.2e-41
CCDS42532.1 ZNF253 gene_id:56242|Hs108|chr19 ( 499) 1282 168.9 1.6e-41
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1284 169.3 1.6e-41
CCDS75075.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 648) 1281 168.9 2e-41
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 1280 168.7 2e-41
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 1280 168.7 2.1e-41
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 1280 168.8 2.1e-41
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 1279 168.6 2.2e-41
CCDS12968.1 ZNF606 gene_id:80095|Hs108|chr19 ( 792) 1278 168.7 2.9e-41
CCDS35235.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 620) 1275 168.1 3.2e-41
CCDS35236.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 639) 1275 168.2 3.3e-41
>>CCDS12316.1 ZNF333 gene_id:84449|Hs108|chr19 (665 aa)
initn: 4642 init1: 4642 opt: 4642 Z-score: 3050.5 bits: 574.8 E(32554): 1.4e-163
Smith-Waterman score: 4642; 100.0% identity (100.0% similar) in 665 aa overlap (1-665:1-665)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MESVTFEDVAVEFIQEWALLDSARRSLCKYRMLDQCRTLASRGTPPCKPSCVSQLGQRAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MESVTFEDVAVEFIQEWALLDSARRSLCKYRMLDQCRTLASRGTPPCKPSCVSQLGQRAE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 PKATERGILRATGVAWESQLKPEELPSMQDLLEEASSRDMQMGPGLFLRMQLVPSIEERE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PKATERGILRATGVAWESQLKPEELPSMQDLLEEASSRDMQMGPGLFLRMQLVPSIEERE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 TPLTREDRPALQEPPWSLGCTGLKAAMQIQRVVIPVPTLGHRNPWVARDSAVPARDPAWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TPLTREDRPALQEPPWSLGCTGLKAAMQIQRVVIPVPTLGHRNPWVARDSAVPARDPAWL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 QEDKVEEEAMAPGLPTACSQEPVTFADVAVVFTPEEWVFLDSTQRSLYRDVMLENYRNLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QEDKVEEEAMAPGLPTACSQEPVTFADVAVVFTPEEWVFLDSTQRSLYRDVMLENYRNLA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 SVADQLCKPNALSYLEERGEQWTTDRGVLSDTCAEPQCQPQEAIPSQDTFTEILSIDVKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SVADQLCKPNALSYLEERGEQWTTDRGVLSDTCAEPQCQPQEAIPSQDTFTEILSIDVKG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 EQPQPGEKLYKYNELEKPFNSIEPLFQYQRIHAGEASCECQEIRNSFFQSAHLIVPEKIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EQPQPGEKLYKYNELEKPFNSIEPLFQYQRIHAGEASCECQEIRNSFFQSAHLIVPEKIR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 SGDKSYACNKCEKSFRYSSDLIRHEKTHTAEKCFDCQECGQAFKYSSNLRRHMRTHTGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SGDKSYACNKCEKSFRYSSDLIRHEKTHTAEKCFDCQECGQAFKYSSNLRRHMRTHTGEK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 PFECSQCGKTFTRNFNLILHQRNHTGEKPYECKDCGKAFNQPSSLRSHVRTHTGEKPFEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PFECSQCGKTFTRNFNLILHQRNHTGEKPYECKDCGKAFNQPSSLRSHVRTHTGEKPFEC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 SQCGKAFREHSSLKTHLRTHTREKPYECNQCGKPFRTSTHLNVHKRIHTGEKLYECATCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SQCGKAFREHSSLKTHLRTHTREKPYECNQCGKPFRTSTHLNVHKRIHTGEKLYECATCG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 QVLSRLSTLKSHMRTHTGEKPYVCQECGRAFSEPSSLRKHARTHSGKKPYACQECGRAFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QVLSRLSTLKSHMRTHTGEKPYVCQECGRAFSEPSSLRKHARTHSGKKPYACQECGRAFG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 QSSHLIVHVRTHSAGRPYQCNQCEKAFRHSSSLTVHKRTHVGRETIRNGSLPLSMSHPYC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QSSHLIVHVRTHSAGRPYQCNQCEKAFRHSSSLTVHKRTHVGRETIRNGSLPLSMSHPYC
