Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6292
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6292, 789 aa
1>>>pF1KB6292 789 - 789 aa - 789 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1076+/-0.00111; mu= -1.3981+/- 0.066
mean_var=271.8359+/-56.189, 0's: 0 Z-trim(112.6): 926 B-trim: 693 in 1/50
Lambda= 0.077789
statistics sampled from 12331 (13329) to 12331 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.738), E-opt: 0.2 (0.409), width: 16
Scan time: 4.270
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5054.2 PRDM1 gene_id:639|Hs108|chr6 ( 825) 5409 621.0 2.4e-177
CCDS34505.1 PRDM1 gene_id:639|Hs108|chr6 ( 691) 4721 543.7 3.7e-154
CCDS279.2 ZNF683 gene_id:257101|Hs108|chr1 ( 504) 814 105.2 2.8e-22
CCDS76126.1 ZNF683 gene_id:257101|Hs108|chr1 ( 524) 616 83.0 1.4e-15
CCDS12975.1 ZSCAN22 gene_id:342945|Hs108|chr19 ( 491) 544 74.9 3.7e-13
CCDS41502.1 ZNF239 gene_id:8187|Hs108|chr10 ( 458) 534 73.7 7.6e-13
CCDS33048.1 ZNF235 gene_id:9310|Hs108|chr19 ( 738) 537 74.2 8.7e-13
CCDS33094.1 ZNF468 gene_id:90333|Hs108|chr19 ( 522) 532 73.5 9.8e-13
CCDS12861.1 ZNF677 gene_id:342926|Hs108|chr19 ( 584) 532 73.6 1.1e-12
CCDS12854.1 ZNF83 gene_id:55769|Hs108|chr19 ( 516) 529 73.2 1.2e-12
CCDS12946.1 ZFP28 gene_id:140612|Hs108|chr19 ( 868) 533 73.8 1.4e-12
CCDS46101.1 ZNF234 gene_id:10780|Hs108|chr19 ( 700) 526 73.0 2e-12
CCDS12637.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 907) 527 73.1 2.2e-12
CCDS54276.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 913) 527 73.1 2.2e-12
CCDS74388.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 748) 524 72.7 2.4e-12
CCDS12636.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 799) 524 72.8 2.5e-12
CCDS33047.1 ZNF233 gene_id:353355|Hs108|chr19 ( 670) 522 72.5 2.6e-12
CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 536) 519 72.1 2.7e-12
CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 592) 519 72.1 3e-12
CCDS32915.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 ( 742) 520 72.3 3.3e-12
CCDS74289.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 ( 745) 520 72.3 3.3e-12
CCDS74348.1 ZNF461 gene_id:92283|Hs108|chr19 ( 540) 516 71.8 3.5e-12
CCDS54257.1 ZNF461 gene_id:92283|Hs108|chr19 ( 563) 516 71.8 3.6e-12
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 518 72.1 4e-12
CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19 ( 970) 520 72.4 4.1e-12
CCDS33096.1 ZNF816 gene_id:125893|Hs108|chr19 ( 651) 514 71.6 4.7e-12
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 510 71.0 4.9e-12
CCDS54310.1 ZNF578 gene_id:147660|Hs108|chr19 ( 590) 511 71.2 5.5e-12
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 516 72.0 5.9e-12
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 512 71.4 6e-12
CCDS452.2 ZFP69B gene_id:65243|Hs108|chr1 ( 534) 509 71.0 6e-12
CCDS32440.1 ZNF267 gene_id:10308|Hs108|chr16 ( 743) 512 71.4 6.1e-12
CCDS58688.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 503) 507 70.7 6.6e-12
CCDS6787.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 630) 509 71.0 6.8e-12
CCDS65109.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 631) 509 71.0 6.8e-12
