Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6501
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6501, 358 aa
1>>>pF1KB6501 358 - 358 aa - 358 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5005+/-0.00107; mu= 5.7293+/- 0.062
mean_var=205.8594+/-45.496, 0's: 0 Z-trim(110.8): 683 B-trim: 371 in 1/49
Lambda= 0.089390
statistics sampled from 11047 (11867) to 11047 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.721), E-opt: 0.2 (0.365), width: 16
Scan time: 2.660
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14125.1 PRKX gene_id:5613|Hs108|chrX ( 358) 2455 329.4 2.8e-90
CCDS72813.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 339) 1238 172.5 4.8e-43
CCDS691.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 351) 1238 172.5 4.9e-43
CCDS55610.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 355) 1238 172.5 5e-43
CCDS72815.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 357) 1238 172.5 5e-43
CCDS55609.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 358) 1238 172.5 5e-43
CCDS693.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 398) 1238 172.5 5.3e-43
CCDS12304.1 PRKACA gene_id:5566|Hs108|chr19 ( 351) 1235 172.1 6.4e-43
CCDS72816.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 338) 1234 171.9 6.9e-43
CCDS12305.1 PRKACA gene_id:5566|Hs108|chr19 ( 343) 1229 171.3 1.1e-42
CCDS6625.1 PRKACG gene_id:5568|Hs108|chr9 ( 351) 1149 161.0 1.4e-39
CCDS55611.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 321) 1008 142.8 3.9e-34
CCDS44399.1 PRKG1 gene_id:5592|Hs108|chr10 ( 671) 1000 142.1 1.3e-33
CCDS7244.1 PRKG1 gene_id:5592|Hs108|chr10 ( 686) 1000 142.1 1.3e-33
CCDS75150.1 PRKG2 gene_id:5593|Hs108|chr4 ( 342) 957 136.2 3.9e-32
CCDS3589.1 PRKG2 gene_id:5593|Hs108|chr4 ( 762) 957 136.6 6.7e-32
CCDS72814.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 264) 924 131.8 6.3e-31
CCDS72812.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 245) 917 130.9 1.1e-30
CCDS692.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 257) 917 130.9 1.2e-30
CCDS64005.1 PRKG2 gene_id:5593|Hs108|chr4 ( 733) 885 127.3 4.1e-29
CCDS13321.1 SGK2 gene_id:10110|Hs108|chr20 ( 367) 857 123.4 3.1e-28
CCDS12552.1 AKT2 gene_id:208|Hs108|chr19 ( 481) 858 123.6 3.4e-28
CCDS13320.1 SGK2 gene_id:10110|Hs108|chr20 ( 427) 857 123.4 3.5e-28
CCDS31076.1 AKT3 gene_id:10000|Hs108|chr1 ( 465) 857 123.5 3.7e-28
CCDS31077.1 AKT3 gene_id:10000|Hs108|chr1 ( 479) 857 123.5 3.7e-28
CCDS5170.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 431) 847 122.1 8.5e-28
CCDS47478.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 445) 847 122.2 8.7e-28
CCDS47477.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 459) 847 122.2 8.9e-28
CCDS47476.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 526) 847 122.2 9.7e-28
CCDS9994.1 AKT1 gene_id:207|Hs108|chr14 ( 480) 846 122.1 1e-27
CCDS6195.1 SGK3 gene_id:23678|Hs108|chr8 ( 496) 816 118.2 1.5e-26
CCDS62271.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 451) 815 118.0 1.5e-26
CCDS62273.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 472) 815 118.1 1.6e-26
CCDS11621.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 525) 815 118.1 1.7e-26
CCDS42513.1 PKN1 gene_id:5585|Hs108|chr19 ( 942) 818 118.8 1.9e-26
CCDS42514.1 PKN1 gene_id:5585|Hs108|chr19 ( 948) 818 118.8 1.9e-26
CCDS81350.1 PKN2 gene_id:5586|Hs108|chr1 ( 936) 804 117.0 6.7e-26
CCDS714.1 PKN2 gene_id:5586|Hs108|chr1 ( 984) 804 117.0 6.9e-26
CCDS41677.1 RPS6KB2 gene_id:6199|Hs108|chr11 ( 482) 781 113.7 3.4e-25
