Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6278
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6278, 781 aa
1>>>pF1KB6278 781 - 781 aa - 781 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5621+/-0.00116; mu= 2.2188+/- 0.068
mean_var=390.5247+/-85.937, 0's: 0 Z-trim(111.4): 739 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.064901
statistics sampled from 11508 (12337) to 11508 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.702), E-opt: 0.2 (0.379), width: 16
Scan time: 3.350
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2254.1 SP3 gene_id:6670|Hs108|chr2 ( 781) 5109 493.6 5e-139
CCDS46452.1 SP3 gene_id:6670|Hs108|chr2 ( 713) 4651 450.7 3.8e-126
CCDS44898.1 SP1 gene_id:6667|Hs108|chr12 ( 778) 1589 164.1 8.1e-40
CCDS8857.1 SP1 gene_id:6667|Hs108|chr12 ( 785) 1589 164.1 8.2e-40
CCDS5373.1 SP4 gene_id:6671|Hs108|chr7 ( 784) 1048 113.4 1.4e-24
CCDS11521.2 SP2 gene_id:6668|Hs108|chr17 ( 613) 756 85.9 2.1e-16
CCDS33322.1 SP5 gene_id:389058|Hs108|chr2 ( 398) 700 80.5 6.1e-15
CCDS46453.1 SP9 gene_id:100131390|Hs108|chr2 ( 484) 661 76.9 8.7e-14
CCDS5372.1 SP8 gene_id:221833|Hs108|chr7 ( 490) 657 76.5 1.1e-13
CCDS43555.1 SP8 gene_id:221833|Hs108|chr7 ( 508) 657 76.6 1.2e-13
CCDS11520.1 SP6 gene_id:80320|Hs108|chr17 ( 376) 596 70.7 5e-12
CCDS73475.1 SP7 gene_id:121340|Hs108|chr12 ( 413) 590 70.2 7.9e-12
CCDS44897.1 SP7 gene_id:121340|Hs108|chr12 ( 431) 590 70.2 8.1e-12
>>CCDS2254.1 SP3 gene_id:6670|Hs108|chr2 (781 aa)
initn: 5109 init1: 5109 opt: 5109 Z-score: 2609.5 bits: 493.6 E(32554): 5e-139
Smith-Waterman score: 5109; 100.0% identity (100.0% similar) in 781 aa overlap (1-781:1-781)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MTAPEKPVKQEEMAALDVDSGGGGGGGGGHGEYLQQQQQHGNGAVAAAAAAQDTQPSPLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 MTAPEKPVKQEEMAALDVDSGGGGGGGGGHGEYLQQQQQHGNGAVAAAAAAQDTQPSPLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 LLAATCSKIGPPSPGDDEEEAAAAAGAPAAAGATGDLASAQLGGAPNRWEVLSATPTTIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 LLAATCSKIGPPSPGDDEEEAAAAAGAPAAAGATGDLASAQLGGAPNRWEVLSATPTTIK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 DEAGNLVQIPSAATSSGQYVLPLQNLQNQQIFSVAPGSDSSNGTVSSVQYQVIPQIQSAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 DEAGNLVQIPSAATSSGQYVLPLQNLQNQQIFSVAPGSDSSNGTVSSVQYQVIPQIQSAD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 GQQVQIGFTGSSDNGGINQESSQIQIIPGSNQTLLASGTPSANIQNLIPQTGQVQVQGVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 GQQVQIGFTGSSDNGGINQESSQIQIIPGSNQTLLASGTPSANIQNLIPQTGQVQVQGVA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 IGGSSFPGQTQVVANVPLGLPGNITFVPINSVDLDSLGLSGSSQTMTAGINADGHLINTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 IGGSSFPGQTQVVANVPLGLPGNITFVPINSVDLDSLGLSGSSQTMTAGINADGHLINTG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 QAMDSSDNSERTGERVSPDINETNTDTDLFVPTSSSSQLPVTIDSTGILQQNTNSLTTSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 