Result of FASTA (omim) for
pF1KB6219
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6219, 669 aa
1>>>pF1KB6219 669 - 669 aa - 669 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0195+/-0.00036; mu= 8.2367+/- 0.022
mean_var=169.5798+/-35.039, 0's: 0 Z-trim(120.1): 182 B-trim: 1209 in 1/56
Lambda= 0.098489
statistics sampled from 34733 (34928) to 34733 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.742), E-opt: 0.2 (0.41), width: 16
Scan time: 11.350
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_690008 (OMIM: 609976) hypoxia-inducible factor ( 669) 4499 651.6 2.8e-186
NP_690007 (OMIM: 609976) hypoxia-inducible factor ( 667) 4453 645.0 2.5e-184
XP_005259209 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 713) 4443 643.6 7.2e-184
XP_016882627 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 663) 4286 621.3 3.5e-177
XP_016882625 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 707) 4230 613.4 9.2e-175
NP_071907 (OMIM: 609976) hypoxia-inducible factor ( 600) 3728 542.0 2.4e-153
XP_005259210 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 594) 3515 511.7 3.1e-144
XP_016882623 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 711) 3204 467.6 7.1e-131
XP_016882626 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 703) 3158 461.0 6.5e-129
XP_016882624 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 709) 3158 461.0 6.6e-129
XP_005259213 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 587) 3152 460.1 1e-128
XP_005259212 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 587) 3152 460.1 1e-128
XP_016882622 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 749) 3148 459.6 1.8e-128
XP_016882621 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 755) 3148 459.6 1.9e-128
NP_690009 (OMIM: 609976) hypoxia-inducible factor ( 450) 2456 361.2 4.9e-99
XP_016882631 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 474) 2437 358.5 3.3e-98
XP_016882628 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 642) 2433 358.0 6.2e-98
XP_016882630 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 642) 2433 358.0 6.2e-98
XP_016882629 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-ind ( 642) 2433 358.0 6.2e-98
NP_001230013 (OMIM: 603348) hypoxia-inducible fact ( 850) 1350 204.2 1.6e-51
NP_851397 (OMIM: 603348) hypoxia-inducible factor ( 735) 1345 203.4 2.4e-51
NP_001521 (OMIM: 603348) hypoxia-inducible factor ( 826) 1345 203.5 2.6e-51
XP_011531000 (OMIM: 603349,611783) PREDICTED: endo ( 883) 1296 196.5 3.4e-49
NP_001421 (OMIM: 603349,611783) endothelial PAS do ( 870) 1293 196.1 4.6e-49
NP_005060 (OMIM: 600892) single-minded homolog 2 l ( 667) 807 127.0 2.3e-28
XP_011534374 (OMIM: 601665,603128) PREDICTED: sing ( 481) 782 123.3 2.1e-27
XP_016866686 (OMIM: 601665,603128) PREDICTED: sing ( 766) 782 123.5 3e-27
NP_005059 (OMIM: 601665,603128) single-minded homo ( 766) 782 123.5 3e-27
XP_005267157 (OMIM: 601665,603128) PREDICTED: sing ( 766) 782 123.5 3e-27
NP_033664 (OMIM: 600892) single-minded homolog 2 s ( 570) 777 122.7 3.9e-27
XP_016883931 (OMIM: 600892) PREDICTED: single-mind ( 327) 724 115.0 4.6e-25
XP_011527996 (OMIM: 600892) PREDICTED: single-mind ( 566) 579 94.5 1.1e-18
XP_016877077 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 831) 397 68.8 9.3e-11
XP_016877075 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 831) 397 68.8 9.3e-11
XP_016877076 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 831) 397 68.8 9.3e-11
