Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6305
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6305, 258 aa
1>>>pF1KB6305 258 - 258 aa - 258 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2750+/-0.00089; mu= 14.7966+/- 0.054
mean_var=68.5966+/-13.697, 0's: 0 Z-trim(106.4): 169 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.154854
statistics sampled from 8803 (8979) to 8803 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.652), E-opt: 0.2 (0.276), width: 16
Scan time: 2.050
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8812.1 CELA1 gene_id:1990|Hs108|chr12 ( 258) 1753 400.5 5.9e-112
CCDS157.1 CELA2A gene_id:63036|Hs108|chr1 ( 269) 997 231.6 4.3e-61
CCDS30605.1 CELA2B gene_id:51032|Hs108|chr1 ( 269) 962 223.8 9.7e-59
CCDS219.1 CELA3B gene_id:23436|Hs108|chr1 ( 270) 942 219.3 2.1e-57
CCDS220.1 CELA3A gene_id:10136|Hs108|chr1 ( 270) 937 218.2 4.7e-57
CCDS156.1 CTRC gene_id:11330|Hs108|chr1 ( 268) 852 199.2 2.4e-51
CCDS10852.1 CTRL gene_id:1506|Hs108|chr16 ( 264) 617 146.7 1.5e-35
CCDS32489.1 CTRB2 gene_id:440387|Hs108|chr16 ( 263) 558 133.5 1.4e-31
CCDS32490.1 CTRB1 gene_id:1504|Hs108|chr16 ( 263) 552 132.2 3.6e-31
CCDS44881.1 TMPRSS12 gene_id:283471|Hs108|chr12 ( 348) 551 132.0 5.2e-31
CCDS34120.1 KLKB1 gene_id:3818|Hs108|chr4 ( 638) 553 132.6 6.3e-31
CCDS3847.1 F11 gene_id:2160|Hs108|chr4 ( 625) 548 131.5 1.3e-30
CCDS5279.1 PLG gene_id:5340|Hs108|chr6 ( 810) 548 131.6 1.7e-30
CCDS58185.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 ( 563) 537 129.0 6.8e-30
CCDS32993.1 HPN gene_id:3249|Hs108|chr19 ( 417) 535 128.5 7.2e-30
CCDS55788.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 ( 532) 536 128.8 7.5e-30
CCDS41721.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 ( 567) 536 128.8 7.9e-30
CCDS10431.1 TPSAB1 gene_id:7177|Hs108|chr16 ( 275) 525 126.2 2.4e-29
CCDS58790.1 TMPRSS3 gene_id:64699|Hs108|chr21 ( 453) 509 122.7 4.3e-28
CCDS83495.1 F9 gene_id:2158|Hs108|chrX ( 423) 508 122.5 4.8e-28
CCDS14666.1 F9 gene_id:2158|Hs108|chrX ( 461) 508 122.5 5.1e-28
CCDS53579.1 HABP2 gene_id:3026|Hs108|chr10 ( 534) 504 121.7 1.1e-27
CCDS7577.1 HABP2 gene_id:3026|Hs108|chr10 ( 560) 504 121.7 1.1e-27
CCDS10481.1 PRSS22 gene_id:64063|Hs108|chr16 ( 317) 499 120.4 1.5e-27
CCDS13686.1 TMPRSS3 gene_id:64699|Hs108|chr21 ( 454) 497 120.0 2.8e-27
CCDS5872.1 PRSS1 gene_id:5644|Hs108|chr7 ( 247) 493 119.0 3.1e-27
CCDS3709.1 PRSS12 gene_id:8492|Hs108|chr4 ( 875) 499 120.7 3.5e-27
CCDS76482.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 290) 485 117.2 1.2e-26
CCDS53717.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 397) 485 117.3 1.6e-26
