Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6227
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6227, 672 aa
1>>>pF1KB6227 672 - 672 aa - 672 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.7980+/-0.00133; mu= -8.1873+/- 0.076
mean_var=383.5762+/-86.924, 0's: 0 Z-trim(108.5): 723 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.065486
statistics sampled from 9404 (10239) to 9404 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.658), E-opt: 0.2 (0.315), width: 16
Scan time: 3.650
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11664.1 PRKCA gene_id:5578|Hs108|chr17 ( 672) 4688 458.3 1.6e-128
CCDS10619.1 PRKCB gene_id:5579|Hs108|chr16 ( 673) 3850 379.2 1.1e-104
CCDS10618.1 PRKCB gene_id:5579|Hs108|chr16 ( 671) 3753 370.0 6.2e-102
CCDS12867.1 PRKCG gene_id:5582|Hs108|chr19 ( 697) 1866 191.7 2.9e-48
CCDS1824.1 PRKCE gene_id:5581|Hs108|chr2 ( 737) 1536 160.6 7.4e-39
CCDS9752.1 PRKCH gene_id:5583|Hs108|chr14 ( 683) 1355 143.4 9.9e-34
CCDS60482.1 PRKCQ gene_id:5588|Hs108|chr10 ( 581) 1295 137.7 4.5e-32
CCDS7079.1 PRKCQ gene_id:5588|Hs108|chr10 ( 706) 1295 137.8 5.1e-32
CCDS2870.1 PRKCD gene_id:5580|Hs108|chr3 ( 676) 1272 135.6 2.2e-31
CCDS41229.1 PRKCZ gene_id:5590|Hs108|chr1 ( 409) 1119 120.9 3.5e-27
CCDS81350.1 PKN2 gene_id:5586|Hs108|chr1 ( 936) 1127 122.0 3.8e-27
CCDS714.1 PKN2 gene_id:5586|Hs108|chr1 ( 984) 1127 122.1 3.9e-27
CCDS55563.1 PRKCZ gene_id:5590|Hs108|chr1 ( 488) 1119 121.0 4e-27
CCDS37.1 PRKCZ gene_id:5590|Hs108|chr1 ( 592) 1119 121.1 4.6e-27
CCDS42513.1 PKN1 gene_id:5585|Hs108|chr19 ( 942) 1105 120.0 1.6e-26
CCDS42514.1 PKN1 gene_id:5585|Hs108|chr19 ( 948) 1105 120.0 1.6e-26
CCDS12552.1 AKT2 gene_id:208|Hs108|chr19 ( 481) 1076 116.9 6.6e-26
CCDS31077.1 AKT3 gene_id:10000|Hs108|chr1 ( 479) 1071 116.5 9.2e-26
CCDS31076.1 AKT3 gene_id:10000|Hs108|chr1 ( 465) 1060 115.4 1.8e-25
CCDS9994.1 AKT1 gene_id:207|Hs108|chr14 ( 480) 1042 113.7 6.1e-25
CCDS6908.1 PKN3 gene_id:29941|Hs108|chr9 ( 889) 1033 113.1 1.7e-24
CCDS47478.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 445) 1020 111.6 2.5e-24
CCDS47477.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 459) 1018 111.4 2.9e-24
CCDS5170.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 431) 1016 111.2 3.1e-24
CCDS47476.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 526) 1016 111.3 3.6e-24
CCDS62271.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 451) 959 105.9 1.3e-22
CCDS11621.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 525) 959 105.9 1.5e-22
CCDS62273.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 472) 953 105.3 2.1e-22
CCDS6195.1 SGK3 gene_id:23678|Hs108|chr8 ( 496) 953 105.3 2.1e-22
CCDS13320.1 SGK2 gene_id:10110|Hs108|chr20 ( 427) 946 104.6 3e-22
CCDS13321.1 SGK2 gene_id:10110|Hs108|chr20 ( 367) 943 104.3 3.3e-22
CCDS41677.1 RPS6KB2 gene_id:6199|Hs108|chr11 ( 482) 929 103.0 1e-21
CCDS284.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 735) 904 100.9 7e-21
CCDS81286.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 719) 897 100.2 1.1e-20
