Result of FASTA (omim) for
pF1KB6285
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6285, 862 aa
1>>>pF1KB6285 862 - 862 aa - 862 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.4079+/-0.000448; mu= -2.5822+/- 0.028
mean_var=259.9694+/-52.764, 0's: 0 Z-trim(117.6): 124 B-trim: 232 in 1/59
Lambda= 0.079545
statistics sampled from 29554 (29681) to 29554 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.678), E-opt: 0.2 (0.348), width: 16
Scan time: 13.160
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005631 (OMIM: 601689,615841) transcription init ( 862) 5409 634.8 5.1e-181
NP_001280654 (OMIM: 601689,615841) transcription i ( 867) 5389 632.5 2.5e-180
XP_005258396 (OMIM: 601689,615841) PREDICTED: tran ( 625) 3830 453.5 1.4e-126
XP_011524455 (OMIM: 601689,615841) PREDICTED: tran ( 611) 3828 453.3 1.6e-126
XP_016881421 (OMIM: 601689,615841) PREDICTED: tran ( 624) 3828 453.3 1.6e-126
XP_016881422 (OMIM: 601689,615841) PREDICTED: tran ( 608) 3819 452.3 3.2e-126
NP_003176 (OMIM: 601796) transcription initiation (1085) 1210 153.0 7e-36
NP_002448 (OMIM: 158370) mucin-2 precursor [Homo s (5289) 317 50.9 0.00018
XP_011514552 (OMIM: 158371) PREDICTED: mucin-3A is (3076) 265 44.8 0.0073
XP_016867720 (OMIM: 158371) PREDICTED: mucin-3A is (3143) 265 44.8 0.0075
XP_011514551 (OMIM: 158371) PREDICTED: mucin-3A is (3245) 265 44.8 0.0077
XP_011514549 (OMIM: 158371) PREDICTED: mucin-3A is (3296) 265 44.8 0.0078
XP_011514548 (OMIM: 158371) PREDICTED: mucin-3A is (3313) 265 44.8 0.0078
NP_005951 (OMIM: 158371) mucin-3A precursor [Homo (3323) 265 44.8 0.0078
>>NP_005631 (OMIM: 601689,615841) transcription initiati (862 aa)
initn: 5409 init1: 5409 opt: 5409 Z-score: 3370.9 bits: 634.8 E(85289): 5.1e-181
Smith-Waterman score: 5409; 100.0% identity (100.0% similar) in 862 aa overlap (1-862:1-862)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPAGLTEPAGAAPPAAVSASGTVTMAPAGALPVRVESTPVALGAVTKAPVSVCVEPTASQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MPAGLTEPAGAAPPAAVSASGTVTMAPAGALPVRVESTPVALGAVTKAPVSVCVEPTASQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 PLRSPVGTLVTKVAPVSAPPKVSSGPRLPAPQIVAVKAPNTTTIQFPANLQLPPGTVLIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PLRSPVGTLVTKVAPVSAPPKVSSGPRLPAPQIVAVKAPNTTTIQFPANLQLPPGTVLIK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 SNSGPLMLVSPQQTVTRAETTSNITSRPAVPANPQTVKICTVPNSSSQLIKKVAVTPVKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SNSGPLMLVSPQQTVTRAETTSNITSRPAVPANPQTVKICTVPNSSSQLIKKVAVTPVKK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LAQIGTTVVTTVPKPSSVQSVAVPTSVVTVTPGKPLNTVTTLKPSSLGASSTPSNEPNLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LAQIGTTVVTTVPKPSSVQSVAVPTSVVTVTPGKPLNTVTTLKPSSLGASSTPSNEPNLK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 AENSAAVQINLSPTMLENVKKCKNFLAMLIKLACSGSQSPEMGQNVKKLVEQLLDAKIEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 AENSAAVQINLSPTMLENVKKCKNFLAMLIKLACSGSQSPEMGQNVKKLVEQLLDAKIEA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 EEFTRKLYVELKSSPQPHLVPFLKKSVVALRQLLPNSQSFIQQCVQQTSSDMVIATCTTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EEFTRKLYVELKSSPQPHLVPFLKKSVVALRQLLPNSQSFIQQCVQQTSSDMVIATCTTT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 VTTSPVVTTTVSSSQSEKSIIVSGATAPRTVSVQTLNPLAGPVGAKAGVVTLHSVGPTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VTTSPVVTTTVSSSQSEKSIIVSGATAPRTVSVQTLNPLAGPVGAKAGVVTLHSVGPTAA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 TGGTTAGTGLLQTSKPLVTSVANTVTTVSLQPEKPVVSGTAVTLSLPAVTFGETSGAAIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TGGTTAGTGLLQTSKPLVTSVANTVTTVSLQPEKPVVSGTAVTLSLPAVTFGETSGAAIC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 