QAMDSSDNSERTGERVSPDINETNTDTDLFVPTSSSSQLPVTIDSTGILQQNTNSLTTSS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 GQVHSSDLQGNYIQSPVSEETQAQNIQVSTAQPVVQHLQLQESQQPTSQAQIVQGITPQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 GQVHSSDLQGNYIQSPVSEETQAQNIQVSTAQPVVQHLQLQESQQPTSQAQIVQGITPQT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 IHGVQASGQNISQQALQNLQLQLNPGTFLIQAQTVTPSGQVTWQTFQVQGVQNLQNLQIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 IHGVQASGQNISQQALQNLQLQLNPGTFLIQAQTVTPSGQVTWQTFQVQGVQNLQNLQIQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 NTAAQQITLTPVQTLTLGQVAAGGAFTSTPVSLSTGQLPNLQTVTVNSIDSAGIQLHPGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 NTAAQQITLTPVQTLTLGQVAAGGAFTSTPVSLSTGQLPNLQTVTVNSIDSAGIQLHPGE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 NADSPADIRIKEEEPDPEEWQLSGDSTLNTNDLTHLRVQVVDEEGDQQHQEGKRLRRVAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 NADSPADIRIKEEEPDPEEWQLSGDSTLNTNDLTHLRVQVVDEEGDQQHQEGKRLRRVAC
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 TCPNCKEGGGRGTNLGKKKQHICHIPGCGKVYGKTSHLRAHLRWHSGERPFVCNWMYCGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 TCPNCKEGGGRGTNLGKKKQHICHIPGCGKVYGKTSHLRAHLRWHSGERPFVCNWMYCGK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB6 RFTRSDELQRHRRTHTGEKKFVCPECSKRFMRSDHLAKHIKTHQNKKGIHSSSTVLASVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 RFTRSDELQRHRRTHTGEKKFVCPECSKRFMRSDHLAKHIKTHQNKKGIHSSSTVLASVE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB6 AARDDTLITAGGTTLILANIQQGSVSGIGTVNTSATSNQDILTNTEIPLQLVTVSGNETM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 AARDDTLITAGGTTLILANIQQGSVSGIGTVNTSATSNQDILTNTEIPLQLVTVSGNETM
730 740 750 760 770 780
pF1KB6 E
:
CCDS22 E
>>CCDS46452.1 SP3 gene_id:6670|Hs108|chr2 (713 aa)
initn: 4651 init1: 4651 opt: 4651 Z-score: 2378.2 bits: 450.7 E(32554): 3.8e-126
Smith-Waterman score: 4651; 99.9% identity (100.0% similar) in 713 aa overlap (69-781:1-713)
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 QHGNGAVAAAAAAQDTQPSPLALLAATCSKIGPPSPGDDEEEAAAAAGAPAAAGATGDLA
.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MGPPSPGDDEEEAAAAAGAPAAAGATGDLA
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 SAQLGGAPNRWEVLSATPTTIKDEAGNLVQIPSAATSSGQYVLPLQNLQNQQIFSVAPGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SAQLGGAPNRWEVLSATPTTIKDEAGNLVQIPSAATSSGQYVLPLQNLQNQQIFSVAPGS
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 DSSNGTVSSVQYQVIPQIQSADGQQVQIGFTGSSDNGGINQESSQIQIIPGSNQTLLASG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DSSNGTVSSVQYQVIPQIQSADGQQVQIGFTGSSDNGGINQESSQIQIIPGSNQTLLASG
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 TPSANIQNLIPQTGQVQVQGVAIGGSSFPGQTQVVANVPLGLPGNITFVPINSVDLDSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TPSANIQNLIPQTGQVQVQGVAIGGSSFPGQTQVVANVPLGLPGNITFVPINSVDLDSLG
