Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6550
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6550, 392 aa
1>>>pF1KB6550 392 - 392 aa - 392 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.5263+/-0.00123; mu= -11.6717+/- 0.074
mean_var=343.1891+/-71.100, 0's: 0 Z-trim(110.9): 139 B-trim: 302 in 3/50
Lambda= 0.069232
statistics sampled from 11820 (11955) to 11820 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.681), E-opt: 0.2 (0.367), width: 16
Scan time: 2.650
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43656.1 LUC7L2 gene_id:51631|Hs108|chr7 ( 392) 2567 270.2 2.3e-72
CCDS59085.1 LUC7L2 gene_id:51631|Hs108|chr7 ( 389) 2455 259.0 5.3e-69
CCDS59084.1 LUC7L2 gene_id:100996928|Hs108|chr7 ( 458) 2440 257.6 1.7e-68
CCDS59510.1 LUC7L2 gene_id:51631|Hs108|chr7 ( 391) 2433 256.8 2.5e-68
CCDS32348.1 LUC7L gene_id:55692|Hs108|chr16 ( 371) 1769 190.5 2.2e-48
CCDS10401.1 LUC7L gene_id:55692|Hs108|chr16 ( 325) 1750 188.5 7.3e-48
CCDS81921.1 LUC7L gene_id:55692|Hs108|chr16 ( 272) 1412 154.7 9.2e-38
CCDS11573.1 LUC7L3 gene_id:51747|Hs108|chr17 ( 432) 849 98.6 1.1e-20
CCDS82158.1 LUC7L3 gene_id:51747|Hs108|chr17 ( 489) 849 98.7 1.2e-20
>>CCDS43656.1 LUC7L2 gene_id:51631|Hs108|chr7 (392 aa)
initn: 2567 init1: 2567 opt: 2567 Z-score: 1412.6 bits: 270.2 E(32554): 2.3e-72
Smith-Waterman score: 2567; 100.0% identity (100.0% similar) in 392 aa overlap (1-392:1-392)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSAQAQMRAMLDQLMGTSRDGDTTRQRIKFSDDRVCKSHLLNCCPHDVLSGTRMDLGECL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MSAQAQMRAMLDQLMGTSRDGDTTRQRIKFSDDRVCKSHLLNCCPHDVLSGTRMDLGECL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 KVHDLALRADYEIASKEQDFFFELDAMDHLQSFIADCDRRTEVAKKRLAETQEEISAEVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KVHDLALRADYEIASKEQDFFFELDAMDHLQSFIADCDRRTEVAKKRLAETQEEISAEVA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 AKAERVHELNEEIGKLLAKVEQLGAEGNVEESQKVMDEVEKARAKKREAEEVYRNSMPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AKAERVHELNEEIGKLLAKVEQLGAEGNVEESQKVMDEVEKARAKKREAEEVYRNSMPAS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 SFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIEIREKLEELKRVVAEKQEKRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIEIREKLEELKRVVAEKQEKRN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 QERLKRREEREREEREKLRRSRSHSKNPKRSRSREHRRHRSRSMSRERKRRTRSKSREKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QERLKRREEREREEREKLRRSRSHSKNPKRSRSREHRRHRSRSMSRERKRRTRSKSREKR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 HRHRSRSSSRSRSRSHQRSRHSSRDRSRERSKRRSSKERFRDQDLASCDRDRSSRDRSPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HRHRSRSSSRSRSRSHQRSRHSSRDRSRERSKRRSSKERFRDQDLASCDRDRSSRDRSPR
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KB6 DRDRKDKKRSYESANGRSEDRRSSEEREAGEI
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DRDRKDKKRSYESANGRSEDRRSSEEREAGEI
370 380 390
>>CCDS59085.1 LUC7L2 gene_id:51631|Hs108|chr7 (389 aa)
initn: 2444 init1: 2444 opt: 2455 Z-score: 1352.2 bits: 259.0 E(32554): 5.3e-69
