Result of FASTA (ccds) for pF1KB6248
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6248, 681 aa
  1>>>pF1KB6248 681 - 681 aa - 681 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7832+/-0.00118; mu= 8.8864+/- 0.069
 mean_var=238.2987+/-50.148, 0's: 0 Z-trim(109.4): 905  B-trim: 7 in 1/51
 Lambda= 0.083083
 statistics sampled from 9832 (10829) to 9832 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.68), E-opt: 0.2 (0.333), width:  16
 Scan time:  3.440

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS13440.1 ZFP64 gene_id:55734|Hs108|chr20        ( 681) 4644 570.7 2.3e-162
CCDS13442.1 ZFP64 gene_id:55734|Hs108|chr20        ( 679) 4607 566.3  5e-161
CCDS13441.1 ZFP64 gene_id:55734|Hs108|chr20        ( 627) 3672 454.2 2.6e-127
CCDS82630.1 ZFP64 gene_id:55734|Hs108|chr20        ( 426) 1836 233.9 3.6e-61
CCDS13439.1 ZFP64 gene_id:55734|Hs108|chr20        ( 645) 1735 222.0 2.1e-57
CCDS10841.1 CTCF gene_id:10664|Hs108|chr16         ( 727)  813 111.6 4.2e-24
CCDS12637.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19        ( 907)  784 108.2 5.3e-23
CCDS54276.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19        ( 913)  784 108.2 5.4e-23
CCDS33048.1 ZNF235 gene_id:9310|Hs108|chr19        ( 738)  781 107.7   6e-23
CCDS33093.2 ZNF28 gene_id:7576|Hs108|chr19         ( 718)  773 106.8 1.1e-22
CCDS58777.1 CTCFL gene_id:140690|Hs108|chr20       ( 422)  765 105.5 1.6e-22
CCDS58782.1 CTCFL gene_id:140690|Hs108|chr20       ( 573)  767 105.9 1.6e-22
CCDS12946.1 ZFP28 gene_id:140612|Hs108|chr19       ( 868)  770 106.5 1.7e-22
CCDS68162.1 CTCFL gene_id:140690|Hs108|chr20       ( 460)  765 105.6 1.7e-22
CCDS68164.1 CTCFL gene_id:140690|Hs108|chr20       ( 627)  767 106.0 1.7e-22
CCDS13459.1 CTCFL gene_id:140690|Hs108|chr20       ( 663)  767 106.0 1.8e-22
CCDS58781.1 CTCFL gene_id:140690|Hs108|chr20       ( 665)  767 106.0 1.8e-22
CCDS46167.1 ZNF808 gene_id:388558|Hs108|chr19      ( 903)  769 106.4 1.9e-22
CCDS58780.1 CTCFL gene_id:140690|Hs108|chr20       ( 700)  767 106.0 1.9e-22
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19         ( 595)  765 105.7   2e-22
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19         ( 803)  765 105.9 2.4e-22
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19         ( 809)  765 105.9 2.4e-22
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19         ( 818)  765 105.9 2.4e-22
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3         ( 544)  761 105.2 2.6e-22
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19       ( 781)  761 105.4 3.3e-22
CCDS74388.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19        ( 748)  760 105.2 3.5e-22
CCDS12636.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19        ( 799)  760 105.3 3.6e-22
CCDS46102.1 ZNF226 gene_id:7769|Hs108|chr19        ( 803)  755 104.7 5.5e-22
CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19      ( 616)  749 103.8 7.6e-22
CCDS68161.1 CTCFL gene_id:140690|Hs108|chr20       ( 299)  742 102.6 8.6e-22
CCDS12505.1 ZNF571 gene_id:51276|Hs108|chr19       ( 609)  747 103.6 8.9e-22
CCDS58776.1 CTCFL gene_id:140690|Hs108|chr20       ( 403)  742 102.8   1e-21
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19       ( 678)  741 102.9 1.6e-21
CCDS46172.1 ZNF813 gene_id:126017|Hs108|chr19      ( 617)  740 102.7 1.6e-21
CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19      ( 536)  738 102.4 1.7e-21
CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19      ( 592)  738 102.5 1.9e-21
CCDS12943.1 ZNF583 gene_id:147949|Hs108|chr19      ( 569)  735 102.1 2.3e-21
CCDS42539.1 ZNF676 gene_id:163223|Hs108|chr19      ( 588)  735 102.1 2.4e-21
CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19      ( 936)  738 102.7 2.5e-21
CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9       ( 699)  735 102.2 2.6e-21
CCDS42495.1 ZNF699 gene_id:374879|Hs108|chr19      ( 642)  734 102.0 2.7e-21
CCDS33095.1 ZNF320 gene_id:162967|Hs108|chr19      ( 509)  730 101.4 3.3e-21
CCDS46100.1 ZNF225 gene_id:7768|Hs108|chr19        ( 706)  732 101.9 3.4e-21
CCDS46991.1 ZNF721 gene_id:170960|Hs108|chr4       ( 923)  734 102.2 3.4e-21
CCDS32979.1 ZNF431 gene_id:170959|Hs108|chr19      ( 576)  730 101.5 3.5e-21
CCDS59368.1 ZNF729 gene_id:100287226|Hs108|chr19   (1252)  735 102.5 3.9e-21
CCDS33094.1 ZNF468 gene_id:90333|Hs108|chr19       ( 522)  728 101.2 3.9e-21
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8           ( 682)  730 101.6   4e-21
CCDS42504.1 ZNF709 gene_id:163051|Hs108|chr19      ( 641)  728 101.3 4.5e-21
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19      ( 527)  726 101.0 4.7e-21


