FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6213, 668 aa
1>>>pF1KB6213 668 - 668 aa - 668 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8177+/-0.000373; mu= 12.8500+/- 0.023
mean_var=107.2497+/-21.086, 0's: 0 Z-trim(115.6): 94 B-trim: 358 in 2/54
Lambda= 0.123844
statistics sampled from 26050 (26148) to 26050 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.664), E-opt: 0.2 (0.307), width: 16
Scan time: 11.260
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_004730 (OMIM: 603947) metastasis-associated pro ( 668) 4464 808.7 0
NP_001317221 (OMIM: 603947) metastasis-associated ( 495) 3331 606.2 9.5e-173
XP_016877247 (OMIM: 603526) PREDICTED: metastasis- ( 726) 2531 463.3 1.4e-129
XP_011535611 (OMIM: 603526) PREDICTED: metastasis- ( 754) 2473 453.0 1.9e-126
XP_011535612 (OMIM: 603526) PREDICTED: metastasis- ( 742) 2472 452.8 2.1e-126
XP_011535610 (OMIM: 603526) PREDICTED: metastasis- ( 758) 2472 452.8 2.2e-126
XP_016877244 (OMIM: 603526) PREDICTED: metastasis- ( 782) 2472 452.8 2.2e-126
NP_001317372 (OMIM: 609050) metastasis-associated ( 593) 2226 408.8 3e-113
NP_004680 (OMIM: 603526) metastasis-associated pro ( 715) 2164 397.7 7.5e-110
XP_011535608 (OMIM: 603526) PREDICTED: metastasis- ( 771) 2164 397.8 8e-110
XP_016877242 (OMIM: 603526) PREDICTED: metastasis- ( 795) 2164 397.8 8.2e-110
XP_016877246 (OMIM: 603526) PREDICTED: metastasis- ( 743) 2163 397.6 8.8e-110
XP_011535609 (OMIM: 603526) PREDICTED: metastasis- ( 759) 2163 397.6 9e-110
XP_016877245 (OMIM: 603526) PREDICTED: metastasis- ( 772) 2163 397.6 9.1e-110
XP_011535607 (OMIM: 603526) PREDICTED: metastasis- ( 775) 2163 397.6 9.1e-110
XP_016877243 (OMIM: 603526) PREDICTED: metastasis- ( 783) 2163 397.6 9.2e-110
XP_016877241 (OMIM: 603526) PREDICTED: metastasis- ( 799) 2163 397.6 9.4e-110
XP_016877248 (OMIM: 603526) PREDICTED: metastasis- ( 657) 2148 394.9 5.1e-109
NP_065795 (OMIM: 609050) metastasis-associated pro ( 515) 1979 364.6 5.1e-100
NP_001317371 (OMIM: 609050) metastasis-associated ( 594) 1979 364.6 5.7e-100
NP_001269685 (OMIM: 609050) metastasis-associated ( 537) 1901 350.7 8.3e-96
NP_001269684 (OMIM: 609050) metastasis-associated ( 537) 1901 350.7 8.3e-96
XP_016860051 (OMIM: 609050) PREDICTED: metastasis- ( 341) 1854 342.2 1.9e-93
XP_005264516 (OMIM: 609050) PREDICTED: metastasis- ( 538) 1654 306.6 1.6e-82
NP_001190187 (OMIM: 603526) metastasis-associated ( 430) 1557 289.2 2.2e-77
NP_001317373 (OMIM: 609050) metastasis-associated ( 530) 1215 228.1 6.4e-59
XP_011539812 (OMIM: 605226,616975) PREDICTED: argi (1524) 453 92.2 1.5e-17
XP_011539813 (OMIM: 605226,616975) PREDICTED: argi (1181) 403 83.2 6e-15
XP_016856847 (OMIM: 605226,616975) PREDICTED: argi (1566) 403 83.3 7.6e-15
XP_016856848 (OMIM: 605226,616975) PREDICTED: argi (1566) 403 83.3 7.6e-15
NP_001036146 (OMIM: 605226,616975) arginine-glutam (1566) 403 83.3 7.6e-15
NP_036234 (OMIM: 605226,616975) arginine-glutamic (1566) 403 83.3 7.6e-15
XP_005263521 (OMIM: 605226,616975) PREDICTED: argi (1566) 403 83.3 7.6e-15
XP_005263523 (OMIM: 605226,616975) PREDICTED: argi (1298) 236 53.4 6.2e-06
NP_055971 (OMIM: 607675) REST corepressor 1 [Homo ( 485) 180 43.2 0.0028
NP_001139585 (OMIM: 616848) mesoderm induction ear ( 370) 170 41.3 0.0076
NP_001071172 (OMIM: 616848) mesoderm induction ear ( 433) 170 41.4 0.0087
XP_016857423 (OMIM: 616848) PREDICTED: mesoderm in ( 449) 170 41.4 0.009
XP_016857422 (OMIM: 616848) PREDICTED: mesoderm in ( 449) 170 41.4 0.009
XP_016857421 (OMIM: 616848) PREDICTED: mesoderm in ( 449) 170 41.4 0.009