CCDS11664.1 PRKCA gene_id:5578|Hs108|chr17 ( 672) 781 113.8 4.2e-25
CCDS60482.1 PRKCQ gene_id:5588|Hs108|chr10 ( 581) 779 113.5 4.5e-25
CCDS7079.1 PRKCQ gene_id:5588|Hs108|chr10 ( 706) 779 113.6 5.2e-25
CCDS81286.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 719) 775 113.1 7.5e-25
CCDS284.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 735) 775 113.1 7.6e-25
CCDS30649.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 744) 775 113.1 7.7e-25
CCDS14197.1 RPS6KA3 gene_id:6197|Hs108|chrX ( 740) 762 111.4 2.4e-24
CCDS62272.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 502) 751 109.8 5e-24
CCDS5294.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 733) 753 110.3 5.4e-24
CCDS34570.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 741) 753 110.3 5.5e-24
CCDS83148.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 758) 753 110.3 5.5e-24
>>CCDS14125.1 PRKX gene_id:5613|Hs108|chrX (358 aa)
initn: 2455 init1: 2455 opt: 2455 Z-score: 1734.2 bits: 329.4 E(32554): 2.8e-90
Smith-Waterman score: 2455; 99.7% identity (100.0% similar) in 358 aa overlap (1-358:1-358)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MEAPGLAQAAAAESDSRKVAEETPDGAPALCPSPEALSPEPPAYSLQDFDTLATVGTGTF
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CCDS14 MEAPGLAQAAAAESDSRKVAEETPDGAPALCPSPEALSPEPPVYSLQDFDTLATVGTGTF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 GRVHLVKEKTAKHFFALKVMSIPDVIRLKQEQHVHNEKSVLKEVSHPFLIRLFWTWHDER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GRVHLVKEKTAKHFFALKVMSIPDVIRLKQEQHVHNEKSVLKEVSHPFLIRLFWTWHDER
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 FLYMLMEYVPGGELFSYLRNRGRFSSTTGLFYSAEIICAIEYLHSKEIVYRDLKPENILL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FLYMLMEYVPGGELFSYLRNRGRFSSTTGLFYSAEIICAIEYLHSKEIVYRDLKPENILL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 DRDGHIKLTDFGFAKKLVDRTWTLCGTPEYLAPEVIQSKGHGRAVDWWALGILIFEMLSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DRDGHIKLTDFGFAKKLVDRTWTLCGTPEYLAPEVIQSKGHGRAVDWWALGILIFEMLSG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 FPPFFDDNPFGIYQKILAGKIDFPRHLDFHVKDLIKKLLVVDRTRRLGNMKNGANDVKHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FPPFFDDNPFGIYQKILAGKIDFPRHLDFHVKDLIKKLLVVDRTRRLGNMKNGANDVKHH
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310 320 330 340 350
pF1KB6 RWFRSVDWEAVPQRKLKPPIVPKIAGDGDTSNFETYPENDWDTAAPVPQKDLEIFKNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RWFRSVDWEAVPQRKLKPPIVPKIAGDGDTSNFETYPENDWDTAAPVPQKDLEIFKNF
310 320 330 340 350
>>CCDS72813.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 (339 aa)
initn: 1267 init1: 1227 opt: 1238 Z-score: 886.3 bits: 172.5 E(32554): 4.8e-43
Smith-Waterman score: 1238; 54.8% identity (84.2% similar) in 303 aa overlap (38-340:21-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 QAAAAESDSRKVAEETPDGAPALCPSPEALSPEPPAYSLQDFDTLATVGTGTFGRVHLVK
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70 80 90 100 110 120
pF1KB6 EKTAKHFFALKVMSIPDVIRLKQEQHVHNEKSVLKEVSHPFLIRLFWTWHDERFLYMLME
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CCDS72 HKATEQYYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVRLEYAFKDNSNLYMVME
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pF1KB6 YVPGGELFSYLRNRGRFSSTTGLFYSAEIICAIEYLHSKEIVYRDLKPENILLDRDGHIK
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CCDS72 YVPGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDHQGYIQ
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190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LTDFGFAKKLVDRTWTLCGTPEYLAPEVIQSKGHGRAVDWWALGILIFEMLSGFPPFFDD
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CCDS72 VTDFGFAKRVKGRTWTLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFAD
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250 260 270 280 290 300
pF1KB6 NPFGIYQKILAGKIDFPRHLDFHVKDLIKKLLVVDRTRRLGNMKNGANDVKHHRWFRSVD
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CCDS72 QPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVSDIKTHKWFATTD
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KB6 WEAVPQRKLKPPIVPKIAGDGDTSNFETYPENDWDTAAPVPQKDLEIFKNF
: :. :::.. :..::. :.::::::. : :.:
CCDS72 WIAIYQRKVEAPFIPKFRGSGDTSNFDDYEEEDIRVSITEKCAKEFGEF
300 310 320 330
>>CCDS691.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 (351 aa)
initn: 1267 init1: 1227 opt: 1238 Z-score: 886.1 bits: 172.5 E(32554): 4.9e-43
Smith-Waterman score: 1238; 54.8% identity (84.2% similar) in 303 aa overlap (38-340:33-335)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 QAAAAESDSRKVAEETPDGAPALCPSPEALSPEPPAYSLQDFDTLATVGTGTFGRVHLVK
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CCDS69 NAATAKKGSEVESVKEFLAKAKEDFLKKWENPTQNNAGLEDFERKKTLGTGSFGRVMLVK
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pF1KB6 EKTAKHFFALKVMSIPDVIRLKQEQHVHNEKSVLKEVSHPFLIRLFWTWHDERFLYMLME
.:......:.:... :..::: .:. ::: .:. :. :::.:: ....:. :::.::
CCDS69 HKATEQYYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVRLEYAFKDNSNLYMVME
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pF1KB6 YVPGGELFSYLRNRGRFSSTTGLFYSAEIICAIEYLHSKEIVYRDLKPENILLDRDGHIK
::::::.::.:: :::: . ::.:.:. ..::::: ...::::::::.:.:..:.:.
CCDS69 YVPGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDHQGYIQ
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190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LTDFGFAKKLVDRTWTLCGTPEYLAPEVIQSKGHGRAVDWWALGILIFEMLSGFPPFFDD
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CCDS69 VTDFGFAKRVKGRTWTLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFAD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 NPFGIYQKILAGKIDFPRHLDFHVKDLIKKLLVVDRTRRLGNMKNGANDVKHHRWFRSVD
.:. ::.::..::. :: :.. .:::...:: :: :.:.::.:::..:.: :.:: ..:
CCDS69 QPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVSDIKTHKWFATTD
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310 320 330 340 350
pF1KB6 WEAVPQRKLKPPIVPKIAGDGDTSNFETYPENDWDTAAPVPQKDLEIFKNF
: :. :::.. :..::. :.::::::. : :.:
CCDS69 WIAIYQRKVEAPFIPKFRGSGDTSNFDDYEEEDIRVSITEKCAKEFGEF
310 320 330 340 350
>>CCDS55610.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 (355 aa)
initn: 1267 init1: 1227 opt: 1238 Z-score: 886.0 bits: 172.5 E(32554): 5e-43
Smith-Waterman score: 1238; 54.8% identity (84.2% similar) in 303 aa overlap (38-340:37-339)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 QAAAAESDSRKVAEETPDGAPALCPSPEALSPEPPAYSLQDFDTLATVGTGTFGRVHLVK
.: .:.::. :.:::.:::: :::
CCDS55 SSDASACSSSEISVKEFLAKAKEDFLKKWENPTQNNAGLEDFERKKTLGTGSFGRVMLVK
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pF1KB6 EKTAKHFFALKVMSIPDVIRLKQEQHVHNEKSVLKEVSHPFLIRLFWTWHDERFLYMLME
.:......:.:... :..::: .:. ::: .:. :. :::.:: ....:. :::.::
CCDS55 HKATEQYYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVRLEYAFKDNSNLYMVME
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pF1KB6 YVPGGELFSYLRNRGRFSSTTGLFYSAEIICAIEYLHSKEIVYRDLKPENILLDRDGHIK
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CCDS55 YVPGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDHQGYIQ
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pF1KB6 LTDFGFAKKLVDRTWTLCGTPEYLAPEVIQSKGHGRAVDWWALGILIFEMLSGFPPFFDD
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CCDS55 VTDFGFAKRVKGRTWTLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFAD
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pF1KB6 NPFGIYQKILAGKIDFPRHLDFHVKDLIKKLLVVDRTRRLGNMKNGANDVKHHRWFRSVD
.:. ::.::..::. :: :.. .:::...:: :: :.:.::.:::..:.: :.:: ..:
CCDS55 QPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVSDIKTHKWFATTD
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310 320 330 340 350
pF1KB6 WEAVPQRKLKPPIVPKIAGDGDTSNFETYPENDWDTAAPVPQKDLEIFKNF
: :. :::.. :..::. :.::::::. : :.:
CCDS55 WIAIYQRKVEAPFIPKFRGSGDTSNFDDYEEEDIRVSITEKCAKEFGEF
310 320 330 340 350
>>CCDS72815.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 (357 aa)
initn: 1267 init1: 1227 opt: 1238 Z-score: 886.0 bits: 172.5 E(32554): 5e-43
Smith-Waterman score: 1238; 54.8% identity (84.2% similar) in 303 aa overlap (38-340:39-341)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 QAAAAESDSRKVAEETPDGAPALCPSPEALSPEPPAYSLQDFDTLATVGTGTFGRVHLVK
.: .:.::. :.:::.:::: :::
CCDS72 ASACSSSEISDSFVKEFLAKAKEDFLKKWENPTQNNAGLEDFERKKTLGTGSFGRVMLVK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 EKTAKHFFALKVMSIPDVIRLKQEQHVHNEKSVLKEVSHPFLIRLFWTWHDERFLYMLME
.:......:.:... :..::: .:. ::: .:. :. :::.:: ....:. :::.::
CCDS72 HKATEQYYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVRLEYAFKDNSNLYMVME
70 80 90 100 110 120
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pF1KB6 YVPGGELFSYLRNRGRFSSTTGLFYSAEIICAIEYLHSKEIVYRDLKPENILLDRDGHIK
::::::.::.:: :::: . ::.:.:. ..::::: ...::::::::.:.:..:.:.
CCDS72 YVPGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDHQGYIQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LTDFGFAKKLVDRTWTLCGTPEYLAPEVIQSKGHGRAVDWWALGILIFEMLSGFPPFFDD
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CCDS72 VTDFGFAKRVKGRTWTLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFAD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 NPFGIYQKILAGKIDFPRHLDFHVKDLIKKLLVVDRTRRLGNMKNGANDVKHHRWFRSVD
.:. ::.::..::. :: :.. .:::...:: :: :.:.::.:::..:.: :.:: ..:
CCDS72 QPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVSDIKTHKWFATTD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB6 WEAVPQRKLKPPIVPKIAGDGDTSNFETYPENDWDTAAPVPQKDLEIFKNF
: :. :::.. :..::. :.::::::. : :.:
CCDS72 WIAIYQRKVEAPFIPKFRGSGDTSNFDDYEEEDIRVSITEKCAKEFGEF
310 320 330 340 350
>>CCDS55609.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 (358 aa)
initn: 1267 init1: 1227 opt: 1238 Z-score: 886.0 bits: 172.5 E(32554): 5e-43
Smith-Waterman score: 1238; 54.8% identity (84.2% similar) in 303 aa overlap (38-340:40-342)
10 20 30 40 50 60
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CCDS55 ASACSSSEISDSFVKEFLAKAKEDFLKKWENPTQNNAGLEDFERKKTLGTGSFGRVMLVK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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70 80 90 100 110 120
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CCDS55 YVPGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDHQGYIQ
130 140 150 160 170 180
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190 200 210 220 230 240
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CCDS55 WIAIYQRKVEAPFIPKFRGSGDTSNFDDYEEEDIRVSITEKCAKEFGEF
310 320 330 340 350
>>CCDS693.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 (398 aa)
initn: 1267 init1: 1227 opt: 1238 Z-score: 885.4 bits: 172.5 E(32554): 5.3e-43
