Result of FASTA (ccds) for pF1KB6502
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6502, 381 aa
  1>>>pF1KB6502 381 - 381 aa - 381 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4450+/-0.000836; mu= 10.5790+/- 0.050
 mean_var=81.1026+/-16.094, 0's: 0 Z-trim(107.8): 47  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.142415
 statistics sampled from 9754 (9800) to 9754 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.678), E-opt: 0.2 (0.301), width:  16
 Scan time:  3.020

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS9033.1 DUSP6 gene_id:1848|Hs108|chr12          ( 381) 2531 529.7 1.7e-150
CCDS33766.2 DUSP7 gene_id:1849|Hs108|chr3          ( 419) 1783 376.0 3.3e-104
CCDS14724.1 DUSP9 gene_id:1852|Hs108|chrX          ( 384) 1048 225.0 8.9e-59
CCDS9034.1 DUSP6 gene_id:1848|Hs108|chr12          ( 235)  882 190.8   1e-48
CCDS1528.1 DUSP10 gene_id:11221|Hs108|chr1         ( 482)  479 108.1 1.7e-23
CCDS6073.1 DUSP4 gene_id:1846|Hs108|chr8           ( 303)  472 106.6   3e-23
CCDS6072.1 DUSP4 gene_id:1846|Hs108|chr8           ( 394)  472 106.7 3.8e-23
CCDS4380.1 DUSP1 gene_id:1843|Hs108|chr5           ( 367)  470 106.2 4.8e-23
CCDS7724.1 DUSP8 gene_id:1850|Hs108|chr11          ( 625)  468 105.9   1e-22
CCDS2016.1 DUSP2 gene_id:1844|Hs108|chr2           ( 314)  460 104.2 1.7e-22
CCDS8650.1 DUSP16 gene_id:80824|Hs108|chr12        ( 665)  446 101.4 2.5e-21
CCDS7566.1 DUSP5 gene_id:1847|Hs108|chr10          ( 384)  414 94.7 1.4e-19
CCDS55882.1 SSH1 gene_id:54434|Hs108|chr12         ( 692)  334 78.4 2.2e-14
CCDS53825.1 SSH1 gene_id:54434|Hs108|chr12         ( 703)  334 78.4 2.2e-14
CCDS9121.1 SSH1 gene_id:54434|Hs108|chr12          (1049)  334 78.4 3.2e-14
CCDS4468.1 DUSP22 gene_id:56940|Hs108|chr6         ( 184)  320 75.3 4.8e-14
CCDS69035.1 DUSP22 gene_id:56940|Hs108|chr6        ( 205)  320 75.3 5.3e-14
CCDS2289.1 DUSP19 gene_id:142679|Hs108|chr2        ( 217)  310 73.3 2.3e-13
CCDS11253.1 SSH2 gene_id:85464|Hs108|chr17         (1423)  319 75.4 3.6e-13
CCDS74024.1 SSH2 gene_id:85464|Hs108|chr17         (1450)  319 75.4 3.7e-13
CCDS11320.1 DUSP14 gene_id:11072|Hs108|chr17       ( 198)  293 69.8 2.4e-12
CCDS11469.1 DUSP3 gene_id:1845|Hs108|chr17         ( 185)  268 64.6 7.9e-11