>>CCDS13440.1 ZFP64 gene_id:55734|Hs108|chr20             (681 aa)
 initn: 4644 init1: 4644 opt: 4644  Z-score: 3028.3  bits: 570.7 E(32554): 2.3e-162
Smith-Waterman score: 4644; 100.0% identity (100.0% similar) in 681 aa overlap (1-681:1-681)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MNASSEGESFAGSVQIPGGTTVLVELTPDIHICGICKQQFNNLDAFVAHKQSGCQLTGTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MNASSEGESFAGSVQIPGGTTVLVELTPDIHICGICKQQFNNLDAFVAHKQSGCQLTGTS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 AAAPSTVQFVSEETVPATQTQTTTRTITSETQTITVSAPEFVFEHGYQTYLPTESNENQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AAAPSTVQFVSEETVPATQTQTTTRTITSETQTITVSAPEFVFEHGYQTYLPTESNENQT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 ATVISLPAKSRTKKPTTPPAQKRLNCCYPGCQFKTAYGMKDMERHLKIHTGDKPHKCEVC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ATVISLPAKSRTKKPTTPPAQKRLNCCYPGCQFKTAYGMKDMERHLKIHTGDKPHKCEVC
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 GKCFSRKDKLKTHMRCHTGVKPYKCKTCDYAAADSSSLNKHLRIHSDERPFKCQICPYAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GKCFSRKDKLKTHMRCHTGVKPYKCKTCDYAAADSSSLNKHLRIHSDERPFKCQICPYAS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 RNSSQLTVHLRSHTGDAPFQCWLCSAKFKISSDLKRHMRVHSGEKPFKCEFCNVRCTMKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RNSSQLTVHLRSHTGDAPFQCWLCSAKFKISSDLKRHMRVHSGEKPFKCEFCNVRCTMKG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 NLKSHIRIKHSGNNFKCPHCDFLGDSKATLRKHSRVHQSEHPEKCSECSYSCSSKAALRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NLKSHIRIKHSGNNFKCPHCDFLGDSKATLRKHSRVHQSEHPEKCSECSYSCSSKAALRI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 HERIHCTDRPFKCNYCSFDTKQPSNLSKHMKKFHGDMVKTEALERKDTGRQSSRQVAKLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 HERIHCTDRPFKCNYCSFDTKQPSNLSKHMKKFHGDMVKTEALERKDTGRQSSRQVAKLD
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 AKKSFHCDICDASFMREDSLRSHKRQHSEYSESKNSDVTVLQFQIDPSKQPATPLTVGHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AKKSFHCDICDASFMREDSLRSHKRQHSEYSESKNSDVTVLQFQIDPSKQPATPLTVGHL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB6 QVPLQPSQVPQFSEGRVKIIVGHQVPQANTIVQAAAAAVNIVPPALVAQNPEELPGNSRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QVPLQPSQVPQFSEGRVKIIVGHQVPQANTIVQAAAAAVNIVPPALVAQNPEELPGNSRL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB6 QILRQVSLIAPPQSSRCPSEAGAMTQPAVLLTTHEQTDGATLHQTLIPTASGGPQEGSGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QILRQVSLIAPPQSSRCPSEAGAMTQPAVLLTTHEQTDGATLHQTLIPTASGGPQEGSGN
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB6 QTFITSSGITCTDFEGLNALIQEGTAEVTVVSDGGQNIAVATTAPPVFSSSSQQELPKQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QTFITSSGITCTDFEGLNALIQEGTAEVTVVSDGGQNIAVATTAPPVFSSSSQQELPKQT
              610       620       630       640       650       660

