Result of FASTA (ccds) for pF1KB6468
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6468, 354 aa
  1>>>pF1KB6468 354 - 354 aa - 354 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3393+/-0.00121; mu= 16.3657+/- 0.073
 mean_var=71.0513+/-13.762, 0's: 0 Z-trim(101.8): 55  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.152156
 statistics sampled from 6613 (6666) to 6613 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.552), E-opt: 0.2 (0.205), width:  16
 Scan time:  2.470

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS802.1 GNAI3 gene_id:2773|Hs108|chr1            ( 354) 2323 519.5 1.7e-147
CCDS5595.1 GNAI1 gene_id:2770|Hs108|chr7           ( 354) 2209 494.5 5.7e-140
CCDS2813.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3           ( 355) 2051 459.8 1.6e-129
CCDS59061.1 GNAI1 gene_id:2770|Hs108|chr7          ( 302) 1893 425.1 3.8e-119
CCDS54587.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3          ( 318) 1827 410.6 9.1e-115
CCDS63642.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3          ( 339) 1827 410.6 9.6e-115
CCDS63644.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3          ( 303) 1748 393.3 1.5e-109
CCDS803.1 GNAT2 gene_id:2780|Hs108|chr1            ( 354) 1688 380.1 1.5e-105
CCDS47625.1 GNAT3 gene_id:346562|Hs108|chr7        ( 354) 1678 377.9  7e-105
CCDS10757.1 GNAO1 gene_id:2775|Hs108|chr16         ( 354) 1675 377.3 1.1e-104
CCDS10756.1 GNAO1 gene_id:2775|Hs108|chr16         ( 354) 1667 375.5 3.7e-104
CCDS2812.1 GNAT1 gene_id:2779|Hs108|chr3           ( 350) 1607 362.3 3.4e-100
CCDS13804.1 GNAZ gene_id:2781|Hs108|chr22          ( 355) 1589 358.4 5.3e-99
CCDS6657.1 GNA14 gene_id:9630|Hs108|chr9           ( 355) 1146 261.1   1e-69
CCDS6658.1 GNAQ gene_id:2776|Hs108|chr9            ( 359) 1144 260.7 1.4e-69
CCDS12103.1 GNA11 gene_id:2767|Hs108|chr19         ( 359) 1114 254.1 1.3e-67
CCDS5335.1 GNA12 gene_id:2768|Hs108|chr7           ( 381)  902 207.6 1.4e-53
CCDS11661.1 GNA13 gene_id:10672|Hs108|chr17        ( 377)  892 205.4 6.4e-53
CCDS12104.1 GNA15 gene_id:2769|Hs108|chr19         ( 374)  874 201.5 9.8e-52
CCDS46624.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20          ( 380)  813 188.1 1.1e-47
CCDS42892.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20          ( 379)  812 187.8 1.2e-47
CCDS11851.1 GNAL gene_id:2774|Hs108|chr18          ( 458)  812 187.9 1.4e-47
CCDS11852.1 GNAL gene_id:2774|Hs108|chr18          ( 381)  795 184.1 1.7e-46
CCDS64584.1 GNA12 gene_id:2768|Hs108|chr7          ( 322)  745 173.1 2.9e-43
CCDS62302.1 GNA13 gene_id:10672|Hs108|chr17        ( 282)  689 160.8 1.3e-39
CCDS64583.1 GNA12 gene_id:2768|Hs108|chr7          ( 305)  659 154.2 1.3e-37
CCDS13472.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20          ( 394)  645 151.2 1.4e-36
CCDS46623.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20          ( 395)  645 151.2 1.4e-36
CCDS46622.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20          (1037)  645 151.5   3e-36
CCDS58614.1 GNAL gene_id:2774|Hs108|chr18          ( 174)  364 89.3 2.6e-18


