FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB6217, 728 aa 1>>>pF1KB6217 728 - 728 aa - 728 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.2776+/-0.000868; mu= 8.6366+/- 0.053 mean_var=190.2909+/-37.960, 0's: 0 Z-trim(114.3): 18 B-trim: 0 in 0/53 Lambda= 0.092975 statistics sampled from 14870 (14888) to 14870 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.776), E-opt: 0.2 (0.457), width: 16 Scan time: 4.490 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS53738.1 SCNN1A gene_id:6337|Hs108|chr12 ( 728) 5094 695.8 6.1e-200 CCDS53739.1 SCNN1A gene_id:6337|Hs108|chr12 ( 692) 4813 658.1 1.3e-188 CCDS8543.1 SCNN1A gene_id:6337|Hs108|chr12 ( 669) 4675 639.6 4.7e-183 CCDS10609.1 SCNN1B gene_id:6338|Hs108|chr16 ( 640) 1210 174.8 3.7e-43 CCDS44037.2 SCNN1D gene_id:6339|Hs108|chr1 ( 802) 1196 173.0 1.6e-42 CCDS10608.1 SCNN1G gene_id:6340|Hs108|chr16 ( 649) 1163 168.5 3e-41 CCDS5915.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7 ( 549) 461 74.2 5.8e-13 CCDS5916.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7 ( 531) 412 67.7 5.4e-11 CCDS5914.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7 ( 543) 411 67.5 6e-11 >>CCDS53738.1 SCNN1A gene_id:6337|Hs108|chr12 (728 aa) initn: 5094 init1: 5094 opt: 5094 Z-score: 3703.0 bits: 695.8 E(32554): 6.1e-200 Smith-Waterman score: 5094; 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CCDS10 LDLFGDNHNGLTSSSASEK--ICNAHGCKMAMRLCSLNRTQCTFRNFTSATQALTEWYIL 170 180 190 200 210 220 320 330 340 350 360 370 pF1KB6 HYINILSRLPETLPSLEEDTLGN-FIFACRFNQVSCNQANYSHFHHPMYGNCYTFNDKNN . ::....:. .: . :. .:.:: :. :: :.. . .: ::::: :: . CCDS10 QATNIFAQVPQQ-ELVEMSYPGEQMILACLFGAEPCNYRNFTSIFYPHYGNCYIFNWGMT 230 240 250 260 270 280 380 390 400 410 420 430 pF1KB6 SNLWMSSMPGINNGLSLMLRAEQNDFIPLLSTVTGARVMVHGQDEPAFMDDGGFNLRPGV . :. :: . ::.:.: :.:..:.:....:.:.:.: : :. : :. :. CCDS10 EKALPSANPGTEFGLKLILDIGQEDYVPFLASTAGVRLMLHEQRSYPFIRDEGIYAMSGT 290 300 310 320 330 340 440 450 460 470 480 pF1KB6 ETSISMRKETLDRLGGDYGDCTKNGSDVPVENLYP---SKYTQQVCIHSCFQESMIKECG ::::.. . :.:.: :. :: :::.:::.:.: . :. :.:..::::. ::..:. CCDS10 ETSIGVLVDKLQRMGEPYSPCTVNGSEVPVQNFYSDYNTTYSIQACLRSCFQDHMIRNCN 