>>CCDS9033.1 DUSP6 gene_id:1848|Hs108|chr12               (381 aa)
 initn: 2531 init1: 2531 opt: 2531  Z-score: 2815.5  bits: 529.7 E(32554): 1.7e-150
Smith-Waterman score: 2531; 99.7% identity (100.0% similar) in 381 aa overlap (1-381:1-381)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MIDTLRPVPFASEMAISKTVAWLNEQLELGNERLLLMDCRPQELYESSHIESAINVAIPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 MIDTLRPVPFASEMAISKTVAWLNEQLELGNERLLLMDCRPQELYESSHIESAINVAIPG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 IMLRRLQKGNLPVRALFTRGEDRDRFTRRCGTDTVVLYDESSSDWNENTGGESLLGLLLK
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS90 IMLRRLQKGNLPVRALFTRGEDRDRFTRRCGTDTVVLYDESSSDWNENTGGESVLGLLLK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 KLKDEGCRAFYLEGGFSKFQAEFSLHCETNLDGSCSSSSPPLPVLGLGGLRISSDSSSDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 KLKDEGCRAFYLEGGFSKFQAEFSLHCETNLDGSCSSSSPPLPVLGLGGLRISSDSSSDI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 ESDLDRDPNSATDSDGSPLSNSQPSFPVEILPFLYLGCAKDSTNLDVLEEFGIKYILNVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 ESDLDRDPNSATDSDGSPLSNSQPSFPVEILPFLYLGCAKDSTNLDVLEEFGIKYILNVT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 PNLPNLFENAGEFKYKQIPISDHWSQNLSQFFPEAISFIDEARGKNCGVLVHCLAGISRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 PNLPNLFENAGEFKYKQIPISDHWSQNLSQFFPEAISFIDEARGKNCGVLVHCLAGISRS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 VTVTVAYLMQKLNLSMNDAYDIVKMKKSNISPNFNFMGQLLDFERTLGLSSPCDNRVPAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 VTVTVAYLMQKLNLSMNDAYDIVKMKKSNISPNFNFMGQLLDFERTLGLSSPCDNRVPAQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380 
pF1KB6 QLYFTTPSNQNVYQVDSLQST
       :::::::::::::::::::::
CCDS90 QLYFTTPSNQNVYQVDSLQST
              370       380 

>>CCDS33766.2 DUSP7 gene_id:1849|Hs108|chr3               (419 aa)
 initn: 1430 init1: 1398 opt: 1783  Z-score: 1984.3  bits: 376.0 E(32554): 3.3e-104
Smith-Waterman score: 1783; 71.7% identity (90.7% similar) in 367 aa overlap (18-381:55-419)

                            10        20         30        40      
pF1KB6              MIDTLRPVPFASEMAISKTVAWLNEQLEL-GNERLLLMDCRPQELYE
                                     :.. ::.:.::  :.  :::.::::.::.:
CCDS33 TRAGSEPGAGSGSGAGTGAGAATGAGAMPCKSAEWLQEELEARGGASLLLLDCRPHELFE
           30        40        50        60        70        80    

         50        60        70        80        90       100      
pF1KB6 SSHIESAINVAIPGIMLRRLQKGNLPVRALFTRGEDRDRFTRRCGTDTVVLYDESSSDWN
       :::::.:::.::::.:::::.:::::.:...    :..::. :: . ::.::::....:.
CCDS33 SSHIETAINLAIPGLMLRRLRKGNLPIRSIIPNHADKERFATRCKAATVLLYDEATAEWQ
           90       100       110       120       130       140    

        110        120       130       140       150        160    
pF1KB6 ENTGGE-SLLGLLLKKLKDEGCRAFYLEGGFSKFQAEFSLHCETNLDGSCS-SSSPPLPV
        . :.  :.:::::.::.:.::.:.::.:::.:::.:.: :::::.:.: : :::::  :
CCDS33 PEPGAPASVLGLLLQKLRDDGCQAYYLQGGFNKFQTEYSEHCETNVDSSSSPSSSPPTSV
          150       160       170       180       190       200    

          170       180       190       200       210       220    
pF1KB6 LGLGGLRISSDSSSDIESDLDRDPNSATDSDGSPLSNSQPSFPVEILPFLYLGCAKDSTN
       ::::::::::: : : ::: .  :.:::.:::::. .:::.:::.:::.:::::::::::
CCDS33 LGLGGLRISSDCS-DGESDREL-PSSATESDGSPVPSSQPAFPVQILPYLYLGCAKDSTN
          210        220        230       240       250       260  

          230       240       250       260       270       280    
pF1KB6 LDVLEEFGIKYILNVTPNLPNLFENAGEFKYKQIPISDHWSQNLSQFFPEAISFIDEARG
       :::: ..:::::::::::::: ::..::: :::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS33 LDVLGKYGIKYILNVTPNLPNAFEHGGEFTYKQIPISDHWSQNLSQFFPEAISFIDEARS
            270       280       290       300       310       320  

          290       300       310       320       330       340    
pF1KB6 KNCGVLVHCLAGISRSVTVTVAYLMQKLNLSMNDAYDIVKMKKSNISPNFNFMGQLLDFE
       :.:::::::::::::::::::::::::.:::.:::::.:: :::::::::::::::::::
CCDS33 KKCGVLVHCLAGISRSVTVTVAYLMQKMNLSLNDAYDFVKRKKSNISPNFNFMGQLLDFE
            330       340       350       360       370       380  