NP_071406 (OMIM: 609430) neuronal PAS domain-conta ( 901) 397 68.8 9.9e-11
NP_001159365 (OMIM: 609430) neuronal PAS domain-co ( 903) 397 68.8 1e-10
XP_011535372 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 918) 397 68.8 1e-10
NP_775182 (OMIM: 609430) neuronal PAS domain-conta ( 920) 397 68.8 1e-10
NP_001158221 (OMIM: 609430) neuronal PAS domain-co ( 933) 397 68.8 1e-10
XP_016877074 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 939) 397 68.8 1e-10
XP_011535369 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 950) 397 68.8 1e-10
XP_016877073 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 956) 397 68.8 1e-10
XP_005268049 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 967) 397 68.8 1.1e-10
XP_005268048 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 969) 397 68.8 1.1e-10
XP_016877071 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 986) 397 68.8 1.1e-10
XP_011535374 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 900) 391 68.0 1.8e-10
XP_011535373 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 936) 391 68.0 1.9e-10
XP_011535371 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 966) 391 68.0 1.9e-10
XP_016877072 (OMIM: 609430) PREDICTED: neuronal PA ( 983) 391 68.0 1.9e-10
>>NP_690008 (OMIM: 609976) hypoxia-inducible factor 3-al (669 aa)
initn: 4499 init1: 4499 opt: 4499 Z-score: 3465.4 bits: 651.6 E(85289): 2.8e-186
Smith-Waterman score: 4499; 100.0% identity (100.0% similar) in 669 aa overlap (1-669:1-669)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MALGLQRARSTTELRKEKSRDAARSRRSQETEVLYQLAHTLPFARGVSAHLDKASIMRLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_690 MALGLQRARSTTELRKEKSRDAARSRRSQETEVLYQLAHTLPFARGVSAHLDKASIMRLT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 ISYLRMHRLCAAGEWNQVGAGGEPLDACYLKALEGFVMVLTAEGDMAYLSENVSKHLGLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_690 ISYLRMHRLCAAGEWNQVGAGGEPLDACYLKALEGFVMVLTAEGDMAYLSENVSKHLGLS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 QLELIGHSIFDFIHPCDQEELQDALTPQQTLSRRKVEAPTERCFSLRMKSTLTSRGRTLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_690 QLELIGHSIFDFIHPCDQEELQDALTPQQTLSRRKVEAPTERCFSLRMKSTLTSRGRTLN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LKAATWKVLNCSGHMRAYKPPAQTSPAGSPDSEPPLQCLVLICEAIPHPGSLEPPLGRGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_690 LKAATWKVLNCSGHMRAYKPPAQTSPAGSPDSEPPLQCLVLICEAIPHPGSLEPPLGRGA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 FLSRHSLDMKFTYCDDRIAEVAGYSPDDLIGCSAYEYIHALDSDAVSKSIHTLLSKGQAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_690 FLSRHSLDMKFTYCDDRIAEVAGYSPDDLIGCSAYEYIHALDSDAVSKSIHTLLSKGQAV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 TGQYRFLARSGGYLWTQTQATVVSGGRGPQSESIVCVHFLISQVEETGVVLSLEQTEQHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_690 TGQYRFLARSGGYLWTQTQATVVSGGRGPQSESIVCVHFLISQVEETGVVLSLEQTEQHS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 RRPIQRGAPSQKDTPNPGDSLDTPGPRILAFLHPPSLSEAALAADPRRFCSPDLRRLLGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_690 RRPIQRGAPSQKDTPNPGDSLDTPGPRILAFLHPPSLSEAALAADPRRFCSPDLRRLLGP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 ILDGASVAATPSTPLATRHPQSPLSADLPDELPVGTENVHRLFTSGKDTEAVETDLDIAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_690 ILDGASVAATPSTPLATRHPQSPLSADLPDELPVGTENVHRLFTSGKDTEAVETDLDIAQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 DADALDLEMLAPYISMDDDFQLNASEQLPRAYHRPLGAVPRPRARSFHGLSPPALEPSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_690 DADALDLEMLAPYISMDDDFQLNASEQLPRAYHRPLGAVPRPRARSFHGLSPPALEPSLL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 PRWGSDPRLSCSSPSRGDPSASSPMAGARKRTLAQSSEDEDEGVELLGVRPPKRSPSPEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_690 PRWGSDPRLSCSSPSRGDPSASSPMAGARKRTLAQSSEDEDEGVELLGVRPPKRSPSPEH