NP_001071170 (OMIM: 616848) mesoderm induction ear ( 450) 170 41.4 0.009
NP_001139583 (OMIM: 616848) mesoderm induction ear ( 470) 170 41.4 0.0093
XP_016857420 (OMIM: 616848) PREDICTED: mesoderm in ( 485) 170 41.4 0.0096
NP_001139584 (OMIM: 616848) mesoderm induction ear ( 485) 170 41.4 0.0096
NP_001071171 (OMIM: 616848) mesoderm induction ear ( 486) 170 41.4 0.0096
>>NP_004730 (OMIM: 603947) metastasis-associated protein (668 aa)
initn: 4464 init1: 4464 opt: 4464 Z-score: 4314.5 bits: 808.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4464; 100.0% identity (100.0% similar) in 668 aa overlap (1-668:1-668)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAANMYRVGDYVYFENSSSNPYLVRRIEELNKTANGNVEAKVVCLFRRRDISSSLNSLAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MAANMYRVGDYVYFENSSSNPYLVRRIEELNKTANGNVEAKVVCLFRRRDISSSLNSLAD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 SNAREFEEESKQPGVSEQQRHQLKHRELFLSRQFESLPATHIRGKCSVTLLNETDILSQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SNAREFEEESKQPGVSEQQRHQLKHRELFLSRQFESLPATHIRGKCSVTLLNETDILSQY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 LEKEDCFFYSLVFDPVQKTLLADQGEIRVGCKYQAEIPDRLVEGESDNRNQQKMEMKVWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LEKEDCFFYSLVFDPVQKTLLADQGEIRVGCKYQAEIPDRLVEGESDNRNQQKMEMKVWD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 PDNPLTDRQIDQFLVVARAVGTFARALDCSSSIRQPSLHMSAAAASRDITLFHAMDTLQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PDNPLTDRQIDQFLVVARAVGTFARALDCSSSIRQPSLHMSAAAASRDITLFHAMDTLQR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 NGYDLAKAMSTLVPQGGPVLCRDEMEEWSASEAMLFEEALEKYGKDFNDIRQDFLPWKSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 NGYDLAKAMSTLVPQGGPVLCRDEMEEWSASEAMLFEEALEKYGKDFNDIRQDFLPWKSL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 ASIVQFYYMWKTTDRYIQQKRLKAAEADSKLKQVYIPTYTKPNPNQIISVGSKPGMNGAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ASIVQFYYMWKTTDRYIQQKRLKAAEADSKLKQVYIPTYTKPNPNQIISVGSKPGMNGAG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 FQKGLTCESCHTTQSAQWYAWGPPNMQCRLCASCWIYWKKYGGLKTPTQLEGATRGTTEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 FQKGLTCESCHTTQSAQWYAWGPPNMQCRLCASCWIYWKKYGGLKTPTQLEGATRGTTEP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 HSRGHLSRPEAQSLSPYTTSANRAKLLAKNRQTFLLQTTKLTRLARRMCRDLLQPRRAAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 HSRGHLSRPEAQSLSPYTTSANRAKLLAKNRQTFLLQTTKLTRLARRMCRDLLQPRRAAR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 RPYAPINANAIKAECSIRLPKAAKTPLKIHPLVRLPLATIVKDLVAQAPLKPKTPRGTKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 RPYAPINANAIKAECSIRLPKAAKTPLKIHPLVRLPLATIVKDLVAQAPLKPKTPRGTKT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 PINRNQLSQNRGLGGIMVKRAYETMAGAGVPFSANGRPLASGIRSSSQPAAKRQKLNPAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PINRNQLSQNRGLGGIMVKRAYETMAGAGVPFSANGRPLASGIRSSSQPAAKRQKLNPAD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 APNPVVFVATKDTRALRKALTHLEMRRAARRPNLPLKVKPTLIAVRPPVPLPAPSHPAST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 APNPVVFVATKDTRALRKALTHLEMRRAARRPNLPLKVKPTLIAVRPPVPLPAPSHPAST
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 NEPIVLED
::::::::
NP_004 NEPIVLED
>>NP_001317221 (OMIM: 603947) metastasis-associated prot (495 aa)
initn: 3331 init1: 3331 opt: 3331 Z-score: 3222.4 bits: 606.2 E(85289): 9.5e-173
Smith-Waterman score: 3331; 100.0% identity (100.0% similar) in 495 aa overlap (174-668:1-495)
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 QGEIRVGCKYQAEIPDRLVEGESDNRNQQKMEMKVWDPDNPLTDRQIDQFLVVARAVGTF
