FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB6440, 345 aa 1>>>pF1KB6440 345 - 345 aa - 345 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2207+/-0.00078; mu= 18.1613+/- 0.047 mean_var=90.5841+/-18.064, 0's: 0 Z-trim(110.2): 81 B-trim: 0 in 0/53 Lambda= 0.134756 statistics sampled from 11348 (11431) to 11348 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.715), E-opt: 0.2 (0.351), width: 16 Scan time: 2.480 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS11663.1 APOH gene_id:350|Hs108|chr17 ( 345) 2474 490.7 7.4e-139 CCDS1282.1 SELP gene_id:6403|Hs108|chr1 ( 830) 456 98.8 1.7e-20 CCDS1477.1 C4BPA gene_id:722|Hs108|chr1 ( 597) 431 93.8 4e-19 CCDS1283.1 SELE gene_id:6401|Hs108|chr1 ( 610) 427 93.0 6.9e-19 CCDS48004.1 SVEP1 gene_id:79987|Hs108|chr9 (3571) 433 94.9 1.1e-18 CCDS55189.1 CSMD1 gene_id:64478|Hs108|chr8 (3564) 414 91.2 1.4e-17 CCDS1386.1 CFHR1 gene_id:3078|Hs108|chr1 ( 330) 388 85.2 8.6e-17 CCDS6317.1 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8 (3667) 391 86.8 3.1e-16 CCDS6315.1 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8 (3707) 391 86.8 3.2e-16 CCDS6316.2 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8 (3538) 387 86.0 5.2e-16 CCDS31006.1 CD55 gene_id:1604|Hs108|chr1 ( 381) 370 81.7 1.1e-15 CCDS44307.1 CD55 gene_id:1604|Hs108|chr1 ( 440) 370 81.8 1.2e-15 CCDS73022.1 CD55 gene_id:1604|Hs108|chr1 ( 444) 370 81.8 1.2e-15 CCDS1388.1 F13B gene_id:2165|Hs108|chr1 ( 661) 369 81.8 1.8e-15 CCDS1484.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1 ( 355) 363 80.3 2.6e-15 CCDS1485.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1 ( 392) 363 80.4 2.8e-15 CCDS1482.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1 ( 399) 363 80.4 2.9e-15 CCDS1385.1 CFH gene_id:3075|Hs108|chr1 (1231) 361 80.5 8.3e-15 CCDS1478.1 CR2 gene_id:1380|Hs108|chr1 (1033) 357 79.6 1.3e-14 CCDS31007.1 CR2 gene_id:1380|Hs108|chr1 (1092) 351 78.5 2.9e-14 CCDS380.1 CSMD2 gene_id:114784|Hs108|chr1 (3487) 356 79.9 3.4e-14 CCDS44310.1 CR1L gene_id:1379|Hs108|chr1 ( 569) 327 73.5 4.7e-13 CCDS60082.1 CSMD2 gene_id:114784|Hs108|chr1 (3631) 323 73.5 3e-12 CCDS1479.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1 ( 349) 285 65.2 9.5e-11 CCDS31009.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1 ( 362) 285 65.2 9.8e-11 CCDS1481.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1 ( 369) 285 65.2 9.9e-11 >>CCDS11663.1 APOH gene_id:350|Hs108|chr17 (345 aa) initn: 2474 init1: 2474 opt: 2474 Z-score: 2606.4 bits: 490.7 E(32554): 7.4e-139 Smith-Waterman score: 2474; 99.7% identity (100.0% similar) in 345 aa overlap (1-345:1-345) 10 20 30 40 50 60 pF1KB6 MISPVLILFSSFLCHVAIAGRTCPKPDDLPFSTVVPLKTFYEPGEEITYSCKPGYVSRGG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 MISPVLILFSSFLCHVAIAGRTCPKPDDLPFSTVVPLKTFYEPGEEITYSCKPGYVSRGG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB6 