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 ENFLLFPLSLSFLLTGGPAPGSLQDPSTPLLNLNEPLGLGPSLLSPYSDEDTTQPGGPFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_690 ENFLLFPLSLSFLLTGGPAPGSLQDPSTPLLNLNEPLGLGPSLLSPYSDEDTTQPGGPFQ
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 PRAGSAQAD
:::::::::
NP_690 PRAGSAQAD
>>NP_690007 (OMIM: 609976) hypoxia-inducible factor 3-al (667 aa)
initn: 4453 init1: 4453 opt: 4453 Z-score: 3430.1 bits: 645.0 E(85289): 2.5e-184
Smith-Waterman score: 4453; 99.7% identity (99.7% similar) in 664 aa overlap (6-669:4-667)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MALGLQRARSTTELRKEKSRDAARSRRSQETEVLYQLAHTLPFARGVSAHLDKASIMRLT
: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_690 MDWQDHRSTTELRKEKSRDAARSRRSQETEVLYQLAHTLPFARGVSAHLDKASIMRLT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 ISYLRMHRLCAAGEWNQVGAGGEPLDACYLKALEGFVMVLTAEGDMAYLSENVSKHLGLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_690 ISYLRMHRLCAAGEWNQVGAGGEPLDACYLKALEGFVMVLTAEGDMAYLSENVSKHLGLS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 QLELIGHSIFDFIHPCDQEELQDALTPQQTLSRRKVEAPTERCFSLRMKSTLTSRGRTLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_690 QLELIGHSIFDFIHPCDQEELQDALTPQQTLSRRKVEAPTERCFSLRMKSTLTSRGRTLN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LKAATWKVLNCSGHMRAYKPPAQTSPAGSPDSEPPLQCLVLICEAIPHPGSLEPPLGRGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_690 LKAATWKVLNCSGHMRAYKPPAQTSPAGSPDSEPPLQCLVLICEAIPHPGSLEPPLGRGA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 FLSRHSLDMKFTYCDDRIAEVAGYSPDDLIGCSAYEYIHALDSDAVSKSIHTLLSKGQAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_690 FLSRHSLDMKFTYCDDRIAEVAGYSPDDLIGCSAYEYIHALDSDAVSKSIHTLLSKGQAV
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 TGQYRFLARSGGYLWTQTQATVVSGGRGPQSESIVCVHFLISQVEETGVVLSLEQTEQHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_690 TGQYRFLARSGGYLWTQTQATVVSGGRGPQSESIVCVHFLISQVEETGVVLSLEQTEQHS
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 RRPIQRGAPSQKDTPNPGDSLDTPGPRILAFLHPPSLSEAALAADPRRFCSPDLRRLLGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_690 RRPIQRGAPSQKDTPNPGDSLDTPGPRILAFLHPPSLSEAALAADPRRFCSPDLRRLLGP
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 ILDGASVAATPSTPLATRHPQSPLSADLPDELPVGTENVHRLFTSGKDTEAVETDLDIAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_690 ILDGASVAATPSTPLATRHPQSPLSADLPDELPVGTENVHRLFTSGKDTEAVETDLDIAQ
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 DADALDLEMLAPYISMDDDFQLNASEQLPRAYHRPLGAVPRPRARSFHGLSPPALEPSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_690 DADALDLEMLAPYISMDDDFQLNASEQLPRAYHRPLGAVPRPRARSFHGLSPPALEPSLL
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 PRWGSDPRLSCSSPSRGDPSASSPMAGARKRTLAQSSEDEDEGVELLGVRPPKRSPSPEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_690 PRWGSDPRLSCSSPSRGDPSASSPMAGARKRTLAQSSEDEDEGVELLGVRPPKRSPSPEH
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 ENFLLFPLSLSFLLTGGPAPGSLQDPSTPLLNLNEPLGLGPSLLSPYSDEDTTQPGGPFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_690 ENFLLFPLSLSFLLTGGPAPGSLQDPSTPLLNLNEPLGLGPSLLSPYSDEDTTQPGGPFQ
