Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6345
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6345, 265 aa
1>>>pF1KB6345 265 - 265 aa - 265 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2342+/-0.000813; mu= 15.2712+/- 0.049
mean_var=63.5840+/-12.942, 0's: 0 Z-trim(106.7): 26 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.160842
statistics sampled from 9117 (9140) to 9117 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.648), E-opt: 0.2 (0.281), width: 16
Scan time: 2.220
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8793.1 AQP5 gene_id:362|Hs108|chr12 ( 265) 1702 403.4 8.5e-113
CCDS8792.1 AQP2 gene_id:359|Hs108|chr12 ( 271) 1158 277.2 8.6e-75
CCDS31798.1 AQP6 gene_id:363|Hs108|chr12 ( 282) 954 229.8 1.6e-60
CCDS8919.1 MIP gene_id:4284|Hs108|chr12 ( 263) 942 227.0 1e-59
CCDS58617.1 AQP4 gene_id:361|Hs108|chr18 ( 301) 796 193.2 1.8e-49
CCDS11889.1 AQP4 gene_id:361|Hs108|chr18 ( 323) 796 193.2 1.9e-49
CCDS5431.1 AQP1 gene_id:358|Hs108|chr7 ( 269) 751 182.7 2.3e-46
CCDS82244.1 AQP4 gene_id:361|Hs108|chr18 ( 296) 576 142.1 4.2e-34
CCDS10626.1 AQP8 gene_id:343|Hs108|chr16 ( 261) 448 112.4 3.3e-25
CCDS55098.1 AQP1 gene_id:358|Hs108|chr7 ( 186) 421 106.1 1.9e-23
CCDS55097.1 AQP1 gene_id:358|Hs108|chr7 ( 218) 421 106.1 2.2e-23
CCDS55096.1 AQP1 gene_id:358|Hs108|chr7 ( 154) 419 105.5 2.2e-23
>>CCDS8793.1 AQP5 gene_id:362|Hs108|chr12 (265 aa)
initn: 1702 init1: 1702 opt: 1702 Z-score: 2138.6 bits: 403.4 E(32554): 8.5e-113
Smith-Waterman score: 1702; 100.0% identity (100.0% similar) in 265 aa overlap (1-265:1-265)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKWPSALPTILQIALAFGLAIGTLAQAL
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CCDS87 MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKWPSALPTILQIALAFGLAIGTLAQAL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 GPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVAAQLVGAIAGAGILYGVAPLNARGNLAVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 GPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVAAQLVGAIAGAGILYGVAPLNARGNLAVN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 ALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDSRRTSPVGSPALSIGLSVTLGHLVGIYFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 ALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDSRRTSPVGSPALSIGLSVTLGHLVGIYFT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 GCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIVGAVLAAILYFYLLFPNSLSLSERVAIIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 GCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIVGAVLAAILYFYLLFPNSLSLSERVAIIK
190 200 210 220 230 240
250 260
pF1KB6 GTYEPDEDWEEQREERKKTMELTTR
:::::::::::::::::::::::::
CCDS87 GTYEPDEDWEEQREERKKTMELTTR
250 260
>>CCDS8792.1 AQP2 gene_id:359|Hs108|chr12 (271 aa)
initn: 1170 init1: 892 opt: 1158 Z-score: 1456.2 bits: 277.2 E(32554): 8.6e-75
Smith-Waterman score: 1158; 66.0% identity (90.3% similar) in 259 aa overlap (4-262:3-259)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKWPSALPTILQIALAFGLAIGTLAQAL
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CCDS87 MWELRSIAFSRAVFAEFLATLLFVFFGLGSALNWPQALPSVLQIAMAFGLGIGTLVQAL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 GPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVAAQLVGAIAGAGILYGVAPLNARGNLAVN
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CCDS87 GHISGAHINPAVTVACLVGCHVSVLRAAFYVAAQLLGAVAGAALLHEITPADIRGDLAVN
