Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6236
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6236, 676 aa
1>>>pF1KB6236 676 - 676 aa - 676 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2528+/-0.00166; mu= -0.3142+/- 0.096
mean_var=304.2386+/-69.752, 0's: 0 Z-trim(105.2): 731 B-trim: 200 in 1/50
Lambda= 0.073530
statistics sampled from 7473 (8321) to 7473 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.595), E-opt: 0.2 (0.256), width: 16
Scan time: 3.160
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2870.1 PRKCD gene_id:5580|Hs108|chr3 ( 676) 4626 506.0 7.2e-143
CCDS60482.1 PRKCQ gene_id:5588|Hs108|chr10 ( 581) 1718 197.4 4.8e-50
CCDS7079.1 PRKCQ gene_id:5588|Hs108|chr10 ( 706) 1718 197.5 5.4e-50
CCDS9752.1 PRKCH gene_id:5583|Hs108|chr14 ( 683) 1505 174.9 3.4e-43
CCDS55701.1 PRKCQ gene_id:5588|Hs108|chr10 ( 643) 1397 163.4 9.1e-40
CCDS1824.1 PRKCE gene_id:5581|Hs108|chr2 ( 737) 1351 158.6 2.9e-38
CCDS10618.1 PRKCB gene_id:5579|Hs108|chr16 ( 671) 1316 154.8 3.6e-37
CCDS11664.1 PRKCA gene_id:5578|Hs108|chr17 ( 672) 1271 150.1 9.9e-36
CCDS10619.1 PRKCB gene_id:5579|Hs108|chr16 ( 673) 1265 149.4 1.5e-35
CCDS12867.1 PRKCG gene_id:5582|Hs108|chr19 ( 697) 1219 144.6 4.6e-34
CCDS42513.1 PKN1 gene_id:5585|Hs108|chr19 ( 942) 1092 131.2 6.5e-30
CCDS42514.1 PKN1 gene_id:5585|Hs108|chr19 ( 948) 1092 131.2 6.5e-30
CCDS81350.1 PKN2 gene_id:5586|Hs108|chr1 ( 936) 1061 127.9 6.3e-29
CCDS714.1 PKN2 gene_id:5586|Hs108|chr1 ( 984) 1061 128.0 6.5e-29
CCDS6908.1 PKN3 gene_id:29941|Hs108|chr9 ( 889) 1000 121.4 5.4e-27
CCDS31077.1 AKT3 gene_id:10000|Hs108|chr1 ( 479) 991 120.2 6.9e-27
CCDS31076.1 AKT3 gene_id:10000|Hs108|chr1 ( 465) 978 118.8 1.7e-26
CCDS12552.1 AKT2 gene_id:208|Hs108|chr19 ( 481) 970 118.0 3.2e-26
CCDS9994.1 AKT1 gene_id:207|Hs108|chr14 ( 480) 968 117.8 3.7e-26
CCDS55563.1 PRKCZ gene_id:5590|Hs108|chr1 ( 488) 957 116.6 8.5e-26
CCDS37.1 PRKCZ gene_id:5590|Hs108|chr1 ( 592) 957 116.7 9.7e-26
CCDS13321.1 SGK2 gene_id:10110|Hs108|chr20 ( 367) 915 112.0 1.5e-24
CCDS13320.1 SGK2 gene_id:10110|Hs108|chr20 ( 427) 916 112.2 1.6e-24
CCDS3212.2 PRKCI gene_id:5584|Hs108|chr3 ( 596) 902 110.9 5.5e-24
CCDS5170.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 431) 899 110.4 5.5e-24
CCDS47478.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 445) 899 110.4 5.7e-24
CCDS47477.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 459) 899 110.4 5.8e-24
CCDS47476.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 526) 899 110.5 6.3e-24
CCDS6195.1 SGK3 gene_id:23678|Hs108|chr8 ( 496) 884 108.9 1.8e-23
CCDS62271.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 451) 871 107.5 4.5e-23
CCDS62273.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 472) 871 107.5 4.6e-23
CCDS11621.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 525) 871 107.5 5e-23
CCDS83148.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 758) 859 106.4 1.5e-22
CCDS5294.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 733) 856 106.1 1.9e-22
CCDS34570.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 741) 856 106.1 1.9e-22
CCDS30649.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 744) 842 104.6 5.3e-22
CCDS284.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 735) 835 103.9 8.8e-22