CCDS44743.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 432) 485 117.4 1.7e-26
CCDS53716.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 435) 485 117.4 1.7e-26
CCDS31684.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 437) 485 117.4 1.7e-26
CCDS43129.2 TMPRSS7 gene_id:344805|Hs108|chr3 ( 717) 481 116.6 4.8e-26
CCDS12046.1 CFD gene_id:1675|Hs108|chr19 ( 253) 472 114.3 8.3e-26
CCDS12031.1 GZMM gene_id:3004|Hs108|chr19 ( 257) 469 113.6 1.3e-25
CCDS73251.1 OVCH2 gene_id:341277|Hs108|chr11 ( 565) 472 114.5 1.6e-25
CCDS10430.1 TPSG1 gene_id:25823|Hs108|chr16 ( 321) 468 113.5 1.9e-25
CCDS73391.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11 ( 413) 465 112.9 3.6e-25
CCDS73392.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11 ( 448) 465 112.9 3.9e-25
CCDS44735.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11 ( 457) 465 112.9 4e-25
CCDS82261.1 CFD gene_id:1675|Hs108|chr19 ( 260) 461 111.9 4.6e-25
CCDS12088.1 TMPRSS9 gene_id:360200|Hs108|chr19 (1059) 468 113.8 4.9e-25
CCDS77203.1 PRSS57 gene_id:400668|Hs108|chr19 ( 282) 457 111.0 9.2e-25
CCDS12041.1 PRSS57 gene_id:400668|Hs108|chr19 ( 283) 457 111.0 9.2e-25
CCDS13571.1 TMPRSS15 gene_id:5651|Hs108|chr21 (1019) 462 112.4 1.2e-24
CCDS33564.1 TMPRSS2 gene_id:7113|Hs108|chr21 ( 492) 457 111.1 1.5e-24
CCDS54486.1 TMPRSS2 gene_id:7113|Hs108|chr21 ( 529) 457 111.2 1.5e-24
CCDS74856.1 TMPRSS6 gene_id:164656|Hs108|chr22 ( 802) 459 111.7 1.6e-24
CCDS13941.1 TMPRSS6 gene_id:164656|Hs108|chr22 ( 811) 459 111.7 1.6e-24
CCDS3964.1 GZMK gene_id:3003|Hs108|chr5 ( 264) 452 109.8 1.9e-24
>>CCDS8812.1 CELA1 gene_id:1990|Hs108|chr12 (258 aa)
initn: 1753 init1: 1753 opt: 1753 Z-score: 2123.4 bits: 400.5 E(32554): 5.9e-112
Smith-Waterman score: 1753; 100.0% identity (100.0% similar) in 258 aa overlap (1-258:1-258)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MLVLYGHSTQDLPETNARVVGGTEAGRNSWPSQISLQYRSGGSRYHTCGGTLIRQNWVMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 MLVLYGHSTQDLPETNARVVGGTEAGRNSWPSQISLQYRSGGSRYHTCGGTLIRQNWVMT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 AAHCVDYQKTFRVVAGDHNLSQNDGTEQYVSVQKIVVHPYWNSDNVAAGYDIALLRLAQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 AAHCVDYQKTFRVVAGDHNLSQNDGTEQYVSVQKIVVHPYWNSDNVAAGYDIALLRLAQS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 VTLNSYVQLGVLPQEGAILANNSPCYITGWGKTKTNGQLAQTLQQAYLPSVDYAICSSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 VTLNSYVQLGVLPQEGAILANNSPCYITGWGKTKTNGQLAQTLQQAYLPSVDYAICSSSS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 YWGSTVKNTMVCAGGDGVRSGCQGDSGGPLHCLVNGKYSVHGVTSFVSSRGCNVSRKPTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 YWGSTVKNTMVCAGGDGVRSGCQGDSGGPLHCLVNGKYSVHGVTSFVSSRGCNVSRKPTV
