FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6264, 769 aa
1>>>pF1KB6264 769 - 769 aa - 769 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1532+/-0.00245; mu= 13.2858+/- 0.144
mean_var=317.6602+/-63.525, 0's: 0 Z-trim(101.7): 998 B-trim: 19 in 1/47
Lambda= 0.071960
statistics sampled from 5541 (6618) to 5541 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.491), E-opt: 0.2 (0.203), width: 16
Scan time: 3.500
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 769) 5416 578.3 1.6e-164
CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 5159 551.6 1.7e-156
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 5033 538.4 1.5e-152
CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12 ( 947) 2757 302.4 2.3e-81
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 2709 297.5 7.6e-80
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CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 2607 286.9 1.2e-76
CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19 ( 970) 2558 281.7 3.8e-75
CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19 ( 936) 2552 281.1 5.8e-75
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CCDS35066.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 852) 2551 280.9 5.9e-75
CCDS59136.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 854) 2551 280.9 5.9e-75
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 2542 279.9 1.1e-74
CCDS82388.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 808) 2516 277.2 7.1e-74
CCDS46161.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 924) 2516 277.3 7.6e-74
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 2515 277.2 7.8e-74
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 2515 277.2 7.8e-74
CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280) 2517 277.7 8.4e-74
CCDS77297.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 810) 2508 276.4 1.3e-73
CCDS12548.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 836) 2508 276.4 1.3e-73
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX ( 779) 2506 276.2 1.4e-73
CCDS46991.1 ZNF721 gene_id:170960|Hs108|chr4 ( 923) 2491 274.7 4.6e-73
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 2490 274.6 4.8e-73
CCDS2717.1 ZNF197 gene_id:10168|Hs108|chr3 (1029) 2486 274.3 7e-73
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 2467 272.1 2.4e-72
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 2467 272.1 2.4e-72
CCDS46212.1 ZNF814 gene_id:730051|Hs108|chr19 ( 855) 2462 271.7 3.6e-72
CCDS59368.1 ZNF729 gene_id:100287226|Hs108|chr19 (1252) 2461 271.8 4.7e-72
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 2451 270.4 7e-72
CCDS46077.1 ZNF780B gene_id:163131|Hs108|chr19 ( 833) 2448 270.2 9.6e-72
CCDS47357.2 ZFP62 gene_id:643836|Hs108|chr5 ( 867) 2447 270.1 1.1e-71
CCDS54955.1 ZFP62 gene_id:643836|Hs108|chr5 ( 900) 2447 270.1 1.1e-71
CCDS46167.1 ZNF808 gene_id:388558|Hs108|chr19 ( 903) 2435 268.9 2.6e-71
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 2427 268.2 4.9e-71
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 2414 266.6 1e-70
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 2405 265.7 2.1e-70
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 2405 265.7 2.1e-70
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 2405 265.7 2.1e-70
CCDS5527.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 783) 2379 263.0 1.3e-69
CCDS75606.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 820) 2379 263.0 1.4e-69
CCDS75605.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 852) 2379 263.0 1.4e-69
CCDS59369.1 ZNF99 gene_id:7652|Hs108|chr19 ( 864) 2355 260.6 7.9e-69
CCDS42536.1 ZNF493 gene_id:284443|Hs108|chr19 ( 774) 2321 257.0 8.6e-68
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 2272 251.8 2.9e-66
CCDS12846.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 731) 2261 250.7 6.3e-66
CCDS82387.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 736) 2261 250.7 6.3e-66
