Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6208
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6208, 720 aa
1>>>pF1KB6208 720 - 720 aa - 720 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4751+/-0.000936; mu= 8.3358+/- 0.056
mean_var=280.0401+/-58.002, 0's: 0 Z-trim(115.2): 907 B-trim: 362 in 1/54
Lambda= 0.076642
statistics sampled from 14748 (15736) to 14748 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.79), E-opt: 0.2 (0.483), width: 16
Scan time: 3.610
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7923.1 ZNF408 gene_id:79797|Hs108|chr11 ( 720) 5108 578.6 1.1e-164
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CCDS42504.1 ZNF709 gene_id:163051|Hs108|chr19 ( 641) 926 116.1 1.7e-25
CCDS42559.1 ZNF527 gene_id:84503|Hs108|chr19 ( 609) 924 115.9 1.9e-25
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CCDS4441.1 ZNF454 gene_id:285676|Hs108|chr5 ( 522) 912 114.5 4.3e-25
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 910 114.3 5.6e-25
CCDS13812.1 ZNF70 gene_id:7621|Hs108|chr22 ( 446) 906 113.7 6.1e-25
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 907 114.1 7.9e-25
CCDS32981.1 ZNF675 gene_id:171392|Hs108|chr19 ( 568) 904 113.6 8.4e-25
CCDS46212.1 ZNF814 gene_id:730051|Hs108|chr19 ( 855) 905 113.9 1e-24
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 889 111.7 2e-24
CCDS47738.1 ZNF786 gene_id:136051|Hs108|chr7 ( 782) 895 112.8 2.1e-24
CCDS12491.1 ZNF565 gene_id:147929|Hs108|chr19 ( 499) 891 112.1 2.1e-24
CCDS33048.1 ZNF235 gene_id:9310|Hs108|chr19 ( 738) 894 112.6 2.1e-24
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 889 111.9 2.4e-24
CCDS32916.1 ZNF136 gene_id:7695|Hs108|chr19 ( 540) 890 112.0 2.4e-24
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 889 111.9 2.4e-24
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CCDS12270.1 ZNF563 gene_id:147837|Hs108|chr19 ( 476) 884 111.3 3.5e-24
CCDS59368.1 ZNF729 gene_id:100287226|Hs108|chr19 (1252) 889 112.4 4.4e-24
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 885 111.7 4.4e-24
CCDS42532.1 ZNF253 gene_id:56242|Hs108|chr19 ( 499) 881 111.0 4.5e-24
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CCDS12409.1 ZNF14 gene_id:7561|Hs108|chr19 ( 642) 882 111.2 4.9e-24
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CCDS82387.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 736) 879 111.0 6.7e-24
CCDS59418.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 742) 879 111.0 6.8e-24
CCDS12972.1 ZNF329 gene_id:79673|Hs108|chr19 ( 541) 876 110.5 6.9e-24
CCDS12966.1 ZNF256 gene_id:10172|Hs108|chr19 ( 627) 876 110.6 7.6e-24
CCDS12632.1 ZNF45 gene_id:7596|Hs108|chr19 ( 682) 876 110.6 8.1e-24
CCDS12637.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 907) 878 111.0 8.3e-24
CCDS54276.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 913) 878 111.0 8.4e-24
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 874 110.4 9.7e-24
CCDS46031.1 ZNF98 gene_id:148198|Hs108|chr19 ( 572) 871 110.0 1.1e-23
CCDS43590.1 ZNF479 gene_id:90827|Hs108|chr7 ( 524) 869 109.7 1.2e-23
CCDS59369.1 ZNF99 gene_id:7652|Hs108|chr19 ( 864) 871 110.2 1.4e-23
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CCDS42642.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 676) 866 109.5 1.7e-23
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 866 109.5 1.7e-23
CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 697) 866 109.5 1.8e-23
CCDS34773.1 ZNF425 gene_id:155054|Hs108|chr7 ( 752) 865 109.4 2e-23
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 861 108.9 2.2e-23
