FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6529, 365 aa
1>>>pF1KB6529 365 - 365 aa - 365 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.6832+/-0.000707; mu= -31.9141+/- 0.041
mean_var=767.0310+/-173.818, 0's: 0 Z-trim(114.1): 1269 B-trim: 1726 in 2/53
Lambda= 0.046309
statistics sampled from 21936 (23716) to 21936 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.635), E-opt: 0.2 (0.278), width: 16
Scan time: 7.480
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_002745 (OMIM: 602899) mitogen-activated protein ( 365) 2426 178.1 2.7e-44
NP_002960 (OMIM: 602399) mitogen-activated protein ( 367) 1601 123.0 1.1e-27
NP_620581 (OMIM: 600289) mitogen-activated protein ( 360) 1506 116.7 8.6e-26
NP_001306 (OMIM: 600289) mitogen-activated protein ( 360) 1487 115.4 2.1e-25
NP_002742 (OMIM: 602898) mitogen-activated protein ( 364) 1485 115.3 2.3e-25
XP_011512612 (OMIM: 600289) PREDICTED: mitogen-act ( 401) 1356 106.7 9.6e-23
XP_016865790 (OMIM: 600289) PREDICTED: mitogen-act ( 301) 1251 99.5 1e-20
XP_016865788 (OMIM: 600289) PREDICTED: mitogen-act ( 328) 1251 99.6 1.1e-20
NP_620582 (OMIM: 600289) mitogen-activated protein ( 297) 1249 99.4 1.1e-20
XP_016865789 (OMIM: 600289) PREDICTED: mitogen-act ( 328) 1232 98.3 2.6e-20
XP_006715061 (OMIM: 600289) PREDICTED: mitogen-act ( 283) 1190 95.4 1.6e-19
XP_016865793 (OMIM: 600289) PREDICTED: mitogen-act ( 258) 1165 93.7 4.9e-19
NP_620583 (OMIM: 600289) mitogen-activated protein ( 307) 1165 93.8 5.5e-19
XP_016865792 (OMIM: 600289) PREDICTED: mitogen-act ( 270) 1091 88.8 1.6e-17
XP_016865791 (OMIM: 600289) PREDICTED: mitogen-act ( 273) 1091 88.8 1.6e-17
XP_011529008 (OMIM: 602898) PREDICTED: mitogen-act ( 256) 1041 85.4 1.5e-16
NP_002737 (OMIM: 601795) mitogen-activated protein ( 379) 1005 83.2 1.1e-15
NP_620407 (OMIM: 176948) mitogen-activated protein ( 360) 985 81.8 2.6e-15
NP_002736 (OMIM: 176948) mitogen-activated protein ( 360) 985 81.8 2.6e-15
NP_001035145 (OMIM: 601795) mitogen-activated prot ( 357) 946 79.2 1.6e-14
NP_620708 (OMIM: 602896) mitogen-activated protein ( 382) 936 78.6 2.6e-14
NP_620709 (OMIM: 602896) mitogen-activated protein ( 424) 936 78.7 2.8e-14
XP_016865127 (OMIM: 602896) PREDICTED: mitogen-act ( 424) 936 78.7 2.8e-14
NP_001290181 (OMIM: 602399) mitogen-activated prot ( 357) 929 78.1 3.4e-14
NP_001310231 (OMIM: 601158) mitogen-activated prot ( 384) 923 77.7 4.7e-14
NP_001310253 (OMIM: 601158) mitogen-activated prot ( 384) 923 77.7 4.7e-14
NP_001310256 (OMIM: 601158) mitogen-activated prot ( 384) 923 77.7 4.7e-14
NP_001310255 (OMIM: 601158) mitogen-activated prot ( 384) 923 77.7 4.7e-14
NP_620637 (OMIM: 601158) mitogen-activated protein ( 427) 923 77.8 5.1e-14
NP_001310257 (OMIM: 601158) mitogen-activated prot ( 427) 923 77.8 5.1e-14