CCDS30649.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 744) 897 100.2 1.1e-20
CCDS45149.1 RPS6KA5 gene_id:9252|Hs108|chr14 ( 549) 886 99.0 1.8e-20
CCDS73313.1 RPS6KA4 gene_id:8986|Hs108|chr11 ( 765) 889 99.5 1.9e-20
CCDS8073.1 RPS6KA4 gene_id:8986|Hs108|chr11 ( 772) 889 99.5 1.9e-20
CCDS14197.1 RPS6KA3 gene_id:6197|Hs108|chrX ( 740) 888 99.4 2e-20
CCDS34570.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 741) 886 99.2 2.3e-20
CCDS9893.1 RPS6KA5 gene_id:9252|Hs108|chr14 ( 802) 886 99.2 2.4e-20
CCDS83148.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 758) 874 98.0 5.1e-20
CCDS5294.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 733) 871 97.7 6e-20
CCDS62272.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 502) 864 96.9 7.3e-20
CCDS3212.2 PRKCI gene_id:5584|Hs108|chr3 ( 596) 856 96.2 1.4e-19
CCDS83480.1 RPS6KA6 gene_id:27330|Hs108|chrX ( 745) 857 96.4 1.5e-19
CCDS14451.1 RPS6KA6 gene_id:27330|Hs108|chrX ( 745) 857 96.4 1.5e-19
CCDS72816.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 338) 826 93.2 6.7e-19
CCDS72813.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 339) 824 93.0 7.6e-19
CCDS691.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 351) 824 93.0 7.8e-19
>>CCDS11664.1 PRKCA gene_id:5578|Hs108|chr17 (672 aa)
initn: 4688 init1: 4688 opt: 4688 Z-score: 2421.0 bits: 458.3 E(32554): 1.6e-128
Smith-Waterman score: 4688; 99.9% identity (100.0% similar) in 672 aa overlap (1-672:1-672)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MADVFPGNDSTASQDVANRFARKGALRQKNVHEVKDHKFIARFFKQPTFCSHCTDFIWGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MADVFPGNDSTASQDVANRFARKGALRQKNVHEVKDHKFIARFFKQPTFCSHCTDFIWGF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 GKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPDTDDPRSKHKFKIHTYGSPTFCDHCGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPDTDDPRSKHKFKIHTYGSPTFCDHCGS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 LLYGLIHQGMKCDTCDMNVHKQCVINVPSLCGMDHTEKRGRIYLKAEVADEKLHVTVRDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LLYGLIHQGMKCDTCDMNVHKQCVINVPSLCGMDHTEKRGRIYLKAEVADEKLHVTVRDA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 KNLIPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKNESKQKTKTIRSTLNPQWNESFTFKLKPSDKDRRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KNLIPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKNESKQKTKTIRSTLNPQWNESFTFKLKPSDKDRRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 SVEIWDWDRTTRNDFMGSLSFGVSELMKMPASGWYKLLNQEEGEYYNVPIPEGDEEGNME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SVEIWDWDRTTRNDFMGSLSFGVSELMKMPASGWYKLLNQEEGEYYNVPIPEGDEEGNME
