Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6213
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6213, 668 aa
1>>>pF1KB6213 668 - 668 aa - 668 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3174+/-0.000909; mu= 15.8518+/- 0.055
mean_var=100.9887+/-19.927, 0's: 0 Z-trim(108.5): 35 B-trim: 6 in 1/51
Lambda= 0.127626
statistics sampled from 10205 (10235) to 10205 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.675), E-opt: 0.2 (0.314), width: 16
Scan time: 3.510
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8022.1 MTA2 gene_id:9219|Hs108|chr11 ( 668) 4464 832.7 0
CCDS81576.1 MTA2 gene_id:9219|Hs108|chr11 ( 495) 3331 624.0 1.5e-178
CCDS32169.1 MTA1 gene_id:9112|Hs108|chr14 ( 715) 2164 409.3 9.9e-114
CCDS46267.1 MTA3 gene_id:57504|Hs108|chr2 ( 515) 1979 375.1 1.4e-103
CCDS82441.1 MTA3 gene_id:57504|Hs108|chr2 ( 594) 1979 375.1 1.5e-103
CCDS62900.1 MTA3 gene_id:57504|Hs108|chr2 ( 537) 1901 360.7 3e-99
CCDS55954.1 MTA1 gene_id:9112|Hs108|chr14 ( 430) 1557 297.3 2.9e-80
CCDS95.1 RERE gene_id:473|Hs108|chr1 (1566) 403 85.2 7.5e-16
>>CCDS8022.1 MTA2 gene_id:9219|Hs108|chr11 (668 aa)
initn: 4464 init1: 4464 opt: 4464 Z-score: 4444.5 bits: 832.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4464; 100.0% identity (100.0% similar) in 668 aa overlap (1-668:1-668)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAANMYRVGDYVYFENSSSNPYLVRRIEELNKTANGNVEAKVVCLFRRRDISSSLNSLAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 MAANMYRVGDYVYFENSSSNPYLVRRIEELNKTANGNVEAKVVCLFRRRDISSSLNSLAD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 SNAREFEEESKQPGVSEQQRHQLKHRELFLSRQFESLPATHIRGKCSVTLLNETDILSQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 SNAREFEEESKQPGVSEQQRHQLKHRELFLSRQFESLPATHIRGKCSVTLLNETDILSQY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 LEKEDCFFYSLVFDPVQKTLLADQGEIRVGCKYQAEIPDRLVEGESDNRNQQKMEMKVWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 LEKEDCFFYSLVFDPVQKTLLADQGEIRVGCKYQAEIPDRLVEGESDNRNQQKMEMKVWD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 PDNPLTDRQIDQFLVVARAVGTFARALDCSSSIRQPSLHMSAAAASRDITLFHAMDTLQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 PDNPLTDRQIDQFLVVARAVGTFARALDCSSSIRQPSLHMSAAAASRDITLFHAMDTLQR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 NGYDLAKAMSTLVPQGGPVLCRDEMEEWSASEAMLFEEALEKYGKDFNDIRQDFLPWKSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 NGYDLAKAMSTLVPQGGPVLCRDEMEEWSASEAMLFEEALEKYGKDFNDIRQDFLPWKSL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 ASIVQFYYMWKTTDRYIQQKRLKAAEADSKLKQVYIPTYTKPNPNQIISVGSKPGMNGAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 ASIVQFYYMWKTTDRYIQQKRLKAAEADSKLKQVYIPTYTKPNPNQIISVGSKPGMNGAG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 FQKGLTCESCHTTQSAQWYAWGPPNMQCRLCASCWIYWKKYGGLKTPTQLEGATRGTTEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 FQKGLTCESCHTTQSAQWYAWGPPNMQCRLCASCWIYWKKYGGLKTPTQLEGATRGTTEP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 HSRGHLSRPEAQSLSPYTTSANRAKLLAKNRQTFLLQTTKLTRLARRMCRDLLQPRRAAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 