Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6279
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6279, 794 aa
1>>>pF1KB6279 794 - 794 aa - 794 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0886+/-0.00154; mu= 3.1444+/- 0.091
mean_var=263.7784+/-56.254, 0's: 0 Z-trim(106.4): 893 B-trim: 126 in 1/49
Lambda= 0.078969
statistics sampled from 7967 (8941) to 7967 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.612), E-opt: 0.2 (0.275), width: 16
Scan time: 4.010
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3031.1 ZNF148 gene_id:7707|Hs108|chr3 ( 794) 5216 608.9 1e-173
CCDS60384.1 ZNF281 gene_id:23528|Hs108|chr1 ( 859) 715 96.2 2.5e-19
CCDS1402.1 ZNF281 gene_id:23528|Hs108|chr1 ( 895) 715 96.2 2.5e-19
CCDS44896.1 ZNF740 gene_id:283337|Hs108|chr12 ( 193) 460 66.5 4.7e-11
>>CCDS3031.1 ZNF148 gene_id:7707|Hs108|chr3 (794 aa)
initn: 5216 init1: 5216 opt: 5216 Z-score: 3232.3 bits: 608.9 E(32554): 1e-173
Smith-Waterman score: 5216; 100.0% identity (100.0% similar) in 794 aa overlap (1-794:1-794)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MNIDDKLEGLFLKCGGIDEMQSSRTMVVMGGVSGQSTVSGELQDSVLQDRSMPHQEILAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MNIDDKLEGLFLKCGGIDEMQSSRTMVVMGGVSGQSTVSGELQDSVLQDRSMPHQEILAA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 DEVLQESEMRQQDMISHDELMVHEETVKNDEEQMETHERLPQGLQYALNVPISVKQEITF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DEVLQESEMRQQDMISHDELMVHEETVKNDEEQMETHERLPQGLQYALNVPISVKQEITF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 TDVSEQLMRDKKQIREPVDLQKKKKRKQRSPAKILTINEDGSLGLKTPKSHVCEHCNAAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 TDVSEQLMRDKKQIREPVDLQKKKKRKQRSPAKILTINEDGSLGLKTPKSHVCEHCNAAF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 RTNYHLQRHVFIHTGEKPFQCSQCDMRFIQKYLLQRHEKIHTGEKPFRCDECGMRFIQKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RTNYHLQRHVFIHTGEKPFQCSQCDMRFIQKYLLQRHEKIHTGEKPFRCDECGMRFIQKY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 HMERHKRTHSGEKPYQCEYCLQYFSRTDRVLKHKRMCHENHDKKLNRCAIKGGLLTSEED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 HMERHKRTHSGEKPYQCEYCLQYFSRTDRVLKHKRMCHENHDKKLNRCAIKGGLLTSEED
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 SGFSTSPKDNSLPKKKRQKTEKKSSGMDKESALDKSDLKKDKNDYLPLYSSSTKVKDEYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SGFSTSPKDNSLPKKKRQKTEKKSSGMDKESALDKSDLKKDKNDYLPLYSSSTKVKDEYM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 VAEYAVEMPHSSVGGSHLEDASGEIHPPKLVLKKINSKRSLKQPLEQNQTISPLSTYEES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VAEYAVEMPHSSVGGSHLEDASGEIHPPKLVLKKINSKRSLKQPLEQNQTISPLSTYEES
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 KVSKYAFELVDKQALLDSEGNADIDQVDNLQEGPSKPVHSSTNYDDAMQFLKKKRYLQAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 KVSKYAFELVDKQALLDSEGNADIDQVDNLQEGPSKPVHSSTNYDDAMQFLKKKRYLQAA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 SNNSREYALNVGTIASQPSVTQAAVASVIDESTTASILESQALNVEIKSNHDKNVIPDEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SNNSREYALNVGTIASQPSVTQAAVASVIDESTTASILESQALNVEIKSNHDKNVIPDEV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 