Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6507
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6507, 359 aa
1>>>pF1KB6507 359 - 359 aa - 359 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3795+/-0.00109; mu= 16.2340+/- 0.065
mean_var=73.0503+/-14.512, 0's: 0 Z-trim(102.7): 52 B-trim: 9 in 1/49
Lambda= 0.150059
statistics sampled from 7008 (7058) to 7008 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.571), E-opt: 0.2 (0.217), width: 16
Scan time: 2.140
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12103.1 GNA11 gene_id:2767|Hs108|chr19 ( 359) 2333 514.7 4.8e-146
CCDS6658.1 GNAQ gene_id:2776|Hs108|chr9 ( 359) 2159 477.0 1e-134
CCDS6657.1 GNA14 gene_id:9630|Hs108|chr9 ( 355) 1950 431.8 4.3e-121
CCDS12104.1 GNA15 gene_id:2769|Hs108|chr19 ( 374) 1218 273.3 2.3e-73
CCDS5595.1 GNAI1 gene_id:2770|Hs108|chr7 ( 354) 1129 254.1 1.4e-67
CCDS10757.1 GNAO1 gene_id:2775|Hs108|chr16 ( 354) 1128 253.8 1.6e-67
CCDS2813.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 ( 355) 1126 253.4 2.2e-67
CCDS802.1 GNAI3 gene_id:2773|Hs108|chr1 ( 354) 1114 250.8 1.3e-66
CCDS47625.1 GNAT3 gene_id:346562|Hs108|chr7 ( 354) 1103 248.4 6.8e-66
CCDS10756.1 GNAO1 gene_id:2775|Hs108|chr16 ( 354) 1101 248.0 9.2e-66
CCDS2812.1 GNAT1 gene_id:2779|Hs108|chr3 ( 350) 1086 244.7 8.6e-65
CCDS803.1 GNAT2 gene_id:2780|Hs108|chr1 ( 354) 1068 240.9 1.3e-63
CCDS54587.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 ( 318) 1029 232.4 4.1e-61
CCDS63642.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 ( 339) 1029 232.4 4.4e-61
CCDS13804.1 GNAZ gene_id:2781|Hs108|chr22 ( 355) 1020 230.5 1.7e-60
CCDS11661.1 GNA13 gene_id:10672|Hs108|chr17 ( 377) 1020 230.5 1.8e-60
CCDS5335.1 GNA12 gene_id:2768|Hs108|chr7 ( 381) 978 221.4 1e-57
CCDS59061.1 GNAI1 gene_id:2770|Hs108|chr7 ( 302) 965 218.5 5.9e-57
CCDS63644.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 ( 303) 961 217.6 1.1e-56
CCDS11851.1 GNAL gene_id:2774|Hs108|chr18 ( 458) 801 183.1 4e-46
CCDS62302.1 GNA13 gene_id:10672|Hs108|chr17 ( 282) 791 180.8 1.2e-45
CCDS42892.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 ( 379) 789 180.5 2.1e-45
CCDS11852.1 GNAL gene_id:2774|Hs108|chr18 ( 381) 788 180.3 2.4e-45
CCDS46624.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 ( 380) 781 178.7 6.9e-45
CCDS64584.1 GNA12 gene_id:2768|Hs108|chr7 ( 322) 768 175.9 4.3e-44
CCDS64583.1 GNA12 gene_id:2768|Hs108|chr7 ( 305) 648 149.9 2.7e-36
CCDS13472.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 ( 394) 607 141.1 1.6e-33
CCDS46622.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 (1037) 607 141.4 3.4e-33
CCDS46623.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 ( 395) 600 139.6 4.5e-33
CCDS58614.1 GNAL gene_id:2774|Hs108|chr18 ( 174) 337 82.4 3.2e-16
>>CCDS12103.1 GNA11 gene_id:2767|Hs108|chr19 (359 aa)
initn: 2333 init1: 2333 opt: 2333 Z-score: 2735.5 bits: 514.7 E(32554): 4.8e-146
Smith-Waterman score: 2333; 100.0% identity (100.0% similar) in 359 aa overlap (1-359:1-359)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MTLESMMACCLSDEVKESKRINAEIEKQLRRDKRDARRELKLLLLGTGESGKSTFIKQMR
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CCDS12 MTLESMMACCLSDEVKESKRINAEIEKQLRRDKRDARRELKLLLLGTGESGKSTFIKQMR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 IIHGAGYSEEDKRGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMETLKILYKYEQNKANALLIREVDVEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IIHGAGYSEEDKRGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMETLKILYKYEQNKANALLIREVDVEK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 VTTFEHQYVSAIKTLWEDPGIQECYDRRREYQLSDSAKYYLTDVDRIATLGYLPTQQDVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VTTFEHQYVSAIKTLWEDPGIQECYDRRREYQLSDSAKYYLTDVDRIATLGYLPTQQDVL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 