          350       360       370       380 
pF1KB6 RTLGLSSPCDNRVPAQQLYFTTPSNQNVYQVDSLQST
       :::::::::::.. ..::::.::.:.:.. ...:.::
CCDS33 RTLGLSSPCDNHASSEQLYFSTPTNHNLFPLNTLEST
            390       400       410         

>>CCDS14724.1 DUSP9 gene_id:1852|Hs108|chrX               (384 aa)
 initn: 1198 init1: 791 opt: 1048  Z-score: 1168.7  bits: 225.0 E(32554): 8.9e-59
Smith-Waterman score: 1217; 54.2% identity (75.3% similar) in 384 aa overlap (16-375:4-381)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MIDTLRPVPFASEMAISKTVAWLNEQLELGNERLLLMDCRPQELYESSHIESAINVAIPG
                      ....  :: ..:     ::::.::: .:::::..: .:..::.:.
CCDS14             MEGLGRSCLWLRRELSPPRPRLLLLDCRSRELYESARIGGALSVALPA
                           10        20        30        40        

               70        80        90       100               110  
pF1KB6 IMLRRLQKGNLPVRALFTRGEDRDRFTRRCGTDTVVLYDESSSDWN--------ENTGGE
       ..::::..:.: ::::.  :       .      :.:::....           :.  .:
CCDS14 LLLRRLRRGSLSVRALLP-GPP----LQPPPPAPVLLYDQGGGRRRRGEAEAEAEEWEAE
       50        60             70        80        90       100   

            120       130       140       150        160           
pF1KB6 SLLGLLLKKLKDEGCRAFYLEGGFSKFQAEFSLHCETNLDGSCSSS-SP---PLPVLGLG
       :.:: ::.::..::  :.::.::::.::::    :::.: :  .:: .:   :.::.:::
CCDS14 SVLGTLLQKLREEGYLAYYLQGGFSRFQAECPHLCETSLAGRAGSSMAPVPGPVPVVGLG
           110       120       130       140       150       160   

      170       180       190          200       210       220     
pF1KB6 GLRISSDSSSDIESDLDRDPNS-ATDSDGS--PLSNSQPSFPVEILPFLYLGCAKDSTNL
       .: ..:: : : ::. :::  : . ::.:.  :  . . ::::.::: :::: :.::.::
CCDS14 SLCLGSDCS-DAESEADRDSMSCGLDSEGATPPPVGLRASFPVQILPNLYLGSARDSANL
           170        180       190       200       210       220  

         230       240       250       260       270       280     
pF1KB6 DVLEEFGIKYILNVTPNLPNLFENAGEFKYKQIPISDHWSQNLSQFFPEAISFIDEARGK
       . : ..::.:::::::::::.::. :.:.:::::::::::::::.:::::: ::::: ..
CCDS14 ESLAKLGIRYILNVTPNLPNFFEKNGDFHYKQIPISDHWSQNLSRFFPEAIEFIDEALSQ
            230       240       250       260       270       280  

         290       300       310       320       330       340     
pF1KB6 NCGVLVHCLAGISRSVTVTVAYLMQKLNLSMNDAYDIVKMKKSNISPNFNFMGQLLDFER
       :::::::::::.:::::::::::::::.::.:::::.:: ::::::::::::::::::::
CCDS14 NCGVLVHCLAGVSRSVTVTVAYLMQKLHLSLNDAYDLVKRKKSNISPNFNFMGQLLDFER
            290       300       310       320       330       340  

                  350       360       370       380 
pF1KB6 TLGL---------SSPCDNRVPAQQLYFTTPSNQNVYQVDSLQST
       .: :         :.   . .     .::::........      
CCDS14 SLRLEERHSQEQGSGGQASAASNPPSFFTTPTSDGAFELAPT   
            350       360       370       380       