>>CCDS802.1 GNAI3 gene_id:2773|Hs108|chr1                 (354 aa)
 initn: 2323 init1: 2323 opt: 2323  Z-score: 2761.7  bits: 519.5 E(32554): 1.7e-147
Smith-Waterman score: 2323; 100.0% identity (100.0% similar) in 354 aa overlap (1-354:1-354)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MGCTLSAEDKAAVERSKMIDRNLREDGEKAAKEVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 MGCTLSAEDKAAVERSKMIDRNLREDGEKAAKEVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 YSEDECKQYKVVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGEAARADDARQLFVLAGSAEEGVMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 YSEDECKQYKVVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGEAARADDARQLFVLAGSAEEGVMT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 PELAGVIKRLWRDGGVQACFSRSREYQLNDSASYYLNDLDRISQSNYIPTQQDVLRTRVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 PELAGVIKRLWRDGGVQACFSRSREYQLNDSASYYLNDLDRISQSNYIPTQQDVLRTRVK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 TTGIVETHFTFKDLYFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 TTGIVETHFTFKDLYFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEM
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 NRMHESMKLFDSICNNKWFTETSIILFLNKKDLFEEKIKRSPLTICYPEYTGSNTYEEAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 NRMHESMKLFDSICNNKWFTETSIILFLNKKDLFEEKIKRSPLTICYPEYTGSNTYEEAA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350    
pF1KB6 AYIQCQFEDLNRRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKECGLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 AYIQCQFEDLNRRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKECGLY
              310       320       330       340       350    

>>CCDS5595.1 GNAI1 gene_id:2770|Hs108|chr7                (354 aa)
 initn: 2230 init1: 2209 opt: 2209  Z-score: 2626.4  bits: 494.5 E(32554): 5.7e-140
Smith-Waterman score: 2209; 93.8% identity (98.9% similar) in 354 aa overlap (1-354:1-354)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MGCTLSAEDKAAVERSKMIDRNLREDGEKAAKEVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDG
       :::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::: :
CCDS55 MGCTLSAEDKAAVERSKMIDRNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEAG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 YSEDECKQYKVVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGEAARADDARQLFVLAGSAEEGVMT
       :::.::::::.:::::::::::::::::::::::::..::::::::::::::.:::: ::
CCDS55 YSEEECKQYKAVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGDSARADDARQLFVLAGAAEEGFMT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 PELAGVIKRLWRDGGVQACFSRSREYQLNDSASYYLNDLDRISQSNYIPTQQDVLRTRVK
        ::::::::::.:.::::::.:::::::::::.:::::::::.: :::::::::::::::
CCDS55 AELAGVIKRLWKDSGVQACFNRSREYQLNDSAAYYLNDLDRIAQPNYIPTQQDVLRTRVK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 TTGIVETHFTFKDLYFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEM
       ::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEM
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 NRMHESMKLFDSICNNKWFTETSIILFLNKKDLFEEKIKRSPLTICYPEYTGSNTYEEAA
       ::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::::::.:::::::::
CCDS55 NRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKIKKSPLTICYPEYAGSNTYEEAA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350    
pF1KB6 AYIQCQFEDLNRRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKECGLY
       :::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.
CCDS55 AYIQCQFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF
              310       320       330       340       350    

>>CCDS2813.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3                (355 aa)
 initn: 2076 init1: 1437 opt: 2051  Z-score: 2439.0  bits: 459.8 E(32554): 1.6e-129
Smith-Waterman score: 2051; 85.9% identity (96.6% similar) in 355 aa overlap (1-354:1-355)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MGCTLSAEDKAAVERSKMIDRNLREDGEKAAKEVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDG
       ::::.:::::::.:::::::.::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 MGCTVSAEDKAAAERSKMIDKNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110          
pF1KB6 YSEDECKQYKVVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGEAARADDARQLFVLAGSAEE-GVM
       :::.::.::..::::::::::.::..::: :.:::.. .:::::::::.:. .::: ::.
CCDS28 YSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMGNLQIDFADPSRADDARQLFALSCTAEEQGVL
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB6 TPELAGVIKRLWRDGGVQACFSRSREYQLNDSASYYLNDLDRISQSNYIPTQQDVLRTRV
         .:.:::.::: : ::::::.:::::::::::.::::::.::.::.:::::::::::::
CCDS28 PDDLSGVIRRLWADHGVQACFGRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRV
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB6 KTTGIVETHFTFKDLYFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEE
       :::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS28 KTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEE
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB6 MNRMHESMKLFDSICNNKWFTETSIILFLNKKDLFEEKIKRSPLTICYPEYTGSNTYEEA
       :::::::::::::::::::::.::::::::::::::::: .::::::.:::::.: :.::
CCDS28 MNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEA
              250       260       270       280       290       300

