Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6219
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6219, 669 aa
1>>>pF1KB6219 669 - 669 aa - 669 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0624+/-0.000867; mu= 7.9331+/- 0.052
mean_var=159.1131+/-31.356, 0's: 0 Z-trim(112.6): 50 B-trim: 7 in 1/50
Lambda= 0.101677
statistics sampled from 13304 (13349) to 13304 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.743), E-opt: 0.2 (0.41), width: 16
Scan time: 3.630
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12681.2 HIF3A gene_id:64344|Hs108|chr19 ( 669) 4499 672.0 7.5e-193
CCDS12682.1 HIF3A gene_id:64344|Hs108|chr19 ( 667) 4453 665.2 8.1e-191
CCDS42580.2 HIF3A gene_id:64344|Hs108|chr19 ( 600) 3728 558.9 7.6e-159
CCDS58324.1 HIF1A gene_id:3091|Hs108|chr14 ( 850) 1350 210.1 1e-53
CCDS9754.1 HIF1A gene_id:3091|Hs108|chr14 ( 735) 1345 209.4 1.5e-53
CCDS9753.1 HIF1A gene_id:3091|Hs108|chr14 ( 826) 1345 209.4 1.7e-53
CCDS1825.1 EPAS1 gene_id:2034|Hs108|chr2 ( 870) 1293 201.8 3.5e-51
CCDS13646.1 SIM2 gene_id:6493|Hs108|chr21 ( 667) 807 130.4 8e-30
CCDS5045.1 SIM1 gene_id:6492|Hs108|chr6 ( 766) 782 126.8 1.1e-28
CCDS9645.1 NPAS3 gene_id:64067|Hs108|chr14 ( 901) 397 70.3 1.3e-11
CCDS55912.1 NPAS3 gene_id:64067|Hs108|chr14 ( 903) 397 70.3 1.3e-11
CCDS53892.1 NPAS3 gene_id:64067|Hs108|chr14 ( 920) 397 70.4 1.3e-11
CCDS53891.1 NPAS3 gene_id:64067|Hs108|chr14 ( 933) 397 70.4 1.3e-11
>>CCDS12681.2 HIF3A gene_id:64344|Hs108|chr19 (669 aa)
initn: 4499 init1: 4499 opt: 4499 Z-score: 3575.7 bits: 672.0 E(32554): 7.5e-193
Smith-Waterman score: 4499; 100.0% identity (100.0% similar) in 669 aa overlap (1-669:1-669)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MALGLQRARSTTELRKEKSRDAARSRRSQETEVLYQLAHTLPFARGVSAHLDKASIMRLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MALGLQRARSTTELRKEKSRDAARSRRSQETEVLYQLAHTLPFARGVSAHLDKASIMRLT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 ISYLRMHRLCAAGEWNQVGAGGEPLDACYLKALEGFVMVLTAEGDMAYLSENVSKHLGLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ISYLRMHRLCAAGEWNQVGAGGEPLDACYLKALEGFVMVLTAEGDMAYLSENVSKHLGLS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 QLELIGHSIFDFIHPCDQEELQDALTPQQTLSRRKVEAPTERCFSLRMKSTLTSRGRTLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QLELIGHSIFDFIHPCDQEELQDALTPQQTLSRRKVEAPTERCFSLRMKSTLTSRGRTLN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LKAATWKVLNCSGHMRAYKPPAQTSPAGSPDSEPPLQCLVLICEAIPHPGSLEPPLGRGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LKAATWKVLNCSGHMRAYKPPAQTSPAGSPDSEPPLQCLVLICEAIPHPGSLEPPLGRGA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 FLSRHSLDMKFTYCDDRIAEVAGYSPDDLIGCSAYEYIHALDSDAVSKSIHTLLSKGQAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FLSRHSLDMKFTYCDDRIAEVAGYSPDDLIGCSAYEYIHALDSDAVSKSIHTLLSKGQAV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 TGQYRFLARSGGYLWTQTQATVVSGGRGPQSESIVCVHFLISQVEETGVVLSLEQTEQHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TGQYRFLARSGGYLWTQTQATVVSGGRGPQSESIVCVHFLISQVEETGVVLSLEQTEQHS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 RRPIQRGAPSQKDTPNPGDSLDTPGPRILAFLHPPSLSEAALAADPRRFCSPDLRRLLGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RRPIQRGAPSQKDTPNPGDSLDTPGPRILAFLHPPSLSEAALAADPRRFCSPDLRRLLGP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 