CCDS41229.1 PRKCZ gene_id:5590|Hs108|chr1 ( 409) 828 102.8 9.9e-22
CCDS81286.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 719) 832 103.5 1.1e-21
CCDS14197.1 RPS6KA3 gene_id:6197|Hs108|chrX ( 740) 830 103.3 1.3e-21
CCDS41677.1 RPS6KB2 gene_id:6199|Hs108|chr11 ( 482) 822 102.3 1.7e-21
CCDS83480.1 RPS6KA6 gene_id:27330|Hs108|chrX ( 745) 816 101.8 3.6e-21
CCDS14451.1 RPS6KA6 gene_id:27330|Hs108|chrX ( 745) 816 101.8 3.6e-21
CCDS62272.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 502) 795 99.4 1.3e-20
CCDS12305.1 PRKACA gene_id:5566|Hs108|chr19 ( 343) 791 98.8 1.3e-20
CCDS12304.1 PRKACA gene_id:5566|Hs108|chr19 ( 351) 791 98.8 1.4e-20
CCDS72815.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 357) 790 98.8 1.5e-20
CCDS55609.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 358) 789 98.6 1.6e-20
CCDS72813.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 339) 786 98.3 1.9e-20
CCDS691.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 351) 784 98.1 2.3e-20
>>CCDS2870.1 PRKCD gene_id:5580|Hs108|chr3 (676 aa)
initn: 4626 init1: 4626 opt: 4626 Z-score: 2678.4 bits: 506.0 E(32554): 7.2e-143
Smith-Waterman score: 4626; 100.0% identity (100.0% similar) in 676 aa overlap (1-676:1-676)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAPFLRIAFNSYELGSLQAEDEANQPFCAVKMKEALSTERGKTLVQKKPTMYPEWKSTFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 MAPFLRIAFNSYELGSLQAEDEANQPFCAVKMKEALSTERGKTLVQKKPTMYPEWKSTFD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 AHIYEGRVIQIVLMRAAEEPVSEVTVGVSVLAERCKKNNGKAEFWLDLQPQAKVLMSVQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 AHIYEGRVIQIVLMRAAEEPVSEVTVGVSVLAERCKKNNGKAEFWLDLQPQAKVLMSVQY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 FLEDVDCKQSMRSEDEAKFPTMNRRGAIKQAKIHYIKNHEFIATFFGQPTFCSVCKDFVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 FLEDVDCKQSMRSEDEAKFPTMNRRGAIKQAKIHYIKNHEFIATFFGQPTFCSVCKDFVW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 GLNKQGYKCRQCNAAIHKKCIDKIIGRCTGTAANSRDTIFQKERFNIDMPHRFKVHNYMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 GLNKQGYKCRQCNAAIHKKCIDKIIGRCTGTAANSRDTIFQKERFNIDMPHRFKVHNYMS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 PTFCDHCGSLLWGLVKQGLKCEDCGMNVHHKCREKVANLCGINQKLLAEALNQVTQRASR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 PTFCDHCGSLLWGLVKQGLKCEDCGMNVHHKCREKVANLCGINQKLLAEALNQVTQRASR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 RSDSASSEPVGIYQGFEKKTGVAGEDMQDNSGTYGKIWEGSSKCNINNFIFHKVLGKGSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 RSDSASSEPVGIYQGFEKKTGVAGEDMQDNSGTYGKIWEGSSKCNINNFIFHKVLGKGSF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 GKVLLGELKGRGEYFAIKALKKDVVLIDDDVECTMVEKRVLTLAAENPFLTHLICTFQTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 GKVLLGELKGRGEYFAIKALKKDVVLIDDDVECTMVEKRVLTLAAENPFLTHLICTFQTK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 DHLFFVMEFLNGGDLMYHIQDKGRFELYRATFYAAEIMCGLQFLHSKGIIYRDLKLDNVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 DHLFFVMEFLNGGDLMYHIQDKGRFELYRATFYAAEIMCGLQFLHSKGIIYRDLKLDNVL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 LDRDGHIKIADFGMCKENIFGESRASTFCGTPDYIAPEILQGLKYTFSVDWWSFGVLLYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 LDRDGHIKIADFGMCKENIFGESRASTFCGTPDYIAPEILQGLKYTFSVDWWSFGVLLYE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 MLIGQSPFHGDDEDELFESIRVDTPHYPRWITKESKDILEKLFEREPTKRLGVTGNIKIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 MLIGQSPFHGDDEDELFESIRVDTPHYPRWITKESKDILEKLFEREPTKRLGVTGNIKIH