MRKFICPLTGLWPINTLKCTPRVCPFAGILENGAVRYTTFEYPNTISFSCNTGFYLNGAD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 MRKFICPLTGLWPINTLKCTPRVCPFAGILENGAVRYTTFEYPNTISFSCNTGFYLNGAD 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB6 SAKCTEEGKWSPELPVCAPIICPPPSIPTFATLRVYKPSAGNNSLYRDTAVFECLPQHAM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 SAKCTEEGKWSPELPVCAPIICPPPSIPTFATLRVYKPSAGNNSLYRDTAVFECLPQHAM 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB6 FGNDTITCTTHGNWTKLPECREVKCPFPSRPDNGFVNYPAKPTLYYKDKATFGCHDGYSL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 FGNDTITCTTHGNWTKLPECREVKCPFPSRPDNGFVNYPAKPTLYYKDKATFGCHDGYSL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB6 DGPEEIECTKLGNWSAMPSCKASCKLPVKKATVVYQGERVKIQEKFKNGMLHGDKVSFFC :::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 DGPEEIECTKLGNWSAMPSCKASCKVPVKKATVVYQGERVKIQEKFKNGMLHGDKVSFFC 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KB6 KNKEKKCSYTEDAQCIDGTIEVPKCFKEHSSLAFWKTDASDVKPC ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 KNKEKKCSYTEDAQCIDGTIEVPKCFKEHSSLAFWKTDASDVKPC 310 320 330 340 >>CCDS1282.1 SELP gene_id:6403|Hs108|chr1 (830 aa) initn: 391 init1: 196 opt: 456 Z-score: 481.3 bits: 98.8 E(32554): 1.7e-20 Smith-Waterman score: 456; 30.8% identity (56.7% similar) in 263 aa overlap (13-264:318-572) 10 20 30 40 pF1KB6 MISPVLILFSSFLCHVAIAGRTCPKPDDLPFSTVVPLKTFYE .:. :. . :.. .. : :: .: CCDS12 CSFSCEEGFALVGPEVVQCTASGVWTAPAPVCK-AVQCQHLEAPSEGTMDCVHPLTAF-A 290 300 310 320 330 340 50 60 70 80 90 pF1KB6 PGEEITYSCKPGYVSRGGMRKFICPLTGLW--PINT---LKCTPRVCPFAGILENGAVRY : . :.::: :: . . : .: : :. : ..: : : : .. . CCDS12 YGSSCKFECQPGYRVRG-LDMLRCIDSGHWSAPLPTCEAISCEPLESPVHGSMDCSP-SL 350 360 370 380 390 400 100 110 120 130 140 150 pF1KB6 TTFEYPNTISFSCNTGFYLNGADSAKCTEEGKWSPELPVCAPIICPPPSIPTFATLRVYK .:.: .. :: : ::.: ::: ..: . :.:. ::: . : .:. : . . CCDS12 RAFQYDTNCSFRCAEGFMLRGADIVRCDNLGQWTAPAPVCQALQCQDLPVPNEARVNCSH 410 420 430 440 450 460 160 170 180 190 200 210 pF1KB6 PSAGNNSLYRDTAVFECLPQHAMFGNDTITCTTHGNWTKLP-ECREVKC-PFPSRPDNGF : .. :... : : . : ... : . :::...: ::. . : :. : :.:: CCDS12 PFGAFR--YQSVCSFTCNEGLLLVGASVLQCLATGNWNSVPPECQAIPCTPLLS-PQNGT 470 480 490 500 510 520 220 230 240 250 260 270 pF1KB6 VNYPAKP--TLYYKDKATFGCHDGYSLDGPEEIECTKLGNWS-AMPSCKA-SCKLPVKKA .. ..: . ::. : : .::::.:::...::. : :. . : :.: .: CCDS12 MTC-VQPLGSSSYKSTCQFICDEGYSLSGPERLDCTRSGRWTDSPPMCEAIKCPELFAPE 530 540 550 560 570 280 290 300 310 320 330 pF1KB6 TVVYQGERVKIQEKFKNGMLHGDKVSFFCKNKEKKCSYTEDAQCIDGTIEVPKCFKEHSS CCDS12 QGSLDCSDTRGEFNVGSTCHFSCDNGFKLEGPNNVECTTSGRWSATPPTCKGIASLPTPG 580 590 600 610 620 630 >>CCDS1477.1 C4BPA gene_id:722|Hs108|chr1 (597 aa) initn: 285 init1: 120 opt: 431 Z-score: 456.9 bits: 93.8 E(32554): 4e-19 Smith-Waterman score: 431; 30.7% identity (53.7% similar) in 270 aa overlap (17-267:45-303) 10 20 30 40 pF1KB6 