NP_001310258 (OMIM: 601158) mitogen-activated prot ( 427) 923 77.8 5.1e-14
NP_001310260 (OMIM: 601158) mitogen-activated prot ( 427) 923 77.8 5.1e-14
NP_620634 (OMIM: 601158) mitogen-activated protein ( 384) 920 77.5 5.5e-14
NP_001310250 (OMIM: 601158) mitogen-activated prot ( 384) 920 77.5 5.5e-14
NP_001310254 (OMIM: 601158) mitogen-activated prot ( 384) 920 77.5 5.5e-14
NP_001310259 (OMIM: 601158) mitogen-activated prot ( 427) 920 77.6 5.9e-14
NP_001310252 (OMIM: 601158) mitogen-activated prot ( 427) 920 77.6 5.9e-14
NP_001310251 (OMIM: 601158) mitogen-activated prot ( 427) 920 77.6 5.9e-14
NP_001265476 (OMIM: 601158) mitogen-activated prot ( 427) 920 77.6 5.9e-14
XP_016865131 (OMIM: 602896) PREDICTED: mitogen-act ( 378) 918 77.4 5.9e-14
NP_620707 (OMIM: 602896) mitogen-activated protein ( 382) 918 77.4 6e-14
XP_016865130 (OMIM: 602896) PREDICTED: mitogen-act ( 382) 918 77.4 6e-14
NP_002743 (OMIM: 602896) mitogen-activated protein ( 424) 918 77.4 6.4e-14
XP_006714954 (OMIM: 602896) PREDICTED: mitogen-act ( 424) 918 77.4 6.4e-14
XP_016863924 (OMIM: 602897) PREDICTED: mitogen-act ( 384) 913 77.1 7.5e-14
XP_016863928 (OMIM: 602897) PREDICTED: mitogen-act ( 384) 913 77.1 7.5e-14
XP_016863926 (OMIM: 602897) PREDICTED: mitogen-act ( 384) 913 77.1 7.5e-14
XP_016863927 (OMIM: 602897) PREDICTED: mitogen-act ( 384) 913 77.1 7.5e-14
XP_016863923 (OMIM: 602897) PREDICTED: mitogen-act ( 384) 913 77.1 7.5e-14
XP_016863925 (OMIM: 602897) PREDICTED: mitogen-act ( 384) 913 77.1 7.5e-14
>>NP_002745 (OMIM: 602899) mitogen-activated protein kin (365 aa)
initn: 2426 init1: 2426 opt: 2426 Z-score: 916.2 bits: 178.1 E(85289): 2.7e-44
Smith-Waterman score: 2426; 100.0% identity (100.0% similar) in 365 aa overlap (1-365:1-365)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSLIRKKGFYKQDVNKTAWELPKTYVSPTHVGSGAYGSVCSAIDKRSGEKVAIKKLSRPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MSLIRKKGFYKQDVNKTAWELPKTYVSPTHVGSGAYGSVCSAIDKRSGEKVAIKKLSRPF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 QSEIFAKRAYRELLLLKHMQHENVIGLLDVFTPASSLRNFYDFYLVMPFMQTDLQKIMGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 QSEIFAKRAYRELLLLKHMQHENVIGLLDVFTPASSLRNFYDFYLVMPFMQTDLQKIMGM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 EFSEEKIQYLVYQMLKGLKYIHSAGVVHRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARHADAEMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 EFSEEKIQYLVYQMLKGLKYIHSAGVVHRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARHADAEMT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 GYVVTRWYRAPEVILSWMHYNQTVDIWSVGCIMAEMLTGKTLFKGKDYLDQLTQILKVTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GYVVTRWYRAPEVILSWMHYNQTVDIWSVGCIMAEMLTGKTLFKGKDYLDQLTQILKVTG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 VPGTEFVQKLNDKAAKSYIQSLPQTPRKDFTQLFPRASPQAADLLEKMLELDVDKRLTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VPGTEFVQKLNDKAAKSYIQSLPQTPRKDFTQLFPRASPQAADLLEKMLELDVDKRLTAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 QALTHPFFEPFRDPEEETEAQQPFDDSLEHEKLTVDEWKQHIYKEIVNFSPIARKDSRRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 QALTHPFFEPFRDPEEETEAQQPFDDSLEHEKLTVDEWKQHIYKEIVNFSPIARKDSRRR
