FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB6264, 769 aa 1>>>pF1KB6264 769 - 769 aa - 769 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1532+/-0.00245; mu= 13.2858+/- 0.144 mean_var=317.6602+/-63.525, 0's: 0 Z-trim(101.7): 998 B-trim: 19 in 1/47 Lambda= 0.071960 statistics sampled from 5541 (6618) to 5541 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.491), E-opt: 0.2 (0.203), width: 16 Scan time: 3.500 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 769) 5416 578.3 1.6e-164 CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 5159 551.6 1.7e-156 CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 5033 538.4 1.5e-152 CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12 ( 947) 2757 302.4 2.3e-81 CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 2709 297.5 7.6e-80 CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 2709 297.5 7.7e-80 CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 2607 286.9 1.2e-76 CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 2607 286.9 1.2e-76 CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19 ( 970) 2558 281.7 3.8e-75 CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19 ( 936) 2552 281.1 5.8e-75 CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 816) 2551 280.9 5.8e-75 CCDS35066.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 852) 2551 280.9 5.9e-75 CCDS59136.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 854) 2551 280.9 5.9e-75 CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 2542 279.9 1.1e-74 CCDS82388.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 808) 2516 277.2 7.1e-74 CCDS46161.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 924) 2516 277.3 7.6e-74 CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 2515 277.2 7.8e-74 CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 2515 277.2 7.8e-74 CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280) 2517 277.7 8.4e-74 CCDS77297.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 810) 2508 276.4 1.3e-73 CCDS12548.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 836) 2508 276.4 1.3e-73 CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX ( 779) 2506 276.2 1.4e-73 CCDS46991.1 ZNF721 gene_id:170960|Hs108|chr4 ( 923) 2491 274.7 4.6e-73 CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 2490 274.6 4.8e-73 CCDS2717.1 ZNF197 gene_id:10168|Hs108|chr3 (1029) 2486 274.3 7e-73 CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 2467 272.1 2.4e-72 CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 2467 272.1 2.4e-72 CCDS46212.1 ZNF814 gene_id:730051|Hs108|chr19 ( 855) 2462 271.7 3.6e-72 CCDS59368.1 ZNF729 gene_id:100287226|Hs108|chr19 (1252) 2461 271.8 4.7e-72 CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 2451 270.4 7e-72 CCDS46077.1 ZNF780B gene_id:163131|Hs108|chr19 ( 833) 2448 270.2 9.6e-72 CCDS47357.2 ZFP62 gene_id:643836|Hs108|chr5 ( 867) 2447 270.1 1.1e-71 CCDS54955.1 ZFP62 gene_id:643836|Hs108|chr5 ( 900) 2447 270.1 1.1e-71 CCDS46167.1 ZNF808 gene_id:388558|Hs108|chr19 ( 903) 2435 268.9 2.6e-71 CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 2427 268.2 4.9e-71 CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 2414 266.6 1e-70 CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 2405 265.7 2.1e-70 CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 2405 265.7 2.1e-70 CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 2405 265.7 2.1e-70 CCDS5527.