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 GPLAN
:::::
CCDS12 GPLAN
>>CCDS74298.1 ZNF333 gene_id:84449|Hs108|chr19 (303 aa)
initn: 2043 init1: 2043 opt: 2043 Z-score: 1357.9 bits: 260.5 E(32554): 2.6e-69
Smith-Waterman score: 2043; 100.0% identity (100.0% similar) in 300 aa overlap (1-300:1-300)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MESVTFEDVAVEFIQEWALLDSARRSLCKYRMLDQCRTLASRGTPPCKPSCVSQLGQRAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MESVTFEDVAVEFIQEWALLDSARRSLCKYRMLDQCRTLASRGTPPCKPSCVSQLGQRAE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 PKATERGILRATGVAWESQLKPEELPSMQDLLEEASSRDMQMGPGLFLRMQLVPSIEERE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 PKATERGILRATGVAWESQLKPEELPSMQDLLEEASSRDMQMGPGLFLRMQLVPSIEERE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 TPLTREDRPALQEPPWSLGCTGLKAAMQIQRVVIPVPTLGHRNPWVARDSAVPARDPAWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 TPLTREDRPALQEPPWSLGCTGLKAAMQIQRVVIPVPTLGHRNPWVARDSAVPARDPAWL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 QEDKVEEEAMAPGLPTACSQEPVTFADVAVVFTPEEWVFLDSTQRSLYRDVMLENYRNLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QEDKVEEEAMAPGLPTACSQEPVTFADVAVVFTPEEWVFLDSTQRSLYRDVMLENYRNLA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 SVADQLCKPNALSYLEERGEQWTTDRGVLSDTCAEPQCQPQEAIPSQDTFTEILSIDVKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SVADQLCKPNALSYLEERGEQWTTDRGVLSDTCAEPQCQPQEAIPSQDTFTEILSIDVKG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 EQPQPGEKLYKYNELEKPFNSIEPLFQYQRIHAGEASCECQEIRNSFFQSAHLIVPEKIR
CCDS74 PPN
>>CCDS7195.1 ZNF25 gene_id:219749|Hs108|chr10 (456 aa)
initn: 6006 init1: 1194 opt: 1422 Z-score: 950.8 bits: 185.7 E(32554): 1.2e-46
Smith-Waterman score: 1422; 45.7% identity (72.1% similar) in 451 aa overlap (200-643:5-451)
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 SAVPARDPAWLQEDKVEEEAMAPGLPTACSQEPVTFADVAVVFTPEEWVFLDSTQRSLYR
: :::. :: : :: ::: .: .::.::.
CCDS71 MNKFQGPVTLKDVIVEFTKEEWKLLTPAQRTLYK
10 20 30
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 DVMLENYRNLASVADQLCKPNALSYLEERGEQWTTD-----RGVLSD--TCAEPQCQPQE
::::::: .:.::. .. ::::. :.. : : . :: : . . . . ::
CCDS71 DVMLENYSHLVSVGYHVNKPNAVFKLKQGKEPWILEVEFPHRGFPEDLWSIHDLEARYQE
40 50 60 70 80 90
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 AIPSQDTFTEILSIDVKGEQPQPGEKLYKYNELEKPFNSIEPLFQYQRIHAGEASCECQE
. ... :. .: .. . :: . .: : : . :. .:. :. : .:..
CCDS71 SQAGNSRNGEL----TKHQKTHTTEKACECKECGKFFCQKSALIVHQHTHSKGKSYDCDK
100 110 120 130 140 150
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 IRNSFFQSAHLIVPEKIRSGDKSYACNKCEKSFRYSSDLIRHEKTHTAEKCFDCQECGQA
.:: .. :: .::.. ::.: :..:.: : . :.: :: .::..:: ..:..: ..
CCDS71 CGKSFSKNEDLIRHQKIHTRDKTYECKECKKIFYHLSSLSRHLRTHAGEKPYECNQCEKS
160 170 180 190 200 210
410 420 430 440 450 460
pF1KB6 FKYSSNLRRHMRTHTGEKPFECSQCGKTFTRNFNLILHQRNHTGEKPYECKDCGKAFNQP
: . .: .:..::::::::::..::: : . :..::..::::::::::.:::::.:
CCDS71 FYQKPHLTEHQKTHTGEKPFECTECGKFFYVKAYLMVHQKTHTGEKPYECKECGKAFSQK
220 230 240 250 260 270
470 480 490 500 510 520
pF1KB6 SSLRSHVRTHTGEKPFECSQCGKAFREHSSLKTHLRTHTREKPYECNQCGKPFRTSTHLN
: : : : ::::::..:..::: : ..: :::: :.:: ::::::..: : : .. :.