LPSVKPVVSSAGTTSDKPVIGTPVQIKLAQPGPVLSQPAGIPQAVQVKQLVVQQPSGGNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LPSVKPVVSSAGTTSDKPVIGTPVQIKLAQPGPVLSQPAGIPQAVQVKQLVVQQPSGGNE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 KQVTTISHSSTLTIQKCGQKTMPVNTIIPTSQFPPASILKQITLPGNKILSLQASPTQKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KQVTTISHSSTLTIQKCGQKTMPVNTIIPTSQFPPASILKQITLPGNKILSLQASPTQKN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 RIKENVTSCFRDEDDINDVTSMAGVNLNEENACILATNSELVGTLIQSCKDEPFLFIGAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RIKENVTSCFRDEDDINDVTSMAGVNLNEENACILATNSELVGTLIQSCKDEPFLFIGAL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB6 QKRILDIGKKHDITELNSDAVNLISQATQERLRGLLEKLTAIAQHRMTTYKASENYILCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QKRILDIGKKHDITELNSDAVNLISQATQERLRGLLEKLTAIAQHRMTTYKASENYILCS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB6 DTRSQLKFLEKLDQLEKQRKDLEEREMLLKAAKSRSNKEDPEQLRLKQKAKELQQLELAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DTRSQLKFLEKLDQLEKQRKDLEEREMLLKAAKSRSNKEDPEQLRLKQKAKELQQLELAQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB6 IQHRDANLTALAAIGPRKKRPLESGIEGLKDNLLASGTSSLTATKQLHRPRITRICLRDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 IQHRDANLTALAAIGPRKKRPLESGIEGLKDNLLASGTSSLTATKQLHRPRITRICLRDL
790 800 810 820 830 840
850 860
pF1KB6 IFCMEQEREMKYSRALYLALLK
::::::::::::::::::::::
NP_005 IFCMEQEREMKYSRALYLALLK
850 860
>>NP_001280654 (OMIM: 601689,615841) transcription initi (867 aa)
initn: 5395 init1: 3306 opt: 5389 Z-score: 3358.5 bits: 632.5 E(85289): 2.5e-180
Smith-Waterman score: 5389; 99.4% identity (99.4% similar) in 867 aa overlap (1-862:1-867)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPAGLTEPAGAAPPAAVSASGTVTMAPAGALPVRVESTPVALGAVTKAPVSVCVEPTASQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MPAGLTEPAGAAPPAAVSASGTVTMAPAGALPVRVESTPVALGAVTKAPVSVCVEPTASQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 PLRSPVGTLVTKVAPVSAPPKVSSGPRLPAPQIVAVKAPNTTTIQFPANLQLPPGTVLIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PLRSPVGTLVTKVAPVSAPPKVSSGPRLPAPQIVAVKAPNTTTIQFPANLQLPPGTVLIK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 SNSGPLMLVSPQQTVTRAETTSNITSRPAVPANPQTVKICTVPNSSSQLIKKVAVTPVKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SNSGPLMLVSPQQTVTRAETTSNITSRPAVPANPQTVKICTVPNSSSQLIKKVAVTPVKK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LAQIGTTVVTTVPKPSSVQSVAVPTSVVTVTPGKPLNTVTTLKPSSLGASSTPSNEPNLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LAQIGTTVVTTVPKPSSVQSVAVPTSVVTVTPGKPLNTVTTLKPSSLGASSTPSNEPNLK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 AENSAAVQINLSPTMLENVKKCKNFLAMLIKLACSGSQSPEMGQNVKKLVEQLLDAKIEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AENSAAVQINLSPTMLENVKKCKNFLAMLIKLACSGSQSPEMGQNVKKLVEQLLDAKIEA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 EEFTRKLYVELKSSPQPHLVPFLKKSVVALRQLLPNSQSFIQQCVQQTSSDMVIATCTTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EEFTRKLYVELKSSPQPHLVPFLKKSVVALRQLLPNSQSFIQQCVQQTSSDMVIATCTTT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 VTTSPVVTTTVSSSQSEKSIIVSGATAPRTVSVQTLNPLAGPVGAKAGVVTLHSVGPTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VTTSPVVTTTVSSSQSEKSIIVSGATAPRTVSVQTLNPLAGPVGAKAGVVTLHSVGPTAA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 TGGTTAGTGLLQTSKPLVTSVANTVTTVSLQPEKPVVSGTAVTLSLPAVTFGETSGAAIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TGGTTAGTGLLQTSKPLVTSVANTVTTVSLQPEKPVVSGTAVTLSLPAVTFGETSGAAIC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KB6 LPSVKPVVSSAGTTSDKPVIGTPVQIKLAQPGPVLSQPAGIPQAVQVKQL-----VVQQP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
NP_001 LPSVKPVVSSAGTTSDKPVIGTPVQIKLAQPGPVLSQPAGIPQAVQVKQLFSLFQVVQQP