CCDS12212.1 ZNF177 gene_id:7730|Hs108|chr19 ( 321) 502 70.0 6.9e-12
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 507 70.7 6.9e-12
CCDS65110.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 645) 509 71.0 6.9e-12
CCDS31418.1 ZNF214 gene_id:7761|Hs108|chr11 ( 606) 508 70.9 7.1e-12
CCDS11067.1 ZFP3 gene_id:124961|Hs108|chr17 ( 502) 506 70.6 7.2e-12
CCDS58687.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 555) 507 70.7 7.2e-12
CCDS12957.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 564) 507 70.8 7.3e-12
CCDS33092.1 ZNF701 gene_id:55762|Hs108|chr19 ( 465) 505 70.5 7.3e-12
CCDS12956.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 577) 507 70.8 7.4e-12
CCDS42495.1 ZNF699 gene_id:374879|Hs108|chr19 ( 642) 508 70.9 7.5e-12
CCDS82393.1 ZNF415 gene_id:55786|Hs108|chr19 ( 325) 501 69.9 7.5e-12
CCDS12856.1 ZNF600 gene_id:162966|Hs108|chr19 ( 722) 509 71.1 7.6e-12
CCDS74468.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 616) 507 70.8 7.8e-12
CCDS12943.1 ZNF583 gene_id:147949|Hs108|chr19 ( 569) 506 70.6 7.9e-12
CCDS58686.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 629) 507 70.8 7.9e-12
>>CCDS5054.2 PRDM1 gene_id:639|Hs108|chr6 (825 aa)
initn: 5409 init1: 5409 opt: 5409 Z-score: 3297.3 bits: 621.0 E(32554): 2.4e-177
Smith-Waterman score: 5409; 99.9% identity (100.0% similar) in 789 aa overlap (1-789:37-825)
10 20 30
pF1KB6 MKMDMEDADMTLWTEAEFEEKCTYIVNDHP
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 EKRVGTTLAAPKCNSSTVRFQGLAEGTKGTMKMDMEDADMTLWTEAEFEEKCTYIVNDHP
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 WDSGADGGTSVQAEASLPRNLLFKYATNSEEVIGVMSKEYIPKGTRFGPLIGEIYTNDTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 WDSGADGGTSVQAEASLPRNLLFKYATNSEEVIGVMSKEYIPKGTRFGPLIGEIYTNDTV
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 PKNANRKYFWRIYSRGELHHFIDGFNEEKSNWMRYVNPAHSPREQNLAACQNGMNIYFYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 PKNANRKYFWRIYSRGELHHFIDGFNEEKSNWMRYVNPAHSPREQNLAACQNGMNIYFYT
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 IKPIPANQELLVWYCREFAERLHYPYPGELTMMNLTQTQSSLKQPSTEKNELCPKNVPKR
::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 IKPIPANQELLVWYCRDFAERLHYPYPGELTMMNLTQTQSSLKQPSTEKNELCPKNVPKR
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 EYSVKEILKLDSNPSKGKDLYRSNISPLTSEKDLDDFRRRGSPEMPFYPRVVYPIRAPLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 EYSVKEILKLDSNPSKGKDLYRSNISPLTSEKDLDDFRRRGSPEMPFYPRVVYPIRAPLP
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 EDFLKASLAYGIERPTYITRSPIPSSTTPSPSARSSPDQSLKSSSPHSSPGNTVSPVGPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 EDFLKASLAYGIERPTYITRSPIPSSTTPSPSARSSPDQSLKSSSPHSSPGNTVSPVGPG
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 SQEHRDSYAYLNASYGTEGLGSYPGYAPLPHLPPAFIPSYNAHYPKFLLPPYGMNCNGLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 SQEHRDSYAYLNASYGTEGLGSYPGYAPLPHLPPAFIPSYNAHYPKFLLPPYGMNCNGLS
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB6 AVSSMNGINNFGLFPRLCPVYSNLLGGGSLPHPMLNPTSLPSSLPSDGARRLLQPEHPRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 AVSSMNGINNFGLFPRLCPVYSNLLGGGSLPHPMLNPTSLPSSLPSDGARRLLQPEHPRE