ILDGASVAATPSTPLATRHPQSPLSADLPDELPVGTENVHRLFTSGKDTEAVETDLDIAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ILDGASVAATPSTPLATRHPQSPLSADLPDELPVGTENVHRLFTSGKDTEAVETDLDIAQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 DADALDLEMLAPYISMDDDFQLNASEQLPRAYHRPLGAVPRPRARSFHGLSPPALEPSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DADALDLEMLAPYISMDDDFQLNASEQLPRAYHRPLGAVPRPRARSFHGLSPPALEPSLL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 PRWGSDPRLSCSSPSRGDPSASSPMAGARKRTLAQSSEDEDEGVELLGVRPPKRSPSPEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PRWGSDPRLSCSSPSRGDPSASSPMAGARKRTLAQSSEDEDEGVELLGVRPPKRSPSPEH
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 ENFLLFPLSLSFLLTGGPAPGSLQDPSTPLLNLNEPLGLGPSLLSPYSDEDTTQPGGPFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ENFLLFPLSLSFLLTGGPAPGSLQDPSTPLLNLNEPLGLGPSLLSPYSDEDTTQPGGPFQ
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 PRAGSAQAD
:::::::::
CCDS12 PRAGSAQAD
>>CCDS12682.1 HIF3A gene_id:64344|Hs108|chr19 (667 aa)
initn: 4453 init1: 4453 opt: 4453 Z-score: 3539.3 bits: 665.2 E(32554): 8.1e-191
Smith-Waterman score: 4453; 99.7% identity (99.7% similar) in 664 aa overlap (6-669:4-667)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MALGLQRARSTTELRKEKSRDAARSRRSQETEVLYQLAHTLPFARGVSAHLDKASIMRLT
: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MDWQDHRSTTELRKEKSRDAARSRRSQETEVLYQLAHTLPFARGVSAHLDKASIMRLT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 ISYLRMHRLCAAGEWNQVGAGGEPLDACYLKALEGFVMVLTAEGDMAYLSENVSKHLGLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ISYLRMHRLCAAGEWNQVGAGGEPLDACYLKALEGFVMVLTAEGDMAYLSENVSKHLGLS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 QLELIGHSIFDFIHPCDQEELQDALTPQQTLSRRKVEAPTERCFSLRMKSTLTSRGRTLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QLELIGHSIFDFIHPCDQEELQDALTPQQTLSRRKVEAPTERCFSLRMKSTLTSRGRTLN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LKAATWKVLNCSGHMRAYKPPAQTSPAGSPDSEPPLQCLVLICEAIPHPGSLEPPLGRGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LKAATWKVLNCSGHMRAYKPPAQTSPAGSPDSEPPLQCLVLICEAIPHPGSLEPPLGRGA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 FLSRHSLDMKFTYCDDRIAEVAGYSPDDLIGCSAYEYIHALDSDAVSKSIHTLLSKGQAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FLSRHSLDMKFTYCDDRIAEVAGYSPDDLIGCSAYEYIHALDSDAVSKSIHTLLSKGQAV
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 TGQYRFLARSGGYLWTQTQATVVSGGRGPQSESIVCVHFLISQVEETGVVLSLEQTEQHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TGQYRFLARSGGYLWTQTQATVVSGGRGPQSESIVCVHFLISQVEETGVVLSLEQTEQHS
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 RRPIQRGAPSQKDTPNPGDSLDTPGPRILAFLHPPSLSEAALAADPRRFCSPDLRRLLGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RRPIQRGAPSQKDTPNPGDSLDTPGPRILAFLHPPSLSEAALAADPRRFCSPDLRRLLGP
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 ILDGASVAATPSTPLATRHPQSPLSADLPDELPVGTENVHRLFTSGKDTEAVETDLDIAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ILDGASVAATPSTPLATRHPQSPLSADLPDELPVGTENVHRLFTSGKDTEAVETDLDIAQ
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 DADALDLEMLAPYISMDDDFQLNASEQLPRAYHRPLGAVPRPRARSFHGLSPPALEPSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DADALDLEMLAPYISMDDDFQLNASEQLPRAYHRPLGAVPRPRARSFHGLSPPALEPSLL