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 ALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDSRRTSPVGSPALSIGLSVTLGHLVGIYFT
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CCDS87 ALSNSTTAGQAVTVELFLTLQLVLCIFASTDERRGENPGTPALSIGFSVALGHLLGIHYT
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 GCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIVGAVLAAILYFYLLFPNSLSLSERVAIIK
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CCDS87 GCSMNPARSLAPAVVTGKFDD-HWVFWIGPLVGAILGSLLYNYVLFPPAKSLSERLAVLK
180 190 200 210 220 230
250 260
pF1KB6 GTYEPDEDWEEQREERKKTMELTTR
: ::: ::::.. .:....::
CCDS87 GL-EPDTDWEEREVRRRQSVELHSPQSLPRGTKA
240 250 260 270
>>CCDS31798.1 AQP6 gene_id:363|Hs108|chr12 (282 aa)
initn: 955 init1: 564 opt: 954 Z-score: 1200.1 bits: 229.8 E(32554): 1.6e-60
Smith-Waterman score: 954; 58.5% identity (88.1% similar) in 236 aa overlap (9-244:22-254)
10 20 30 40
pF1KB6 MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKWPSALPTILQIAL
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CCDS31 MDAVEPGGRGWASMLACRLWKAISRALFAEFLATGLYVFFGVGSVMRWPTALPSVLQIAI
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 AFGLAIGTLAQALGPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVAAQLVGAIAGAGILYG
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CCDS31 TFNLVTAMAVQVTWKASGAHANPAVTLAFLVGSHISLPRAVAYVAAQLVGATVGAALLYG
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 VAPLNARGNLAVNALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDSRRTSPVGSPALSIGL
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CCDS31 VMPGDIRETLGINVVRNSVSTGQAVAVELLLTLQLVLCVFASTDSRQTS--GSPATMIGI
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 SVTLGHLVGIYFTGCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIVGAVLAAILYFYLLFP
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CCDS31 SVALGHLIGIHFTGCSMNPARSFGPAIIIGKFT-VHWVFWVGPLMGALLASLIYNFVLFP
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260
pF1KB6 NSLSLSERVAIIKGTYEPDEDWEEQREERKKTMELTTR
.. .:..:.::. :: :
CCDS31 DTKTLAQRLAILTGTVEVGTGAGAGAEPLKKESQPGSGAVEMESV
240 250 260 270 280
>>CCDS8919.1 MIP gene_id:4284|Hs108|chr12 (263 aa)
initn: 949 init1: 744 opt: 942 Z-score: 1185.5 bits: 227.0 E(32554): 1e-59
Smith-Waterman score: 942; 54.0% identity (85.6% similar) in 263 aa overlap (4-265:3-261)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKW-PSALPTILQIALAFGLAIGTLAQA
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CCDS89 MWELRSASFWRAIFAEFFATLFYVFFGLGSSLRWAPGPLH-VLQVAMAFGLALATLVQS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 LGPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVAAQLVGAIAGAGILYGVAPLNARGNLAV
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CCDS89 VGHISGAHVNPAVTFAFLVGSQMSLLRAFCYMAAQLLGAVAGAAVLYSVTPPAVRGNLAL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 NALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDSRRTSPVGSPALSIGLSVTLGHLVGIYF
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CCDS89 NTLHPAVSVGQATTVEIFLTLQFVLCIFATYDERRNGQLGSVALAVGFSLALGHLFGMYY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 TGCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIVGAVLAAILYFYLLFPNSLSLSERVAII
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CCDS89 TGAGMNPARSFAPAILTGNFT-NHWVYWVGPIIGGGLGSLLYDFLLFPRLKSISERLSVL
180 190 200 210 220 230
240 250 260
pF1KB6 KGTYEPDEDWEEQREERKKTMELTTR
::. .:: . . : : . .::.:.
