FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB6215, 669 aa 1>>>pF1KB6215 669 - 669 aa - 669 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.9208+/-0.00106; mu= -4.0259+/- 0.064 mean_var=375.9157+/-75.038, 0's: 0 Z-trim(115.5): 30 B-trim: 62 in 1/53 Lambda= 0.066150 statistics sampled from 16084 (16113) to 16084 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.785), E-opt: 0.2 (0.495), width: 16 Scan time: 4.600 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS10792.1 MMP15 gene_id:4324|Hs108|chr16 ( 669) 4818 474.0 2.9e-133 CCDS6246.1 MMP16 gene_id:4325|Hs108|chr8 ( 607) 1092 118.4 3e-26 CCDS46593.1 MMP24 gene_id:10893|Hs108|chr20 ( 645) 1073 116.6 1.1e-25 CCDS9577.1 MMP14 gene_id:4323|Hs108|chr14 ( 582) 1071 116.4 1.2e-25 CCDS10492.1 MMP25 gene_id:64386|Hs108|chr16 ( 562) 832 93.6 8.4e-19 CCDS8322.1 MMP1 gene_id:4312|Hs108|chr11 ( 469) 652 76.3 1.1e-13 CCDS8318.1 MMP20 gene_id:9313|Hs108|chr11 ( 483) 648 75.9 1.5e-13 CCDS8320.1 MMP8 gene_id:4317|Hs108|chr11 ( 467) 611 72.4 1.6e-12 CCDS73375.1 MMP12 gene_id:4321|Hs108|chr11 ( 470) 606 71.9 2.3e-12 CCDS8324.1 MMP13 gene_id:4322|Hs108|chr11 ( 471) 598 71.2 3.9e-12 >>CCDS10792.1 MMP15 gene_id:4324|Hs108|chr16 (669 aa) initn: 4818 init1: 4818 opt: 4818 Z-score: 2505.9 bits: 474.0 E(32554): 2.9e-133 Smith-Waterman score: 4818; 100.0% identity (100.0% similar) in 669 aa overlap (1-669:1-669) 10 20 30 40 50 60 pF1KB6 MGSDPSAPGRPGWTGSLLGDREEAARPRLLPLLLVLLGCLGLGVAAEDAEVHAENWLRLY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 MGSDPSAPGRPGWTGSLLGDREEAARPRLLPLLLVLLGCLGLGVAAEDAEVHAENWLRLY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB6 GYLPQPSRHMSTMRSAQILASALAEMQRFYGIPVTGVLDEETKEWMKRPRCGVPDQFGVR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 GYLPQPSRHMSTMRSAQILASALAEMQRFYGIPVTGVLDEETKEWMKRPRCGVPDQFGVR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB6 VKANLRRRRKRYALTGRKWNNHHLTFSIQNYTEKLGWYHSMEAVRRAFRVWEQATPLVFQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 VKANLRRRRKRYALTGRKWNNHHLTFSIQNYTEKLGWYHSMEAVRRAFRVWEQATPLVFQ 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB6 EVPYEDIRLRRQKEADIMVLFASGFHGDSSPFDGTGGFLAHAYFPGPGLGGDTHFDADEP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 EVPYEDIRLRRQKEADIMVLFASGFHGDSSPFDGTGGFLAHAYFPGPGLGGDTHFDADEP 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB6 WTFSSTDLHGNNLFLVAVHELGHALGLEHSSNPNAIMAPFYQWKDVDNFKLPEDDLRGIQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 WTFSSTDLHGNNLFLVAVHELGHALGLEHSSNPNAIMAPFYQWKDVDNFKLPEDDLRGIQ 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB6 QLYGTPDGQPQPTQPLPTVTPRRPGRPDHRPPRPPQPPPPGGKPERPPKPGPPVQPRATE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 QLYGTPDGQPQPTQPLPTVTPRRPGRPDHRPPRPPQPPPPGGKPERPPKPGPPVQPRATE 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB6 RPDQYGPNICDGDFDTVAMLRGEMFVFKGRWFWRVRHNRVLDNYPMPIGHFWRGLPGDIS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 RPDQYGPNICDGDFDTVAMLRGEMFVFKGRWFWRVRHNRVLDNYPMPIGHFWRGLPGDIS 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB6 AAYERQDGRFVFFKGDRYWLFREANLEPGYPQPLTSYGLGIPYDRIDTAIWWEPTGHTFF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 