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 LSGSSQTMTAGINADGHLINTGQAMDSSDNSERTGERVSPDINETNTDTDLFVPTSSSSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LSGSSQTMTAGINADGHLINTGQAMDSSDNSERTGERVSPDINETNTDTDLFVPTSSSSQ
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 LPVTIDSTGILQQNTNSLTTSSGQVHSSDLQGNYIQSPVSEETQAQNIQVSTAQPVVQHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LPVTIDSTGILQQNTNSLTTSSGQVHSSDLQGNYIQSPVSEETQAQNIQVSTAQPVVQHL
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KB6 QLQESQQPTSQAQIVQGITPQTIHGVQASGQNISQQALQNLQLQLNPGTFLIQAQTVTPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QLQESQQPTSQAQIVQGITPQTIHGVQASGQNISQQALQNLQLQLNPGTFLIQAQTVTPS
340 350 360 370 380 390
460 470 480 490 500 510
pF1KB6 GQVTWQTFQVQGVQNLQNLQIQNTAAQQITLTPVQTLTLGQVAAGGAFTSTPVSLSTGQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GQVTWQTFQVQGVQNLQNLQIQNTAAQQITLTPVQTLTLGQVAAGGAFTSTPVSLSTGQL
400 410 420 430 440 450
520 530 540 550 560 570
pF1KB6 PNLQTVTVNSIDSAGIQLHPGENADSPADIRIKEEEPDPEEWQLSGDSTLNTNDLTHLRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PNLQTVTVNSIDSAGIQLHPGENADSPADIRIKEEEPDPEEWQLSGDSTLNTNDLTHLRV
460 470 480 490 500 510
580 590 600 610 620 630
pF1KB6 QVVDEEGDQQHQEGKRLRRVACTCPNCKEGGGRGTNLGKKKQHICHIPGCGKVYGKTSHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QVVDEEGDQQHQEGKRLRRVACTCPNCKEGGGRGTNLGKKKQHICHIPGCGKVYGKTSHL
520 530 540 550 560 570
640 650 660 670 680 690
pF1KB6 RAHLRWHSGERPFVCNWMYCGKRFTRSDELQRHRRTHTGEKKFVCPECSKRFMRSDHLAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RAHLRWHSGERPFVCNWMYCGKRFTRSDELQRHRRTHTGEKKFVCPECSKRFMRSDHLAK
580 590 600 610 620 630
700 710 720 730 740 750
pF1KB6 HIKTHQNKKGIHSSSTVLASVEAARDDTLITAGGTTLILANIQQGSVSGIGTVNTSATSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HIKTHQNKKGIHSSSTVLASVEAARDDTLITAGGTTLILANIQQGSVSGIGTVNTSATSN
640 650 660 670 680 690
760 770 780
pF1KB6 QDILTNTEIPLQLVTVSGNETME
:::::::::::::::::::::::
CCDS46 QDILTNTEIPLQLVTVSGNETME
700 710
>>CCDS44898.1 SP1 gene_id:6667|Hs108|chr12 (778 aa)
initn: 1327 init1: 644 opt: 1589 Z-score: 828.3 bits: 164.1 E(32554): 8.1e-40
Smith-Waterman score: 1680; 40.1% identity (67.3% similar) in 828 aa overlap (11-777:3-776)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MTAPEKPVKQEEMAALDVDSG-GG--GGGGGGHGEYLQQQQQHGNGAVAAAAAAQDTQPS
: :.. ...: :: ::.:.: : . : ... ... ......:..:::
CCDS44 MDEMTAVVKIEKGVGGNNGGNGNGGGAFSQARSSSTGSSSSTGGGGQESQPS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 PLALLAATCSKIGPPSPGDDEEEAAAAAGAPAAAGATG--DLASAQLGGAPNRWEVLS--
::::::::::.: :. : . . .:. .:.:: ::...::. . : :...:
CCDS44 PLALLAATCSRIESPN------ENSNNSQGPSQSGGTGELDLTATQLSQGANGWQIISSS
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160
pF1KB6 --ATPTTIKDEAGNLVQIPSAATSS-------GQYVLPLQ-NLQNQQIFSVAPGSDSSNG
::::. :...:. .. ... :: ::::. ::::::... ::
CCDS44 SGATPTS-KEQSGSSTNGSNGSESSKNRTVSGGQYVVAAAPNLQNQQVLTGLPG------
110 120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 TVSSVQYQVIPQIQSADGQQVQIGFTGSSDNGGINQESS-QIQIIPGSNQTLLASGTPSA
.. ..:::::::.:..::::.:.. ::.. ..:..: :::::::.:: .... ..
