Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6552
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6552, 394 aa
1>>>pF1KB6552 394 - 394 aa - 394 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3875+/-0.000695; mu= 12.9530+/- 0.042
mean_var=94.6522+/-19.117, 0's: 0 Z-trim(113.0): 46 B-trim: 694 in 1/51
Lambda= 0.131828
statistics sampled from 13627 (13678) to 13627 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.76), E-opt: 0.2 (0.42), width: 16
Scan time: 3.460
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6072.1 DUSP4 gene_id:1846|Hs108|chr8 ( 394) 2644 512.5 2.7e-145
CCDS6073.1 DUSP4 gene_id:1846|Hs108|chr8 ( 303) 1717 336.1 2.6e-92
CCDS4380.1 DUSP1 gene_id:1843|Hs108|chr5 ( 367) 1521 298.9 5.1e-81
CCDS7566.1 DUSP5 gene_id:1847|Hs108|chr10 ( 384) 963 192.7 4.7e-49
CCDS2016.1 DUSP2 gene_id:1844|Hs108|chr2 ( 314) 947 189.7 3.2e-48
CCDS1528.1 DUSP10 gene_id:11221|Hs108|chr1 ( 482) 582 120.3 3.7e-27
CCDS33766.2 DUSP7 gene_id:1849|Hs108|chr3 ( 419) 477 100.3 3.4e-21
CCDS9033.1 DUSP6 gene_id:1848|Hs108|chr12 ( 381) 472 99.4 6e-21
CCDS14724.1 DUSP9 gene_id:1852|Hs108|chrX ( 384) 454 95.9 6.5e-20
CCDS7724.1 DUSP8 gene_id:1850|Hs108|chr11 ( 625) 415 88.6 1.7e-17
CCDS8650.1 DUSP16 gene_id:80824|Hs108|chr12 ( 665) 402 86.2 9.7e-17
CCDS11320.1 DUSP14 gene_id:11072|Hs108|chr17 ( 198) 367 79.2 3.5e-15
CCDS55882.1 SSH1 gene_id:54434|Hs108|chr12 ( 692) 326 71.7 2.3e-12
CCDS53825.1 SSH1 gene_id:54434|Hs108|chr12 ( 703) 326 71.7 2.3e-12
CCDS9121.1 SSH1 gene_id:54434|Hs108|chr12 (1049) 326 71.8 3.2e-12
CCDS13883.1 DUSP18 gene_id:150290|Hs108|chr22 ( 188) 315 69.3 3.2e-12
CCDS11253.1 SSH2 gene_id:85464|Hs108|chr17 (1423) 322 71.1 7e-12
CCDS74024.1 SSH2 gene_id:85464|Hs108|chr17 (1450) 322 71.1 7.1e-12
CCDS2289.1 DUSP19 gene_id:142679|Hs108|chr2 ( 217) 298 66.1 3.4e-11
CCDS14264.1 DUSP21 gene_id:63904|Hs108|chrX ( 190) 296 65.7 4e-11
CCDS53542.1 DUSP13 gene_id:51207|Hs108|chr10 ( 188) 295 65.5 4.5e-11
>>CCDS6072.1 DUSP4 gene_id:1846|Hs108|chr8 (394 aa)
initn: 2644 init1: 2644 opt: 2644 Z-score: 2721.9 bits: 512.5 E(32554): 2.7e-145
Smith-Waterman score: 2644; 100.0% identity (100.0% similar) in 394 aa overlap (1-394:1-394)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MVTMEELREMDCSVLKRLMNRDENGGGAGGSGSHGTLGLPSGGKCLLLDCRPFLAHSAGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MVTMEELREMDCSVLKRLMNRDENGGGAGGSGSHGTLGLPSGGKCLLLDCRPFLAHSAGY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 ILGSVNVRCNTIVRRRAKGSVSLEQILPAEEEVRARLRSGLYSAVIVYDERSPRAESLRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 ILGSVNVRCNTIVRRRAKGSVSLEQILPAEEEVRARLRSGLYSAVIVYDERSPRAESLRE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 DSTVSLVVQALRRNAERTDICLLKGGYERFSSEYPEFCSKTKALAAIPPPVPPSATEPLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 