              670       680 
pF1KB6 YSIIQGAAHPALLCPADSIPD
       :::::::::::::::::::::
CCDS13 YSIIQGAAHPALLCPADSIPD
              670       680 

>>CCDS13442.1 ZFP64 gene_id:55734|Hs108|chr20             (679 aa)
 initn: 4532 init1: 4532 opt: 4607  Z-score: 3004.4  bits: 566.3 E(32554): 5e-161
Smith-Waterman score: 4607; 99.6% identity (99.7% similar) in 681 aa overlap (1-681:1-679)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MNASSEGESFAGSVQIPGGTTVLVELTPDIHICGICKQQFNNLDAFVAHKQSGCQLTGTS
       :::::::::::::::  .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MNASSEGESFAGSVQ--SGTTVLVELTPDIHICGICKQQFNNLDAFVAHKQSGCQLTGTS
               10          20        30        40        50        

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 AAAPSTVQFVSEETVPATQTQTTTRTITSETQTITVSAPEFVFEHGYQTYLPTESNENQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AAAPSTVQFVSEETVPATQTQTTTRTITSETQTITVSAPEFVFEHGYQTYLPTESNENQT
       60        70        80        90       100       110        

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 ATVISLPAKSRTKKPTTPPAQKRLNCCYPGCQFKTAYGMKDMERHLKIHTGDKPHKCEVC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ATVISLPAKSRTKKPTTPPAQKRLNCCYPGCQFKTAYGMKDMERHLKIHTGDKPHKCEVC
      120       130       140       150       160       170        

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 GKCFSRKDKLKTHMRCHTGVKPYKCKTCDYAAADSSSLNKHLRIHSDERPFKCQICPYAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GKCFSRKDKLKTHMRCHTGVKPYKCKTCDYAAADSSSLNKHLRIHSDERPFKCQICPYAS
      180       190       200       210       220       230        

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 RNSSQLTVHLRSHTGDAPFQCWLCSAKFKISSDLKRHMRVHSGEKPFKCEFCNVRCTMKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RNSSQLTVHLRSHTGDAPFQCWLCSAKFKISSDLKRHMRVHSGEKPFKCEFCNVRCTMKG
      240       250       260       270       280       290        

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 NLKSHIRIKHSGNNFKCPHCDFLGDSKATLRKHSRVHQSEHPEKCSECSYSCSSKAALRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NLKSHIRIKHSGNNFKCPHCDFLGDSKATLRKHSRVHQSEHPEKCSECSYSCSSKAALRI
      300       310       320       330       340       350        

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 HERIHCTDRPFKCNYCSFDTKQPSNLSKHMKKFHGDMVKTEALERKDTGRQSSRQVAKLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 HERIHCTDRPFKCNYCSFDTKQPSNLSKHMKKFHGDMVKTEALERKDTGRQSSRQVAKLD
      360       370       380       390       400       410        

              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 AKKSFHCDICDASFMREDSLRSHKRQHSEYSESKNSDVTVLQFQIDPSKQPATPLTVGHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AKKSFHCDICDASFMREDSLRSHKRQHSEYSESKNSDVTVLQFQIDPSKQPATPLTVGHL
      420       430       440       450       460       470        

              490       500       510       520       530       540
pF1KB6 QVPLQPSQVPQFSEGRVKIIVGHQVPQANTIVQAAAAAVNIVPPALVAQNPEELPGNSRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QVPLQPSQVPQFSEGRVKIIVGHQVPQANTIVQAAAAAVNIVPPALVAQNPEELPGNSRL
      480       490       500       510       520       530        

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pF1KB6 QILRQVSLIAPPQSSRCPSEAGAMTQPAVLLTTHEQTDGATLHQTLIPTASGGPQEGSGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QILRQVSLIAPPQSSRCPSEAGAMTQPAVLLTTHEQTDGATLHQTLIPTASGGPQEGSGN
      540       550       560       570       580       590        

              610       620       630       640       650       660
pF1KB6 QTFITSSGITCTDFEGLNALIQEGTAEVTVVSDGGQNIAVATTAPPVFSSSSQQELPKQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QTFITSSGITCTDFEGLNALIQEGTAEVTVVSDGGQNIAVATTAPPVFSSSSQQELPKQT
      600       610       620       630       640       650        