>>CCDS9034.1 DUSP6 gene_id:1848|Hs108|chr12               (235 aa)
 initn: 879 init1: 879 opt: 882  Z-score: 987.9  bits: 190.8 E(32554): 1e-48
Smith-Waterman score: 1244; 61.4% identity (61.7% similar) in 381 aa overlap (1-381:1-235)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MIDTLRPVPFASEMAISKTVAWLNEQLELGNERLLLMDCRPQELYESSHIESAINVAIPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 MIDTLRPVPFASEMAISKTVAWLNEQLELGNERLLLMDCRPQELYESSHIESAINVAIPG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 IMLRRLQKGNLPVRALFTRGEDRDRFTRRCGTDTVVLYDESSSDWNENTGGESLLGLLLK
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS90 IMLRRLQKGNLPVRALFTRGEDRDRFTRRCGTDTVVLYDESSSDWNENTGGESVLGLLLK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 KLKDEGCRAFYLEGGFSKFQAEFSLHCETNLDGSCSSSSPPLPVLGLGGLRISSDSSSDI
       :::::::::::::                                               
CCDS90 KLKDEGCRAFYLE-----------------------------------------------
              130                                                  

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 ESDLDRDPNSATDSDGSPLSNSQPSFPVEILPFLYLGCAKDSTNLDVLEEFGIKYILNVT
                                                                   
CCDS90 ------------------------------------------------------------
                                                                   

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 PNLPNLFENAGEFKYKQIPISDHWSQNLSQFFPEAISFIDEARGKNCGVLVHCLAGISRS
                                              :::::::::::::::::::::
CCDS90 ---------------------------------------DEARGKNCGVLVHCLAGISRS
                                                  140       150    

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 VTVTVAYLMQKLNLSMNDAYDIVKMKKSNISPNFNFMGQLLDFERTLGLSSPCDNRVPAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 VTVTVAYLMQKLNLSMNDAYDIVKMKKSNISPNFNFMGQLLDFERTLGLSSPCDNRVPAQ
          160       170       180       190       200       210    

              370       380 
pF1KB6 QLYFTTPSNQNVYQVDSLQST
       :::::::::::::::::::::
CCDS90 QLYFTTPSNQNVYQVDSLQST
          220       230     

>>CCDS1528.1 DUSP10 gene_id:11221|Hs108|chr1              (482 aa)
 initn: 638 init1: 477 opt: 479  Z-score: 535.3  bits: 108.1 E(32554): 1.7e-23
Smith-Waterman score: 646; 37.1% identity (67.3% similar) in 315 aa overlap (35-347:173-462)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KB6 LRPVPFASEMAISKTVAWLNEQLELGNERLLLMDCRPQELYESSHIESAINVAIPG-IML
                                     ...::::   :..:::..:...     :  
CCDS15 QLASIKIIYPNDLAKKMTKCSKSHLPSQGPVIIDCRPFMEYNKSHIQGAVHINCADKISR
            150       160       170       180       190       200  

            70        80        90       100       110       120   
pF1KB6 RRLQKGNLPVRALFTRGEDRDRFTRRCGTDTVVLYDESSSDWNENTGGESLLGLLLKKLK
       ::::.:.. :  :..  : .: : .:  .  ...:::.... ..   .. :  ..:..::
CCDS15 RRLQQGKITVLDLISCREGKDSF-KRIFSKEIIVYDENTNEPSRVMPSQPL-HIVLESLK
            210       220        230       240       250        260

           130       140       150        160       170       180  
pF1KB6 DEGCRAFYLEGGFSKFQAEFSLHCETNLD-GSCSSSSPPLPVLGLGGLRISSDSSSDIES
        :: . . :.::.:.:. .    :...:.   :         .: ::   .: .:: . .
CCDS15 REGKEPLVLKGGLSSFKQNHENLCDNSLQLQECRE-------VG-GG---ASAASSLLPQ
              270       280       290                  300         

            190       200       210       220       230       240  
pF1KB6 DLDRDPNSATDSDGSPLSNSQPSFPVEILPFLYLGCAKDSTNLDVLEEFGIKYILNVTPN
        .   :    : ... :.   :     :::::.::  .:. .::......: :..::: .
CCDS15 PIPTTP----DIENAELT---P-----ILPFLFLGNEQDAQDLDTMQRLNIGYVINVTTH
     310           320               330       340       350       