MISPVLILFSSFLCHVAIAGRTCPKPDDLPFSTVVPL---KTFYEP :. : .: : : :.. . . .: .. CCDS14 RKMAAWPFSRLWKVSDPILFQMTLIAALLPAVLG-NCGPPPTLSFAAPMDITLTETRFKT 20 30 40 50 60 70 50 60 70 80 90 100 pF1KB6 GEEITYSCKPGYVSRGGMRKFICPLTGLWPINTLKCTPRVCPFAGILENGAVRYTT-FEY : . :.: :::: . . . : : : ::. : . : : :.:: :. : . . CCDS14 GTTLKYTCLPGYVRSHSTQTLTCNSDGEWVYNTF-CIYKRCRHPGELRNGQVEIKTDLSF 80 90 100 110 120 130 110 120 130 140 150 pF1KB6 PNTISFSCNTGFYLNGADSAKCTEEGK---WSPELPVCAPIIC-PPPSIPTFATLRVYKP . : :::. ::.: :. ...: . . :: :: : . : :::.: : . CCDS14 GSQIEFSCSEGFFLIGSTTSRCEVQDRGVGWSHPLPQCEIVKCKPPPDI------RNGRH 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KB6 SAGNNSL-YRDTAVFECLPQHAMFGNDTITCT----THGNWTKLPE-CREVKCPFPSRPD :. .: : .... : :. ...:. .:.:: : : : : :... : .:: CCDS14 SGEENFYAYGFSVTYSCDPRFSLLGHASISCTVENETIGVWRPSPPTCEKITC---RKPD 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 pF1KB6 --NGFVNYPAKPTLYYKDKATFGCHDGYSLDGPEEIECTKLGNWS-AMPSCKA-SC-KLP .: . : ::: .: :. :. : : :.: ..:. . :.:. :: .:: CCDS14 VSHGEMVSGFGPIYNYKDTIVFKCQKGFVLRGSSVIHCDADSKWNPSPPACEPNSCINLP 250 260 270 280 290 300 270 280 290 300 310 320 pF1KB6 VKKATVVYQGERVKIQEKFKNGMLHGDKVSFFCKNKEKKCSYTEDAQCIDGTIEVPKCFK CCDS14 DIPHASWETYPRPTKEDVYVVGTVLRYRCHPGYKPTTDEPTTVICQKNLRWTPYQGCEAL 310 320 330 340 350 360 >>CCDS1283.1 SELE gene_id:6401|Hs108|chr1 (610 aa) initn: 454 init1: 158 opt: 427 Z-score: 452.5 bits: 93.0 E(32554): 6.9e-19 Smith-Waterman score: 427; 27.0% identity (54.8% similar) in 341 aa overlap (9-333:169-497) 10 20 30 pF1KB6 MISPVLILFSSFLCHVAIAGRTCPKPDDLPFSTVVPLK ::.. :. . . .:. . :: CCDS12 YTAACTNTSCSGHGECVETINNYTCKCDPGFSGLKCEQIVNCTALESPEHGSLVCSHPLG 140 150 160 170 180 190 40 50 60 70 80 90 pF1KB6 TF-YEPGEEITYSCKPGYVSRGGMRKFICPLTGLW--PI---NTLKCTPRVCPFAGILEN .: :. . : :: ::. ..:. . : .: : :: :...: . : :..: CCDS12 NFSYNSSCSI--SCDRGYLP-SSMETMQCMSSGEWSAPIPACNVVECDAVTNPANGFVEC 200 210 220 230 240 250 100 110 120 130 140 150 pF1KB6 GAVRYTTFEYPNTISFSCNTGFYLNGADSAKCTEEGKWSPELPVCAPIICPPPSIPTFAT .: . .: .:.:. :: : ::.: .:: :.:. : :.: . : : .. CCDS12 FQ-NPGSFPWNTTCTFDCEEGFELMGAQSLQCTSSGNWDNEKPTCKAVTCRAVRQPQNGS 260 270 280 290 300 310 160 170 180 190 200 210 pF1KB6 LRVYKPSAGNNSLYRDTAVFECLPQHAMFGNDTITCTTHGNWTK-LPECREVKCPFPSRP .: . ::. . .... : : . : . :::.:.::. .: :. .: : : CCDS12 VRCSHSPAGEFT-FKSSCNFTCEEGFMLQGPAQVECTTQGQWTQQIPVCEAFQCTALSNP 320 330 340 350 360 370 220 230 240 250 260 pF1KB6 DNGFVN-YP-AKPTLYYKDKATFGCHDGYSLDGPEEIECTKLGNW-SAMPSCKASCKLPV . :..: : :. .. : .. :.:..:. : : ....: :.: . :.:.: CCDS12 ERGYMNCLPSASGSFRYGSSCEFSCEQGFVLKGSKRLQCGPTGEWDNEKPTCEAV----- 380 390 400 410 420 270 280 290 300 310 320 pF1KB6 KKATVVYQGER--VKIQEKFKNGMLHGDKVSFFCKNKEKKCSYTEDAQCIDG---TIEVP . .:.: . :. .. . . . .. .: :.. . . :. .: . : ::: CCDS12 -RCDAVHQPPKGLVRCAHSPIGEFTYKSSCAFSCEEGFELHGSTQ-LECTSQGQWTEEVP 430 440 450 460 470 480 330 340 pF1KB6 KC-FKEHSSLAFWKTDASDVKPC .: . :::: CCDS12 