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 SGGNEKQVTTISHSSTLTIQKCGQKTMPVNTIIPTSQFPPASILKQITLPGNKILSLQAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SGGNEKQVTTISHSSTLTIQKCGQKTMPVNTIIPTSQFPPASILKQITLPGNKILSLQAS
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KB6 PTQKNRIKENVTSCFRDEDDINDVTSMAGVNLNEENACILATNSELVGTLIQSCKDEPFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PTQKNRIKENVTSCFRDEDDINDVTSMAGVNLNEENACILATNSELVGTLIQSCKDEPFL
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KB6 FIGALQKRILDIGKKHDITELNSDAVNLISQATQERLRGLLEKLTAIAQHRMTTYKASEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FIGALQKRILDIGKKHDITELNSDAVNLISQATQERLRGLLEKLTAIAQHRMTTYKASEN
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KB6 YILCSDTRSQLKFLEKLDQLEKQRKDLEEREMLLKAAKSRSNKEDPEQLRLKQKAKELQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YILCSDTRSQLKFLEKLDQLEKQRKDLEEREMLLKAAKSRSNKEDPEQLRLKQKAKELQQ
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KB6 LELAQIQHRDANLTALAAIGPRKKRPLESGIEGLKDNLLASGTSSLTATKQLHRPRITRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LELAQIQHRDANLTALAAIGPRKKRPLESGIEGLKDNLLASGTSSLTATKQLHRPRITRI
790 800 810 820 830 840
840 850 860
pF1KB6 CLRDLIFCMEQEREMKYSRALYLALLK
:::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CLRDLIFCMEQEREMKYSRALYLALLK
850 860
>>XP_005258396 (OMIM: 601689,615841) PREDICTED: transcri (625 aa)
initn: 3828 init1: 3828 opt: 3830 Z-score: 2393.7 bits: 453.5 E(85289): 1.4e-126
Smith-Waterman score: 3830; 99.2% identity (99.5% similar) in 617 aa overlap (1-617:1-617)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPAGLTEPAGAAPPAAVSASGTVTMAPAGALPVRVESTPVALGAVTKAPVSVCVEPTASQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MPAGLTEPAGAAPPAAVSASGTVTMAPAGALPVRVESTPVALGAVTKAPVSVCVEPTASQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 PLRSPVGTLVTKVAPVSAPPKVSSGPRLPAPQIVAVKAPNTTTIQFPANLQLPPGTVLIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PLRSPVGTLVTKVAPVSAPPKVSSGPRLPAPQIVAVKAPNTTTIQFPANLQLPPGTVLIK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 SNSGPLMLVSPQQTVTRAETTSNITSRPAVPANPQTVKICTVPNSSSQLIKKVAVTPVKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SNSGPLMLVSPQQTVTRAETTSNITSRPAVPANPQTVKICTVPNSSSQLIKKVAVTPVKK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LAQIGTTVVTTVPKPSSVQSVAVPTSVVTVTPGKPLNTVTTLKPSSLGASSTPSNEPNLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LAQIGTTVVTTVPKPSSVQSVAVPTSVVTVTPGKPLNTVTTLKPSSLGASSTPSNEPNLK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 AENSAAVQINLSPTMLENVKKCKNFLAMLIKLACSGSQSPEMGQNVKKLVEQLLDAKIEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AENSAAVQINLSPTMLENVKKCKNFLAMLIKLACSGSQSPEMGQNVKKLVEQLLDAKIEA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 EEFTRKLYVELKSSPQPHLVPFLKKSVVALRQLLPNSQSFIQQCVQQTSSDMVIATCTTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EEFTRKLYVELKSSPQPHLVPFLKKSVVALRQLLPNSQSFIQQCVQQTSSDMVIATCTTT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 VTTSPVVTTTVSSSQSEKSIIVSGATAPRTVSVQTLNPLAGPVGAKAGVVTLHSVGPTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VTTSPVVTTTVSSSQSEKSIIVSGATAPRTVSVQTLNPLAGPVGAKAGVVTLHSVGPTAA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 TGGTTAGTGLLQTSKPLVTSVANTVTTVSLQPEKPVVSGTAVTLSLPAVTFGETSGAAIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TGGTTAGTGLLQTSKPLVTSVANTVTTVSLQPEKPVVSGTAVTLSLPAVTFGETSGAAIC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 LPSVKPVVSSAGTTSDKPVIGTPVQIKLAQPGPVLSQPAGIPQAVQVKQLVVQQPSGGNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LPSVKPVVSSAGTTSDKPVIGTPVQIKLAQPGPVLSQPAGIPQAVQVKQLVVQQPSGGNE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 KQVTTISHSSTLTIQKCGQKTMPVNTIIPTSQFPPASILKQITLPGNKILSLQASPTQKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KQVTTISHSSTLTIQKCGQKTMPVNTIIPTSQFPPASILKQITLPGNKILSLQASPTQKN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 RIKENVTSCFRDEDDINDVTSMAGVNLNEENACILATNSELVGTLIQSCKDEPFLFIGAL