Smith-Waterman score: 2455; 97.2% identity (99.2% similar) in 387 aa overlap (7-392:3-389)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSAQAQMRAMLDQLMGTS-RDGDTTRQRIKFSDDRVCKSHLLNCCPHDVLSGTRMDLGEC
....: ...:.: : :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MVIHSQLKKIQGASERMGDTTRQRIKFSDDRVCKSHLLNCCPHDVLSGTRMDLGEC
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 LKVHDLALRADYEIASKEQDFFFELDAMDHLQSFIADCDRRTEVAKKRLAETQEEISAEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LKVHDLALRADYEIASKEQDFFFELDAMDHLQSFIADCDRRTEVAKKRLAETQEEISAEV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 AAKAERVHELNEEIGKLLAKVEQLGAEGNVEESQKVMDEVEKARAKKREAEEVYRNSMPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 AAKAERVHELNEEIGKLLAKVEQLGAEGNVEESQKVMDEVEKARAKKREAEEVYRNSMPA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 SSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIEIREKLEELKRVVAEKQEKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIEIREKLEELKRVVAEKQEKR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 NQERLKRREEREREEREKLRRSRSHSKNPKRSRSREHRRHRSRSMSRERKRRTRSKSREK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 NQERLKRREEREREEREKLRRSRSHSKNPKRSRSREHRRHRSRSMSRERKRRTRSKSREK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 RHRHRSRSSSRSRSRSHQRSRHSSRDRSRERSKRRSSKERFRDQDLASCDRDRSSRDRSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 RHRHRSRSSSRSRSRSHQRSRHSSRDRSRERSKRRSSKERFRDQDLASCDRDRSSRDRSP
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390
pF1KB6 RDRDRKDKKRSYESANGRSEDRRSSEEREAGEI
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 RDRDRKDKKRSYESANGRSEDRRSSEEREAGEI
360 370 380
>>CCDS59084.1 LUC7L2 gene_id:100996928|Hs108|chr7 (458 aa)
initn: 2440 init1: 2440 opt: 2440 Z-score: 1343.1 bits: 257.6 E(32554): 1.7e-68
Smith-Waterman score: 2440; 100.0% identity (100.0% similar) in 372 aa overlap (21-392:87-458)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSAQAQMRAMLDQLMGTSRDGDTTRQRIKFSDDRVCKSHLLNCCPHDVLS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 HELHFQAATYLCLLRSIRKHVALHQEFHGKGDTTRQRIKFSDDRVCKSHLLNCCPHDVLS
60 70 80 90 100 110
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 GTRMDLGECLKVHDLALRADYEIASKEQDFFFELDAMDHLQSFIADCDRRTEVAKKRLAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GTRMDLGECLKVHDLALRADYEIASKEQDFFFELDAMDHLQSFIADCDRRTEVAKKRLAE
120 130 140 150 160 170
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 TQEEISAEVAAKAERVHELNEEIGKLLAKVEQLGAEGNVEESQKVMDEVEKARAKKREAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 TQEEISAEVAAKAERVHELNEEIGKLLAKVEQLGAEGNVEESQKVMDEVEKARAKKREAE
180 190 200 210 220 230
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 EVYRNSMPASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIEIREKLEELKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EVYRNSMPASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIEIREKLEELKR
240 250 260 270 280 290
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 VVAEKQEKRNQERLKRREEREREEREKLRRSRSHSKNPKRSRSREHRRHRSRSMSRERKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 VVAEKQEKRNQERLKRREEREREEREKLRRSRSHSKNPKRSRSREHRRHRSRSMSRERKR