SCQVVKCSSLAVPGKINMSCSGEPVFGTVCKFACPEGWTLNGSAARTCGATGHWSGLLPT 490 500 510 520 530 540 >>CCDS48004.1 SVEP1 gene_id:79987|Hs108|chr9 (3571 aa) initn: 591 init1: 192 opt: 433 Z-score: 449.2 bits: 94.9 E(32554): 1.1e-18 Smith-Waterman score: 451; 28.3% identity (50.8% similar) in 315 aa overlap (23-329:2264-2555) 10 20 30 40 50 pF1KB6 MISPVLILFSSFLCHVAIAGRTCPKPDDLPFSTVVPLKTFYEPGEEITYSCK : :: :... .: : .. . :. CCDS48 GYKSVGSPVFVCQANRHWHSESPLMCVPLDCGKPP--PIQNGFMKGENFEVGSKVQFFCN 2240 2250 2260 2270 2280 2290 60 70 80 90 100 110 pF1KB6 PGYVSRGGMRKFICPLTGLWPINTL-KCTPRVCPFAGILENGAVRYTTFEYPNTISFSCN :: : .. : .: : .. :: : :: .::: : ....:::. CCDS48 EGYELVGD-SSWTCQKSGKWNKKSNPKCMPAKCPEPPLLENQLVLKELTTEVGVVTFSCK 2300 2310 2320 2330 2340 2350 120 130 140 150 160 170 pF1KB6 TGFYLNGADSAKCTEEGKWSPELPVCAPIICPPPSIPTFATLRVYKPSAGNNSLYRDTAV : :.: . :: .:. .::: ..: :: . .:. : ::.. . . .:. CCDS48 EGHVLQGPSVLKCLPSQQWNDSFPVCKIVLCTPPPLISFG---VPIPSSALH--FGSTVK 2360 2370 2380 2390 2400 180 190 200 210 220 230 pF1KB6 FECLPQHAMFGNDTITCTTHGNWTK-LPECREVKCPFPSRPDNGFVNYPAKPTLYYKDKA . :. . ::.: : :.:.. :::: :.:: : . ::... . : : . : CCDS48 YSCVGGFFLRGNSTTLCQPDGTWSSPLPECVPVECPQPEEIPNGIIDVQG---LAYLSTA 2410 2420 2430 2440 2450 2460 240 250 260 270 280 pF1KB6 TFGCHDGYSLDGPEEIECTKLGNW-SAMPSCKA-SCKLPVKKATVVYQGERVKIQEKFKN . :. :. : : : . :.: .. :.::: : : . . .: ::. CCDS48 LYTCKPGFELVGNTTTLCGENGHWLGGKPTCKAIECLKPKE----ILNG-------KFSY 2470 2480 2490 2500 2510 290 300 310 320 330 340 pF1KB6 GMLH-GDKVSFFCKNKEKKCSYTEDAQCI---DGTIEVPKCFKEHSSLAFWKTDASDVKP :: :. :.. : :. . :. : ...:.: : CCDS48 TDLHYGQTVTYSC-NRGFRLEGPSALTCLETGDWDVDAPSCNAIHCDSPQPIENGFVEGA 2520 2530 2540 2550 2560 2570 pF1KB6 C CCDS48 DYSYGAIIIYSCFPGFQVAGHAMQTCEESGWSSSIPTCMPIDCGLPPHIDFGDCTKLKDD 2580 2590 2600 2610 2620 2630 >-- initn: 506 init1: 163 opt: 443 Z-score: 459.7 bits: 96.9 E(32554): 2.8e-19 Smith-Waterman score: 443; 27.8% identity (53.6% similar) in 302 aa overlap (22-318:3240-3525) 10 20 30 40 50 pF1KB6 MISPVLILFSSFLCHVAIAGRTCPKPDDLPFSTVVPLKTFYEPGEEITYSC .: ::.. . :: : .: : :.: CCDS48 GYTFEGVNISVCQLDGTWEPPFSDESCSPVSCGKPESPEHGFVVGSKYTFES--TIIYQC 3210 3220 3230 3240 3250 3260 60 70 80 90 100 110 pF1KB6 KPGYVSRGGMRKFICPLTGLWPINTLKCTPRVCPFAGILENGAVRYTTFEYPNTISFSCN .::: .:. :. .: . : .. : : . :: . . .. .::: CCDS48 EPGYELEGN-RERVCQENRQWSGGVAICKETRCETPLEFLNGKADIENRTTGPNVVYSCN 3270 3280 3290 3300 3310 3320 120 130 140 150 160 170 pF1KB6 TGFYLNGADSAKCTEEGKWSPELPVCAPIICPPP-SIPTFATLRVYKPSAGNNSLYRDTA :. :.: . :.:::.: :: .:.: : :: : :: : : ... .: : CCDS48 RGYSLEGPSEAHCTENGTWSHPVPLCKPNPCPVPFVIPENALL-------SEKEFYVDQN 3330 3340 3350 3360 3370 180 190 200 210 220 pF1KB6 V-FECLPQHAMFGNDTITCTTHGNWTKLP-ECREVKCPFPSRPDNGFVNYPAKPTLY-YK : ..: . :. :::. .::. .:....: :.. .:.. :. . : : CCDS48 VSIKCREGFLLQGHGIITCNPDETWTQTSAKCEKISCGPPAHVENAI----ARGVHYQYG 3380 3390 3400 3410 3420 3430 230 240 250 260 270 280 pF1KB6 