FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB6461, 321 aa 1>>>pF1KB6461 321 - 321 aa - 321 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6128+/-0.000765; mu= 11.0436+/- 0.046 mean_var=121.5235+/-23.289, 0's: 0 Z-trim(112.8): 128 B-trim: 16 in 1/50 Lambda= 0.116344 statistics sampled from 13414 (13549) to 13414 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.774), E-opt: 0.2 (0.416), width: 16 Scan time: 2.940 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS12184.1 FCER2 gene_id:2208|Hs108|chr19 ( 321) 2221 383.3 1.4e-106 CCDS12185.1 CLEC4G gene_id:339390|Hs108|chr19 ( 293) 438 84.0 1.6e-16 CCDS59347.1 CLEC4M gene_id:10332|Hs108|chr19 ( 263) 399 77.4 1.4e-14 CCDS82049.1 CLEC10A gene_id:10462|Hs108|chr17 ( 289) 379 74.1 1.5e-13 CCDS12187.1 CLEC4M gene_id:10332|Hs108|chr19 ( 399) 381 74.5 1.5e-13 CCDS45598.1 ASGR2 gene_id:433|Hs108|chr17 ( 292) 377 73.7 1.9e-13 CCDS32544.1 ASGR2 gene_id:433|Hs108|chr17 ( 311) 377 73.8 2e-13 CCDS45597.1 CLEC10A gene_id:10462|Hs108|chr17 ( 292) 376 73.6 2.2e-13 CCDS59344.1 CD209 gene_id:30835|Hs108|chr19 ( 268) 375 73.4 2.3e-13 CCDS56087.1 CLEC17A gene_id:388512|Hs108|chr19 ( 378) 377 73.8 2.4e-13 CCDS11088.1 ASGR2 gene_id:433|Hs108|chr17 ( 287) 367 72.1 6.1e-13 CCDS45952.1 CD209 gene_id:30835|Hs108|chr19 ( 312) 367 72.1 6.5e-13 CCDS56017.1 ASGR1 gene_id:432|Hs108|chr17 ( 252) 363 71.3 8.8e-13 CCDS11089.1 ASGR1 gene_id:432|Hs108|chr17 ( 291) 363 71.4 9.8e-13 CCDS45949.1 CD209 gene_id:30835|Hs108|chr19 ( 360) 351 69.4 4.7e-12 CCDS45950.1 CD209 gene_id:30835|Hs108|chr19 ( 380) 351 69.5 4.9e-12 CCDS12186.1 CD209 gene_id:30835|Hs108|chr19 ( 404) 351 69.5 5.1e-12 CCDS59345.1 CD209 gene_id:30835|Hs108|chr19 ( 243) 339 67.3 1.4e-11 CCDS11087.1 CLEC10A gene_id:10462|Hs108|chr17 ( 316) 338 67.2 1.9e-11 CCDS1149.1 BCAN gene_id:63827|Hs108|chr1 ( 911) 341 68.1 3.1e-11 CCDS12397.1 NCAN gene_id:1463|Hs108|chr19 (1321) 340 68.0 4.6e-11 >>CCDS12184.1 FCER2 gene_id:2208|Hs108|chr19 (321 aa) initn: 2221 init1: 2221 opt: 2221 Z-score: 2026.9 bits: 383.3 E(32554): 1.4e-106 Smith-Waterman score: 2221; 99.7% identity (100.0% similar) in 321 aa overlap (1-321:1-321) 10 20 30 40 50 60 pF1KB6 MEEGQYSEIEELPRRRCCRRGTQIVLLGLVTAALWAGLLTLLLLWHWDTTQSLKQLEERA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 MEEGQYSEIEELPRRRCCRRGTQIVLLGLVTAALWAGLLTLLLLWHWDTTQSLKQLEERA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB6 ARNVSQVSKNLESHHGDQMAQKSQSTQISQELEELRAEQQRLKSQDLELSWNLNGLQADL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 