190 200 210 220 230 240
250
pF1KB6 FTQVSAYISWINNVIASN
::::::::::::::::::
CCDS88 FTQVSAYISWINNVIASN
250
>>CCDS157.1 CELA2A gene_id:63036|Hs108|chr1 (269 aa)
initn: 978 init1: 820 opt: 997 Z-score: 1210.3 bits: 231.6 E(32554): 4.3e-61
Smith-Waterman score: 997; 57.5% identity (80.6% similar) in 247 aa overlap (13-258:23-269)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MLVLYGHSTQDLPETNARVVGGTEAGRNSWPSQISLQYRSGGSRYHTCGG
: .::::: :: :::: :.:::: :.:. ::::::
CCDS15 MIRTLLLSTLVAGALSCGDPTYPPYVTRVVGGEEARPNSWPWQVSLQYSSNGKWYHTCGG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 TLIRQNWVMTAAHCVDYQKTFRVVAGDHNLSQNDGTEQYVSVQKIVVHPYWNSDNVAAGY
.:: ..::.:::::.. ..:.:: : ::: .. :::.::::: :::.... :
CCDS15 SLIANSWVLTAAHCISSSRTYRVGLGRHNLYVAESGSLAVSVSKIVVHKDWNSNQISKGN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 DIALLRLAQSVTLNSYVQLGVLPQEGAILANNSPCYITGWGKTKTNGQLAQTLQQAYLPS
:::::.::. :.:.. .::. :: :.:: :: :::.::::. .::: . ..:::. :
CCDS15 DIALLKLANPVSLTDKIQLACLPPAGTILPNNYPCYVTGWGRLQTNGAVPDVLQQGRLLV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KB6 VDYAICSSSSYWGSTVKNTMVCAGGDGVRSGCQGDSGGPLHCLV-NGKYSVHGVTSFVSS
:::: ::::..:::.::..:.::::::: :.:.:::::::.: . .:...:::..:: :
CCDS15 VDYATCSSSAWWGSSVKTSMICAGGDGVISSCNGDSGGPLNCQASDGRWQVHGIVSFGSR
190 200 210 220 230 240
230 240 250
pF1KB6 RGCNVSRKPTVFTQVSAYISWINNVIASN
::: .::.:::.:: ::.:::.:::.:
CCDS15 LGCNYYHKPSVFTRVSNYIDWINSVIANN
250 260
>>CCDS30605.1 CELA2B gene_id:51032|Hs108|chr1 (269 aa)
initn: 938 init1: 796 opt: 962 Z-score: 1168.1 bits: 223.8 E(32554): 9.7e-59
Smith-Waterman score: 962; 56.4% identity (79.0% similar) in 243 aa overlap (17-258:27-269)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MLVLYGHSTQDLPETNARVVGGTEAGRNSWPSQISLQYRSGGSRYHTCGG
.:..:: :: :::: :.:::: :.:. ::::::
CCDS30 MIRTLLLSTLVAGALSCGVSTYAPDMSRMLGGEEARPNSWPWQVSLQYSSNGQWYHTCGG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 TLIRQNWVMTAAHCVDYQKTFRVVAGDHNLSQNDGTEQYVSVQKIVVHPYWNSDNVAAGY
.:: ..::.:::::.. . .::. :.::: .. :::.::::: ::::.:. :
CCDS30 SLIANSWVLTAAHCISSSGIYRVMLGQHNLYVAESGSLAVSVSKIVVHKDWNSDQVSKGN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 DIALLRLAQSVTLNSYVQLGVLPQEGAILANNSPCYITGWGKTKTNGQLAQTLQQAYLPS
:::::.::. :.:.. .::. :: :.:: :: :::.::::. .::: : . :.:. :
CCDS30 DIALLKLANPVSLTDKIQLACLPPAGTILPNNYPCYVTGWGRLQTNGALPDDLKQGQLLV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KB6 VDYAICSSSSYWGSTVKNTMVCAGGDGVRSGCQGDSGGPLHCLV-NGKYSVHGVTSFVSS
:::: ::::..::::::..:.::::::: :.:::::::.: . .:.. :::. :..:
CCDS30 VDYATCSSSGWWGSTVKTNMICAGGDGVICTCNGDSGGPLNCQASDGRWEVHGIGSLTSV
190 200 210 220 230 240
230 240 250
pF1KB6 RGCNVSRKPTVFTQVSAYISWINNVIASN