600 610 620 630 640 650
pF1KB6 PRAGSAQAD
:::::::::
NP_690 PRAGSAQAD
660
>>XP_005259209 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-inducib (713 aa)
initn: 4485 init1: 4443 opt: 4443 Z-score: 3422.0 bits: 643.6 E(85289): 7.2e-184
Smith-Waterman score: 4443; 100.0% identity (100.0% similar) in 660 aa overlap (10-669:54-713)
10 20 30
pF1KB6 MALGLQRARSTTELRKEKSRDAARSRRSQETEVLYQLAH
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TRNSHPGPGCTASPPAPPGWPFSQRGPGRWSTTELRKEKSRDAARSRRSQETEVLYQLAH
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 TLPFARGVSAHLDKASIMRLTISYLRMHRLCAAGEWNQVGAGGEPLDACYLKALEGFVMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TLPFARGVSAHLDKASIMRLTISYLRMHRLCAAGEWNQVGAGGEPLDACYLKALEGFVMV
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 LTAEGDMAYLSENVSKHLGLSQLELIGHSIFDFIHPCDQEELQDALTPQQTLSRRKVEAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LTAEGDMAYLSENVSKHLGLSQLELIGHSIFDFIHPCDQEELQDALTPQQTLSRRKVEAP
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 TERCFSLRMKSTLTSRGRTLNLKAATWKVLNCSGHMRAYKPPAQTSPAGSPDSEPPLQCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TERCFSLRMKSTLTSRGRTLNLKAATWKVLNCSGHMRAYKPPAQTSPAGSPDSEPPLQCL
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 VLICEAIPHPGSLEPPLGRGAFLSRHSLDMKFTYCDDRIAEVAGYSPDDLIGCSAYEYIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VLICEAIPHPGSLEPPLGRGAFLSRHSLDMKFTYCDDRIAEVAGYSPDDLIGCSAYEYIH
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 ALDSDAVSKSIHTLLSKGQAVTGQYRFLARSGGYLWTQTQATVVSGGRGPQSESIVCVHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ALDSDAVSKSIHTLLSKGQAVTGQYRFLARSGGYLWTQTQATVVSGGRGPQSESIVCVHF
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 LISQVEETGVVLSLEQTEQHSRRPIQRGAPSQKDTPNPGDSLDTPGPRILAFLHPPSLSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LISQVEETGVVLSLEQTEQHSRRPIQRGAPSQKDTPNPGDSLDTPGPRILAFLHPPSLSE
390 400 410 420 430 440
400 410 420 430 440 450
pF1KB6 AALAADPRRFCSPDLRRLLGPILDGASVAATPSTPLATRHPQSPLSADLPDELPVGTENV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AALAADPRRFCSPDLRRLLGPILDGASVAATPSTPLATRHPQSPLSADLPDELPVGTENV
450 460 470 480 490 500
460 470 480 490 500 510
pF1KB6 HRLFTSGKDTEAVETDLDIAQDADALDLEMLAPYISMDDDFQLNASEQLPRAYHRPLGAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HRLFTSGKDTEAVETDLDIAQDADALDLEMLAPYISMDDDFQLNASEQLPRAYHRPLGAV
510 520 530 540 550 560
520 530 540 550 560 570
pF1KB6 PRPRARSFHGLSPPALEPSLLPRWGSDPRLSCSSPSRGDPSASSPMAGARKRTLAQSSED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PRPRARSFHGLSPPALEPSLLPRWGSDPRLSCSSPSRGDPSASSPMAGARKRTLAQSSED
570 580 590 600 610 620
580 590 600 610 620 630
pF1KB6 EDEGVELLGVRPPKRSPSPEHENFLLFPLSLSFLLTGGPAPGSLQDPSTPLLNLNEPLGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EDEGVELLGVRPPKRSPSPEHENFLLFPLSLSFLLTGGPAPGSLQDPSTPLLNLNEPLGL
630 640 650 660 670 680
640 650 660
pF1KB6 GPSLLSPYSDEDTTQPGGPFQPRAGSAQAD
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GPSLLSPYSDEDTTQPGGPFQPRAGSAQAD
690 700 710
>>XP_016882627 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-inducib (663 aa)
initn: 4284 init1: 4284 opt: 4286 Z-score: 3301.9 bits: 621.3 E(85289): 3.5e-177