DKATFGCHDGYSLDGPEEIECTKLGNWSAMPSCKASCKLPVKKATVVYQGERVKIQEKFK : :..:..:: :.: . : . :.:.. : :.: :..: ... . . . . : . CCDS48 DMITYSCYSGYMLEGFLRSVCLENGTWTSPPICRAVCRFPCQNGGICQRPNACSCPEGWM 3440 3450 3460 3470 3480 3490 290 300 310 320 330 340 pF1KB6 NGMLHGDKVSFF-CKNKEKKCSYTEDAQCIDGTIEVPKCFKEHSSLAFWKTDASDVKPC : : . . .. : : .: . .: : CCDS48 -GRLCEEPICILPCLNG-GRCVAPYQCDCPPGWTGSRCHTAVCQSPCLNGGKCVRPNRCH 3500 3510 3520 3530 3540 3550 CCDS48 CLSSWTGHNCSRKRRTGF 3560 3570 >-- initn: 667 init1: 171 opt: 440 Z-score: 456.5 bits: 96.3 E(32554): 4.2e-19 Smith-Waterman score: 440; 27.7% identity (48.9% similar) in 329 aa overlap (22-338:2774-3084) 10 20 30 40 50 pF1KB6 MISPVLILFSSFLCHVAIAGRTCPKPDDLPFSTVVPLKTFYEPGEEITYSC .: ::. . ... . : . : : CCDS48 KPGHILAGSDLRLCLENRKWSGASPRCEAISCKKPNPVMNGSIK--GSNYTYLSTLYYEC 2750 2760 2770 2780 2790 2800 60 70 80 90 100 110 pF1KB6 KPGYVSRGGMRKFICPLTGLWPINTLKCTPRVCPFAGILENGAVRYTTFEYPNTISFSCN :::: : :. : : . : : : . :: :: . . . : ..:: CCDS48 DPGYVLNGTERR-TCQDDKNWDEDEPICIPVDCSSPPVSANGQVRGDEYTFQKEIEYTCN 2810 2820 2830 2840 2850 2860 120 130 140 150 160 170 pF1KB6 TGFYLNGADSAKCTEEGKWSPELPVCAPIICPPPSIPTFATLRVYKPSAGNNSLYRDTAV :: :.:: : : .:.:: : :.:. : : : .:. . : . . .. CCDS48 EGFLLEGARSRVCLANGSWSGATPDCVPVRCATP--PQLAN----GVTEGLDYGFMKEVT 2870 2880 2890 2900 2910 180 190 200 210 220 230 pF1KB6 FECLPQHAMFGNDTITCTTHGNW-TKLPECREVKCPFPSRPDNGFVNYPAKPTLYYKDKA :.: . . : .:: . ::: ...: :. :.: : .:: : .. . . CCDS48 FHCHEGYILHGAPKLTCQSDGNWDAEIPLCKPVNCGPPEDLAHGF---PNGFSFIHGGHI 2920 2930 2940 2950 2960 2970 240 250 260 270 280 pF1KB6 TFGCHDGYSLDGPEEIECTKLGNWS-AMPSC-KASCKLPVKKATVVYQ-----GERVKIQ . : ::.: : .: . :.:: . ::: :. :: . .: :. ..:: CCDS48 QYQCFPGYKLHGNSSRRCLSNGSWSGSSPSCLPCRCSTPVIEYGTVNGTDFDCGKAARIQ 2980 2990 3000 3010 3020 3030 290 300 310 320 330 pF1KB6 EKFKNGMLHGDKVSFFCKNKEKKCS---YTEDAQCIDGTIE-VPKCFKEHSSLAFWKTDA ::. : : . . :. . : . : ..: :.. .:. : ..: :: . CCDS48 C-FKGFKLLGLS-EITCEADGQWSSGFPHCEHTSC--GSLPMIPNAFISETS--SWKENV 3040 3050 3060 3070 3080 340 pF1KB6 SDVKPC CCDS48 ITYSCRSGYVIQGSSDLICTEKGVWSQPYPVCEPLSCGSPPSVANAVATGEAHTYESEVK 3090 3100 3110 3120 3130 3140 >>CCDS55189.1 CSMD1 gene_id:64478|Hs108|chr8 (3564 aa) initn: 869 init1: 210 opt: 414 Z-score: 429.2 bits: 91.2 E(32554): 1.4e-17 Smith-Waterman score: 421; 27.8% identity (52.9% similar) in 295 aa overlap (39-326:2576-2855) 10 20 30 40 50 60 pF1KB6 FSSFLCHVAIAGRTCPKPDDLPFSTVVPLKTFYEPGEEITYSCKPGYVSRGGMRKFICPL .. : : .. ::.::: .: : . : CCDS55 KGKPPTCKPVACPSIEAQLSEHVIWRLVSGSLNEYGAQVLLSCSPGYYLEG-WRLLRCQA 2550 2560 2570 2580 2590 2600 70 80 90 100 110 120 pF1KB6 TGLWPINTLKCTPRV--CPFAGILENGAVRYTTFEYPNTISFSCNTGFYLNGADSAKCTE .: : :. . . :: : .. :: : : : :.::::. : :. .: CCDS55 NGTWNIGDERPSCRVISCGSLSFPPNGNKIGTLTVYGATAIFTCNTGYTLVGSHVRECLA 2610 2620 2630 2640 2650 2660 130 140 150 160 170 180 pF1KB6 EGKWSPELPVCAPIICPPPSIPTFATLRVYKPSAGNNSLYRDTAVFECLPQHAMFGNDTI .: :: : : :. : : .:.. ::::.:..: : . :... CCDS55 NGLWSGSETRCLAGHCGSPD-PI-----VNGHISGDGFSYRDTVVYQCNPGFRLVGTSVR 2670 2680 2690 2700 2710 190 200 210 220 230 240 pF1KB6 TCTTHGNWT-KLPECREVKCPFPSRPDNGFVNYPAKPTLYYKDKATFGCHDGYSLDGPEE : .:. . : : . : :. : .::.: . .: ..: :. :: :.: . CCDS55 ICLQDHKWSGQTPVCVPITCGHPGNPAHGFTN---GSEFNLNDVVNFTCNTGYLLQGVSR 2720 2730 2740 2750 2760 2770 250 260 270 280 290 300 pF1KB6 IECTKLGNWSA-MPSCKA-SCKLPVKKATVVYQGERVKIQEKFKNGMLHGDKVSFFCKNK .: . :.::. .:.:.. .:. : ... .:.. .. :.:. :: .. . ::. CCDS55 AQCRSNGQWSSPLPTCRVVNCSDPGFVENAIRHGQQ-NFPESFEYGM----SILYHCKKG 2780 2790 2800 2810 2820 2830 310 320 330 340 pF1KB6 EKKCSYTEDAQCIDGTIE--VPKCFKEHSSLAFWKTDASDVKPC . . . .: . .:::. CCDS55 FYLLGSSALTCMANGLWDRSLPKCLAISCGHPGVPANAVLTGELFTYGAVVHYSCRGSES 2840 2850 2860 2870 2880 2890 >-- initn: 423 init1: 186 opt: 390 Z-score: 404.0 bits: 86.6 E(32554): 3.5e-16 Smith-Waterman score: 395; 26.7% identity (53.9% similar) in 258 aa overlap (47-301:3001-3244) 20 30 40 50 60 70 pF1KB6 AIAGRTCPKPDDLPFSTVVPLKTFYEPGEEITYSCKPGYVSRGGMRKFICPLTGLWPINT . :.: :: . : : . : .: : .. CCDS55 PVCEAVSCGNPGTPTNGMIVSSDGILFSSSVIYACWEGYKTSGLMTRH-CTANGTWTGTA 2980 2990 3000 3010 3020 80 90 100 110 120 130 pF1KB6 LKCTPRVCPFAGILENGAVRYTTFEYPNTISFSCNTGFYLNGADSA--KCTEEGKWSPEL :: : : : :: : : . .:.:..:: :. .... :: .::..:.:.: CCDS55 PDCTIISCGDPGTLANGIQFGTDFTFNKTVSYQCNPGYVMEAVTSATIRCTKDGRWNPSK 3030 3040 3050 3060 3070 3080 140 150 160 170 180 190 pF1KB6 PVCAPIICPPPSIPTFATLRVYKPSAGNNSLYRDTAVFECLPQHAMFGNDTITCTTHGNW ::: ..:: : : . : :.. . .. . :. . . . ..: .: : CCDS55 PVCKAVLCPQP--PPVQNGTV----EGSDFRWGSSISYSCMDGYQLSHSAILSCEGRGVW 3090 3100 3110 3120 3130 3140 200 210 220 230 240 250 pF1KB6 T-KLPECREVKCPFPSRPDNGFVNYPAKPTLYYKDKATFGCHDGYSLDGPEEIECTKLGN ..:.: : : :. : .: .. .. ::... : :.. . : : . : :. CCDS55 KGEIPQCLPVFCGDPGIPAEGRLS---GKSFTYKSEVFFQCKSPFILVGSSRRVCQADGT 3150 3160 3170 3180 3190 3200 260 270 280 290 300 310 pF1KB6 WSAMPSCKASCKLPVKKATVVYQGERVKIQEKFKNGMLHGDKVSFFCKNKEKKCSYTEDA ::.. . .: :.... . ::.. . :. :. : : :. CCDS55 WSGI---QPTCIDPAHNTCPDPGTPHFGIQNSSR-GYEVGSTVFFRCRKGYHIQGSTTRT 3210 3220 3230 3240 3250 320 330 340 pF1KB6 QCIDGTIEVPKCFKEHSSLAFWKTDASDVKPC CCDS55 CLANLTWSGIQTECIPHACRQPETPAHADVRAIDLPTFGYTLVYTCHPGFFLAGGSEHRT 3260 3270 3280 3290 3300 3310 >>CCDS1386.1 CFHR1 gene_id:3078|Hs108|chr1 (330 aa) initn: 178 init1: 63 opt: 388 Z-score: 414.9 bits: 85.2 E(32554): 8.6e-17 Smith-Waterman score: 388; 28.8% identity (53.8% similar) in 312 aa overlap (30-327:41-329) 10 20 30 40 50 pF1KB6 MISPVLILFSSFLCHVAIAGRTCPKPDDLPFSTVVPLKTFYEPGEEITYSCKPGYVS-- ::: : ..:: :::. ..:: CCDS13 SRISSVGGEATFCDFPKINHGILYDEEKYKPFSQVPTGEVFY-------YSCEYNFVSPS 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB6 RGGMRKFICPLTGLWPINTLKCTPRVCPFAGILENGAVRYT--TFEYPNTISFSCNTGFY .. .. : : : : :: :.: : ..::: . . : .:... ::::. CCDS13 