              670       680 
pF1KB6 YSIIQGAAHPALLCPADSIPD
       :::::::::::::::::::::
CCDS13 YSIIQGAAHPALLCPADSIPD
      660       670         

>>CCDS13441.1 ZFP64 gene_id:55734|Hs108|chr20             (627 aa)
 initn: 4262 init1: 3672 opt: 3672  Z-score: 2399.1  bits: 454.2 E(32554): 2.6e-127
Smith-Waterman score: 4158; 92.1% identity (92.1% similar) in 681 aa overlap (1-681:1-627)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MNASSEGESFAGSVQIPGGTTVLVELTPDIHICGICKQQFNNLDAFVAHKQSGCQLTGTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MNASSEGESFAGSVQIPGGTTVLVELTPDIHICGICKQQFNNLDAFVAHKQSGCQLTGTS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 AAAPSTVQFVSEETVPATQTQTTTRTITSETQTITVSAPEFVFEHGYQTYLPTESNENQT
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::                         
CCDS13 AAAPSTVQFVSEETVPATQTQTTTRTITSETQTIT-------------------------
               70        80        90                              

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 ATVISLPAKSRTKKPTTPPAQKRLNCCYPGCQFKTAYGMKDMERHLKIHTGDKPHKCEVC
                                    :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 -----------------------------GCQFKTAYGMKDMERHLKIHTGDKPHKCEVC
                                      100       110       120      

              190       200       210       220       230       240
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GKCFSRKDKLKTHMRCHTGVKPYKCKTCDYAAADSSSLNKHLRIHSDERPFKCQICPYAS
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pF1KB6 RNSSQLTVHLRSHTGDAPFQCWLCSAKFKISSDLKRHMRVHSGEKPFKCEFCNVRCTMKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RNSSQLTVHLRSHTGDAPFQCWLCSAKFKISSDLKRHMRVHSGEKPFKCEFCNVRCTMKG
        190       200       210       220       230       240      

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pF1KB6 NLKSHIRIKHSGNNFKCPHCDFLGDSKATLRKHSRVHQSEHPEKCSECSYSCSSKAALRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NLKSHIRIKHSGNNFKCPHCDFLGDSKATLRKHSRVHQSEHPEKCSECSYSCSSKAALRI
        250       260       270       280       290       300      

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pF1KB6 HERIHCTDRPFKCNYCSFDTKQPSNLSKHMKKFHGDMVKTEALERKDTGRQSSRQVAKLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 HERIHCTDRPFKCNYCSFDTKQPSNLSKHMKKFHGDMVKTEALERKDTGRQSSRQVAKLD
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pF1KB6 AKKSFHCDICDASFMREDSLRSHKRQHSEYSESKNSDVTVLQFQIDPSKQPATPLTVGHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AKKSFHCDICDASFMREDSLRSHKRQHSEYSESKNSDVTVLQFQIDPSKQPATPLTVGHL
        370       380       390       400       410       420      

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pF1KB6 QVPLQPSQVPQFSEGRVKIIVGHQVPQANTIVQAAAAAVNIVPPALVAQNPEELPGNSRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QVPLQPSQVPQFSEGRVKIIVGHQVPQANTIVQAAAAAVNIVPPALVAQNPEELPGNSRL
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pF1KB6 QILRQVSLIAPPQSSRCPSEAGAMTQPAVLLTTHEQTDGATLHQTLIPTASGGPQEGSGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QILRQVSLIAPPQSSRCPSEAGAMTQPAVLLTTHEQTDGATLHQTLIPTASGGPQEGSGN
        490       500       510       520       530       540      

              610       620       630       640       650       660
pF1KB6 QTFITSSGITCTDFEGLNALIQEGTAEVTVVSDGGQNIAVATTAPPVFSSSSQQELPKQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QTFITSSGITCTDFEGLNALIQEGTAEVTVVSDGGQNIAVATTAPPVFSSSSQQELPKQT
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              670       680 
pF1KB6 YSIIQGAAHPALLCPADSIPD
       :::::::::::::::::::::
CCDS13 YSIIQGAAHPALLCPADSIPD
        610       620       

>>CCDS82630.1 ZFP64 gene_id:55734|Hs108|chr20             (426 aa)
 initn: 1307 init1: 1307 opt: 1836  Z-score: 1211.7  bits: 233.9 E(32554): 3.6e-61
Smith-Waterman score: 1836; 65.8% identity (85.1% similar) in 383 aa overlap (111-488:49-424)

