Result of FASTA (ccds) for pF1KB6229
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6229, 673 aa
  1>>>pF1KB6229 673 - 673 aa - 673 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.8788+/-0.00118; mu= -0.4259+/- 0.070
 mean_var=280.0749+/-59.544, 0's: 0 Z-trim(112.8): 928  B-trim: 585 in 1/51
 Lambda= 0.076637
 statistics sampled from 12425 (13468) to 12425 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.737), E-opt: 0.2 (0.414), width:  16
 Scan time:  4.410

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS8367.1 ZBTB16 gene_id:7704|Hs108|chr11         ( 673) 4592 521.5 1.5e-147
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12         ( 738)  823 104.9 4.4e-22
CCDS77368.1 ZNF773 gene_id:374928|Hs108|chr19      ( 441)  785 100.5 5.5e-21
CCDS33134.1 ZNF773 gene_id:374928|Hs108|chr19      ( 442)  785 100.5 5.5e-21
CCDS47539.1 ZNF12 gene_id:7559|Hs108|chr7          ( 659)  784 100.5   8e-21
CCDS47538.1 ZNF12 gene_id:7559|Hs108|chr7          ( 697)  784 100.5 8.4e-21
CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9       ( 699)  780 100.1 1.1e-20
CCDS5951.2 ZNF596 gene_id:169270|Hs108|chr8        ( 504)  773 99.2 1.5e-20
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1          ( 470)  771 98.9 1.7e-20
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19     ( 714)  771 99.1 2.3e-20
CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19     ( 769)  771 99.1 2.4e-20
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5           ( 461)  765 98.3 2.6e-20
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19       ( 488)  765 98.3 2.7e-20
CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19      ( 769)  766 98.6 3.6e-20
CCDS74348.1 ZNF461 gene_id:92283|Hs108|chr19       ( 540)  760 97.8 4.3e-20
CCDS35106.1 ZNF483 gene_id:158399|Hs108|chr9       ( 744)  763 98.2 4.4e-20
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19        ( 620)  761 97.9 4.5e-20
CCDS54257.1 ZNF461 gene_id:92283|Hs108|chr19       ( 563)  760 97.8 4.5e-20
CCDS43307.1 PRDM9 gene_id:56979|Hs108|chr5         ( 894)  764 98.4 4.7e-20
CCDS2716.1 ZNF660 gene_id:285349|Hs108|chr3        ( 331)  753 96.8 5.1e-20
CCDS12213.1 ZNF266 gene_id:10781|Hs108|chr19       ( 549)  755 97.2 6.5e-20
CCDS46211.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19       ( 464)  753 97.0 6.6e-20
CCDS4645.1 ZKSCAN8 gene_id:7745|Hs108|chr6         ( 578)  755 97.3 6.7e-20
CCDS42637.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19       ( 478)  753 97.0 6.8e-20
CCDS82388.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19      ( 808)  758 97.7 6.9e-20
CCDS54328.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19       ( 497)  753 97.0   7e-20
CCDS54327.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19       ( 498)  753 97.0   7e-20
CCDS54326.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19       ( 510)  753 97.0 7.1e-20
CCDS54325.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19       ( 511)  753 97.0 7.1e-20
CCDS4441.1 ZNF454 gene_id:285676|Hs108|chr5        ( 522)  753 97.0 7.2e-20
CCDS46161.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19      ( 924)  758 97.7 7.6e-20
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19        ( 706)  755 97.3 7.8e-20
CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19      ( 536)  751 96.8 8.6e-20
CCDS12491.1 ZNF565 gene_id:147929|Hs108|chr19      ( 499)  750 96.6 8.8e-20
CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19      ( 592)  751 96.8 9.3e-20
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19      ( 475)  748 96.4 9.9e-20
CCDS74388.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19        ( 748)  751 96.9 1.1e-19
CCDS12636.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19        ( 799)  751 96.9 1.2e-19
CCDS62706.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19        ( 819)  751 96.9 1.2e-19
CCDS42574.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19        ( 825)  751 96.9 1.2e-19
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5       ( 563)  747 96.4 1.2e-19
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3         ( 544)  746 96.2 1.3e-19
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19       ( 782)  749 96.7 1.3e-19
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19      ( 527)  745 96.1 1.3e-19
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19       ( 818)  749 96.7 1.4e-19
CCDS10701.1 ZNF668 gene_id:79759|Hs108|chr16       ( 619)  744 96.1 1.6e-19
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19      ( 686)  745 96.2 1.6e-19
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19      ( 580)  743 95.9 1.7e-19
CCDS54003.1 ZNF668 gene_id:79759|Hs108|chr16       ( 642)  744 96.1 1.7e-19
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16         ( 585)  743 95.9 1.7e-19