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LRQKFEKAKLGPAGNKVISPSEDRKQPSNNLDRVKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLADRKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LRQKFEKAKLGPAGNKVISPSEDRKQPSNNLDRVKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLADRKG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 TEELYAIKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALLDKPPFLTQLHSCFQTVDRLYFVMEYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TEELYAIKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALLDKPPFLTQLHSCFQTVDRLYFVMEYV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 NGGDLMYHIQQVGKFKEPQAVFYAAEISIGLFFLHKRGIIYRDLKLDNVMLDSEGHIKIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NGGDLMYHIQQVGKFKEPQAVFYAAEISIGLFFLHKRGIIYRDLKLDNVMLDSEGHIKIA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 DFGMCKEHMMDGVTTRTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWAYGVLLYEMLAGQPPFDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DFGMCKEHMMDGVTTRTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWAYGVLLYEMLAGQPPFDG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 EDEDELFQSIMEHNVSYPKSLSKEAVSICKGLMTKHPAKRLGCGPEGERDVREHAFFRRI
:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EDEDELFQSIMEHNVSYPKSLSKEAVSVCKGLMTKHPAKRLGCGPEGERDVREHAFFRRI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 DWEKLENREIQPPFKPKVCGKGAENFDKFFTRGQPVLTPPDQLVIANIDQSDFEGFSYVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DWEKLENREIQPPFKPKVCGKGAENFDKFFTRGQPVLTPPDQLVIANIDQSDFEGFSYVN
610 620 630 640 650 660
670
pF1KB6 PQFVHPILQSAV
::::::::::::
CCDS11 PQFVHPILQSAV
670
>>CCDS10619.1 PRKCB gene_id:5579|Hs108|chr16 (673 aa)
initn: 4039 init1: 2056 opt: 3850 Z-score: 1993.1 bits: 379.2 E(32554): 1.1e-104
Smith-Waterman score: 3850; 80.3% identity (92.1% similar) in 674 aa overlap (1-670:1-673)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MADVFPGNDSTASQDVANRFARKGALRQKNVHEVKDHKFIARFFKQPTFCSHCTDFIWGF
::: : . ... . :::::::::::::::::.::: ::::::::::::::::::::
CCDS10 MADPAAGPPPSEGEESTVRFARKGALRQKNVHEVKNHKFTARFFKQPTFCSHCTDFIWGF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 GKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPDTDDPRSKHKFKIHTYGSPTFCDHCGS
::::::::::::::::::::::::::::::::: .::::::::::::::.::::::::::
CCDS10 GKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPASDDPRSKHKFKIHTYSSPTFCDHCGS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 LLYGLIHQGMKCDTCDMNVHKQCVINVPSLCGMDHTEKRGRIYLKAEVADEKLHVTVRDA
::::::::::::::: :::::.::.::::::: ::::.:::::..:.. . : : ::::
CCDS10 LLYGLIHQGMKCDTCMMNVHKRCVMNVPSLCGTDHTERRGRIYIQAHIDRDVLIVLVRDA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 KNLIPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKNESKQKTKTIRSTLNPQWNESFTFKLKPSDKDRRL
:::.:::::::::::::::::::::.:::::::::. .:::.:::.: :.:: :::::::
CCDS10 KNLVPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKSESKQKTKTIKCSLNPEWNETFRFQLKESDKDRRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 SVEIWDWDRTTRNDFMGSLSFGVSELMKMPASGWYKLLNQEEGEYYNVPIPEGDEEGNME
:::::::: :.:::::::::::.:::.: ..::.:::.::::::.:::.: :.: :
CCDS10 SVEIWDWDLTSRNDFMGSLSFGISELQKASVDGWFKLLSQEEGEYFNVPVPPEGSEANEE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB6 LRQKFEKAKLGPAGNKV----ISPSEDRKQPSNNLDRVKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLA
::::::.::.. :.:: . . .. . ..: ::.:::::::::::::::::::::.