300 310 320 330 340 350
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 RTRSKSREKRHRHRSRSSSRSRSRSHQRSRHSSRDRSRERSKRRSSKERFRDQDLASCDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 RTRSKSREKRHRHRSRSSSRSRSRSHQRSRHSSRDRSRERSKRRSSKERFRDQDLASCDR
360 370 380 390 400 410
360 370 380 390
pF1KB6 DRSSRDRSPRDRDRKDKKRSYESANGRSEDRRSSEEREAGEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DRSSRDRSPRDRDRKDKKRSYESANGRSEDRRSSEEREAGEI
420 430 440 450
>>CCDS59510.1 LUC7L2 gene_id:51631|Hs108|chr7 (391 aa)
initn: 2432 init1: 2432 opt: 2433 Z-score: 1340.3 bits: 256.8 E(32554): 2.5e-68
Smith-Waterman score: 2433; 96.2% identity (97.4% similar) in 392 aa overlap (7-392:1-391)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSAQAQMRAMLDQLMGTSRDG------DTTRQRIKFSDDRVCKSHLLNCCPHDVLSGTRM
: :.:. :.:. : . :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MPAYLN-LQGSVRKAPHSPSRDTTRQRIKFSDDRVCKSHLLNCCPHDVLSGTRM
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 DLGECLKVHDLALRADYEIASKEQDFFFELDAMDHLQSFIADCDRRTEVAKKRLAETQEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DLGECLKVHDLALRADYEIASKEQDFFFELDAMDHLQSFIADCDRRTEVAKKRLAETQEE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 ISAEVAAKAERVHELNEEIGKLLAKVEQLGAEGNVEESQKVMDEVEKARAKKREAEEVYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ISAEVAAKAERVHELNEEIGKLLAKVEQLGAEGNVEESQKVMDEVEKARAKKREAEEVYR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 NSMPASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIEIREKLEELKRVVAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 NSMPASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIEIREKLEELKRVVAE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 KQEKRNQERLKRREEREREEREKLRRSRSHSKNPKRSRSREHRRHRSRSMSRERKRRTRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KQEKRNQERLKRREEREREEREKLRRSRSHSKNPKRSRSREHRRHRSRSMSRERKRRTRS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 KSREKRHRHRSRSSSRSRSRSHQRSRHSSRDRSRERSKRRSSKERFRDQDLASCDRDRSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KSREKRHRHRSRSSSRSRSRSHQRSRHSSRDRSRERSKRRSSKERFRDQDLASCDRDRSS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390
pF1KB6 RDRSPRDRDRKDKKRSYESANGRSEDRRSSEEREAGEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 RDRSPRDRDRKDKKRSYESANGRSEDRRSSEEREAGEI
360 370 380 390
>>CCDS32348.1 LUC7L gene_id:55692|Hs108|chr16 (371 aa)
initn: 1577 init1: 1577 opt: 1769 Z-score: 982.2 bits: 190.5 E(32554): 2.2e-48
Smith-Waterman score: 1817; 73.0% identity (88.8% similar) in 392 aa overlap (1-392:1-371)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSAQAQMRAMLDQLMGTSRDGDTTRQRIKFSDDRVCKSHLLNCCPHDVLSGTRMDLGECL
:::::::::.:::::::.:::: ::::.::.::::::::::.:::::.:.:::::::::
CCDS32 MSAQAQMRALLDQLMGTARDGDETRQRVKFTDDRVCKSHLLDCCPHDILAGTRMDLGECT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 KVHDLALRADYEIASKEQDFFFELDAMDHLQSFIADCDRRTEVAKKRLAETQEEISAEVA
:.:::::::::::::::.:.::::::::::.::::.::::::.::::::::::::::::.