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 PRWGSDPRLSCSSPSRGDPSASSPMAGARKRTLAQSSEDEDEGVELLGVRPPKRSPSPEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PRWGSDPRLSCSSPSRGDPSASSPMAGARKRTLAQSSEDEDEGVELLGVRPPKRSPSPEH
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 ENFLLFPLSLSFLLTGGPAPGSLQDPSTPLLNLNEPLGLGPSLLSPYSDEDTTQPGGPFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ENFLLFPLSLSFLLTGGPAPGSLQDPSTPLLNLNEPLGLGPSLLSPYSDEDTTQPGGPFQ
600 610 620 630 640 650
pF1KB6 PRAGSAQAD
:::::::::
CCDS12 PRAGSAQAD
660
>>CCDS42580.2 HIF3A gene_id:64344|Hs108|chr19 (600 aa)
initn: 3728 init1: 3728 opt: 3728 Z-score: 2965.2 bits: 558.9 E(32554): 7.6e-159
Smith-Waterman score: 3728; 100.0% identity (100.0% similar) in 549 aa overlap (121-669:52-600)
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 KALEGFVMVLTAEGDMAYLSENVSKHLGLSQLELIGHSIFDFIHPCDQEELQDALTPQQT
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PSPAASAPTWTRPLSCASPSATCACTASAPQLELIGHSIFDFIHPCDQEELQDALTPQQT
30 40 50 60 70 80
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 LSRRKVEAPTERCFSLRMKSTLTSRGRTLNLKAATWKVLNCSGHMRAYKPPAQTSPAGSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSRRKVEAPTERCFSLRMKSTLTSRGRTLNLKAATWKVLNCSGHMRAYKPPAQTSPAGSP
90 100 110 120 130 140
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 DSEPPLQCLVLICEAIPHPGSLEPPLGRGAFLSRHSLDMKFTYCDDRIAEVAGYSPDDLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DSEPPLQCLVLICEAIPHPGSLEPPLGRGAFLSRHSLDMKFTYCDDRIAEVAGYSPDDLI
150 160 170 180 190 200
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 GCSAYEYIHALDSDAVSKSIHTLLSKGQAVTGQYRFLARSGGYLWTQTQATVVSGGRGPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GCSAYEYIHALDSDAVSKSIHTLLSKGQAVTGQYRFLARSGGYLWTQTQATVVSGGRGPQ
210 220 230 240 250 260
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 SESIVCVHFLISQVEETGVVLSLEQTEQHSRRPIQRGAPSQKDTPNPGDSLDTPGPRILA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SESIVCVHFLISQVEETGVVLSLEQTEQHSRRPIQRGAPSQKDTPNPGDSLDTPGPRILA
270 280 290 300 310 320
400 410 420 430 440 450
pF1KB6 FLHPPSLSEAALAADPRRFCSPDLRRLLGPILDGASVAATPSTPLATRHPQSPLSADLPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 FLHPPSLSEAALAADPRRFCSPDLRRLLGPILDGASVAATPSTPLATRHPQSPLSADLPD
330 340 350 360 370 380
460 470 480 490 500 510
pF1KB6 ELPVGTENVHRLFTSGKDTEAVETDLDIAQDADALDLEMLAPYISMDDDFQLNASEQLPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ELPVGTENVHRLFTSGKDTEAVETDLDIAQDADALDLEMLAPYISMDDDFQLNASEQLPR
390 400 410 420 430 440
520 530 540 550 560 570
pF1KB6 AYHRPLGAVPRPRARSFHGLSPPALEPSLLPRWGSDPRLSCSSPSRGDPSASSPMAGARK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AYHRPLGAVPRPRARSFHGLSPPALEPSLLPRWGSDPRLSCSSPSRGDPSASSPMAGARK
450 460 470 480 490 500
580 590 600 610 620 630
pF1KB6 RTLAQSSEDEDEGVELLGVRPPKRSPSPEHENFLLFPLSLSFLLTGGPAPGSLQDPSTPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RTLAQSSEDEDEGVELLGVRPPKRSPSPEHENFLLFPLSLSFLLTGGPAPGSLQDPSTPL
510 520 530 540 550 560
640 650 660
pF1KB6 LNLNEPLGLGPSLLSPYSDEDTTQPGGPFQPRAGSAQAD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LNLNEPLGLGPSLLSPYSDEDTTQPGGPFQPRAGSAQAD
570 580 590 600
>>CCDS58324.1 HIF1A gene_id:3091|Hs108|chr14 (850 aa)
initn: 1463 init1: 767 opt: 1350 Z-score: 1077.8 bits: 210.1 E(32554): 1e-53
Smith-Waterman score: 1414; 40.1% identity (62.6% similar) in 679 aa overlap (5-600:32-670)
10 20 30
pF1KB6 MALGLQRARSTTELRKEKSRDAARSRRSQETEVL
.. .: ..: ::::::::::::::.:.::.