CCDS44 VMPNIQYQVIPQFQTVDGQQLQFAATGAQ----VQQDGSGQIQIIPGANQQIITNRGSGG
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 NIQNLIPQTGQ--VQVQGVAIGGSSFPGQTQVVANVPLGLPGNITFVPINSVDLDSLGLS
:: .:. : : .::.: .. . :::: :.:::..: ::::..:.:::. .: .
CCDS44 NIIAAMPNLLQQAVPLQGLA--NNVLSGQTQYVTNVPVALNGNITLLPVNSVSAATL--T
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330
pF1KB6 GSSQTMTAGINADGHLINTGQAMDSSDNSERTGERVSP-DINETNTDTDLFVPTSSSSQL
:::..: :... ...:... .: .: .. ...... : ...: .
CCDS44 PSSQAVT---------ISSSGSQESGSQPVTSGTTISSASLVSSQASSSSFFTNANSYST
280 290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 PVTIDSTGILQQNTN--SLTTSSGQVHS--SDLQGNYIQSPVSEETQAQNIQVSTAQPVV
.: .. ::.. .:. : :.:.::. . : :::. . ...:.. ..:.. .
CCDS44 TTTTSNMGIMNFTTSGSSGTNSQGQTPQRVSGLQGSDALNIQQNQTSGGSLQAGQQKEGE
330 340 350 360 370 380
400 410 420 430 440
pF1KB6 QHLQLQESQQPTSQAQIVQGITPQTIHGVQA---SGQN-----ISQQALQNLQLQLNP--
:. : :. :: : :.::: :.....:: :::. :::..::::::: :
CCDS44 QNQQTQQ-QQILIQPQLVQG--GQALQALQAAPLSGQTFTTQAISQETLQNLQLQAVPNS
390 400 410 420 430
450 460 470 480 490
pF1KB6 GTFLIQAQTVTPSGQVTWQTFQVQGVQNLQNLQIQNTAAQQITLTPVQTLTLGQ------
: ..:.. :: :.:::.:::.: :::::.:: :: :::.:.: ..:::
CCDS44 GPIIIRTPTVGPNGQVSWQTLQ------LQNLQVQNPQAQTITLAPMQGVSLGQTSSSNT
440 450 460 470 480 490
500 510 520 530 540
pF1KB6 ----VAAGGAFTSTPVSLSTGQL---PNLQTVTVNSIDSAGIQLHPGEN-----ADSPAD
.:..... . :.....:: :.:::...... ..:::.:: .. :..:.:
CCDS44 TLTPIASAASIPAGTVTVNAAQLSSMPGLQTINLSALGTSGIQVHPIQGLPLAIANAPGD
500 510 520 530 540 550
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 IRIKEEEPDPEEWQLSGDSTLNTNDLTHLRVQVVDEEG----DQQHQEGKRLRRVACTCP
. : : . . .: : . ::: : : : :.: :: :::::
CCDS44 --------HGAQLGLHGAGGDGIHDDT-----AGGEEGENSPDAQPQAGRRTRREACTCP
560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 NCKEGGGRGT-NLGKKKQHICHIPGCGKVYGKTSHLRAHLRWHSGERPFVCNWMYCGKRF
::.. :::. . :::::::::: :::::::::::::::::::.:::::.:.: ::::::
CCDS44 YCKDSEGRGSGDPGKKKQHICHIQGCGKVYGKTSHLRAHLRWHTGERPFMCTWSYCGKRF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KB6 TRSDELQRHRRTHTGEKKFVCPECSKRFMRSDHLAKHIKTHQNKKG---IHSSSTVLASV
:::::::::.:::::::::.:::: :::::::::.::::::::::: . : .:
CCDS44 TRSDELQRHKRTHTGEKKFACPECPKRFMRSDHLSKHIKTHQNKKGGPGVALSVGTLPLD
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KB6 EAARDDTLITAGGTTLILANIQQGSVSGIGTVNTSATSNQDILTNTEIPLQLVTVSGNET
.: .. :: ..:: .:. .. .: . . .:. : . :: ...:::
CCDS44 SGAGSEGSGTATPSALITTNMV--AMEAICPEGIARLANSGINVMQVADLQSINISGNGF
730 740 750 760 770
780
pF1KB6 ME
>>CCDS8857.1 SP1 gene_id:6667|Hs108|chr12 (785 aa)
initn: 1327 init1: 644 opt: 1589 Z-score: 828.3 bits: 164.1 E(32554): 8.2e-40
Smith-Waterman score: 1680; 40.1% identity (67.3% similar) in 828 aa overlap (11-777:10-783)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MTAPEKPVKQEEMAALDVDSG-GG--GGGGGGHGEYLQQQQQHGNGAVAAAAAAQDTQPS
: :.. ...: :: ::.:.: : . : ... ... ......:..:::
CCDS88 MSDQDHSMDEMTAVVKIEKGVGGNNGGNGNGGGAFSQARSSSTGSSSSTGGGGQESQPS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 PLALLAATCSKIGPPSPGDDEEEAAAAAGAPAAAGATG--DLASAQLGGAPNRWEVLS--
::::::::::.: :. : . . .:. .:.:: ::...::. . : :...:
CCDS88 PLALLAATCSRIESPN------ENSNNSQGPSQSGGTGELDLTATQLSQGANGWQIISSS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KB6 --ATPTTIKDEAGNLVQIPSAATSS-------GQYVLPLQ-NLQNQQIFSVAPGSDSSNG
::::. :...:. .. ... :: ::::. ::::::... ::
CCDS88 SGATPTS-KEQSGSSTNGSNGSESSKNRTVSGGQYVVAAAPNLQNQQVLTGLPG------
120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 TVSSVQYQVIPQIQSADGQQVQIGFTGSSDNGGINQESS-QIQIIPGSNQTLLASGTPSA
.. ..:::::::.:..::::.:.. ::.. ..:..: :::::::.:: .... ..
CCDS88 VMPNIQYQVIPQFQTVDGQQLQFAATGAQ----VQQDGSGQIQIIPGANQQIITNRGSGG
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 NIQNLIPQTGQ--VQVQGVAIGGSSFPGQTQVVANVPLGLPGNITFVPINSVDLDSLGLS
:: .:. : : .::.: .. . :::: :.:::..: ::::..:.:::. .: .
CCDS88 NIIAAMPNLLQQAVPLQGLA--NNVLSGQTQYVTNVPVALNGNITLLPVNSVSAATL--T
230 240 250 260 270
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pF1KB6 GSSQTMTAGINADGHLINTGQAMDSSDNSERTGERVSP-DINETNTDTDLFVPTSSSSQL
:::..: :... ...:... .: .: .. ...... : ...: .
CCDS88 PSSQAVT---------ISSSGSQESGSQPVTSGTTISSASLVSSQASSSSFFTNANSYST
280 290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 PVTIDSTGILQQNTN--SLTTSSGQVHS--SDLQGNYIQSPVSEETQAQNIQVSTAQPVV
.: .. ::.. .:. : :.:.::. . : :::. . ...:.. ..:.. .