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEMKVWDPDNPLTDRQIDQFLVVARAVGTF
10 20 30
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 ARALDCSSSIRQPSLHMSAAAASRDITLFHAMDTLQRNGYDLAKAMSTLVPQGGPVLCRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ARALDCSSSIRQPSLHMSAAAASRDITLFHAMDTLQRNGYDLAKAMSTLVPQGGPVLCRD
40 50 60 70 80 90
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 EMEEWSASEAMLFEEALEKYGKDFNDIRQDFLPWKSLASIVQFYYMWKTTDRYIQQKRLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EMEEWSASEAMLFEEALEKYGKDFNDIRQDFLPWKSLASIVQFYYMWKTTDRYIQQKRLK
100 110 120 130 140 150
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 AAEADSKLKQVYIPTYTKPNPNQIISVGSKPGMNGAGFQKGLTCESCHTTQSAQWYAWGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AAEADSKLKQVYIPTYTKPNPNQIISVGSKPGMNGAGFQKGLTCESCHTTQSAQWYAWGP
160 170 180 190 200 210
390 400 410 420 430 440
pF1KB6 PNMQCRLCASCWIYWKKYGGLKTPTQLEGATRGTTEPHSRGHLSRPEAQSLSPYTTSANR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PNMQCRLCASCWIYWKKYGGLKTPTQLEGATRGTTEPHSRGHLSRPEAQSLSPYTTSANR
220 230 240 250 260 270
450 460 470 480 490 500
pF1KB6 AKLLAKNRQTFLLQTTKLTRLARRMCRDLLQPRRAARRPYAPINANAIKAECSIRLPKAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AKLLAKNRQTFLLQTTKLTRLARRMCRDLLQPRRAARRPYAPINANAIKAECSIRLPKAA
280 290 300 310 320 330
510 520 530 540 550 560
pF1KB6 KTPLKIHPLVRLPLATIVKDLVAQAPLKPKTPRGTKTPINRNQLSQNRGLGGIMVKRAYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KTPLKIHPLVRLPLATIVKDLVAQAPLKPKTPRGTKTPINRNQLSQNRGLGGIMVKRAYE
340 350 360 370 380 390
570 580 590 600 610 620
pF1KB6 TMAGAGVPFSANGRPLASGIRSSSQPAAKRQKLNPADAPNPVVFVATKDTRALRKALTHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TMAGAGVPFSANGRPLASGIRSSSQPAAKRQKLNPADAPNPVVFVATKDTRALRKALTHL
400 410 420 430 440 450
630 640 650 660
pF1KB6 EMRRAARRPNLPLKVKPTLIAVRPPVPLPAPSHPASTNEPIVLED
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EMRRAARRPNLPLKVKPTLIAVRPPVPLPAPSHPASTNEPIVLED
460 470 480 490
>>XP_016877247 (OMIM: 603526) PREDICTED: metastasis-asso (726 aa)
initn: 1959 init1: 1511 opt: 2531 Z-score: 2447.4 bits: 463.3 E(85289): 1.4e-129
Smith-Waterman score: 2598; 58.9% identity (75.5% similar) in 711 aa overlap (1-639:1-702)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAANMYRVGDYVYFENSSSNPYLVRRIEELNKTANGNVEAKVVCLFRRRDISSSLNSLAD
:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::..:::::::.: .:::
XP_016 MAANMYRVGDYVYFENSSSNPYLIRRIEELNKTANGNVEAKVVCFYRRRDISSTLIALAD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB6 SNAREFEEESKQP---GVSEQQRHQLKHRELFLSRQFESLPATHIRGKCSVTLLNETDIL
..:::.::: ..: . :. .:::.:::::::::.::::::::::::::::::::. :
XP_016 KHAREIEEEMENPEMVDLPEKLKHQLRHRELFLSRQLESLPATHIRGKCSVTLLNETESL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 SQYLEKEDCFFYSLVFDPVQKTLLADQGEIRVGCKYQAEIPDRLVEGESDNRNQQKMEMK
..:::.:: ::::::.:: :::::::.:::::: .:::.: : : ::: :.:.:...: .
XP_016 KSYLEREDFFFYSLVYDPQQKTLLADKGEIRVGNRYQADITDLLKEGEEDGRDQSRLETQ
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 VWDPDNPLTDRQIDQFLVVARAVGTFARALDCSSSIRQPSLHMSAAAASRDITLFHAMDT
::. :::::.::::::::::.:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
XP_016 VWEAHNPLTDKQIDQFLVVARSVGTFARALDCSSSVRQPSLHMSAAAASRDITLFHAMDT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 LQRNGYDLAKAMSTLVPQGGPVLCRDEMEEWSASEAMLFEEALEKYGKDFNDIRQDFLPW
:..: ::..::.:.:::::::::::::::::::::: :::::::::::::.::.::::::
XP_016 LHKNIYDISKAISALVPQGGPVLCRDEMEEWSASEANLFEEALEKYGKDFTDIQQDFLPW
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 KSLASIVQFYYMWKTTDRYIQQKRLKAAEADSKLKQVYIPTYTKPNPNQIISVGSKPGM-
:::.::...::::::::::.::::::::::.:::::::::.:.::::::: . : :.