CCDS89 KGA-KPDVS-NGQPEVTGEPVELNTQAL
240 250 260
>>CCDS58617.1 AQP4 gene_id:361|Hs108|chr18 (301 aa)
initn: 806 init1: 555 opt: 796 Z-score: 1001.5 bits: 193.2 E(32554): 1.8e-49
Smith-Waterman score: 796; 50.2% identity (77.2% similar) in 263 aa overlap (3-254:5-266)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKWPSA---LPT-ILQIALAFGLAIG
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CCDS58 MVAFKGVWTQAFWKAVTAEFLAMLIFVLLSLGSTINWGGTEKPLPVDMVLISLCFGLSIA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 TLAQALGPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVAAQLVGAIAGAGILYGVAPLNAR
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CCDS58 TMVQCFGHISGGHINPAVTVAMVCTRKISIAKSVFYIAAQCLGAIIGAGILYLVTPPSVV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 GNLAVNALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDSRRTSPVGSPALSIGLSVTLGHL
:.:.:. ...: : :....::::.::::.. :::: ::.::. .:: ::.::.::..:::
CCDS58 GGLGVTMVHGNLTAGHGLLVELIITFQLVFTIFASCDSKRTDVTGSIALAIGFSVAIGHL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KB6 VGIYFTGCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIVGAVLAAILYFYLLFPN------
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CCDS58 FAINYTGASMNPARSFGPAVIMGNWE-NHWIYWVGPIIGAVLAGGLYEYVFCPDVEFKRR
190 200 210 220 230
230 240 250 260
pF1KB6 -SLSLSERVAIIKGTYEPDEDWEEQREERKKTMELTTR
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CCDS58 FKEAFSKAAQQTKGSYMEVEDNRSQVETDDLILKPGVVHVIDVDRGEEKKGKDQSGEVLS
240 250 260 270 280 290
>>CCDS11889.1 AQP4 gene_id:361|Hs108|chr18 (323 aa)
initn: 806 init1: 555 opt: 796 Z-score: 1001.1 bits: 193.2 E(32554): 1.9e-49
Smith-Waterman score: 796; 50.2% identity (77.2% similar) in 263 aa overlap (3-254:27-288)
10 20 30
pF1KB6 MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKWP
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CCDS11 MSDRPTARRWGKCGPLCTRENIMVAFKGVWTQAFWKAVTAEFLAMLIFVLLSLGSTINWG
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 SA---LPT-ILQIALAFGLAIGTLAQALGPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVA
.. ::. .. :.: :::.:.:..: .: .::::::::.:.:.. .::. .. ::.:
CCDS11 GTEKPLPVDMVLISLCFGLSIATMVQCFGHISGGHINPAVTVAMVCTRKISIAKSVFYIA
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 AQLVGAIAGAGILYGVAPLNARGNLAVNALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDS
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CCDS11 AQCLGAIIGAGILYLVTPPSVVGGLGVTMVHGNLTAGHGLLVELIITFQLVFTIFASCDS
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 RRTSPVGSPALSIGLSVTLGHLVGIYFTGCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIV
.::. .:: ::.::.::..::: .: .:: ::::::::::::.:. . ::..:::::.
CCDS11 KRTDVTGSIALAIGFSVAIGHLFAINYTGASMNPARSFGPAVIMGNWE-NHWIYWVGPII
190 200 210 220 230
220 230 240 250 260
pF1KB6 GAVLAAILYFYLLFPN-------SLSLSERVAIIKGTYEPDEDWEEQREERKKTMELTTR
:::::. :: :.. :. . ..:. . ::.: :: . : :
CCDS11 GAVLAGGLYEYVFCPDVEFKRRFKEAFSKAAQQTKGSYMEVEDNRSQVETDDLILKPGVV
240 250 260 270 280 290
CCDS11 HVIDVDRGEEKKGKDQSGEVLSSV
300 310 320
>>CCDS5431.1 AQP1 gene_id:358|Hs108|chr7 (269 aa)
initn: 742 init1: 524 opt: 751 Z-score: 945.8 bits: 182.7 E(32554): 2.3e-46
Smith-Waterman score: 751; 46.6% identity (77.2% similar) in 268 aa overlap (1-257:1-267)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSAL--KWP-----SALPTILQIALAFGLAI
: .: . : .:: :::::: .:::...:::: :.: .:. ....:::::.:
CCDS54 MASEFKKKLFWRAVVAEFLATTLFVFISIGSALGFKYPVGNNQTAVQDNVKVSLAFGLSI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 GTLAQALGPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVAAQLVGAIAGAGILYGVAPLNA
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CCDS54 ATLAQSVGHISGAHLNPAVTLGLLLSCQISIFRALMYIIAQCVGAIVATAILSGITSSLT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 RGNLAVNALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDSRRTSPVGSPALSIGLSVTLGH
..:. : : .....::.. .:.: :.::.::..:.:: :: . :: :.:::::.:::
CCDS54 GNSLGRNDLADGVNSGQGLGIEIIGTLQLVLCVLATTDRRRRDLGGSAPLAIGLSVALGH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 LVGIYFTGCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIVGAVLAAILYFYLLFPNSLSLS
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CCDS54 LLAIDYTGCGINPARSFGSAVITHNFS-NHWIFWVGPFIGGALAVLIYDFILAPRSSDLT
190 200 210 220 230
240 250 260
pF1KB6 ERVAI-IKGT---YEPDEDWEEQREERKKTMELTTR
.:: . .: :. : : ..: : :
CCDS54 DRVKVWTSGQVEEYDLDADDINSRVEMKPK
240 250 260
>>CCDS82244.1 AQP4 gene_id:361|Hs108|chr18 (296 aa)
initn: 678 init1: 465 opt: 576 Z-score: 725.8 bits: 142.1 E(32554): 4.2e-34
Smith-Waterman score: 612; 44.1% identity (68.8% similar) in 263 aa overlap (3-254:27-261)
10 20 30
pF1KB6 MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKWP
: : . :: ::: ::::: ::::...:::...:
CCDS82 MSDRPTARRWGKCGPLCTRENIMVAFKGVWTQAFWKAVTAEFLAMLIFVLLSLGSTINWG
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 SA---LPT-ILQIALAFGLAIGTLAQALGPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVA
.. ::. .. :.: :::.:.:..: .: .::::::::.:.:.. .::. .. ::.:
CCDS82 GTEKPLPVDMVLISLCFGLSIATMVQCFGHISGGHINPAVTVAMVCTRKISIAKSVFYIA
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 AQLVGAIAGAGILYGVAPLNARGNLAVNALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDS
:: .::: :::::: :.: .. :.:.:. ...: : :....::::.::::.. :::: ::
CCDS82 AQCLGAIIGAGILYLVTPPSVVGGLGVTMVHGNLTAGHGLLVELIITFQLVFTIFASCDS
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 RRTSPVGSPALSIGLSVTLGHLVGIYFTGCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIV
.::. .:: ::.::.::..::: .:: :::::.
CCDS82 KRTDVTGSIALAIGFSVAIGHLFAIY----------------------------WVGPII
190 200 210
220 230 240 250 260
pF1KB6 GAVLAAILYFYLLFPN-------SLSLSERVAIIKGTYEPDEDWEEQREERKKTMELTTR
:::::. :: :.. :. . ..:. . ::.: :: . : :
CCDS82 GAVLAGGLYEYVFCPDVEFKRRFKEAFSKAAQQTKGSYMEVEDNRSQVETDDLILKPGVV
220 230 240 250 260 270
CCDS82 HVIDVDRGEEKKGKDQSGEVLSSV
280 290
>>CCDS10626.1 AQP8 gene_id:343|Hs108|chr16 (261 aa)
initn: 441 init1: 197 opt: 448 Z-score: 566.1 bits: 112.4 E(32554): 3.3e-25
Smith-Waterman score: 448; 37.7% identity (72.6% similar) in 215 aa overlap (10-220:34-244)
10 20 30
pF1KB6 MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKWPSAL
:.. ..:.:.. .:.:.: :... ..
CCDS10 EIAMCEPEFGNDKAREPSVGGRWRVSWYERFVQPCLVELLGSALFIFIGCLSVIE-NGTD
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 PTILQIALAFGLAIGTLAQALGPVSGGHINPAITLA-LLVGNQISLLRAFFYVAAQLVGA
.:: ::: :::.: . .:: .::::.:::..:: .:.:. ..:. . : ..::.:.
CCDS10 TGLLQPALAHGLALGLVIATLGNISGGHFNPAVSLAAMLIGG-LNLVMLLPYWVSQLLGG
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 IAGAGILYGVAPLNARGNLAVNALNNNTTQGQ---AMVVELILTFQLALCIFASTDSRRT
. ::.. .:.: . : . :. . ::: :.:.:.::: ::: . .. ...:
CCDS10 MLGAALAKAVSPEERFWNASGAAFVTVQEQGQVAGALVAEIILTTLLALAVCMGAINEKT
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 SPVGSPALSIGLSVTLGHLVGIYFTGCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIVGAV
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