DSTVSLVVQALRRNAERTDICLLKGGYERFSSEYPEFCSKTKALAAIPPPVPPSATEPLD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LGCSSCGTPLHDQGGPVEILPFLYLGSAYHAARRDMLDALGITALLNVSSDCPNHFEGHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LGCSSCGTPLHDQGGPVEILPFLYLGSAYHAARRDMLDALGITALLNVSSDCPNHFEGHY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 QYKCIPVEDNHKADISSWFMEAIEYIDAVKDCRGRVLVHCQAGISRSATICLAYLMMKKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 QYKCIPVEDNHKADISSWFMEAIEYIDAVKDCRGRVLVHCQAGISRSATICLAYLMMKKR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 VRLEEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLATSCAAEAASPSGPLRERGKTPATP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 VRLEEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLATSCAAEAASPSGPLRERGKTPATP
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KB6 TSQFVFSFPVSVGVHSAPSSLPYLHSPITTSPSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 TSQFVFSFPVSVGVHSAPSSLPYLHSPITTSPSC
370 380 390
>>CCDS6073.1 DUSP4 gene_id:1846|Hs108|chr8 (303 aa)
initn: 1712 init1: 1712 opt: 1717 Z-score: 1770.8 bits: 336.1 E(32554): 2.6e-92
Smith-Waterman score: 1717; 90.7% identity (93.4% similar) in 289 aa overlap (111-394:17-303)
90 100 110 120 130
pF1KB6 VSLEQILPAEEEVRARLRSGLYSAVIVYDERSPRAESLREDSTVSLVVQAL--RRNAERT
:::: .. :. . : .:: . : :.
CCDS60 MGRKVHSNGSQFAEHSRSPR-RTGRDCKPVRAPSMALGVSQLAGRS
10 20 30 40
140 150 160 170 180 190
pF1KB6 DICLL---KGGYERFSSEYPEFCSKTKALAAIPPPVPPSATEPLDLGCSSCGTPLHDQGG
:: .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 R-CLCSESQGGYERFSSEYPEFCSKTKALAAIPPPVPPSATEPLDLGCSSCGTPLHDQGG
50 60 70 80 90 100
200 210 220 230 240 250
pF1KB6 PVEILPFLYLGSAYHAARRDMLDALGITALLNVSSDCPNHFEGHYQYKCIPVEDNHKADI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PVEILPFLYLGSAYHAARRDMLDALGITALLNVSSDCPNHFEGHYQYKCIPVEDNHKADI
110 120 130 140 150 160
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 SSWFMEAIEYIDAVKDCRGRVLVHCQAGISRSATICLAYLMMKKRVRLEEAFEFVKQRRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SSWFMEAIEYIDAVKDCRGRVLVHCQAGISRSATICLAYLMMKKRVRLEEAFEFVKQRRS
170 180 190 200 210 220
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 IISPNFSFMGQLLQFESQVLATSCAAEAASPSGPLRERGKTPATPTSQFVFSFPVSVGVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 IISPNFSFMGQLLQFESQVLATSCAAEAASPSGPLRERGKTPATPTSQFVFSFPVSVGVH
230 240 250 260 270 280
380 390
pF1KB6 SAPSSLPYLHSPITTSPSC
:::::::::::::::::::
CCDS60 SAPSSLPYLHSPITTSPSC
290 300
>>CCDS4380.1 DUSP1 gene_id:1843|Hs108|chr5 (367 aa)
initn: 1387 init1: 1189 opt: 1521 Z-score: 1568.1 bits: 298.9 E(32554): 5.1e-81
Smith-Waterman score: 1521; 63.1% identity (83.5% similar) in 369 aa overlap (26-394:6-367)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MVTMEELREMDCSVLKRLMNRDENGGGAGGSGSHGTLGLPSGGKCLLLDCRPFLAHSAGY
: ..: .. :: ...::::::: :.: .::.