CCDS10 LRQKFERAKISQ-GTKVPEEKTTNTVSKFDNNGNRDRMKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLS
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 DRKGTEELYAIKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALLDKPPFLTQLHSCFQTVDRLYFV
.::::.::::.:::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::.::::::
CCDS10 ERKGTDELYAVKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALPGKPPFLTQLHSCFQTMDRLYFV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 MEYVNGGDLMYHIQQVGKFKEPQAVFYAAEISIGLFFLHKRGIIYRDLKLDNVMLDSEGH
:::::::::::::::::.::::.::::::::.::::::...:::::::::::::::::::
CCDS10 MEYVNGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEIAIGLFFLQSKGIIYRDLKLDNVMLDSEGH
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 IKIADFGMCKEHMMDGVTTRTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWAYGVLLYEMLAGQP
:::::::::::.. :::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS10 IKIADFGMCKENIWDGVTTKTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWAFGVLLYEMLAGQA
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 PFDGEDEDELFQSIMEHNVSYPKSLSKEAVSICKGLMTKHPAKRLGCGPEGERDVREHAF
::.::::::::::::::::.::::.:::::.::::::::::.::::::::::::..::::
CCDS10 PFEGEDEDELFQSIMEHNVAYPKSMSKEAVAICKGLMTKHPGKRLGCGPEGERDIKEHAF
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB6 FRRIDWEKLENREIQPPFKPKVCGKGAENFDKFFTRGQPVLTPPDQLVIANIDQSDFEGF
:: ::::::: .:::::.:::.::..:::::.:::: :::::::: :: :::::.::::
CCDS10 FRYIDWEKLERKEIQPPYKPKACGRNAENFDRFFTRHPPVLTPPDQEVIRNIDQSEFEGF
600 610 620 630 640 650
660 670
pF1KB6 SYVNPQFVHPILQSAV
:.:: .:..: ..:
CCDS10 SFVNSEFLKPEVKS
660 670
>>CCDS10618.1 PRKCB gene_id:5579|Hs108|chr16 (671 aa)
initn: 3785 init1: 1806 opt: 3753 Z-score: 1943.6 bits: 370.0 E(32554): 6.2e-102
Smith-Waterman score: 3753; 79.7% identity (91.2% similar) in 670 aa overlap (1-664:1-668)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MADVFPGNDSTASQDVANRFARKGALRQKNVHEVKDHKFIARFFKQPTFCSHCTDFIWGF
::: : . ... . :::::::::::::::::.::: ::::::::::::::::::::
CCDS10 MADPAAGPPPSEGEESTVRFARKGALRQKNVHEVKNHKFTARFFKQPTFCSHCTDFIWGF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 GKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPDTDDPRSKHKFKIHTYGSPTFCDHCGS
::::::::::::::::::::::::::::::::: .::::::::::::::.::::::::::
CCDS10 GKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPGADKGPASDDPRSKHKFKIHTYSSPTFCDHCGS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 LLYGLIHQGMKCDTCDMNVHKQCVINVPSLCGMDHTEKRGRIYLKAEVADEKLHVTVRDA
::::::::::::::: :::::.::.::::::: ::::.:::::..:.. . : : ::::
CCDS10 LLYGLIHQGMKCDTCMMNVHKRCVMNVPSLCGTDHTERRGRIYIQAHIDRDVLIVLVRDA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 KNLIPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKNESKQKTKTIRSTLNPQWNESFTFKLKPSDKDRRL
:::.:::::::::::::::::::::.:::::::::. .:::.:::.: :.:: :::::::
CCDS10 KNLVPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKSESKQKTKTIKCSLNPEWNETFRFQLKESDKDRRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 SVEIWDWDRTTRNDFMGSLSFGVSELMKMPASGWYKLLNQEEGEYYNVPIPEGDEEGNME
:::::::: :.:::::::::::.:::.: ..::.:::.::::::.:::.: :.: :
CCDS10 SVEIWDWDLTSRNDFMGSLSFGISELQKASVDGWFKLLSQEEGEYFNVPVPPEGSEANEE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB6 LRQKFEKAKLGPAGNKV----ISPSEDRKQPSNNLDRVKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLA
::::::.::.. :.:: . . .. . ..: ::.:::::::::::::::::::::.