350 360 370 380 390 400 490 500 510 520 530 540 pF1KB6 CAYIFYPRPQNVEYCDYRKHSSWGYCYYKLQVDFSSDHLGCFTKCRKPCSVTSYQLSAGY :.. .:: :.. .::. : .:..:: ::.. .. . :. :.. :. :.:... .. CCDS10 CGHYLYPLPRGEKYCNNRDFPDWAHCYSDLQMSVAQRET-CIGMCKESCNDTQYKMTISM 410 420 430 440 450 550 560 570 580 590 600 pF1KB6 SRWPSVTSQEWVFQMLSRQNNYTVNN--KRNGVAKVNIFFKELNYKTNSESPSVTMVTLL . ::: .:..:.:..::.. . ..: .:.:..:.::.:.:.::.: :: . ..: :: CCDS10 ADWPSEASEDWIFHVLSQERDQSTNITLSRKGIVKLNIYFQEFNYRTIEESAANNIVWLL 460 470 480 490 500 510 610 620 630 640 650 660 pF1KB6 SNLGSQWSLWFGSSVLSVVEMAELVFDLL---VIMFLMLLRRFRSRYWSPGRGGRGAQEV ::::.:...:.:.::: ..:..:...:.. .: .. : . .:.: . . .: : CCDS10 SNLGGQFGFWMGGSVLCLIEFGEIIIDFVWITIIKLVALAKSLRQRRAQASYAG-PPPTV 520 530 540 550 560 570 670 680 690 700 710 720 pF1KB6 ASTLASSPPSHFCPHPMSLSLSQPGPAPS----PALTAPPPAYATLGPRPSPGGSAGASS : . . : : : . :: :: : .::: : .: .: CCDS10 AELVEAHTNFGFQPDTAPRS-PNTGPYPSEQALPIPGTPPPNYDSLRLQPLDVIESDSEG 580 590 600 610 620 630 pF1KB6 SACPLGGP CCDS10 DAI 640 >>CCDS44037.2 SCNN1D gene_id:6339|Hs108|chr1 (802 aa) initn: 1521 init1: 675 opt: 1196 Z-score: 876.7 bits: 173.0 E(32554): 1.6e-42 Smith-Waterman score: 1590; 36.4% identity (65.9% similar) in 701 aa overlap (26-710:130-796) 10 20 30 40 50 pF1KB6 MGMARGSLTRVPGVMGEGTQGPELSLDPDPCSPQSTPGLMK---GNKLEEQDPRP : :. : .. : : :. : ..: : CCDS44 AFLSRTSPVAAASFQSRQEARGSILLQSCQLPPQWLSTEAWTGEWKQPHGGALTSRSPGP 100 110 120 130 140 150 60 70 80 90 100 pF1KB6 LQPI-PGLMEGNKLEEQDSSPPQSTPGLMKGNKREEQGLGP-EPAAPQQPTAE--EEALI . : : ..: . : : . . .:. . : :.:: : : .:.:. CCDS44 VAPQRPCHLKG-----WQHRPTQHNAACKQGQAAAQTPPRPGPPSAPPPPPKEGHQEGLV 160 170 180 190 200 210 110 120 130 140 150 160 pF1KB6 EFHRSYRELFEFFCNNTTIHGAIRLVCSQHNRMKTAFWAVLWLCTFGMMYWQFGLLFGEY :. :.:::. :::.:.:::::::::::. ::.::. :..: : .. . ::.:::: .. CCDS44 ELPASFRELLTFFCTNATIHGAIRLVCSRGNRLKTTSWGLLSLGALVALCWQLGLLFERH 220 230 240 250 260 270 170 180 190 200 210 220 pF1KB6 FSYPVSLNINLNSDKLVFPAVTICTLNPYRYPEIKEELEELDRITEQTLFDLYKYSSFTT . :: . ....:.. ..: ::.: :: : . ..:: ::....... .::. CCDS44 WHRPVLMAVSVHSERKLLPLVTLCDGNPRRPSPVLRHLELLDEFARENIDSLYN------ 280 290 300 310 320 230 240 250 260 270 