CCDS43 MVMEVGTLDAGGLRALLG-ERAAQCLLLDCRSFFAFNAGH
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 ILGSVNVRCNTIVRRRAKGSVSLEQILPAEEEVRARLRSGLYSAVIVYDERSPRAESLRE
: :::::: .:::::::::...::.:.: . :.:.:: .: : ::.. :::: .. ..
CCDS43 IAGSVNVRFSTIVRRRAKGAMGLEHIVP-NAELRGRLLAGAYHAVVLLDERSAALDGAKR
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 DSTVSLVVQALRRNAERTDICLLKGGYERFSSEYPEFCSKTKALAAIPPPVPPSATEPLD
:.:..:.. :: :.:. ... .:::::: ::. ::.::: .. .. :. :. . .
CCDS43 DGTLALAAGALCREARAAQVFFLKGGYEAFSASCPELCSKQSTPMGLSLPLSTSVPDSAE
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LGCSSCGTPLHDQGGPVEILPFLYLGSAYHAARRDMLDALGITALLNVSSDCPNHFEGHY
:::::.:::.::::::::::::::::::::.:.:::::::::::.:::..:::::::::
CCDS43 SGCSSCSTPLYDQGGPVEILPFLYLGSAYHASRKDMLDALGITALINVSANCPNHFEGHY
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 QYKCIPVEDNHKADISSWFMEAIEYIDAVKDCRGRVLVHCQAGISRSATICLAYLMMKKR
::: ::::::::::::::: :::..::..:. :::.::::::::::::::::::: .:
CCDS43 QYKSIPVEDNHKADISSWFNEAIDFIDSIKNAGGRVFVHCQAGISRSATICLAYLMRTNR
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 VRLEEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLATSCAAEAASPSGPLRERGKTPATP
:.:.:::::::::::::::::::::::::::::::: :.:::.::. . .:: . .:
CCDS43 VKLDEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLAPHCSAEAGSPAMAVLDRGTSTTT-
280 290 300 310 320 330
370 380 390
pF1KB6 TSQFVFSFPVSVGVHSAPSSLPYLHSPITTSPSC
::.::::. :::. :.: ::.:::::::::
CCDS43 ----VFNFPVSIPVHSTNSALSYLQSPITTSPSC
340 350 360
>>CCDS7566.1 DUSP5 gene_id:1847|Hs108|chr10 (384 aa)
initn: 952 init1: 635 opt: 963 Z-score: 994.2 bits: 192.7 E(32554): 4.7e-49
Smith-Waterman score: 971; 46.7% identity (67.7% similar) in 381 aa overlap (41-394:19-384)
20 30 40 50 60 70
pF1KB6 DCSVLKRLMNRDENGGGAGGSGSHGTLGLPSGGKCLLLDCRPFLAHSAGYILGSVNVRCN
....:..:::::.:: .:. . ::.:: :
CCDS75 MKVTSLDGRQLRKMLRKEAAARCVVLDCRPYLAFAASNVRGSLNVNLN
10 20 30 40
80 90 100 110 120
pF1KB6 TIVRRRAKG-SVSLEQILPAEEEVRARLRS---GLYSAVIVYDERSPRAESLREDSTVSL
..: :::.: .:: . .:: .: .:::: . : .::.: :. : . ..:::.:.. .
CCDS75 SVVLRRARGGAVSARYVLP-DEAARARLLQEGGGGVAAVVVLDQGSRHWQKLREESAARV
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 VVQALRRNAERTD-ICLLKGGYERFSSEYPEFCSKTKALAAIPPPVPPSATEPLDLGCSS
:. .: . .:::::: : ::::: : .: :. : :.
CCDS75 VLTSLLACLPAGPRVYFLKGGYETFYSEYPECCVDVK-------PISQEKIESERALISQ
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KB6 CGTPL--------HDQGGPVEILPFLYLGSAYHAARRDMLDALGITALLNVSSDCPNHFE
:: :. .::::::::::::::::::::.. ..: : :::::::: .