AAYERQDGRFVFFKGDRYWLFREANLEPGYPQPLTSYGLGIPYDRIDTAIWWEPTGHTFF 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB6 FQEDRYWRFNEETQRGDPGYPKPISVWQGIPASPKGAFLSNDAAYTYFYKGTKYWKFDNE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 FQEDRYWRFNEETQRGDPGYPKPISVWQGIPASPKGAFLSNDAAYTYFYKGTKYWKFDNE 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KB6 RLRMEPGYPKSILRDFMGCQEHVEPGPRWPDVARPPFNPHGGAEPGADSAEGDVGDGDGD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 RLRMEPGYPKSILRDFMGCQEHVEPGPRWPDVARPPFNPHGGAEPGADSAEGDVGDGDGD 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KB6 FGAGVNKDGGSRVVVQMEEVARTVNVVMVLVPLLLLLCVLGLTYALVQMQRKGAPRVLLY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 FGAGVNKDGGSRVVVQMEEVARTVNVVMVLVPLLLLLCVLGLTYALVQMQRKGAPRVLLY 610 620 630 640 650 660 pF1KB6 CKRSLQEWV ::::::::: CCDS10 CKRSLQEWV >>CCDS6246.1 MMP16 gene_id:4325|Hs108|chr8 (607 aa) initn: 1543 init1: 1053 opt: 1092 Z-score: 584.7 bits: 118.4 E(32554): 3e-26 Smith-Waterman score: 2394; 53.8% identity (76.6% similar) in 638 aa overlap (32-669:22-607) 10 20 30 40 50 60 pF1KB6 GSDPSAPGRPGWTGSLLGDREEAARPRLLPLLLVLLGCLGLGVAAEDAEVHAENWLRLYG .: .:: : : . . ..: ::. :: CCDS62 MILLTFSTGRRLDFVHHSGVFFLQTLLWILCATVCGTEQYFNVEVWLQKYG 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB6 YLPQPSRHMSTMRSAQILASALAEMQRFYGIPVTGVLDEETKEWMKRPRCGVPDQFGVRV ::: . .::..:::. . :::: ::.:::: .:: .:..: .:::.:::::::: .: CCDS62 YLPPTDPRMSVLRSAETMQSALAAMQQFYGINMTGKVDRNTIDWMKKPRCGVPDQ--TRG 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KB6 KANLRRRRKRYALTGRKWNNHHLTFSIQNYTEKLGWYHSMEAVRRAFRVWEQATPLVFQE ..... :::::::::.::...:.:.::.: : :.: .. .:.:::: ::...:::.:.: CCDS62 SSKFHIRRKRYALTGQKWQHKHITYSIKNVTPKVGDPETRKAIRRAFDVWQNVTPLTFEE 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KB6 VPYEDIRLRRQKEADIMVLFASGFHGDSSPFDGTGGFLAHAYFPGPGLGGDTHFDADEPW ::: ... ....:: ..:::::::::::::: :::::::::::::.:::::::.:::: CCDS62 VPYSELE-NGKRDVDITIIFASGFHGDSSPFDGEGGFLAHAYFPGPGIGGDTHFDSDEPW 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KB6 TFSSTDLHGNNLFLVAVHELGHALGLEHSSNPNAIMAPFYQWKDVDNFKLPEDDLRGIQQ :... . ::.::::::::::::::::::..:.::::::::. ..::::::.:::.:::. CCDS62 TLGNPNHDGNDLFLVAVHELGHALGLEHSNDPTAIMAPFYQYMETDNFKLPNDDLQGIQK 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KB6 LYGTPDGQPQPTQPLPTVTPRRPGRPDHRPPRPPQPPPPGGKPERPPKPGPPVQPRATER .:: :: : ::.::::: :.: . : : . .: :: ::: : : : : CCDS62 IYGPPDKIPPPTRPLPTVPPHR-SIPPADPRKNDRPKPP-----RPPT-GRPSYPGAK-- 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 pF1KB6 PDQYGPNICDGDFDTVAMLRGEMFVFKGRWFWRVRHNRVLDNYPMPIGHFWRGLPGDISA ::::::.:.:.:.:: :::::: .::::::.:::.:.::: : .:::::: .:.: CCDS62 -----PNICDGNFNTLAILRREMFVFKDQWFWRVRNNRVMDGYPMQITYFWRGLPPSIDA 340 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 480 pF1KB6 AYERQDGRFVFFKGDRYWLFREANLEPGYPQPLTSYGLGIPYDRIDTAIWWEPTGHTFFF .:: .:: ::::::..::.:....:.::::. : . : ::: ::.::::: .:.:.:: CCDS62 VYENSDGNFVFFKGNKYWVFKDTTLQPGYPHDLITLGSGIPPHGIDSAIWWEDVGKTYFF 400 410 420 430 440 450 490 500 510 520 530 540 pF1KB6 QEDRYWRFNEETQRGDPGYPKPISVWQGIPASPKGAFLSNDAAYTYFYKGTKYWKFDNER . :::::..:: . ::::::::.::.::: ::.:::. .. ..:::::: .::::.:. CCDS62 