XP_016 KSLTSIIEYYYMWKTTDRYVQQKRLKAAEAESKLKQVYIPNYNKPNPNQISVNNVKAGVV
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 NGAGFQ-----KGLTCESCHTTQSAQWYAWGPPNMQCRLCASCWIYWKKYGGLKTPTQLE
::.: : .::::.:::: :::.::::::::::::::: ::::::::: ::.:.
XP_016 NGTGAPGQSPGAGRACESCYTTQSYQWYSWGPPNMQCRLCASCWTYWKKYGGLKMPTRLD
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 GATRGTTEPHSRGHLSRPEAQSLSPYTTSANRAKLLAKNRQTFLLQTTKLTRLARRMCRD
: : .. . : . : .: :: :. :.::.: :.::::::.:::.::.
XP_016 GERPGPNRSNMSPH-GLPARSSGSP--------KFAMKTRQAFYLHTTKLTRIARRLCRE
430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 LLQPRRAARRPYAPINANAIKAECSIRLPKAAKTPLKIHPLVRLPLATIVKDLVAQA-PL
.:.: .:::.:: :::. ::::::. :::.:...:: .. :: :: .... : .. :
XP_016 ILRPWHAARHPYLPINSAAIKAECTARLPEASQSPLVLKQAVRKPLEAVLRYLETHPRPP
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570
pF1KB6 KPK------------TP--------RGTKTPINRNQLSQNRGLGGIMVKRAYETMAGAGV
:: :: :. : ... . :. :. : : :: :. .
XP_016 KPDPVKSVSSVLSSLTPAKVAPVINNGSPTILGKRSYEQHNGVDGNMKKRLLMPSRGTYL
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610
pF1KB6 PFSANGR-----P----LASG---------IRSSSQPAAKRQKLNPADAPNPVVFVATKD
.. .:. : : .: ::..: : .::...: :::. : ..::..
XP_016 GLANHGQARHMGPSRNLLLNGKSYPTKVRLIRGGSLPPVKRRRMNWIDAPDDVFYMATEE
600 610 620 630 640 650
620 630 640
pF1KB6 TR------------------------ALRKALTHLEMRRAARRPNLPLKVKPTLIAVRPP
:: .:: :. : .:::::: :. ..
XP_016 TRWGLPRAGGRAPHSVPALTTTSAHRKIRKLLSSSETKRAARRPYKPIALRQSQALPPRP
660 670 680 690 700 710
650 660
pF1KB6 VPLPAPSHPASTNEPIVLED
XP_016 PPPAPVNDEPIVIED
720
>>XP_011535611 (OMIM: 603526) PREDICTED: metastasis-asso (754 aa)
initn: 2023 init1: 1511 opt: 2473 Z-score: 2391.1 bits: 453.0 E(85289): 1.9e-126
Smith-Waterman score: 2647; 60.0% identity (77.4% similar) in 703 aa overlap (10-668:66-754)
10 20 30
pF1KB6 MAANMYRVGDYVYFENSSSNPYLVRRIEELNKTANGNVE
::::::::::::::.:::::::::::::::
XP_011 CVCSPWSLWPGVLGAVRPPTCPPRGLPLPADYVYFENSSSNPYLIRRIEELNKTANGNVE
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 AKVVCLFRRRDISSSLNSLADSNAREFEEESKQP---GVSEQQRHQLKHRELFLSRQFES
:::::..:::::::.: .:::..:::.::: ..: . :. .:::.:::::::::.::
XP_011 AKVVCFYRRRDISSTLIALADKHAREIEEEMENPEMVDLPEKLKHQLRHRELFLSRQLES
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 LPATHIRGKCSVTLLNETDILSQYLEKEDCFFYSLVFDPVQKTLLADQGEIRVGCKYQAE
::::::::::::::::::. :..:::.:: ::::::.:: :::::::.:::::: .:::.