ARNVSQVSKNLESHHGDQMAQKSQSTQISQELEELRAEQQRLKSQDLELSWNLNGLQADL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB6 SSFKSQELNERNEASDLLERLREEVTKLRMELQVSSGFVCNTCPEKWINFQRKCYYFGKG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 SSFKSQELNERNEASDLLERLREEVTKLRMELQVSSGFVCNTCPEKWINFQRKCYYFGKG 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB6 TKQWVHARYACDDMEGQLVSIHSPEEQDFLTKHASHTGSWIGLRNLDLKGEFIWVDGSHV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 TKQWVHARYACDDMEGQLVSIHSPEEQDFLTKHASHTGSWIGLRNLDLKGEFIWVDGSHV 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB6 DYSNWAPGEPTSRSQGEDCVMMRGSGRWNDAFCDRKLGAWVCDQLATCTPPASEGSAESM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::: CCDS12 DYSNWAPGEPTSRSQGEDCVMMRGSGRWNDAFCDRKLGAWVCDRLATCTPPASEGSAESM 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KB6 GPDSRPDPDGRLPTPSAPLHS ::::::::::::::::::::: CCDS12 GPDSRPDPDGRLPTPSAPLHS 310 320 >>CCDS12185.1 CLEC4G gene_id:339390|Hs108|chr19 (293 aa) initn: 448 init1: 196 opt: 438 Z-score: 410.1 bits: 84.0 E(32554): 1.6e-16 Smith-Waterman score: 438; 29.7% identity (56.8% similar) in 273 aa overlap (19-288:29-293) 10 20 30 40 50 pF1KB6 MEEGQYSEIEELPRRRCCRRGTQIVLLGLVTAALWAGLLTLLLLWHWDTT :: ..: :::..::: .:..:: CCDS12 MDTTRYSKWGGSSEEVPGGPWGRWVHWSRRPLFLALAVLVTTVLWAVILSILLSKASTER 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB6 QSLKQLEERAARNVSQVSKNLESHHGDQMAQKSQSTQISQELEELRAEQQRLKSQDLELS .: . .. :.:. . : . . . .: . . .:. ::: . ... .: CCDS12 AALLDGHDLLRTNASKQTAALGALKEEVGDCHSCCSGTQAQLQTTRAELGEAQAKLMEQE 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB6 WNLNGLQADLSSFKSQELNERNEASDLLERLREEVTKLRMELQVSSGFVCNTCPEKWINF : :. ... .. :... : : : : .:: .: :. :: .:..: CCDS12 SALRELRERVTQGLAEAGRGREDVRTELFRALEAV-----RLQNNS---CEPCPTSWLSF 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB6 QRKCYYFGKGTKQWVHARYACDDMEGQLVSIHSPEEQDFLTKHASHTGSWIGLRNLDLKG . .::.:. :. :. : : ..:: . . .:: :::... : :.::: . : CCDS12 EGSCYFFSVPKTTWAAAQDHCADASAHLVIVGGLDEQGFLTRNTRGRGYWLGLRAVRHLG 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KB6 E---FIWVDGSHVDYSNWAPGEPTSRSQGEDCVMMRGSGRWNDAFCDRKLGAWVCDQLAT . . :::: ...:.: :::.. :.:::: .: :::: :: . .:.:.. . CCDS12 KVQGYQWVDGVSLSFSHWNQGEPNDAWGRENCVMMLHTGLWNDAPCDSEKDGWICEKRHN 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 pF1KB6 CTPPASEGSAESMGPDSRPDPDGRLPTPSAPLHS : CCDS12 C >>CCDS59347.1 CLEC4M gene_id:10332|Hs108|chr19 (263 aa) initn: 343 init1: 169 opt: 399 Z-score: 375.3 bits: 77.4 E(32554): 1.4e-14 