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 SGMKL
:::::
NP_002 SGMKL
>>NP_002960 (OMIM: 602399) mitogen-activated protein kin (367 aa)
initn: 1498 init1: 970 opt: 1601 Z-score: 618.3 bits: 123.0 E(85289): 1.1e-27
Smith-Waterman score: 1601; 67.1% identity (88.8% similar) in 347 aa overlap (6-351:8-353)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSLIRKKGFYKQDVNKTAWELPKTYVSPTHVGSGAYGSVCSAIDKRSGEKVAIKKLSR
..:::.:.:.:::::. .: . :::::::.::::.: :.: ::::::: :
NP_002 MSSPPPARSGFYRQEVTKTAWEVRAVYRDLQPVGSGAYGAVCSAVDGRTGAKVAIKKLYR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 PFQSEIFAKRAYRELLLLKHMQHENVIGLLDVFTPASSLRNFYDFYLVMPFMQTDLQKIM
:::::.::::::::: :::::.::::::::::::: .: .: ::::::::: ::: :.:
NP_002 PFQSELFAKRAYRELRLLKHMRHENVIGLLDVFTPDETLDDFTDFYLVMPFMGTDLGKLM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 GME-FSEEKIQYLVYQMLKGLKYIHSAGVVHRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARHADA
: ..:..::.:::::::::.:::.::..::::::::::::::::::::::::::.::.
NP_002 KHEKLGEDRIQFLVYQMLKGLRYIHAAGIIHRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARQADS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 EMTGYVVTRWYRAPEVILSWMHYNQTVDIWSVGCIMAEMLTGKTLFKGKDYLDQLTQILK
::::::::::::::::::.::.:.:::::::::::::::.::::::::.:.:::: .:.:
NP_002 EMTGYVVTRWYRAPEVILNWMRYTQTVDIWSVGCIMAEMITGKTLFKGSDHLDQLKEIMK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 VTGVPGTEFVQKLNDKAAKSYIQSLPQTPRKDFTQLFPRASPQAADLLEKMLELDVDKRL
:::.: .::::.:.. ::.:...::. .:::.... ::: :..:::::: ::...:.
NP_002 VTGTPPAEFVQRLQSDEAKNYMKGLPELEKKDFASILTNASPLAVNLLEKMLVLDAEQRV
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 TAAQALTHPFFEPFRDPEEETEAQQPFDDSLEHEKLTVDEWKQHIYKEIVNFSPIARKDS
::..::.::.:: ..: :.: ..:. .:::.. :.::::. :::...:.:
NP_002 TAGEALAHPYFESLHDTEDEPQVQK-YDDSFDDVDRTLDEWKRVTYKEVLSFKPPRQLGA
310 320 330 340 350
360
pF1KB6 RRRSGMKL
NP_002 RVSKETPL
360
>>NP_620581 (OMIM: 600289) mitogen-activated protein kin (360 aa)
initn: 1436 init1: 912 opt: 1506 Z-score: 584.1 bits: 116.7 E(85289): 8.6e-26
Smith-Waterman score: 1506; 62.2% identity (86.9% similar) in 344 aa overlap (9-351:8-350)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSLIRKKGFYKQDVNKTAWELPKTYVSPTHVGSGAYGSVCSAIDKRSGEKVAIKKLSRPF
::.:..::: ::.:. : . . ::::::::::.:.: ..: .::.:::::::
NP_620 MSQERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB6 QSEIFAKRAYRELLLLKHMQHENVIGLLDVFTPASSLRNFYDFYLVMPFMQTDLQKIMG-
:: : :::.:::: :::::.:::::::::::::: ::..: : ::: .: .::..:.