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KB6 VLVPAPHSAFSFTGAAASMKDKACSPTSGSPTAGTAATAEHVVQPKATSAAMAAPSSDEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 VLVPAPHSAFSFTGAAASMKDKACSPTSGSPTAGTAATAEHVVQPKATSAAMAAPSSDEA
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KB6 MNLIKNKRNMTGYKTLPYPLKKQNGKIKYECNVCAKTFGQLSNLKVHLRVHSGERPFKCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 MNLIKNKRNMTGYKTLPYPLKKQNGKIKYECNVCAKTFGQLSNLKVHLRVHSGERPFKCQ
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KB6 TCNKGFTQLAHLQKHYLVHTGEKPHECQVCHKRFSSTSNLKTHLRLHSGEKPYQCKVCPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 TCNKGFTQLAHLQKHYLVHTGEKPHECQVCHKRFSSTSNLKTHLRLHSGEKPYQCKVCPA
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KB6 KFTQFVHLKLHKRLHTRERPHKCSQCHKNYIHLCSLKVHLKGNCAAAPAPGLPLEDLTRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 KFTQFVHLKLHKRLHTRERPHKCSQCHKNYIHLCSLKVHLKGNCAAAPAPGLPLEDLTRI
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740 750
pF1KB6 NEEIEKFDISDNADRLEDVEDDISVISVVEKEILAVVRKEKEETGLKVSLQRNMGNGLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 NEEIEKFDISDNADRLEDVEDDISVISVVEKEILAVVRKEKEETGLKVSLQRNMGNGLLS
730 740 750 760 770 780
760 770 780
pF1KB6 SGCSLYESSDLPLMKLPPSNPLPLVPVKVKQETVEPMDP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 SGCSLYESSDLPLMKLPPSNPLPLVPVKVKQETVEPMDP
790 800 810 820
>>CCDS34505.1 PRDM1 gene_id:639|Hs108|chr6 (691 aa)
initn: 4721 init1: 4721 opt: 4721 Z-score: 2881.1 bits: 543.7 E(32554): 3.7e-154
Smith-Waterman score: 4721; 99.7% identity (100.0% similar) in 689 aa overlap (101-789:3-691)
80 90 100 110 120 130
pF1KB6 IPKGTRFGPLIGEIYTNDTVPKNANRKYFWRIYSRGELHHFIDGFNEEKSNWMRYVNPAH
.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MEKIYSRGELHHFIDGFNEEKSNWMRYVNPAH
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KB6 SPREQNLAACQNGMNIYFYTIKPIPANQELLVWYCREFAERLHYPYPGELTMMNLTQTQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS34 SPREQNLAACQNGMNIYFYTIKPIPANQELLVWYCRDFAERLHYPYPGELTMMNLTQTQS
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KB6 SLKQPSTEKNELCPKNVPKREYSVKEILKLDSNPSKGKDLYRSNISPLTSEKDLDDFRRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SLKQPSTEKNELCPKNVPKREYSVKEILKLDSNPSKGKDLYRSNISPLTSEKDLDDFRRR
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 GSPEMPFYPRVVYPIRAPLPEDFLKASLAYGIERPTYITRSPIPSSTTPSPSARSSPDQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GSPEMPFYPRVVYPIRAPLPEDFLKASLAYGIERPTYITRSPIPSSTTPSPSARSSPDQS
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 LKSSSPHSSPGNTVSPVGPGSQEHRDSYAYLNASYGTEGLGSYPGYAPLPHLPPAFIPSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LKSSSPHSSPGNTVSPVGPGSQEHRDSYAYLNASYGTEGLGSYPGYAPLPHLPPAFIPSY
220 230 240 250 260 270
380 390 400 410 420 430
pF1KB6 NAHYPKFLLPPYGMNCNGLSAVSSMNGINNFGLFPRLCPVYSNLLGGGSLPHPMLNPTSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NAHYPKFLLPPYGMNCNGLSAVSSMNGINNFGLFPRLCPVYSNLLGGGSLPHPMLNPTSL
280 290 300 310 320 330
440 450 460 470 480 490
pF1KB6 PSSLPSDGARRLLQPEHPREVLVPAPHSAFSFTGAAASMKDKACSPTSGSPTAGTAATAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PSSLPSDGARRLLQPEHPREVLVPAPHSAFSFTGAAASMKDKACSPTSGSPTAGTAATAE