            250       260       270       280       290       300  
pF1KB6 LPNLFENAGEFKYKQIPISDHWSQNLSQFFPEAISFIDEARGKNCGVLVHCLAGISRSVT
       ::    . : :.::..: .:  .::: :.: ::. ::.::.  . :.:.:: ::.:::.:
CCDS15 LPLYHYEKGLFNYKRLPATDSNKQNLRQYFEEAFEFIEEAHQCGKGLLIHCQAGVSRSAT
       360       370       380       390       400       410       

            310       320       330       340       350       360  
pF1KB6 VTVAYLMQKLNLSMNDAYDIVKMKKSNISPNFNFMGQLLDFERTLGLSSPCDNRVPAQQL
       ...::::..  ..:.::: .:: :.  ::::.:::::::.::. :               
CCDS15 IVIAYLMKHTRMTMTDAYKFVKGKRPIISPNLNFMGQLLEFEEDLNNGVTPRILTPKLMG
       420       430       440       450       460       470       

            370       380 
pF1KB6 YFTTPSNQNVYQVDSLQST
                          
CCDS15 VETVV              
       480                

>>CCDS6073.1 DUSP4 gene_id:1846|Hs108|chr8                (303 aa)
 initn: 503 init1: 318 opt: 472  Z-score: 530.8  bits: 106.6 E(32554): 3e-23
Smith-Waterman score: 485; 37.2% identity (62.1% similar) in 253 aa overlap (127-373:47-275)

        100       110       120       130       140       150      
pF1KB6 LYDESSSDWNENTGGESLLGLLLKKLKDEGCRAFYLEGGFSKFQAEFSLHCETNLDGSCS
                                     :     .::. .:..:.   :  .   . .
CCDS60 RSPRRTGRDCKPVRAPSMALGVSQLAGRSRCLCSESQGGYERFSSEYPEFCSKT--KALA
         20        30        40        50        60        70      

        160       170       180       190       200       210      
pF1KB6 SSSPPLPVLGLGGLRISSDSSSDIESDLDRDPNSATDSDGSPLSNSQPSFPVEILPFLYL
       .  ::.:             :.    ::      . .: :.:: ..    ::::::::::
CCDS60 AIPPPVP------------PSATEPLDL------GCSSCGTPLHDQGG--PVEILPFLYL
           80                    90             100         110    

        220       230       240       250       260       270      
pF1KB6 GCAKDSTNLDVLEEFGIKYILNVTPNLPNLFENAGEFKYKQIPISDHWSQNLSQFFPEAI
       : :  ..  :.:. .::  .:::. . :: ::  :...:: ::. :. . ..:..: :::
CCDS60 GSAYHAARRDMLDALGITALLNVSSDCPNHFE--GHYQYKCIPVEDNHKADISSWFMEAI
          120       130       140         150       160       170  

        280       290       300       310       320       330      
pF1KB6 SFIDEARGKNCGVLVHCLAGISRSVTVTVAYLMQKLNLSMNDAYDIVKMKKSNISPNFNF
        .:: ..     ::::: ::::::.:. .::::.:  . ...:...::...: :::::.:
CCDS60 EYIDAVKDCRGRVLVHCQAGISRSATICLAYLMMKKRVRLEEAFEFVKQRRSIISPNFSF
            180       190       200       210       220       230  

        340        350       360            370       380          
pF1KB6 MGQLLDFE-RTLGLSSPCDNRVPAQQLYF-----TTPSNQNVYQVDSLQST         
       :::::.:: ..:. :   .   :.  :       .::..: :.                 
CCDS60 MGQLLQFESQVLATSCAAEAASPSGPLRERGKTPATPTSQFVFSFPVSVGVHSAPSSLPY
            240       250       260       270       280       290  

CCDS60 LHSPITTSPSC
            300   

>>CCDS6072.1 DUSP4 gene_id:1846|Hs108|chr8                (394 aa)
 initn: 569 init1: 318 opt: 472  Z-score: 529.0  bits: 106.7 E(32554): 3.8e-23
Smith-Waterman score: 588; 34.6% identity (62.9% similar) in 350 aa overlap (33-373:44-366)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KB6 DTLRPVPFASEMAISKTVAWLNEQLELGNERLLLMDCRPQELYESSHIESAINVAIPGIM
                                     . ::.::::   . ...: ...::   . .
CCDS60 VLKRLMNRDENGGGAGGSGSHGTLGLPSGGKCLLLDCRPFLAHSAGYILGSVNVRC-NTI
            20        30        40        50        60         70  