CCDS32 KIHDLALRADYEIASKERDLFFELDAMDHLESFIAECDRRTELAKKRLAETQEEISAEVS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 AKAERVHELNEEIGKLLAKVEQLGAEGNVEESQKVMDEVEKARAKKREAEEVYRNSMPAS
::::.::::::::::::::.:::::::::.::::.. ::::.::::.:::: ::::::::
CCDS32 AKAEKVHELNEEIGKLLAKAEQLGAEGNVDESQKILMEVEKVRAKKKEAEEEYRNSMPAS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 SFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIEIREKLEELKRVVAEKQEKRN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::..:...:::::::::
CCDS32 SFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIQIREKLDQLRKTVAEKQEKRN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 QERLKRREEREREEREKLRRSRSHSKNPKRSRSREHRRHRSRSMSRERKRRTRSKSREKR
:.::.:::::::::: . ::: :.... .:::::..::.:::: ::::.. .::.::...
CCDS32 QDRLRRREEREREERLS-RRSGSRTRDRRRSRSRDRRRRRSRSTSRERRKLSRSRSRDRH
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 HRHRSRSSSRSRSRSHQRSRHSSRDRSRERSKRRSSKERFRDQDLASCDRDRSSRDRSPR
.:::::: ::.::.:.: .::::: .: . :.:: .. : . :: .:.:
CCDS32 RRHRSRS--RSHSRGHRR---ASRDRS---AKYKFSRERASREE--SWESGRS--ERGPP
300 310 320 330 340
370 380 390
pF1KB6 DRDRKDKKRSYESANGRSEDRRSSEEREAGEI
: ::.::. .::: ::.:::::
CCDS32 DW-------RLESSNGKMASRRS-EEKEAGEI
350 360 370
>>CCDS10401.1 LUC7L gene_id:55692|Hs108|chr16 (325 aa)
initn: 2125 init1: 1529 opt: 1750 Z-score: 972.8 bits: 188.5 E(32554): 7.3e-48
Smith-Waterman score: 1750; 80.1% identity (95.4% similar) in 327 aa overlap (1-327:1-321)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSAQAQMRAMLDQLMGTSRDGDTTRQRIKFSDDRVCKSHLLNCCPHDVLSGTRMDLGECL
:::::::::.:::::::.:::: ::::.::.::::::::::.:::::.:.:::::::::
CCDS10 MSAQAQMRALLDQLMGTARDGDETRQRVKFTDDRVCKSHLLDCCPHDILAGTRMDLGECT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 KVHDLALRADYEIASKEQDFFFELDAMDHLQSFIADCDRRTEVAKKRLAETQEEISAEVA
:.:::::::::::::::.:.::::::::::.::::.::::::.::::::::::::::::.
CCDS10 KIHDLALRADYEIASKERDLFFELDAMDHLESFIAECDRRTELAKKRLAETQEEISAEVS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 AKAERVHELNEEIGKLLAKVEQLGAEGNVEESQKVMDEVEKARAKKREAEEVYRNSMPAS
::::.::::::::::::::.:::::::::.::::.. ::::.::::.:::: ::::::::
CCDS10 AKAEKVHELNEEIGKLLAKAEQLGAEGNVDESQKILMEVEKVRAKKKEAEEEYRNSMPAS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 SFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIEIREKLEELKRVVAEKQEKRN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::..:...:::::::::
CCDS10 SFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIQIREKLDQLRKTVAEKQEKRN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 QERLKRREEREREEREKLRRSRSHSKNPKRSRSREHRRHRSRSMSRERKRRTRSKSREKR
:.::.:::::::::: . ::: :.... .:::::..::.:::: ::::.. .::.::...