340 350 360 370 380 390
500 510 520 530 540 550
pF1KB6 HVVQPKATSAAMAAPSSDEAMNLIKNKRNMTGYKTLPYPLKKQNGKIKYECNVCAKTFGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HVVQPKATSAAMAAPSSDEAMNLIKNKRNMTGYKTLPYPLKKQNGKIKYECNVCAKTFGQ
400 410 420 430 440 450
560 570 580 590 600 610
pF1KB6 LSNLKVHLRVHSGERPFKCQTCNKGFTQLAHLQKHYLVHTGEKPHECQVCHKRFSSTSNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LSNLKVHLRVHSGERPFKCQTCNKGFTQLAHLQKHYLVHTGEKPHECQVCHKRFSSTSNL
460 470 480 490 500 510
620 630 640 650 660 670
pF1KB6 KTHLRLHSGEKPYQCKVCPAKFTQFVHLKLHKRLHTRERPHKCSQCHKNYIHLCSLKVHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KTHLRLHSGEKPYQCKVCPAKFTQFVHLKLHKRLHTRERPHKCSQCHKNYIHLCSLKVHL
520 530 540 550 560 570
680 690 700 710 720 730
pF1KB6 KGNCAAAPAPGLPLEDLTRINEEIEKFDISDNADRLEDVEDDISVISVVEKEILAVVRKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KGNCAAAPAPGLPLEDLTRINEEIEKFDISDNADRLEDVEDDISVISVVEKEILAVVRKE
580 590 600 610 620 630
740 750 760 770 780
pF1KB6 KEETGLKVSLQRNMGNGLLSSGCSLYESSDLPLMKLPPSNPLPLVPVKVKQETVEPMDP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KEETGLKVSLQRNMGNGLLSSGCSLYESSDLPLMKLPPSNPLPLVPVKVKQETVEPMDP
640 650 660 670 680 690
>>CCDS279.2 ZNF683 gene_id:257101|Hs108|chr1 (504 aa)
initn: 763 init1: 735 opt: 814 Z-score: 513.4 bits: 105.2 E(32554): 2.8e-22
Smith-Waterman score: 827; 39.8% identity (61.2% similar) in 405 aa overlap (299-701:111-473)
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 LPEDFLKASLAYGIERPTYITRSPIPSSTTPSPSARSSPDQSLKSSSPHSSPGNTVSPVG
:. .: :. :... . :... .:
CCDS27 DLNLCTPQPAPLGTDLQGLQEDALSMKHEPPGLQASSTDDKKFTVKYPQNKDKLGKQPER
90 100 110 120 130 140
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 PGSQEHRDSYAYLNASYGTEGLGSYPGYAPLPHLPPAFIPSYNAHYPKFLLPPYGMNCNG
: ... :.: . : . . .:: : . : . . : ::: . :
CCDS27 AGEGAPCPAFSSHNSS-SPPPLQNRKSPSPLAFCPCPPVNSISKELP-FLLHAF---YPG
150 160 170 180 190
390 400 410 420 430 440
pF1KB6 LSAVSSMNGINNFGLFPR-LCPVYSNLLGGGSLPHPMLNPT-SLPSSLPSDGARRLLQPE
. . ..: .: :: .:: ::. :: ..:: : . .: .:
CCDS27 YPLLLPPPHLFTYGALPSDQCP---HLL---MLPQDPSYPTMAMPSLLMM--VNELGHPS
200 210 220 230 240
450 460 470 480 490 500
pF1KB6 HPREVLVPAPHSAFSFTGAAASMKDKACSPTSGSPTAGTAATAEHVVQPKATSAAMAAPS
:.:.: : .::. .: : . . .: ::.: : .: ..::.:.
CCDS27 ARWETLLPYP-GAFQASGQALPSQAR-------NPGAGAAPTD----SPGLERGGMASPA
250 260 270 280 290
510 520 530 540 550 560
pF1KB6 SDEAMNLIKNKRNMTGYKTLPYPLKKQNGKIKYECNVCAKTFGQLSNLKVHLRVHSGERP
. .. ..:: .:::::::.:::: ::::.:.:.:::::::::::::::::::
CCDS27 KRVPLS------SQTGTAALPYPLKKKNGKILYECNICGKSFGQLSNLKVHLRVHSGERP
300 310 320 330 340
570 580 590 600 610 620
pF1KB6 FKCQTCNKGFTQLAHLQKHYLVHTGEKPHECQVCHKRFSSTSNLKTHLRLHSGEKPYQCK
:.: :.:.::::::::::.::::::.::.:.::::::::.:::::::::::: .:.::.
CCDS27 FQCALCQKSFTQLAHLQKHHLVHTGERPHKCSVCHKRFSSSSNLKTHLRLHSGARPFQCS
350 360 370 380 390 400
630 640 650 660 670 680
pF1KB6 VCPAKFTQFVHLKLHKRLHTRERPHKCSQCHKNYIHLCSLKVHLKGNCAAAPAPGLPLED
:: ..::: .:::::.:::. :. :. : . . : :: : : : :.
CCDS27 VCRSRFTQHIHLKLHHRLHA---PQPCGLVHTQ-LPLASLA------CLAQWHQG-ALDL
410 420 430 440 450
690 700 710 720 730 740
pF1KB6 LTRINEEIEKFDISDNADRLEDVEDDISVISVVEKEILAVVRKEKEETGLKVSLQRNMGN
.. .:. .::..