CCDS59418.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 742) 2261 250.7 6.3e-66
CCDS12412.1 ZNF493 gene_id:284443|Hs108|chr19 ( 646) 2245 248.9 1.9e-65
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 2221 246.5 1.1e-64
>>CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 (769 aa)
initn: 5416 init1: 5416 opt: 5416 Z-score: 3067.1 bits: 578.3 E(32554): 1.6e-164
Smith-Waterman score: 5416; 100.0% identity (100.0% similar) in 769 aa overlap (1-769:1-769)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MPANWTSPQKSSALAPEDHGSSYEGSVSFRDVAIDFSREEWRHLDPSQRNLYRDVMLETY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SHLLSVGYQVPEAEVVMLEQGKEPWALQGERPRQSCPGEKLWDHNQCRKILSYKQVSSQP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QKMYPGEKAYECAKFEKIFTQKSQLKVHLKVLAGEKLYVCIECGKAFVQKPEFIIHQKTH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MREKPFKCNECGKSFFQVSSLFRHQRIHTGEKLYECSQCGKGFSYNSDLSIHEKIHTGER
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 HHECTDCGKAFTQKSTLKMHQKIHTGERSYICIECGQAFIQKTHLIAHRRIHTGEKPYEC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SNCGKSFISKSQLQVHQRVHTRVKPYICTEYGKVFSNNSNLVTHKKVQSREKSSICTECG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KAFTYRSELIIHQRIHTGEKPYECSDCGKAFTQKSALTVHQRIHTGEKSYICMKCGLAFI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QKAHLIAHQIIHTGEKPHKCGHCGKLFTSKSQLHVHKRIHTGEKPYMCNKCGKAFTNRSN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LITHQKTHTGEKSYICSKCGKAFTQRSDLITHQRIHTGEKPYECNTCGKAFTQKSHLNIH
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550 560 570 580 590 600
pF1KB6 QKIHTGERQYECHECGKAFNQKSILIVHQKIHTGEKPYVCTECGRAFIRKSNFITHQRIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QKIHTGERQYECHECGKAFNQKSILIVHQKIHTGEKPYVCTECGRAFIRKSNFITHQRIH
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 TGEKPYECSDCGKSFTSKSQLLVHQPVHTGEKPYVCAECGKAFSGRSNLSKHQKTHTGEK
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670 680 690 700 710 720
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 PYICSECGKTFRQKSELITHHRIHTGEKPYECSDCGKSFTKKSQLQVHQRIHTGEKPYVC
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 AECGKAFTDRSNLNKHQTTHTGDKPYKCGICGKGFVQKSVFSVHQSSHA
730 740 750 760
>>CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 (769 aa)
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Smith-Waterman score: 5159; 94.5% identity (98.4% similar) in 769 aa overlap (1-769:1-769)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPANWTSPQKSSALAPEDHGSSYEGSVSFRDVAIDFSREEWRHLDPSQRNLYRDVMLETY
:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS12 MPASWTSPQKSSALAPEDHGSSYEGSVSFRDVAIDFSREEWRHLDLSQRNLYRDVMLETY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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:::::::::::. ::::::::::::::::::::.:::::::::::: :::..:: .:::
CCDS12 SHLLSVGYQVPKPEVVMLEQGKEPWALQGERPRHSCPGEKLWDHNQHRKIIGYKPASSQD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 QKMYPGEKAYECAKFEKIFTQKSQLKVHLKVLAGEKLYVCIECGKAFVQKPEFIIHQKTH
::.: :::.::::.: : :: :::.:::::: .:::::::::::.::::::::: :::::
CCDS12 QKIYSGEKSYECAEFGKSFTWKSQFKVHLKVPTGEKLYVCIECGRAFVQKPEFITHQKTH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 MREKPFKCNECGKSFFQVSSLFRHQRIHTGEKLYECSQCGKGFSYNSDLSIHEKIHTGER
:::::.::::::::::::::::::.::::::::::::.::::: ::::::::::::::::
CCDS12 MREKPYKCNECGKSFFQVSSLFRHHRIHTGEKLYECSECGKGFPYNSDLSIHEKIHTGER
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 HHECTDCGKAFTQKSTLKMHQKIHTGERSYICIECGQAFIQKTHLIAHRRIHTGEKPYEC
::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.::::::::.:::::::
CCDS12 HHECTDCGKAFTQKSTLKIHQKIHTGERSYICIECGQAFIQKTQLIAHRRIHSGEKPYEC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 SNCGKSFISKSQLQVHQRVHTRVKPYICTEYGKVFSNNSNLVTHKKVQSREKSSICTECG
.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:.:::::::::::::
CCDS12 NNCGKSFISKSQLQVHQRVHTRVKPYICTEYGKVFSNNSNLITHEKIQSREKSSICTECG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 KAFTYRSELIIHQRIHTGEKPYECSDCGKAFTQKSALTVHQRIHTGEKSYICMKCGLAFI