Smith-Waterman score: 4286; 97.3% identity (98.0% similar) in 660 aa overlap (1-658:1-660)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MALGLQRARSTTELRKEKSRDAARSRRSQETEVLYQLAHTLPFARGVSAHLDKASIMRLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MALGLQRARSTTELRKEKSRDAARSRRSQETEVLYQLAHTLPFARGVSAHLDKASIMRLT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 ISYLRMHRLCAAGEWNQVGAGGEPLDACYLKALEGFVMVLTAEGDMAYLSENVSKHLGLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ISYLRMHRLCAAGEWNQVGAGGEPLDACYLKALEGFVMVLTAEGDMAYLSENVSKHLGLS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 QLELIGHSIFDFIHPCDQEELQDALTPQQTLSRRKVEAPTERCFSLRMKSTLTSRGRTLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QLELIGHSIFDFIHPCDQEELQDALTPQQTLSRRKVEAPTERCFSLRMKSTLTSRGRTLN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LKAATWKVLNCSGHMRAYKPPAQTSPAGSPDSEPPLQCLVLICEAIPHPGSLEPPLGRGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LKAATWKVLNCSGHMRAYKPPAQTSPAGSPDSEPPLQCLVLICEAIPHPGSLEPPLGRGA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 FLSRHSLDMKFTYCDDRIAEVAGYSPDDLIGCSAYEYIHALDSDAVSKSIHTLLSKGQAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FLSRHSLDMKFTYCDDRIAEVAGYSPDDLIGCSAYEYIHALDSDAVSKSIHTLLSKGQAV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 TGQYRFLARSGGYLWTQTQATVVSGGRGPQSESIVCVHFLISQVEETGVVLSLEQTEQHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TGQYRFLARSGGYLWTQTQATVVSGGRGPQSESIVCVHFLISQVEETGVVLSLEQTEQHS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 RRPIQRGAPSQKDTPNPGDSLDTPGPRILAFLHPPSLSEAALAADPRRFCSPDLRRLLGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RRPIQRGAPSQKDTPNPGDSLDTPGPRILAFLHPPSLSEAALAADPRRFCSPDLRRLLGP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 ILDGASVAATPSTPLATRHPQSPLSADLPDELPVGTENVHRLFTSGKDTEAVETDLDIAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ILDGASVAATPSTPLATRHPQSPLSADLPDELPVGTENVHRLFTSGKDTEAVETDLDIAQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 DADALDLEMLAPYISMDDDFQLNASEQLPRAYHRPLGAVPRPRARSFHGLSPPALEPSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DADALDLEMLAPYISMDDDFQLNASEQLPRAYHRPLGAVPRPRARSFHGLSPPALEPSLL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 PRWGSDPRLSCSSPSRGDPSASSPMAGARKRTLAQSSEDEDEGVELLGVRPPKRSPSPEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PRWGSDPRLSCSSPSRGDPSASSPMAGARKRTLAQSSEDEDEGVELLGVRPPKRSPSPEH
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650
pF1KB6 ENFLLFPLSLSFLLTGGPAPGSLQDPSTPLLNLNEPLGLGPSLLS--PYSDEDTTQPGGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. : . ... :: :
XP_016 ENFLLFPLSLSFLLTGGPAPGSLQDPSTPLLNLNEPLGFHFVTQSGVQWHKHSSPQPRPP
610 620 630 640 650 660
660
pF1KB6 FQPRAGSAQAD
XP_016 GLK
>>XP_016882625 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-inducib (707 aa)
initn: 4270 init1: 4228 opt: 4230 Z-score: 3258.5 bits: 613.4 E(85289): 9.2e-175
Smith-Waterman score: 4230; 97.2% identity (98.0% similar) in 651 aa overlap (10-658:54-704)
10 20 30
pF1KB6 MALGLQRARSTTELRKEKSRDAARSRRSQETEVLYQLAH
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TRNSHPGPGCTASPPAPPGWPFSQRGPGRWSTTELRKEKSRDAARSRRSQETEVLYQLAH
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 TLPFARGVSAHLDKASIMRLTISYLRMHRLCAAGEWNQVGAGGEPLDACYLKALEGFVMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TLPFARGVSAHLDKASIMRLTISYLRMHRLCAAGEWNQVGAGGEPLDACYLKALEGFVMV
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 LTAEGDMAYLSENVSKHLGLSQLELIGHSIFDFIHPCDQEELQDALTPQQTLSRRKVEAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LTAEGDMAYLSENVSKHLGLSQLELIGHSIFDFIHPCDQEELQDALTPQQTLSRRKVEAP
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 TERCFSLRMKSTLTSRGRTLNLKAATWKVLNCSGHMRAYKPPAQTSPAGSPDSEPPLQCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TERCFSLRMKSTLTSRGRTLNLKAATWKVLNCSGHMRAYKPPAQTSPAGSPDSEPPLQCL