::: ::..::.:: : .:::.:::.:
CCDS30 LGCNYYYKPSIFTRVSNYNDWINSVIANN
250 260
>>CCDS219.1 CELA3B gene_id:23436|Hs108|chr1 (270 aa)
initn: 947 init1: 578 opt: 942 Z-score: 1143.9 bits: 219.3 E(32554): 2.1e-57
Smith-Waterman score: 942; 55.3% identity (80.9% similar) in 246 aa overlap (16-258:26-270)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MLVLYGHSTQDLPETNARVVGGTEAGRNSWPSQISLQYRSGGSRYHTCGG
..:::.: .: ::: :.::::...:: ::::::
CCDS21 MMLRLLSSLLLVAVASGYGPPSSRPSSRVVNGEDAVPYSWPWQVSLQYEKSGSFYHTCGG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KB6 TLIRQNWVMTAAHCVDYQKTFRVVAGDHNLSQNDGTEQYVSVQK--IVVHPYWNSDNVAA
.:: .::.::.::.. ..:..:: :... . ..: :: . ... . ::: :: . ::
CCDS21 SLIAPDWVVTAGHCISSSRTYQVVLGEYDRAVKEGPEQVIPINSGDLFVHPLWNRSCVAC
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 GYDIALLRLAQSVTLNSYVQLGVLPQEGAILANNSPCYITGWGKTKTNGQLAQTLQQAYL
: ::::..:..:. :.. :::. :: : :: :..::::::::. ::: : . ::.: :
CCDS21 GNDIALIKLSRSAQLGDAVQLASLPPAGDILPNETPCYITGWGRLYTNGPLPDKLQEALL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 PSVDYAICSSSSYWGSTVKNTMVCAGGDGVRSGCQGDSGGPLHCLV-NGKYSVHGVTSFV
: ::: :: ..:::.::.:::::::: .::::.:::::::.: . .: ..::::::::
CCDS21 PVVDYEHCSRWNWWGSSVKKTMVCAGGD-IRSGCNGDSGGPLNCPTEDGGWQVHGVTSFV
190 200 210 220 230
230 240 250
pF1KB6 SSRGCNVSRKPTVFTQVSAYISWINNVIASN
:. :::. :::::::.:::.:.::...:::.
CCDS21 SAFGCNTRRKPTVFTRVSAFIDWIEETIASH
240 250 260 270
>>CCDS220.1 CELA3A gene_id:10136|Hs108|chr1 (270 aa)
initn: 937 init1: 562 opt: 937 Z-score: 1137.8 bits: 218.2 E(32554): 4.7e-57
Smith-Waterman score: 937; 55.9% identity (79.4% similar) in 247 aa overlap (15-258:25-270)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MLVLYGHSTQDLPETNARVVGGTEAGRNSWPSQISLQYRSGGSRYHTCGG
...::: : .: ::: :.::::...:: ::::::
CCDS22 MMLRLLSSLLLVAVASGYGPPSSHSSSRVVHGEDAVPYSWPWQVSLQYEKSGSFYHTCGG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KB6 TLIRQNWVMTAAHCVDYQKTFRVVAGDHNLSQNDGTEQYVSV--QKIVVHPYWNSDNVAA
.:: .::.::.::.. . :..:: :..::. ..: :: . . ... ::: :: . ::
CCDS22 SLIAPDWVVTAGHCISRDLTYQVVLGEYNLAVKEGPEQVIPINSEELFVHPLWNRSCVAC
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 GYDIALLRLAQSVTLNSYVQLGVLPQEGAILANNSPCYITGWGKTKTNGQLAQTLQQAYL
: ::::..:..:. :.. :::. :: : :: :..::::::::. ::: : . :::: :
CCDS22 GNDIALIKLSRSAQLGDAVQLASLPPAGDILPNKTPCYITGWGRLYTNGPLPDKLQQARL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 PSVDYAICSSSSYWGSTVKNTMVCAGGDGVRSGCQGDSGGPLHCLV-NGKYSVHGVTSFV
: ::: :: ..::::::.::::::: .::::.:::::::.: . .: ..::::::::
CCDS22 PVVDYKHCSRWNWWGSTVKKTMVCAGGY-IRSGCNGDSGGPLNCPTEDGGWQVHGVTSFV
190 200 210 220 230
230 240 250
pF1KB6 SSRGCNVSRKPTVFTQVSAYISWINNVIASN
:. ::: ::::::.:::.:.::...:::.