Smith-Waterman score: 1238; 54.8% identity (84.2% similar) in 303 aa overlap (38-340:80-382)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 QAAAAESDSRKVAEETPDGAPALCPSPEALSPEPPAYSLQDFDTLATVGTGTFGRVHLVK
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CCDS69 LHFSEHTALWDRSMKEFLAKAKEDFLKKWENPTQNNAGLEDFERKKTLGTGSFGRVMLVK
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70 80 90 100 110 120
pF1KB6 EKTAKHFFALKVMSIPDVIRLKQEQHVHNEKSVLKEVSHPFLIRLFWTWHDERFLYMLME
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CCDS69 HKATEQYYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVRLEYAFKDNSNLYMVME
110 120 130 140 150 160
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 YVPGGELFSYLRNRGRFSSTTGLFYSAEIICAIEYLHSKEIVYRDLKPENILLDRDGHIK
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CCDS69 YVPGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDHQGYIQ
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190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LTDFGFAKKLVDRTWTLCGTPEYLAPEVIQSKGHGRAVDWWALGILIFEMLSGFPPFFDD
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CCDS69 VTDFGFAKRVKGRTWTLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFAD
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250 260 270 280 290 300
pF1KB6 NPFGIYQKILAGKIDFPRHLDFHVKDLIKKLLVVDRTRRLGNMKNGANDVKHHRWFRSVD
.:. ::.::..::. :: :.. .:::...:: :: :.:.::.:::..:.: :.:: ..:
CCDS69 QPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVSDIKTHKWFATTD
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310 320 330 340 350
pF1KB6 WEAVPQRKLKPPIVPKIAGDGDTSNFETYPENDWDTAAPVPQKDLEIFKNF
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CCDS69 WIAIYQRKVEAPFIPKFRGSGDTSNFDDYEEEDIRVSITEKCAKEFGEF
350 360 370 380 390
>>CCDS12304.1 PRKACA gene_id:5566|Hs108|chr19 (351 aa)
initn: 1269 init1: 1229 opt: 1235 Z-score: 884.0 bits: 172.1 E(32554): 6.4e-43
Smith-Waterman score: 1235; 51.5% identity (79.8% similar) in 336 aa overlap (5-340:2-335)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MEAPGLAQAAAAESDSRKVAEETPDGAPALCPSPEALSPEPPAYSLQDFDTLATVGTGTF
: : :: :....: : . . . : :: . :..:. . :.:::.:
CCDS12 MGNAAAAKKGSEQESVKEFLAKAKEDFLKKWE--SPAQNTAHLDQFERIKTLGTGSF
10 20 30 40 50
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pF1KB6 GRVHLVKEKTAKHFFALKVMSIPDVIRLKQEQHVHNEKSVLKEVSHPFLIRLFWTWHDER
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CCDS12 GRVMLVKHKETGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNS
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pF1KB6 FLYMLMEYVPGGELFSYLRNRGRFSSTTGLFYSAEIICAIEYLHSKEIVYRDLKPENILL
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CCDS12 NLYMVMEYVPGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 DRDGHIKLTDFGFAKKLVDRTWTLCGTPEYLAPEVIQSKGHGRAVDWWALGILIFEMLSG
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CCDS12 DQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWTLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 FPPFFDDNPFGIYQKILAGKIDFPRHLDFHVKDLIKKLLVVDRTRRLGNMKNGANDVKHH
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CCDS12 YPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNH
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pF1KB6 RWFRSVDWEAVPQRKLKPPIVPKIAGDGDTSNFETYPENDWDTAAPVPQKDLEIFKNF
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CCDS12 KWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVSINEKCGKEFSEF
300 310 320 330 340 350
>>CCDS72816.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 (338 aa)
initn: 1267 init1: 1227 opt: 1234 Z-score: 883.5 bits: 171.9 E(32554): 6.9e-43