RVRVPTTGIIEYPFDLENIIFRMVDVGGQRSERRKWIHCFENVTSIMFLVALSEYDQVLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RVRVPTTGIIEYPFDLENIIFRMVDVGGQRSERRKWIHCFENVTSIMFLVALSEYDQVLV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 ESDNENRMEESKALFRTIITYPWFQNSSVILFLNKKDLLEDKILYSHLVDYFPEFDGPQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ESDNENRMEESKALFRTIITYPWFQNSSVILFLNKKDLLEDKILYSHLVDYFPEFDGPQR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB6 DAQAAREFILKMFVDLNPDSDKIIYSHFTCATDTENIRFVFAAVKDTILQLNLKEYNLV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DAQAAREFILKMFVDLNPDSDKIIYSHFTCATDTENIRFVFAAVKDTILQLNLKEYNLV
310 320 330 340 350
>>CCDS6658.1 GNAQ gene_id:2776|Hs108|chr9 (359 aa)
initn: 2159 init1: 2159 opt: 2159 Z-score: 2531.9 bits: 477.0 E(32554): 1e-134
Smith-Waterman score: 2159; 90.3% identity (98.3% similar) in 359 aa overlap (1-359:1-359)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MTLESMMACCLSDEVKESKRINAEIEKQLRRDKRDARRELKLLLLGTGESGKSTFIKQMR
:::::.::::::.:.::..::: :::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MTLESIMACCLSEEAKEARRINDEIERQLRRDKRDARRELKLLLLGTGESGKSTFIKQMR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 IIHGAGYSEEDKRGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMETLKILYKYEQNKANALLIREVDVEK
::::.:::.:::::::::::::::::::::::::.:::: ::::.:::.: :.:::::::
CCDS66 IIHGSGYSDEDKRGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMDTLKIPYKYEHNKAHAQLVREVDVEK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 VTTFEHQYVSAIKTLWEDPGIQECYDRRREYQLSDSAKYYLTDVDRIATLGYLPTQQDVL
:..::. ::.:::.::.:::::::::::::::::::.::::.:.::.: .:::::::::
CCDS66 VSAFENPYVDAIKSLWNDPGIQECYDRRREYQLSDSTKYYLNDLDRVADPAYLPTQQDVL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 RVRVPTTGIIEYPFDLENIIFRMVDVGGQRSERRKWIHCFENVTSIMFLVALSEYDQVLV
::::::::::::::::...:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 RVRVPTTGIIEYPFDLQSVIFRMVDVGGQRSERRKWIHCFENVTSIMFLVALSEYDQVLV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 ESDNENRMEESKALFRTIITYPWFQNSSVILFLNKKDLLEDKILYSHLVDYFPEFDGPQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.::::::::::.:::::
CCDS66 ESDNENRMEESKALFRTIITYPWFQNSSVILFLNKKDLLEEKIMYSHLVDYFPEYDGPQR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB6 DAQAAREFILKMFVDLNPDSDKIIYSHFTCATDTENIRFVFAAVKDTILQLNLKEYNLV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 DAQAAREFILKMFVDLNPDSDKIIYSHFTCATDTENIRFVFAAVKDTILQLNLKEYNLV
310 320 330 340 350
>>CCDS6657.1 GNA14 gene_id:9630|Hs108|chr9 (355 aa)
initn: 1950 init1: 1950 opt: 1950 Z-score: 2287.5 bits: 431.8 E(32554): 4.3e-121
Smith-Waterman score: 1950; 82.3% identity (94.9% similar) in 351 aa overlap (9-359:5-355)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MTLESMMACCLSDEVKESKRINAEIEKQLRRDKRDARRELKLLLLGTGESGKSTFIKQMR
:::: : :::.::.::::.::::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MAGCCCLSAEEKESQRISAEIERQLRRDKKDARRELKLLLLGTGESGKSTFIKQMR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 IIHGAGYSEEDKRGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMETLKILYKYEQNKANALLIREVDVEK
::::.:::.::..:::::::::::::::::::::.::.: : :::: :: .::::.:.:
CCDS66 IIHGSGYSDEDRKGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMDTLRIQYVCEQNKENAQIIREVEVDK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 VTTFEHQYVSAIKTLWEDPGIQECYDRRREYQLSDSAKYYLTDVDRIATLGYLPTQQDVL
:. . .. : ::: ::.::::::::::::::::::::::::::.::::: ...:::::::
CCDS66 VSMLSREQVEAIKQLWQDPGIQECYDRRREYQLSDSAKYYLTDIDRIATPSFVPTQQDVL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 RVRVPTTGIIEYPFDLENIIFRMVDVGGQRSERRKWIHCFENVTSIMFLVALSEYDQVLV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::::::::::::.
