Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6223
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6223, 670 aa
1>>>pF1KB6223 670 - 670 aa - 670 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0486+/-0.00202; mu= 24.5444+/- 0.123
mean_var=324.0129+/-58.461, 0's: 0 Z-trim(105.5): 936 B-trim: 4 in 1/49
Lambda= 0.071251
statistics sampled from 7433 (8475) to 7433 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.585), E-opt: 0.2 (0.26), width: 16
Scan time: 2.950
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 4759 504.8 1.6e-142
CCDS12966.1 ZNF256 gene_id:10172|Hs108|chr19 ( 627) 2298 251.8 2.2e-66
CCDS42636.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 ( 662) 2033 224.6 3.5e-58
CCDS82405.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 ( 664) 2033 224.6 3.5e-58
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 2023 223.6 7.1e-58
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1991 220.4 7.3e-57
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1965 218.1 5.2e-56
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1964 218.0 5.7e-56
CCDS82409.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 591) 1938 214.7 2.9e-55
CCDS42642.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 676) 1938 214.9 3.1e-55
CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 697) 1938 214.9 3.1e-55
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1934 214.4 3.9e-55
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1934 214.5 4.1e-55
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1934 214.5 4.1e-55
CCDS53850.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 672) 1931 214.1 5e-55
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1927 213.8 6.9e-55
CCDS46212.1 ZNF814 gene_id:730051|Hs108|chr19 ( 855) 1919 213.1 1.3e-54
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1915 212.5 1.6e-54
CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 816) 1914 212.6 1.8e-54
CCDS35066.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 852) 1914 212.6 1.8e-54
CCDS59136.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 854) 1914 212.6 1.8e-54
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1907 211.7 2.8e-54
CCDS12945.1 ZNF471 gene_id:57573|Hs108|chr19 ( 626) 1902 211.1 3.9e-54
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1884 209.1 1.3e-53
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1884 209.3 1.4e-53
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19 ( 706) 1881 209.1 1.8e-53
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1876 208.2 2.3e-53
CCDS12955.1 ZNF530 gene_id:348327|Hs108|chr19 ( 599) 1871 207.9 3.5e-53
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 1868 207.7 4.6e-53
CCDS47539.1 ZNF12 gene_id:7559|Hs108|chr7 ( 659) 1866 207.4 5.1e-53
CCDS74462.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 617) 1863 207.1 6.2e-53
CCDS12950.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 659) 1863 207.1 6.3e-53
CCDS77365.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 706) 1863 207.2 6.5e-53
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 1862 207.5 8.1e-53
CCDS77297.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 810) 1851 206.1 1.6e-52
CCDS12548.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 836) 1851 206.1 1.6e-52
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1845 205.2 2.2e-52
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1845 205.3 2.3e-52
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 1845 205.4 2.4e-52
CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 769) 1845 205.4 2.4e-52
CCDS46165.1 ZNF534 gene_id:147658|Hs108|chr19 ( 674) 1843 205.1 2.7e-52
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1842 205.0 2.8e-52
CCDS31938.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 641) 1836 204.3 4.3e-52
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1831 203.7 5.9e-52
CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 ( 778) 1832 204.1 6.1e-52
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 1831 204.1 6.8e-52
CCDS74349.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 647) 1828 203.5 7.6e-52
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 1826 203.6 9.7e-52
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 1826 203.6 9.7e-52
CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12 ( 947) 1826 203.7 1e-51
>>CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 (670 aa)
initn: 4759 init1: 4759 opt: 4759 Z-score: 2672.4 bits: 504.8 E(32554): 1.6e-142
Smith-Waterman score: 4759; 100.0% identity (100.0% similar) in 670 aa overlap (1-670:1-670)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPAPVGRRSPPSPRSSMAAVALRDSAQGMTFEDVAIYFSQEEWELLDESQRFLYCDVMLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MPAPVGRRSPPSPRSSMAAVALRDSAQGMTFEDVAIYFSQEEWELLDESQRFLYCDVMLE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 NFAHVTSLGYCHGMENEAIASEQSVSIQVRTSKGNTPTQKTHLSEIKMCVPVLKDILPAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NFAHVTSLGYCHGMENEAIASEQSVSIQVRTSKGNTPTQKTHLSEIKMCVPVLKDILPAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 EHQTTSPVQKSYLGSTSMRGFCFSADLHQHQKHYNEEEPWKRKVDEATFVTGCRFHVLNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EHQTTSPVQKSYLGSTSMRGFCFSADLHQHQKHYNEEEPWKRKVDEATFVTGCRFHVLNY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 FTCGEAFPAPTDLLQHEATPSGEEPHSSSSKHIQAFFNAKSYYKWGEYRKASSHKHTLVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FTCGEAFPAPTDLLQHEATPSGEEPHSSSSKHIQAFFNAKSYYKWGEYRKASSHKHTLVQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 HQSVCSEGGLYECSKCEKAFTCKNTLVQHQQIHTGQKMFECSECEESFSKKCHLILHKII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HQSVCSEGGLYECSKCEKAFTCKNTLVQHQQIHTGQKMFECSECEESFSKKCHLILHKII
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 HTGERPYECSDREKAFIHKSEFIHHQRRHTGGVRHECGECRKTFSYKSNLIEHQRVHTGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HTGERPYECSDREKAFIHKSEFIHHQRRHTGGVRHECGECRKTFSYKSNLIEHQRVHTGE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 RPYECGECGKSFRQSSSLFRHQRVHSGERPYQCCECGKSFRQIFNLIRHRRVHTGEMPYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RPYECGECGKSFRQSSSLFRHQRVHSGERPYQCCECGKSFRQIFNLIRHRRVHTGEMPYQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 CSDCGKSFSCKSELIQHQRIHSGERPYECRECGKSFRQFSNLIRHRSIHTGDRPYECSEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CSDCGKSFSCKSELIQHQRIHSGERPYECRECGKSFRQFSNLIRHRSIHTGDRPYECSEC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 EKSFSRKFILIQHQRVHTGERPYECSECGKSFTRKSDLIQHRRIHTGTRPYECSECGKSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EKSFSRKFILIQHQRVHTGERPYECSECGKSFTRKSDLIQHRRIHTGTRPYECSECGKSF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 RQRSGLIQHRRLHTGERPYECSECGKSFSQSASLIQHQRVHTGERPYECSECGKSFSQSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RQRSGLIQHRRLHTGERPYECSECGKSFSQSASLIQHQRVHTGERPYECSECGKSFSQSS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 SLIQHQRGHTGERPYECSQCGKPFTHKSDLIQHQRVHTGERPYECSECGKSFSRKSNLIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SLIQHQRGHTGERPYECSQCGKPFTHKSDLIQHQRVHTGERPYECSECGKSFSRKSNLIR
610 620 630 640 650 660
670
pF1KB6 HRRVHTEERP
::::::::::
CCDS12 HRRVHTEERP
670
>>CCDS12966.1 ZNF256 gene_id:10172|Hs108|chr19 (627 aa)
initn: 3502 init1: 1909 opt: 2298 Z-score: 1305.4 bits: 251.8 E(32554): 2.2e-66
Smith-Waterman score: 2298; 54.0% identity (75.9% similar) in 632 aa overlap (17-639:1-627)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MPAPVGRRSPPSPRSSMAAVALRDSAQGM-TFEDVAIYFSQEEWELLDESQRFLYCDVML
:::. : :::. ::::::.::: .:: ::::.:. :: ::::
CCDS12 MAAAELTAPAQGIVTFEDVAVYFSWKEWGLLDEAQKCLYHDVML
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 ENFAHVTSLGYCHGMENEAI----ASEQSVSIQVRTSKGNTPTQKTHLSEIKMCVPVLKD
::.. .:::: . ..:: .: : :: ::: :. :::. :: : :::..
CCDS12 ENLTLTTSLGGSGAGDEEAPYQQSTSPQRVS-QVRIPKALPSPQKTNPCEI--CGPVLRQ
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pF1KB6 ILPAAEHQTTSPVQKSYLGSTSMRGFCFSADLHQHQKHYNEEEPWKRKVDEATFVTGCRF
:: .::: : :: : .. . . :.: ::::::.. .. .. . . :...: :
CCDS12 ILHLVEHQGTHHGQKLYTDGACRKQLQFTAYLHQHQKQHVGQKHFRSNGGRDMFLSSCTF
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180 190 200 210 220 230
pF1KB6 HVLNY-FTC---GEAFPAPTDLLQHEATPSGEEPHSSSSKHIQAFFNAKSYYKWGEYRKA
.: . ::: :. : . . .::..:. . . .:. .: :: ..:..:.::: ::
CCDS12 EVSGKPFTCKEVGKDFLVRSRFLQQQAAHT--RKKSNRTKSAVAFHSVKNHYNWGECVKA
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 SSHKHTLVQHQSVCSEGGLYECSKCEKAFTCKNTLVQHQQIHTGQKMFECSECEESFSKK
:.::. ::::. . : ::.: :.:. . .: .: ..::..: . :.:: .:. ..