>>CCDS8367.1 ZBTB16 gene_id:7704|Hs108|chr11              (673 aa)
 initn: 4592 init1: 4592 opt: 4592  Z-score: 2762.6  bits: 521.5 E(32554): 1.5e-147
Smith-Waterman score: 4592; 100.0% identity (100.0% similar) in 673 aa overlap (1-673:1-673)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MDLTKMGMIQLQNPSHPTGLLCKANQMRLAGTLCDVVIMVDSQEFHAHRTVLACTSKMFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MDLTKMGMIQLQNPSHPTGLLCKANQMRLAGTLCDVVIMVDSQEFHAHRTVLACTSKMFE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 ILFHRNSQHYTLDFLSPKTFQQILEYAYTATLQAKAEDLDDLLYAAEILEIEYLEEQCLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 ILFHRNSQHYTLDFLSPKTFQQILEYAYTATLQAKAEDLDDLLYAAEILEIEYLEEQCLK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 MLETIQASDDNDTEATMADGGAEEEEDRKARYLKNIFISKHSSEESGYASVAGQSLPGPM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MLETIQASDDNDTEATMADGGAEEEEDRKARYLKNIFISKHSSEESGYASVAGQSLPGPM
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 VDQSPSVSTSFGLSAMSPTKAAVDSLMTIGQSLLQGTLQPPAGPEEPTLAGGGRHPGVAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 VDQSPSVSTSFGLSAMSPTKAAVDSLMTIGQSLLQGTLQPPAGPEEPTLAGGGRHPGVAE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 VKTEMMQVDEVPSQDSPGAAESSISGGMGDKVEERGKEGPGTPTRSSVITSARELHYGRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 VKTEMMQVDEVPSQDSPGAAESSISGGMGDKVEERGKEGPGTPTRSSVITSARELHYGRE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 ESAEQVPPPAEAGQAPTGRPEHPAPPPEKHLGIYSVLPNHKADAVLSMPSSVTSGLHVQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 ESAEQVPPPAEAGQAPTGRPEHPAPPPEKHLGIYSVLPNHKADAVLSMPSSVTSGLHVQP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 ALAVSMDFSTYGGLLPQGFIQRELFSKLGELAVGMKSESRTIGEQCSVCGVELPDNEAVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 ALAVSMDFSTYGGLLPQGFIQRELFSKLGELAVGMKSESRTIGEQCSVCGVELPDNEAVE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 QHRKLHSGMKTYGCELCGKRFLDSLRLRMHLLAHSAGAKAFVCDQCGAQFSKEDALETHR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 QHRKLHSGMKTYGCELCGKRFLDSLRLRMHLLAHSAGAKAFVCDQCGAQFSKEDALETHR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB6 QTHTGTDMAVFCLLCGKRFQAQSALQQHMEVHAGVRSYICSECNRTFPSHTALKRHLRSH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 QTHTGTDMAVFCLLCGKRFQAQSALQQHMEVHAGVRSYICSECNRTFPSHTALKRHLRSH
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB6 TGDHPYECEFCGSCFRDESTLKSHKRIHTGEKPYECNGCGKKFSLKHQLETHYRVHTGEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 TGDHPYECEFCGSCFRDESTLKSHKRIHTGEKPYECNGCGKKFSLKHQLETHYRVHTGEK
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB6 PFECKLCHQRSRDYSAMIKHLRTHNGASPYQCTICTEYCPSLSSMQKHMKGHKPEEIPPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 PFECKLCHQRSRDYSAMIKHLRTHNGASPYQCTICTEYCPSLSSMQKHMKGHKPEEIPPD
              610       620       630       640       650       660

              670   
pF1KB6 WRIEKTYLYLCYV
       :::::::::::::
CCDS83 WRIEKTYLYLCYV
              670   

>>CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12              (738 aa)
 initn: 957 init1: 577 opt: 823  Z-score: 509.9  bits: 104.9 E(32554): 4.4e-22
Smith-Waterman score: 823; 40.8% identity (67.3% similar) in 294 aa overlap (370-656:368-656)