             70        80        90        100       110       120 
pF1KB6 LRRLQKGNLPVRALFTRGEDRDRFTRRCGT-DTVVLYDESSSDWNENTGGESLLGLLLKK
       .::  ::.. .. ..  .:.. :   : :  ..:..::: :    :.   .: ..:... 
CCDS60 VRRRAKGSVSLEQILP-AEEEVRARLRSGLYSAVIVYDERSPR-AESLREDSTVSLVVQA
             80         90       100       110        120       130

               130       140       150       160       170         
pF1KB6 LKDEGCRA--FYLEGGFSKFQAEFSLHCETNLDGSCSSSSPPLPVLGLGGLRISSDSSSD
       :. .. :.    :.::. .:..:.   :  .   . ..  ::.:             :. 
CCDS60 LRRNAERTDICLLKGGYERFSSEYPEFCSKT--KALAAIPPPVP------------PSAT
              140       150       160         170                  

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB6 IESDLDRDPNSATDSDGSPLSNSQPSFPVEILPFLYLGCAKDSTNLDVLEEFGIKYILNV
          ::      . .: :.:: ..    ::::::::::: :  ..  :.:. .::  .:::
CCDS60 EPLDL------GCSSCGTPLHDQGG--PVEILPFLYLGSAYHAARRDMLDALGITALLNV
        180             190         200       210       220        

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB6 TPNLPNLFENAGEFKYKQIPISDHWSQNLSQFFPEAISFIDEARGKNCGVLVHCLAGISR
       . . :: ::  :...:: ::. :. . ..:..: ::: .:: ..     ::::: :::::
CCDS60 SSDCPNHFE--GHYQYKCIPVEDNHKADISSWFMEAIEYIDAVKDCRGRVLVHCQAGISR
      230         240       250       260       270       280      

     300       310       320       330       340        350        
pF1KB6 SVTVTVAYLMQKLNLSMNDAYDIVKMKKSNISPNFNFMGQLLDFE-RTLGLSSPCDNRVP
       :.:. .::::.:  . ...:...::...: :::::.::::::.:: ..:. :   .   :
CCDS60 SATICLAYLMMKKRVRLEEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLATSCAAEAASP
        290       300       310       320       330       340      

      360            370       380                     
pF1KB6 AQQLYF-----TTPSNQNVYQVDSLQST                    
       .  :       .::..: :.                            
CCDS60 SGPLRERGKTPATPTSQFVFSFPVSVGVHSAPSSLPYLHSPITTSPSC
        350       360       370       380       390    

>>CCDS4380.1 DUSP1 gene_id:1843|Hs108|chr5                (367 aa)
 initn: 553 init1: 322 opt: 470  Z-score: 527.2  bits: 106.2 E(32554): 4.8e-23
Smith-Waterman score: 586; 35.9% identity (64.1% similar) in 345 aa overlap (35-373:25-339)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KB6 LRPVPFASEMAISKTVAWLNEQLELGNERLLLMDCRPQELYESSHIESAINVAIPGIMLR
                                     ::.:::    ....:: ...:: .  :. :
CCDS43       MVMEVGTLDAGGLRALLGERAAQCLLLDCRSFFAFNAGHIAGSVNVRFSTIVRR
                     10        20        30        40        50    

           70        80        90        100         110        120
pF1KB6 RLQKGNLPVRALFTRGEDRDRFTRRCGT-DTVVLYDESSS--DWNENTGGESLL-GLLLK
       :  :: . .. .   .: : :.    :.  .::: :: :.  :  .  :  .:  : : .
CCDS43 R-AKGAMGLEHIVPNAELRGRLL--AGAYHAVVLLDERSAALDGAKRDGTLALAAGALCR
            60        70          80        90       100       110 

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 KLKDEGCRAFYLEGGFSKFQAEFSLHCETNLDGSCSSSSPPLPVLGLGGLRISSDSSSDI
       . .  . ..:.:.::.  :.:     :       ::..: :.   ::. : .:..  .. 
CCDS43 EAR--AAQVFFLKGGYEAFSAS----CPE----LCSKQSTPM---GLS-LPLSTSVPDSA
               120       130               140           150       