KGDRYWRYSEEMKTMDPGYPKPITVWKGIPESPQGAFVHKENGFTYFYKGKEYWKFNNQI 460 470 480 490 500 510 550 560 570 580 590 600 pF1KB6 LRMEPGYPKSILRDFMGCQEHVEPGPRWPDVARPPFNPHGGAEPGADSAEGDVGDGDGDF :..:::::.:::.:::::. :: : .. :: : : CCDS62 LKVEPGYPRSILKDFMGCD-----GPT--DRVK----------------EGHSPPDDVD- 520 530 540 550 610 620 630 640 650 660 pF1KB6 GAGVNKDGGSRVVVQMEEVARTVNVVMVLVPLLLLLCVLGLTYALVQMQRKGAPRVLLYC .:......: ::... ...: .: ::.: :.:.. :..:::.:: .::: CCDS62 -----------IVIKLDNTASTVKAIAIVIPCILALCLLVLVYTVFQFKRKGTPRHILYC 560 570 580 590 pF1KB6 KRSLQEWV :::.:::: CCDS62 KRSMQEWV 600 >>CCDS46593.1 MMP24 gene_id:10893|Hs108|chr20 (645 aa) initn: 2132 init1: 1001 opt: 1073 Z-score: 574.5 bits: 116.6 E(32554): 1.1e-25 Smith-Waterman score: 2349; 52.7% identity (72.3% similar) in 692 aa overlap (5-669:17-645) 10 20 30 40 pF1KB6 MGSDPSAPGR-PGWTGSLLGDREEAARPRLLPLLLVLLGCL------- : ::. : :. : .. ::: ::: : :: CCDS46 MPRSRGGRAAPGPPPPPPPPGQAPRWS------RWRVP-GRLLLLLLPALCCLPGAARAA 10 20 30 40 50 50 60 70 80 pF1KB6 ----GLG----VA-----AEDAEVH--AENWLRLYGYL-PQPSRHMSTMRSAQILASALA : : :: :..::. ..:::. :::: : :: :...::. : ::.. CCDS46 AAAAGAGNRAAVAVAVARADEAEAPFAGQNWLKSYGYLLPYDSR-ASALHSAKALQSAVS 60 70 80 90 100 110 90 100 110 120 130 140 pF1KB6 EMQRFYGIPVTGVLDEETKEWMKRPRCGVPDQFGVRVKANLRRRRKRYALTGRKWNNHHL ::.:::::::::::. : ::::.:::::::. . . ::: :::::::.:: ..:. CCDS46 TMQQFYGIPVTGVLDQTTIEWMKKPRCGVPDHPHL----SRRRRNKRYALTGQKWRQKHI 120 130 140 150 160 150 160 170 180 190 200 pF1KB6 TFSIQNYTEKLGWYHSMEAVRRAFRVWEQATPLVFQEVPYEDIRLRRQKEADIMVLFASG :.::.::: :.: . .:.:.:: ::...:::.:.::::..:. : ::::::..:::: CCDS46 TYSIHNYTPKVGELDTRKAIRQAFDVWQKVTPLTFEEVPYHEIKSDR-KEADIMIFFASG 170 180 190 200 210 220 210 220 230 240 250 260 pF1KB6 FHGDSSPFDGTGGFLAHAYFPGPGLGGDTHFDADEPWTFSSTDLHGNNLFLVAVHELGHA :::::::::: :::::::::::::.:::::::.:::::..... ::.:::::::::::: CCDS46 FHGDSSPFDGEGGFLAHAYFPGPGIGGDTHFDSDEPWTLGNANHDGNDLFLVAVHELGHA 230 240 250 260 270 280 270 280 290 300 310 320 pF1KB6 LGLEHSSNPNAIMAPFYQWKDVDNFKLPEDDLRGIQQLYGTPDGQPQPTQPLPTVTPRRP :::::::.:.::::::::. .. :::::.:::.:::..:: : .::.::::. :: CCDS46 LGLEHSSDPSAIMAPFYQYMETHNFKLPQDDLQGIQKIYGPPAEPLEPTRPLPTLPVRRI 290 300 310 320 330 340 330 340 350 360 370 380 pF1KB6 GRPDHRP-PRPPQPP-PPGGKPERPPKPGPPVQPRATERPDQYGPNICDGDFDTVAMLRG :..: : :.:: :: : .:: :: ::::::.:.:::..:: CCDS46 HSPSERKHERQPRPPRPPLG--DRPSTPGTK-------------PNICDGNFNTVALFRG 350 360 370 380 390 390 400 410 420 430 440 pF1KB6 EMFVFKGRWFWRVRHNRVLDNYPMPIGHFWRGLPGDISAAYERQDGRFVFFKGDRYWLFR :::::: :::::.:.::: ..::: : .::.:::. :.::::: ::::::::::.::.:. CCDS46 EMFVFKDRWFWRLRNNRVQEGYPMQIEQFWKGLPARIDAAYERADGRFVFFKGDKYWVFK 400 410 420 430 440 450 450 460 470 480 490 500 pF1KB6 EANLEPGYPQPLTSYGLGIPYDRIDTAIWWEPTGHTFFFQEDRYWRFNEETQRGDPGYPK :...:::::. : : .: . ::::. :::.:.:.::. .::::..:: . :::::: CCDS46 EVTVEPGYPHSLGELGSCLPREGIDTALRWEPVGKTYFFKGERYWRYSEERRATDPGYPK 460 470 480 490 500 510 510 520 530 540 550 560 pF1KB6 PISVWQGIPASPKGAFLSNDAAYTYFYKGTKYWKFDNERLRMEPGYPKSILRDFMGC-QE ::.::.::: .:.:::.:... ::::::: ::::::..: .:::::..::::.::: :. CCDS46 PITVWKGIPQAPQGAFISKEGYYTYFYKGRDYWKFDNQKLSVEPGYPRNILRDWMGCNQK 520 530 540 550 560 