               90       100       110       120       130       140
pF1KB6 QTTTRTITSETQTITVSAPEFVFEHGYQTYLPTESNENQTATVISLPAKSRTKKPTTPPA
                                     : :::...  : ::.::...: .  :   .
CCDS82 PARRECAEVAPQVAGEPASELDDDVPKANCLSTESTDTPKAPVITLPSEAREQMATL--G
       20        30        40        50        60        70        

              150       160       170       180       190       200
pF1KB6 QKRLNCCYPGCQFKTAYGMKDMERHLKIHTGDKPHKCEVCGKCFSRKDKLKTHMRCHTGV
       .. .:::::::.:::..::::..:::.::::::::::: : :::::::.:  ::::::.:
CCDS82 ERTFNCCYPGCHFKTVHGMKDLDRHLRIHTGDKPHKCEFCDKCFSRKDNLTMHMRCHTSV
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pF1KB6 KPYKCKTCDYAAADSSSLNKHLRIHSDERPFKCQICPYASRNSSQLTVHLRSHTGDAPFQ
       ::.::. :::::.:::::.:::::::::::.:::.:::::::::::::::::::::.:::
CCDS82 KPHKCHLCDYAAVDSSSLKKHLRIHSDERPYKCQLCPYASRNSSQLTVHLRSHTGDTPFQ
        140       150       160       170       180       190      

              270       280       290       300       310       320
pF1KB6 CWLCSAKFKISSDLKRHMRVHSGEKPFKCEFCNVRCTMKGNLKSHIRIKHSGNNFKCPHC
       :::::::::::::::::: :::::::::::::.::::::.::::::::::.   ::: ::
CCDS82 CWLCSAKFKISSDLKRHMIVHSGEKPFKCEFCDVRCTMKANLKSHIRIKHT---FKCLHC
        200       210       220       230       240          250   

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pF1KB6 DFLGDSKATLRKHSRVHQSEHPEKCSECSYSCSSKAALRIHERIHCTDRPFKCNYCSFDT
        : : ..: : .:::.::..::::: :::::::: ::::.: :.:: ::::::..:::::
CCDS82 AFQGRDRADLLEHSRLHQADHPEKCPECSYSCSSAAALRVHSRVHCKDRPFKCDFCSFDT
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pF1KB6 KQPSNLSKHMKKFHGDMVKTEALERKDTGRQ-----SSRQVAKLDAKKSFHCDICDASFM
       :.::.:.::. : : : .:::  .:   :..     ::..:::. ....:.:. : :::.
CCDS82 KRPSSLAKHVDKVHRDEAKTE--NRAPLGKEGLREGSSQHVAKIVTQRAFRCETCGASFV
           320       330         340       350       360       370 

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pF1KB6 REDSLRSHKRQHSEYSESKNSDVTVLQFQIDPSKQPATPLTVGHLQVPLQPSQVPQFSEG
       :.:::: ::.:::. ::.::::....  .   : : .: ..::.:..::.:::       
CCDS82 RDDSLRCHKKQHSDQSENKNSDLVTFPPESGASGQLSTLVSVGQLEAPLEPSQDL     
             380       390       400       410       420           

         500       510       520       530       540       550     
pF1KB6 RVKIIVGHQVPQANTIVQAAAAAVNIVPPALVAQNPEELPGNSRLQILRQVSLIAPPQSS

>>CCDS13439.1 ZFP64 gene_id:55734|Hs108|chr20             (645 aa)
 initn: 2536 init1: 1735 opt: 1735  Z-score: 1144.1  bits: 222.0 E(32554): 2.1e-57
Smith-Waterman score: 2490; 62.3% identity (69.8% similar) in 648 aa overlap (1-488:1-643)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MNASSEGESFAGSVQIPGGTTVLVELTPDIHICGICKQQFNNLDAFVAHKQSGCQLTGTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MNASSEGESFAGSVQIPGGTTVLVELTPDIHICGICKQQFNNLDAFVAHKQSGCQLTGTS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 AAAPSTVQFVSEETVPATQTQTTTRTITSETQTITVSAPEFVFEHGYQTYLPTESNENQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AAAPSTVQFVSEETVPATQTQTTTRTITSETQTITVSAPEFVFEHGYQTYLPTESNENQT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 ATVISLPAKSRTKKPTTPPAQKRLNCCYPGCQFKTAYGMKDMERHLKIHTGDKPHKCEVC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ATVISLPAKSRTKKPTTPPAQKRLNCCYPGCQFKTAYGMKDMERHLKIHTGDKPHKCEVC
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 GKCFSRKDKLKTHMRCHTGVKPYKCKTCDYAAADSSSLNKHLRIHSDERPFKCQICPYAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GKCFSRKDKLKTHMRCHTGVKPYKCKTCDYAAADSSSLNKHLRIHSDERPFKCQICPYAS
              190       200       210       220       230       240