280 pF1KB6 LVAGSRSRRDLRGTLPHPLQRLRVPPPPHGARRARSVASSLRDNNPQVDWKDWKIGFQLC : :..: : .:.: : :: : :. : . : .. .: ..::.:: CCDS44 -VNLSKGRAALSATVP------RHEPPFHLDREIR--LQRLSHSGSRV-----RVGFRLC 330 340 350 360 370 290 300 310 320 330 340 pF1KB6 NQNKSDCFYQTYSSGVDAVREWYRFHYINILSRLPETLPSLEEDTLGNFIFACRFNQVSC :.. .::::. :.::: ::..::.:::..::. :: . . . . :.:...: .. ..: CCDS44 NSTGGDCFYRGYTSGVAAVQDWYHFHYVDILALLPAAWEDSHGSQDGHFVLSCSYDGLDC 380 390 400 410 420 430 350 360 370 380 390 400 pF1KB6 NQANYSHFHHPMYGNCYTFNDKNNSNLWMSSMPGINNGLSLMLRAEQNDFIPLLSTVTGA . .. :::: ::.::: . ..: .. :::..:..:.::.::. .:::::..: CCDS44 QARQFRTFHHPTYGSCYTVD-----GVWTAQRPGITHGVGLVLRVEQQPHLPLLSTLAGI 440 450 460 470 480 410 420 430 440 450 460 pF1KB6 RVMVHGQDEPAFMDDGGFNLRPGVETSISMRKETLDRLGGDYGDCTKNGSDVPVENLYPS ::::::... :. .:..:::.:..::.:.. . :::. :: :: .: : :: :. . CCDS44 RVMVHGRNHTPFLGHHSFSVRPGTEATISIREDEVHRLGSPYGHCTAGGEGVEVELLHNT 490 500 510 520 530 540 470 480 490 500 510 520 pF1KB6 KYTQQVCIHSCFQESMIKECGCAYIFYPRPQNVEYCDYRKHSSWGYCYYKLQVDFSSDHL .::.:.:. ::::. :.. :.:.: ..: : ..:::. .: .::.:.:.: :. . .: CCDS44 SYTRQACLVSCFQQLMVETCSCGYYLHPLPAGAEYCSSARHPAWGHCFYRLYQDLETHRL 550 560 570 580 590 600 530 540 550 560 570 580 pF1KB6 GCFTKCRKPCSVTSYQLSAGYSRWPSVTSQEWVFQMLSRQN-NYTVNNKRNGVAKVNIFF : ..: .:: ....::.: :::::. : :.. :..:. . . .:...::.:: . CCDS44 PCTSRCPRPCRESAFKLSTGTSRWPSAKSAGWTLATLGEQGLPHQSHRQRSSLAKINIVY 610 620 630 640 650 660 590 600 610 620 630 640 pF1KB6 KELNYKTNSESPSVTMVTLLSNLGSQWSLWFGSSVLSVVEMAELVFDLLVIMFLMLLRRF .::::.. :.: .. ::: .:: :::::.::::..:. ::..: .. ... ::. CCDS44 QELNYRSVEEAPVYSVPQLLSAMGSLCSLWFGASVLSLLELLELLLDASALTLVLGGRRL 670 680 690 700 710 720 650 660 670 680 690 700 pF1KB6 RSRY--WSPGRGGRGAQEVASTLASSPPSHFCPHPMSLSLSQP-GPA-PS---PALTAPP : . : . . ::. . .. :: : . . .: :: : :.. : CCDS44 RRAWFSWPRASPASGASSIKPEASQMPP----PAGGTSDDPEPSGPHLPRVMLPGVLAGV 730 740 750 760 770 780 710 720 pF1KB6 PAYATL-GPRPSPGGSAGASSSACPLGGP : . ::.: CCDS44 SAEESWAGPQPLETLDT 790 800 >>CCDS10608.1 SCNN1G gene_id:6340|Hs108|chr16 (649 aa) initn: 1330 init1: 943 opt: 1163 Z-score: 854.1 bits: 168.5 E(32554): 3e-41 Smith-Waterman score: 1332; 34.8% identity (65.3% similar) in 