     340       350       360       370       380        390        
pF1KB6 HKADAVLSMPSSVTSGLHVQPALAVSMDFSTYGGLLPQGFIQ-RELFSKLGELAVGMKSE
                                     :. :  : :  . :. : . .::   .. .
CCDS31 QRIHTGEKPFECRECGKAFSRKSQLVTHHRTHTGTKPFGCSDCRKAFFEKSEL---IRHQ
       340       350       360       370       380       390       

      400          410       420       430       440       450     
pF1KB6 SRTIGEQ---CSVCGVELPDNEAVEQHRKLHSGMKTYGCELCGKRFLDSLRLRMHLLAHS
       .   ::.   :: :   . .  .. .:.. :.: : .::  ::: : .. .:  : ..:.
CCDS31 TIHTGEKPYECSECRKAFRERSSLINHQRTHTGEKPHGCIQCGKAFSQKSHLISHQMTHT
          400       410       420       430       440       450    

         460       470       480       490       500       510     
pF1KB6 AGAKAFVCDQCGAQFSKEDALETHRQTHTGTDMAVFCLLCGKRFQAQSALQQHMEVHAGV
        : : :.:..::  ::... :  :..:::: .    :  ::: :. . .: .:...:.: 
CCDS31 -GEKPFICSKCGKAFSRKSQLVRHQRTHTG-EKPYECSECGKAFSEKLSLTNHQRIHTGE
           460       470       480        490       500       510  

         520       530       540       550       560       570     
pF1KB6 RSYICSECNRTFPSHTALKRHLRSHTGDHPYECEFCGSCFRDESTLKSHKRIHTGEKPYE
       . :.::::...: ... :  : :.:::..::::  ::. : ..:.: .:.: ::::::::
CCDS31 KPYVCSECGKAFCQKSHLISHQRTHTGEKPYECSECGKAFGEKSSLATHQRTHTGEKPYE
            520       530       540       550       560       570  

         580       590       600       610       620       630     
pF1KB6 CNGCGKKFSLKHQLETHYRVHTGEKPFECKLCHQRSRDYSAMIKHLRTHNGASPYQCTIC
       :  : : :: : ::.:: :.::::::.::.::..   . : .:.:::::.: .::.:. :
CCDS31 CRDCEKAFSQKSQLNTHQRIHTGEKPYECSLCRKAFFEKSELIRHLRTHTGEKPYECNEC
            580       590       600       610       620       630  

         640       650          660       670                      
pF1KB6 TEYCPSLSSMQKHMK---GHKPEEIPPDWRIEKTYLYLCYV                   
        .     ::. .:..   :.:: :                                    
CCDS31 RKAFREKSSLINHQRIHTGEKPFECSECGKAFSRKSHLIPHQRTHTGEKPYGCSECRKAF
            640       650       660       670       680       690  

>--
 initn: 940 init1: 446 opt: 550  Z-score: 346.8  bits: 74.7 E(32554): 5.4e-13
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      400       410       420       430       440       450        
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CCDS31 KGDYGKAESDDFNVFDNFFLHSKPEDTDTWLKYYDCD----KYKESYKKSQIIIYHRNRL
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       : : . :..:  .:::. .:  :.. :   :.:  :  ::: :  .: .  : ..:.: .
CCDS31 GEKLYECSECRKRFSKKPSLIKHQSRHI-RDIAFGCGNCGKTFPQKSQFITHHRTHTGEK
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        : ::.:...: ... :  : :.:::..::::  ::. :  .: : :: : ::::::: :
CCDS31 PYNCSQCGKAFSQKSQLTSHQRTHTGEKPYECGECGKAFSRKSHLISHWRTHTGEKPYGC
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       : ::. :: : .: .: :.:::::::::. : .     : .. : :              
CCDS31 NECGRAFSEKSNLINHQRIHTGEKPFECRECGKAFSRKSQLVTHHRTHTGTKPFGCSDCR
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CCDS31 KAFFEKSELIRHQTIHTGEKPYECSECRKAFRERSSLINHQRTHTGEKPHGCIQCGKAFS
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>>CCDS77368.1 ZNF773 gene_id:374928|Hs108|chr19           (441 aa)
 initn: 3074 init1: 577 opt: 785  Z-score: 490.3  bits: 100.5 E(32554): 5.5e-21
Smith-Waterman score: 785; 42.2% identity (68.1% similar) in 251 aa overlap (405-655:191-439)