CCDS75 CGKPVVNVSYRPAYDQGGPVEILPFLYLGSAYHASKCEFLANLHITALLNVSRRTSEACA
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 GHYQYKCIPVEDNHKADISSWFMEAIEYIDAVKDCRGRVLVHCQAGISRSATICLAYLMM
: .:: :::::.: ::::: :.:::..:: :.. :.:::::.:::::: :::.::::
CCDS75 THLHYKWIPVEDSHTADISSHFQEAIDFIDCVREKGGKVLVHCEAGISRSPTICMAYLMK
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340
pF1KB6 KKRVRLEEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLAT-------SCAAEAASPS--G
:. ::.:::...:::::..::::.:::::::.::..: . :: .:::. : :
CCDS75 TKQFRLKEAFDYIKQRRSMVSPNFGFMGQLLQYESEILPSTPNPQPPSCQGEAAGSSLIG
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390
pF1KB6 PLRERGKTPATPTSQFVF-SFPVSV----GVHSAPSSLPYLHSPITTSPSC
:. .: : .. .::.:: .::. : : .::..:. ::
CCDS75 HLQT-----LSPDMQGAYCTFPASVLAPVPTHSTVSELS--RSPVATATSC
350 360 370 380
>>CCDS2016.1 DUSP2 gene_id:1844|Hs108|chr2 (314 aa)
initn: 866 init1: 729 opt: 947 Z-score: 979.1 bits: 189.7 E(32554): 3.2e-48
Smith-Waterman score: 950; 48.2% identity (71.4% similar) in 336 aa overlap (4-335:3-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MVTMEELREMDCSVLKRLMNRDENGGGAGGSGSHGTLGLPSGGKCLLLDCRPFLAHSAGY
.: ::..:..: :. :: . . :::::::::: .
CCDS20 MGLEAARELECAALGTLL-RDPR----------------EAERTLLLDCRPFLAFCRRH
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB6 ILGSVNVRCNTIVRRRAKG--SVSLEQILPAEEEVRARLRSGLYSAVIVYDERSPRAESL
. .. : :...::::.: .. : .:: .. .:.:: : . ..: :: : . :
CCDS20 VRAARPVPWNALLRRRARGPPAAVLACLLP-DRALRTRLVRGELARAVVLDEGSASVAEL
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 REDSTVSLVVQAL--RRNAERTDICLLKGGYERFSSEYPEFCSKTKALAAIPPPVPPSAT
: :: . ... :: . : : . .:.::.. :.. :..::.. : : .::..
CCDS20 RPDSPAHVLLAALLHETRAGPTAVYFLRGGFDGFQGCCPDLCSEAPA-----PALPPTGD
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 EPLDLGCSSCGTPLHDQGGPVEILPFLYLGSAYHAARRDMLDALGITALLNVSSDCPNHF
. . :. .:..::::::::::.:.::: :.. . :.: ::::.::::..:::::
CCDS20 KT---SRSDSRAPVYDQGGPVEILPYLFLGSCSHSSDLQGLQACGITAVLNVSASCPNHF
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 EGHYQYKCIPVEDNHKADISSWFMEAIEYIDAVKDCRGRVLVHCQAGISRSATICLAYLM
:: ..:: ::::::. ..::.::.::: .:: ::. :::::::::::::::::::::::
CCDS20 EGLFRYKSIPVEDNQMVEISAWFQEAIGFIDWVKNSGGRVLVHCQAGISRSATICLAYLM
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 MKKRVRLEEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLATSCAAEAASPSGPLRERGKT
...::::.:::.::::::..:::::::::::::::.:::
CCDS20 QSRRVRLDEAFDFVKQRRGVISPNFSFMGQLLQFETQVLCH
280 290 300 310
360 370 380 390
pF1KB6 PATPTSQFVFSFPVSVGVHSAPSSLPYLHSPITTSPSC
>>CCDS1528.1 DUSP10 gene_id:11221|Hs108|chr1 (482 aa)
initn: 544 init1: 338 opt: 582 Z-score: 601.1 bits: 120.3 E(32554): 3.7e-27
Smith-Waterman score: 582; 34.0% identity (66.3% similar) in 297 aa overlap (39-331:167-459)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 EMDCSVLKRLMNRDENGGGAGGSGSHGTLGLPSGGKCLLLDCRPFLAHSAGYILGSVNVR
::: : ...:::::. .. ..: :.:..