Smith-Waterman score: 412; 33.0% identity (66.1% similar) in 230 aa overlap (64-288:51-259) 40 50 60 70 80 90 pF1KB6 LWAGLLTLLLLWHWDTTQSLKQLEERAARNVSQVSKNLESHHGDQMAQKSQSTQISQELE ::.: ..: .....: : .. ::.. . CCDS59 TSGIRLFPRDFQFQQIHGHKSSTVPFLLGPVSKVPSSLSQEQSEQDAIYQNLTQLKAAVG 30 40 50 60 70 80 100 110 120 130 140 150 pF1KB6 ELRAEQQRLKSQDLELSWNLNGLQADLSSFKSQELNERNEASDLLERLREEVTKLRMELQ :: .:...:. :. .:. :.: .. :: :... :... .:.:.:. .. CCDS59 EL-SEKSKLQ----EIYQELTQLKAAVG-----ELPEKSK----LQEIYQELTRLKAAVE 90 100 110 120 160 170 180 190 200 210 pF1KB6 VSSGFVCNTCPEKWINFQRKCYYFGKGTKQWVHARYACDDMEGQLVSIHSPEEQDFLTKH .: ::. : :: .::..... ..: . ::.....::: :.. :::.:: . CCDS59 R----LCRHCPKDWTFFQGNCYFMSNSQRNWHDSVTACQEVRAQLVVIKTAEEQNFLQLQ 130 140 150 160 170 180 220 230 240 250 260 pF1KB6 ASHTG--SWIGLRNLDLKGEFIWVDGSHVDYS---NWAPGEPTSRSQGEDCVMMRGSGRW .:... ::.:: .:. .: . ::::: .. : : :::.. : .:::. . ::: : CCDS59 TSRSNRFSWMGLSDLNQEGTWQWVDGSPLSPSFQRYWNSGEPNN-SGNEDCAEFSGSG-W 190 200 210 220 230 240 270 280 290 300 310 320 pF1KB6 NDAFCDRKLGAWVCDQLATCTPPASEGSAESMGPDSRPDPDGRLPTPSAPLHS :: :: . :.: . :.: CCDS59 NDNRCDVD-NYWICKKPAACFRDE 250 260 >>CCDS82049.1 CLEC10A gene_id:10462|Hs108|chr17 (289 aa) initn: 387 init1: 209 opt: 379 Z-score: 356.6 bits: 74.1 E(32554): 1.5e-13 Smith-Waterman score: 379; 31.4% identity (63.3% similar) in 210 aa overlap (86-283:74-278) 60 70 80 90 100 110 pF1KB6 LEERAARNVSQVSKNLESHHGDQMAQKSQSTQISQELEELRAEQQRLKSQDLELSWNLNG :..:. . :: : : :: : .. . CCDS82 SLGLGLLLLVIICVVGFQNSKFQRDLVTLRTDFSNFTSNTVAEIQALTSQGSSLEETIAS 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KB6 LQADLSSFKSQELNERNEASDLLERLREEVTKLRMEL-----QVSSGFVCNTCPEKWINF :.:.. .::... ..: ...: ... :: .. ..:. .: :: .:.. CCDS82 LKAEVEGFKQERQAVHSEMLLRVQQLVQDLKKLTCQVATLNNNASTEGTC--CPVNWVEH 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB6 QRKCYYFGKGTKQWVHARYACDDMEGQLVSIHSPEEQDFLTKHASHTGSWIGLRNLDLKG : .::.:... .:..:. :. ...:: :.: :::.:. :. . . .:.:: : .: CCDS82 QDSCYWFSHSGMSWAEAEKYCQLKNAHLVVINSREEQNFVQKYLGSAYTWMGLS--DPEG 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 pF1KB6 EFIWVDGSH--VDYSNWAPGEPTSRSQ-----GEDCVMMRGSGRWNDAFCDRKLGAWVCD . ::::. . ..:: ::.: . . ::::. .. .::::: :.: :::. CCDS82 AWKWVDGTDYATGFQNWKPGQPDDWQGHGLGGGEDCAHFHPDGRWNDDVCQRPYH-WVCE 220 230 240 250 260 270 290 300 310 320 pF1KB6 QLATCTPPASEGSAESMGPDSRPDPDGRLPTPSAPLHS CCDS82 AGLGQTSQESH 280 >>CCDS12187.1 CLEC4M gene_id:10332|Hs108|chr19 (399 aa) initn: 347 init1: 169 opt: 381 Z-score: 356.5 bits: 74.5 E(32554): 1.5e-13 