620 aa overlap (113-712:24-625) 90 100 110 120 130 140 pF1KB6 NKREEQGLGPEPAAPQQPTAEEEALIEFHRSYRELFEFFCNNTTIHGAIRLVCSQHNRMK . .::....: ::. :: :.: :. .:.. CCDS10 MAPGEKIKAKIKKNLPVTGPQAPTIKELMRWYCLNTNTHGCRRIVVSR-GRLR 10 20 30 40 50 150 160 170 180 190 200 pF1KB6 TAFWAVLWLCTFGMMYWQFGLLFGEYFSYPVSLNINLNSDKLVFPAVTICTLNPYRYPEI .: . : . ... :: .:: . : ::..:... :: :::::::..:::.: . CCDS10 RLLWIGFTLTAVALILWQCALLVFSF--YTVSVSIKVHFRKLDFPAVTICNINPYKYSTV 60 70 80 90 100 110 210 220 230 240 250 pF1KB6 KEELEELDRITEQTLFDLYKYSSFTTLVAGSRSRRDLR-------GTLP---HPLQRLRV .. : .:.. :...: .:: . ::.::. . : : : . : CCDS10 RHLLADLEQETREALKSLYGFPE-------SRKRREAESWNSVSEGKQPRFSHRIPLLIF 120 130 140 150 160 260 270 280 290 300 pF1KB6 PPPPHG-AR-----RARSVASSLRDNNPQVDWKDWK--IGFQLCNQNKSDCFYQTYSSGV .: :: : :.:..:. . .: . : .:::::... ::: :.:::. CCDS10 DQDEKGKARDFFTGRKRKVGGSIIHKASNVMHIESKQVVGFQLCSNDTSDCATYTFSSGI 170 180 190 200 210 220 310 320 330 340 350 360 pF1KB6 DAVREWYRFHYINILSRLPETLPSLEEDTLGNFIFACRFNQVSCNQANYSHFHHPMYGNC .:..:::..::.::....: . ... .: :. :::. :.. :::::.::: CCDS10 NAIQEWYKLHYMNIMAQVPLEKKINMSYSAEELLVTCFFDGVSCDARNFTLFHHPMHGNC 230 240 250 260 270 280 370 380 390 400 410 420 pF1KB6 YTFNDKNNSNLWMSSMPGINNGLSLMLRAEQNDFIPLLSTVTGARVMVHGQDEPAFMDDG ::::...: .. .:: : . ::...: ..... :.: . :::.:..: ::: :..: CCDS10 YTFNNRENETILSTSMGGSEYGLQVILYINEEEYNPFLVSSTGAKVIIHRQDEYPFVEDV 290 300 310 320 330 340 430 440 450 460 470 480 pF1KB6 GFNLRPGVETSISMRKETLDRLGGDYGDCTKNGSDVPVENLYPSKYTQQVCIHSCFQESM : ... .. :::.:. .:. :..::..:::::..:.: . :. :.:.::::: .: CCDS10 GTEIETAMVTSIGMHLTESFKLSEPYSQCTEDGSDVPIRNIYNAAYSLQICLHSCFQTKM 350 360 370 380 390 400 490 500 510 520 530 540 pF1KB6 IKECGCAYIFYPRPQNVEYCDYRKHSSWGYCYYKLQVDFSSDHLGCFTKCRKPCSVTSYQ ...:::: : : ..::.:..: .: ::::.:. : ...::: . :.. :: . CCDS10 VEKCGCAQYSQPLPPAANYCNYQQHPNWMYCYYQLHRAFVQEELGCQSVCKEACSFKEWT 410 420 430 440 450 460 550 560 570 580 590 600 pF1KB6 LSAGYSRWPSVTSQEWVFQMLSRQNNYTVNNKRN--GVAKVNIFFKELNYKTNSESPSVT :... ..::::.:..:.. .:. ... ::.: : .::. ::.:.:: .. :::. . CCDS10 LTTSLAQWPSVVSEKWLLPVLTWDQGRQVNKKLNKTDLAKLLIFYKDLNQRSIMESPANS 470 480 490 500 510 520 610 620 630 640 650 660 pF1KB6 