HSRGHLSRPEAQSLSPYTTSANRAKLLAKNRQTFLLQTTKLTRLARRMCRDLLQPRRAAR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 RPYAPINANAIKAECSIRLPKAAKTPLKIHPLVRLPLATIVKDLVAQAPLKPKTPRGTKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 RPYAPINANAIKAECSIRLPKAAKTPLKIHPLVRLPLATIVKDLVAQAPLKPKTPRGTKT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 PINRNQLSQNRGLGGIMVKRAYETMAGAGVPFSANGRPLASGIRSSSQPAAKRQKLNPAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 PINRNQLSQNRGLGGIMVKRAYETMAGAGVPFSANGRPLASGIRSSSQPAAKRQKLNPAD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 APNPVVFVATKDTRALRKALTHLEMRRAARRPNLPLKVKPTLIAVRPPVPLPAPSHPAST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 APNPVVFVATKDTRALRKALTHLEMRRAARRPNLPLKVKPTLIAVRPPVPLPAPSHPAST
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 NEPIVLED
::::::::
CCDS80 NEPIVLED
>>CCDS81576.1 MTA2 gene_id:9219|Hs108|chr11 (495 aa)
initn: 3331 init1: 3331 opt: 3331 Z-score: 3318.9 bits: 624.0 E(32554): 1.5e-178
Smith-Waterman score: 3331; 100.0% identity (100.0% similar) in 495 aa overlap (174-668:1-495)
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 QGEIRVGCKYQAEIPDRLVEGESDNRNQQKMEMKVWDPDNPLTDRQIDQFLVVARAVGTF
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MEMKVWDPDNPLTDRQIDQFLVVARAVGTF
10 20 30
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 ARALDCSSSIRQPSLHMSAAAASRDITLFHAMDTLQRNGYDLAKAMSTLVPQGGPVLCRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ARALDCSSSIRQPSLHMSAAAASRDITLFHAMDTLQRNGYDLAKAMSTLVPQGGPVLCRD
40 50 60 70 80 90
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 EMEEWSASEAMLFEEALEKYGKDFNDIRQDFLPWKSLASIVQFYYMWKTTDRYIQQKRLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EMEEWSASEAMLFEEALEKYGKDFNDIRQDFLPWKSLASIVQFYYMWKTTDRYIQQKRLK
100 110 120 130 140 150
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 AAEADSKLKQVYIPTYTKPNPNQIISVGSKPGMNGAGFQKGLTCESCHTTQSAQWYAWGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 AAEADSKLKQVYIPTYTKPNPNQIISVGSKPGMNGAGFQKGLTCESCHTTQSAQWYAWGP
160 170 180 190 200 210
390 400 410 420 430 440
pF1KB6 PNMQCRLCASCWIYWKKYGGLKTPTQLEGATRGTTEPHSRGHLSRPEAQSLSPYTTSANR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PNMQCRLCASCWIYWKKYGGLKTPTQLEGATRGTTEPHSRGHLSRPEAQSLSPYTTSANR
220 230 240 250 260 270
450 460 470 480 490 500
pF1KB6 AKLLAKNRQTFLLQTTKLTRLARRMCRDLLQPRRAARRPYAPINANAIKAECSIRLPKAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 AKLLAKNRQTFLLQTTKLTRLARRMCRDLLQPRRAARRPYAPINANAIKAECSIRLPKAA
280 290 300 310 320 330
510 520 530 540 550 560
pF1KB6 KTPLKIHPLVRLPLATIVKDLVAQAPLKPKTPRGTKTPINRNQLSQNRGLGGIMVKRAYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KTPLKIHPLVRLPLATIVKDLVAQAPLKPKTPRGTKTPINRNQLSQNRGLGGIMVKRAYE
340 350 360 370 380 390
570 580 590 600 610 620
pF1KB6 TMAGAGVPFSANGRPLASGIRSSSQPAAKRQKLNPADAPNPVVFVATKDTRALRKALTHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TMAGAGVPFSANGRPLASGIRSSSQPAAKRQKLNPADAPNPVVFVATKDTRALRKALTHL
400 410 420 430 440 450
630 640 650 660
pF1KB6 EMRRAARRPNLPLKVKPTLIAVRPPVPLPAPSHPASTNEPIVLED
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EMRRAARRPNLPLKVKPTLIAVRPPVPLPAPSHPASTNEPIVLED