CCDS58 SSQCRSLENKFVFLKEGLGNSKPEELEEIRIENGRISSERRKEKSRDAARSRRSKESEVF
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 YQLAHTLPFARGVSAHLDKASIMRLTISYLRMHRLCAAGEWNQVGAGGEPLDACYLKALE
:.::: ::. ..::.::::::.:::::::::...: ::. . .. :::::.
CCDS58 YELAHQLPLPHNVSSHLDKASVMRLTISYLRVRKLLDAGDLDIEDDMKAQMNCFYLKALD
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 GFVMVLTAEGDMAYLSENVSKHLGLSQLELIGHSIFDFIHPCDQEELQDALTPQQTLSRR
::::::: .::: :.:.::.:..::.:.:: :::.::: ::::.::... :: .. : ..
CCDS58 GFVMVLTDDGDMIYISDNVNKYMGLTQFELTGHSVFDFTHPCDHEEMREMLTHRNGLVKK
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 KVEAPTERCFSLRMKSTLTSRGRTLNLKAATWKVLNCSGHMRAYKPPAQTSPAGSPDSEP
: :.: : :::: ::::::::.:.:.::::::.:.::...: .. : ..:
CCDS58 GKEQNTQRSFFLRMKCTLTSRGRTMNIKSATWKVLHCTGHIHVYDTNSNQPQCGY--KKP
190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 PLQCLVLICEAIPHPGSLEPPLGRGAFLSRHSLDMKFTYCDDRIAEVAGYSPDDLIGCSA
:. ::::::: ::::...: :: .:::::::::::.:::.::.:. :: :..:.: :
CCDS58 PMTCLVLICEPIPHPSNIEIPLDSKTFLSRHSLDMKFSYCDERITELMGYEPEELLGRSI
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 YEYIHALDSDAVSKSIHTLLSKGQAVTGQYRFLARSGGYLWTQTQATVVSGGRGPQSESI
::: :::::: ..:. : ...:::..:::::.::. :::.:..:::::. . .. : . :
CCDS58 YEYYHALDSDHLTKTHHDMFTKGQVTTGQYRMLAKRGGYVWVETQATVIYNTKNSQPQCI
300 310 320 330 340 350
340 350 360
pF1KB6 VCVHFLISQVEETGVVLSLEQTEQHSRRPIQRG---------------------------
:::....: . . ...::.::: .:.. .