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 ESDLDRDPNSATDSDGSPLSNSQPSFPVEILPFLYLGCAKDSTNLDVLEEFGIKYILNVT
       ::        . .: ..:: ..    ::::::::::: :  ..  :.:. .::  ..::.
CCDS43 ES--------GCSSCSTPLYDQGG--PVEILPFLYLGSAYHASRKDMLDALGITALINVS
               160       170         180       190       200       

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 PNLPNLFENAGEFKYKQIPISDHWSQNLSQFFPEAISFIDEARGKNCGVLVHCLAGISRS
        : :: ::  :...::.::. :. . ..:..: :::.:::  .. .  :.::: ::::::
CCDS43 ANCPNHFE--GHYQYKSIPVEDNHKADISSWFNEAIDFIDSIKNAGGRVFVHCQAGISRS
       210         220       230       240       250       260     

              310       320       330       340       350          
pF1KB6 VTVTVAYLMQKLNLSMNDAYDIVKMKKSNISPNFNFMGQLLDFERTLGLSSPCDNRV--P
       .:. .::::.   .....:...::...: :::::.::::::.::  . :.  :. ..  :
CCDS43 ATICLAYLMRTNRVKLDEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQV-LAPHCSAEAGSP
         270       280       290       300       310        320    

      360       370       380                     
pF1KB6 AQQLYFTTPSNQNVYQVDSLQST                    
       :. .     :. .:.                            
CCDS43 AMAVLDRGTSTTTVFNFPVSIPVHSTNSALSYLQSPITTSPSC
          330       340       350       360       

>>CCDS7724.1 DUSP8 gene_id:1850|Hs108|chr11               (625 aa)
 initn: 552 init1: 335 opt: 468  Z-score: 521.2  bits: 105.9 E(32554): 1e-22
Smith-Waterman score: 545; 34.4% identity (60.4% similar) in 323 aa overlap (35-349:28-302)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KB6 LRPVPFASEMAISKTVAWLNEQLELGNERLLLMDCRPQELYESSHIESAINVAIPGIMLR
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CCDS77    MAGDRLPRKVMDAKKLASLLRGGPGGPLVIDSRSFVEYNSWHVLSSVNICCSKLVKR
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       :::.:.. .  :. .   :..       : ::.::.:. : .   ...:.:..::.::  
CCDS77 RLQQGKVTIAELI-QPAARSQVEATEPQD-VVVYDQSTRDASV-LAADSFLSILLSKL--
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       .::   .  : :::. :.. :   ::          . :  .:                 
CCDS77 DGCFDSVAILTGGFATFSSCFPGLCE----------GKPAALL-----------------
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                      :.: ::: .::      .::: ::::  ::  : :.. . ::.:.
CCDS77 ---------------PMSLSQPCLPVPSVGLTRILPHLYLGSQKDVLNKDLMTQNGISYV
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       ::.. . :.  .   : .. ..::.:.. ..:  .. ..: :::.:. ..: :.::::::
CCDS77 LNASNSCPKP-DFICESRFMRVPINDNYCEKLLPWLDKSIEFIDKAKLSSCQVIVHCLAG
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       ::::.:...::.:. ...: .::: .:: .. .:::::::.::::..::.: :       
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                                     :: ::.::::   .   :...:    .: .
CCDS20       MGLEAARELECAALGTLLRDPREAERTLLLDCRPFLAFCRRHVRAA--RPVPWN
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        .:::  .:  :. .:     ::   ::  :     .:. ::.:..  :   .. .. ::
CCDS20 ALLRRRARGP-PAAVLACLLPDRALRTRLVRGELARAVVLDEGSASVAELRPDSPAHVLL
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CCDS20 AALLHETRAGPTAVYFLRGGFDGFQG-----CCPDL---CSEAPAPALPPTG--------
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       :..:  .:: .: :  . :. :          ::::::.:.::  . :..:. :.  :: 
CCDS20 DKTS--RSD-SRAP--VYDQGG----------PVEILPYLFLGSCSHSSDLQGLQACGIT
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        .:::. . :: ::  : :.::.::. :.   ..: .: :::.::: .....  ::::: 
CCDS20 AVLNVSASCPNHFE--GLFRYKSIPVEDNQMVEISAWFQEAIGFIDWVKNSGGRVLVHCQ
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381 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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