CCDS74348.1 ZNF461 gene_id:92283|Hs108|chr19 ( 540) 860 108.7 2.4e-23
CCDS12947.1 ZNF71 gene_id:58491|Hs108|chr19 ( 489) 859 108.6 2.4e-23
CCDS54257.1 ZNF461 gene_id:92283|Hs108|chr19 ( 563) 860 108.7 2.4e-23
CCDS42496.1 ZNF846 gene_id:162993|Hs108|chr19 ( 533) 859 108.6 2.5e-23
>>CCDS7923.1 ZNF408 gene_id:79797|Hs108|chr11 (720 aa)
initn: 5108 init1: 5108 opt: 5108 Z-score: 3069.8 bits: 578.6 E(32554): 1.1e-164
Smith-Waterman score: 5108; 100.0% identity (100.0% similar) in 720 aa overlap (1-720:1-720)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MEEAEELLLEGKKALQLAREPRLGLDLGWNPSGEGCTQGLKDVPPEPTRDILALKSLPRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 MEEAEELLLEGKKALQLAREPRLGLDLGWNPSGEGCTQGLKDVPPEPTRDILALKSLPRG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 LALGPSLAKEQRLGVWCVGDPLQPGLLWGPLEEESASKEKGEGVKPRQEENLSLGPWGDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 LALGPSLAKEQRLGVWCVGDPLQPGLLWGPLEEESASKEKGEGVKPRQEENLSLGPWGDV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 CACEQSSGWTSLVQRGRLESEGNVAPVRISERLHLQVYQLVLPGSELLLWPQPSSEGPSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 CACEQSSGWTSLVQRGRLESEGNVAPVRISERLHLQVYQLVLPGSELLLWPQPSSEGPSL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 TQPGLDKEAAVAVVTEVESAVQQEVASPGEDAAEPCIDPGSQSPSGIQAENMVSPGLKFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 TQPGLDKEAAVAVVTEVESAVQQEVASPGEDAAEPCIDPGSQSPSGIQAENMVSPGLKFP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 TQDRISKDSQPLGPLLQDGDVDEECPAQAQMPPELQSNSATQQDPDGSGASFSSSARGTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 TQDRISKDSQPLGPLLQDGDVDEECPAQAQMPPELQSNSATQQDPDGSGASFSSSARGTQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 PHGYLAKKLHSPSDQCPPRAKTPEPGAQQSGFPTLSRSPPGPAGSSPKQGRRYRCGECGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 PHGYLAKKLHSPSDQCPPRAKTPEPGAQQSGFPTLSRSPPGPAGSSPKQGRRYRCGECGK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 AFLQLCHLKKHAFVHTGHKPFLCTECGKSYSSEESFKAHMLGHRGVRPFPCPQCDKAYGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 AFLQLCHLKKHAFVHTGHKPFLCTECGKSYSSEESFKAHMLGHRGVRPFPCPQCDKAYGT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 QRDLKEHQVVHSGARPFACDQCGKAFARRPSLRLHRKTHQVPAAPAPCPCPVCGRPLANQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 QRDLKEHQVVHSGARPFACDQCGKAFARRPSLRLHRKTHQVPAAPAPCPCPVCGRPLANQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 GSLRNHMRLHTGEKPFLCPHCGRAFRQRGNLRGHLRLHTGERPYRCPHCADAFPQLPELR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 GSLRNHMRLHTGEKPFLCPHCGRAFRQRGNLRGHLRLHTGERPYRCPHCADAFPQLPELR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 RHLISHTGEAHLCPVCGKALRDPHTLRAHERLHSGERPFPCPQCGRAYTLATKLRRHLKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 RHLISHTGEAHLCPVCGKALRDPHTLRAHERLHSGERPFPCPQCGRAYTLATKLRRHLKS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 HLEDKPYRCPTCGMGYTLPQSLRRHQLSHRPEAPCSPPSVPSAASEPTVVLLQAEPQLLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 HLEDKPYRCPTCGMGYTLPQSLRRHQLSHRPEAPCSPPSVPSAASEPTVVLLQAEPQLLD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB6 THREEEVSPARDVVEVTISESQEKCFVVPEEPDAAPSLVLIHKDMGLGAWAEVVEVEMGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 THREEEVSPARDVVEVTISESQEKCFVVPEEPDAAPSLVLIHKDMGLGAWAEVVEVEMGT
670 680 690 700 710 720
>>CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9 (699 aa)
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Smith-Waterman score: 989; 43.8% identity (71.0% similar) in 283 aa overlap (353-634:394-673)
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 PEPGAQQSGFPTLSRSPPGPAGSSPKQGRRYRCGECGKAFLQLCHLKKHAFVHTGHKPFL
:.: :::::: . .:.:: .:::.::.