CCDS10 QDRLRRREEREREERLS-RRSGSRTRDRRRSRSRDRRRRRSRSTSRERRKLSRSRSRDRH
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 HRHRSRSSSRSRSRSHQRSRHSSRDRSRERSKRRSSKERFRDQDLASCDRDRSSRDRSPR
.::::: :::.::.:.: .:::::
CCDS10 RRHRSR--SRSHSRGHRR---ASRDRSAKYK
300 310 320
>>CCDS81921.1 LUC7L gene_id:55692|Hs108|chr16 (272 aa)
initn: 1806 init1: 1191 opt: 1412 Z-score: 791.4 bits: 154.7 E(32554): 9.2e-38
Smith-Waterman score: 1412; 79.2% identity (94.9% similar) in 274 aa overlap (54-327:1-268)
30 40 50 60 70 80
pF1KB6 TRQRIKFSDDRVCKSHLLNCCPHDVLSGTRMDLGECLKVHDLALRADYEIASKEQDFFFE
:::::: :.:::::::::::::::.:.:::
CCDS81 MDLGECTKIHDLALRADYEIASKERDLFFE
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 LDAMDHLQSFIADCDRRTEVAKKRLAETQEEISAEVAAKAERVHELNEEIGKLLAKVEQL
:::::::.::::.::::::.::::::::::::::::.::::.::::::::::::::.:::
CCDS81 LDAMDHLESFIAECDRRTELAKKRLAETQEEISAEVSAKAEKVHELNEEIGKLLAKAEQL
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 GAEGNVEESQKVMDEVEKARAKKREAEEVYRNSMPASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDND
::::::.::::.. ::::.::::.:::: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GAEGNVDESQKILMEVEKVRAKKKEAEEEYRNSMPASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDND
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 RRLADHFGGKLHLGFIEIREKLEELKRVVAEKQEKRNQERLKRREEREREEREKLRRSRS
::::::::::::::::.:::::..:...::::::::::.::.:::::::::: . ::: :
CCDS81 RRLADHFGGKLHLGFIQIREKLDQLRKTVAEKQEKRNQDRLRRREEREREERLS-RRSGS
160 170 180 190 200
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 HSKNPKRSRSREHRRHRSRSMSRERKRRTRSKSREKRHRHRSRSSSRSRSRSHQRSRHSS
.... .:::::..::.:::: ::::.. .::.::....:::::: ::.::.:.:. :
CCDS81 RTRDRRRSRSRDRRRRRSRSTSRERRKLSRSRSRDRHRRHRSRS--RSHSRGHRRA---S
210 220 230 240 250 260
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 RDRSRERSKRRSSKERFRDQDLASCDRDRSSRDRSPRDRDRKDKKRSYESANGRSEDRRS
::::
CCDS81 RDRSAKYK
270
>>CCDS11573.1 LUC7L3 gene_id:51747|Hs108|chr17 (432 aa)
initn: 809 init1: 361 opt: 849 Z-score: 484.6 bits: 98.6 E(32554): 1.1e-20
Smith-Waterman score: 849; 37.8% identity (70.2% similar) in 392 aa overlap (10-384:7-390)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSAQAQMRAMLDQLMGTSRD--GDTTRQRIKFSDDRVCKSHLLNCCPHDVLSGTRMDLGE
.::.::: .:. : :. .... . ::: .: . :: .....:: :::
CCDS11 MISAAQLLDELMGRDRNLAPDEKRSNVRWDHESVCKYYLCGFCPAELFTNTRSDLGP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 CLKVHDLALRADYEIASKEQDFFFELDAMDHLQSFIADCDRRTEVAKKRLAETQEEISAE
: :.:: :: .:: .:. . .: : . .:::..:. .:: . .. ::: .:.. :.
CCDS11 CEKIHDENLRKQYEKSSRFMKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 VAAKA----ERVHELNEEIGKLLAKVEQLGAEGNVEESQKVMDEVEKARAKKREAEEVYR
.:. . :... :...: :: ..:.::.::.:::.: .: ::. . ..:: .
CCDS11 AAGPTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQLK-EERELLRSTT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 NSMPASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIEIREKLEELKRVVAE
... . . :.....:::::.:.: . : . :. ::. :: :.:. .:. .::::. . .