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CCDS77 VLKHQVTHTGEKSHRSSKSREAFHAGKRHYKCSECGKAFGQKYLLVQHQRLHTGEKPYEC
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         ::: :  .  : .: ..:. : . . :..:: .::..  :  :...::: .    :  
CCDS77 SECGKLFSHKSNLFIHQIVHT-GERPYGCSDCGKSFSRNADLIQHQRVHTG-EKPFTCSE
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pF1KB6 CGKRFQAQSALQQHMEVHAGVRSYICSECNRTFPSHTALKRHLRSHTGDHPYECEFCGSC
       ::: :. .:.: :: ..:.::: : ::::.. :  ...: .: : :::..::.:  ::. 
CCDS77 CGKAFRHNSTLVQHHRIHTGVRPYECSECGKLFSFNSSLMKHQRVHTGERPYKCSECGKF
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       .  .:.: .: :.::::.::::. ::: :: . .:  : .::::::::.:. : .   . 
CCDS77 YSHKSSLINHWRVHTGERPYECSECGKFFSQSSSLMQHRKVHTGEKPFKCNECGRFFSEN
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       :...:: :.:.::.::.:  : ..    ::. :: . :  :                  
CCDS77 SSLVKHQRVHTGAKPYECRECGKFFRHSSSLVKHRRIHTGEIQ                
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>>CCDS33134.1 ZNF773 gene_id:374928|Hs108|chr19           (442 aa)
 initn: 3074 init1: 577 opt: 785  Z-score: 490.2  bits: 100.5 E(32554): 5.5e-21
Smith-Waterman score: 785; 42.2% identity (68.1% similar) in 251 aa overlap (405-655:192-440)

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CCDS33 VLKHQVTHTGEKSHRSSKSREAFHAGKRHYKCSECGKAFGQKYLLVQHQRLHTGEKPYEC
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pF1KB6 ELCGKRFLDSLRLRMHLLAHSAGAKAFVCDQCGAQFSKEDALETHRQTHTGTDMAVFCLL
         ::: :  .  : .: ..:. : . . :..:: .::..  :  :...::: .    :  
CCDS33 SECGKLFSHKSNLFIHQIVHT-GERPYGCSDCGKSFSRNADLIQHQRVHTG-EKPFTCSE
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pF1KB6 CGKRFQAQSALQQHMEVHAGVRSYICSECNRTFPSHTALKRHLRSHTGDHPYECEFCGSC
       ::: :. .:.: :: ..:.::: : ::::.. :  ...: .: : :::..::.:  ::. 
CCDS33 CGKAFRHNSTLVQHHRIHTGVRPYECSECGKLFSFNSSLMKHQRVHTGERPYKCSECGKF
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pF1KB6 FRDESTLKSHKRIHTGEKPYECNGCGKKFSLKHQLETHYRVHTGEKPFECKLCHQRSRDY
       .  .:.: .: :.::::.::::. ::: :: . .:  : .::::::::.:. : .   . 
CCDS33 YSHKSSLINHWRVHTGERPYECSECGKFFSQSSSLMQHRKVHTGEKPFKCNECGRFFSEN
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CCDS33 SSLVKHQRVHTGAKPYECRECGKFFRHSSSLVKHRRIHTGEIQ                
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>>CCDS47539.1 ZNF12 gene_id:7559|Hs108|chr7               (659 aa)
 initn: 1870 init1: 573 opt: 784  Z-score: 487.3  bits: 100.5 E(32554): 8e-21
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CCDS47 KSFCKKSKFIIHQRTHTGEKPYECNQCGKSFCQKGTLTVHQRTHTGEKPYECNECGKNFY
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pF1KB6 DNEAVEQHRKLHSGMKTYGCELCGKRFLDSLRLRMHLLAHSAGAKAFVCDQCGAQFSKED
       ..  . ::.. ::: : : :  ::: : .. .: .:  .:: : . .:: .::  ::...
CCDS47 QKLHLIQHQRTHSGEKPYECSYCGKSFCQKTHLTQHQRTHS-GERPYVCHDCGKTFSQKS
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pF1KB6 ALETHRQTHTGTDMAVFCLLCGKRFQAQSALQQHMEVHAGVRSYICSECNRTFPSHTALK
       ::. :.. :::. .   :  ::: :  .:.:  :...:.: . : :.::.. :   . : 
CCDS47 ALNDHQKIHTGVKLYK-CSECGKCFCRKSTLTTHLRTHTGEKPYECNECGKFFSRLSYLT
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pF1KB6 RHLRSHTGDHPYECEFCGSCFRDESTLKSHKRIHTGEKPYECNGCGKKFSLKHQLETHYR
        : :.:.:..::::. ::. :  .:.:  :.:.:::::::::: ::: ::    :  :.:
CCDS47 VHYRTHSGEKPYECNECGKTFYLNSALMRHQRVHTGEKPYECNECGKLFSQLSYLTIHHR
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       .:.: ::.::. : .   . ::. .: : :.: .::.: :: ..  ..: .  : .   :
CCDS47 THSGVKPYECSECGKTFYQNSALCRHRRIHKGEKPYECYICGKFFSQMSYLTIHHRIHSG
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       .:: :                                                       
CCDS47 EKPYECSECGKTFCQNSALNRHQRTHTGEKAYECYECGKCFSQMSYLTIHHRIHSGEKPF
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>>CCDS47538.1 ZNF12 gene_id:7559|Hs108|chr7               (697 aa)
 initn: 1870 init1: 573 opt: 784  Z-score: 487.0  bits: 100.5 E(32554): 8.4e-21
Smith-Waterman score: 788; 39.6% identity (65.8% similar) in 275 aa overlap (385-656:306-578)