              250                                                  
pF1KB6 RNSSQLTVHLRSHT----------------------------------------------
       ::::::::::::::                                              
CCDS13 RNSSQLTVHLRSHTASELDDDVPKANCLSTESTDTPKAPVITLPSEAREQMATLGERTFN
              250       260       270       280       290       300

                                                                   
pF1KB6 ------------------------------------------------------------
                                                                   
CCDS13 CCYPGCHFKTVHGMKDLDRHLRIHTGDKPHKCEFCDKCFSRKDNLTMHMRCHTSVKPHKC
              310       320       330       340       350       360

                                                           260     
pF1KB6 -------------------------------------------------GDAPFQCWLCS
                                                        ::.::::::::
CCDS13 HLCDYAAVDSSSLKKHLRIHSDERPYKCQLCPYASRNSSQLTVHLRSHTGDTPFQCWLCS
              370       380       390       400       410       420

         270       280       290       300       310       320     
pF1KB6 AKFKISSDLKRHMRVHSGEKPFKCEFCNVRCTMKGNLKSHIRIKHSGNNFKCPHCDFLGD
       ::::::::::::: :::::::::::::.::::::.::::::::::.   ::: :: : : 
CCDS13 AKFKISSDLKRHMIVHSGEKPFKCEFCDVRCTMKANLKSHIRIKHT---FKCLHCAFQGR
              430       440       450       460          470       

         330       340       350       360       370       380     
pF1KB6 SKATLRKHSRVHQSEHPEKCSECSYSCSSKAALRIHERIHCTDRPFKCNYCSFDTKQPSN
       ..: : .:::.::..::::: :::::::: ::::.: :.:: ::::::..::::::.::.
CCDS13 DRADLLEHSRLHQADHPEKCPECSYSCSSAAALRVHSRVHCKDRPFKCDFCSFDTKRPSS
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pF1KB6 LSKHMKKFHGDMVKTEALERKDTGRQ-----SSRQVAKLDAKKSFHCDICDASFMREDSL
       :.::. : : : .:::  .:   :..     ::..:::. ....:.:. : :::.:.:::
CCDS13 LAKHVDKVHRDEAKTE--NRAPLGKEGLREGSSQHVAKIVTQRAFRCETCGASFVRDDSL
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pF1KB6 RSHKRQHSEYSESKNSDVTVLQFQIDPSKQPATPLTVGHLQVPLQPSQVPQFSEGRVKII
       : ::.:::. ::.::::....  .   : : .: ..::.:..::.:::            
CCDS13 RCHKKQHSDQSENKNSDLVTFPPESGASGQLSTLVSVGQLEAPLEPSQDL          
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              510       520       530       540       550       560
pF1KB6 VGHQVPQANTIVQAAAAAVNIVPPALVAQNPEELPGNSRLQILRQVSLIAPPQSSRCPSE