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 PFFKTINWTLLEKRRLEPPFRPKVKSPRDYSNFDQEFLNEKARLSYSDKNLIDSMDQSAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 PFFKTINWTLLEKRRLEPPFRPKVKSPRDYSNFDQEFLNEKARLSYSDKNLIDSMDQSAF
610 620 630 640 650 660
670
pF1KB6 AGFSFVNPKFEHLLED
::::::::::::::::
CCDS28 AGFSFVNPKFEHLLED
670
>>CCDS60482.1 PRKCQ gene_id:5588|Hs108|chr10 (581 aa)
initn: 2757 init1: 1707 opt: 1718 Z-score: 1012.0 bits: 197.4 E(32554): 4.8e-50
Smith-Waterman score: 2599; 65.2% identity (83.4% similar) in 580 aa overlap (125-674:1-580)
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 CKKNNGKAEFWLDLQPQAKVLMSVQYFLEDVDCKQSMRSEDEAKFPTMNRRGAIKQAKIH
.: :. . : :. : .:::::::::.:
CCDS60 MDTKDMNEFETEGFFALHQRRGAIKQAKVH
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 YIKNHEFIATFFGQPTFCSVCKDFVWGLNKQGYKCRQCNAAIHKKCIDKIIGRCTGTAAN
..: ::: :::: ::::::::..::::::::::.:::::::::::::::.:..:::.: :
CCDS60 HVKCHEFTATFFPQPTFCSVCHEFVWGLNKQGYQCRQCNAAIHKKCIDKVIAKCTGSAIN
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 SRDTIFQKERFNIDMPHRFKVHNYMSPTFCDHCGSLLWGLVKQGLKCEDCGMNVHHKCRE
::.:.:.::::.:::::::::.:: :::::.:::.:::::..:::::. :::::::.:.
CCDS60 SRETMFHKERFKIDMPHRFKVYNYKSPTFCEHCGTLLWGLARQGLKCDACGMNVHHRCQT
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310
pF1KB6 KVANLCGINQKLLAEALNQV--TQRAS--RRSDSASSE-PVGI----------------Y
::::::::::::.:::: .. ::.: : ... : :: :
CCDS60 KVANLCGINQKLMAEALAMIESTQQARCLRDTEQIFREGPVEIGLPCSIKNEARPPCLPT
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360
pF1KB6 QGFEKKTGVAGEDMQDNSGTYGKIWEG---------SSKCNINNFIFHKVLGKGSFGKVL
: .. :.. :. :. . .. : . : .:..::.::.:::::::::.
CCDS60 PGKREPQGISWESPLDEVDKMCHLPEPELNKERPSLQIKLKIEDFILHKMLGKGSFGKVF
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 LGELKGRGEYFAIKALKKDVVLIDDDVECTMVEKRVLTLAAENPFLTHLICTFQTKDHLF
:.:.: ...::::::::::::.::::::::::::::.:: :.:::::..::::::..::
CCDS60 LAEFKKTNQFFAIKALKKDVVLMDDDVECTMVEKRVLSLAWEHPFLTHMFCTFQTKENLF
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 FVMEFLNGGDLMYHIQDKGRFELYRATFYAAEIMCGLQFLHSKGIIYRDLKLDNVLLDRD
::::.:::::::::::. .:.: :::::::::. ::::::::::.::::::::.:::.:
CCDS60 FVMEYLNGGDLMYHIQSCHKFDLSRATFYAAEIILGLQFLHSKGIVYRDLKLDNILLDKD
340 350 360 370 380 390
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 GHIKIADFGMCKENIFGESRASTFCGTPDYIAPEILQGLKYTFSVDWWSFGVLLYEMLIG
::::::::::::::..:.....:::::::::::::: : ::. :::::::::::::::::
CCDS60 GHIKIADFGMCKENMLGDAKTNTFCGTPDYIAPEILLGQKYNHSVDWWSFGVLLYEMLIG
400 410 420 430 440 450
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 QSPFHGDDEDELFESIRVDTPHYPRWITKESKDILEKLFEREPTKRLGVTGNIKIHPFFK
::::::.::.:::.:::.:.: ::::. ::.::.: ::: ::: ::::: :.:. ::.:.
CCDS60 QSPFHGQDEEELFHSIRMDNPFYPRWLEKEAKDLLVKLFVREPEKRLGVRGDIRQHPLFR
460 470 480 490 500 510
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 TINWTLLEKRRLEPPFRPKVKSPRDYSNFDQEFLNEKARLSYSDKNLIDSMDQSAFAGFS
::: ::.....:::::::::: : ::::.:::::: :::..:. ::.::::. : .::
CCDS60 EINWEELERKEIDPPFRPKVKSPFDCSNFDKEFLNEKPRLSFADRALINSMDQNMFRNFS
520 530 540 550 560 570
670
pF1KB6 FVNPKFEHLLED
:.:: .:.:.