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pF1KB6 GLHVQPALAVSMDFSTYGGLLPQGFIQRELFSKLGELAVGMKSESRTIGEQCSVCGVELP
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CCDS47 KSFCKKSKFIIHQRTHTGEKPYECNQCGKSFCQKGTLTVHQRTHTGEKPYECNECGKNFY
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pF1KB6 DNEAVEQHRKLHSGMKTYGCELCGKRFLDSLRLRMHLLAHSAGAKAFVCDQCGAQFSKED
       ..  . ::.. ::: : : :  ::: : .. .: .:  .:: : . .:: .::  ::...
CCDS47 QKLHLIQHQRTHSGEKPYECSYCGKSFCQKTHLTQHQRTHS-GERPYVCHDCGKTFSQKS
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pF1KB6 ALETHRQTHTGTDMAVFCLLCGKRFQAQSALQQHMEVHAGVRSYICSECNRTFPSHTALK
       ::. :.. :::. .   :  ::: :  .:.:  :...:.: . : :.::.. :   . : 
CCDS47 ALNDHQKIHTGVKLYK-CSECGKCFCRKSTLTTHLRTHTGEKPYECNECGKFFSRLSYLT
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pF1KB6 RHLRSHTGDHPYECEFCGSCFRDESTLKSHKRIHTGEKPYECNGCGKKFSLKHQLETHYR
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CCDS47 VHYRTHSGEKPYECNECGKTFYLNSALMRHQRVHTGEKPYECNECGKLFSQLSYLTIHHR
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pF1KB6 VHTGEKPFECKLCHQRSRDYSAMIKHLRTHNGASPYQCTICTEYCPSLSSMQKHMK---G
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CCDS47 THSGVKPYECSECGKTFYQNSALCRHRRIHKGEKPYECYICGKFFSQMSYLTIHHRIHSG
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CCDS47 EKPYECSECGKTFCQNSALNRHQRTHTGEKAYECYECGKCFSQMSYLTIHHRIHSGEKPF
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>>CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9            (699 aa)
 initn: 575 init1: 575 opt: 780  Z-score: 484.6  bits: 100.1 E(32554): 1.1e-20
Smith-Waterman score: 780; 40.2% identity (69.7% similar) in 261 aa overlap (396-656:386-644)

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pF1KB6 MDFSTYGGLLPQGFIQRELFSKLGELAVGMKSESRTIGEQCSVCGVELPDNEAVEQHRKL
                                     ::..     .:  ::  . ..  ...:.. 
CCDS35 HQKVHIRAKPYEYNECGKSCSMNSHLIWPQKSHTGEKPYECPECGKAFSEKSRLRKHQRT
         360       370       380       390       400       410     