     300       310       320       330       340       350    
pF1KB6 AAYIQCQFEDLNRRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKECGLY
       :.::: .:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.
CCDS28 ASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF
              310       320       330       340       350     

>>CCDS59061.1 GNAI1 gene_id:2770|Hs108|chr7               (302 aa)
 initn: 1914 init1: 1893 opt: 1893  Z-score: 2252.5  bits: 425.1 E(32554): 3.8e-119
Smith-Waterman score: 1893; 93.0% identity (98.7% similar) in 302 aa overlap (53-354:1-302)

             30        40        50        60        70        80  
pF1KB6 LREDGEKAAKEVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEDECKQYKVVVYSNTIQSII
                                     :::::: ::::.::::::.:::::::::::
CCDS59                               MKIIHEAGYSEEECKQYKAVVYSNTIQSII
                                             10        20        30

             90       100       110       120       130       140  
pF1KB6 AIIRAMGRLKIDFGEAARADDARQLFVLAGSAEEGVMTPELAGVIKRLWRDGGVQACFSR
       ::::::::::::::..::::::::::::::.:::: :: ::::::::::.:.::::::.:
CCDS59 AIIRAMGRLKIDFGDSARADDARQLFVLAGAAEEGFMTAELAGVIKRLWKDSGVQACFNR
               40        50        60        70        80        90

            150       160       170       180       190       200  
pF1KB6 SREYQLNDSASYYLNDLDRISQSNYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLYFKMFDVG
       ::::::::::.:::::::::.: :::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS59 SREYQLNDSAAYYLNDLDRIAQPNYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVG
              100       110       120       130       140       150

            210       220       230       240       250       260  
pF1KB6 GQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS59 GQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDT
              160       170       180       190       200       210

            270       280       290       300       310       320  
pF1KB6 SIILFLNKKDLFEEKIKRSPLTICYPEYTGSNTYEEAAAYIQCQFEDLNRRKDTKEIYTH
       :::::::::::::::::.::::::::::.::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS59 SIILFLNKKDLFEEKIKKSPLTICYPEYAGSNTYEEAAAYIQCQFEDLNKRKDTKEIYTH
              220       230       240       250       260       270

            330       340       350    
pF1KB6 FTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKECGLY
       :::::::::::::::::::::::::::.:::.
CCDS59 FTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF
              280       290       300  

>>CCDS54587.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3               (318 aa)
 initn: 1852 init1: 1437 opt: 1827  Z-score: 2173.9  bits: 410.6 E(32554): 9.1e-115
Smith-Waterman score: 1827; 85.4% identity (96.2% similar) in 316 aa overlap (40-354:3-318)

      10        20        30        40        50        60         
pF1KB6 KAAVERSKMIDRNLREDGEKAAKEVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEDECKQY
                                     ::::::::::::::::::::::::.::.::
CCDS54                             MRGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECRQY
                                           10        20        30  

      70        80        90       100       110        120        
pF1KB6 KVVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGEAARADDARQLFVLAGSAEE-GVMTPELAGVIK
       ..::::::::::.::..::: :.:::.. .:::::::::.:. .::: ::.  .:.:::.
CCDS54 RAVVYSNTIQSIMAIVKAMGNLQIDFADPSRADDARQLFALSCTAEEQGVLPDDLSGVIR
             40        50        60        70        80        90  

      130       140       150       160       170       180        
pF1KB6 RLWRDGGVQACFSRSREYQLNDSASYYLNDLDRISQSNYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETH
       ::: : ::::::.:::::::::::.::::::.::.::.::::::::::::::::::::::
CCDS54 RLWADHGVQACFGRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETH
            100       110       120       130       140       150  