CCDS35 KPYEYNECGKSCSMNSHLIWPQKSHTGEKPYECPECGKAFSEKSRLRKHQRTHTGEKPYK
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KB6 CTECGKSYSSEESFKAHMLGHRGVRPFPCPQCDKAYGTQRDLKEHQVVHSGARPFACDQC
: : :..:.. ... :. : : .:: : .: :... . : :: .:.: .:: :..:
CCDS35 CDGCDKAFSAKSGLRIHQRTHTGEKPFECHECGKSFNYKSILIVHQRTHTGEKPFECNEC
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KB6 GKAFARRPSLRLHRKTHQVPAAPAPCPCPVCGRPLANQGSLRNHMRLHTGEKPFLCPHCG
::.:.. .:: ::.:: .. : : ::. . ...::.: : ::::::. : .::
CCDS35 GKSFSHMSGLRNHRRTH---TGERPYKCDECGKAFKLKSGLRKHHRTHTGEKPYKCNQCG
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KB6 RAFRQRGNLRGHLRLHTGERPYRCPHCADAFPQLPELRRHLISHTGEA-HLCPVCGKALR
.:: :...:::: :.::::.::.: ::..:: : .:: : .:::: . : :::..:
CCDS35 KAFGQKSQLRGHHRIHTGEKPYKCNHCGEAFSQKSNLRVHHRTHTGEKPYQCEECGKTFR
550 560 570 580 590 600
570 580 590 600 610 620
pF1KB6 DPHTLRAHERLHSGERPFPCPQCGRAYTLATKLRRHLKSHLEDKPYRCPTCGMGYTLPQS
. .::.:.: :.::.:. : .::.:.. . ::.: ..: .::: : :: ... ..
CCDS35 QKSNLRGHQRTHTGEKPYECNECGKAFSEKSVLRKHQRTHTGEKPYNCNQCGEAFSQKSN
610 620 630 640 650 660
630 640 650 660 670 680
pF1KB6 LRRHQLSHRPEAPCSPPSVPSAASEPTVVLLQAEPQLLDTHREEEVSPARDVVEVTISES
:: :: .: : :
CCDS35 LRVHQRTHTGEKPYKCDKCGRTFSQKSSLREHQKAHPGD
670 680 690
>>CCDS42505.1 ZNF564 gene_id:163050|Hs108|chr19 (553 aa)
initn: 879 init1: 326 opt: 951 Z-score: 587.0 bits: 118.8 E(32554): 2.2e-26
Smith-Waterman score: 951; 39.9% identity (64.5% similar) in 318 aa overlap (318-634:168-476)
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 SGASFSSSARGTQPHGYLAKKLHSPSDQCPPRAKTPEPGAQQSGFPTLSRSPPGPAGSSP
: : :: : ..:.. : .:..:
CCDS42 EKPYKCKQCGKAFSSCQSFRRHERTHTGEKPYA-CPECGKAFISLPSVRRHMIKHTGDGP
140 150 160 170 180 190
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 KQGRRYRCGECGKAFLQLCHLKKHAFVHTGHKPFLCTECGKSYSSEESFKAHMLGHRGVR
:.: :::::: . .. : .:::.::. : ::.:.. : ::. ::. : :
CCDS42 -----YKCQECGKAFDRPSLFQIHERTHTGEKPYECQECAKAFISLPSFQRHMIRHTGDG
200 210 220 230 240 250
410 420 430 440 450 460
pF1KB6 PFPCPQCDKAYGTQRDLKEHQVVHSGARPFACDQCGKAFARRPSLRLHRKTHQVPAAPAP
:. : .: ::. .. :. .:.: .: : :::::: ... : : .. .:
CCDS42 PYKCQECGKAFDRPSLFRIHERTHTGEKPHECKQCGKAFISFTNFQSHMIRH---TGDGP
260 270 280 290 300
470 480 490 500 510 520
pF1KB6 CPCPVCGRPLANQGSLRNHMRLHTGEKPFLCPHCGRAFRQRGNLRGHLRLHTGERPYRCP
: :::: . . .:.: : ::::::. : .::..: . .:.: : : ::::.::.:
CCDS42 YKCKVCGRAFIFPSYVRKHERTHTGEKPYECNKCGKTFSSSSNVRTHERTHTGEKPYECK
310 320 330 340 350 360
530 540 550 560 570 580
pF1KB6 HCADAFPQLPELRRHLISHTGEA-HLCPVCGKALRDPHTLRAHERLHSGERPFPCPQCGR
.:. :: .:: .:::.:.:::.. . : :::.:. : ... ::: :.::.:. : ::.
