FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB6411, 307 aa 1>>>pF1KB6411 307 - 307 aa - 307 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0022+/-0.000858; mu= 16.9039+/- 0.052 mean_var=59.8295+/-12.020, 0's: 0 Z-trim(105.6): 30 B-trim: 413 in 1/50 Lambda= 0.165812 statistics sampled from 8485 (8512) to 8485 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.649), E-opt: 0.2 (0.261), width: 16 Scan time: 2.340 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS10669.1 PPP4C gene_id:5531|Hs108|chr16 ( 307) 2106 512.2 2e-145 CCDS6079.1 PPP2CB gene_id:5516|Hs108|chr8 ( 309) 1470 360.0 1.3e-99 CCDS4173.1 PPP2CA gene_id:5515|Hs108|chr5 ( 309) 1465 358.8 2.9e-99 CCDS6861.1 PPP6C gene_id:5537|Hs108|chr9 ( 305) 1373 336.8 1.2e-92 CCDS48018.1 PPP6C gene_id:5537|Hs108|chr9 ( 342) 1312 322.3 3.3e-88 CCDS48019.1 PPP6C gene_id:5537|Hs108|chr9 ( 283) 1046 258.6 4e-69 CCDS9150.1 PPP1CC gene_id:5501|Hs108|chr12 ( 323) 994 246.2 2.5e-65 CCDS58279.1 PPP1CC gene_id:5501|Hs108|chr12 ( 337) 994 246.2 2.6e-65 CCDS8160.1 PPP1CA gene_id:5499|Hs108|chr11 ( 330) 982 243.3 1.9e-64 CCDS31618.1 PPP1CA gene_id:5499|Hs108|chr11 ( 341) 982 243.3 1.9e-64 CCDS33169.1 PPP1CB gene_id:5500|Hs108|chr2 ( 327) 977 242.1 4.2e-64 CCDS8161.1 PPP1CA gene_id:5499|Hs108|chr11 ( 286) 891 221.5 5.9e-58 CCDS12684.1 PPP5C gene_id:5536|Hs108|chr19 ( 499) 758 189.8 3.5e-48 CCDS44436.1 PPP3CB gene_id:5532|Hs108|chr10 ( 515) 703 176.7 3.3e-44 CCDS7328.1 PPP3CB gene_id:5532|Hs108|chr10 ( 524) 703 176.7 3.4e-44 CCDS44437.1 PPP3CB gene_id:5532|Hs108|chr10 ( 525) 703 176.7 3.4e-44 CCDS47113.1 PPP3CA gene_id:5530|Hs108|chr4 ( 469) 698 175.5 7.1e-44 CCDS47114.1 PPP3CA gene_id:5530|Hs108|chr4 ( 511) 698 175.5 7.6e-44 CCDS34037.1 PPP3CA gene_id:5530|Hs108|chr4 ( 521) 698 175.5 7.7e-44 CCDS59094.1 PPP3CC gene_id:5533|Hs108|chr8 ( 502) 671 169.0 6.6e-42 CCDS34859.1 PPP3CC gene_id:5533|Hs108|chr8 ( 512) 671 169.0 6.7e-42 CCDS59093.1 PPP3CC gene_id:5533|Hs108|chr8 ( 521) 671 169.0 6.8e-42 CCDS34013.1 PPEF2 gene_id:5470|Hs108|chr4 ( 753) 373 97.8 2.6e-20 CCDS43920.1 PPEF1 gene_id:5475|Hs108|chrX ( 591) 338 89.4 7.2e-18 CCDS14188.1 PPEF1 gene_id:5475|Hs108|chrX ( 653) 338 89.4 7.8e-18 >>CCDS10669.1 PPP4C gene_id:5531|Hs108|chr16 (307 aa) initn: 2106 init1: 2106 opt: 2106 Z-score: 2724.3 bits: 512.2 E(32554): 2e-145 Smith-Waterman score: 2106; 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61.6% identity (85.0% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-305) 10 20 30 40 50 60 pF1KB6 MAEISDLDRQIEQLRRCELIKESEVKALCAKAREILVEESNVQRVDSPVTVCGDIHGQFY :: . :::. .: : :. . :...: :: . ..:.:::::: :..::::::::::::: CCDS68 MAPL-DLDKYVEIARLCKYLPENDLKRLCDYVCDLLLEESNVQPVSTPVTVCGDIHGQFY 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB6 DLKELFRVGGDVPETNYLFMGDFVDRGFYSVETFLLLLALKVRYPDRITLIRGNHESRQI :: ::::.::.::.:::.:::::::::.::.::: :::::...::::::.::::::::: CCDS68 DLCELFRTGGQVPDTNYIFMGDFVDRGYYSLETFTYLLALKAKWPDRITLLRGNHESRQI 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB6 TQVYGFYDECLRKYGSVTVWRYCTEIFDYLSLSAIIDGKIFCVHGGLSPSIQTLDQIRTI :::::::::: :::....:::::..::.:...:.:: .:.::::::::.:.:::::::: CCDS68 TQVYGFYDECQTKYGNANAWRYCTKVFDMLTVAALIDEQILCVHGGLSPDIKTLDQIRTI 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KB6 DRKQEVPHDGPMCDLLWSDPEDTTGWGVSPRGAGYLFGSDVVAQFNAANDIDMICRAHQL .:.::.:: : .:::.::::::. :..::::::.:::. :. .: :.. .::::::: CCDS68 ERNQEIPHKGAFCDLVWSDPEDVDTWAISPRGAGWLFGAKVTNEFVHINNLKLICRAHQL 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KB6 VMEGYKWHFNETVLTVWSAPNYCYRCGNVAAILELDEHLQKDFIIFEAAPQETRGIPSKK : ::::. :.: ..::::::::::::::.:.:. . . .. .:.:.:. : :: . CCDS68 VHEGYKFMFDEKLVTVWSAPNYCYRCGNIASIMVFKDVNTREPKLFRAVPDSERVIPPRT 240 250 260 270 280 290 pF1KB6 PVADYFL .. ::: CCDS68 -TTPYFL 300 >>CCDS48018.1 PPP6C gene_id:5537|Hs108|chr9 (342 aa) initn: 1344 init1: 1305 opt: 1312 Z-score: 1697.1 bits: 322.3 E(32554): 3.3e-88 Smith-Waterman score: 1312; 63.9% identity (86.8% similar) in 280 aa overlap (28-307:64-342) 10 20 30 40 50 pF1KB6 MAEISDLDRQIEQLRRCELIKESEVKALCAKAREILVEESNVQRVDSPVTVCGDIHG :: . ..:.:::::: :..:::::::::: CCDS48 PSGCGAPAGRPFLSPGPPPVFHFLRFLKERLCDYVCDLLLEESNVQPVSTPVTVCGDIHG 40 50 60 70 80 90 60 70 80 90 100 110 pF1KB6 QFYDLKELFRVGGDVPETNYLFMGDFVDRGFYSVETFLLLLALKVRYPDRITLIRGNHES ::::: ::::.::.::.:::.:::::::::.::.::: :::::...::::::.:::::: CCDS48 QFYDLCELFRTGGQVPDTNYIFMGDFVDRGYYSLETFTYLLALKAKWPDRITLLRGNHES 100 110 120 130 140 150 120 130 140 150 160 170 pF1KB6 RQITQVYGFYDECLRKYGSVTVWRYCTEIFDYLSLSAIIDGKIFCVHGGLSPSIQTLDQI ::::::::::::: :::....:::::..::.:...:.:: .:.::::::::.:.::::: CCDS48 RQITQVYGFYDECQTKYGNANAWRYCTKVFDMLTVAALIDEQILCVHGGLSPDIKTLDQI 160 170 180 190 200 210 180 190 200 210 220 230 pF1KB6 RTIDRKQEVPHDGPMCDLLWSDPEDTTGWGVSPRGAGYLFGSDVVAQFNAANDIDMICRA :::.:.::.:: : .:::.::::::. :..::::::.:::. :. .: :.. .:::: CCDS48 