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 783) 2379 263.0 1.3e-69 CCDS75606.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 820) 2379 263.0 1.4e-69 CCDS75605.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 852) 2379 263.0 1.4e-69 CCDS59369.1 ZNF99 gene_id:7652|Hs108|chr19 ( 864) 2355 260.6 7.9e-69 CCDS42536.1 ZNF493 gene_id:284443|Hs108|chr19 ( 774) 2321 257.0 8.6e-68 CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 2272 251.8 2.9e-66 CCDS12846.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 731) 2261 250.7 6.3e-66 CCDS82387.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 736) 2261 250.7 6.3e-66 CCDS59418.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 742) 2261 250.7 6.3e-66 CCDS12412.1 ZNF493 gene_id:284443|Hs108|chr19 ( 646) 2245 248.9 1.9e-65 CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 2221 246.5 1.1e-64 >>CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 (769 aa) initn: 5416 init1: 5416 opt: 5416 Z-score: 3067.1 bits: 578.3 E(32554): 1.6e-164 Smith-Waterman score: 5416; 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CCDS45 TVIGIKYCES----IESGKTVNKKSQLMCQQMYMGEKPFGCSCCEKAFSSKSYLLVHQQT 250 260 270 280 290 130 140 150 160 170 180 pF1KB6 YPGEKAYECAKFEKIFTQKSQLKVHLKVLAGEKLYVCIECGKAFVQKPEFIIHQKTHMRE . :: : : . : :..:: : :: .. .::::. : :: :.: . ...:::. : : CCDS45 HAEEKPYGCNECGKDFSSKSYLIVHQRIHTGEKLHECSECRKTFSFHSQLVIHQRIHTGE 300 310 320 330 340 350 190 200 210 220 230 240 pF1KB6 KPFKCNECGKSFFQVSSLFRHQRIHTGEKLYECSQCGKGFSYNSDLSIHEKIHTGERHHE .:..: :::: : . ..: ::. :.:.: : :..:::.:. .:.: :::.:::::. .: CCDS45 NPYECCECGKVFSRKDQLVSHQKTHSGQKPYVCNECGKAFGLKSQLIIHERIHTGEKPYE 360 370 380 390 400 410 250 260 270 280 290 300 pF1KB6 CTDCGKAFTQKSTLKMHQKIHTGERSYICIECGQAFIQKTHLIAHRRIHTGEKPYECSNC :..: :::. ::.: .::. ::::. :.: .::.:: :..::.:. :::: ::: : .: CCDS45 CNECQKAFNTKSNLMVHQRTHTGEKPYVCSDCGKAFTFKSQLIVHQGIHTGVKPYGCIQC 420 430 440 450 460 470 310 320 330 340 350 360 pF1KB6 GKSFISKSQLQVHQRVHTRVKPYICTEYGKVFSNNSNLVTHKKVQSREKSSICTECGKAF ::.: :::: :::: :: .:::.:.: ::.: ..: :. : .... :: :..::::: CCDS45 GKGFSLKSQLIVHQRSHTGMKPYVCNECGKAFRSKSYLIIHTRTHTGEKLHECNNCGKAF 480 490 500 510 520 530 370 380 390 400 410 420 pF1KB6 TYRSELIIHQRIHTGEKPYECSDCGKAFTQKSALTVHQRIHTGEKSYICMKCGLAFIQKA ...:.:::::::::::.:::: .:::::..: : ::: :.::: : : :: :: :. 