XP_011 LPATHIRGKCSVTLLNETESLKSYLEREDFFFYSLVYDPQQKTLLADKGEIRVGNRYQAD
160 170 180 190 200 210
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: : : ::: :.:.:...: .::. :::::.::::::::::.:::::::::::::.:::
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:: :: .... : .. : :: :: :. : ... . :
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:: :: .... : .. : :: ..... .. .. : : :. ::.::
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.::..:: .:: :. : .:::::: :. .. . :. : : ::: . .::::.:
XP_011 MATEETRKIRKLLSSSETKRAARRPYKPIALRQSQ-ALPPRPPPPAPVN----DEPIVIE
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pF1KB6 D
:
XP_011 D
>>XP_011535610 (OMIM: 603526) PREDICTED: metastasis-asso (758 aa)
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Smith-Waterman score: 2647; 59.7% identity (77.1% similar) in 707 aa overlap (10-668:66-758)
10 20 30
pF1KB6 MAANMYRVGDYVYFENSSSNPYLVRRIEELNKTANGNVE
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XP_011 LPATHIRGKCSVTLLNETESLKSYLEREDFFFYSLVYDPQQKTLLADKGEIRVGNRYQAD
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pF1KB6 IPDRLVEGESDNRNQQKMEMKVWDPDNPLTDRQIDQFLVVARAVGTFARALDCSSSIRQP
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XP_011 ITDLLKEGEEDGRDQSRLETQVWEAHNPLTDKQIDQFLVVARSVGTFARALDCSSSVRQP
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220 230 240 250 260 270
pF1KB6 SLHMSAAAASRDITLFHAMDTLQRNGYDLAKAMSTLVPQGGPVLCRDEMEEWSASEAMLF
::::::::::::::::::::::..: ::..::.:.:::::::::::::::::::::: ::
XP_011 SLHMSAAAASRDITLFHAMDTLHKNIYDISKAISALVPQGGPVLCRDEMEEWSASEANLF
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 EEALEKYGKDFNDIRQDFLPWKSLASIVQFYYMWKTTDRYIQQKRLKAAEADSKLKQVYI
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XP_011 EEALEKYGKDFTDIQQDFLPWKSLTSIIEYYYMWKTTDRYVQQKRLKAAEAESKLKQVYI
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XP_011 CASCWTYWKKYGGLKMPTRLDGERPGPNRSNMSPH-GLPARSSGSP--------KFAMKT
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:: :: .... : .. : :: :: :. : ... . :
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::...: :::. : ..::..:: .:: :. : .:::::: :. .. . :. : :
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pF1KB6 PAPSHPASTNEPIVLED
::: . .::::.::
XP_011 PAPVN----DEPIVIED
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>>XP_016877244 (OMIM: 603526) PREDICTED: metastasis-asso (782 aa)
initn: 1959 init1: 1511 opt: 2472 Z-score: 2389.9 bits: 452.8 E(85289): 2.2e-126
Smith-Waterman score: 2539; 58.4% identity (75.2% similar) in 702 aa overlap (10-639:66-758)
10 20 30
pF1KB6 MAANMYRVGDYVYFENSSSNPYLVRRIEELNKTANGNVE
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XP_016 AKVVCFYRRRDISSTLIALADKHAREIEEEMENPEMVDLPEKLKHQLRHRELFLSRQLES
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100 110 120 130 140 150
pF1KB6 LPATHIRGKCSVTLLNETDILSQYLEKEDCFFYSLVFDPVQKTLLADQGEIRVGCKYQAE
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XP_016 LPATHIRGKCSVTLLNETESLKSYLEREDFFFYSLVYDPQQKTLLADKGEIRVGNRYQAD
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 IPDRLVEGESDNRNQQKMEMKVWDPDNPLTDRQIDQFLVVARAVGTFARALDCSSSIRQP
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XP_016 ITDLLKEGEEDGRDQSRLETQVWEAHNPLTDKQIDQFLVVARSVGTFARALDCSSSVRQP
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 SLHMSAAAASRDITLFHAMDTLQRNGYDLAKAMSTLVPQGGPVLCRDEMEEWSASEAMLF
::::::::::::::::::::::..: ::..::.:.:::::::::::::::::::::: ::
XP_016 SLHMSAAAASRDITLFHAMDTLHKNIYDISKAISALVPQGGPVLCRDEMEEWSASEANLF
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 EEALEKYGKDFNDIRQDFLPWKSLASIVQFYYMWKTTDRYIQQKRLKAAEADSKLKQVYI
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XP_016 EEALEKYGKDFTDIQQDFLPWKSLTSIIEYYYMWKTTDRYVQQKRLKAAEAESKLKQVYI
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 PTYTKPNPNQIISVGSKPGM-NGAGFQ-----KGLTCESCHTTQSAQWYAWGPPNMQCRL
:.:.::::::: . : :. ::.: : .::::.:::: :::.::::::::::
XP_016 PNYNKPNPNQISVNNVKAGVVNGTGAPGQSPGAGRACESCYTTQSYQWYSWGPPNMQCRL
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KB6 CASCWIYWKKYGGLKTPTQLEGATRGTTEPHSRGHLSRPEAQSLSPYTTSANRAKLLAKN
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XP_016 CASCWTYWKKYGGLKMPTRLDGERPGPNRSNMSPH-GLPARSSGSP--------KFAMKT
460 470 480 490 500
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pF1KB6 RQTFLLQTTKLTRLARRMCRDLLQPRRAARRPYAPINANAIKAECSIRLPKAAKTPLKIH
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XP_016 RQAFYLHTTKLTRIARRLCREILRPWHAARHPYLPINSAAIKAECTARLPEASQSPLVLK
510 520 530 540 550 560
520 530 540
pF1KB6 PLVRLPLATIVKDLVAQA-PLKPK------------TP--------RGTKTPINRNQLSQ
:: :: .... : .. : :: :: :. : ... . :
XP_016 QAVRKPLEAVLRYLETHPRPPKPDPVKSVSSVLSSLTPAKVAPVINNGSPTILGKRSYEQ
570 580 590 600 610 620
550 560 570 580 590
pF1KB6 NRGLGGIMVKRAYETMAGAGVPFSANGR-----P----LASG---------IRSSSQPAA
. :. : : :: :. . .. .:. : : .: ::..: : .