CCDS10 LRQKFERAKISQ-GTKVPEEKTTNTVSKFDNNGNRDRMKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLS
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 DRKGTEELYAIKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALLDKPPFLTQLHSCFQTVDRLYFV
.::::.::::.:::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::.::::::
CCDS10 ERKGTDELYAVKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALPGKPPFLTQLHSCFQTMDRLYFV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 MEYVNGGDLMYHIQQVGKFKEPQAVFYAAEISIGLFFLHKRGIIYRDLKLDNVMLDSEGH
:::::::::::::::::.::::.::::::::.::::::...:::::::::::::::::::
CCDS10 MEYVNGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEIAIGLFFLQSKGIIYRDLKLDNVMLDSEGH
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 IKIADFGMCKEHMMDGVTTRTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWAYGVLLYEMLAGQP
:::::::::::.. :::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS10 IKIADFGMCKENIWDGVTTKTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWAFGVLLYEMLAGQA
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 PFDGEDEDELFQSIMEHNVSYPKSLSKEAVSICKGLMTKHPAKRLGCGPEGERDVREHAF
::.::::::::::::::::.::::.:::::.::::::::::.::::::::::::..::::
CCDS10 PFEGEDEDELFQSIMEHNVAYPKSMSKEAVAICKGLMTKHPGKRLGCGPEGERDIKEHAF
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB6 FRRIDWEKLENREIQPPFKPKVCGK-GAENFDKFFTRGQPV-LTPPDQLVIANIDQSDFE
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CCDS10 FRYIDWEKLERKEIQPPYKPKARDKRDTSNFDKEFTR-QPVELTPTDKLFIMNLDQNEFA
600 610 620 630 640 650
660 670
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CCDS10 GFSYTNPEFVINV
660 670
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10 20 30 40 50
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:: . :: .:: .. : :::::::: :::::.::: :::::::::::::::::::
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10 20 30 40 50
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.::::.::::: ::::.:::::::: :::: :::.:::::.::::..:.:.:::::::::
CCDS12 IGKQGLQCQVCSFVVHRRCHEFVTFECPGAGKGPQTDDPRNKHKFRLHSYSSPTFCDHCG
60 70 80 90 100 110
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120 130 140 150 160 170
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.:.:::::::::::::::::::::::.: .::::.:...:::: :::.:.:.:::.: .
CCDS12 GEARNLIPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPRNLTKQKTRTVKATLNPVWNETFVFNLKPGDVE
180 190 200 210 220 230
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::::::.::::::.::::::..:::::::.: :..:::::::::::::::::. ..:
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240 250 260 270 280 290
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: : :::: ....::... . ::: . .:. . :....::.::
CCDS12 NCSLLQKFEACNYPLELYERVRMGPSSSPIPSPSPSPTDPKRCFFGASPGRLHISDFSFL
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390
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::::::::::::::.:.:..::::::::::::..:::::.::.:::::::: . :
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400 410 420 430 440 450
pF1KB6 -FLTQLHSCFQTVDRLYFVMEYVNGGDLMYHIQQVGKFKEPQAVFYAAEISIGLFFLHKR
::::::: ::: ::::::::::.::::::::::.::::::.:.::::::.:::::::..
CCDS12 HFLTQLHSTFQTPDRLYFVMEYVTGGDLMYHIQQLGKFKEPHAAFYAAEIAIGLFFLHNQ
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460 470 480 490 500 510
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:::::::::::::::.::::::.:::::::... :.::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GIIYRDLKLDNVMLDAEGHIKITDFGMCKENVFPGTTTRTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGK
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:::::..:::::::::::::::::::.::::.:::..:.::::::.:::.::::..::::
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580 590 600 610 620 630
pF1KB6 AKRLGCGPEGERDVREHAFFRRIDWEKLENREIQPPFKPKVCGKGAENFDKFFTRGQPVL
.:::: ::.:: .: :.::: ::::.:: :: :::.:. ::...:::::::::. :.:
CCDS12 GKRLGSGPDGEPTIRAHGFFRWIDWERLERLEIPPPFRPRPCGRSGENFDKFFTRAAPAL
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pF1KB6 TPPDQLVIANIDQSDFEGFSYVNPQFVHPILQSAV
::::.::.:.:::.::.::.::::.::::
CCDS12 TPPDRLVLASIDQADFQGFTYVNPDFVHPDARSPTSPVPVPVM
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10 20 30 40 50
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CCDS18 HCRDFIWGVIGKQGYQCQVCTCVVHKRCHELIITKCAGLKKQETPDQVGSQRFSVNMPHK
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. .:: : :: :. .. : .... : : .. .::
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230 240 250 260 270 280