460 470 480 490
>>CCDS32169.1 MTA1 gene_id:9112|Hs108|chr14 (715 aa)
initn: 2303 init1: 1511 opt: 2164 Z-score: 2155.3 bits: 409.3 E(32554): 9.9e-114
Smith-Waterman score: 2654; 59.0% identity (75.7% similar) in 729 aa overlap (1-668:1-715)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAANMYRVGDYVYFENSSSNPYLVRRIEELNKTANGNVEAKVVCLFRRRDISSSLNSLAD
:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::..:::::::.: .:::
CCDS32 MAANMYRVGDYVYFENSSSNPYLIRRIEELNKTANGNVEAKVVCFYRRRDISSTLIALAD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100
pF1KB6 SNAR-----------------EFEEESKQP---GVSEQQRHQLKHRELFLSRQFESLPAT
..: :.::: ..: . :. .:::.:::::::::.::::::
CCDS32 KHATLSVCYKAGPGADNGEEGEIEEEMENPEMVDLPEKLKHQLRHRELFLSRQLESLPAT
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 HIRGKCSVTLLNETDILSQYLEKEDCFFYSLVFDPVQKTLLADQGEIRVGCKYQAEIPDR
::::::::::::::. :..:::.:: ::::::.:: :::::::.:::::: .:::.: :
CCDS32 HIRGKCSVTLLNETESLKSYLEREDFFFYSLVYDPQQKTLLADKGEIRVGNRYQADITDL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 LVEGESDNRNQQKMEMKVWDPDNPLTDRQIDQFLVVARAVGTFARALDCSSSIRQPSLHM
: ::: :.:.:...: .::. :::::.::::::::::.:::::::::::::.:::::::
CCDS32 LKEGEEDGRDQSRLETQVWEAHNPLTDKQIDQFLVVARSVGTFARALDCSSSVRQPSLHM
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 SAAAASRDITLFHAMDTLQRNGYDLAKAMSTLVPQGGPVLCRDEMEEWSASEAMLFEEAL
::::::::::::::::::..: ::..::.:.:::::::::::::::::::::: ::::::
CCDS32 SAAAASRDITLFHAMDTLHKNIYDISKAISALVPQGGPVLCRDEMEEWSASEANLFEEAL
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 EKYGKDFNDIRQDFLPWKSLASIVQFYYMWKTTDRYIQQKRLKAAEADSKLKQVYIPTYT
:::::::.::.:::::::::.::...::::::::::.::::::::::.:::::::::.:.
CCDS32 EKYGKDFTDIQQDFLPWKSLTSIIEYYYMWKTTDRYVQQKRLKAAEAESKLKQVYIPNYN
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390
pF1KB6 KPNPNQIISVGSKPGM-NGAGFQ-----KGLTCESCHTTQSAQWYAWGPPNMQCRLCASC
::::::: . : :. ::.: : .::::.:::: :::.::::::::::::::
CCDS32 KPNPNQISVNNVKAGVVNGTGAPGQSPGAGRACESCYTTQSYQWYSWGPPNMQCRLCASC
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB6 WIYWKKYGGLKTPTQLEGATRGTTEPHSRGHLSRPEAQSLSPYTTSANRAKLLAKNRQTF
: ::::::::: ::.:.: : .. . : . : .: :: :. :.::.:
CCDS32 WTYWKKYGGLKMPTRLDGERPGPNRSNMSPH-GLPARSSGSP--------KFAMKTRQAF
430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KB6 LLQTTKLTRLARRMCRDLLQPRRAARRPYAPINANAIKAECSIRLPKAAKTPLKIHPLVR
:.::::::.:::.::..:.: .:::.:: :::. ::::::. :::.:...:: .. ::
CCDS32 YLHTTKLTRIARRLCREILRPWHAARHPYLPINSAAIKAECTARLPEASQSPLVLKQAVR
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550
pF1KB6 LPLATIVKDLVAQA-PLKPK------------TP--------RGTKTPINRNQLSQNRGL
:: .... : .. : :: :: :. : ... . :. :.
CCDS32 KPLEAVLRYLETHPRPPKPDPVKSVSSVLSSLTPAKVAPVINNGSPTILGKRSYEQHNGV
540 550 560 570 580 590
560 570 580 590
pF1KB6 GGIMVKR--------AYETMA---GAGVPFSANGRPLASG---IRSSSQPAAKRQKLNPA
: : :: : . .: : . . ::. . ::..: : .::...:
CCDS32 DGNMKKRLLMPSRGLANHGQARHMGPSRNLLLNGKSYPTKVRLIRGGSLPPVKRRRMNWI
600 610 620 630 640 650
600 610 620 630 640 650
pF1KB6 DAPNPVVFVATKDTRALRKALTHLEMRRAARRPNLPLKVKPTLIAVRPPVPLPAPSHPAS
:::. : ..::..:: .:: :. : .:::::: :. .. . :. : : ::: .