CCDS71 SHLTVHQRMHTGEKPYKCKECGKFFSRNSHLKTHQRSHTGEKPYECKECRKCFYQKSALT
280 290 300 310 320 330
530 540 550 560 570 580
pF1KB6 VHKRIHTGEKLYECATCGQVLSRLSTLKSHMRTHTGEKPYVCQECGRAFSEPSSLRKHAR
::.: ::::: .:: ::... : : .:.: ::::::: : :::..:. : :: : :
CCDS71 VHQRTHTGEKPFECNKCGKTFYYKSDLTKHQRKHTGEKPYECTECGKSFAVNSVLRLHQR
340 350 360 370 380 390
590 600 610 620 630 640
pF1KB6 THSGKKPYACQECGRAFGQSSHLIVHVRTHSAGRPYQCNQCEKAFRHSSSLTVHKRTHVG
::.:.:::::.:::..:.:.::.:.: : :.. .::.:..: ..: ..:.::.:..::.
CCDS71 THTGEKPYACKECGKSFSQKSHFIIHQRKHTGEKPYECQECGETFIQKSQLTAHQKTHTK
400 410 420 430 440 450
650 660
pF1KB6 RETIRNGSLPLSMSHPYCGPLAN
.
CCDS71 KRNAEK
>>CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 (498 aa)
initn: 3349 init1: 1202 opt: 1407 Z-score: 940.6 bits: 184.0 E(32554): 4.5e-46
Smith-Waterman score: 1407; 44.2% identity (73.1% similar) in 475 aa overlap (169-642:4-469)
140 150 160 170 180 190
pF1KB6 GCTGLKAAMQIQRVVIPVPTLGHRNPWVARDSAVPARDPAWLQEDKVEEEAMAPGLPTAC
....:. :: ::... ::.:: :: ::
CCDS68 MLEEGVLPSPGPALPQEENTGEEGMAAGLLTAG
10 20 30
200 210 220 230 240 250
pF1KB6 SQEPVTFADVAVVFTPEEWVFLDSTQRSLYRDVMLENYRNLASVADQLCKPNALSYLEER
. . :..:.:.:. :.: : :: :. ... . . :.:. .. . .:. : ::.:
CCDS68 PRGSTFFSSVTVAFAQERWRCLVSTPRDRFKEGIPGKSRSLVLLGLPVSQPGMNSQLEQR
40 50 60 70 80 90
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 GEQWTTDRGVLSDTCAEPQCQPQEAIPSQDTFTEILSIDVKGEQPQPGEKLYKYNELEKP
: . : . : . . : .....: : :.: ::.. . ..:::
CCDS68 EGAWMLEGEDLRSP--SPGWKIISGSPPEQALSEASFQDPCVEMP-PGDSDHGTSDLEKS
100 110 120 130 140 150
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 FNSIEPLFQ-YQRIHAGEASCECQEIRNSFFQSAHLIVPEKIRSGDKSYACNKCEKSFRY
:: ..:... ::. . .: : .. :...... :.. : ::::.: :.: :
CCDS68 FN-LRPVLSPQQRVPVEARPRKC-ETHTESFKNSEILKPHRA----KPYACNECGKAFSY
160 170 180 190 200
380 390 400 410 420 430
pF1KB6 SSDLIRHEKTHTAEKCFDCQECGQAFKYSSNLRRHMRTHTGEKPFECSQCGKTFTRNFNL
:.: .:.:.::.:: ..:.:::.::. ::.: .:.: ::::::..::.::..:..: ::
CCDS68 CSSLSQHQKSHTGEKPYECSECGKAFSQSSSLIQHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQNANL
210 220 230 240 250 260
440 450 460 470 480 490
pF1KB6 ILHQRNHTGEKPYECKDCGKAFNQPSSLRSHVRTHTGEKPFECSQCGKAFREHSSLKTHL
:::.:::::::.:..: :::.. :.: .: : ::::::.:::.::::::. ..: .:
CCDS68 TKHQRTHTGEKPYRCSECEKAFSDCSALVQHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQ
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CCDS54 KAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFR
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CCDS54 QSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAP
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CCDS54 ERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTH
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CCDS14 MPANGTSPQRFPALIPGEPGRSFEGSVSFEDVAVDFTRQEWH
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CCDS14 RLDPAQRTMHKDVMLETYSNLASVGLCVAKPEMIFKLE-RGEELWILEEESSGHGYSGSL
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