CCDS66 RVRVPTTGIIEYPFDLENIIFRMVDVGGQRSERRKWIHCFESVTSIIFLVALSEYDQVLA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 ESDNENRMEESKALFRTIITYPWFQNSSVILFLNKKDLLEDKILYSHLVDYFPEFDGPQR
: :::::::::::::.:::::::: :::::::::::::::.::.::::..::::. ::..
CCDS66 ECDNENRMEESKALFKTIITYPWFLNSSVILFLNKKDLLEEKIMYSHLISYFPEYTGPKQ
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KB6 DAQAAREFILKMFVDLNPDSDKIIYSHFTCATDTENIRFVFAAVKDTILQLNLKEYNLV
:..:::.::::.. : :::..:.:::::::::::.::::::::::::::::::.:.:::
CCDS66 DVRAARDFILKLYQDQNPDKEKVIYSHFTCATDTDNIRFVFAAVKDTILQLNLREFNLV
300 310 320 330 340 350
>>CCDS12104.1 GNA15 gene_id:2769|Hs108|chr19 (374 aa)
initn: 1334 init1: 1218 opt: 1218 Z-score: 1430.7 bits: 273.3 E(32554): 2.3e-73
Smith-Waterman score: 1325; 55.8% identity (80.4% similar) in 362 aa overlap (10-359:13-374)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MTLESMMACCLSDEVKESKRINAEIEKQLRRDKRDARRELKLLLLGTGESGKSTFIK
::... : . :.. ::.. : ..:.. : :::::::: ::::::::::
CCDS12 MARSLTWRCCPWCLTEDEKAAARVDQEINRILLEQKKQDRGELKLLLLGPGESGKSTFIK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 QMRIIHGAGYSEEDKRGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMETLKILYKYEQNKANALLIREVD
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CCDS12 QMRIIHGAGYSEEERKGFRPLVYQNIFVSMRAMIEAMERLQIPFSRPESKHHASLVMSQD
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 VEKVTTFEHQYVSAIKTLWEDPGIQECYDRRREYQLSDSAKYYLTDVDRIATLGYLPTQQ
::::::..:..:.. ::.: ::. ::.::::..: ::: :::. ..::. ::.:: :
CCDS12 PYKVTTFEKRYAAAMQWLWRDAGIRACYERRREFHLLDSAVYYLSHLERITEEGYVPTAQ
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 DVLRVRVPTTGIIEYPFDLENIIFRMVDVGGQRSERRKWIHCFENVTSIMFLVALSEYDQ
:::: :.::::: :: :.... .:.::::::.:::.::::::::: ....:..::::::
CCDS12 DVLRSRMPTTGINEYCFSVQKTNLRIVDVGGQKSERKKWIHCFENVIALIYLASLSEYDQ
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 VLVESDNENRMEESKALFRTIITYPWFQNSSVILFLNKKDLLEDKILYSHLVDYFPEFDG
: :...::::.:: ::: ::. :::...:::::::: :.::.:: :::. ::: :.:
CCDS12 CLEENNQENRMKESLALFGTILELPWFKSTSVILFLNKTDILEEKIPTSHLATYFPSFQG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340
pF1KB6 PQRDAQAAREFILKMFVDL------NPDSDKI------IYSHFTCATDTENIRFVFAAVK
:..::.::..::: :.. . .:...: ..::.::::::.::: :: :.
CCDS12 PKQDAEAAKRFILDMYTRMYTGCVDGPEGSKKGARSRRLFSHYTCATDTQNIRKVFKDVR
310 320 330 340 350 360
350
pF1KB6 DTILQLNLKEYNLV
:..: : : ::.
CCDS12 DSVLARYLDEINLL
370
>>CCDS5595.1 GNAI1 gene_id:2770|Hs108|chr7 (354 aa)
initn: 1103 init1: 824 opt: 1129 Z-score: 1326.9 bits: 254.1 E(32554): 1.4e-67
Smith-Waterman score: 1129; 51.8% identity (76.1% similar) in 355 aa overlap (7-358:1-353)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MTLESMMACCLSDEVKESKRINAEIEKQLRRDKRDARRELKLLLLGTGESGKSTFIKQMR
:.: :: : : . . . :...::.: . : ::.::::::.:::::::..:::.