Smith-Waterman score: 413; 32.6% identity (62.8% similar) in 239 aa overlap (57-288:174-395) 30 40 50 60 70 80 pF1KB6 LGLVTAALWAGLLTLLLLWHWDTTQSLKQLEERAARNVSQVSKNLESHHGDQMAQKSQST :. ... : :.. :. . .::. CCDS12 AAVGELPEKSKLQEIYQELTRLKAAVGELPEKSKLQEIYQELTRLKAAVGE-LPEKSKLQ 150 160 170 180 190 200 90 100 110 120 130 140 pF1KB6 QISQELEELRAEQQRL--KSQDLELSWNLNGLQADLSSFKSQELNERNEASDLLERLREE .: ::: ::.: .: ::. :. .:. :.: .. :: .... ... .: CCDS12 EIYQELTELKAAVGELPEKSKLQEIYQELTQLKAAVG-----ELPDQSKQ----QQIYQE 210 220 230 240 250 150 160 170 180 190 200 pF1KB6 VTKLRMELQVSSGFVCNTCPEKWINFQRKCYYFGKGTKQWVHARYACDDMEGQLVSIHSP .: :. .. .: ::. : :: .::..... ..: . ::.....::: :.. CCDS12 LTDLKTAFE----RLCRHCPKDWTFFQGNCYFMSNSQRNWHDSVTACQEVRAQLVVIKTA 260 270 280 290 300 210 220 230 240 250 pF1KB6 EEQDFLTKHASHTG--SWIGLRNLDLKGEFIWVDGSHVDYS---NWAPGEPTSRSQGEDC :::.:: ..:... ::.:: .:. .: . ::::: .. : : :::.. : .::: CCDS12 EEQNFLQLQTSRSNRFSWMGLSDLNQEGTWQWVDGSPLSPSFQRYWNSGEPNN-SGNEDC 310 320 330 340 350 360 260 270 280 290 300 310 pF1KB6 VMMRGSGRWNDAFCDRKLGAWVCDQLATCTPPASEGSAESMGPDSRPDPDGRLPTPSAPL . . ::: ::: :: . :.: . :.: CCDS12 AEFSGSG-WNDNRCDVD-NYWICKKPAACFRDE 370 380 390 >>CCDS45598.1 ASGR2 gene_id:433|Hs108|chr17 (292 aa) initn: 362 init1: 228 opt: 377 Z-score: 354.8 bits: 73.7 E(32554): 1.9e-13 Smith-Waterman score: 377; 32.2% identity (63.0% similar) in 227 aa overlap (72-284:63-283) 50 60 70 80 90 pF1KB6 LLLWHWDTTQSLKQLEERAARNVSQVSKNLESHHGDQMAQKSQSTQ--ISQELEELRAEQ :.: : :. . .: . .:. .: CCDS45 RLCSMVCFSLLALSFNILLLVVICVTGSQSEGHGGAQLQAELRSLKEAFSNFSSSTLTEV 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 pF1KB6 QRLKSQDLELSWNLNGLQADLSSFKSQELNERNEASDLLERLREEVTKLR-----MELQV : .... .. ....: : : . ..:.:. ..: :: .:.. . :: ::: CCDS45 QAISTHGGSVGDKITSLGAKLEK-QQQDLKADHDA--LLFHLKHFPVDLRFVACQMELLH 100 110 120 130 140 160 170 180 190 200 210 pF1KB6 SSGFVCNTCPEKWINFQRKCYYFGKGTKQWVHARYACDDMEGQLVSIHSPEEQDFLTKHA :.: . :: .:.. : .::.:... : :..:. :. ...:: :.: ::: :...:. CCDS45 SNGSQRTCCPVNWVEHQGSCYWFSHSGKAWAEAEKYCQLENAHLVVINSWEEQKFIVQHT 150 160 170 180 190 200 220 230 240 250 260 pF1KB6 SHTGSWIGLRNLDLKGEFIWVDGSHV--DYSNWAPGEPTSR-----SQGEDCVMMRGSGR . ..:::: . : : . ::::. .:.::: .: . . .:::: .. .:: CCDS45 NPFNTWIGLTDSD--GSWKWVDGTDYRHNYKNWAVTQPDNWHGHELGGSEDCVEVQPDGR 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KB6 WNDAFCDRKLGAWVCDQLATCTPPASEGSAESMGPDSRPDPDGRLPTPSAPLHS ::: :: .. :::.. CCDS45 WNDDFC-LQVYRWVCEKRRNATGEVA 270 280 290 >>CCDS32544.1 ASGR2 gene_id:433|Hs108|chr17 (311 