MVTLLSNLGSQWSLWFGSSVLSVVEMAELVFDLLVIMFLMLLRRFRSRYWSPGRGGRGAQ . ::::.:.: .::.. ::. :.:. :. : : :. .. : : :. .. : CCDS10 IEMLLSNFGGQLGLWMSCSVVCVIEIIEVFF----IDFFSIIAR---RQWQKAKEWW-AW 530 540 550 560 570 670 680 690 700 710 720 pF1KB6 EVASTLASSPPSHFCPHPMSLSLSQPGPAPSPALTAPPPAYATLGPRPSPGGSAGASSSA . : .: : .:.... :. . :: :: . . : : CCDS10 KQAPPCPEAPRSPQGQDNPALDIDDDLPTFNSALHLPPALGTQVPGTPPPKYNTLRLERA 580 590 600 610 620 630 pF1KB6 CPLGGP CCDS10 FSNQLTDTQMLDEL 640 >>CCDS5915.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7 (549 aa) initn: 439 init1: 132 opt: 461 Z-score: 346.2 bits: 74.2 E(32554): 5.8e-13 Smith-Waterman score: 553; 28.3% identity (58.8% similar) in 420 aa overlap (333-728:156-548) 310 320 330 340 350 360 pF1KB6 GVDAVREWYRFHYINILSRLPETLPSLEEDTLGNFIFACRFNQVSCNQANYSHFHHPMYG .: .... ::: :. :.. . : : CCDS59 LRALGRPPAPPGFMPSPTFDMAQLYARAGHSLDDMLLDCRFRGQPCGPENFTTIFTRM-G 130 140 150 160 170 180 370 380 390 400 410 pF1KB6 NCYTFND-KNNSNLWMSSMPGINNGLSLMLRAEQNDFIPLLSTV------TGARVMVHGQ .:::::. ....: .. :..:::..:: ..:....:. .: ::..:.: CCDS59 KCYTFNSGADGAELLTTTRGGMGNGLDIMLDVQQEEYLPVWRDNEETPFEVGIRVQIHSQ 190 200 210 220 230 240 420 430 440 450 460 pF1KB6 DEPAFMDDGGFNLRPGVETSISMRKETLDRLGGDYGDCTKNG---------SDVPVENLY .:: ..:. :... :: .: .: ... :. : .:::.. . :: :. . CCDS59 EEPPIIDQLGLGVSPGYQTFVSCQQQQLSFLPPPWGDCSSASLNPNYEPEPSD-PLGSPS 250 260 270 280 290 300 470 480 490 500 510 520 pF1KB6 PSK---YTQQVCIHSCFQESMIKECGCAYIFYPRPQNVEYCDYRKHSSWGYCYYKLQVDF :: :: . : .: . . ..::: ....: .: :. ..... : . .: CCDS59 PSPSPPYTLMGCRLACETRYVARKCGCRMVYMP--GDVPVCSPQQYKN---CAHP-AIDA 310 320 330 340 350 530 540 550 560 570 580 pF1KB6 SSDHLGCFTKCRKPCSVTSYQLSAGYSRWPSVTSQEWVFQMLSRQNNYTVNNKRNGVAKV . .: : .::. : : .. : :: .. ... . :.:.. : ..: : . CCDS59 MLRKDSC--ACPNPCASTRYAKELSMVRIPSRAAARFLARKLNRSEAYIAEN----VLAL 360 370 380 390 400 410 590 600 610 620 630 640 pF1KB6 NIFFKELNYKTNSESPSVTMVTLLSNLGSQWSLWFGSSVLSVVEMAELVFDLLVIMFL-M .:::. :::.: .. . : ::...:.: .:..:.:.:...: ..: : .: CCDS59 DIFFEALNYETVEQKKAYEMSELLGDIGGQMGLFIGASLLTILE----ILDYLCEVFRDK 420 430 440 450 460 650 660 670 680 690 pF1KB6 LLRRFRSRYWSPGRGGRGA-QEVASTLASSPPSHFCPHPMSLSLSQ---PGPAPSPALTA .: : .: : ... . :: .. .. : :. : .: :. : :.::: :. CCDS59 VLGYFWNRQHSQRHSSTNLLQEGLGSHRTQVP-HLSLGPSTLLCSEDLPPLPVPSPRLSP 470 480 490 500 510 520 700 710 720 pF1KB6 PPPAYATLGPRPSPGGSAGASSSACPLGGP :: : :::. : ..: ::.: CCDS59 PPTAPATLSHSSRP--------AVCVLGAPP 530 540 >>CCDS5916.