Result of FASTA (omim) for
pF1KB6278
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6278, 781 aa
1>>>pF1KB6278 781 - 781 aa - 781 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2765+/-0.000513; mu= 5.2011+/- 0.032
mean_var=549.5672+/-123.584, 0's: 0 Z-trim(118.8): 1212 B-trim: 0 in 0/59
Lambda= 0.054710
statistics sampled from 30603 (32191) to 30603 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.377), width: 16
Scan time: 10.630
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003102 (OMIM: 601804) transcription factor Sp3 ( 781) 5109 419.4 2.9e-116
NP_001166183 (OMIM: 601804) transcription factor S ( 778) 5073 416.6 2.1e-115
NP_001017371 (OMIM: 601804) transcription factor S ( 713) 4651 383.2 2.1e-105
NP_003100 (OMIM: 189906) transcription factor Sp1 ( 778) 1589 141.6 1.2e-32
XP_011536998 (OMIM: 189906) PREDICTED: transcripti ( 778) 1589 141.6 1.2e-32
NP_612482 (OMIM: 189906) transcription factor Sp1 ( 785) 1589 141.6 1.2e-32
NP_001238754 (OMIM: 189906) transcription factor S ( 737) 1436 129.5 5.2e-29
XP_005249885 (OMIM: 600540) PREDICTED: transcripti ( 767) 1048 98.9 8.8e-20
NP_001313471 (OMIM: 600540) transcription factor S ( 767) 1048 98.9 8.8e-20
NP_003103 (OMIM: 600540) transcription factor Sp4 ( 784) 1048 98.9 8.9e-20
NP_001313472 (OMIM: 600540) transcription factor S ( 471) 961 91.7 8e-18
XP_011513788 (OMIM: 600540) PREDICTED: transcripti ( 711) 833 81.9 1.1e-14
XP_005249886 (OMIM: 600540) PREDICTED: transcripti ( 706) 813 80.3 3.2e-14
NP_003101 (OMIM: 601801) transcription factor Sp2 ( 613) 756 75.7 6.8e-13
XP_011523442 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 717) 756 75.8 7.4e-13
XP_006722089 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 660) 754 75.6 7.9e-13
XP_011523445 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 660) 754 75.6 7.9e-13
XP_016880458 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 660) 754 75.6 7.9e-13
XP_006722090 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 660) 754 75.6 7.9e-13
XP_011523444 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 660) 754 75.6 7.9e-13
XP_016880457 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 660) 754 75.6 7.9e-13
XP_006722088 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 660) 754 75.6 7.9e-13
XP_006722086 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 667) 754 75.6 7.9e-13
XP_011523441 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 727) 754 75.6 8.3e-13
XP_011523440 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 760) 754 75.7 8.5e-13
XP_011523439 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 768) 754 75.7 8.5e-13
XP_011523438 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 771) 754 75.7 8.5e-13
NP_001003845 (OMIM: 609391) transcription factor S ( 398) 700 70.9 1.2e-11
XP_005246599 (OMIM: 609391) PREDICTED: transcripti ( 442) 700 71.0 1.2e-11
XP_011509461 (OMIM: 609391) PREDICTED: transcripti ( 454) 700 71.0 1.3e-11
NP_945194 (OMIM: 608306) transcription factor Sp8 ( 490) 657 67.7 1.4e-10
NP_874359 (OMIM: 608306) transcription factor Sp8 ( 508) 657 67.7 1.4e-10
NP_001245177 (OMIM: 608613) transcription factor S ( 376) 596 62.7 3.4e-09
XP_006722178 (OMIM: 608613) PREDICTED: transcripti ( 376) 596 62.7 3.4e-09
NP_954871 (OMIM: 608613) transcription factor Sp6 ( 376) 596 62.7 3.4e-09