CCDS11 STIESFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 KQEKRNQ-ERLKRREEREREEREKLRRSRSHSKNPKRSRSREHRRHRSRSMSRERKRRTR
. :. .. ::::. :..::::::: .: : . . .. : .:..:.. :. .:::..:.:
CCDS11 RTEEPDRDERLKK-EKQEREEREK-EREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB6 SKSREKRHRHRSRSSSR--SRSRSHQRSRHSSRDRSRERSKRRSS-------KERFRDQD
:.: :: ::.:.: ::::.:.::: : ::: :..::: :.: :..:
CCDS11 SRS-----RHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRD
300 310 320 330 340
350 360 370 380 390
pF1KB6 LA-SCDRDRSSRDRSPRDRDRKDKKRSYESANGRSEDRRSSEEREAGEI
: .:::.: . ..:::.. ..: :. . :.:..::
CCDS11 RRRSKSRDRKSYKHRSKSRDREQDRKSKEKEKRGSDDKKSSVKSGSREKQSEDTNTESKE
350 360 370 380 390 400
CCDS11 SDTKNEVNGTSEDIKSEGDTQSN
410 420 430
>>CCDS82158.1 LUC7L3 gene_id:51747|Hs108|chr17 (489 aa)
initn: 809 init1: 361 opt: 849 Z-score: 483.9 bits: 98.7 E(32554): 1.2e-20
Smith-Waterman score: 849; 37.8% identity (70.2% similar) in 392 aa overlap (10-384:7-390)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSAQAQMRAMLDQLMGTSRD--GDTTRQRIKFSDDRVCKSHLLNCCPHDVLSGTRMDLGE
.::.::: .:. : :. .... . ::: .: . :: .....:: :::
CCDS82 MISAAQLLDELMGRDRNLAPDEKRSNVRWDHESVCKYYLCGFCPAELFTNTRSDLGP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 CLKVHDLALRADYEIASKEQDFFFELDAMDHLQSFIADCDRRTEVAKKRLAETQEEISAE
: :.:: :: .:: .:. . .: : . .:::..:. .:: . .. ::: .:.. :.
CCDS82 CEKIHDENLRKQYEKSSRFMKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 VAAKA----ERVHELNEEIGKLLAKVEQLGAEGNVEESQKVMDEVEKARAKKREAEEVYR
.:. . :... :...: :: ..:.::.::.:::.: .: ::. . ..:: .
CCDS82 AAGPTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQLK-EERELLRSTT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 NSMPASSFQQQKLRVCEVCSAYLGLHDNDRRLADHFGGKLHLGFIEIREKLEELKRVVAE
... . . :.....:::::.:.: . : . :. ::. :: :.:. .:. .::::. . .
CCDS82 STIESFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 KQEKRNQ-ERLKRREEREREEREKLRRSRSHSKNPKRSRSREHRRHRSRSMSRERKRRTR
. :. .. ::::. :..::::::: .: : . . .. : .:..:.. :. .:::..:.:
CCDS82 RTEEPDRDERLKK-EKQEREEREK-EREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB6 SKSREKRHRHRSRSSSR--SRSRSHQRSRHSSRDRSRERSKRRSS-------KERFRDQD
:.: :: ::.:.: ::::.:.::: : ::: :..::: :.: :..:
CCDS82 SRS-----RHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRD
300 310 320 330 340
350 360 370 380 390
pF1KB6 LA-SCDRDRSSRDRSPRDRDRKDKKRSYESANGRSEDRRSSEEREAGEI
: .:::.: . ..:::.. ..: :. . :.:..::
CCDS82 RRRSKSRDRKSYKHRSKSRDREQDRKSKEKEKRGSDDKKSSVKSGSREKQSEDTNTESKE
350 360 370 380 390 400
CCDS82 SDTKNEVNGTSEDIKSEVQRKYAQMKMELSRVRRHTKASSEGKDSVVLQNILRYIVLSQL
410 420 430 440 450 460
392 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 16:06:50 2016 done: Fri Nov 4 16:06:51 2016
Total Scan time: 2.650 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]