      190       200       210       220       230       240        
pF1KB6 FTFKDLYFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEMNRMHESMK
       ::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS54 FTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMK
            160       170       180       190       200       210  

      250       260       270       280       290       300        
pF1KB6 LFDSICNNKWFTETSIILFLNKKDLFEEKIKRSPLTICYPEYTGSNTYEEAAAYIQCQFE
       ::::::::::::.::::::::::::::::: .::::::.:::::.: :.:::.::: .::
CCDS54 LFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFE
            220       230       240       250       260       270  

      310       320       330       340       350    
pF1KB6 DLNRRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKECGLY
       :::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.
CCDS54 DLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF
            280       290       300       310        

>>CCDS63642.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3               (339 aa)
 initn: 1852 init1: 1437 opt: 1827  Z-score: 2173.5  bits: 410.6 E(32554): 9.6e-115
Smith-Waterman score: 1827; 85.4% identity (96.2% similar) in 316 aa overlap (40-354:24-339)

      10        20        30        40        50        60         
pF1KB6 KAAVERSKMIDRNLREDGEKAAKEVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEDECKQY
                                     ::::::::::::::::::::::::.::.::
CCDS63        MTEGVKTLGWTKQKGGCHWGRSEGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECRQY
                      10        20        30        40        50   

      70        80        90       100       110        120        
pF1KB6 KVVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGEAARADDARQLFVLAGSAEE-GVMTPELAGVIK
       ..::::::::::.::..::: :.:::.. .:::::::::.:. .::: ::.  .:.:::.
CCDS63 RAVVYSNTIQSIMAIVKAMGNLQIDFADPSRADDARQLFALSCTAEEQGVLPDDLSGVIR
            60        70        80        90       100       110   

      130       140       150       160       170       180        
pF1KB6 RLWRDGGVQACFSRSREYQLNDSASYYLNDLDRISQSNYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETH
       ::: : ::::::.:::::::::::.::::::.::.::.::::::::::::::::::::::
CCDS63 RLWADHGVQACFGRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETH
           120       130       140       150       160       170   

      190       200       210       220       230       240        
pF1KB6 FTFKDLYFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEMNRMHESMK
       ::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS63 FTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMK
           180       190       200       210       220       230   

      250       260       270       280       290       300        
pF1KB6 LFDSICNNKWFTETSIILFLNKKDLFEEKIKRSPLTICYPEYTGSNTYEEAAAYIQCQFE
       ::::::::::::.::::::::::::::::: .::::::.:::::.: :.:::.::: .::
CCDS63 LFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFE
           240       250       260       270       280       290   

      310       320       330       340       350    
pF1KB6 DLNRRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKECGLY
       :::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.
CCDS63 DLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF
           300       310       320       330         

>>CCDS63644.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3               (303 aa)
 initn: 1773 init1: 1437 opt: 1748  Z-score: 2080.5  bits: 393.3 E(32554): 1.5e-109
Smith-Waterman score: 1748; 84.8% identity (96.0% similar) in 303 aa overlap (53-354:1-303)

             30        40        50        60        70        80  
pF1KB6 LREDGEKAAKEVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEDECKQYKVVVYSNTIQSII
                                     :::::::::::.::.::..::::::::::.
CCDS63                               MKIIHEDGYSEEECRQYRAVVYSNTIQSIM
                                             10        20        30

             90       100       110        120       130       140 
pF1KB6 AIIRAMGRLKIDFGEAARADDARQLFVLAGSAEE-GVMTPELAGVIKRLWRDGGVQACFS
       ::..::: :.:::.. .:::::::::.:. .::: ::.  .:.:::.::: : ::::::.
CCDS63 AIVKAMGNLQIDFADPSRADDARQLFALSCTAEEQGVLPDDLSGVIRRLWADHGVQACFG
               40        50        60        70        80        90