570 570 580 590 600 610 620 pF1KB6 HVEPGPRWPDVARPPFNPHGGAEPGADSAEGDVGDGDGDFGAGVNKDGGSRVVVQMEEVA .:: : . : . :: ..: ...: CCDS46 EVE---RRKERRLP---------------QDDVD-----------------IMVTINDVP 580 590 630 640 650 660 pF1KB6 RTVNVVMVLVPLLLLLCVLGLTYALVQMQRKGAPRVLLYCKRSLQEWV .::.: :..: .: ::.: :.:.. :.. : .:. . : :: .:::: CCDS46 GSVNAVAVVIPCILSLCILVLVYTIFQFKNKTGPQPVTYYKRPVQEWV 600 610 620 630 640 >>CCDS9577.1 MMP14 gene_id:4323|Hs108|chr14 (582 aa) initn: 2098 init1: 1033 opt: 1071 Z-score: 574.1 bits: 116.4 E(32554): 1.2e-25 Smith-Waterman score: 2312; 53.6% identity (73.6% similar) in 645 aa overlap (27-669:8-582) 10 20 30 40 50 pF1KB6 MGSDPSAPGRPGWTGSLLGDREEAARPR--LLPLLLVLLGCLGLGVAAEDAEVHAENWLR :: ::::: . . .:: .:... : ::. CCDS95 MSPAPRPPRCLLLPLLTLGTALASLG-SAQSSSFSPEAWLQ 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KB6 LYGYLPQPSRHMSTMRSAQILASALAEMQRFYGIPVTGVLDEETKEWMKRPRCGVPDQFG ::::: . . :.:: : :..:.: ::.:::. ::: : .: . :.::::::::.:: CCDS95 QYGYLPPGDLRTHTQRSPQSLSAAIAAMQKFYGLQVTGKADADTMKAMRRPRCGVPDKFG 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KB6 VRVKANLRRRRKRYALTGRKWNNHHLTFSIQNYTEKLGWYHSMEAVRRAFRVWEQATPLV ...:::.: :::::. : ::.....:: ::::: :.: : ..::.:.::::::.:::: CCDS95 AEIKANVR--RKRYAIQGLKWQHNEITFCIQNYTPKVGEYATYEAIRKAFRVWESATPLR 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KB6 FQEVPYEDIRLRRQKEADIMVLFASGFHGDSSPFDGTGGFLAHAYFPGPGLGGDTHFDAD :.:::: :: ..:.::::..:: ::::::.:::: ::::::::::::..:::::::. CCDS95 FREVPYAYIREGHEKQADIMIFFAEGFHGDSTPFDGEGGFLAHAYFPGPNIGGDTHFDSA 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KB6 EPWTFSSTDLHGNNLFLVAVHELGHALGLEHSSNPNAIMAPFYQWKDVDNFKLPEDDLRG :::: . ::.::..::::::::::::::::::.:.::::::::: :..:: ::.:: :: CCDS95 EPWTVRNEDLNGNDIFLVAVHELGHALGLEHSSDPSAIMAPFYQWMDTENFVLPDDDRRG 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KB6 IQQLYGTPDGQPQPTQPLPTVTPRRPGRPDHRPPRPPQPPPPGGKPERPPKPGPPVQPRA :::::: .: : : : .: : :. :: ::. : CCDS95 IQQLYGGESGFPTKMPPQPRTTSR-PSVPD--------------KPKNPT---------- 280 290 300 310 360 370 380 390 400 410 pF1KB6 TERPDQYGPNICDGDFDTVAMLRGEMFVFKGRWFWRVRHNRVLDNYPMPIGHFWRGLPGD ::::::::.::::::::::::::: :::::::.:.:.:.::::::.::::::.. CCDS95 ------YGPNICDGNFDTVAMLRGEMFVFKERWFWRVRNNQVMDGYPMPIGQFWRGLPAS 320 330 340 350 360 420 430 440 450 460 470 pF1KB6 ISAAYERQDGRFVFFKGDRYWLFREANLEPGYPQPLTSYGLGIPYDRIDTAIWWEPTGHT :..::::.::.:::::::..:.: ::.::::::. . : :.: :.::.:..: :.:.: CCDS95 INTAYERKDGKFVFFKGDKHWVFDEASLEPGYPKHIKELGRGLPTDKIDAALFWMPNGKT 370 380 390 400 410 420 480 490 500 510 520 530 pF1KB6 FFFQEDRYWRFNEETQRGDPGYPKPISVWQGIPASPKGAFLSNDAAYTYFYKGTKYWKFD .::. ..:.::::: . : ::: :.::.::: ::.:.:...: ..::::::.:::::. CCDS95 YFFRGNKYYRFNEELRAVDSEYPKNIKVWEGIPESPRGSFMGSDEVFTYFYKGNKYWKFN 430 440 450 460 470 480 540 550 560 570 580 590 pF1KB6 NERLRMEPGYPKSILRDFMGCQEHVEPGPRWPDVARPPFNPHGGAEPGADSAEGDVGDGD :..:..::::::: :::.::: : :: . : .: CCDS95 NQKLKVEPGYPKSALRDWMGC-------------------PSGGRPDEGTEEETEV---- 490 500 510 520 600 610 620 630 640 650 pF1KB6 GDFGAGVNKDGGSRVVVQMEEVARTVNVVMVLVPLLLLLCVLGLTYALVQMQRKGAPRVL . :...::. .:... :..:.:::: ::.. :. ..:.:.:: : CCDS95 --IIIEVDEEGGG-----------AVSAAAVVLPVLLLLLVLAVGLAVFFFRRHGTPRRL 