CCDS12 FSYKHVRVQHQGDLIRERSYMCSECGKSFSTSCSLSDHLRVHTSEKPYTCGECGKSYRQS
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 CHLILHKIIHTGERPYECSDREKAFIHKSEFIHHQRRHTGGVRHECGECRKTFSYKSNLI
:: :. :::: ::..:.. : : .: ... ::: ::: ..:.:: :.::..:.::
CCDS12 SSLITHRRIHTGVRPHQCDECGKLFNRKYDLLIHQRVHTGERPYKCSECGKSFSHSSSLI
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 EHQRVHTGERPYECGECGKSFRQSSSLFRHQRVHSGERPYQCCECGKSFRQIFNLIRHRR
:::.::: :::::.:::::: .::::. :::::.: :::.: :::::: : .::.:::
CCDS12 THQRIHTGMRPYECSECGKSFIHSSSLITHQRVHTGTRPYMCSECGKSFSQSCHLIKHRR
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 VHTGEMPYQCSDCGKSFSCKSELIQHQRIHSGERPYECRECGKSFRQFSNLIRHRSIHTG
.: :: ::.::.::: :. .:...::::.:.: : .::.:::: : . .:: :. .:::
CCDS12 LHIGEGPYECSECGKLFTYRSRFFQHQRVHTGVRSHECHECGKLFSRKFDLIVHERVHTG
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 DRPYECSECEKSFSRKFILIQHQRVHTGERPYECSECGKSFTRKSDLIQHRRIHTGTRPY
.:::::::: :::. : ::.: .:::: :::::.:::::::..: :.::.:.::: :::
CCDS12 ERPYECSECGKSFTCKSYLISHWKVHTGARPYECGECGKSFTHSSTLLQHQRVHTGERPY
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 ECSECGKSFRQRSGLIQHRRLHTGERPYECSECGKSFSQSASLIQHQRVHTGERPYECSE
::.:::: : : :.::.::: :::::::::::: ::::. .::..:.:::::::::::::
CCDS12 ECNECGKFFSQSSSLIRHRRSHTGERPYECSECWKSFSNHSSLVKHRRVHTGERPYECSE
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KB6 CGKSFSQSSSLIQHQRGHTGERPYECSQCGKPFTHKSDLIQHQRVHTGERPYECSECGKS
:::::::::.: .::: :.::::::::.::: :: .:.:..:: :: :
CCDS12 CGKSFSQSSNLTNHQRIHSGERPYECSDCGKFFTFNSNLLKHQNVHKG
580 590 600 610 620
660 670
pF1KB6 FSRKSNLIRHRRVHTEERP
>>CCDS42636.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 (662 aa)
initn: 1953 init1: 1953 opt: 2033 Z-score: 1158.1 bits: 224.6 E(32554): 3.5e-58
Smith-Waterman score: 2286; 51.2% identity (73.1% similar) in 648 aa overlap (29-670:8-637)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPAPVGRRSPPSPRSSMAAVALRDSAQGMTFEDVAIYFSQEEWELLDESQRFLYCDVMLE
:.::::::.:::::: .:.. :: :. :::::
CCDS42 MNLTEDYMVFEDVAIHFSQEEWGILNDVQRHLHSDVMLE
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KB6 NFAHVTSLGYCHGMENEAIASEQSVSI---QVRTSKGNTPTQKTHLSEIKMCVPVLKDIL
::: ..:.: :: ..: :.: ::. :: : : :::.. : : .:::::
CCDS42 NFALLSSVGCWHGAKDEEAPSKQCVSVGVSQVTTLKPALSTQKAQPCET--CSSLLKDIL
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 PAAEHQTTSPVQKSYLGSTSMRGFCFSADLHQHQKHYNEEEPWKRKVDEATFVTGCRFHV
:::. : : . .: :. :::.. .:. . . .::. .
CCDS42 HLAEHDGTHPKR--------------TAKLYLHQKEHLREKLTRSDEGRPSFVNDSVHLA
100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 LNYFTC---GEAFPAPTDLLQHEATPSGEEPHSSSSKHIQAFFNAKSYYKWGEYRKASSH
.:: :. : . .:: :..: :: .:: .. . ..:: .... :. . : :
CCDS42 KRNLTCMQGGKDFTGDSDL-QQQALHSGWKPHRDT-HGVEAFQSGQNNYSCTQCGKDFCH
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 KHTLVQHQSVCSEGGLYECSKCEKAFTCKNTLVQHQQIHTGQKMFECSECEESFSKKCHL
.::: .::.. .: ::::.: : : .. :..::. :::.. ..:::: ..:: : ..
CCDS42 QHTLFEHQKIHTEERPYECSECGKLFRYNSDLIKHQRNHTGERPYKCSECGKAFSLKYNV
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 ILHKIIHTGERPYECSDREKAFIHKSEFIHHQRRHTGGVRHECGECRKTFSYKSNLIEHQ
. :. :::::::::::. :::..::....::: :: . :.:: :.: ...:. ::
CCDS42 VQHQKIHTGERPYECSECGKAFLRKSHLLQHQRIHTRPRPYVCSECGKAFLTQAHLVGHQ
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 RVHTGERPYECGECGKSFRQSSSLFRHQRVHSGERPYQCCECGKSFRQIFNLIRHRRVHT
..::::::: :.:::: : ::.:.:::.::.::::. :::::: : . .:: :.::::
CCDS42 KIHTGERPYGCNECGKYFMYSSALIRHQKVHTGERPFYCCECGKFFMDSCTLIIHQRVHT
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 GEMPYQCSDCGKSFSCKSELIQHQRIHSGERPYECRECGKSFRQFSNLIRHRSIHTGDRP
:: ::.:..::: : .: ::.::..:.::.:::: :::: : . :.:: :. .:::..:
CCDS42 GEKPYECNECGKFFRYRSTLIRHQKVHTGEKPYECSECGKFFMDTSTLIIHQRVHTGEKP
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 YECSECEKSFSRKFILIQHQRVHTGERPYECSECGKSFTRKSDLIQHRRIHTGTRPYECS
:::..: : : : : .:::::.:::::::::::: :. . : .:.:.::: ::.:::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]