NP_001287766 (OMIM: 606633,613849) transcription f ( 413) 590 62.3 4.9e-09
XP_011536202 (OMIM: 606633,613849) PREDICTED: tran ( 413) 590 62.3 4.9e-09
NP_690599 (OMIM: 606633,613849) transcription fact ( 431) 590 62.3 5e-09
NP_001166938 (OMIM: 606633,613849) transcription f ( 431) 590 62.3 5e-09
XP_011513791 (OMIM: 600540) PREDICTED: transcripti ( 562) 585 62.1 7.5e-09
XP_011513789 (OMIM: 600540) PREDICTED: transcripti ( 572) 585 62.1 7.6e-09
XP_016868046 (OMIM: 600540) PREDICTED: transcripti ( 661) 585 62.2 8.2e-09
NP_057079 (OMIM: 605328,612001) Krueppel-like fact ( 288) 480 53.3 1.7e-06
NP_001171187 (OMIM: 603301,610508) Krueppel-like f ( 495) 467 52.7 4.5e-06
NP_001171189 (OMIM: 603301,610508) Krueppel-like f ( 495) 467 52.7 4.5e-06
NP_003588 (OMIM: 603301,610508) Krueppel-like fact ( 512) 467 52.7 4.6e-06
NP_001027453 (OMIM: 601878) Krueppel-like factor 1 ( 469) 466 52.6 4.6e-06
NP_005646 (OMIM: 601878) Krueppel-like factor 10 i ( 480) 466 52.6 4.7e-06
NP_001197 (OMIM: 602902) Krueppel-like factor 9 [H ( 244) 450 50.9 7.9e-06
NP_114124 (OMIM: 606139) Krueppel-like factor 16 [ ( 252) 446 50.6 1e-05
>>NP_003102 (OMIM: 601804) transcription factor Sp3 isof (781 aa)
initn: 5109 init1: 5109 opt: 5109 Z-score: 2208.4 bits: 419.4 E(85289): 2.9e-116
Smith-Waterman score: 5109; 100.0% identity (100.0% similar) in 781 aa overlap (1-781:1-781)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MTAPEKPVKQEEMAALDVDSGGGGGGGGGHGEYLQQQQQHGNGAVAAAAAAQDTQPSPLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MTAPEKPVKQEEMAALDVDSGGGGGGGGGHGEYLQQQQQHGNGAVAAAAAAQDTQPSPLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 LLAATCSKIGPPSPGDDEEEAAAAAGAPAAAGATGDLASAQLGGAPNRWEVLSATPTTIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LLAATCSKIGPPSPGDDEEEAAAAAGAPAAAGATGDLASAQLGGAPNRWEVLSATPTTIK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 DEAGNLVQIPSAATSSGQYVLPLQNLQNQQIFSVAPGSDSSNGTVSSVQYQVIPQIQSAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 DEAGNLVQIPSAATSSGQYVLPLQNLQNQQIFSVAPGSDSSNGTVSSVQYQVIPQIQSAD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 GQQVQIGFTGSSDNGGINQESSQIQIIPGSNQTLLASGTPSANIQNLIPQTGQVQVQGVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 GQQVQIGFTGSSDNGGINQESSQIQIIPGSNQTLLASGTPSANIQNLIPQTGQVQVQGVA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 IGGSSFPGQTQVVANVPLGLPGNITFVPINSVDLDSLGLSGSSQTMTAGINADGHLINTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 IGGSSFPGQTQVVANVPLGLPGNITFVPINSVDLDSLGLSGSSQTMTAGINADGHLINTG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 QAMDSSDNSERTGERVSPDINETNTDTDLFVPTSSSSQLPVTIDSTGILQQNTNSLTTSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QAMDSSDNSERTGERVSPDINETNTDTDLFVPTSSSSQLPVTIDSTGILQQNTNSLTTSS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 GQVHSSDLQGNYIQSPVSEETQAQNIQVSTAQPVVQHLQLQESQQPTSQAQIVQGITPQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 GQVHSSDLQGNYIQSPVSEETQAQNIQVSTAQPVVQHLQLQESQQPTSQAQIVQGITPQT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 IHGVQASGQNISQQALQNLQLQLNPGTFLIQAQTVTPSGQVTWQTFQVQGVQNLQNLQIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 IHGVQASGQNISQQALQNLQLQLNPGTFLIQAQTVTPSGQVTWQTFQVQGVQNLQNLQIQ
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490 500 510 520 530 540