NP_620 QSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKC
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 MEFSEEKIQYLVYQMLKGLKYIHSAGVVHRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARHADAEM
........:.:.::.:.:::::::: ..::::::.::::::::::::::::::::.: ::
NP_620 QKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARHTDDEM
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 TGYVVTRWYRAPEVILSWMHYNQTVDIWSVGCIMAEMLTGKTLFKGKDYLDQLTQILKVT
::::.::::::::..:.:::::::::::::::::::.:::.::: : :..::: ::...
NP_620 TGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 GVPGTEFVQKLNDKAAKSYIQSLPQTPRKDFTQLFPRASPQAADLLEKMLELDVDKRLTA
:.::.:...:.....:..::::: : :. .:...: :.: :.::::::: :: :::.::
NP_620 GTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 AQALTHPFFEPFRDPEEETEAQQPFDDSLEHEKLTVDEWKQHIYKEIVNFSPIARKDSRR
::::.: .: ..::..: :. :.:.:.: . : .::::. : :...: :
NP_620 AQALAHAYFAQYHDPDDEPVAD-PYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPPLDQEEM
300 310 320 330 340 350
360
pF1KB6 RSGMKL
NP_620 ES
360
>>NP_001306 (OMIM: 600289) mitogen-activated protein kin (360 aa)
initn: 1400 init1: 893 opt: 1487 Z-score: 577.2 bits: 115.4 E(85289): 2.1e-25
Smith-Waterman score: 1487; 61.3% identity (86.0% similar) in 344 aa overlap (9-351:8-350)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSLIRKKGFYKQDVNKTAWELPKTYVSPTHVGSGAYGSVCSAIDKRSGEKVAIKKLSRPF
::.:..::: ::.:. : . . ::::::::::.:.: ..: .::.:::::::
NP_001 MSQERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB6 QSEIFAKRAYRELLLLKHMQHENVIGLLDVFTPASSLRNFYDFYLVMPFMQTDLQKIMG-
:: : :::.:::: :::::.:::::::::::::: ::..: : ::: .: .::..:.
NP_001 QSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKC
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 MEFSEEKIQYLVYQMLKGLKYIHSAGVVHRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARHADAEM
........:.:.::.:.:::::::: ..::::::.::::::::::::::::::::.: ::
NP_001 QKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARHTDDEM
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 TGYVVTRWYRAPEVILSWMHYNQTVDIWSVGCIMAEMLTGKTLFKGKDYLDQLTQILKVT
::::.::::::::..:.:::::::::::::::::::.:::.::: : :...:: ::...:
NP_001 TGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHINQLQQIMRLT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 GVPGTEFVQKLNDKAAKSYIQSLPQTPRKDFTQLFPRASPQAADLLEKMLELDVDKRLTA
:.: . ..... .. :..::::: : :. .:...: :.: :.::::::: :: :::.::
NP_001 GTPPAYLINRMPSHEARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 AQALTHPFFEPFRDPEEETEAQQPFDDSLEHEKLTVDEWKQHIYKEIVNFSPIARKDSRR
::::.: .: ..::..: :. :.:.:.: . : .::::. : :...: :
NP_001 AQALAHAYFAQYHDPDDEPVAD-PYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPPLDQEEM
300 310 320 330 340 350
360
pF1KB6 RSGMKL
NP_001 ES
360
>>NP_002742 (OMIM: 602898) mitogen-activated protein kin (364 aa)
initn: 1362 init1: 908 opt: 1485 Z-score: 576.4 bits: 115.3 E(85289): 2.3e-25
Smith-Waterman score: 1485; 60.5% identity (86.2% similar) in 347 aa overlap (6-351:5-350)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSLIRKKGFYKQDVNKTAWELPKTYVSPTHVGSGAYGSVCSAIDKRSGEKVAIKKLSRPF
. :::.:..:::.::.:. . :::::::::::: : : .:::.:::::::
NP_002 MSGPRAGFYRQELNKTVWEVPQRLQGLRPVGSGAYGSVCSAYDARLRQKVAVKKLSRPF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 QSEIFAKRAYRELLLLKHMQHENVIGLLDVFTPASSLRNFYDFYLVMPFMQTDLQKIMGM
:: : :.:.:::: ::::..::::::::::::::.:...: . ::: .: .::..:.