             150       160       170       180       190       200 
pF1KB6 RSREYQLNDSASYYLNDLDRISQSNYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLYFKMFDV
       :::::::::::.::::::.::.::.::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS63 RSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDV
              100       110       120       130       140       150

             210       220       230       240       250       260 
pF1KB6 GGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTE
       ::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS63 GGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTD
              160       170       180       190       200       210

             270       280       290       300       310       320 
pF1KB6 TSIILFLNKKDLFEEKIKRSPLTICYPEYTGSNTYEEAAAYIQCQFEDLNRRKDTKEIYT
       ::::::::::::::::: .::::::.:::::.: :.:::.::: .:::::.:::::::::
CCDS63 TSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYT
              220       230       240       250       260       270

             330       340       350    
pF1KB6 HFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKECGLY
       ::::::::::::::::::::::::::::.:::.
CCDS63 HFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF
              280       290       300   

>>CCDS803.1 GNAT2 gene_id:2780|Hs108|chr1                 (354 aa)
 initn: 1688 init1: 1688 opt: 1688  Z-score: 2008.3  bits: 380.1 E(32554): 1.5e-105
Smith-Waterman score: 1688; 69.5% identity (89.8% similar) in 354 aa overlap (1-354:1-354)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MGCTLSAEDKAAVERSKMIDRNLREDGEKAAKEVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDG
       ::   :::::  ..::: ....:.::..: :: ::::::::::::::::::::::::.::
CCDS80 MGSGASAEDKELAKRSKELEKKLQEDADKEAKTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHQDG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 YSEDECKQYKVVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGEAARADDARQLFVLAGSAEEGVMT
       :: .:: ..:...:.:..:::.::::::  : ::..: . :::.:::  :: : :::.: 
CCDS80 YSPEECLEFKAIIYGNVLQSILAIIRAMTTLGIDYAEPSCADDGRQLNNLADSIEEGTMP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 PELAGVIKRLWRDGGVQACFSRSREYQLNDSASYYLNDLDRISQSNYIPTQQDVLRTRVK
       :::. ::.:::.:::::::: :. :::::::::::::.:.::.. .:.:..:::::.:::
CCDS80 PELVEVIRRLWKDGGVQACFERAAEYQLNDSASYYLNQLERITDPEYLPSEQDVLRSRVK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 TTGIVETHFTFKDLYFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEM
       ::::.::.:. ::: :.:::::::::::::::::::::: ::::.::: ::.::.::.:.
CCDS80 TTGIIETKFSVKDLNFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDDEV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 NRMHESMKLFDSICNNKWFTETSIILFLNKKDLFEEKIKRSPLTICYPEYTGSNTYEEAA
       ::::::..::.::::.:.:. :::.::::::::::::::.  :.::.::: :.:.:..:.
CCDS80 NRMHESLHLFNSICNHKFFAATSIVLFLNKKDLFEEKIKKVHLSICFPEYDGNNSYDDAG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350    
pF1KB6 AYIQCQFEDLNRRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKECGLY
        ::. :: ::: :::.::::.:.::::::.::.::::::::.:::.:::.:::.
CCDS80 NYIKSQFLDLNMRKDVKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
              310       320       330       340       350    