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. . ::..:: :. :. . :.. .:::
CCDS18 ASGSS----PSEEDRSKSAPTSPCDQEIKELENNIRKALSF-------------------
340 350 360
290 300 310 320 330 340
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CCDS18 -------------DNRGEEH------RAASSPDG-QLMSPGENGEVRQGQAKRLGLDEFN
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350 360 370 380 390 400
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410 420 430 440 450 460
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:::. :::: :::.::::::::::::..::. :: ::.. :::::.. .:.:::..:.:
CCDS18 TQLYCCFQTKDRLFFVMEYVNGGDLMFQIQRSRKFDEPRSRFYAAEVTSALMFLHQHGVI
470 480 490 500 510 520
470 480 490 500 510 520
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530 540 550 560 570 580
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::: :::.:::.::::::....::.::.::.. .: :: :::::::: :..:::.: ::
CCDS18 WWALGVLMYEMMAGQPPFEADNEDDLFESILHDDVLYPVWLSKEAVSILKAFMTKNPHKR
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590 600 610 620 630
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CCDS18 LGCVASQNGEDAIKQHPFFKEIDWVLLEQKKIKPPFKPRIKTKRDVNNFDQDFTREEPVL
650 660 670 680 690 700
640 650 660 670
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CCDS18 TLVDEAIVKQINQEEFKGFSYFGEDLMP
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10 20 30
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CCDS97 TGASDTFEGWVDLEPEGKVFVVITLTGSFTEATLQRDRIFKHFTRKRQRAMRRR-VHQIN
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CCDS97 GHKFMATYLRQPTYCSHCREFIWGVFGKQGYQCQVCTCVVHKRCHHLIVTACTCQNNINK
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.:. .. :::.::.: :::::::::::.:...::..: : :::: .: :
CCDS97 VDSKIAEQRFGINIPHKFSIHNYKVPTFCDHCGSLLWGIMRQGLQCKICKMNVHIRCQAN
240 250 260 270 280 290
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CCDS97 VAPNCGVNAVEL---------------------AKTLAGM---GLQ-----------PGN
300 310
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pF1KB6 ESKQKTKTIRSTLNPQWNESFTFKLKPSDKDRRLSVEIWDWDRTTRNDFMGSLSFGVSEL
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CCDS97 ISPTSKLVSRSTLRRQGKES----------------------------------------
320 330
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pF1KB6 MKMPASGWYKLLNQEEGEYYNVPIPEGDEEGNMELRQKFEKAKLGPAGNKVISPSEDRKQ
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CCDS97 ---------------------------SKEGN---------------GIGV---------
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:. .:. . .:.:. ::::::::::::: : : .:::.:.:::::..:::::::::.
CCDS97 --NSSNRLGIDNFEFIRVLGKGSFGKVMLARVKETGDLYAVKVLKKDVILQDDDVECTMT
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CCDS97 EKRILSLARNHPFLTQLFCCFQTPDRLFFVMEFVNGGDLMFHIQKSRRFDEARARFYAAE
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: .:.::: .::::::::::::.:: ::: :.:::::::: . .:::: ::::::::::
CCDS97 IISALMFLHDKGIIYRDLKLDNVLLDHEGHCKLADFGMCKEGICNGVTTATFCGTPDYIA
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CCDS97 PEILQEMLYGPAVDWWAMGVLLYEMLCGHAPFEAENEDDLFEAILNDEVVYPTWLHEDAT
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CCDS97 GILKSFMTKNPTMRLGSLTQGGEHAILRHPFFKEIDWAQLNHRQIEPPFRPRIKSREDVS
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CCDS97 NFDPDFIKEEPVLTPIDEGHLPMINQDEFRNFSYVSPELQP
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CCDS60 MDTKDMNEFETEGFFALHQRRGAIKQAKVHHVKCHEFTATFFPQPTFCSVCHEFVWGL
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CCDS60 NKQGYQCRQCNAAIHKKCIDKVIAKCTGSAINSRETMFHKERFKIDMPHRFKVYNYKSPT
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CCDS60 FCEHCGTLLWGLARQGLKCDACGMNVHHRCQTKVANLCGINQK-------LMAEA-----
120 130 140 150 160
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CCDS60 ------------------------LAMI-----ESTQQARCLRDTEQ-------IFREGP
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::: . .:. .. .:. : . .: .. :. :
CCDS60 --------VEI-GLPCSIKNE---------ARPPCLPTPGKR----EPQGISWESPLDEV
200 210 220
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CCDS60 DKMCHL------------PE------PELNKERPSLQI-KLKIEDFILHKMLGKGSFGKV
230 240 250 260
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pF1KB6 MLADRKGTEELYAIKILKKDVVIQDDDVECTMVEKRVLALLDKPPFLTQLHSCFQTVDRL
.::. : :....::: ::::::..::::::::::::::.: . ::::.. ::: . :
CCDS60 FLAEFKKTNQFFAIKALKKDVVLMDDDVECTMVEKRVLSLAWEHPFLTHMFCTFQTKENL
270 280 290 300 310 320
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pF1KB6 YFVMEYVNGGDLMYHIQQVGKFKEPQAVFYAAEISIGLFFLHKRGIIYRDLKLDNVMLDS
.:::::.::::::::::. :: .:.:::::: .:: :::..::.::::::::..::.