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 VLICEAIPHPGSLEPPLGRGAFLSRHSLDMKFTYCDDRIAEVAGYSPDDLIGCSAYEYIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VLICEAIPHPGSLEPPLGRGAFLSRHSLDMKFTYCDDRIAEVAGYSPDDLIGCSAYEYIH
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 ALDSDAVSKSIHTLLSKGQAVTGQYRFLARSGGYLWTQTQATVVSGGRGPQSESIVCVHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALDSDAVSKSIHTLLSKGQAVTGQYRFLARSGGYLWTQTQATVVSGGRGPQSESIVCVHF
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 LISQVEETGVVLSLEQTEQHSRRPIQRGAPSQKDTPNPGDSLDTPGPRILAFLHPPSLSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LISQVEETGVVLSLEQTEQHSRRPIQRGAPSQKDTPNPGDSLDTPGPRILAFLHPPSLSE
390 400 410 420 430 440
400 410 420 430 440 450
pF1KB6 AALAADPRRFCSPDLRRLLGPILDGASVAATPSTPLATRHPQSPLSADLPDELPVGTENV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AALAADPRRFCSPDLRRLLGPILDGASVAATPSTPLATRHPQSPLSADLPDELPVGTENV
450 460 470 480 490 500
460 470 480 490 500 510
pF1KB6 HRLFTSGKDTEAVETDLDIAQDADALDLEMLAPYISMDDDFQLNASEQLPRAYHRPLGAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HRLFTSGKDTEAVETDLDIAQDADALDLEMLAPYISMDDDFQLNASEQLPRAYHRPLGAV
510 520 530 540 550 560
520 530 540 550 560 570
pF1KB6 PRPRARSFHGLSPPALEPSLLPRWGSDPRLSCSSPSRGDPSASSPMAGARKRTLAQSSED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PRPRARSFHGLSPPALEPSLLPRWGSDPRLSCSSPSRGDPSASSPMAGARKRTLAQSSED
570 580 590 600 610 620
580 590 600 610 620 630
pF1KB6 EDEGVELLGVRPPKRSPSPEHENFLLFPLSLSFLLTGGPAPGSLQDPSTPLLNLNEPLGL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
XP_016 EDEGVELLGVRPPKRSPSPEHENFLLFPLSLSFLLTGGPAPGSLQDPSTPLLNLNEPLGF
630 640 650 660 670 680
640 650 660
pF1KB6 GPSLLS--PYSDEDTTQPGGPFQPRAGSAQAD
: . ... :: :
XP_016 HFVTQSGVQWHKHSSPQPRPPGLK
690 700
>>NP_071907 (OMIM: 609976) hypoxia-inducible factor 3-al (600 aa)
initn: 3728 init1: 3728 opt: 3728 Z-score: 2874.0 bits: 542.0 E(85289): 2.4e-153
Smith-Waterman score: 3728; 100.0% identity (100.0% similar) in 549 aa overlap (121-669:52-600)
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 KALEGFVMVLTAEGDMAYLSENVSKHLGLSQLELIGHSIFDFIHPCDQEELQDALTPQQT
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 PSPAASAPTWTRPLSCASPSATCACTASAPQLELIGHSIFDFIHPCDQEELQDALTPQQT
30 40 50 60 70 80
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 LSRRKVEAPTERCFSLRMKSTLTSRGRTLNLKAATWKVLNCSGHMRAYKPPAQTSPAGSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 LSRRKVEAPTERCFSLRMKSTLTSRGRTLNLKAATWKVLNCSGHMRAYKPPAQTSPAGSP
90 100 110 120 130 140
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 DSEPPLQCLVLICEAIPHPGSLEPPLGRGAFLSRHSLDMKFTYCDDRIAEVAGYSPDDLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 DSEPPLQCLVLICEAIPHPGSLEPPLGRGAFLSRHSLDMKFTYCDDRIAEVAGYSPDDLI
150 160 170 180 190 200
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 GCSAYEYIHALDSDAVSKSIHTLLSKGQAVTGQYRFLARSGGYLWTQTQATVVSGGRGPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 GCSAYEYIHALDSDAVSKSIHTLLSKGQAVTGQYRFLARSGGYLWTQTQATVVSGGRGPQ
210 220 230 240 250 260
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 SESIVCVHFLISQVEETGVVLSLEQTEQHSRRPIQRGAPSQKDTPNPGDSLDTPGPRILA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 SESIVCVHFLISQVEETGVVLSLEQTEQHSRRPIQRGAPSQKDTPNPGDSLDTPGPRILA
270 280 290 300 310 320
400 410 420 430 440 450
pF1KB6 FLHPPSLSEAALAADPRRFCSPDLRRLLGPILDGASVAATPSTPLATRHPQSPLSADLPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 FLHPPSLSEAALAADPRRFCSPDLRRLLGPILDGASVAATPSTPLATRHPQSPLSADLPD