LQTLLDHYSHKANGQHEISFSVADTEVTSSISINSSEVPEVTPSENVGSSSQASSSDKAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LQTLLDHYSHKANGQHEISFSVADTEVTSSISINSSEVPEVTPSENVGSSSQASSSDKAN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 MLQEYSKFLQQALDRTSQNDAYLNSPSLNFVTDNQTLPNQPAFSSIDKQVYATMPINSFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MLQEYSKFLQQALDRTSQNDAYLNSPSLNFVTDNQTLPNQPAFSSIDKQVYATMPINSFR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB6 SGMNSPLRTTPDKSHFGLIVGDSQHSFPFSGDETNHASATSTQDFLDQVTSQKKAEAQPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SGMNSPLRTTPDKSHFGLIVGDSQHSFPFSGDETNHASATSTQDFLDQVTSQKKAEAQPV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB6 HQAYQMSSFEQPFRAPYHGSRAGIATQFSTANGQVNLRGPGTSAEFSEFPLVNVNDNRAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 HQAYQMSSFEQPFRAPYHGSRAGIATQFSTANGQVNLRGPGTSAEFSEFPLVNVNDNRAG
730 740 750 760 770 780
790
pF1KB6 MTSSPDATTGQTFG
::::::::::::::
CCDS30 MTSSPDATTGQTFG
790
>>CCDS60384.1 ZNF281 gene_id:23528|Hs108|chr1 (859 aa)
initn: 951 init1: 679 opt: 715 Z-score: 460.6 bits: 96.2 E(32554): 2.5e-19
Smith-Waterman score: 1369; 40.7% identity (68.5% similar) in 615 aa overlap (121-728:173-749)
100 110 120 130 140
pF1KB6 EEQMETHERLPQGLQYALNVPISVKQEITFTDVSEQLMRDKKQIR-EPVDLQKKKKRKQR
:. .: :: : .: . : :::
CCDS60 ILHQHVQQQPAQHHRDVLLSSSSRTDDHHGTEEPKQDTNVKKAKRPKPESQGIKAKRKPS
150 160 170 180 190 200
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 SPAKILTINEDGSLGLKTP--KSHVCEHCNAAFRTNYHLQRHVFIHTGEKPFQCSQCDMR
. .: .. :: .. .: : :.:.::.::::..:::.:::.:::::.:::::::.:
CCDS60 ASSKPSLVG-DGEGAILSPSQKPHICDHCSAAFRSSYHLRRHVLIHTGERPFQCSQCSMG
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 FIQKYLLQRHEKIHTGEKPFRCDECGMRFIQKYHMERHKRTHSGEKPYQCEYCLQYFSRT
::::::::::::::. :::: ::.:.:.::::::::::::::::::::.:. : ::::::
CCDS60 FIQKYLLQRHEKIHSREKPFGCDQCSMKFIQKYHMERHKRTHSGEKPYKCDTCQQYFSRT
270 280 290 300 310 320
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 DRVLKHKRMCHENHDKKLNRCAIKGGLLTSEEDSGFSTSPKDNSLPKKKRQKTEKKSSGM
::.:::.: : : .::. . .:. .. . : . . .....:..
CCDS60 DRLLKHRRTCGE--------VIVKGATSAEPGSSNHTNMGNLAVLSQGNTSSSRRKTK--
330 340 350 360 370
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 DKESALDKSDLKKDKNDYLPLYSSSTKVKDEYMVAEYAVEMPHSSVGGSHLEDASGEIHP
.: :..... : : .. ...... . :.:::: : .:. . . :..
CCDS60 SKSIAIENKEQKTGK-------TNESQISNNINMQSYSVEMPTVSSSGGIIGTGIDELQK
380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KB6 --PKLVLKKINSKRSLKQPLEQNQTISPLSTYEESKVSKYAFELVDKQA-LLDSEGNADI
:::..:: . : . :. : . .::: .: : : . : .: ..
CCDS60 RVPKLIFKKGSRKNTDKNYL---NFVSPLPDIVGQK------SLSGKPSGSLGIVSNNSV
430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KB6 DQVDNLQEGPSKPVHSSTNYDDAMQFLKKKRYLQAASNNSREYALNVGTIASQPSVTQAA
. . :: .: . :.:::::::: ::.::: .::.:: ...::: ..:: :: :.:
CCDS60 ETIGLLQSTSGKQGQISSNYDDAMQFSKKRRYLPTASSNS-AFSINVGHMVSQQSVIQSA
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KB6 VASVIDESTTASILESQALNVEIKSNHDKNVIPDEVLQTLLDHYSHKANGQHEISFSVAD
.::.:. . :...:.:::.:::: :::. :::::::..::.::.:...:.: :..:.
CCDS60 GVSVLDNEAPLSLIDSSALNAEIKSCHDKSGIPDEVLQSILDQYSNKSESQKEDPFNIAE
540 550 560 570 580 590
570 580 590 600 610 620
pF1KB6 TEVTSSISINSSEVPEVTPSENVGSSSQASSSDKANMLQEYSKFLQQALDRTSQNDAYLN
.: .:.: :.. ::.. ..:. :.:::.:::::::.::::... : : ..