XP_016 HNGVDGNMKKRLLMPSRGTYLGLANHGQARHMGPSRNLLLNGKSYPTKVRLIRGGSLPPV
630 640 650 660 670 680
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pF1KB6 KRQKLNPADAPNPVVFVATKDTR------------------------ALRKALTHLEMRR
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pF1KB6 AARRPNLPLKVKPTLIAVRPPVPLPAPSHPASTNEPIVLED
::::: :. ..
XP_016 AARRPYKPIALRQSQALPPRPPPPAPVNDEPIVIED
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>>NP_001317372 (OMIM: 609050) metastasis-associated prot (593 aa)
initn: 2011 init1: 1515 opt: 2226 Z-score: 2154.2 bits: 408.8 E(85289): 3e-113
Smith-Waterman score: 2480; 65.6% identity (83.8% similar) in 587 aa overlap (1-567:1-583)
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pF1KB6 MAANMYRVGDYVYFENSSSNPYLVRRIEELNKTANGNVEAKVVCLFRRRDISSSLNSLAD
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pF1KB6 SNAREFEEESK---QPGVSEQQRHQLKHRELFLSRQFESLPATHIRGKCSVTLLNETDIL
..:.:.::::. . ....:.:::::::::::::.::::::::::::::.:::::. .
NP_001 KHAKEIEEESETTVEADLTDKQKHQLKHRELFLSRQYESLPATHIRGKCSVALLNETESV
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pF1KB6 SQYLEKEDCFFYSLVFDPVQKTLLADQGEIRVGCKYQAEIPDRLVEGESDNRNQQKMEMK
.::.::: ::::::.:: ::::::.:::::: .:::.::. :.:::::.:.:.:.:.:
NP_001 LSYLDKEDTFFYSLVYDPSLKTLLADKGEIRVGPRYQADIPEMLLEGESDEREQSKLEVK
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pF1KB6 VWDPDNPLTDRQIDQFLVVARAVGTFARALDCSSSIRQPSLHMSAAAASRDITLFHAMDT
::::..:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
NP_001 VWDPNSPLTDRQIDQFLVVARAVGTFARALDCSSSVRQPSLHMSAAAASRDITLFHAMDT
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: :..:::..:.:.::: :::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
NP_001 LYRHSYDLSSAISVLVPLGGPVLCRDEMEEWSASEASLFEEALEKYGKDFNDIRQDFLPW
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pF1KB6 KSLASIVQFYYMWKTTDRYIQQKRLKAAEADSKLKQVYIPTYTKPNPNQIISVGSKPG-M
:::.::...::::::::::.::::::::::.::::::::::: ::::::: . ..::: .
NP_001 KSLTSIIEYYYMWKTTDRYVQQKRLKAAEAESKLKQVYIPTY-KPNPNQISTSNGKPGAV
310 320 330 340 350
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pF1KB6 NGA-G--FQK-----GLTCESCHTTQSAQWYAWGPPNMQCRLCASCWIYWKKYGGLKTPT
::: : :: : .::::..::: :::.:::::::::::: ::.::::::::: ::
NP_001 NGAVGTTFQPQNPLLGRACESCYATQSHQWYSWGPPNMQCRLCAICWLYWKKYGGLKMPT
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB6 QLE----GATRGTTEPHSRGHLSRPEAQSLSPYTTSANRAKLLAKNRQTFLLQTTKLTRL
: : . . : .:. :.:.:: :.. .:.. .. . :.::.:.:.:: .:..