330 340 350 360 370 380
460 470 480 490 500 510
pF1KB6 ELPVGTENVHRLFTSGKDTEAVETDLDIAQDADALDLEMLAPYISMDDDFQLNASEQLPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 ELPVGTENVHRLFTSGKDTEAVETDLDIAQDADALDLEMLAPYISMDDDFQLNASEQLPR
390 400 410 420 430 440
520 530 540 550 560 570
pF1KB6 AYHRPLGAVPRPRARSFHGLSPPALEPSLLPRWGSDPRLSCSSPSRGDPSASSPMAGARK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 AYHRPLGAVPRPRARSFHGLSPPALEPSLLPRWGSDPRLSCSSPSRGDPSASSPMAGARK
450 460 470 480 490 500
580 590 600 610 620 630
pF1KB6 RTLAQSSEDEDEGVELLGVRPPKRSPSPEHENFLLFPLSLSFLLTGGPAPGSLQDPSTPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 RTLAQSSEDEDEGVELLGVRPPKRSPSPEHENFLLFPLSLSFLLTGGPAPGSLQDPSTPL
510 520 530 540 550 560
640 650 660
pF1KB6 LNLNEPLGLGPSLLSPYSDEDTTQPGGPFQPRAGSAQAD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 LNLNEPLGLGPSLLSPYSDEDTTQPGGPFQPRAGSAQAD
570 580 590 600
>>XP_005259210 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-inducib (594 aa)
initn: 3555 init1: 3513 opt: 3515 Z-score: 2710.5 bits: 511.7 E(85289): 3.1e-144
Smith-Waterman score: 3515; 96.7% identity (97.6% similar) in 540 aa overlap (121-658:52-591)
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 KALEGFVMVLTAEGDMAYLSENVSKHLGLSQLELIGHSIFDFIHPCDQEELQDALTPQQT
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PSPAASAPTWTRPLSCASPSATCACTASAPQLELIGHSIFDFIHPCDQEELQDALTPQQT
30 40 50 60 70 80
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 LSRRKVEAPTERCFSLRMKSTLTSRGRTLNLKAATWKVLNCSGHMRAYKPPAQTSPAGSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LSRRKVEAPTERCFSLRMKSTLTSRGRTLNLKAATWKVLNCSGHMRAYKPPAQTSPAGSP
90 100 110 120 130 140
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 DSEPPLQCLVLICEAIPHPGSLEPPLGRGAFLSRHSLDMKFTYCDDRIAEVAGYSPDDLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DSEPPLQCLVLICEAIPHPGSLEPPLGRGAFLSRHSLDMKFTYCDDRIAEVAGYSPDDLI
150 160 170 180 190 200
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 GCSAYEYIHALDSDAVSKSIHTLLSKGQAVTGQYRFLARSGGYLWTQTQATVVSGGRGPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GCSAYEYIHALDSDAVSKSIHTLLSKGQAVTGQYRFLARSGGYLWTQTQATVVSGGRGPQ
210 220 230 240 250 260
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 SESIVCVHFLISQVEETGVVLSLEQTEQHSRRPIQRGAPSQKDTPNPGDSLDTPGPRILA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SESIVCVHFLISQVEETGVVLSLEQTEQHSRRPIQRGAPSQKDTPNPGDSLDTPGPRILA
270 280 290 300 310 320
400 410 420 430 440 450
pF1KB6 FLHPPSLSEAALAADPRRFCSPDLRRLLGPILDGASVAATPSTPLATRHPQSPLSADLPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FLHPPSLSEAALAADPRRFCSPDLRRLLGPILDGASVAATPSTPLATRHPQSPLSADLPD
330 340 350 360 370 380
460 470 480 490 500 510
pF1KB6 ELPVGTENVHRLFTSGKDTEAVETDLDIAQDADALDLEMLAPYISMDDDFQLNASEQLPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ELPVGTENVHRLFTSGKDTEAVETDLDIAQDADALDLEMLAPYISMDDDFQLNASEQLPR
390 400 410 420 430 440
520 530 540 550 560 570
pF1KB6 AYHRPLGAVPRPRARSFHGLSPPALEPSLLPRWGSDPRLSCSSPSRGDPSASSPMAGARK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AYHRPLGAVPRPRARSFHGLSPPALEPSLLPRWGSDPRLSCSSPSRGDPSASSPMAGARK
450 460 470 480 490 500
580 590 600 610 620 630
pF1KB6 RTLAQSSEDEDEGVELLGVRPPKRSPSPEHENFLLFPLSLSFLLTGGPAPGSLQDPSTPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RTLAQSSEDEDEGVELLGVRPPKRSPSPEHENFLLFPLSLSFLLTGGPAPGSLQDPSTPL
510 520 530 540 550 560
640 650 660
pF1KB6 LNLNEPLGLGPSLLS--PYSDEDTTQPGGPFQPRAGSAQAD
::::::::. : . ... :: :
XP_005 LNLNEPLGFHFVTQSGVQWHKHSSPQPRPPGLK
570 580 590