NP_002 QSLIHARRTYRELRLLKHLKHENVIGLLDVFTPATSIEDFSEVYLVTTLMGADLNNIVKC
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB6 E-FSEEKIQYLVYQMLKGLKYIHSAGVVHRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARHADAEM
. .:.:..:.::::.:.:::::::::..::::::.:.::::::::.::::::::.:: ::
NP_002 QALSDEHVQFLVYQLLRGLKYIHSAGIIHRDLKPSNVAVNEDCELRILDFGLARQADEEM
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 TGYVVTRWYRAPEVILSWMHYNQTVDIWSVGCIMAEMLTGKTLFKGKDYLDQLTQILKVT
::::.::::::::..:.:::::::::::::::::::.: ::.:: :.::.::: .:..:.
NP_002 TGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLQGKALFPGSDYIDQLKRIMEVV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 GVPGTEFVQKLNDKAAKSYIQSLPQTPRKDFTQLFPRASPQAADLLEKMLELDVDKRLTA
:.:. : . :.... :..:::::: :.::....: :.: : ::: .:: :: :.:..:
NP_002 GTPSPEVLAKISSEHARTYIQSLPPMPQKDLSSIFRGANPLAIDLLGRMLVLDSDQRVSA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 AQALTHPFFEPFRDPEEETEAQQPFDDSLEHEKLTVDEWKQHIYKEIVNFSPIARKDSRR
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NP_002 AEALAHAYFSQYHDPEDEPEAE-PYDESVEAKERTLEEWKELTYQEVLSFKPPEPPKPPG
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360
pF1KB6 RSGMKL
NP_002 SLEIEQ
360
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10 20 30 40
pF1KB6 MSLIRKKGFYKQDVNKTAWELPKTYVSP-THVGSGAYGSVCS--------AIDKRS
:: :: .: ..::: :.: ..
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50 60 70 80 90 100
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XP_011 GLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVT
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XP_011 HLMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKI
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230 240 250 260 270 280
pF1KB6 DYLDQLTQILKVTGVPGTEFVQKLNDKAAKSYIQSLPQTPRKDFTQLFPRASPQAADLLE
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XP_011 DHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLE
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290 300 310 320 330 340
pF1KB6 KMLELDVDKRLTAAQALTHPFFEPFRDPEEETEAQQPFDDSLEHEKLTVDEWKQHIYKEI
::: :: :::.::::::.: .: ..::..: :. :.:.:.: . : .::::. : :.
XP_011 KMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVAD-PYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEV
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350 360
pF1KB6 VNFSPIARKDSRRRSGMKL
..: :
XP_011 ISFVPPPLDQEEMES
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10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSLIRKKGFYKQDVNKTAWELPKTYVSPTHVGSGAYGSVCSAIDKRSGEKVAIKKLSRPF
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pF1KB6 QSEIFAKRAYRELLLLKHMQHENVIGLLDVFTPASSLRNFYDFYLVMPFMQTDLQKIMG-
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pF1KB6 MEFSEEKIQYLVYQMLKGLKYIHSAGVVHRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARHADAEM
........:.:.::.:.:::::::: ..::::::.::::::::::::::::::::.: ::
XP_016 QKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARHTDDEM
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pF1KB6 TGYVVTRWYRAPEVILSWMHYNQTVDIWSVGCIMAEMLTGKTLFKGKDYLDQLTQILKVT
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XP_016 TGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLV
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pF1KB6 GVPGTEFVQKLNDKAAKSYIQSLPQTPRKDFTQLFPRASPQAADLLEKMLELDVDKRLTA
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XP_016 GTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLGSQSVAQPGELFYLLSCDP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 AQALTHPFFEPFRDPEEETEAQQPFDDSLEHEKLTVDEWKQHIYKEIVNFSPIARKDSRR
XP_016 GK
300
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10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSLIRKKGFYKQDVNKTAWELPKTYVSPTHVGSGAYGSVCSAIDKRSGEKVAIKKLSRPF
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XP_016 MSQERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPF
10 20 30 40 50
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pF1KB6 QSEIFAKRAYRELLLLKHMQHENVIGLLDVFTPASSLRNFYDFYLVMPFMQTDLQKIMG-
:: : :::.:::: :::::.:::::::::::::: ::..: : ::: .: .::..:.