CCDS32 DAPDDVFYMATEETRKIRKLLSSSETKRAARRPYKPIALRQSQ-ALPPRPPPPAPVN---
660 670 680 690 700
660
pF1KB6 TNEPIVLED
.::::.::
CCDS32 -DEPIVIED
710
>>CCDS46267.1 MTA3 gene_id:57504|Hs108|chr2 (515 aa)
initn: 2037 init1: 1577 opt: 1979 Z-score: 1973.3 bits: 375.1 E(32554): 1.4e-103
Smith-Waterman score: 2439; 70.7% identity (88.3% similar) in 515 aa overlap (1-499:1-513)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAANMYRVGDYVYFENSSSNPYLVRRIEELNKTANGNVEAKVVCLFRRRDISSSLNSLAD
:::::::::::::::::::::::.::::::::::.:::::::::..::::::..: :::
CCDS46 MAANMYRVGDYVYFENSSSNPYLIRRIEELNKTASGNVEAKVVCFYRRRDISNTLIMLAD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB6 SNAREFEEESK---QPGVSEQQRHQLKHRELFLSRQFESLPATHIRGKCSVTLLNETDIL
..:.:.::::. . ....:.:::::::::::::.::::::::::::::.:::::. .
CCDS46 KHAKEIEEESETTVEADLTDKQKHQLKHRELFLSRQYESLPATHIRGKCSVALLNETESV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 SQYLEKEDCFFYSLVFDPVQKTLLADQGEIRVGCKYQAEIPDRLVEGESDNRNQQKMEMK
.::.::: ::::::.:: ::::::.:::::: .:::.::. :.:::::.:.:.:.:.:
CCDS46 LSYLDKEDTFFYSLVYDPSLKTLLADKGEIRVGPRYQADIPEMLLEGESDEREQSKLEVK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 VWDPDNPLTDRQIDQFLVVARAVGTFARALDCSSSIRQPSLHMSAAAASRDITLFHAMDT
::::..:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VWDPNSPLTDRQIDQFLVVARAVGTFARALDCSSSVRQPSLHMSAAAASRDITLFHAMDT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 LQRNGYDLAKAMSTLVPQGGPVLCRDEMEEWSASEAMLFEEALEKYGKDFNDIRQDFLPW
: :..:::..:.:.::: :::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
CCDS46 LYRHSYDLSSAISVLVPLGGPVLCRDEMEEWSASEASLFEEALEKYGKDFNDIRQDFLPW
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 KSLASIVQFYYMWKTTDRYIQQKRLKAAEADSKLKQVYIPTYTKPNPNQIISVGSKPG-M
:::.::...::::::::::.::::::::::.:::::::::::.::::::: . ..::: .
CCDS46 KSLTSIIEYYYMWKTTDRYVQQKRLKAAEAESKLKQVYIPTYSKPNPNQISTSNGKPGAV
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400
pF1KB6 NGA-G--FQK-----GLTCESCHTTQSAQWYAWGPPNMQCRLCASCWIYWKKYGGLKTPT
::: : :: : .::::..::: :::.:::::::::::: ::.::::::::: ::
CCDS46 NGAVGTTFQPQNPLLGRACESCYATQSHQWYSWGPPNMQCRLCAICWLYWKKYGGLKMPT
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB6 QLE----GATRGTTEPHSRGHLSRPEAQSLSPYTTSANRAKLLAKNRQTFLLQTTKLTRL
: : . . : .:. :.:.:: :.. .:.. .. . :.::.:.:.:: .:..
CCDS46 QSEEEKLSPSPTTEDPRVRSHVSRQAMQGMPVRNTGSPKSAV--KTRQAFFLHTTYFTKF
430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB6 ARRMCRDLLQPRRAARRPYAPINANAIKAECSIRLPKAAKTPLKIHPLVRLPLATIVKDL
::..:.. :. :.:::::.. :: ::.:::.. :
CCDS46 ARQVCKNTLRLRQAARRPFVAINYAAIRAECKMLLNS
480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KB6 VAQAPLKPKTPRGTKTPINRNQLSQNRGLGGIMVKRAYETMAGAGVPFSANGRPLASGIR
>>CCDS82441.1 MTA3 gene_id:57504|Hs108|chr2 (594 aa)
initn: 2073 init1: 1577 opt: 1979 Z-score: 1972.4 bits: 375.1 E(32554): 1.5e-103
Smith-Waterman score: 2494; 65.6% identity (84.0% similar) in 587 aa overlap (1-567:1-584)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAANMYRVGDYVYFENSSSNPYLVRRIEELNKTANGNVEAKVVCLFRRRDISSSLNSLAD
:::::::::::::::::::::::.::::::::::.:::::::::..::::::..: :::
CCDS82 MAANMYRVGDYVYFENSSSNPYLIRRIEELNKTASGNVEAKVVCFYRRRDISNTLIMLAD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB6 SNAREFEEESK---QPGVSEQQRHQLKHRELFLSRQFESLPATHIRGKCSVTLLNETDIL
..:.:.::::. . ....:.:::::::::::::.::::::::::::::.:::::. .