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pF1KB6 FVAHKQSGCQLTGTSAAAPSTVQFVSEETVPATQTQTTTRT---ITSETQTITVSAPEFV
                                     :: .:. : ..    : : . . ::.  . 
CCDS10 GANGEVETLEQGELPPQEDPSWQKDPDYQPPAKKTKKTKKSKLRYTEEGKDVDVSV--YD
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pF1KB6 FEHGYQTYLPTESNENQTATVISLPAKSRTKKPTTPPAQKRLNC--CYPGCQFKTAYGMK
       ::.  :  : .: : ....  .. :  .. ::     ..: ..:  :   :  ..     
CCDS10 FEEEQQEGLLSEVNAEKVVGNMKPPKPTKIKKKG---VKKTFQCELCSYTCPRRS-----
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       ...::.: :: ..::::..::. :     :..:.  :::..:.::  ::.: . :. : .
CCDS10 NLDRHMKSHTDERPHKCHLCGRAFRTVTLLRNHLNTHTGTRPHKCPDCDMAFVTSGELVR
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pF1KB6 HLRI-HSDERPFKCQICPYASRNSSQLTVHLRSHTGDAPFQCWLCSAKFKISSDLKRHMR
       : :  :. :.::::..: ::: . :.:  :.:::::. :::: :::   . .  ::::::
CCDS10 HRRYKHTHEKPFKCSMCDYASVEVSKLKRHIRSHTGERPFQCSLCSYASRDTYKLKRHMR
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pF1KB6 VHSGEKPFKCEFCNVRCTMKGNLKSHIRIKHSGN--NFKCPHCDFL----GDSKATLRK-
       .::::::..: .:..: :..:..: ::  ::. :  .:.::::: .    .:  . ::: 
CCDS10 THSGEKPYECYICHARFTQSGTMKMHILQKHTENVAKFHCPHCDTVIARKSDLGVHLRKQ
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pF1KB6 -------------------------HSRVHQSEHPEKCSECSYSCSSKAALRIHERIHCT
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CCDS10 HSYIEQGKKCRYCDAVFHERYALIQHQKSHKNEKRFKCDQCDYACRQERHMIMHKRTHTG
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pF1KB6 DRPFKCNYCSFDTKQPSNLSKHMKKFHGDMVKTEALERKDTGRQSSRQVAKLDAKKSFHC
       ..:. :..:.   .: . :. :.:..:       :.  .  :.  .:. .   :... .:
CCDS10 EKPYACSHCDKTFRQKQLLDMHFKRYHDPNFVPAAFVCSKCGKTFTRRNTM--ARHADNC
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pF1KB6 DICD------------ASFMREDSLRSHKRQHSEYSESKNSDVT--------VLQFQIDP
          :            ..  :. ..::.:.. :. ::. . :.         ..... .:
CCDS10 AGPDGVEGENGGETKKSKRGRKRKMRSKKEDSSD-SENAEPDLDDNEDEEEPAVEIEPEP
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pF1KB6 SKQPATPLTV-GHLQVPLQPSQVPQFSEGRVKIIVGHQVPQANT-IVQAAAAAVNIVPPA
         ::.::    .. .    :... : ....   :.  :: . ::  ..   . :.  : :
CCDS10 EPQPVTPAPPPAKKRRGRPPGRTNQPKQNQPTAII--QVEDQNTGAIENIIVEVKKEPDA
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pF1KB6 LVAQNPEELPGNSRLQILRQVSLIAPPQSSRCPSEAGAMTQPAVLLTTHEQTDGATLHQT
         :.. ::                                                    
CCDS10 EPAEGEEEEAQPAATDAPNGDLTPEMILSMMDR                           
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>>CCDS12637.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19             (907 aa)
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pF1KB6 TATVISLPAKSRTKKPTTPPAQKRLNCCYPGCQFKTAYGMKDMERHLKIHTGDKPHKCEV
                                     :  :. .  .::   : ..:::.::.::..
CCDS12 RYVCSNSFSHNLYLQGHPKIHIGEKPRKEHGNGFNWSSKLKD---HQRVHTGQKPYKCNI
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pF1KB6 CGKCFSRKDKLKTHMRCHTGVKPYKCKTCDYAAADSSSLNKHLRIHSDERPFKCQICPYA
       ::: :.... :..:.: ::: :::::. :: . . :: :. : :.:. :.:.::. :  .
CCDS12 CGKGFNHRSVLNVHQRVHTGEKPYKCEECDKGFSRSSYLQAHQRVHTGEKPYKCEECGKG
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pF1KB6 SRNSSQLTVHLRSHTGDAPFQCWLCSAKFKISSDLKRHMRVHSGEKPFKCEFCNVRCTMK
          .: :  : : :::. :..:  :.  :. :: :. :.:::.:::::::: :.   . .
CCDS12 FSRNSYLQGHQRVHTGEKPYKCEECGKGFSRSSHLQGHQRVHTGEKPFKCEECGKGFSWS
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pF1KB6 GNLKSHIRIKHSGNN-FKCPHCDFLGDSKA-TLRKHSRVHQSEHPEKCSECSYSCSSKAA
        ::. : :. :.:.. .:: .:   : ::: ::  :.::: .:.: .:.::. : :... 
CCDS12 FNLQIHQRV-HTGEKPYKCEECG-KGFSKASTLLAHQRVHTGEKPYQCDECGKSFSQRSY
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pF1KB6 LRIHERIHCTDRPFKCNYCSFDTKQPSNLSKHMKKFHGDMVKTEALERKDTG-RQSSRQV
       :. :. .:  .::. :. :.   .: . :. : .. :   ::    :    :  ::::  
CCDS12 LQSHQSVHSGERPYICEVCGKGFSQRAYLQGH-QRVH-TRVKPYKCEMCGKGFSQSSRLE
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pF1KB6 AKLDAK---KSFHCDICDASFMREDSLRSHKRQHSEYSESKNSDVTVLQFQIDPSKQPAT
       :.  ..   : ..:..:  .: . . :..:.: : :                        
CCDS12 AHRRVHTGGKPYKCEVCTKGFSESSRLQAHQRVHVEGRPYKCEQCGKGFSGYSSLQAHHR
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pF1KB6 PLTVGHLQVPLQPSQVPQFSEGRVKIIVGHQVPQANTIVQAAAAAVNIVPPALVAQNPEE
                                                                   