>>XP_016882623 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-inducib (711 aa)
initn: 3200 init1: 3200 opt: 3204 Z-score: 2470.6 bits: 467.6 E(85289): 7.1e-131
Smith-Waterman score: 4338; 94.0% identity (94.0% similar) in 701 aa overlap (1-659:1-701)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MALGLQRARSTTELRKEKSRDAARSRRSQETEVLYQLAHTLPFARGVSAHLDKASIMRLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MALGLQRARSTTELRKEKSRDAARSRRSQETEVLYQLAHTLPFARGVSAHLDKASIMRLT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 ISYLRMHRLCAAGEWNQVGAGGEPLDACYLKALEGFVMVLTAEGDMAYLSENVSKHLGLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ISYLRMHRLCAAGEWNQVGAGGEPLDACYLKALEGFVMVLTAEGDMAYLSENVSKHLGLS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 QLELIGHSIFDFIHPCDQEELQDALTPQQTLSRRKVEAPTERCFSLRMKSTLTSRGRTLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QLELIGHSIFDFIHPCDQEELQDALTPQQTLSRRKVEAPTERCFSLRMKSTLTSRGRTLN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LKAATWKVLNCSGHMRAYKPPAQTSPAGSPDSEPPLQCLVLICEAIPHPGSLEPPLGRGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LKAATWKVLNCSGHMRAYKPPAQTSPAGSPDSEPPLQCLVLICEAIPHPGSLEPPLGRGA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 FLSRHSLDMKFTYCDDRIAEVAGYSPDDLIGCSAYEYIHALDSDAVSKSIHTLLSKGQAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FLSRHSLDMKFTYCDDRIAEVAGYSPDDLIGCSAYEYIHALDSDAVSKSIHTLLSKGQAV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 TGQYRFLARSGGYLWTQTQATVVSGGRGPQSESIVCVHFLISQVEETGVVLSLEQTEQHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TGQYRFLARSGGYLWTQTQATVVSGGRGPQSESIVCVHFLISQVEETGVVLSLEQTEQHS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 RRPIQRGAPSQKDTPNPGDSLDTPGPRILAFLHPPSLSEAALAADPRRFCSPDLRRLLGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RRPIQRGAPSQKDTPNPGDSLDTPGPRILAFLHPPSLSEAALAADPRRFCSPDLRRLLGP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 ILDGASVAATPSTPLATRHPQSPLSADLPDELPVGTENVHRLFTSGKDTEAVETDLDIAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ILDGASVAATPSTPLATRHPQSPLSADLPDELPVGTENVHRLFTSGKDTEAVETDLDIAQ
430 440 450 460 470 480
490
pF1KB6 ------------------------------------------DADALDLEMLAPYISMDD
::::::::::::::::::
XP_016 MRKLKLRLLTTGTELRSDGAGTSAKVHPSPRLILLPPSCPPQDADALDLEMLAPYISMDD
490 500 510 520 530 540
500 510 520 530 540 550
pF1KB6 DFQLNASEQLPRAYHRPLGAVPRPRARSFHGLSPPALEPSLLPRWGSDPRLSCSSPSRGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DFQLNASEQLPRAYHRPLGAVPRPRARSFHGLSPPALEPSLLPRWGSDPRLSCSSPSRGD
550 560 570 580 590 600
560 570 580 590 600 610
pF1KB6 PSASSPMAGARKRTLAQSSEDEDEGVELLGVRPPKRSPSPEHENFLLFPLSLSFLLTGGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PSASSPMAGARKRTLAQSSEDEDEGVELLGVRPPKRSPSPEHENFLLFPLSLSFLLTGGP
610 620 630 640 650 660
620 630 640 650 660
pF1KB6 APGSLQDPSTPLLNLNEPLGLGPSLLSPYSDEDTTQPGGPFQPRAGSAQAD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 APGSLQDPSTPLLNLNEPLGLGPSLLSPYSDEDTTQPGGPFQPRAGSAQAD
670 680 690 700 710
>>XP_016882626 (OMIM: 609976) PREDICTED: hypoxia-inducib (703 aa)
initn: 4231 init1: 3154 opt: 3158 Z-score: 2435.3 bits: 461.0 E(85289): 6.5e-129
Smith-Waterman score: 4145; 91.0% identity (91.7% similar) in 699 aa overlap (6-662:4-698)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MALGLQRARSTTELRKEKSRDAARSRRSQETEVLYQLAHTLPFARGVSAHLDKASIMRLT
: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MDWQDHRSTTELRKEKSRDAARSRRSQETEVLYQLAHTLPFARGVSAHLDKASIMRLT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]