CCDS82 KHAKEIEEESETTVEADLTDKQKHQLKHRELFLSRQYESLPATHIRGKCSVALLNETESV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 SQYLEKEDCFFYSLVFDPVQKTLLADQGEIRVGCKYQAEIPDRLVEGESDNRNQQKMEMK
.::.::: ::::::.:: ::::::.:::::: .:::.::. :.:::::.:.:.:.:.:
CCDS82 LSYLDKEDTFFYSLVYDPSLKTLLADKGEIRVGPRYQADIPEMLLEGESDEREQSKLEVK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 VWDPDNPLTDRQIDQFLVVARAVGTFARALDCSSSIRQPSLHMSAAAASRDITLFHAMDT
::::..:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VWDPNSPLTDRQIDQFLVVARAVGTFARALDCSSSVRQPSLHMSAAAASRDITLFHAMDT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 LQRNGYDLAKAMSTLVPQGGPVLCRDEMEEWSASEAMLFEEALEKYGKDFNDIRQDFLPW
: :..:::..:.:.::: :::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
CCDS82 LYRHSYDLSSAISVLVPLGGPVLCRDEMEEWSASEASLFEEALEKYGKDFNDIRQDFLPW
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 KSLASIVQFYYMWKTTDRYIQQKRLKAAEADSKLKQVYIPTYTKPNPNQIISVGSKPG-M
:::.::...::::::::::.::::::::::.:::::::::::.::::::: . ..::: .
CCDS82 KSLTSIIEYYYMWKTTDRYVQQKRLKAAEAESKLKQVYIPTYSKPNPNQISTSNGKPGAV
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400
pF1KB6 NGA-G--FQK-----GLTCESCHTTQSAQWYAWGPPNMQCRLCASCWIYWKKYGGLKTPT
::: : :: : .::::..::: :::.:::::::::::: ::.::::::::: ::
CCDS82 NGAVGTTFQPQNPLLGRACESCYATQSHQWYSWGPPNMQCRLCAICWLYWKKYGGLKMPT
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410 420 430 440 450 460
pF1KB6 QLE----GATRGTTEPHSRGHLSRPEAQSLSPYTTSANRAKLLAKNRQTFLLQTTKLTRL
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CCDS82 QSEEEKLSPSPTTEDPRVRSHVSRQAMQGMPVRNTGSPKSAV--KTRQAFFLHTTYFTKF
430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
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::..:.. :. :.:::::.. :: ::.:: . : . . .::: . .: ::: :. :
CCDS82 ARQVCKNTLRLRQAARRPFVAINYAAIRAEYADRHAELSGSPLKSKS-TRKPLACIIGYL
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB6 VAQAPLKPKTPRGT---KTPINRNQLSQ-NRGLGGIMVKRAYETMAGAGVPFSANGRPLA
. ::.. :.: .:: .. .:. :. .:. :: : :
CCDS82 EIHPAKKPNVIRSTPSLQTPTTKRMLTTPNHTSLSILGKRNYSHHNGLDELTCCVSD
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CCDS62 HRELFLSRQYESLPATHIRGKCSVALLNETESVLSYLDKEDTFFYSLVYDPSLKTLLADK
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CCDS62 GEIRVGPRYQADIPEMLLEGESDEREQSKLEVKVWDPNSPLTDRQIDQFLVVARAVGTFA
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::::::::.::::::::::::::::::::::::: :..:::..:.:.::: :::::::::
CCDS62 RALDCSSSVRQPSLHMSAAAASRDITLFHAMDTLYRHSYDLSSAISVLVPLGGPVLCRDE
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CCDS62 MEEWSASEASLFEEALEKYGKDFNDIRQDFLPWKSLTSIIEYYYMWKTTDRYVQQKRLKA
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pF1KB6 AEADSKLKQVYIPTYTKPNPNQIISVGSKPG-MNGA-G--FQK-----GLTCESCHTTQS
:::.::::::::::: ::::::: . ..::: .::: : :: : .::::..:::
CCDS62 AEAESKLKQVYIPTY-KPNPNQISTSNGKPGAVNGAVGTTFQPQNPLLGRACESCYATQS
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CCDS62 HQWYSWGPPNMQCRLCAICWLYWKKYGGLKMPTQSEEEKLSPSPTTEDPRVRSHVSRQAM
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pF1KB6 QSLSPYTTSANRAKLLAKNRQTFLLQTTKLTRLARRMCRDLLQPRRAARRPYAPINANAI
:.. .:.. .. . :.::.:.:.:: .:..::..:.. :. :.:::::.. :: ::
CCDS62 QGMPVRNTGSPKSAV--KTRQAFFLHTTYFTKFARQVCKNTLRLRQAARRPFVAINYAAI
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.:: . : . . .::: . .: ::: :. : . ::.. :.: .:: .. .:.