CCDS42 ECGKAFISLPSVRRHMIKHTGDGPYKCQVCGRAFDCPSSFQIHERTHTGEKPYECQVCGK
370 380 390 400 410 420
590 600 610 620 630 640
pF1KB6 AYTLATKLRRHLKSHLEDKPYRCPTCGMGYTLPQSLRRHQLSHRPEAPCSPPSVPSAASE
:. ..:.:. : : ::.: .:: .. :.:.: :. .: : :
CCDS42 AFISLKRIRKHMILHTGDGPYKCQVCGKAFDCPSSVRTHERTHTGEKPYECKECGKAFNY
430 440 450 460 470 480
650 660 670 680 690 700
pF1KB6 PTVVLLQAEPQLLDTHREEEVSPARDVVEVTISESQEKCFVVPEEPDAAPSLVLIHKDMG
CCDS42 ASSIRIHERTHTGEKPYECKQCGKTFSYSSSFQRHERAHNGDKPYVKNVGKLSFITQPSN
490 500 510 520 530 540
>>CCDS6709.2 ZNF169 gene_id:169841|Hs108|chr9 (603 aa)
initn: 1209 init1: 370 opt: 939 Z-score: 579.4 bits: 117.5 E(32554): 6e-26
Smith-Waterman score: 939; 40.6% identity (64.5% similar) in 330 aa overlap (305-632:188-511)
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 LQSNSATQQDPDGSGASFSSSARGTQPHGYLAKKLH-SPSDQCPPRAKTPEPGAQQSGFP
::... . :: : : : :: :
CCDS67 SRISRTFFSPHQGDPVEWVEGNREGGTDLRLAQRMSLGGSDTMLKGADTSESGAVIRGNY
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 TLSRSPPGPAGSSPKQGRRYRCGECGKAFLQLCHLKKHAFVHTGHKPFLCTECGKSYSSE
:. : . : :. . : :::..: : : :: .:::.::.:: :::. .:..
CCDS67 RLGLSKKSSLFSHQKH---HVCPECGRGFCQRSDLIKHQRTHTGEKPYLCPECGRRFSQK
220 230 240 250 260 270
400 410 420 430 440 450
pF1KB6 ESFKAHMLGHRGVRPFPCPQCDKAYGTQRDLKEHQVVHSGARPFACDQCGKAFARRPSLR
:.. :. : : .:. : .: . . .: .:. .::: :::.:..::..: .. .:
CCDS67 ASLSIHQRKHSGEKPYVCRECGRHFRYTSSLTNHKRIHSGERPFVCQECGRGFRQKIALL
280 290 300 310 320 330
460 470 480 490 500 510
pF1KB6 LHRKTHQVPAAPAPCPCPVCGRPLANQGSLRNHMRLHTGEKPFLCPHCGRAFRQRGNLRG
::..:: : :: ::: . ...:: .:. ::::.:::: .:::.:::.. : .
CCDS67 LHQRTH---LEEKPFVCPECGRGFCQKASLLQHQSSHTGERPFLCLECGRSFRQQSLLLS
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KB6 HLRLHTGERPYRCPHCADAFPQLPELRRHLISHTGEA-HLCPVCGKALRDPHTLRAHERL
: :.::.:: : .:. .: : : :: .:::: .::: ::... . :: .:.:
CCDS67 HQVTHSGEKPYVCAECGHSFRQKVTLIRHQRTHTGEKPYLCPQCGRGFSQKVTLIGHQRT
400 410 420 430 440 450
580 590 600 610 620 630
pF1KB6 HSGERPFPCPQCGRAYTLATKLRRHLKSHLEDKPYRCPTCGMGYTLPQSLRRHQLSHRPE
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420 430 440 450 460 470
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: :: ::.. . ... :. .:.: .:. : ::::::. :.:.:..:: .. : :
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480 490 500 510 520 530
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540 550 560 570 580
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CCDS32 CEECGKAFKYSSALNTHKRIHTGEKPYKCDKCDKAFIASSTLSKHEIIHTGKKPYKCEEC
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CCDS32 PSSLSRHEIIHTGEKP
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CCDS13 MEVPPATKFGETFAFENRLESQQGL-FPGED-
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pF1KB6 ISKDSQPLG-PLLQDGDVDEECPAQAQMPPELQSNSATQQDPDGSGASFSSSAR------
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CCDS13 -------LGDPFLQERGLEQMAVIYKEIP--LGEQDEENDDYEGNFSLCSSPVQHQSIPP
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CCDS13 GTRPQDDELFGQTFLQKSDLSMCQI-IHSEEPSPCDCAETDRGDSGPNAPHRTPQPAKPY
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CCDS13 ACRECGKAFSQSSHLLRHLVIHTGEKPYECCECGKAFSQSSHLLRHQIIHTGEKPYECRE
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