         430       440       450       460       470       480     
pF1KB6 HSGMKTYGCELCGKRFLDSLRLRMHLLAHSAGAKAFVCDQCGAQFSKEDALETHRQTHTG
       :.: : : :. : : :  .  ::.:  .:. : : : : .:: .:. .. : .:..::::
CCDS35 HTGEKPYKCDGCDKAFSAKSGLRIHQRTHT-GEKPFECHECGKSFNYKSILIVHQRTHTG
         420       430       440        450       460       470    

         490       500       510       520       530       540     
pF1KB6 TDMAVFCLLCGKRFQAQSALQQHMEVHAGVRSYICSECNRTFPSHTALKRHLRSHTGDHP
        .    :  ::: :. .:.:..: ..:.: : : :.::...:  ...:..: :.:::..:
CCDS35 -EKPFECNECGKSFSHMSGLRNHRRTHTGERPYKCDECGKAFKLKSGLRKHHRTHTGEKP
           480       490       500       510       520       530   

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pF1KB6 YECEFCGSCFRDESTLKSHKRIHTGEKPYECNGCGKKFSLKHQLETHYRVHTGEKPFECK
       :.:. ::. : ..: :..:.:::::::::.:: ::. :: : .:..:.:.::::::..:.
CCDS35 YKCNQCGKAFGQKSQLRGHHRIHTGEKPYKCNHCGEAFSQKSNLRVHHRTHTGEKPYQCE
           540       550       560       570       580       590   

         610       620       630       640       650       660     
pF1KB6 LCHQRSRDYSAMIKHLRTHNGASPYQCTICTEYCPSLSSMQKHMKGHKPEEIPPDWRIEK
        : .  :. : .  : :::.: .::.:. : .     : ..::.. :  :.         
CCDS35 ECGKTFRQKSNLRGHQRTHTGEKPYECNECGKAFSEKSVLRKHQRTHTGEKPYNCNQCGE
           600       610       620       630       640       650   

         670                                         
pF1KB6 TYLYLCYV                                      
                                                     
CCDS35 AFSQKSNLRVHQRTHTGEKPYKCDKCGRTFSQKSSLREHQKAHPGD
           660       670       680       690         

>>CCDS5951.2 ZNF596 gene_id:169270|Hs108|chr8             (504 aa)
 initn: 2703 init1: 552 opt: 773  Z-score: 482.3  bits: 99.2 E(32554): 1.5e-20
Smith-Waterman score: 773; 41.1% identity (64.3% similar) in 280 aa overlap (385-658:204-478)

          360       370       380       390       400          410 
pF1KB6 GLHVQPALAVSMDFSTYGGLLPQGFIQRELFSKLGELAVGMKSESRTIGEQ---CSVCGV
                                     ::: ..:    . :    ::.   : .:: 
CCDS59 YAFIQNSALRPHSVTHTREITLECRVCGKTFSKNSNLR---RHEMIHTGEKPHGCHLCGK
           180       190       200       210          220       230

             420       430       440       450       460       470 
pF1KB6 ELPDNEAVEQHRKLHSGMKTYGCELCGKRFLDSLRLRMHLLAHSAGAKAFVCDQCGAQFS
        .     ...:.. :.: : :::.:::: :  :  :: : . :.   :: .:  ::  :.
CCDS59 AFTHCSDLRKHERTHTGEKPYGCHLCGKAFSKSSNLRRHEMIHTR-EKAQICHLCGKAFT
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             480       490       500       510       520       530 
pF1KB6 KEDALETHRQTHTGTDMAVFCLLCGKRFQAQSALQQHMEVHAGVRSYICSECNRTFPSHT
       . . :. :..:: : :    :::::: :.  : :.:: ..: : . : :  :...:   .
CCDS59 HCSDLRKHERTHLG-DKPYGCLLCGKAFSKCSYLRQHERTHNGEKPYECHLCGKAFSHCS
     290       300        310       320       330       340        

             540       550       560       570       580       590 
pF1KB6 ALKRHLRSHTGDHPYECEFCGSCFRDESTLKSHKRIHTGEKPYECNGCGKKFSLKHQLET
        :..: :::.:..:. :..::. : . :.:: :.:::::::::::. ::: :. . .:. 
CCDS59 HLRQHERSHNGEKPHGCHLCGKAFTESSVLKRHERIHTGEKPYECHVCGKAFTESSDLRR
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pF1KB6 HYRVHTGEKPFECKLCHQRSRDYSAMIKHLRTHNGASPYQCTICTEYCPSLSSMQKHMK-
       : :.::::::.::.:: .     :.. .: :::.: .::.:.:: .      ... : . 
CCDS59 HERTHTGEKPYECHLCGKAFNHSSVLRRHERTHTGEKPYECNICGKAFNRSYNFRLHRRV
      410       420       430       440       450       460        