CCDS62 RAEYADRHAELSGSPLKSKS-TRKPLACIIGYLEIHPAKKPNVIRSTPSLQTPTTKRMLT
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pF1KB6 Q-NRGLGGIMVKRAYETMAGAGVPFSANGRPLASGIRSSSQPAAKRQKLNPADAPNPVVF
:. .:. :: : :
CCDS62 TPNHTSLSILGKRNYSHHNGLDELTCCVSD
510 520 530
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CCDS55 MAANMYRVGDYVYFENSSSNPYLIRRIEELNKTANGNVEAKVVCFYRRRDISSTLIALAD
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CCDS55 KHATLSVCYKAGPGADNGEEGEIEEEMENPEMVDLPEKLKHQLRHRELFLSRQLESLPAT
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110 120 130 140 150 160
pF1KB6 HIRGKCSVTLLNETDILSQYLEKEDCFFYSLVFDPVQKTLLADQGEIRVGCKYQAEIPDR
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CCDS55 HIRGKCSVTLLNETESLKSYLEREDFFFYSLVYDPQQKTLLADKGEIRVGNRYQADITDL
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CCDS55 LKEGEEDGRDQSRLETQVWEAHNPLTDKQIDQFLVVARSVGTFARALDCSSSVRQPSLHM
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CCDS55 SAAAASRDITLFHAMDTLHKNIYDISKAISALVPQGGPVLCRDEMEEWSASEANLFEEAL
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pF1KB6 EKYGKDFNDIRQDFLPWKSLASIVQFYYMWKTTDRYIQQKRLKAAEADSKLKQVYIPTYT
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CCDS55 EKYGKDFTDIQQDFLPWKSLTSIIEYYYMWKTTDRYVQQKRLKAAEAESKLKQVYIPNYN
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pF1KB6 KPNPNQIISVGSKPGM-NGAGFQ-----KGLTCESCHTTQSAQWYAWGPPNMQCRLCASC
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CCDS55 KPNPNQISVNNVKAGVVNGTGAPGQSPGAGRACESCYMSSLRILLDILEEIWWLENANPV
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CCDS55 RWREARTKPQ
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pF1KB6 SSLNSLADSNAREFEEESKQPGVSEQQRHQLKHRELFLSRQFESLPATHIRGKCSVTLLN
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CCDS95 EVPDSVYQHLVQDRHNENDSGRELVITDPVIKNRELFISDYVDTYHAAALRGKCNISHFS
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CCDS95 DIFAAREFKARVDSFFYILGYNPETRRLNSTQGEIRVGPSHQAKLPDLQPFPSPDGDTVT
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CCDS95 QHEELVWMPG--VNDCDLLMYLRAARSMAAFAGMCDGGST------EDGCVAASRDDTTL
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.:..::...::: .::.. :: . : : . . :. .:. : ..:..:::.: ::.
CCDS95 NALNTLHESGYDAGKALQRLVKKPVPKLIE---KCWTEDEVKRFVKGLRQYGKNFFRIRK
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CCDS95 ELLPNKETGELITFYYYWKKTPEAASSRAHRRHRRQAVFRRIKTRTASTPVNTPSRPPSS
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]