CCDS60 PRVDLH---TSGEHSELVQEENLSPGTQTPSNDKASMLQEYSKYLQQAFEK-STNASFTL
600 610 620 630 640 650
630 640 650 660 670 680
pF1KB6 SPSLNFVTDNQTLPNQPAFSSIDKQVYATMPIN-SFRSGMNSPLRTTPDKSHFGLIVGDS
. ...::. .. : :. : .::.:.: :.. .: ....: : .. : ::.. : :
CCDS60 GHGFQFVSLSSPLHNHTLFP--EKQIYTTSPLECGFGQSVTSVLPSSLPKPPFGMLFG-S
660 670 680 690 700
690 700 710 720 730 740
pF1KB6 QHSFPFSGDETNHASATSTQDFLDQVTSQKKAEAQPVHQAYQMSSFEQPFRAPYHGSRAG
: .. .:. ...: . : .:.. : . :::. :.. .:.: ::
CCDS60 QPGLYLSALDATHQQLTPSQELDDLIDSQKNLETS---SAFQSSSQKLTSQKEQKNLESS
710 720 730 740 750 760
750 760 770 780 790
pF1KB6 IATQFSTANGQVNLRGPGTSAEFSEFPLVNVNDNRAGMTSSPDATTGQTFG
CCDS60 TGFQIPSQELASQIDPQKDIEPRTTYQIENFAQAFGSQFKSGSRVPMTFITNSNGEVDHR
770 780 790 800 810 820
>>CCDS1402.1 ZNF281 gene_id:23528|Hs108|chr1 (895 aa)
initn: 951 init1: 679 opt: 715 Z-score: 460.3 bits: 96.2 E(32554): 2.5e-19
Smith-Waterman score: 1369; 40.7% identity (68.5% similar) in 615 aa overlap (121-728:209-785)
100 110 120 130 140
pF1KB6 EEQMETHERLPQGLQYALNVPISVKQEITFTDVSEQLMRDKKQIR-EPVDLQKKKKRKQR
:. .: :: : .: . : :::
CCDS14 ILHQHVQQQPAQHHRDVLLSSSSRTDDHHGTEEPKQDTNVKKAKRPKPESQGIKAKRKPS
180 190 200 210 220 230
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 SPAKILTINEDGSLGLKTP--KSHVCEHCNAAFRTNYHLQRHVFIHTGEKPFQCSQCDMR
. .: .. :: .. .: : :.:.::.::::..:::.:::.:::::.:::::::.:
CCDS14 ASSKPSLVG-DGEGAILSPSQKPHICDHCSAAFRSSYHLRRHVLIHTGERPFQCSQCSMG
240 250 260 270 280 290
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 FIQKYLLQRHEKIHTGEKPFRCDECGMRFIQKYHMERHKRTHSGEKPYQCEYCLQYFSRT
::::::::::::::. :::: ::.:.:.::::::::::::::::::::.:. : ::::::
CCDS14 FIQKYLLQRHEKIHSREKPFGCDQCSMKFIQKYHMERHKRTHSGEKPYKCDTCQQYFSRT
300 310 320 330 340 350
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 DRVLKHKRMCHENHDKKLNRCAIKGGLLTSEEDSGFSTSPKDNSLPKKKRQKTEKKSSGM
::.:::.: : : .::. . .:. .. . : . . .....:..
CCDS14 DRLLKHRRTCGE--------VIVKGATSAEPGSSNHTNMGNLAVLSQGNTSSSRRKTK--
360 370 380 390 400
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 DKESALDKSDLKKDKNDYLPLYSSSTKVKDEYMVAEYAVEMPHSSVGGSHLEDASGEIHP
.: :..... : : .. ...... . :.:::: : .:. . . :..
CCDS14 SKSIAIENKEQKTGK-------TNESQISNNINMQSYSVEMPTVSSSGGIIGTGIDELQK
410 420 430 440 450 460
390 400 410 420 430 440
pF1KB6 --PKLVLKKINSKRSLKQPLEQNQTISPLSTYEESKVSKYAFELVDKQA-LLDSEGNADI
:::..:: . : . :. : . .::: .: : : . : .: ..