530 540 550 560 570 660 pF1KB6 LYCKRSLQEWV :::.::: . : CCDS95 LYCQRSLLDKV 580 >>CCDS10492.1 MMP25 gene_id:64386|Hs108|chr16 (562 aa) initn: 948 init1: 261 opt: 832 Z-score: 451.0 bits: 93.6 E(32554): 8.4e-19 Smith-Waterman score: 1399; 40.9% identity (65.1% similar) in 565 aa overlap (26-576:4-521) 10 20 30 40 50 pF1KB6 MGSDPSAPGRPGWTGSLLGDREEAARPRLLPLLLVLLG--CLGLGVAAEDAEVHAENWLR : ::: :::.::. . .:.:. . .. :: CCDS10 MRLRLRLLALLLLLLAPPARAPKPSAQDVSLGVD-WLT 10 20 30 60 70 80 90 100 110 pF1KB6 LYGYLPQPSRHMSTMRSAQILASALAEMQRFYGIPVTGVLDEETKEWMKRPRCGVPDQFG ::::: : .. ..: . : .:. :::: :.: :: .: : :..:::..:: .: CCDS10 RYGYLPPPHPAQAQLQSPEKLRDAIKVMQRFAGLPETGRMDPGTVATMRKPRCSLPDVLG 40 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KB6 VRVKANLRRRRKRYALTGRKWNNHHLTFSIQNYTEKLGWYHSMEAVR----RAFRVWEQA : :.: :::.::::.: :... ::. .... .. :.:.:: :. .: . CCDS10 V---AGLVRRRRRYALSGSVWKKRTLTWRVRSFPQSSQL--SQETVRVLMSYALMAWGME 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KB6 TPLVFQEVPYEDIRLRRQKEADIMVLFASGFHGDSSPFDGTGGFLAHAYFPGPG-LGGDT . :.:.:: . .: ::.. :: .:: :: :::: :: ::::.::: ..::: CCDS10 SGLTFHEVDSP-----QGQEPDILIDFARAFHQDSYPFDGLGGTLAHAFFPGEHPISGDT 160 170 180 190 200 240 250 260 270 280 290 pF1KB6 HFDADEPWTFSSTDLHGNNLFLVAVHELGHALGLEHSSNPNAIMAPFYQWK--DVDNFKL ::: .: :::.: : .:..:: :::::.:::::: ::: ::.:: :::: : :...: CCDS10 HFDDEETWTFGSKDGEGTDLFAVAVHEFGHALGLGHSSAPNSIMRPFYQGPVGDPDKYRL 210 220 230 240 250 260 300 310 320 330 340 350 pF1KB6 PEDDLRGIQQLYGTPDGQPQPTQPLPTVTPRRPGRPDHRPPRPPQPPPPGGKPERPPKPG .:: :.::::: . : : .: : : ::: CCDS10 SQDDRDGLQQLYG-----------------KAPQTPYDKPTRKPLAPPPQ---------- 270 280 290 300 360 370 380 390 400 410 pF1KB6 PPVQPRATERPDQYGPNICDGDFDTVAMLRGEMFVFKGRWFWRVRHN-RVLDNYPMPIGH ::..: :. :. :. :.:.::..: .::: : ::: ::::.. . .... : . . CCDS10 PPASP--THSPSFPIPDRCEGNFDAIANIRGETFFFKGPWFWRLQPSGQLVSPRPARLHR 310 320 330 340 350 420 430 440 450 460 pF1KB6 FWRGLPGDI---SAAYERQ-DGRFVFFKGDRYWLFREANLEPGYPQPLTSYGLGIPYDRI ::.:::... .::: :. :::...:.: ..:.:.. .:: : .::: :: : ... CCDS10 FWEGLPAQVRVVQAAYARHRDGRILLFSGPQFWVFQDRQLEGG-ARPLTELGLP-PGEEV 360 370 380 390 400 410 470 480 490 500 510 520 pF1KB6 DTAIWWEPTGHTFFFQEDRYWRFNEETQRGDPGYPKPISVWQGIPASPKGAFLSNDAAYT :... : .:.:.. . .:::..: . : :::::. .:.:.: : :: . .:: :. : CCDS10 DAVFSWPQNGKTYLVRGRQYWRYDEAAARPDPGYPRDLSLWEGAPPSPDDVTVSN-AGDT 420 430 440 450 460 470 530 540 550 560 570 580 pF1KB6 YFYKGTKYWKFDNERLRMEPGYPKSILRDFMGCQEHVEPGPRWPDVARPPFNPHGGAEPG ::.::..::.: .. .. :: :. . ... : ::: : ::: CCDS10 YFFKGAHYWRFPKNSIKTEPDAPQPMGPNWLDCPAP-SSGPRAP---RPPKATPVSETCD 480 490 500 510 520 530 590 600 610 620 630 640 pF1KB6 ADSAEGDVGDGDGDFGAGVNKDGGSRVVVQMEEVARTVNVVMVLVPLLLLLCVLGLTYAL CCDS10 CQCELNQAAGRWPAPIPLLLLPLLVGGVASR 540 550 560 >>CCDS8322.1 MMP1 gene_id:4312|Hs108|chr11 (469 aa) initn: 981 init1: 247 opt: 652 Z-score: 359.2 bits: 76.3 E(32554): 1.1e-13 Smith-Waterman score: 938; 35.5% identity (59.4% similar) in 529 aa overlap (31-544:6-454) 10 20 30 40 50 pF1KB6 MGSDPSAPGRPGWTGSLLGDREEAARPRLLPLLLVLL-GCLGLGVAA----EDAEVH-AE ::::.:. : .. . : .. .: .. CCDS83 MHSFPPLLLLLFWGVVSHSFPATLETQEQDVDLVQ 10 20 30 60 70 80 90 100 110 