CCDS12 VHTGEKPYKCEVCGKGFSQRSNLQAHQRVHTGEKPYKCDACGKGFRWSSGLLIHQRVHSS
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>>CCDS54276.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19             (913 aa)
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pF1KB6 TATVISLPAKSRTKKPTTPPAQKRLNCCYPGCQFKTAYGMKDMERHLKIHTGDKPHKCEV
                                     :  :. .  .::   : ..:::.::.::..
CCDS54 RYVCSNSFSHNLYLQGHPKIHIGEKPRKEHGNGFNWSSKLKD---HQRVHTGQKPYKCNI
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pF1KB6 CGKCFSRKDKLKTHMRCHTGVKPYKCKTCDYAAADSSSLNKHLRIHSDERPFKCQICPYA
       ::: :.... :..:.: ::: :::::. :: . . :: :. : :.:. :.:.::. :  .
CCDS54 CGKGFNHRSVLNVHQRVHTGEKPYKCEECDKGFSRSSYLQAHQRVHTGEKPYKCEECGKG
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pF1KB6 SRNSSQLTVHLRSHTGDAPFQCWLCSAKFKISSDLKRHMRVHSGEKPFKCEFCNVRCTMK
          .: :  : : :::. :..:  :.  :. :: :. :.:::.:::::::: :.   . .
CCDS54 FSRNSYLQGHQRVHTGEKPYKCEECGKGFSRSSHLQGHQRVHTGEKPFKCEECGKGFSWS
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pF1KB6 GNLKSHIRIKHSGNN-FKCPHCDFLGDSKA-TLRKHSRVHQSEHPEKCSECSYSCSSKAA
        ::. : :. :.:.. .:: .:   : ::: ::  :.::: .:.: .:.::. : :... 
CCDS54 FNLQIHQRV-HTGEKPYKCEECG-KGFSKASTLLAHQRVHTGEKPYQCDECGKSFSQRSY
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pF1KB6 LRIHERIHCTDRPFKCNYCSFDTKQPSNLSKHMKKFHGDMVKTEALERKDTG-RQSSRQV
       :. :. .:  .::. :. :.   .: . :. : .. :   ::    :    :  ::::  
CCDS54 LQSHQSVHSGERPYICEVCGKGFSQRAYLQGH-QRVH-TRVKPYKCEMCGKGFSQSSRLE
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pF1KB6 AKLDAK---KSFHCDICDASFMREDSLRSHKRQHSEYSESKNSDVTVLQFQIDPSKQPAT
       :.  ..   : ..:..:  .: . . :..:.: : :                        
CCDS54 AHRRVHTGGKPYKCEVCTKGFSESSRLQAHQRVHVEGRPYKCEQCGKGFSGYSSLQAHHR
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pF1KB6 PLTVGHLQVPLQPSQVPQFSEGRVKIIVGHQVPQANTIVQAAAAAVNIVPPALVAQNPEE
                                                                   
CCDS54 VHTGEKPYKCEVCGKGFSQRSNLQAHQRVHTGEKPYKCDACGKGFRWSSGLLIHQRVHSS
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>>CCDS33048.1 ZNF235 gene_id:9310|Hs108|chr19             (738 aa)
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pF1KB6 EGESFAGSVQIPGGTTVLVELTPDIHICGICKQQFNNLDAFVAHKQSGCQLTGTSAAAPS
                                     :.. ::. ...  :::   .:   : :  .
CCDS33 NSDCGKDTLKVSPLTQRSIHTGQKTYQGNECEEAFNDSSSLELHKQ--VHLGKKSPACST
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pF1KB6 TVQFVSEET-VPATQTQTT--TRTITSE-----TQTITVSAPEFVFEHGYQTYLPTESNE
         . .:  . .:. :.  :   :    :     .:. .... . :   : . :   : ..
CCDS33 HEKDTSYSSGIPVQQSVRTGKKRYWCHECGKGFSQSSNLQTHQRVHT-GEKPYTCHECGK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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