Smith-Waterman score: 1234; 55.9% identity (85.4% similar) in 295 aa overlap (46-340:28-322)
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pF1KB6 SRKVAEETPDGAPALCPSPEALSPEPPAYSLQDFDTLATVGTGTFGRVHLVKEKTAKHFF
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CCDS72 MLLLSSSISLYKDRNEARLISSQNNAGLEDFERKKTLGTGSFGRVMLVKHKATEQYY
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pF1KB6 ALKVMSIPDVIRLKQEQHVHNEKSVLKEVSHPFLIRLFWTWHDERFLYMLMEYVPGGELF
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CCDS72 AMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVRLEYAFKDNSNLYMVMEYVPGGEMF
60 70 80 90 100 110
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pF1KB6 SYLRNRGRFSSTTGLFYSAEIICAIEYLHSKEIVYRDLKPENILLDRDGHIKLTDFGFAK
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CCDS72 SHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDHQGYIQVTDFGFAK
120 130 140 150 160 170
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pF1KB6 KLVDRTWTLCGTPEYLAPEVIQSKGHGRAVDWWALGILIFEMLSGFPPFFDDNPFGIYQK
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CCDS72 RVKGRTWTLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEK
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pF1KB6 ILAGKIDFPRHLDFHVKDLIKKLLVVDRTRRLGNMKNGANDVKHHRWFRSVDWEAVPQRK
:..::. :: :.. .:::...:: :: :.:.::.:::..:.: :.:: ..:: :. :::
CCDS72 IVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVSDIKTHKWFATTDWIAIYQRK
240 250 260 270 280 290
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pF1KB6 LKPPIVPKIAGDGDTSNFETYPENDWDTAAPVPQKDLEIFKNF
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CCDS72 VEAPFIPKFRGSGDTSNFDDYEEEDIRVSITEKCAKEFGEF
300 310 320 330
>>CCDS12305.1 PRKACA gene_id:5566|Hs108|chr19 (343 aa)
initn: 1269 init1: 1229 opt: 1229 Z-score: 879.9 bits: 171.3 E(32554): 1.1e-42
Smith-Waterman score: 1229; 54.5% identity (83.5% similar) in 303 aa overlap (38-340:25-327)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 QAAAAESDSRKVAEETPDGAPALCPSPEALSPEPPAYSLQDFDTLATVGTGTFGRVHLVK
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CCDS12 MASNSSDVKEFLAKAKEDFLKKWESPAQNTAHLDQFERIKTLGTGSFGRVMLVK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 EKTAKHFFALKVMSIPDVIRLKQEQHVHNEKSVLKEVSHPFLIRLFWTWHDERFLYMLME
.: . . .:.:... :..::: .:. ::: .:. :. :::..: ....:. :::.::
CCDS12 HKETGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVME
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 YVPGGELFSYLRNRGRFSSTTGLFYSAEIICAIEYLHSKEIVYRDLKPENILLDRDGHIK
::::::.::.:: :::: . ::.:.:. ..::::: ...::::::::.:.:..:.:.
CCDS12 YVPGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQ
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LTDFGFAKKLVDRTWTLCGTPEYLAPEVIQSKGHGRAVDWWALGILIFEMLSGFPPFFDD
.:::::::.. :::::::::::::::.: :::...::::::::.::.:: .:.:::: :
CCDS12 VTDFGFAKRVKGRTWTLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFAD
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 NPFGIYQKILAGKIDFPRHLDFHVKDLIKKLLVVDRTRRLGNMKNGANDVKHHRWFRSVD
.:. ::.::..::. :: :.. .:::...:: :: :.:.::.:::.::.:.:.:: ..:
CCDS12 QPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTD
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KB6 WEAVPQRKLKPPIVPKIAGDGDTSNFETYPENDWDTAAPVPQKDLEIFKNF
: :. :::.. :..::. : ::::::. : :..
CCDS12 WIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVSINEKCGKEFSEF
300 310 320 330 340
358 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 12:53:06 2016 done: Sun Nov 6 12:53:06 2016
Total Scan time: 2.660 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]