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7 (531 aa) initn: 505 init1: 132 opt: 412 Z-score: 310.9 bits: 67.7 E(32554): 5.4e-11 Smith-Waterman score: 496; 26.5% identity (59.6% similar) in 381 aa overlap (333-687:156-522) 310 320 330 340 350 360 pF1KB6 GVDAVREWYRFHYINILSRLPETLPSLEEDTLGNFIFACRFNQVSCNQANYSHFHHPMYG .: .... ::: :. :.. . : : CCDS59 LRALGRPPAPPGFMPSPTFDMAQLYARAGHSLDDMLLDCRFRGQPCGPENFTTIFTRM-G 130 140 150 160 170 180 370 380 390 400 410 pF1KB6 NCYTFND-KNNSNLWMSSMPGINNGLSLMLRAEQNDFIPLLSTV------TGARVMVHGQ .:::::. ....: .. :..:::..:: ..:....:. .: ::..:.: CCDS59 KCYTFNSGADGAELLTTTRGGMGNGLDIMLDVQQEEYLPVWRDNEETPFEVGIRVQIHSQ 190 200 210 220 230 240 420 430 440 450 460 pF1KB6 DEPAFMDDGGFNLRPGVETSISMRKETLDRLGGDYGDCTKNG---------SDVPVENLY .:: ..:. :... :: .: .: ... :. : .:::.. . :: :. . CCDS59 EEPPIIDQLGLGVSPGYQTFVSCQQQQLSFLPPPWGDCSSASLNPNYEPEPSD-PLGSPS 250 260 270 280 290 300 470 480 490 500 510 520 pF1KB6 PSK---YTQQVCIHSCFQESMIKECGCAYIFYPRPQNVEYCDYRKHSSWGYCYYKLQVDF :: :: . : .: . . ..::: .... : .: :. ..... : . .: CCDS59 PSPSPPYTLMGCRLACETRYVARKCGCRMVYM--PGDVPVCSPQQYKN---CAHP-AIDA 310 320 330 340 350 530 540 550 560 570 580 pF1KB6 SSDHLGCFTKCRKPCSVTSYQLSAGYSRWPSVTSQEWVFQMLSRQNNYTVNNKRNGVAKV . .: : .::. : : .. : :: .. ... . :.:.. : ..: : . CCDS59 MLRKDSC--ACPNPCASTRYAKELSMVRIPSRAAARFLARKLNRSEAYIAEN----VLAL 360 370 380 390 400 410 590 600 610 620 630 640 pF1KB6 NIFFKELNYKTNSESPSVTMVTLLSNLGSQWSLWFGSSVLSVVEMAELVFDLLV--IMFL .:::. :::.: .. . : ::...:.: .:..:.:.:...:. . . ... .. CCDS59 DIFFEALNYETVEQKKAYEMSELLGDIGGQMGLFIGASLLTILEILDYLCEVFRDKVLGY 420 430 440 450 460 470 650 660 670 680 690 pF1KB6 MLLRRFRSRYWSP-----GRGGRGAQEVASTLASSPPSHFCPHPMSLSLSQPGPAPSPAL . :. .:. : : :.. .: .:. ::. : .:: :. CCDS59 FWNRQHSQRHSSTNLLQEGLGSHRTQVPHLSLGPRPPTPPCAVTKTLSASHRTCYLVTQL 480 490 500 510 520 530 700 710 720 pF1KB6 TAPPPAYATLGPRPSPGGSAGASSSACPLGGP >>CCDS5914.