                660       670              
pF1KB6 --GHKPEEIPPDWRIEKTYLYLCYV           
         :.::   :                          
CCDS59 HTGEKPYVCPLCGKAFSKFFNLRQHERTHTKKAMNM
      470       480       490       500    

>>CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1               (470 aa)
 initn: 2997 init1: 562 opt: 771  Z-score: 481.5  bits: 98.9 E(32554): 1.7e-20
Smith-Waterman score: 771; 40.4% identity (66.9% similar) in 275 aa overlap (385-656:175-447)

          360       370       380       390       400       410    
pF1KB6 GLHVQPALAVSMDFSTYGGLLPQGFIQRELFSKLGELAVGMKSESRTIGEQCSVCGVELP
                                     ::. ..:   .....     .:. ::  . 
CCDS23 KAFSQISDLNRHQKTHTGDRPYKCYECGKGFSRSSHLIQHQRTHTGERPYDCNECGKSFG
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          420       430       440       450       460       470    
pF1KB6 DNEAVEQHRKLHSGMKTYGCELCGKRFLDSLRLRMHLLAHSAGAKAFVCDQCGAQFSKED
        .  . ::. .:.: : . :. ::: :    .: .:  .:: : : . :..:: .::. .
CCDS23 RSSHLIQHQTIHTGEKPHKCNECGKSFCRLSHLIQHQRTHS-GEKPYECEECGKSFSRSS
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          480       490       500       510       520       530    
pF1KB6 ALETHRQTHTGTDMAVFCLLCGKRFQAQSALQQHMEVHAGVRSYICSECNRTFPSHTALK
        :  :..:::: .    :  ::. :. .: : .:..::.: : : :.::...: ... : 
CCDS23 HLAQHQRTHTG-EKPYECNECGRGFSERSDLIKHYRVHTGERPYKCDECGKNFSQNSDLV
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pF1KB6 RHLRSHTGDHPYECEFCGSCFRDESTLKSHKRIHTGEKPYECNGCGKKFSLKHQLETHYR
       :: :.:::..::.:. ::  :   : : .:.: ::::::::::.:::.:: . .: :: .
CCDS23 RHRRAHTGEKPYHCNECGENFSRISHLVQHQRTHTGEKPYECNACGKSFSRSSHLITHQK
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pF1KB6 VHTGEKPFECKLCHQRSRDYSAMIKHLRTHNGASPYQCTICTEYCPSLSSMQKHMK---G
       .::::::.::. : .   . : .::: :::.: .::.:. : .   . :..  :..   :
CCDS23 IHTGEKPYECNECWRSFGERSDLIKHQRTHTGEKPYECVQCGKGFTQSSNLITHQRVHTG
            390       400       410       420       430       440  

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pF1KB6 HKPEEIPPDWRIEKTYLYLCYV      
       .:: :                       
CCDS23 EKPYECTECEKSFSRSSALIKHKRVHTD
            450       460       470

>>CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19          (714 aa)
 initn: 3281 init1: 563 opt: 771  Z-score: 479.0  bits: 99.1 E(32554): 2.3e-20
Smith-Waterman score: 771; 38.8% identity (67.9% similar) in 268 aa overlap (385-652:448-713)

          360       370       380       390       400       410    
pF1KB6 GLHVQPALAVSMDFSTYGGLLPQGFIQRELFSKLGELAVGMKSESRTIGEQCSVCGVELP
                                     :.. ..: . .. ..     .:..::  . 
CCDS12 KAFTNRSNLITHQKTHTGEKSYICSKCGKAFTQRSDLITHQRIHTGEKPYECNTCGKAFT
       420       430       440       450       460       470       

          420       430       440       450       460       470    
pF1KB6 DNEAVEQHRKLHSGMKTYGCELCGKRFLDSLRLRMHLLAHSAGAKAFVCDQCGAQFSKED
       ..  .. :.:.:.: . : :. ::: : ..  : .:   :. : : .:: .::  : ...
CCDS12 QKSHLNIHQKIHTGERQYECHECGKAFNQKSILIVHQKIHT-GEKPYVCTECGRAFIRKS
       480       490       500       510        520       530      