CCDS58 VCVNYVVSGIIQHDLIFSLQQTEC-VLKPVESSDMKMTQLFTKVESEDTSSLFDKLKKEP
360 370 380 390 400 410
370 380
pF1KB6 ------APSQKDT-----------------------------PNPGDSLD------TP--
::. :: :.:...:. .:
CCDS58 DALTLLAPAAGDTIISLDFGSNDTETDDQQLEEVPLYNDVMLPSPNEKLQNINLAMSPLP
420 430 440 450 460 470
390 400 410 420 430 440
pF1KB6 ---GPRILAFLHPPSLS-EAALAADPRRFCSPDLRRLLGPILDGASVAATPSTPLATRHP
:. : :.:. :.:: .: : .: . : : . . :: .. .:
CCDS58 TAETPKPLRSSADPALNQEVALKLEPNPE-SLELSFTMPQIQDQTPSPSDGSTRQSSPEP
480 490 500 510 520 530
450 460 470 480 490
pF1KB6 QSP------LSADLPDELPVGTENVHRLFTSGKDTEAVETDLDIAQDADALDLEMLAPYI
.:: ...:. .:. . : :..::. .:::: .. .. .::.: ::::::::::
CCDS58 NSPSEYCFYVDSDMVNEFKL--ELVEKLFA--EDTEA-KNPFS-TQDTD-LDLEMLAPYI
540 550 560 570 580 590
500 510 520 530 540 550
pF1KB6 SMDDDFQLNASEQLPRAYHRPLGAVPRPRARSFHGLSPPALEPSLLPRWGSDPRLSCSSP
::::::: ::: ::: :: : ...:. . .
CCDS58 PMDDDFQL----------------------RSFDQLSP--LESSSASPESASPQSTVTVF
600 610 620
560 570 580 590 600 610
pF1KB6 SRG---DPSASSPMAGARKRTLAQSSEDEDEGVELLGVRPPKRSPSPEHENFLLFPLSLS
.. .:.:.. . : : ..:. : ...: . :::: :
CCDS58 QQTQIQEPTANATTTTATTDELKTVTKDRMEDIKILIA-----SPSPTHIHKETTSATSS
630 640 650 660 670 680
620 630 640 650 660
pF1KB6 FLLTGGPAPGSLQDPSTPLLNLNEPLGLGPSLLSPYSDEDTTQPGGPFQPRAGSAQAD
CCDS58 PYRDTQSRTASPNRAGKGVIEQTEKSHPRSPNVLSVALSQRTTVPEEELNPKILALQNAQ
690 700 710 720 730 740
>>CCDS9754.1 HIF1A gene_id:3091|Hs108|chr14 (735 aa)
initn: 1458 init1: 762 opt: 1345 Z-score: 1074.8 bits: 209.4 E(32554): 1.5e-53
Smith-Waterman score: 1409; 40.0% identity (62.5% similar) in 677 aa overlap (7-600:10-646)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MALGLQRARSTTELRKEKSRDAARSRRSQETEVLYQLAHTLPFARGVSAHLDKASIM
. . ..: ::::::::::::::.:.::.:.::: ::. ..::.::::::.:
CCDS97 MEGAGGANDKKKISSERRKEKSRDAARSRRSKESEVFYELAHQLPLPHNVSSHLDKASVM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 RLTISYLRMHRLCAAGEWNQVGAGGEPLDACYLKALEGFVMVLTAEGDMAYLSENVSKHL
::::::::...: ::. . .. :::::.::::::: .::: :.:.::.:..
CCDS97 RLTISYLRVRKLLDAGDLDIEDDMKAQMNCFYLKALDGFVMVLTDDGDMIYISDNVNKYM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 GLSQLELIGHSIFDFIHPCDQEELQDALTPQQTLSRRKVEAPTERCFSLRMKSTLTSRGR
::.:.:: :::.::: ::::.::... :: .. : .. : :.: : :::: :::::::
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:.:.:.::::::.:.::...: .. : ..::. ::::::: ::::...: ::
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.:::::::::::.:::.::.:. :: :..:.: : ::: :::::: ..:. : ...::
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:..:::::.::. :::.:..:::::. . .. : . ::::....: . . ...::.:::
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.:.. . ::. ::
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380 390 400
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:.:...:. .: :. : :.:. :.::
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.: : .: . : : . . :: .. .:.:: ...:. .:. . :
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::: ::: :: : ...:. . . .. .:.:.. . : :
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..:. : ...: . :::: :
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.:::::::::::.:::.::.:. :: :..:.: : ::: :::::: ..:. : ...::
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:..:::::.::. :::.:..:::::. . .. : . ::::....: . . ...::.:::
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.:.. . ::. ::
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380 390 400
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:.:...:. .: :. : :.:. :.::
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.: : .: . : : . . :: .. .:.:: ...:. .:. . :
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CCDS97 TVTKDRMEDIKILIA-----SPSPTHIHKETTSATSSPYRDTQSRTASPNRAGKGVIEQT
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CCDS18 QNFEESSAYGKAILPPSQPWATELRSHSTQSEAGSLPAFTVPQAAAPGSTTPSATSSSSS
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pF1KB6 D
CCDS18 PAMVALSNKLKLKRQLEYEEQAFQDLSGGDPPGGSTSHLMWKRMKNLRGGSCPLMPDKPL
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CCDS13 AITEIKLYSNMFMFRASLDLKLIFLDSRVTEVTGYEPQDLIEKTLYHHVHGCDVFHLRYA
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: :: :::..: ::.:.. ::..:.:. :::: ..:. . . :: :.......: .