NP_001 QSEEEKLSPSPTTEDPRVRSHVSRQAMQGMPVRNTGSPKSAV--KTRQAFFLHTTYFTKF
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB6 ARRMCRDLLQPRRAARRPYAPINANAIKAECSIRLPKAAKTPLKIHPLVRLPLATIVKDL
::..:.. :. :.:::::.. :: ::.:: . : . . .::: . .: ::: :. :
NP_001 ARQVCKNTLRLRQAARRPFVAINYAAIRAEYADRHAELSGSPLKSKS-TRKPLACIIGYL
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB6 VAQAPLKPKTPRGT---KTPINRNQLSQ-NRGLGGIMVKRAYETMAGAGVPFSANGRPLA
. ::.. :.: .:: .. .:. :. .:. :: : :
NP_001 EIHPAKKPNVIRSTPSLQTPTTKRMLTTPNHTSLSILGKRNYSHHNGLDELTCCVSD
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KB6 SGIRSSSQPAAKRQKLNPADAPNPVVFVATKDTRALRKALTHLEMRRAARRPNLPLKVKP
>>NP_004680 (OMIM: 603526) metastasis-associated protein (715 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAANMYRVGDYVYFENSSSNPYLVRRIEELNKTANGNVEAKVVCLFRRRDISSSLNSLAD
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NP_004 MAANMYRVGDYVYFENSSSNPYLIRRIEELNKTANGNVEAKVVCFYRRRDISSTLIALAD
10 20 30 40 50 60
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..: :.::: ..: . :. .:::.:::::::::.::::::
NP_004 KHATLSVCYKAGPGADNGEEGEIEEEMENPEMVDLPEKLKHQLRHRELFLSRQLESLPAT
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pF1KB6 HIRGKCSVTLLNETDILSQYLEKEDCFFYSLVFDPVQKTLLADQGEIRVGCKYQAEIPDR
::::::::::::::. :..:::.:: ::::::.:: :::::::.:::::: .:::.: :
NP_004 HIRGKCSVTLLNETESLKSYLEREDFFFYSLVYDPQQKTLLADKGEIRVGNRYQADITDL
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170 180 190 200 210 220
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: ::: :.:.:...: .::. :::::.::::::::::.:::::::::::::.:::::::
NP_004 LKEGEEDGRDQSRLETQVWEAHNPLTDKQIDQFLVVARSVGTFARALDCSSSVRQPSLHM
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230 240 250 260 270 280
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::::::::::::::::::..: ::..::.:.:::::::::::::::::::::: ::::::
NP_004 SAAAASRDITLFHAMDTLHKNIYDISKAISALVPQGGPVLCRDEMEEWSASEANLFEEAL
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290 300 310 320 330 340
pF1KB6 EKYGKDFNDIRQDFLPWKSLASIVQFYYMWKTTDRYIQQKRLKAAEADSKLKQVYIPTYT
:::::::.::.:::::::::.::...::::::::::.::::::::::.:::::::::.:.
NP_004 EKYGKDFTDIQQDFLPWKSLTSIIEYYYMWKTTDRYVQQKRLKAAEAESKLKQVYIPNYN
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350 360 370 380 390
pF1KB6 KPNPNQIISVGSKPGM-NGAGFQ-----KGLTCESCHTTQSAQWYAWGPPNMQCRLCASC
::::::: . : :. ::.: : .::::.:::: :::.::::::::::::::
NP_004 KPNPNQISVNNVKAGVVNGTGAPGQSPGAGRACESCYTTQSYQWYSWGPPNMQCRLCASC
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB6 WIYWKKYGGLKTPTQLEGATRGTTEPHSRGHLSRPEAQSLSPYTTSANRAKLLAKNRQTF
: ::::::::: ::.:.: : .. . : . : .: :: :. :.::.:
NP_004 WTYWKKYGGLKMPTRLDGERPGPNRSNMSPH-GLPARSSGSP--------KFAMKTRQAF
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pF1KB6 LLQTTKLTRLARRMCRDLLQPRRAARRPYAPINANAIKAECSIRLPKAAKTPLKIHPLVR
:.::::::.:::.::..:.: .:::.:: :::. ::::::. :::.:...:: .. ::
NP_004 YLHTTKLTRIARRLCREILRPWHAARHPYLPINSAAIKAECTARLPEASQSPLVLKQAVR
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pF1KB6 LPLATIVKDLVAQA-PLKPK------------TP--------RGTKTPINRNQLSQNRGL
:: .... : .. : :: :: :. : ... . :. :.
NP_004 KPLEAVLRYLETHPRPPKPDPVKSVSSVLSSLTPAKVAPVINNGSPTILGKRSYEQHNGV
540 550 560 570 580 590
560 570 580 590
pF1KB6 GGIMVKR--------AYETMA---GAGVPFSANGRPLASG---IRSSSQPAAKRQKLNPA
: : :: : . .: : . . ::. . ::..: : .::...:
NP_004 DGNMKKRLLMPSRGLANHGQARHMGPSRNLLLNGKSYPTKVRLIRGGSLPPVKRRRMNWI
600 610 620 630 640 650
600 610 620 630 640 650
pF1KB6 DAPNPVVFVATKDTRALRKALTHLEMRRAARRPNLPLKVKPTLIAVRPPVPLPAPSHPAS
:::. : ..::..:: .:: :. : .:::::: :. .. . :. : : ::: .