pF1KB6 NWLRLYGYLPQPSRHMSTMRSAQILASALAEMQRFYGIPVTGVLDEETKEWMKRPRCGVP ..:. : : . .:.. :.. .. : .::.:.:. ::: : :: . ::.:::::: CCDS83 KYLEKYYNLKNDGRQVEKRRNSGPVVEKLKQMQEFFGLKVTGKPDAETLKVMKQPRCGVP 40 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KB6 D--QFGVRVKANLRRRRKRYALTGRKWNNHHLTFSIQNYTEKLGWYHSMEAVRRAFRVWE : :: : ...: : :.. :::. :.::: : .:...::..: CCDS83 DVAQF-VLTEGNPR------------WEQTHLTYRIENYTPDLPRADVDHAIEKAFQLWS 100 110 120 130 140 180 190 200 210 220 230 pF1KB6 QATPLVFQEVPYEDIRLRRQKEADIMVLFASGFHGDSSPFDGTGGFLAHAYFPGPGLGGD ..:::.: .: . .::::. :. : : :.::::: :: ::::. ::::.::: CCDS83 NVTPLTFTKV--------SEGQADIMISFVRGDHRDNSPFDGPGGNLAHAFQPGPGIGGD 150 160 170 180 190 240 250 260 270 280 290 pF1KB6 THFDADEPWTFSSTDLHGNNLFLVAVHELGHALGLEHSSNPNAIMAPFYQWKDVDNFKLP .::: :: :: .... :: ::.:::::.::: ::.. .:.: : : .. . .: CCDS83 AHFDEDERWT---NNFREYNLHRVAAHELGHSLGLSHSTDIGALMYPSYTFSG--DVQLA 200 210 220 230 240 300 310 320 330 340 350 pF1KB6 EDDLRGIQQLYGTPDGQPQPTQPLPTVTPRRPGRPDHRPPRPPQPPPPGGKPERPPKPGP .::. ::: .:: . .:.::. :: CCDS83 QDDIDGIQAIYGRSQ---NPVQPI----------------------------------GP 250 260 270 360 370 380 390 400 pF1KB6 PVQPRATERPDQYGPNICDGD--FDTVAMLRGEMFVFKGRWFWRVR--HNRVLDNYPMPI . :. ::. ::... .:::.. :: :.. :. . .: :. : CCDS83 QT------------PKACDSKLTFDAITTIRGEVMFFKDRFYMRTNPFYPEVELNF---I 280 290 300 310 410 420 430 440 450 460 pF1KB6 GHFWRGLPGDISAAYERQDGRFV-FFKGDRYWLFREANLEPGYPQPL-TSYGLGIPYDRI . :: ::. . :::: : : ::::..:: . :. :::. . .:.:. .: CCDS83 SVFWPQLPNGLEAAYEFADRDEVRFFKGNKYWAVQGQNVLHGYPKDIYSSFGFPRTVKHI 320 330 340 350 360 370 470 480 490 500 510 520 pF1KB6 DTAIWWEPTGHTFFFQEDRYWRFNEETQRGDPGYPKPISV-WQGIPASPKGAFLSNDAAY :.:. : ::.:.:: ..:::..: . :::::: :. . :: . ..:... .. CCDS83 DAALSEENTGKTYFFVANKYWRYDEYKRSMDPGYPKMIAHDFPGIGHKVDAVFMKD--GF 380 390 400 410 420 430 530 540 550 560 570 580 pF1KB6 TYFYKGTKYWKFDNERLRMEPGYPKSILRDFMGCQEHVEPGPRWPDVARPPFNPHGGAEP ::..::. .::: . :. CCDS83 FYFFHGTRQYKFDPKTKRILTLQKANSWFNCRKN 440 450 460 >>CCDS8318.1 MMP20 gene_id:9313|Hs108|chr11 (483 aa) initn: 675 init1: 244 opt: 648 Z-score: 357.0 bits: 75.9 E(32554): 1.5e-13 Smith-Waterman score: 895; 35.3% identity (60.1% similar) in 496 aa overlap (53-541:41-468) 30 40 50 60 70 80 pF1KB6 EAARPRLLPLLLVLLGCLGLGVAAEDAEVHAENWLRLYGYLPQPSRHMSTM--RSAQILA :. .: : : . ..... : :... . CCDS83 VFLIMALKFSTAAPSLVAASPRTWRNNYRLAQAYLDKY-YTNKEGHQIGEMVARGSNSMI 20 30 40 50 60 90 100 110 120 130 pF1KB6 SALAEMQRFYGIPVTGVLDEETKEWMKRPRCGVPDQFGVRVKANLRRRRKRYALTGR-KW . :.: :.:. ::: ::. : . .:.::::::: :: : . :. :: CCDS83 RKIKELQAFFGLQVTGKLDQTTMNVIKKPRCGVPDV------ANYR------LFPGEPKW 70 80 90 100 110 140 150 160 170 180 190 pF1KB6 NNHHLTFSIQNYTEKLGWYHSMEAVRRAFRVWEQATPLVFQEVPYEDIRLRRQKEADIMV ... ::. :..:: ... . .::. :...: .:.:: : .:. . :::::. CCDS83 KKNTLTYRISKYTPSMSSVEVDKAVEMALQAWSSAVPLSF-------VRIN-SGEADIMI 120 130 140 150 160 200 210 220 230 240 250 pF1KB6 LFASGFHGDSSPFDGTGGFLAHAYFPGPGLGGDTHFDADEPWTFSSTDLHGNNLFLVAVH : .: :::: :::: : ::::. :: ::::::::: : ::... .: ::: ::.: CCDS83 SFENGDHGDSYPFDGPRGTLAHAFAPGEGLGGDTHFDNAEKWTMGT---NGFNLFTVAAH 170 180 190 200 210 220 260 270 280 290 300 310 pF1KB6 