XP_016 QSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKC
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pF1KB6 MEFSEEKIQYLVYQMLKGLKYIHSAGVVHRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARHADAEM
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pF1KB6 TGYVVTRWYRAPEVILSWMHYNQTVDIWSVGCIMAEMLTGKTLFKGKDYLDQLTQILKVT
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XP_016 TGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLV
180 190 200 210 220 230
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pF1KB6 GVPGTEFVQKLNDKAAKSYIQSLPQTPRKDFTQLFPRASPQAADLLEKMLELDVDKRLTA
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XP_016 GTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLGSQSVAQPGELFYLLSCDP
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pF1KB6 AQALTHPFFEPFRDPEEETEAQQPFDDSLEHEKLTVDEWKQHIYKEIVNFSPIARKDSRR
XP_016 GKCQHSRDCPRHEGELGLHISCTQTEMQR
300 310 320
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pF1KB6 MSLIRKKGFYKQDVNKTAWELPKTYVSPTHVGSGAYGSVCSAIDKRSGEKVAIKKLSRPF
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pF1KB6 QSEIFAKRAYRELLLLKHMQHENVIGLLDVFTPASSLRNFYDFYLVMPFMQTDLQKIMG-
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NP_620 QSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKC
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pF1KB6 MEFSEEKIQYLVYQMLKGLKYIHSAGVVHRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARHADAEM
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pF1KB6 TGYVVTRWYRAPEVILSWMHYNQTVDIWSVGCIMAEMLTGKTLFKGKDYLDQLTQILKVT
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pF1KB6 GVPGTEFVQKLNDKAAKSYIQSLPQTPRKDFTQLFPRASPQAADLLEKMLELDVDKRLTA
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NP_620 GTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLGKLTIYPHLMDIELVMI
240 250 260 270 280 290
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pF1KB6 AQALTHPFFEPFRDPEEETEAQQPFDDSLEHEKLTVDEWKQHIYKEIVNFSPIARKDSRR
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pF1KB6 MSLIRKKGFYKQDVNKTAWELPKTYVSPTHVGSGAYGSVCSAIDKRSGEKVAIKKLSRPF
::.:..::: ::.:. : . . ::::::::::.:.: ..: .::.:::::::
XP_016 MSQERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB6 QSEIFAKRAYRELLLLKHMQHENVIGLLDVFTPASSLRNFYDFYLVMPFMQTDLQKIMG-
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XP_016 QSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKC
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 MEFSEEKIQYLVYQMLKGLKYIHSAGVVHRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARHADAEM
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XP_016 QKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARHTDDEM
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pF1KB6 TGYVVTRWYRAPEVILSWMHYNQTVDIWSVGCIMAEMLTGKTLFKGKDYLDQLTQILKVT
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XP_016 TGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHINQLQQIMRLT
180 190 200 210 220 230
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pF1KB6 GVPGTEFVQKLNDKAAKSYIQSLPQTPRKDFTQLFPRASPQAADLLEKMLELDVDKRLTA
:.: . ..... .. :..::::: : :. .:...: :.: ... . . ::
XP_016 GTPPAYLINRMPSHEARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLGSQSVAQPGELFYLLSCDP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]