KSFWTRITCTEEGWSP--TPKCL-RLC-FFPFVENGHSESSGQTHLEGDTVQIICNTGYR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB6 L-NGADSAKCTEEGKWSPELPVC--APIIC-PPPSIPTFATLRVYKPSAGNNSLYRDTAV : :. .. .:.:.: :: : : . : ::.. . : . .. : CCDS13 LQNNENNISCVERG-WSTP-PKCRSTDTSCVNPPTVQNAHILSRQMSKYPSGERVR---- 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KB6 FECLPQHAMFGNDTITCTTHGNWTKLPECREV--KCPFPSRPDNG-FVNYPAKPTLYYKD .:: . :::.. . : .::::. :.:.. :: : ::: ....: ..: CCDS13 YECRSPYEMFGDEEVMCL-NGNWTEPPQCKDSTGKCGPPPPIDNGDITSFPL--SVYAPA 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KB6 KAT-FGCHDGYSLDGPEEIECTKLGNWSAMPSCKASCKLPVKKATVVYQGERVKIQEKFK ... . :.. :.:.: ..: : . :.:: :.: : ... . . .. : : CCDS13 SSVEYQCQNLYQLEGNKRITC-RNGQWSEPPKCLHPCV--ISREIMENYNIALRWTAKQK 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KB6 NGMLHGDKVSFFCKN--KEKKCSYTEDAQCIDGTIEVPKCFKEHSSLAFWKTDASDVKPC . :... : :: . .. :.: . : :: .: : : : CCDS13 LYLRTGESAEFVCKRGYRLSSRSHTLRTTCWDGKLEYPTCAKR 290 300 310 320 330 >>CCDS6317.1 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8 (3667 aa) initn: 388 init1: 205 opt: 391 Z-score: 404.9 bits: 86.8 E(32554): 3.1e-16 Smith-Waterman score: 398; 27.7% identity (54.3% similar) in 256 aa overlap (18-267:2773-3019) 10 20 30 40 pF1KB6 MISPVLILFSSFLCHVAIAGRTCPKPDDLPFSTVVPLKTFYEPGEEI .::. : :. . . :. . :. . . CCDS63 FTCDLGFMLVGSAVRECLSSGLWSESETRCLAGH-CGIPELIVNGQVIGENYGYR--DTV 2750 2760 2770 2780 2790 50 60 70 80 90 100 pF1KB6 TYSCKPGYVSRGGMRKFICPLTGLWPINTLKCTPRVCPFAGILENGAVRYTTFEYPNTIS .:.:.::. :. . :: : . .:.: : : : . . :.. .... CCDS63 VYQCNPGFRLIGSSVR-ICQQDHNWSGQLPSCVPVSCGHPGSPIYGRTSGNGFNFNDVVT 2800 2810 2820 2830 2840 2850 110 120 130 140 150 160 pF1KB6 FSCNTGFYLNGADSAKCTEEGKWSPELPVCAPIICPPPSIPTFATLRVYKPSAGNNSLYR :::: :. ..: .:.: . .:: :.: . : :.::. . : : :: . : CCDS63 FSCNIGYLMQGPTKAQCQANRQWSHPPPMCKVVNCSDPGIPA-NSKRESKIEHGNFT-YG 2860 2870 2880 2890 2900 2910 170 180 190 200 210 220 pF1KB6 DTAVFECLPQHAMFGNDTITCTTHGNWTK-LPECREVKCPFPSRPDNGFVNYPAKPTLYY .. ..: : . .::.... : .:.: : :::: . : :. : :. .. : : . CCDS63 TVVFYDCNPGYFLFGSSVLICQPNGQWDKPLPECIMIDCGHPGVPPNAVLS-GEKYT--F 2920 2930 2940 2950 2960 2970 230 240 250 260 270 280 pF1KB6 KDKATFGCHDGYSLDGPEEIECTKLGNWS-AMPSCKA----SCKLPVKKATVVYQGERVK . . ..: :: : : :.:: ..: :.. .: : CCDS63 GSTVHYSCTGKRSLLGQSSRTCQLNGHWSGSQPHCSGDATGTCGDPGTPGHGSRQESNFR 2980 2990 3000 3010 3020 3030 290 300 310 320 330 340 pF1KB6 IQEKFKNGMLHGDKVSFFCKNKEKKCSYTEDAQCIDGTIEVPKCFKEHSSLAFWKTDASD CCDS63 TKSTVRYACDTGYILHGSEERTCLANGSWTGRQPECKAVQCGNPGTTANGKVFRIDGTTF 3040 3050 3060 3070 3080 3090 >-- initn: 212 init1: 170 opt: 379 Z-score: 392.3 bits: 84.4 E(32554): 1.6e-15 Smith-Waterman score: 379; 28.8% identity (53.0% similar) in 236 aa overlap (41-267:3149-3374) 20 30 40 50 60 pF1KB6 SFLCHVAIAGRTCPKPDDLPFSTVVPLKTFYEPGEEITYSCKPGYVSR-GGMRKFICPLT : :....: :.:::. . .: : : .. CCDS63 GTWSGTLPNCTIISCGDPGIPANGLRYGDDYVVGQNVSYMCQPGYTMELNGSRIRTCTIN 