>>CCDS47625.1 GNAT3 gene_id:346562|Hs108|chr7             (354 aa)
 initn: 1678 init1: 1678 opt: 1678  Z-score: 1996.5  bits: 377.9 E(32554): 7e-105
Smith-Waterman score: 1678; 67.5% identity (90.4% similar) in 354 aa overlap (1-354:1-354)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MGCTLSAEDKAAVERSKMIDRNLREDGEKAAKEVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDG
       ::  .:.:.: ...::: ....:.::.:. :. ::::::::::::::::::::::::..:
CCDS47 MGSGISSESKESAKRSKELEKKLQEDAERDARTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHKNG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 YSEDECKQYKVVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGEAARADDARQLFVLAGSAEEGVMT
       :::.:: ..:.:.::::.:::.::..::  : ::. .   :.: :::...:.. :.: ::
CCDS47 YSEQECMEFKAVIYSNTLQSILAIVKAMTTLGIDYVNPRSAEDQRQLYAMANTLEDGGMT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 PELAGVIKRLWRDGGVQACFSRSREYQLNDSASYYLNDLDRISQSNYIPTQQDVLRTRVK
       :.:: :::::::: :.:::: :. ::::::::.:::::::::. :.:.:..::::..:::
CCDS47 PQLAEVIKRLWRDPGIQACFERASEYQLNDSAAYYLNDLDRITASGYVPNEQDVLHSRVK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 TTGIVETHFTFKDLYFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEM
       ::::.::.:.::::.:.:::::::::::::::::::::: ::::.::: ::.::.::::.
CCDS47 TTGIIETQFSFKDLHFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDEEV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 NRMHESMKLFDSICNNKWFTETSIILFLNKKDLFEEKIKRSPLTICYPEYTGSNTYEEAA
       ::::::..::.::::.:.:. :::.:::::::.:.::. .  :.::.::::: ::.:.:.
CCDS47 NRMHESLHLFNSICNHKYFSTTSIVLFLNKKDIFQEKVTKVHLSICFPEYTGPNTFEDAG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350    
pF1KB6 AYIQCQFEDLNRRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKECGLY
        ::. :: ::: .:. ::::.:.::::::.::.::::::::.:::.:::.:::.
CCDS47 NYIKNQFLDLNLKKEDKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
              310       320       330       340       350    

>>CCDS10757.1 GNAO1 gene_id:2775|Hs108|chr16              (354 aa)
 initn: 1017 init1: 1017 opt: 1675  Z-score: 1992.9  bits: 377.3 E(32554): 1.1e-104
Smith-Waterman score: 1675; 71.0% identity (87.6% similar) in 355 aa overlap (1-354:1-354)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MGCTLSAEDKAAVERSKMIDRNLREDGEKAAKEVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDG
       ::::::::..::.:::: :..::.::: .:::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MGCTLSAEERAALERSKAIEKNLKEDGISAAKDVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110          
pF1KB6 YSEDECKQYKVVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGEAARADDARQLFVLAGSAEEGV-M
       .: .. :::: :::::::::. ::.:::  : :..:.  :  ::...  ...  :.   .
CCDS10 FSGEDVKQYKPVVYSNTIQSLAAIVRAMDTLGIEYGDKERKADAKMVCDVVSRMEDTEPF
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB6 TPELAGVIKRLWRDGGVQACFSRSREYQLNDSASYYLNDLDRISQSNYIPTQQDVLRTRV
       . :: ... ::: :.:.: ::.:::::::::::.:::..::::. ..: ::.::.:::::
CCDS10 SAELLSAMMRLWGDSGIQECFNRSREYQLNDSAKYYLDSLDRIGAADYQPTEQDILRTRV
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB6 KTTGIVETHFTFKDLYFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEE
       :::::::::::::.:.:..:::::::::::::::::: ::::::::::: :: :: ::: 
CCDS10 KTTGIVETHFTFKNLHFRLFDVGGQRSERKKWIHCFEDVTAIIFCVALSGYDQVLHEDET
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB6 MNRMHESMKLFDSICNNKWFTETSIILFLNKKDLFEEKIKRSPLTICYPEYTGSNTYEEA
        ::::::.:::::::::::::.:::::::::::.::::::.::::::.::::: ... ::
CCDS10 TNRMHESLKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDIFEEKIKKSPLTICFPEYTGPSAFTEA
              250       260       270       280       290       300

     300       310       320       330       340       350    
pF1KB6 AAYIQCQFEDLNRRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKECGLY
       .:::: :.:. :.    :::::: ::::::.:.:::::::::::: .::. ::::
CCDS10 VAYIQAQYESKNKSAH-KEIYTHVTCATDTNNIQFVFDAVTDVIIAKNLRGCGLY
              310        320       330       340       350    




354 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 23:05:22 2016 done: Fri Nov  4 23:05:22 2016
 Total Scan time:  2.470 Total Display time:  0.040

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com