NP_004 DAPDDVFYMATEETRKIRKLLSSSETKRAARRPYKPIALRQSQ-ALPPRPPPPAPVN---
660 670 680 690 700
660
pF1KB6 TNEPIVLED
.::::.::
NP_004 -DEPIVIED
710
>>XP_011535608 (OMIM: 603526) PREDICTED: metastasis-asso (771 aa)
initn: 2303 init1: 1511 opt: 2164 Z-score: 2092.6 bits: 397.8 E(85289): 8e-110
Smith-Waterman score: 2595; 58.5% identity (75.4% similar) in 720 aa overlap (10-668:66-771)
10 20 30
pF1KB6 MAANMYRVGDYVYFENSSSNPYLVRRIEELNKTANGNVE
::::::::::::::.:::::::::::::::
XP_011 CVCSPWSLWPGVLGAVRPPTCPPRGLPLPADYVYFENSSSNPYLIRRIEELNKTANGNVE
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40 50 60 70
pF1KB6 AKVVCLFRRRDISSSLNSLADSNAR-----------------EFEEESKQP---GVSEQQ
:::::..:::::::.: .:::..: :.::: ..: . :.
XP_011 AKVVCFYRRRDISSTLIALADKHATLSVCYKAGPGADNGEEGEIEEEMENPEMVDLPEKL
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.:::.:::::::::.::::::::::::::::::::. :..:::.:: ::::::.:: :::
XP_011 KHQLRHRELFLSRQLESLPATHIRGKCSVTLLNETESLKSYLEREDFFFYSLVYDPQQKT
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pF1KB6 LLADQGEIRVGCKYQAEIPDRLVEGESDNRNQQKMEMKVWDPDNPLTDRQIDQFLVVARA
::::.:::::: .:::.: : : ::: :.:.:...: .::. :::::.::::::::::.
XP_011 LLADKGEIRVGNRYQADITDLLKEGEEDGRDQSRLETQVWEAHNPLTDKQIDQFLVVARS
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:::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::..: ::..::.:.::::::::
XP_011 VGTFARALDCSSSVRQPSLHMSAAAASRDITLFHAMDTLHKNIYDISKAISALVPQGGPV
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pF1KB6 LCRDEMEEWSASEAMLFEEALEKYGKDFNDIRQDFLPWKSLASIVQFYYMWKTTDRYIQQ
:::::::::::::: :::::::::::::.::.:::::::::.::...::::::::::.::
XP_011 LCRDEMEEWSASEANLFEEALEKYGKDFTDIQQDFLPWKSLTSIIEYYYMWKTTDRYVQQ
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pF1KB6 KRLKAAEADSKLKQVYIPTYTKPNPNQIISVGSKPGM-NGAGFQ-----KGLTCESCHTT
::::::::.:::::::::.:.::::::: . : :. ::.: : .::::.::
XP_011 KRLKAAEAESKLKQVYIPNYNKPNPNQISVNNVKAGVVNGTGAPGQSPGAGRACESCYTT
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380 390 400 410 420 430
pF1KB6 QSAQWYAWGPPNMQCRLCASCWIYWKKYGGLKTPTQLEGATRGTTEPHSRGHLSRPEAQS
:: :::.::::::::::::::: ::::::::: ::.:.: : .. . : . : .:
XP_011 QSYQWYSWGPPNMQCRLCASCWTYWKKYGGLKMPTRLDGERPGPNRSNMSPH-GLPARSS
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440 450 460 470 480 490
pF1KB6 LSPYTTSANRAKLLAKNRQTFLLQTTKLTRLARRMCRDLLQPRRAARRPYAPINANAIKA
:: :. :.::.: :.::::::.:::.::..:.: .:::.:: :::. ::::
XP_011 GSP--------KFAMKTRQAFYLHTTKLTRIARRLCREILRPWHAARHPYLPINSAAIKA
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pF1KB6 ECSIRLPKAAKTPLKIHPLVRLPLATIVKDLVAQA-PLKPK------------TP-----
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XP_011 ECTARLPEASQSPLVLKQAVRKPLEAVLRYLETHPRPPKPDPVKSVSSVLSSLTPAKVAP
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pF1KB6 ---RGTKTPINRNQLSQNRGLGGIMVKR--------AYETMA---GAGVPFSANGRPLAS
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XP_011 VINNGSPTILGKRSYEQHNGVDGNMKKRLLMPSRGLANHGQARHMGPSRNLLLNGKSYPT
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pF1KB6 G---IRSSSQPAAKRQKLNPADAPNPVVFVATKDTRALRKALTHLEMRRAARRPNLPLKV
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pF1KB6 KPTLIAVRPPVPLPAPSHPASTNEPIVLED
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XP_011 RQSQ-ALPPRPPPPAPVN----DEPIVIED
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668 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 13:51:53 2016 done: Sat Nov 5 13:51:55 2016
Total Scan time: 11.260 Total Display time: 0.190
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]