3120 3130 3140 3150 3160 3170 70 80 90 100 110 120 pF1KB6 GLWPINTLKCTPRVCPFAGILENGAVRYTTFEYPNTISFSCNTGFYLNGADSAKCTEEGK : : : .:: . :: .. :.:.. .::. :. :. :. :. .: CCDS63 GTWSGVMPTCRAVTCPTPPQISNGRLEGTNFDWGFSISYICSPGYELSFPAVLTCVGNGT 3180 3190 3200 3210 3220 3230 130 140 150 160 170 180 pF1KB6 WSPELPVCAPIICPPPSIPTFATLRVYKPSAGNNSLYRDTAVFECLPQHAMFGNDTITCT :: :.: : : .: :.::. :.. .:.. . : : . :..: : CCDS63 WSGEVPQCLPKFCGDPGIPA------QGKREGKSFIYQSEVSFSCNFPFILVGSSTRICQ 3240 3250 3260 3270 3280 3290 190 200 210 220 230 240 pF1KB6 THGNWT-KLPECRE---VKCPFPSRPDNGFVNYPAKPTLYYK--DKATFGCHDGYSLDGP . :.:. . :.: : ..: :. : .: : :. .. . . : :. :. :.: CCDS63 ADGTWSGSSPHCIEPTQTSCENPGVPRHGSQNN----TFGFQVGSVVQFHCKKGHLLQGS 3300 3310 3320 3330 3340 250 260 270 280 290 300 pF1KB6 EEIECTKLGNWSAM-PSC-KASCKLPVKKATVVYQGERVKIQEKFKNGMLHGDKVSFFCK : .::.. : : ::: : CCDS63 TTRTCLPDLTWSGIQPECIPHSCKQPETPAHANVVGMDLPSHGYTLIYTCQPGFFLAGGT 3350 3360 3370 3380 3390 3400 >>CCDS6315.1 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8 (3707 aa) initn: 388 init1: 205 opt: 391 Z-score: 404.8 bits: 86.8 E(32554): 3.2e-16 Smith-Waterman score: 398; 27.7% identity (54.3% similar) in 256 aa overlap (18-267:2813-3059) 10 20 30 40 pF1KB6 MISPVLILFSSFLCHVAIAGRTCPKPDDLPFSTVVPLKTFYEPGEEI .::. : :. . . :. . :. . . CCDS63 FTCDLGFMLVGSAVRECLSSGLWSESETRCLAGH-CGIPELIVNGQVIGENYGYR--DTV 2790 2800 2810 2820 2830 50 60 70 80 90 100 pF1KB6 TYSCKPGYVSRGGMRKFICPLTGLWPINTLKCTPRVCPFAGILENGAVRYTTFEYPNTIS .:.:.::. :. . :: : . .:.: : : : . . :.. .... CCDS63 VYQCNPGFRLIGSSVR-ICQQDHNWSGQLPSCVPVSCGHPGSPIYGRTSGNGFNFNDVVT 2840 2850 2860 2870 2880 2890 110 120 130 140 150 160 pF1KB6 FSCNTGFYLNGADSAKCTEEGKWSPELPVCAPIICPPPSIPTFATLRVYKPSAGNNSLYR :::: :. ..: .:.: . .:: :.: . : :.::. . : : :: . : CCDS63 FSCNIGYLMQGPTKAQCQANRQWSHPPPMCKVVNCSDPGIPA-NSKRESKIEHGNFT-YG 2900 2910 2920 2930 2940 2950 170 180 190 200 210 220 pF1KB6 DTAVFECLPQHAMFGNDTITCTTHGNWTK-LPECREVKCPFPSRPDNGFVNYPAKPTLYY .. ..: : . .::.... : .:.: : :::: . : :. : :. .. : : . CCDS63 TVVFYDCNPGYFLFGSSVLICQPNGQWDKPLPECIMIDCGHPGVPPNAVLS-GEKYT--F 2960 2970 2980 2990 3000 3010 230 240 250 260 270 280 pF1KB6 KDKATFGCHDGYSLDGPEEIECTKLGNWS-AMPSCKA----SCKLPVKKATVVYQGERVK . . ..: :: : : :.:: ..: :.. .: : CCDS63 GSTVHYSCTGKRSLLGQSSRTCQLNGHWSGSQPHCSGDATGTCGDPGTPGHGSRQESNFR 3020 3030 3040 3050 3060 3070 290 300 310 320 330 340 pF1KB6 IQEKFKNGMLHGDKVSFFCKNKEKKCSYTEDAQCIDGTIEVPKCFKEHSSLAFWKTDASD CCDS63 TKSTVRYACDTGYILHGSEERTCLANGSWTGRQPECKAVQCGNPGTTANGKVFRIDGTTF 3080 3090 3100 3110 3120 3130 >-- initn: 212 init1: 170 opt: 379 Z-score: 392.2 bits: 84.4 E(32554): 1.6e-15 Smith-Waterman score: 379; 28.8% identity (53.0% similar) in 236 aa overlap (41-267:3189-3414) 20 30 40 50 60 pF1KB6 SFLCHVAIAGRTCPKPDDLPFSTVVPLKTFYEPGEEITYSCKPGYVSR-GGMRKFICPLT : :....: :.:::. . .: : : .. 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