RTIERNQEIPHKGAFCDLVWSDPEDVDTWAISPRGAGWLFGAKVTNEFVHINNLKLICRA 220 230 240 250 260 270 240 250 260 270 280 290 pF1KB6 HQLVMEGYKWHFNETVLTVWSAPNYCYRCGNVAAILELDEHLQKDFIIFEAAPQETRGIP :::: ::::. :.: ..::::::::::::::.:.:. . . .. .:.:.:. : :: CCDS48 HQLVHEGYKFMFDEKLVTVWSAPNYCYRCGNIASIMVFKDVNTREPKLFRAVPDSERVIP 280 290 300 310 320 330 300 pF1KB6 SKKPVADYFL . .. ::: CCDS48 PRT-TTPYFL 340 >>CCDS48019.1 PPP6C gene_id:5537|Hs108|chr9 (283 aa) initn: 1248 init1: 1039 opt: 1046 Z-score: 1354.4 bits: 258.6 E(32554): 4e-69 Smith-Waterman score: 1197; 56.0% identity (78.2% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-283) 10 20 30 40 50 60 pF1KB6 MAEISDLDRQIEQLRRCELIKESEVKALCAKAREILVEESNVQRVDSPVTVCGDIHGQFY :: . :::. .: : :. . :...: :: . ..:.:::::: :..::::::::::: CCDS48 MAPL-DLDKYVEIARLCKYLPENDLKRLCDYVCDLLLEESNVQPVSTPVTVCGDIHGQ-- 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB6 DLKELFRVGGDVPETNYLFMGDFVDRGFYSVETFLLLLALKVRYPDRITLIRGNHESRQI :::::::.::.::: :::::...::::::.::::::::: CCDS48 --------------------GDFVDRGYYSLETFTYLLALKAKWPDRITLLRGNHESRQI 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KB6 TQVYGFYDECLRKYGSVTVWRYCTEIFDYLSLSAIIDGKIFCVHGGLSPSIQTLDQIRTI :::::::::: :::....:::::..::.:...:.:: .:.::::::::.:.:::::::: CCDS48 TQVYGFYDECQTKYGNANAWRYCTKVFDMLTVAALIDEQILCVHGGLSPDIKTLDQIRTI 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KB6 DRKQEVPHDGPMCDLLWSDPEDTTGWGVSPRGAGYLFGSDVVAQFNAANDIDMICRAHQL .:.::.:: : .:::.::::::. :..::::::.:::. :. .: :.. .::::::: CCDS48 ERNQEIPHKGAFCDLVWSDPEDVDTWAISPRGAGWLFGAKVTNEFVHINNLKLICRAHQL 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KB6 VMEGYKWHFNETVLTVWSAPNYCYRCGNVAAILELDEHLQKDFIIFEAAPQETRGIPSKK : ::::. :.: ..::::::::::::::.:.:. . . .. .:.:.:. : :: . CCDS48 VHEGYKFMFDEKLVTVWSAPNYCYRCGNIASIMVFKDVNTREPKLFRAVPDSERVIPPRT 220 230 240 250 260 270 pF1KB6 PVADYFL .. ::: CCDS48 -TTPYFL 280 >>CCDS9150.1 PPP1CC gene_id:5501|Hs108|chr12 (323 aa) initn: 879 init1: 644 opt: 994 Z-score: 1286.3 bits: 246.2 E(32554): 2.5e-65 Smith-Waterman score: 994; 47.9% identity (78.5% similar) in 284 aa overlap (20-302:30-310) 10 20 30 40 50 pF1KB6 MAEISDLDRQIEQLRRCELIKESEVKALCAKAREILVEESNVQRVDSPVT ..:.:...:: :.:::.. . . ....:. CCDS91 MADLDKLNIDSIIQRLLEVRGSKPGKNVQLQENEIRGLCLKSREIFLSQPILLELEAPLK 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB6 VCGDIHGQFYDLKELFRVGGDVPETNYLFMGDFVDRGFYSVETFLLLLALKVRYPDRITL .:::::::.::: .::. :: ::.::::.::.:::: :.::. :::: :..::. . : CCDS91 