pF1KB6 NTAAQQITLTPVQTLTLGQVAAGGAFTSTPVSLSTGQLPNLQTVTVNSIDSAGIQLHPGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 NTAAQQITLTPVQTLTLGQVAAGGAFTSTPVSLSTGQLPNLQTVTVNSIDSAGIQLHPGE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 NADSPADIRIKEEEPDPEEWQLSGDSTLNTNDLTHLRVQVVDEEGDQQHQEGKRLRRVAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 NADSPADIRIKEEEPDPEEWQLSGDSTLNTNDLTHLRVQVVDEEGDQQHQEGKRLRRVAC
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 TCPNCKEGGGRGTNLGKKKQHICHIPGCGKVYGKTSHLRAHLRWHSGERPFVCNWMYCGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TCPNCKEGGGRGTNLGKKKQHICHIPGCGKVYGKTSHLRAHLRWHSGERPFVCNWMYCGK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB6 RFTRSDELQRHRRTHTGEKKFVCPECSKRFMRSDHLAKHIKTHQNKKGIHSSSTVLASVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 RFTRSDELQRHRRTHTGEKKFVCPECSKRFMRSDHLAKHIKTHQNKKGIHSSSTVLASVE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB6 AARDDTLITAGGTTLILANIQQGSVSGIGTVNTSATSNQDILTNTEIPLQLVTVSGNETM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 AARDDTLITAGGTTLILANIQQGSVSGIGTVNTSATSNQDILTNTEIPLQLVTVSGNETM
730 740 750 760 770 780
pF1KB6 E
:
NP_003 E
>>NP_001166183 (OMIM: 601804) transcription factor Sp3 i (778 aa)
initn: 4818 init1: 4818 opt: 5073 Z-score: 2193.0 bits: 416.6 E(85289): 2.1e-115
Smith-Waterman score: 5073; 99.6% identity (99.6% similar) in 781 aa overlap (1-781:1-778)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MTAPEKPVKQEEMAALDVDSGGGGGGGGGHGEYLQQQQQHGNGAVAAAAAAQDTQPSPLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
NP_001 MTAPEKPVKQEEMAALDVDSGGGGGGGGGHGEYLQQQQQHGNGAVAAAAAA---QPSPLA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 LLAATCSKIGPPSPGDDEEEAAAAAGAPAAAGATGDLASAQLGGAPNRWEVLSATPTTIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLAATCSKIGPPSPGDDEEEAAAAAGAPAAAGATGDLASAQLGGAPNRWEVLSATPTTIK
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pF1KB6 DEAGNLVQIPSAATSSGQYVLPLQNLQNQQIFSVAPGSDSSNGTVSSVQYQVIPQIQSAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DEAGNLVQIPSAATSSGQYVLPLQNLQNQQIFSVAPGSDSSNGTVSSVQYQVIPQIQSAD
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pF1KB6 GQQVQIGFTGSSDNGGINQESSQIQIIPGSNQTLLASGTPSANIQNLIPQTGQVQVQGVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GQQVQIGFTGSSDNGGINQESSQIQIIPGSNQTLLASGTPSANIQNLIPQTGQVQVQGVA
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250 260 270 280 290 300
pF1KB6 IGGSSFPGQTQVVANVPLGLPGNITFVPINSVDLDSLGLSGSSQTMTAGINADGHLINTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IGGSSFPGQTQVVANVPLGLPGNITFVPINSVDLDSLGLSGSSQTMTAGINADGHLINTG
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 QAMDSSDNSERTGERVSPDINETNTDTDLFVPTSSSSQLPVTIDSTGILQQNTNSLTTSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QAMDSSDNSERTGERVSPDINETNTDTDLFVPTSSSSQLPVTIDSTGILQQNTNSLTTSS
300 310 320 330 340 350
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pF1KB6 GQVHSSDLQGNYIQSPVSEETQAQNIQVSTAQPVVQHLQLQESQQPTSQAQIVQGITPQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GQVHSSDLQGNYIQSPVSEETQAQNIQVSTAQPVVQHLQLQESQQPTSQAQIVQGITPQT
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 IHGVQASGQNISQQALQNLQLQLNPGTFLIQAQTVTPSGQVTWQTFQVQGVQNLQNLQIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IHGVQASGQNISQQALQNLQLQLNPGTFLIQAQTVTPSGQVTWQTFQVQGVQNLQNLQIQ