::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KAFTYRSELIIHQRIHTGEKPYECSDCGRAFTQKSALTVHQRIHTGEKSYICMKCGLAFI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 QKAHLIAHQIIHTGEKPHKCGHCGKLFTSKSQLHVHKRIHTGEKPYMCNKCGKAFTNRSN
.:::::.::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS12 RKAHLITHQIIHTGEKPYKCGHCGKLFTSKSQLHVHKRIHTGEKPYVCNKCGKAFTNRSN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 LITHQKTHTGEKSYICSKCGKAFTQRSDLITHQRIHTGEKPYECNTCGKAFTQKSHLNIH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS12 LITHQKTHTGEKSYICSKCGKAFTQRSDLITHQRIHTGEKPYECNTCGKAFTQKSNLNIH
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 QKIHTGERQYECHECGKAFNQKSILIVHQKIHTGEKPYVCTECGRAFIRKSNFITHQRIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QKIHTGERQYECHECGKAFNQKSILIVHQKIHTGEKPYVCTECGRAFIRKSNFITHQRIH
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 TGEKPYECSDCGKSFTSKSQLLVHQPVHTGEKPYVCAECGKAFSGRSNLSKHQKTHTGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TGEKPYECSDCGKSFTSKSQLLVHQPVHTGEKPYVCAECGKAFSGRSNLSKHQKTHTGEK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB6 PYICSECGKTFRQKSELITHHRIHTGEKPYECSDCGKSFTKKSQLQVHQRIHTGEKPYVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PYICSECGKTFRQKSELITHHRIHTGEKPYECSDCGKSFTKKSQLQVHQRIHTGEKPYVC
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760
pF1KB6 AECGKAFTDRSNLNKHQTTHTGDKPYKCGICGKGFVQKSVFSVHQSSHA
:::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AECGKAFSNRSNLNKHQTTHTGDKPYKCGICGKGFVQKSVFSVHQSSHA
730 740 750 760
>>CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 (714 aa)
initn: 5033 init1: 5033 opt: 5033 Z-score: 2852.5 bits: 538.4 E(32554): 1.5e-152
Smith-Waterman score: 5033; 100.0% identity (100.0% similar) in 714 aa overlap (56-769:1-714)
30 40 50 60 70 80
pF1KB6 SVSFRDVAIDFSREEWRHLDPSQRNLYRDVMLETYSHLLSVGYQVPEAEVVMLEQGKEPW
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MLETYSHLLSVGYQVPEAEVVMLEQGKEPW
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 ALQGERPRQSCPGEKLWDHNQCRKILSYKQVSSQPQKMYPGEKAYECAKFEKIFTQKSQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ALQGERPRQSCPGEKLWDHNQCRKILSYKQVSSQPQKMYPGEKAYECAKFEKIFTQKSQL
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 KVHLKVLAGEKLYVCIECGKAFVQKPEFIIHQKTHMREKPFKCNECGKSFFQVSSLFRHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KVHLKVLAGEKLYVCIECGKAFVQKPEFIIHQKTHMREKPFKCNECGKSFFQVSSLFRHQ
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 RIHTGEKLYECSQCGKGFSYNSDLSIHEKIHTGERHHECTDCGKAFTQKSTLKMHQKIHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RIHTGEKLYECSQCGKGFSYNSDLSIHEKIHTGERHHECTDCGKAFTQKSTLKMHQKIHT
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 GERSYICIECGQAFIQKTHLIAHRRIHTGEKPYECSNCGKSFISKSQLQVHQRVHTRVKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GERSYICIECGQAFIQKTHLIAHRRIHTGEKPYECSNCGKSFISKSQLQVHQRVHTRVKP
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YICTEYGKVFSNNSNLVTHKKVQSREKSSICTECGKAFTYRSELIIHQRIHTGEKPYECS
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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CCDS12 LFTSKSQLHVHKRIHTGEKPYMCNKCGKAFTNRSNLITHQKTHTGEKSYICSKCGKAFTQ
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CCDS12 RSDLITHQRIHTGEKPYECNTCGKAFTQKSHLNIHQKIHTGERQYECHECGKAFNQKSIL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IVHQKIHTGEKPYVCTECGRAFIRKSNFITHQRIHTGEKPYECSDCGKSFTSKSQLLVHQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PVHTGEKPYVCAECGKAFSGRSNLSKHQKTHTGEKPYICSECGKTFRQKSELITHHRIHT
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CCDS12 GEKPYECSDCGKSFTKKSQLQVHQRIHTGEKPYVCAECGKAFTDRSNLNKHQTTHTGDKP
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CCDS12 YKCGICGKGFVQKSVFSVHQSSHA
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CCDS45 TVIGIKYCES----IESGKTVNKKSQLMCQQMYMGEKPFGCSCCEKAFSSKSYLLVHQQT
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...:.:::::::::::.:::: .:::::..: : ::: :.::: : : :: :: :.