          480       490       500       510       520       530    
pF1KB6 ALETHRQTHTGTDMAVFCLLCGKRFQAQSALQQHMEVHAGVRSYICSECNRTFPSHTALK
        . ::.. ::: .    :  ::: : ..: :  :. ::.: . :.:.::...: ... :.
CCDS12 NFITHQRIHTG-EKPYECSDCGKSFTSKSQLLVHQPVHTGEKPYVCAECGKAFSGRSNLS
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pF1KB6 RHLRSHTGDHPYECEFCGSCFRDESTLKSHKRIHTGEKPYECNGCGKKFSLKHQLETHYR
       .: ..:::..:: :  ::. ::..: : .:.:::::::::::. :::.:. : ::..: :
CCDS12 KHQKTHTGEKPYICSECGKTFRQKSELITHHRIHTGEKPYECSDCGKSFTKKSQLQVHQR
         600       610       620       630       640       650     

          600       610       620       630       640       650    
pF1KB6 VHTGEKPFECKLCHQRSRDYSAMIKHLRTHNGASPYQCTICTEYCPSLSSMQKHMKGHKP
       .::::::. :  : .   : : . ::  ::.: .::.: :: .   . : .. :...:  
CCDS12 IHTGEKPYVCAECGKAFTDRSNLNKHQTTHTGDKPYKCGICGKGFVQKSVFSVHQSSHA 
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          660       670   
pF1KB6 EEIPPDWRIEKTYLYLCYV

>--
 initn: 2846 init1: 468 opt: 648  Z-score: 405.6  bits: 85.5 E(32554): 2.9e-16
Smith-Waterman score: 648; 36.3% identity (65.7% similar) in 251 aa overlap (385-635:196-444)

          360       370       380       390       400       410    
pF1KB6 GLHVQPALAVSMDFSTYGGLLPQGFIQRELFSKLGELAVGMKSESRTIGEQCSVCGVELP
                                     :.. . : . .: ..   .  :  ::  . 
CCDS12 KGFSYNSDLSIHEKIHTGERHHECTDCGKAFTQKSTLKMHQKIHTGERSYICIECGQAFI
         170       180       190       200       210       220     

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pF1KB6 DNEAVEQHRKLHSGMKTYGCELCGKRFLDSLRLRMHLLAHSAGAKAFVCDQCGAQFSKED
       ..  .  ::..:.: : : :  ::: :... .:..:  .:.  .: ..: . :  ::...
CCDS12 QKTHLIAHRRIHTGEKPYECSNCGKSFISKSQLQVHQRVHTR-VKPYICTEYGKVFSNNS
         230       240       250       260        270       280    

          480       490       500       510       520       530    
pF1KB6 ALETHRQTHTGTDMAVFCLLCGKRFQAQSALQQHMEVHAGVRSYICSECNRTFPSHTALK
        : ::.....  . . .:  ::: :  .: :  :...:.: . : ::.:...: ...:: 
CCDS12 NLVTHKKVQS-REKSSICTECGKAFTYRSELIIHQRIHTGEKPYECSDCGKAFTQKSALT
          290        300       310       320       330       340   

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pF1KB6 RHLRSHTGDHPYECEFCGSCFRDESTLKSHKRIHTGEKPYECNGCGKKFSLKHQLETHYR
        : : :::.. : :  ::  : ... : .:. :::::::..:. ::: :. : ::..: :
CCDS12 VHQRIHTGEKSYICMKCGLAFIQKAHLIAHQIIHTGEKPHKCGHCGKLFTSKSQLHVHKR
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pF1KB6 VHTGEKPFECKLCHQRSRDYSAMIKHLRTHNGASPYQCTICTEYCPSLSSMQKHMKGHKP
       .::::::. :. : .   . : .: : .::.: . : :. :                   
CCDS12 IHTGEKPYMCNKCGKAFTNRSNLITHQKTHTGEKSYICSKCGKAFTQRSDLITHQRIHTG
           410       420       430       440       450       460   

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pF1KB6 EEIPPDWRIEKTYLYLCYV                                         
                                                                   
CCDS12 EKPYECNTCGKAFTQKSHLNIHQKIHTGERQYECHECGKAFNQKSILIVHQKIHTGEKPY
           470       480       490       500       510       520   




673 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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