ELGHALGLEHSSNPNAIMAPFYQWKDVDNFKLPEDDLRGIQQLYGTPDGQPQPTQPLPTV :.:::::: ::..:.:.: : :..:. .:.::.::..::: ::: CCDS83 EFGHALGLAHSTDPSALMYPTYKYKNPYGFHLPKDDVKGIQALYG--------------- 230 240 250 260 270 320 330 340 350 360 370 pF1KB6 TPRRPGRPDHRPPRPPQPPPPGGKPERPPKPGPPVQPRATERPDQYGPNICDGD--FDTV ::. ::: : : ..:. :..::.. ::.: CCDS83 -PRKVFL---------------GKPTLPHAPH--------HKPSI--PDLCDSSSSFDAV 280 290 300 380 390 400 410 420 430 pF1KB6 AMLRGEMFVFKGRWFWRVRHNRVLDNYPMPIGHFWRGLPGDISAAYERQD-GRFVFFKGD .:: :...:: : ::: . . : : . : ....:::: . : :::: CCDS83 TMLGKELLLFKDRIFWRRQVHLRTGIRPSTITSSFPQLMSNVDAAYEVAERGTAYFFKGP 310 320 330 340 350 360 440 450 460 470 480 490 pF1KB6 RYWLFREANLEPGYPQPLTSYGLGIPYDRIDTAIWWEPTGHTFFFQEDRYWRFNEETQRG .::. : ... : :. . ..:. ..::.:.. . .:.:: :.:. ..:. .. CCDS83 HYWITRGFQMQ-GPPRTIYDFGFPRHVQQIDAAVYLREPQKTLFFVGDEYYSYDERKRKM 370 380 390 400 410 420 500 510 520 530 540 550 pF1KB6 DPGYPKPISV-WQGIPASPKGAFLSNDAAYTYFYKGTKYWKFDNERLRMEPGYPKSILRD . ::: ..:. .. .: : .: ::..: : .:.:.:. CCDS83 EKDYPKNTEEEFSGVNGQIDAAVELN--GYIYFFSGPKTYKYDTEKEDVVSVVKSSSWIG 430 440 450 460 470 480 560 570 580 590 600 610 pF1KB6 FMGCQEHVEPGPRWPDVARPPFNPHGGAEPGADSAEGDVGDGDGDFGAGVNKDGGSRVVV CCDS83 C >>CCDS8320.1 MMP8 gene_id:4317|Hs108|chr11 (467 aa) initn: 955 init1: 256 opt: 611 Z-score: 338.1 bits: 72.4 E(32554): 1.6e-12 Smith-Waterman score: 1030; 35.6% identity (62.6% similar) in 519 aa overlap (28-538:5-446) 10 20 30 40 50 pF1KB6 MGSDPSAPGRPGWTGSLLGDREEAARPRLLPLLLVLLGCLG--LGVAAEDAEVHA-ENWL . ::.::.: .. . :.... .... ...: CCDS83 MFSLKTLPFLLLLHVQISKAFPVSSKEKNTKTVQDYL 10 20 30 60 70 80 90 100 110 pF1KB6 RLYGYLPQPSRHMSTMRSAQILASALAEMQRFYGIPVTGVLDEETKEWMKRPRCGVPDQF . . ::. . . . ...... : :::::.:. ::: .::: . ::.:::::::. CCDS83 EKFYQLPSNQYQSTRKNGTNVIVEKLKEMQRFFGLNVTGKPNEETLDMMKKPRCGVPDSG 40 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KB6 GVRVKANLRRRRKRYALTGRKWNNHHLTFSIQNYTEKLGWYHSMEAVRRAFRVWEQATPL : . . . ::. .::. :.::: .:. . .:.. ::..: :.:: CCDS83 GFMLTPG-----------NPKWERTNLTYRIRNYTPQLSEAEVERAIKDAFELWSVASPL 100 110 120 130 140 180 190 200 210 220 230 pF1KB6 VFQEVPYEDIRLRRQKEADIMVLFASGFHGDSSPFDGTGGFLAHAYFPGPGLGGDTHFDA .: .. : :::: . : . :::.::::: .:.::::. :: :.:::.:::: CCDS83 IFTRIS--------QGEADINIAFYQRDHGDNSPFDGPNGILAHAFQPGQGIGGDAHFDA 150 160 170 180 190 240 250 260 270 280 290 pF1KB6 DEPWTFSSTDLHGNNLFLVAVHELGHALGLEHSSNPNAIMAPFYQWKDVDNFKLPEDDLR .: :: .:.. ::::::.::.::.::: :::.:.:.: : : .....:..::.::. CCDS83 EETWTNTSANY---NLFLVAAHEFGHSLGLAHSSDPGALMYPNYAFRETSNYSLPQDDID 200 210 220 230 240 250 300 310 320 330 340 350 pF1KB6 GIQQLYGTPDGQPQPTQPLPTVTPRRPGRPDHRPPRPPQPPPPGGKPERPPKPGPPVQPR ::: .:: .. ::: : ::. : .: CCDS83 GIQAIYGLSSNPIQPTGP---STPK------------------------------PCDPS 260 270 280 360 370 380 390 400 410 pF1KB6 ATERPDQYGPNICDGDFDTVAMLRGEMFVFKGRWFWRVRH---NRVLDNYPMPIGHFWRG : ::... ::::.. :: :.::: :: .:: :. :. :: . CCDS83 LT--------------FDAITTLRGEILFFKDRYFWR-RHPQLQRVEMNF---ISLFWPS 290 300 310 320 420 430 440 450 460 470 pF1KB6 LPGDISAAYERQDGRFVF-FKGDRYWLFREANLEPGYPQPLTSYGLGIPYDRIDTAIWWE :: :.:::: : ..: :::..:: . .. :::. ...::. . ::.:.... CCDS83 LPTGIQAAYEDFDRDLIFLFKGNQYWALSGYDILQGYPKDISNYGFPSSVQAIDAAVFYR 