CCDS88 TTTTSNMGIMNFTTSGSSGTNSQGQTPQRVSGLQGSDALNIQQNQTSGGSLQAGQQKEGE
330 340 350 360 370 380
400 410 420 430 440
pF1KB6 QHLQLQESQQPTSQAQIVQGITPQTIHGVQA---SGQN-----ISQQALQNLQLQLNP--
:. : :. :: : :.::: :.....:: :::. :::..::::::: :
CCDS88 QNQQTQQ-QQILIQPQLVQG--GQALQALQAAPLSGQTFTTQAISQETLQNLQLQAVPNS
390 400 410 420 430 440
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780
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CCDS53 LLAATCSKIG--TPGENQATGQQQIIIDPSQGLVQLQNQPQQLELVTTQLAG--NAWQLV
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CCDS53 SVQYQVIPQLQTVEGQQIQINPTSSSS---LQDLQGQIQLISAGNNQAILTAANRTASGN
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CCDS53 ILAQNLANQTVPVQIRPGVSIPLQLQTLPGTQAQVVTTLPINIGGVTLALPVINNV---A
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CCDS53 SDTLVSSADTGQYASTSASSSERTIEESQTPAATESEAQ-SSSQLQPNGMQNAQDQSNSL
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CCDS53 QQVQI-VGQPILQQIQIQQPQQ-----QIIQAIPPQSFQ-LQ-SGQTIQTIQQQPLQNVQ
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CCDS53 LQAVNPTQVLIRAPTLTPSGQISWQTVQVQNIQSLSNLQVQNAGLSQQLTITPVSSSGGT
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CCDS53 IVTSGELDSSVTEVLGSPRIVTVAAISQDSNPATPNVSTNMEEF
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780
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pF1KB6 -DTLITAGGTTLILANIQQGSVSGIGTVNTSATSNQDILTNTEIPLQLVTVSGNETME
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CCDS46 PDLILHDSGVSAARAAAAAAAAAAAAAAAASAGGKEAASGPNDS
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pF1KB6 QGITPQTIHGVQASGQNISQQALQNLQLQLNPGTFLIQAQTVTPSGQVTWQTFQVQGVQN
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pF1KB6 AGIQLHPGENADSPADIRIKEEEPD--PEEWQLSGDSTLNTNDLTHLRVQVVDEEGDQQH
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CCDS53 SSARRYSGRATCDCPNCQEAERLGPAGASLRRKGLHSCHIPGCGKVYGKTSHLKAHLRWH
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pF1KB6 SGERPFVCNWMYCGKRFTRSDELQRHRRTHTGEKKFVCPECSKRFMRSDHLAKHIKTHQN
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CCDS53 TGERPFVCNWLFCGKRFTRSDELQRHLRTHTGEKRFACPVCNKRFMRSDHLSKHVKTHSG
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CCDS53 GGGGGGSAGSGSGGKKGSDTDSEHSAAGSPPCHSPELLQPPEPGHRNGLE
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pF1KB6 QGITPQTIHGVQASGQNISQQALQNLQLQLNPGTFLIQAQTVTPSGQVTWQTFQVQGVQN
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CCDS43 SKVHTSVDGLQGIYPRVGMAHPYESWFKPSHPG--LGAAGEVGSAGASSWWDVGA-GWID
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CCDS43 VQN--PNSAAALPGSLHP---------AAGGLQTSLHSPLGGYNSDYSGLSHSAFSSGAS
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CCDS43 SHLLSPAGQHLMDGFKPVLPGSYPDSAPSPLAGAGGSMLSAGPSAPL--------GGSPR
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CCDS43 SSARRYSGRATCDCPNCQEAERLGPAGASLRRKGLHSCHIPGCGKVYGKTSHLKAHLRWH
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CCDS43 TGERPFVCNWLFCGKRFTRSDELQRHLRTHTGEKRFACPVCNKRFMRSDHLSKHVKTHSG
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: .:. .. . . : :. .:.:.
CCDS43 GGGGGGSAGSGSGGKKGSDTDSEHSAAGSPPCHSPELLQPPEPGHRNGLE
460 470 480 490 500
781 residues in 1 query sequences
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Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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