CCDS55 MGCTLSAEDKAAVERSKMIDRNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB6 IIHGAGYSEEDKRGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMETLKILY--KYEQNKANALLIREVDV
::: ::::::. . . .::.: . .. :.:::: ::: . . . . : :.. .
CCDS55 IIHEAGYSEEECKQYKAVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGDSARADDARQLFVLAGAA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 EKVTTFEHQYVSAIKTLWEDPGIQECYDRRREYQLSDSAKYYLTDVDRIATLGYLPTQQD
:. . . ...:: ::.: :.: :..: :::::.::: :::.:.:::: .:.:::::
CCDS55 EE-GFMTAELAGVIKRLWKDSGVQACFNRSREYQLNDSAAYYLNDLDRIAQPNYIPTQQD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 VLRVRVPTTGIIEYPFDLENIIFRMVDVGGQRSERRKWIHCFENVTSIMFLVALSEYDQV
:::.:: ::::.: : .... :.: :::::::::.:::::::.::.:.: ::::.:: :
CCDS55 VLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 LVESDNENRMEESKALFRTIITYPWFQNSSVILFLNKKDLLEDKILYSHLVDYFPEFDGP
:.:... :::.:: :: .: . :: ..:.:::::::::.:.:: : :. .::. :
CCDS55 LAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKIKKSPLTICYPEYAGS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 QRDAQAAREFILKMFVDLNPDSD-KIIYSHFTCATDTENIRFVFAAVKDTILQLNLKEYN
. .:: .: .: ::: .: : ::.::::::::.:..::: :: :.:.. :::. .
CCDS55 NTYEEAA-AYIQCQFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCG
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 LV
:
CCDS55 LF
>>CCDS10757.1 GNAO1 gene_id:2775|Hs108|chr16 (354 aa)
initn: 1098 init1: 711 opt: 1128 Z-score: 1325.8 bits: 253.8 E(32554): 1.6e-67
Smith-Waterman score: 1128; 50.9% identity (75.7% similar) in 350 aa overlap (7-354:1-349)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MTLESMMACCLSDEVKESKRINAEIEKQLRRDKRDARRELKLLLLGTGESGKSTFIKQMR
:.: :: : . . . . :::.:..: .: ...::::::.:::::::..:::.
CCDS10 MGCTLSAEERAALERSKAIEKNLKEDGISAAKDVKLLLLGAGESGKSTIVKQMK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB6 IIHGAGYSEEDKRGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMETLKILYKYEQNKANALLIREV--DV
::: :.: :: . . .::.: . .. :..:::.:: : : .. ::.: .. .: .
CCDS10 IIHEDGFSGEDVKQYKPVVYSNTIQSLAAIVRAMDTLGIEYGDKERKADAKMVCDVVSRM
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 EKVTTFEHQYVSAIKTLWEDPGIQECYDRRREYQLSDSAKYYLTDVDRIATLGYLPTQQD
: . : . .::. :: : :::::..: :::::.::::::: ..:::.. : ::.::
CCDS10 EDTEPFSAELLSAMMRLWGDSGIQECFNRSREYQLNDSAKYYLDSLDRIGAADYQPTEQD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 VLRVRVPTTGIIEYPFDLENIIFRMVDVGGQRSERRKWIHCFENVTSIMFLVALSEYDQV
.::.:: ::::.: : ..:. ::. :::::::::.:::::::.::.:.: :::: ::::
CCDS10 ILRTRVKTTGIVETHFTFKNLHFRLFDVGGQRSERKKWIHCFEDVTAIIFCVALSGYDQV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 LVESDNENRMEESKALFRTIITYPWFQNSSVILFLNKKDLLEDKILYSHLVDYFPEFDGP
: :... :::.:: :: .: . :: ..:.::::::::..:.:: : :. :::. ::
CCDS10 LHEDETTNRMHESLKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDIFEEKIKKSPLTICFPEYTGP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 QRDAQAAREFILKMFVDLNPDSDKIIYSHFTCATDTENIRFVFAAVKDTILQLNLKEYNL
. ..:. .: .. . : .. : ::.: ::::::.::.::: :: :.:. ::.
CCDS10 SAFTEAV-AYIQAQYESKNKSAHKEIYTHVTCATDTNNIQFVFDAVTDVIIAKNLRGCGL
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 V
CCDS10 Y
>>CCDS2813.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 (355 aa)
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Smith-Waterman score: 1126; 50.7% identity (75.2% similar) in 355 aa overlap (7-358:1-354)
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CCDS80 LY
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CCDS47 LF
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