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CCDS74 RNLAFLGICPHFPQDFWPEQSMED-SFQKVLLRKYEKCGHENLQLRKGCKSVDECKVHKE 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KB6 QVSSQPQKMYPGE-KAYECAKFEKIFTQKSQLKVHLKVLAGEKLYVCIECGKAFVQKPEF .. : . .. :...:.:. :.: . . . : .:.: . : .: :.: . . CCDS74 GYNKLNQCLTTAQSKVFQCGKYLKVFYKFLNSNRHTIRHTGKKCFKCKKCVKSFCIRLHK 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB6 IIHQKTHMREKPFKCNECGKSFFQVSSLFRHQRIHTGEKLYECSQCGKGFSYNSDLSIHE :. ... :: ::.:: :.: :.: :..::: .: :.: .:::.:. : :. :. CCDS74 TQHKCVYITEKSCKCKECEKTFHWSSTLTNHKEIHTEDKPYKCEECGKAFKQLSTLTTHK 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB6 KIHTGERHHECTDCGKAFTQKSTLKMHQKIHTGERSYICIECGQAFIQKTHLIAHRRIHT : . :. ..: .::::: .::: :..:::::. : : :::.:: ... : :.:::: CCDS74 IICAKEKIYKCEECGKAFLWSSTLTRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSHSSTLAKHKRIHT 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KB6 GEKPYECSNCGKSFISKSQLQVHQRVHTRVKPYICTEYGKVFSNNSNLVTHKKVQSREKS :::::.: .:::.: .: : :.:.:: ::: : : ::.:::.:.:..:: ....:: CCDS74 GEKPYKCEECGKAFSRSSTLAKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFSNSSTLANHKITHTEEKP 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KB6 SICTECGKAFTYRSELIIHQRIHTGEKPYECSDCGKAFTQKSALTVHQRIHTGEKSYICM : :: ::: : : :. ::.::: :.: .:::::...: ::.:. :::::: : : CCDS74 YKCKECDKAFKRLSTLTKHKIIHAGEKLYKCEECGKAFNRSSNLTIHKFIHTGEKPYKCE 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KB6 KCGLAFIQKAHLIAHQIIHTGEKPHKCGHCGKLFTSKSQLHVHKRIHTGEKPYMCNKCGK CCDS74 ECGKAFNWSSSLTKHKRFHTREKPFKCKECGKAFIWSSTLTRHKRIHTGEKPYKCEECGK 410 420 430 440 450 460 >>CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191 aa) initn: 17444 init1: 2570 opt: 2607 Z-score: 1489.3 bits: 286.9 E(32554): 1.2e-76 Smith-Waterman score: 2607; 52.4% identity (75.0% similar) in 691 aa overlap (79-768:438-1128) 50 60 70 80 90 100 pF1KB6 RNLYRDVMLETYSHLLSVGYQVPEAEVVMLEQGKE-PWALQGERPRQSCPGEKLWDHNQC : :: :. . . .. :: . ..: CCDS42 CEECGKAFNRSSNLTIHKFIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSSLTKHKRFHTREKPFKCKEC 410 420 430 440 450 460 110 120 130 140 150 160 pF1KB6 RKILSYKQVSSQPQKMYPGEKAYECAKFEKIFTQKSQLKVHLKVLAGEKLYVCIECGKAF : . .... .. .... ::: :.: . : : :.: : : . .::: : :::::: CCDS42 GKAFIWSSTLTRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFRQSSTLTKHKIIHTGEKPYKFEECGKAF 470 480 490 500 510 520 170 180 190 200 210 220 pF1KB6 VQKPEFIIHQKTHMREKPFKCNECGKSFFQVSSLFRHQRIHTGEKLYECSQCGKGFSYNS :. . :. : ::::.::.::::.: : :.: :. ::.:.:::.: .:::.:...: CCDS42 RQSLTLNKHKIIHSREKPYKCKECGKAFKQFSTLTTHKIIHAGKKLYKCEECGKAFNHSS 530 540 550 560 570 580 230 240 250 260 270 280 pF1KB6 DLSIHEKIHTGERHHECTDCGKAFTQKSTLKMHQKIHTGERSYICIECGQAFIQKTHLIA .:: :. :::::. ..: .::::: .:::. :..:::::. : : :::.:: ... : CCDS42 SLSTHKIIHTGEKSYKCEECGKAFLWSSTLRRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSHSSALAK 590 600 610 620 630 640 290 300 310 320 330 340 pF1KB6 HRRIHTGEKPYECSNCGKSFISKSQLQVHQRVHTRVKPYICTEYGKVFSNNSNLVTHKKV :.:::::::::.:..:::.: ..: : :. .::. ::: : : :.:. :.:. :: . 