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pF1KB6 KAYECAKFEKIFTQKSQLKVHLKVLAGEKLYVCIECGKAFVQKPEFIIHQKTHMREKPFK
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CCDS59 CKECGKSFTFHSALIRHQRIHTGEKPYDCKECGKSFTFRSGLIGHQAIHTGEKPYDCKEC
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CCDS59 GKSFTAGSTLIQHQRIHTGEKPYDCKECGKSFASGSALLQHQRIHTGEKPYCCKECGKSF
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CCDS59 CKECGKSFTSHSTLIQHQPLHTGEKPYHCKECGKSFTLRSALIQHRPVHTGEKRYSCKEC
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CCDS59 RRRSKLTQHQRIHTGEKPYRCHECGKAFVRFSGLTKHHSIHTGEKPYECKTCGKSFRQRT
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pF1KB6 THTGEKSYICSKCGKAFTQRSDLITHQRIHTGEKPYECNTCGKAFTQKSHLNIHQKIHTG
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CCDS59 IHTGEKPYRCHECGKAFVRFSGLTKHHSIHTGEKPYECKTCGKSFRQRTHLTLHQRIHTG
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CCDS59 DRPYECKECGKSFTCGSELIRHQRTHTGEKPYDCKECGKAFRCPSQLSQHKRIHTGEKTY
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CCDS59 QCPECGKAFFYASGLSRHQSVHTGEKPYECKTCGKAFKQLTQLTRHQRIHDLT
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CCDS42 VLLRKYEKCGHENLQLRKGCKSVDECKVHKEGYNKLNQCLT----TAQSKVFQCGKYLKV
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CCDS42 FYKFLNSNRHTIRHTGKKCFKCKKCVKSFCIRLHKTQHKCVYITEKSCKCKECEKTFHWS
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CCDS42 STLTNHKEIHTEDKPYKCEECGKAFKQLSTLTTHKIICAKEKIYKCEECGKAFLWSSTLT
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CCDS42 IHTGEKPYKCKECGKAFSNSSTLANHKITHTEEKPYKCKECDKAFKRLSTLTKHKIIHAG
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CCDS42 EKLYKCEECGKAFNRSSNLTIHKFIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSSLTKHKRFHTREKPF
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pF1KB6 MCNKCGKAFTNRSNLITHQKTHTGEKSYICSKCGKAFTQRSDLITHQRIHTGEKPYECNT
CCDS42 KCKECGKAFIWSSTLTRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFRQSSTLTKHKIIHTGEKPYKFEE
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CCDS46 HMREKSFQCNESGKAFNYSSVLRKHQIIHLGAKQYKCDVCGKVFNQKRYLACHRRCHTGK
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CCDS46 KPYKCNDCGKTFSQELTLTCHHRLHTGEKHYKCSECGKTFSRNSALVIHKAIHTGEKSYK
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CCDS46 CNECGKTFSQTSYLVYHRRLHTGEKPYKCEECDKAFSFKSNLERHRKIHTGEKPYKCNEC
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CCDS46 SRTFSRKSSLTRHRRLHTGEKPYKCNDCGKTFSQMSSLVYHRRLHTGEKPYKCEECDEAF
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CCDS46 SFKSNLERHRRIHTGEKPYKCNDCGKTFSQTSSLVYHRRLHTGEKPYKCEECDEAFSFKS
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CCDS46 NLERHRIIHTGEKLYKCNECGKTFSRKSSLTRHCRLHTGEKPYQCNECGKAFRGQSALIY
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