aa) initn: 362 init1: 228 opt: 377 Z-score: 354.4 bits: 73.8 E(32554): 2e-13 Smith-Waterman score: 377; 32.2% identity (63.0% similar) in 227 aa overlap (72-284:82-302) 50 60 70 80 90 pF1KB6 LLLWHWDTTQSLKQLEERAARNVSQVSKNLESHHGDQMAQKSQSTQ--ISQELEELRAEQ :.: : :. . .: . .:. .: CCDS32 RLCSMVCFSLLALSFNILLLVVICVTGSQSEGHGGAQLQAELRSLKEAFSNFSSSTLTEV 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KB6 QRLKSQDLELSWNLNGLQADLSSFKSQELNERNEASDLLERLREEVTKLR-----MELQV : .... .. ....: : : . ..:.:. ..: :: .:.. . :: ::: CCDS32 QAISTHGGSVGDKITSLGAKLEK-QQQDLKADHDA--LLFHLKHFPVDLRFVACQMELLH 120 130 140 150 160 160 170 180 190 200 210 pF1KB6 SSGFVCNTCPEKWINFQRKCYYFGKGTKQWVHARYACDDMEGQLVSIHSPEEQDFLTKHA :.: . :: .:.. : .::.:... : :..:. :. ...:: :.: ::: :...:. CCDS32 SNGSQRTCCPVNWVEHQGSCYWFSHSGKAWAEAEKYCQLENAHLVVINSWEEQKFIVQHT 170 180 190 200 210 220 220 230 240 250 260 pF1KB6 SHTGSWIGLRNLDLKGEFIWVDGSHV--DYSNWAPGEPTSR-----SQGEDCVMMRGSGR . ..:::: . : : . ::::. .:.::: .: . . .:::: .. .:: CCDS32 NPFNTWIGLTDSD--GSWKWVDGTDYRHNYKNWAVTQPDNWHGHELGGSEDCVEVQPDGR 230 240 250 260 270 280 270 280 290 300 310 320 pF1KB6 WNDAFCDRKLGAWVCDQLATCTPPASEGSAESMGPDSRPDPDGRLPTPSAPLHS ::: :: .. :::.. CCDS32 WNDDFC-LQVYRWVCEKRRNATGEVA 290 300 310 >>CCDS45597.1 CLEC10A gene_id:10462|Hs108|chr17 (292 aa) initn: 387 init1: 209 opt: 376 Z-score: 353.8 bits: 73.6 E(32554): 2.2e-13 Smith-Waterman score: 376; 31.3% identity (63.0% similar) in 211 aa overlap (86-283:74-281) 60 70 80 90 100 110 pF1KB6 LEERAARNVSQVSKNLESHHGDQMAQKSQSTQISQELEELRAEQQRLKSQDLELSWNLNG :..:. . :: : : :: : .. . CCDS45 SLGLGLLLLVIICVVGFQNSKFQRDLVTLRTDFSNFTSNTVAEIQALTSQGSSLEETIAS 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 pF1KB6 LQADLSSFKSQELNERNEASDLLERLREEVTKLRMELQV--SSGFVCNT----CPEKWIN :.:.. .::... ..: ...: ... :: .. . ..: .: :: .:.. CCDS45 LKAEVEGFKQERQAVHSEMLLRVQQLVQDLKKLTCQVATLNNNGEEASTEGTCCPVNWVE 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KB6 FQRKCYYFGKGTKQWVHARYACDDMEGQLVSIHSPEEQDFLTKHASHTGSWIGLRNLDLK : .::.:... .:..:. :. ...:: :.: :::.:. :. . . .:.:: : . CCDS45 HQDSCYWFSHSGMSWAEAEKYCQLKNAHLVVINSREEQNFVQKYLGSAYTWMGLS--DPE 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KB6 GEFIWVDGSH--VDYSNWAPGEPTSRSQ-----GEDCVMMRGSGRWNDAFCDRKLGAWVC : . ::::. . ..:: ::.: . . ::::. .. .::::: :.: ::: CCDS45 GAWKWVDGTDYATGFQNWKPGQPDDWQGHGLGGGEDCAHFHPDGRWNDDVCQRPYH-WVC 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KB6 DQLATCTPPASEGSAESMGPDSRPDPDGRLPTPSAPLHS . 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