:::::::::::. . :
XP_005 RIKENVTSCFRSCEPNNGMKMSYAV
610 620
>>XP_011524455 (OMIM: 601689,615841) PREDICTED: transcri (611 aa)
initn: 3828 init1: 3828 opt: 3828 Z-score: 2392.6 bits: 453.3 E(85289): 1.6e-126
Smith-Waterman score: 3828; 100.0% identity (100.0% similar) in 611 aa overlap (1-611:1-611)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPAGLTEPAGAAPPAAVSASGTVTMAPAGALPVRVESTPVALGAVTKAPVSVCVEPTASQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MPAGLTEPAGAAPPAAVSASGTVTMAPAGALPVRVESTPVALGAVTKAPVSVCVEPTASQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 PLRSPVGTLVTKVAPVSAPPKVSSGPRLPAPQIVAVKAPNTTTIQFPANLQLPPGTVLIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PLRSPVGTLVTKVAPVSAPPKVSSGPRLPAPQIVAVKAPNTTTIQFPANLQLPPGTVLIK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 SNSGPLMLVSPQQTVTRAETTSNITSRPAVPANPQTVKICTVPNSSSQLIKKVAVTPVKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SNSGPLMLVSPQQTVTRAETTSNITSRPAVPANPQTVKICTVPNSSSQLIKKVAVTPVKK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LAQIGTTVVTTVPKPSSVQSVAVPTSVVTVTPGKPLNTVTTLKPSSLGASSTPSNEPNLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LAQIGTTVVTTVPKPSSVQSVAVPTSVVTVTPGKPLNTVTTLKPSSLGASSTPSNEPNLK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 AENSAAVQINLSPTMLENVKKCKNFLAMLIKLACSGSQSPEMGQNVKKLVEQLLDAKIEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AENSAAVQINLSPTMLENVKKCKNFLAMLIKLACSGSQSPEMGQNVKKLVEQLLDAKIEA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 EEFTRKLYVELKSSPQPHLVPFLKKSVVALRQLLPNSQSFIQQCVQQTSSDMVIATCTTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EEFTRKLYVELKSSPQPHLVPFLKKSVVALRQLLPNSQSFIQQCVQQTSSDMVIATCTTT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 VTTSPVVTTTVSSSQSEKSIIVSGATAPRTVSVQTLNPLAGPVGAKAGVVTLHSVGPTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VTTSPVVTTTVSSSQSEKSIIVSGATAPRTVSVQTLNPLAGPVGAKAGVVTLHSVGPTAA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 TGGTTAGTGLLQTSKPLVTSVANTVTTVSLQPEKPVVSGTAVTLSLPAVTFGETSGAAIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TGGTTAGTGLLQTSKPLVTSVANTVTTVSLQPEKPVVSGTAVTLSLPAVTFGETSGAAIC
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::.:. ::::: :.: .:::: :: :: :. :. :....:. . .. . :
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:: :: :: : :.: : .. :...
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.: ..: .:::.: :: ::. .:::..:: . :::.::::::
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.:::::::.::.: :::::::::::: .::::: ::. . ::.:::.::::: ::::. :
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:: .:::.:..:::::: .::::::::::::::.:: ::::...::::::::::::::::
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..:.::. :. ... ::.. : .. ...:: . . .. . .
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..:. .. :.. : : : : : .:. :. .... . .:. .: :. .
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: ..: :.:... ...: .: :: . :: . : :. :: . . .
NP_002 TTTTTVTPTPTPTGTQSPTPTAITTTTTVTPTPTPTGTQTPTTTPITTTTTVTPTPTPTG
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: :. .: :. : .. . . :.: . .: :: ..:.: : .:
NP_002 TVTPTPTPTGTQTPTTTPITTTTTVTPTPTPTGTQTPTTTPISTTTTVTPTPTPTGTQTP
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:..: .. : :.. : . .. .::
NP_002 TSTPITTTTTVTPTPTPTGTQTPTPTPITTTTTVTPTPTPTGTQTPTSTPITTTTTVTPT
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:.. .. : :. : .: :. : .::. . . ::.. ::.:. .. .
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.:: .: : ::: . : .. ..:.: :: ..: . .: :
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]