CCDS22 SAFGCNFIWKPTVFTRVSAFIDWIEETIASH
240 250 260 270
>>CCDS156.1 CTRC gene_id:11330|Hs108|chr1 (268 aa)
initn: 418 init1: 418 opt: 852 Z-score: 1035.3 bits: 199.2 E(32554): 2.4e-51
Smith-Waterman score: 852; 52.3% identity (77.0% similar) in 243 aa overlap (13-252:24-263)
10 20 30 40
pF1KB6 MLVLYGHSTQDLPETNARVVGGTEAGRNSWPSQISLQYRSGGSRYHTCG
:. .:::::: .: .::: :::::: .. . ::::
CCDS15 MLGITVLAALLACASSCGVPSFPPNLSARVVGGEDARPHSWPWQISLQYLKNDTWRHTCG
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 GTLIRQNWVMTAAHCVDYQKTFRVVAGDHNLSQND--GTEQYVSVQKIVVHPYWNSDNVA
:::: .:.:.:::::.. .:.::..: .:: .: :. .:.:. : :: ::. .
CCDS15 GTLIASNFVLTAAHCISNTRTYRVAVGKNNLEVEDEEGS-LFVGVDTIHVHKRWNA--LL
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 AGYDIALLRLAQSVTLNSYVQLGVLPQEGAILANNSPCYITGWGKTKTNGQLAQTLQQAY
::::..::. : :.. .:.. ::.. ..: .. :::.::::. ::: .:. :::.
CCDS15 LRNDIALIKLAEHVELSDTIQVACLPEKDSLLPKDYPCYVTGWGRLWTNGPIADKLQQGL
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 LPSVDYAICSSSSYWGSTVKNTMVCAGGDGVRSGCQGDSGGPLHC-LVNGKYSVHGVTSF
: ::.: :: ..:: ::.:::::::::: :.:.:::::::.: : ::.. : :..::
CCDS15 QPVVDHATCSRIDWWGFRVKKTMVCAGGDGVISACNGDSGGPLNCQLENGSWEVFGIVSF
180 190 200 210 220 230
230 240 250
pF1KB6 VSSRGCNVSRKPTVFTQVSAYISWINNVIASN
: ::::. .::.:.:.:::::.:::
CCDS15 GSRRGCNTRKKPVVYTRVSAYIDWINEKMQL
240 250 260
>>CCDS10852.1 CTRL gene_id:1506|Hs108|chr16 (264 aa)
initn: 484 init1: 194 opt: 617 Z-score: 751.6 bits: 146.7 E(32554): 1.5e-35
Smith-Waterman score: 617; 41.6% identity (69.5% similar) in 243 aa overlap (18-258:33-264)
10 20 30 40
pF1KB6 MLVLYGHSTQDLPETNARVVGGTEAGRNSWPSQISLQYRSGGSRYHT
:.:.: .: .::: :.::: :: .:
CCDS10 LLSLTLSLVLLGSSWGCGIPAIKPALSFSQRIVNGENAVLGSWPWQVSLQDSSG---FHF
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
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CCDS44 VILLATT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]