CCDS60 FFVMEYLNGGDLMYHIQSCHKFDLSRATFYAAEIILGLQFLHSKGIVYRDLKLDNILLDK
330 340 350 360 370 380
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pF1KB6 EGHIKIADFGMCKEHMMDGVTTRTFCGTPDYIAPEIIAYQPYGKSVDWWAYGVLLYEMLA
.:::::::::::::.:. . : :::::::::::::. : :..:::::..::::::::
CCDS60 DGHIKIADFGMCKENMLGDAKTNTFCGTPDYIAPEILLGQKYNHSVDWWSFGVLLYEMLI
390 400 410 420 430 440
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pF1KB6 GQPPFDGEDEDELFQSIMEHNVSYPKSLSKEAVSICKGLMTKHPAKRLGCGPEGERDVRE
:: :: :.::.:::.:: : ::. : ::: .. :....: :::: .: :.:.
CCDS60 GQSPFHGQDEEELFHSIRMDNPFYPRWLEKEAKDLLVKLFVREPEKRLGV--RG--DIRQ
450 460 470 480 490 500
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pF1KB6 HAFFRRIDWEKLENREIQPPFKPKVCGK-GAENFDKFFTRGQPVLTPPDQLVIANIDQSD
: .::.:.::.:: .::.:::.::: . :::: : .: :. :. .: ..::.
CCDS60 HPLFREINWEELERKEIDPPFRPKVKSPFDCSNFDKEFLNEKPRLSFADRALINSMDQNM
510 520 530 540 550 560
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pF1KB6 FEGFSYVNPQFVHPILQSAV
:..::..::
CCDS60 FRNFSFMNPGMERLIS
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pF1KB6 MADVFPGNDSTASQDVANRFARKGALRQKNVHEVKDHKFIARFFKQPTFCS
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CCDS70 MLMNARYFLEMSDTKDMNEFETEGFFALHQRRGAIKQAKVHHVKCHEFTATFFPQPTFCS
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: .:.::..:::.::. : ..::.: . : .: : : .. .: : : :.:
CCDS70 VCHEFVWGLNKQGYQCRQCNAAIHKKCIDKVIAKCTGSAINSRETMFHKERFKIDMPHRF
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pF1KB6 KIHTYGSPTFCDHCGSLLYGLIHQGMKCDTCDMNVHKQCVINVPSLCGMDHTEKRGRIYL
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CCDS70 KVYNYKSPTFCEHCGTLLWGLARQGLKCDACGMNVHHRCQTKVANLCGINQK-------L
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CCDS70 MAEA-----------------------------LAMI-----ESTQQARCLRDTEQ----
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:. : ::: . .:. .. .:. : . .:
CCDS70 ---IFREGP--------VEI-GLPCSIKNE---------ARPPCLPTPGKR----EPQGI
310 320 330 340
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.. :. : :. .. : : ....:: .. ..:. :: . .
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CCDS70 LINSMDQNMFRNFSFMNPGMERLIS
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CCDS28 FLNEKARLSYSDKNLIDSMDQSAFAGFSFVNPKFEHLLED
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]