CCDS60 FMNPGMERLIS
580
>>CCDS7079.1 PRKCQ gene_id:5588|Hs108|chr10 (706 aa)
initn: 3221 init1: 1707 opt: 1718 Z-score: 1011.0 bits: 197.5 E(32554): 5.4e-50
Smith-Waterman score: 3055; 63.0% identity (82.8% similar) in 705 aa overlap (1-674:1-705)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MAPFLRIAFNSYELGSLQA-EDEANQPFCAVKMKEALSTERGKTLVQKKPTMYPEWKSTF
:.:::::...... :: :. . :: .:.::: .:: . .: :. .:::::::: : :::
CCDS70 MSPFLRIGLSNFDCGSCQSCQGEAVNPYCAVLVKEYVESENGQMYIQKKPTMYPPWDSTF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 DAHIYEGRVIQIVLMRAAEEPVSEVTVGVSVLAERCKKNNGKAEFWLDLQPQAKVLMSVQ
:::: .:::.::.. . .::.:: . :::::.:::::.:.::.:.::...::...
CCDS70 DAHINKGRVMQIIVKGKNVDLISETTVELYSLAERCRKNNGKTEIWLELKPQGRMLMNAR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 YFLEDVDCKQSMRSEDEAKFPTMNRRGAIKQAKIHYIKNHEFIATFFGQPTFCSVCKDFV
:::: : :. . : :. : .:::::::::.:..: ::: :::: ::::::::..::
CCDS70 YFLEMSDTKDMNEFETEGFFALHQRRGAIKQAKVHHVKCHEFTATFFPQPTFCSVCHEFV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 WGLNKQGYKCRQCNAAIHKKCIDKIIGRCTGTAANSRDTIFQKERFNIDMPHRFKVHNYM
::::::::.:::::::::::::::.:..:::.: :::.:.:.::::.:::::::::.::
CCDS70 WGLNKQGYQCRQCNAAIHKKCIDKVIAKCTGSAINSRETMFHKERFKIDMPHRFKVYNYK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 SPTFCDHCGSLLWGLVKQGLKCEDCGMNVHHKCREKVANLCGINQKLLAEALNQV--TQR
:::::.:::.:::::..:::::. :::::::.:. ::::::::::::.:::: .. ::.
CCDS70 SPTFCEHCGTLLWGLARQGLKCDACGMNVHHRCQTKVANLCGINQKLMAEALAMIESTQQ
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330
pF1KB6 AS--RRSDSASSE-PVGI----------------YQGFEKKTGVAGEDMQDNSGTYGKIW
: : ... : :: : : .. :.. :. :. . ..
CCDS70 ARCLRDTEQIFREGPVEIGLPCSIKNEARPPCLPTPGKREPQGISWESPLDEVDKMCHLP
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380
pF1KB6 EG---------SSKCNINNFIFHKVLGKGSFGKVLLGELKGRGEYFAIKALKKDVVLIDD
: . : .:..::.::.:::::::::.:.:.: ...::::::::::::.::
CCDS70 EPELNKERPSLQIKLKIEDFILHKMLGKGSFGKVFLAEFKKTNQFFAIKALKKDVVLMDD
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KB6 DVECTMVEKRVLTLAAENPFLTHLICTFQTKDHLFFVMEFLNGGDLMYHIQDKGRFELYR
::::::::::::.:: :.:::::..::::::..::::::.:::::::::::. .:.: :
CCDS70 DVECTMVEKRVLSLAWEHPFLTHMFCTFQTKENLFFVMEYLNGGDLMYHIQSCHKFDLSR
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KB6 ATFYAAEIMCGLQFLHSKGIIYRDLKLDNVLLDRDGHIKIADFGMCKENIFGESRASTFC
::::::::. ::::::::::.::::::::.:::.:::::::::::::::..:.....:::
CCDS70 ATFYAAEIILGLQFLHSKGIVYRDLKLDNILLDKDGHIKIADFGMCKENMLGDAKTNTFC
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KB6 GTPDYIAPEILQGLKYTFSVDWWSFGVLLYEMLIGQSPFHGDDEDELFESIRVDTPHYPR
::::::::::: : ::. :::::::::::::::::::::::.::.:::.:::.:.: :::
CCDS70 GTPDYIAPEILLGQKYNHSVDWWSFGVLLYEMLIGQSPFHGQDEEELFHSIRMDNPFYPR
550 560 570 580 590 600
570 580 590 600 610 620
pF1KB6 WITKESKDILEKLFEREPTKRLGVTGNIKIHPFFKTINWTLLEKRRLEPPFRPKVKSPRD
:. ::.::.: ::: ::: ::::: :.:. ::.:. ::: ::.....:::::::::: :
CCDS70 WLEKEAKDLLVKLFVREPEKRLGVRGDIRQHPLFREINWEELERKEIDPPFRPKVKSPFD
610 620 630 640 650 660
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CCDS97 EFRNFSYVSPELQP
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CCDS55 CSNFDKEFLNEKPRLSFADRALINSMDQNMFRNFSFMNPGMERLIS
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CCDS18 EEFKGFSYFGEDLMP
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CCDS10 KTIKCSLNPEWNETFRFQLKESDKDRRLSVEIWDWDLTSRNDFMGSLSFGISE--LQKAS