330 340 350 360 370 380 480 490 500 510 520 530 pF1KB6 PTGHTFFFQEDRYWRFNEETQRGDPGYPKPIS-VWQGIPASPKGAFLSNDAAYTYFYKGT ..:.:: .:..::.... : .::::: :: .. :: .. ..: .. . . ..: CCDS83 --SKTYFFVNDQFWRYDNQRQFMEPGYPKSISGAFPGIESKVDAVFQQEH--FFHVFSGP 390 400 410 420 430 440 540 550 560 570 580 590 pF1KB6 KYWKFDNERLRMEPGYPKSILRDFMGCQEHVEPGPRWPDVARPPFNPHGGAEPGADSAEG .:. :: CCDS83 RYYAFDLIAQRVTRVARGNKWLNCRYG 450 460 >>CCDS73375.1 MMP12 gene_id:4321|Hs108|chr11 (470 aa) initn: 1055 init1: 261 opt: 606 Z-score: 335.5 bits: 71.9 E(32554): 2.3e-12 Smith-Waterman score: 996; 36.3% identity (58.6% similar) in 524 aa overlap (30-538:1-452) 10 20 30 40 50 pF1KB6 MGSDPSAPGRPGWTGSLLGDREEAARPRLLPLLLVLL------GCLGLGVAA---EDAEV . .::.:: : : :. .. .. . CCDS73 MKFLLILLLQATASGALPLNSSTSLEKNNVL 10 20 30 60 70 80 90 100 pF1KB6 HAENWL-RLYGYLPQPSRHMSTMR-SAQILASALAEMQRFYGIPVTGVLDEETKEWMKRP .: .: ..:: : . .. :. :.... . :::.: :. ::: :: : : :. : CCDS73 FGERYLEKFYG-LEINKLPVTKMKYSGNLMKEKIQEMQHFLGLKVTGQLDTSTLEMMHAP 40 50 60 70 80 90 110 120 130 140 150 160 pF1KB6 RCGVPDQFGVRVKANLRRRRKRYALTGRKWNNHHLTFSIQNYTEKLGWYHSMEAVRRAFR :::::: : . : : .:..:. :.::: .. :.:.::. CCDS73 RCGVPDVHHFREMPG-----------GPVWRKHYITYRINNYTPDMNREDVDYAIRKAFQ 100 110 120 130 170 180 190 200 210 220 pF1KB6 VWEQATPLVFQEVPYEDIRLRRQKEADIMVLFASGFHGDSSPFDGTGGFLAHAYFPGPGL :: ..::: :... :::.:.:: : ::: ::: ::.::::. :: :. CCDS73 VWSNVTPLKFSKI--------NTGMADILVVFARGAHGDFHAFDGKGGILAHAFGPGSGI 140 150 160 170 180 190 230 240 250 260 270 280 pF1KB6 GGDTHFDADEPWTFSSTDLHGNNLFLVAVHELGHALGLEHSSNPNAIMAPFYQWKDVDNF :::.::: :: :: : :.::::.::::.::.::: :::.:.:.: : :.. :...: CCDS73 GGDAHFDEDEFWTTHSG---GTNLFLTAVHEIGHSLGLGHSSDPKAVMFPTYKYVDINTF 200 210 220 230 240 290 300 310 320 330 340 pF1KB6 KLPEDDLRGIQQLYGTPDGQPQPTQPLPTVTPRRPGRPDHRPPRPPQPPPPGGKPERPPK .: ::.::::.::: .:. .: ::. CCDS73 RLSADDIRGIQSLYG----DPKENQRLPN------------------------------- 250 260 270 350 360 370 380 390 400 pF1KB6 PGPPVQPRATERPDQYGPNICDGD--FDTVAMLRGEMFVFKGRWFWRVRHNRVLDNYPMP ::. : .:: . ::.:. . ...: :: :.:: .: . . CCDS73 ------------PDNSEPALCDPNLSFDAVTTVGNKIFFFKDRFFWLKVSERPKTSVNL- 280 290 300 310 320 410 420 430 440 450 460 pF1KB6 IGHFWRGLPGDISAAYERQDGRFVF-FKGDRYWLFREANLEPGYPQPLTSYGLGIPYDRI :. .: ::. : :::: . :: :: :.:::. . ::.::. . :.:. .: CCDS73 ISSLWPTLPSGIEAAYEIEARNQVFLFKDDKYWLISNLRPEPNYPKSIHSFGFPNFVKKI 330 340 350 360 370 380 470 480 490 500 510 520 pF1KB6 DTAIWWEPTGHTFFFQEDRYWRFNEETQRGDPGYPKPISV-WQGIPASPKGAFLSNDAAY :.:.. .:.:: ...:::..:. : :::::: :. .::: . ..: :.. : CCDS73 DAAVFNPRFYRTYFFVDNQYWRYDERRQMMDPGYPKLITKNFQGIGPKIDAVFYSKNK-Y 390 400 410 420 430 530 540 550 560 570 580 pF1KB6 TYFYKGTKYWKFDNERLRMEPGYPKSILRDFMGCQEHVEPGPRWPDVARPPFNPHGGAEP ::..:.. ...: CCDS73 YYFFQGSNQFEYDFLLQRITKTLKSNSWFGC 440 450 460 470 >>CCDS8324.1 MMP13 gene_id:4322|Hs108|chr11 (471 aa) initn: 711 init1: 265 opt: 598 Z-score: 331.3 bits: 71.2 E(32554): 3.9e-12 Smith-Waterman score: 938; 35.1% identity (59.4% similar) in 515 aa overlap (44-553:31-469) 20 30 40 50 60 70 pF1KB6 TGSLLGDREEAARPRLLPLLLVLLGCLGLGVAAEDAEVHAENWLRLYGYLPQPSRHMSTM .. :: . :: .:: : : : . 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