CCDS13 HHLLLVKGQVTTKYYRLLSKRGGWVWVQSYATVVHNSRSSRPHCIVSVNYVLTEIEYKEL
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:::::. : : : . . .: .. : . ::. . ... :
CCDS13 QLSLEQVSTAKSQDSWRTALSTSQETRKLVKPKNTKMKTKLRTNPY--PPQ-QYSSFQMD
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. :. .: ::.:: : .:.: :.:: :. :: . . :
CCDS13 -KLECGQLGNWRASP---PASAAAPPEL-----QPHSE-SSDLLYTPSYSLPFSYHYGHF
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..:.: : . . . : . ... . . . : . .. : . :
CCDS13 PLDSHVFSSKKPM--LPAKFGQPQGSPCEVARFFLSTLPASGECQWHYANPLVPSSSSPA
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pF1KB6 GAVPRPRARSF-HGLSPPALEPSL-LPRWGSD---PRLSCSSPSRGDPSASSPMAGARKR
:.: : . :.: : :. . :.: : : . . : .: : .: .::
CCDS13 KNPPEPPANTARHSLVPSYEAPAAAVRRFGEDTAPPSFPSCGHYREEP-ALGPAKAAR--
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CCDS13 ---QAARD---GARLALARAAPECCAPPTPEAPGA---PAQLPFVLLNYHRVLARRGPLG
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:. : . : . : : : :. ::.:. :..
CCDS13 GAAPAASGLACAPGGPEAATGALRLRHPSPAATSPPGAPLPHYLGASVIITNGR
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>>CCDS5045.1 SIM1 gene_id:6492|Hs108|chr6 (766 aa)
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CCDS50 MKEKSKNAARTRREKENSEFYELAKLLPLPSAITSQLDKASIIRLT
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CCDS50 TSYLKMRVVFPEGLGEAWGHSSRTSPLDNVGRELGSHLLQTLDGFIFVVAPDGKIMYISE
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pF1KB6 NVSKHLGLSQLELIGHSIFDFIHPCDQEELQDALTPQQTLSRRKV-EAPTERCFSLRMKS
..: ::::::.:: :.::...::: :..:. .:: .: . : : :: : ::::
CCDS50 TASVHLGLSQVELTGNSIYEYIHPADHDEMTAVLTAHQPYHSHFVQEYEIERSFFLRMKC
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.:..:. .: . .::..:::... . . :: :. :: . ...: .
CCDS50 VLAKRNA--GLTCGGYKVIHCSGYLKIRQYSLDMSPF---DGCYQNVGLVAVGHSLPPSA
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: : . :. : :::::. . :.:.::..:: :.::: . :...:. :. . .
CCDS50 VTEIKLHSNMFMFRASLDMKLIFLDSRVAELTGYEPQDLIEKTLYHHVHGCDTFHLRCAH
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CCDS50 HLLLVKGQVTTKYYRFLAKHGGWVWVQSYATIVHNSRSSRPHCIVSVNYVLTDTEYKGLQ
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:::.:
CCDS50 LSLDQISASKPAFSYTSSSTPTMTDNRKGAKSRLSSSKSKSRTSPYPQYSGFHTERSESD
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