FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB6259, 764 aa 1>>>pF1KB6259 764 - 764 aa - 764 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2090+/-0.000517; mu= 20.8929+/- 0.032 mean_var=69.2882+/-14.268, 0's: 0 Z-trim(107.4): 51 B-trim: 0 in 0/49 Lambda= 0.154079 statistics sampled from 15380 (15430) to 15380 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.511), E-opt: 0.2 (0.181), width: 16 Scan time: 9.800 The best scores are: opt bits E(85289) NP_000102 (OMIM: 126650,214700) chloride anion exc ( 764) 4939 1108.0 0 XP_011514169 (OMIM: 126650,214700) PREDICTED: chlo ( 764) 4939 1108.0 0 XP_005250482 (OMIM: 274600,600791,605646) PREDICTE ( 780) 2288 518.7 3.6e-146 NP_000432 (OMIM: 274600,600791,605646) pendrin [Ho ( 780) 2288 518.7 3.6e-146 NP_945350 (OMIM: 604943,613865) prestin isoform a ( 744) 1763 402.0 4.7e-111 XP_011514472 (OMIM: 604943,613865) PREDICTED: pres ( 744) 1763 402.0 4.7e-111 NP_996766 (OMIM: 604943,613865) prestin isoform b ( 685) 1690 385.8 3.3e-106 NP_996767 (OMIM: 604943,613865) prestin isoform c ( 516) 1459 334.3 7.6e-91 NP_443166 (OMIM: 608481) solute carrier family 26 ( 791) 1393 319.8 2.8e-86 NP_599152 (OMIM: 608481) solute carrier family 26 ( 887) 1393 319.8 3.1e-86 NP_602298 (OMIM: 610068) solute carrier family 26 ( 740) 1344 308.9 5.1e-83 XP_016867807 (OMIM: 274600,600791,605646) PREDICTE ( 754) 1312 301.8 7.1e-81 XP_006716088 (OMIM: 274600,600791,605646) PREDICTE ( 423) 1306 300.3 1.1e-80 XP_016864680 (OMIM: 222600,226900,256050,600972,60 ( 739) 1293 297.5 1.3e-79 NP_000103 (OMIM: 222600,226900,256050,600972,60671 ( 739) 1293 297.5 1.3e-79 NP_001308716 (OMIM: 604943,613865) prestin isoform ( 653) 1251 288.2 7.6e-77 NP_001161434 (OMIM: 604943,613865) prestin isoform ( 712) 1251 288.2 8.2e-77 NP_599025 (OMIM: 610068) solute carrier family 26 ( 758) 1212 279.5 3.5e-74 NP_001035544 (OMIM: 610068) solute carrier family ( 738) 1209 278.9 5.5e-74 NP_075062 (OMIM: 610068) solute carrier family 26 ( 759) 1209 278.9 5.6e-74 XP_011507423 (OMIM: 608481) PREDICTED: solute carr ( 702) 1191 274.8 8.4e-73 NP_071325 (OMIM: 167030,610130) sulfate anion tran ( 701) 1180 272.4 4.6e-72 NP_998778 (OMIM: 167030,610130) sulfate anion tran ( 701) 1180 272.4 4.6e-72 XP_011507426 (OMIM: 608481) PREDICTED: solute carr ( 466) 1119 258.7 4e-68 XP_016865724 (OMIM: 606766,608480) PREDICTED: test ( 970) 1111 257.2 2.5e-67 NP_443193 (OMIM: 606766,608480) testis anion trans ( 970) 1111 257.2 2.5e-67 NP_001180405 (OMIM: 606766,608480) testis anion tr ( 970) 1111 257.2 2.5e-67 NP_439897 (OMIM: 608479) anion exchange transporte ( 656) 1073 248.6 6.3e-65 NP_001269285 (OMIM: 608479) anion exchange transpo ( 656) 1073 248.6 6.3e-65 NP_599028 (OMIM: 608479) anion exchange transporte ( 663) 1073 248.6 6.3e-65 XP_011507424 (OMIM: 608481) PREDICTED: solute carr ( 627) 1043 241.9 6.1e-63 NP_001268661 (OMIM: 610068) solute carrier family ( 723) 961 223.7 2.1e-57 NP_001268662 (OMIM: 610068) solute carrier family ( 651) 953 221.9 6.7e-57 NP_996768 (OMIM: 604943,613865) prestin isoform d ( 335) 921 214.6 5.4e-55 XP_011512596 (OMIM: 606766,608480) PREDICTED: test ( 944) 763 179.8 4.6e-44 NP_619732 (OMIM: 606766,608480) testis anion trans ( 865) 554 133.3 4.2e-30 NP_001269286 (OMIM: 608479) anion exchange transpo ( 355) 438 107.3 1.2e-22 NP_001159820 (OMIM: 610117) sodium-independent sul ( 606) 385 95.6 6.4e-19 NP_775897 (OMIM: 610117) sodium-independent sulfat ( 606) 385 95.6 6.4e-19 NP_001159819 (OMIM: 610117) sodium-independent sul ( 606) 385 95.6 6.4e-19 NP_001159821 (OMIM: 610117) sodium-independent sul ( 606) 385 95.6 6.4e-19 NP_602297 (OMIM: 167030,610130) sulfate anion tran ( 224) 361 90.0 1.2e-17 XP_016879996 (OMIM: 610117) PREDICTED: sodium-inde ( 630) 333 84.1 2e-15 XP_006721896 (OMIM: 610117) PREDICTED: sodium-inde ( 630) 333 84.1 2e-15 XP_016879995 (OMIM: 610117) PREDICTED: sodium-inde ( 677) 333 84.1 2.1e-15 XP_016879994 (OMIM: 610117) PREDICTED: sodium-inde ( 696) 333 84.1 2.2e-15 XP_011522956 (OMIM: 610117) PREDICTED: sodium-inde ( 441) 197 53.8 1.9e-06 XP_011522955 (OMIM: 610117) PREDICTED: sodium-inde ( 441) 197 53.8 1.9e-06 XP_011522954 (OMIM: 610117) PREDICTED: sodium-inde ( 465) 197 53.8 2e-06 >>NP_000102 (OMIM: 126650,214700) chloride anion exchang (764 aa) initn: 4939 init1: 4939 opt: 4939 Z-score: 5930.2 bits: 1108.0 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 4939; 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