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7 (543 aa) initn: 477 init1: 132 opt: 411 Z-score: 310.0 bits: 67.5 E(32554): 6e-11 Smith-Waterman score: 506; 28.2% identity (58.7% similar) in 397 aa overlap (333-710:156-523) 310 320 330 340 350 360 pF1KB6 GVDAVREWYRFHYINILSRLPETLPSLEEDTLGNFIFACRFNQVSCNQANYSHFHHPMYG .: .... ::: :. :.. . : : CCDS59 LRALGRPPAPPGFMPSPTFDMAQLYARAGHSLDDMLLDCRFRGQPCGPENFTTIFTRM-G 130 140 150 160 170 180 370 380 390 400 410 pF1KB6 NCYTFND-KNNSNLWMSSMPGINNGLSLMLRAEQNDFIPLLSTV------TGARVMVHGQ .:::::. ....: .. :..:::..:: ..:....:. .: ::..:.: CCDS59 KCYTFNSGADGAELLTTTRGGMGNGLDIMLDVQQEEYLPVWRDNEETPFEVGIRVQIHSQ 190 200 210 220 230 240 420 430 440 450 460 pF1KB6 DEPAFMDDGGFNLRPGVETSISMRKETLDRLGGDYGDCTKNG---------SDVPVENLY .:: ..:. :... :: .: .: ... :. : .:::.. . :: :. . CCDS59 EEPPIIDQLGLGVSPGYQTFVSCQQQQLSFLPPPWGDCSSASLNPNYEPEPSD-PLGSPS 250 260 270 280 290 300 470 480 490 500 510 520 pF1KB6 PSK---YTQQVCIHSCFQESMIKECGCAYIFYPRPQNVEYCDYRKHSSWGYCYYKLQVDF :: :: . : .: . . ..::: .... : .: :. ..... : . .: CCDS59 PSPSPPYTLMGCRLACETRYVARKCGCRMVYM--PGDVPVCSPQQYKN---CAHP-AIDA 310 320 330 340 350 530 540 550 560 570 580 pF1KB6 SSDHLGCFTKCRKPCSVTSYQLSAGYSRWPSVTSQEWVFQMLSRQNNYTVNNKRNGVAKV . .: : .::. : : .. : :: .. ... . :.:.. : ..: : . CCDS59 MLRKDSC--ACPNPCASTRYAKELSMVRIPSRAAARFLARKLNRSEAYIAEN----VLAL 360 370 380 390 400 410 590 600 610 620 630 640 pF1KB6 NIFFKELNYKTNSESPSVTMVTLLSNLGSQWSLWFGSSVLSVVEMAELVFDLLVIMFLML .:::. :::.: .. . : ::...:.: .:..:.:.:...: ..: : .: CCDS59 DIFFEALNYETVEQKKAYEMSELLGDIGGQMGLFIGASLLTILE----ILDYLCEVFR-- 420 430 440 450 460 650 660 670 680 690 700 pF1KB6 LRRFRSRYWSPGRGGRGAQEVASTLASSPPSHFCPHPMSLSLSQPGPAPSPALTAPPPAY . . .:. : . .:. .:: .: :: .: : :: : : : : :: CCDS59 -DKVLGYFWN--R--QHSQRHSSTNLTSHPS-LCRHQDSLRL--P-PHLLPCHTALDLLS 470 480 490 500 510 710 720 pF1KB6 ATLGPRPSPGGSAGASSSACPLGGP .. ::: CCDS59 VSSEPRPDILDMPSLHVAFPSSPQIKS 520 530 540 728 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sat Nov 5 14:14:39 2016 done: Sat Nov 5 14:14:40 2016 Total Scan time: 4.490 Total Display time: 0.170 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]