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CCDS10 VDGWFKLLSQEEGEYFNVPVPPEGSEANEELRQKFERAKISQGTKVPEEKTTNTVSKFDN
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CCDS10 NGNRDRMKLTDFNFLMVLGKGSFGKVMLSERKGTDELYAVKILKKDVVIQDDDVECTMVE
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CCDS10 KRVLALPGKPPFLTQLHSCFQTMDRLYFVMEYVNGGDLMYHIQQVGRFKEPHAVFYAAEI
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CCDS10 AIGLFFLQSKGIIYRDLKLDNVMLDSEGHIKIADFGMCKENIWDGVTTKTFCGTPDYIAP
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pF1KB6 EILQGLKYTFSVDWWSFGVLLYEMLIGQSPFHGDDEDELFESIRVDTPHYPRWITKESKD
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CCDS10 EIIAYQPYGKSVDWWAFGVLLYEMLAGQAPFEGEDEDELFQSIMEHNVAYPKSMSKEAVA
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pF1KB6 ILEKLFEREPTKRLGV--TG--NIKIHPFFKTINWTLLEKRRLEPPFRPKVKSPRDYSNF
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CCDS10 ICKGLMTKHPGKRLGCGPEGERDIKEHAFFRYIDWEKLERKEIQPPYKPKARDKRDTSNF
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CCDS10 DKEFTRQPVELTPTDKLFIMNLDQNEFAGFSYTNPEFVINV
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pF1KB6 GKAEFWLDLQPQAKVLMSVQYFLEDVDCKQSMRSEDEAKFPTMNRRGAIKQAKIHYIKNH
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CCDS11 MADVFPGNDSTASQDVAN--RFARKGALRQKNVHEVKDH
10 20 30
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CCDS11 KFIARFFKQPTFCSHCTDFIWGFGKQGFQCQVCCFVVHKRCHEFVTFSCPG-ADKGPDTD
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CCDS11 DPRSK------HKFKIHTYGSPTFCDHCGSLLYGLIHQGMKCDTCDMNVHKQCVINVPSL
100 110 120 130 140 150
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CCDS11 CGMDHTEKRGRIYLKAEVADEKLHVTVRDAKNLIPMDPNGLSDPYVKLKLIPDPKNESKQ
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.. . :.: .: :.
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: ::: : : ::. . . : . ..
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.. ....: : ::::::::::.:.. :: : .::: ::::::. :::::::::::::
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:.: . ::::.: ::: :.:.::::..::::::::::. :.:. .:.:::::: :
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: :::..::::::::::::.:: .:::::::::::::... . :::::::::::::.
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: :::::..:::::::: :: :: :.::::::.:: . ::. ..::. .. .
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:. ..:.:::: : ... : ::. :.: ::.:...:::.::: . :::.
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: . :. :. .: ..::: : :::.:::.: :
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CCDS10 ICKGLMTKHPGKRLGCGPEGERDIKEHAFFRYIDWEKLERKEIQPPYKPKA-CGRNAENF
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CCDS10 DRFFTRHPPVLTPPDQEVIRNIDQSEFEGFSFVNSEFLKPEVKS
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CCDS12 TFCSHCTDFIWGIGKQGLQCQVCSFVVHRRCHEFVTFECPG-AGKGPQTDDPRNK-----
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CCDS12 -HKFRLHSYSSPTFCDHCGSLLYGLVHQGMKCSCCEMNVHRRCVRSVPSLCGVDHTERRG
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CCDS12 NPVWNETFVFNLKPGDVERRLSVEVWDWDRTSRNDFMGAMSFGVSELLKAPVDGWYKLLN
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CCDS12 GASPGRLHISDFSFLMVLGKGSFGKVMLAERRGSDELYAIKILKKDVIVQDDDVDCTLVE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]