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CCDS42 TLTRHTRMHTGEKPYKCEECGKAFNRSSKLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFISSSTLNG 1010 1020 1030 1040 1050 1060 710 720 730 740 750 760 pF1KB6 HQRIHTGEKPYVCAECGKAFTDRSNLNKHQTTHTGDKPYKCGICGKGFVQKSVFSVHQSS :.:::: :::: : ::::::.. :.:..:. :::.:::::: :::.: ..:... :. CCDS42 HKRIHTREKPYKCEECGKAFSQSSTLTRHKRLHTGEKPYKCGECGKAFKESSALTKHKII 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KB6 HA : CCDS42 HTGEKPYKCEKCGKAFNQSSILTNHKKIHTITPVIPLLWEAEAGGSRGQEMETILANTVK 1130 1140 1150 1160 1170 1180 >-- initn: 1035 init1: 1035 opt: 1040 Z-score: 610.1 bits: 124.3 E(32554): 1.2e-27 Smith-Waterman score: 1154; 41.2% identity (65.6% similar) in 439 aa overlap (16-440:2-436) 10 20 30 40 50 60 pF1KB6 MPANWTSPQKSSALAPEDHGSSYEGSVSFRDVAIDFSREEWRHLDPSQRNLYRDVMLETY : :: : ..::::::.:: :::. :: .:.::::.::::.: CCDS42 MPGTPGSLEMGLLTFRDVAIEFSPEEWQCLDTAQQNLYRNVMLENY 10 20 30 40 70 80 90 100 pF1KB6 SHLLSVGYQVPEAEVV-MLEQGKEPWALQG----ERPRQSCPG--EKLWDH----NQCRK .: .: . . ... .:::::::: .. ..: :: . .: . .. .: CCDS42 RNLAFLGIALSKPDLITYLEQGKEPWNMKQHEMVDEPTGICPHFPQDFWPEQSMEDSFQK 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KB6 IL--SYKQVSSQPQKMYPGEKAY-ECAKFEKIFTQKSQLKVHLKVLAGEKLYVCIECGKA .: .:.. . . .. : :. :: .. ... .: . : :.. : . :. CCDS42 VLLRKYEKCGHENLQLRKGCKSVDECKVHKEGYNKLNQCLT----TAQSKVFQCGKYLKV 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KB6 FVQKPEFIIHQKTHMREKPFKCNECGKSFFQVSSLFRHQRIHTGEKLYECSQCGKGFSYN : . . : : .: :::..: ::: .:. .. :: .:..: : : .. CCDS42 FYKFLNSNRHTIRHTGKKCFKCKKCVKSFCIRLHKTQHKCVYITEKSCKCKECEKTFHWS 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KB6 SDLSIHEKIHTGERHHECTDCGKAFTQKSTLKMHQKIHTGERSYICIECGQAFIQKTHLI : :. :..::: .. ..: .::::: : ::: :. : . :. : : :::.::. .. : CCDS42 STLTNHKEIHTEDKPYKCEECGKAFKQLSTLTTHKIICAKEKIYKCEECGKAFLWSSTLT 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KB6 AHRRIHTGEKPYECSNCGKSFISKSQLQVHQRVHTRVKPYICTEYGKVFSNNSNLVTHKK :.:::::::::.: .:::.: .: : :.:.:: ::: : : ::.:: .:.:. ::. CCDS42 RHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSHSSTLAKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSRSSTLAKHKR 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KB6 VQSREKSSICTECGKAFTYRSELIIHQRIHTGEKPYECSDCGKAFTQKSALTVHQRIHTG ... :: : ::::::. : : :. :: ::::.:..: ::: . :.:: :. ::.: CCDS42 IHTGEKPYKCKECGKAFSNSSTLANHKITHTEEKPYKCKECDKAFKRLSTLTKHKIIHAG 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KB6 EKSYICMKCGLAFIQKAHLIAHQIIHTGEKPHKCGHCGKLFTSKSQLHVHKRIHTGEKPY :: : : .:: :: ....: :..:::::::.:: CCDS42 EKLYKCEECGKAFNRSSNLTIHKFIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSSLTKHKRFHTREKPF 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KB6 MCNKCGKAFTNRSNLITHQKTHTGEKSYICSKCGKAFTQRSDLITHQRIHTGEKPYECNT CCDS42 KCKECGKAFIWSSTLTRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFRQSSTLTKHKIIHTGEKPYKFEE 470 480 490 500 510 520 >>CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19 (970 aa) initn: 17068 init1: 2558 opt: 2558 Z-score: 1462.6 bits: 281.7 E(32554): 3.8e-75 Smith-Waterman score: 2592; 50.2% identity (76.9% similar) in 671 aa overlap (98-768:239-909) 70 80 90 100 110 120 pF1KB6 YQVPEAEVVMLEQGKEPWALQGERPRQSCPGEKLWDHNQCRKILSYKQVSSQPQKMYPGE : : . . : :... :. . .. . :. 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