CCDS27 MAVASEKHMGYDIDEVKVSSTSQGKARAVSLSSAGTPLVMGQDQNN
460 470 480 490 500
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: ... :.: . : . . .:: : . : . . : ::: . :
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. . ..: .: :: .:: ::. :: ..:: : . .: .:
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:.:.: : .::. .: : . . .: ::.: : .: ..::.:.
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. .. ..:: .:::::::.:::: ::::.:.:.:::::::::::::::::::
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CCDS76 SSNLKTHLRLHSGARPFQCSVCRSRFTQHIHLKLHHRLHA---PQPCGLVHTQ-LPLASL
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: : : :. .. .:. .::..
CCDS76 A------CLAQWHQG-ALDLMAVASEKHMGYDIDEVKVSSTSQGKARAVSLSSAGTPLVM
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CCDS76 GQDQNN
520
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: : .: : : . : : : : : .. .: ... :: : :. :
CCDS12 ECRKMFQSASALEAHQKTHSRKTPYACSECGKAFS--RSTHLAQHQVVHTGAK--PHECK
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CCDS12 ECGKAFSRVTHLTQHQRIHTGEKPYKCGECGKTFSRSTHLTQHQRVHTGERPYECDACGK
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CCDS12 AFSQSTHLTQHQRIHTGEKPYKCDACGRAFSDCSALIRHLRIHSGEKPYQCKVCPKAFAQ
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: :.:.:: :.:.:::.: : . . .: :::.
CCDS12 SSSLIEHQRIHTGEKPYKCSDCGKAFSRSSALMVHLRIHITVLQ
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CCDS41 HTGEKPYECEECGMSFSQRSNLHIHQRVHTGERPYKCGECGKGFSQSSNLHIHRCIHTGE
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CCDS41 KPYQCYECGKGFSQSSDLRIHLRVHTGEKPYHCGKCGKGFSQSSKLLIHQRVHTGEKPYE
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::.: :.. . .:..: .
CCDS41 CSKCGKGFSQSSNLHIHQRVHKKDPR
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CCDS33 EAFNDSSSLELHKQVHLGKKSPACSTHEKDTSYSSGIPVQQSVRTGKKRYWCHECGKGFS
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CCDS33 QSSNLQTHQRVHTGEKPYTCHECGKSFNQSSHLYAHLPIHTGEKPYRCDSCGKGFSRSTD
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. . :
CCDS33 QRVHTEEKPYKCDECGKCFSLSFNLHSHQRVHTGEKPYKCEECGKGFSSASSFQSHQRVH
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CCDS33 RIHTGEKPYKCKVCDEAFAYNSYLAKHTILHTGEKPYTCNECGKVFNRLSTLARHHRLHT
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CCDS33 YKCKVCDKAFQRDSHLAQHQRVHTGEKPYKCNECGKTFGQTSSLIIHRRLHTGEKPYKCN
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CCDS33 ECGKTFSQMSSLVYHHRLHSGEKP
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CCDS12 RYAGNKYVKCFENKIGLSLQAQLAELQRFQTGEKMYECNPVEKSINSSSVSPLPPCVKNI
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CCDS12 CN-KYRKILKYPLLHTQYGRTHIREKSYKCNDCGKAFSKSSNLTNHQRIHSGQRPYKCNE
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CCDS12 CGKAFNQCSNLTRHQRVHTGEKPYQCNICGKVCSQNSNLASHQRMHTGEKPYKCNECGKA
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CCDS12 FIQRSHLWGHERIHTGEKPYKCNECDKAFAERSSLTQHKRIHTGEKPYICNECGKAFKQC
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CCDS12 THISHTYECNFVDSLFTQKEKANIGTEHYKCSERGKAFHQGLHFTIHQIIHTKETQFKCD
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. . .. :: ...: :: : :: .. ..:. :.:: :
CCDS12 ICGKIFNKKSNLASHQRIHTGEK--PYKCNECGKVFHNMSHLAQHRRIHTGEKPYKCNEC
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CCDS12 GKVFNQISHLAQHQRIHTGEKPYKCNECGKVFHQISHLAQHRTIHTGEKPYECNKCGKVF
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CCDS12 SRNSYLVQHLIIHTGEKPYRCNVCGKVFHHISHLAQHQRIHTGEKPYKCNECGKVFSHKS
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CCDS12 SLVNHWRIHTGEKPYKCNECGKVFSHKSSLVNHWRIHTGEKPYKCNECGKVFSRNSYLAQ
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]