CCDS14 RVPKLIFKKGSRKNTDKNYL---NFVSPLPDIVGQK------SLSGKPSGSLGIVSNNSV
470 480 490 500 510
450 460 470 480 490 500
pF1KB6 DQVDNLQEGPSKPVHSSTNYDDAMQFLKKKRYLQAASNNSREYALNVGTIASQPSVTQAA
. . :: .: . :.:::::::: ::.::: .::.:: ...::: ..:: :: :.:
CCDS14 ETIGLLQSTSGKQGQISSNYDDAMQFSKKRRYLPTASSNS-AFSINVGHMVSQQSVIQSA
520 530 540 550 560 570
510 520 530 540 550 560
pF1KB6 VASVIDESTTASILESQALNVEIKSNHDKNVIPDEVLQTLLDHYSHKANGQHEISFSVAD
.::.:. . :...:.:::.:::: :::. :::::::..::.::.:...:.: :..:.
CCDS14 GVSVLDNEAPLSLIDSSALNAEIKSCHDKSGIPDEVLQSILDQYSNKSESQKEDPFNIAE
580 590 600 610 620 630
570 580 590 600 610 620
pF1KB6 TEVTSSISINSSEVPEVTPSENVGSSSQASSSDKANMLQEYSKFLQQALDRTSQNDAYLN
.: .:.: :.. ::.. ..:. :.:::.:::::::.::::... : : ..
CCDS14 PRVDLH---TSGEHSELVQEENLSPGTQTPSNDKASMLQEYSKYLQQAFEK-STNASFTL
640 650 660 670 680
630 640 650 660 670 680
pF1KB6 SPSLNFVTDNQTLPNQPAFSSIDKQVYATMPIN-SFRSGMNSPLRTTPDKSHFGLIVGDS
. ...::. .. : :. : .::.:.: :.. .: ....: : .. : ::.. : :
CCDS14 GHGFQFVSLSSPLHNHTLFP--EKQIYTTSPLECGFGQSVTSVLPSSLPKPPFGMLFG-S
690 700 710 720 730 740
690 700 710 720 730 740
pF1KB6 QHSFPFSGDETNHASATSTQDFLDQVTSQKKAEAQPVHQAYQMSSFEQPFRAPYHGSRAG
: .. .:. ...: . : .:.. : . :::. :.. .:.: ::
CCDS14 QPGLYLSALDATHQQLTPSQELDDLIDSQKNLETS---SAFQSSSQKLTSQKEQKNLESS
750 760 770 780 790 800
750 760 770 780 790
pF1KB6 IATQFSTANGQVNLRGPGTSAEFSEFPLVNVNDNRAGMTSSPDATTGQTFG
CCDS14 TGFQIPSQELASQIDPQKDIEPRTTYQIENFAQAFGSQFKSGSRVPMTFITNSNGEVDHR
810 820 830 840 850 860
>>CCDS44896.1 ZNF740 gene_id:283337|Hs108|chr12 (193 aa)
initn: 464 init1: 420 opt: 460 Z-score: 311.9 bits: 66.5 E(32554): 4.7e-11
Smith-Waterman score: 496; 46.8% identity (70.1% similar) in 154 aa overlap (130-283:60-185)
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 LPQGLQYALNVPISVKQEITFTDVSEQLMRDKKQIREPVDLQKKKKRKQRSPAKILTINE
::.. :. : .. ...... :......
CCDS44 QIASKQAENGERAGSPDVLRCSSQGHRKDSDKSRSRKDDDSLSEASHSKKTVKKVVVVEQ
30 40 50 60 70 80
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 DGSLGLKTPKSHVCEHCNAAFRTNYHLQRHVFIHTGEKPFQCSQCDMRFIQKYLLQRHEK
.::. .: ::. ::::: .:::..:::.::..::::::::.:. :::::::::
CCDS44 NGSFQVKIPKNFVCEHCFGAFRSSYHLKRHILIHTGEKPFECDICDMRFIQKY-------
90 100 110 120 130 140
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 IHTGEKPFRCDECGMRFIQKYHMERHKRTHSGEKPYQCEYCLQYFSRTDRVLKHKRMCHE
:.:::::.:::::::::: : : ::::::.:.:::::.
CCDS44 ---------------------HLERHKRVHSGEKPYQCERCHQCFSRTDRLLRHKRMCQG
150 160 170 180
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 NHDKKLNRCAIKGGLLTSEEDSGFSTSPKDNSLPKKKRQKTEKKSSGMDKESALDKSDLK
..:
CCDS44 CQSKTSDGQFSL
190
794 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 14:01:13 2016 done: Sat Nov 5 14:01:13 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]