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 NTAAQQITLTPVQTLTLGQVAAGGAFTSTPVSLSTGQLPNLQTVTVNSIDSAGIQLHPGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NTAAQQITLTPVQTLTLGQVAAGGAFTSTPVSLSTGQLPNLQTVTVNSIDSAGIQLHPGE
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 NADSPADIRIKEEEPDPEEWQLSGDSTLNTNDLTHLRVQVVDEEGDQQHQEGKRLRRVAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NADSPADIRIKEEEPDPEEWQLSGDSTLNTNDLTHLRVQVVDEEGDQQHQEGKRLRRVAC
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 TCPNCKEGGGRGTNLGKKKQHICHIPGCGKVYGKTSHLRAHLRWHSGERPFVCNWMYCGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TCPNCKEGGGRGTNLGKKKQHICHIPGCGKVYGKTSHLRAHLRWHSGERPFVCNWMYCGK
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KB6 RFTRSDELQRHRRTHTGEKKFVCPECSKRFMRSDHLAKHIKTHQNKKGIHSSSTVLASVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RFTRSDELQRHRRTHTGEKKFVCPECSKRFMRSDHLAKHIKTHQNKKGIHSSSTVLASVE
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KB6 AARDDTLITAGGTTLILANIQQGSVSGIGTVNTSATSNQDILTNTEIPLQLVTVSGNETM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AARDDTLITAGGTTLILANIQQGSVSGIGTVNTSATSNQDILTNTEIPLQLVTVSGNETM
720 730 740 750 760 770
pF1KB6 E
:
NP_001 E
>>NP_001017371 (OMIM: 601804) transcription factor Sp3 i (713 aa)
initn: 4651 init1: 4651 opt: 4651 Z-score: 2013.4 bits: 383.2 E(85289): 2.1e-105
Smith-Waterman score: 4651; 99.9% identity (100.0% similar) in 713 aa overlap (69-781:1-713)
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 QHGNGAVAAAAAAQDTQPSPLALLAATCSKIGPPSPGDDEEEAAAAAGAPAAAGATGDLA
.:::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MGPPSPGDDEEEAAAAAGAPAAAGATGDLA
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 SAQLGGAPNRWEVLSATPTTIKDEAGNLVQIPSAATSSGQYVLPLQNLQNQQIFSVAPGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SAQLGGAPNRWEVLSATPTTIKDEAGNLVQIPSAATSSGQYVLPLQNLQNQQIFSVAPGS
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 DSSNGTVSSVQYQVIPQIQSADGQQVQIGFTGSSDNGGINQESSQIQIIPGSNQTLLASG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DSSNGTVSSVQYQVIPQIQSADGQQVQIGFTGSSDNGGINQESSQIQIIPGSNQTLLASG
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 TPSANIQNLIPQTGQVQVQGVAIGGSSFPGQTQVVANVPLGLPGNITFVPINSVDLDSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TPSANIQNLIPQTGQVQVQGVAIGGSSFPGQTQVVANVPLGLPGNITFVPINSVDLDSLG
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 LSGSSQTMTAGINADGHLINTGQAMDSSDNSERTGERVSPDINETNTDTDLFVPTSSSSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LSGSSQTMTAGINADGHLINTGQAMDSSDNSERTGERVSPDINETNTDTDLFVPTSSSSQ
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 LPVTIDSTGILQQNTNSLTTSSGQVHSSDLQGNYIQSPVSEETQAQNIQVSTAQPVVQHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LPVTIDSTGILQQNTNSLTTSSGQVHSSDLQGNYIQSPVSEETQAQNIQVSTAQPVVQHL
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KB6 QLQESQQPTSQAQIVQGITPQTIHGVQASGQNISQQALQNLQLQLNPGTFLIQAQTVTPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QLQESQQPTSQAQIVQGITPQTIHGVQASGQNISQQALQNLQLQLNPGTFLIQAQTVTPS
340 350 360 370 380 390
460 470 480 490 500 510
pF1KB6 GQVTWQTFQVQGVQNLQNLQIQNTAAQQITLTPVQTLTLGQVAAGGAFTSTPVSLSTGQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GQVTWQTFQVQGVQNLQNLQIQNTAAQQITLTPVQTLTLGQVAAGGAFTSTPVSLSTGQL
400 410 420 430 440 450
520 530 540 550 560 570
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