ICGDIHGQYYDLLRLFEYGGFPPESNYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFFL 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB6 IRGNHESRQITQVYGFYDECLRKYGSVTVWRYCTEIFDYLSLSAIIDGKIFCVHGGLSPS .::::: .:...::::::: :.: .. .:. :. :. : ..::.: :::: ::::::. CCDS91 LRGNHECASINRIYGFYDECKRRY-NIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPD 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KB6 IQTLDQIRTIDRKQEVPHDGPMCDLLWSDPE-DTTGWGVSPRGAGYLFGSDVVAQFNAAN .:...::: : : .:: .: .::::::::. :. ::: . ::... ::..:::.: . CCDS91 LQSMEQIRRIMRPTDVPDQGLLCDLLWSDPDKDVLGWGENDRGVSFTFGAEVVAKFLHKH 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KB6 DIDMICRAHQLVMEGYKWHFNETVLTVWSAPNYCYRCGNVAAILELDEHLQKDFIIFEAA :.:.::::::.: .::.. .. ..:..:::::: . :..:.. .:: :. .: :.. CCDS91 DLDLICRAHQVVEDGYEFFAKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGAMMSVDETLMCSFQILK-- 240 250 260 270 280 290 290 300 pF1KB6 PQETRGIPSKKPVADYFL : : . . .:: CCDS91 PAEKKKPNATRPVTPPRGMITKQAKK 300 310 320 >>CCDS58279.1 PPP1CC gene_id:5501|Hs108|chr12 (337 aa) initn: 879 init1: 644 opt: 994 Z-score: 1286.0 bits: 246.2 E(32554): 2.6e-65 Smith-Waterman score: 994; 47.9% identity (78.5% similar) in 284 aa overlap (20-302:30-310) 10 20 30 40 50 pF1KB6 MAEISDLDRQIEQLRRCELIKESEVKALCAKAREILVEESNVQRVDSPVT ..:.:...:: :.:::.. . . ....:. CCDS58 MADLDKLNIDSIIQRLLEVRGSKPGKNVQLQENEIRGLCLKSREIFLSQPILLELEAPLK 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB6 VCGDIHGQFYDLKELFRVGGDVPETNYLFMGDFVDRGFYSVETFLLLLALKVRYPDRITL .:::::::.::: .::. :: ::.::::.::.:::: :.::. :::: :..::. . : CCDS58 ICGDIHGQYYDLLRLFEYGGFPPESNYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFFL 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB6 IRGNHESRQITQVYGFYDECLRKYGSVTVWRYCTEIFDYLSLSAIIDGKIFCVHGGLSPS .::::: .:...::::::: :.: .. .:. :. :. : ..::.: :::: ::::::. CCDS58 LRGNHECASINRIYGFYDECKRRY-NIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPD 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KB6 IQTLDQIRTIDRKQEVPHDGPMCDLLWSDPE-DTTGWGVSPRGAGYLFGSDVVAQFNAAN .:...::: : : .:: .: .::::::::. :. ::: . ::... ::..:::.: . CCDS58 LQSMEQIRRIMRPTDVPDQGLLCDLLWSDPDKDVLGWGENDRGVSFTFGAEVVAKFLHKH 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KB6 DIDMICRAHQLVMEGYKWHFNETVLTVWSAPNYCYRCGNVAAILELDEHLQKDFIIFEAA :.:.::::::.: .::.. .. ..:..:::::: . :..:.. .:: :. .: :.. 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