CCDS15 VSGTPKQLASIKIIYPNDLAKKMTKCSKSHLPSQGP-VIIDCRPFMEYNKSHIQGAVHIN
140 150 160 170 180 190
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 C-NTIVRRR-AKGSVSLEQILPAEEEVRARLRSGLYSAVIVYDERSPRAESLREDSTVSL
: . : ::: .:.... ... .: . .. . . .::::: . . . .. . .
CCDS15 CADKISRRRLQQGKITVLDLISCREG-KDSFKRIFSKEIIVYDENTNEPSRVMPSQPLHI
200 210 220 230 240 250
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 VVQALRRNAERTDICLLKGGYERFSSEYPEFCSKTKALAAIPPPVPPSATEPLDLGCSSC
:...:.: : . .:::: :.... ..:... : ... :
CCDS15 VLESLKR--EGKEPLVLKGGLSSFKQNHENLCDNSLQLQECREVGGGASAASSLLPQPIP
260 270 280 290 300 310
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 GTPLHDQGGPVEILPFLYLGSAYHAARRDMLDALGITALLNVSSDCP-NHFE-GHYQYKC
:: ... . :::::.::. : : .. :.: ..::.. : :.: : ..::
CCDS15 TTPDIENAELTPILPFLFLGNEQDAQDLDTMQRLNIGYVINVTTHLPLYHYEKGLFNYKR
320 330 340 350 360 370
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 IPVEDNHKADISSWFMEAIEYIDAVKDCRGRVLVHCQAGISRSATICLAYLMMKKRVRLE
.:. :..: .. ..: ::.:.:. ...: .:.:::::.:::::: .:::: . :. .
CCDS15 LPATDSNKQNLRQYFEEAFEFIEEAHQCGKGLLIHCQAGVSRSATIVIAYLMKHTRMTMT
380 390 400 410 420 430
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 EAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLATSCAAEAASPSGPLRERGKTPATPTSQF
.:..::: .: :::::..::::::.::
CCDS15 DAYKFVKGKRPIISPNLNFMGQLLEFEEDLNNGVTPRILTPKLMGVETVV
440 450 460 470 480
>>CCDS33766.2 DUSP7 gene_id:1849|Hs108|chr3 (419 aa)
initn: 553 init1: 333 opt: 477 Z-score: 494.1 bits: 100.3 E(32554): 3.4e-21
Smith-Waterman score: 624; 34.4% identity (62.8% similar) in 366 aa overlap (24-345:37-397)
10 20 30 40
pF1KB6 MVTMEELREMDCSVLKRLMNRDENGGGAGGSGSHGTLGLP-------------
.:.:.:.... :. ..:
CCDS33 GPPARAHMSTSGAAAAGGTRAGSEPGAGSGSGAGTGAGAATGAGAMPCKSAEWLQEELEA
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KB6 -SGGKCLLLDCRPFLAHSAGYILGSVNVRC-NTIVRRRAKGSVSLEQILPAEEEVRARLR
.:.. ::::::: ...: ..:. . ..:: ::.. ...:.: . . . :.
CCDS33 RGGASLLLLDCRPHELFESSHIETAINLAIPGLMLRRLRKGNLPIRSIIPNHAD-KERFA
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 SGLYSA-VIVYDERSP--RAESLREDSTVSLVVQALRRNAERTDICLLKGGYERFSSEYP
. .: :..::: . . : :...:..: :: .. .. :.::...:..::
CCDS33 TRCKAATVLLYDEATAEWQPEPGAPASVLGLLLQKLRDDGCQAYY--LQGGFNKFQTEYS
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190
pF1KB6 EFCSKTKALAAIPPPVPPSATEPLDLG-------CS--------------SCGTPLHDQG
: : . .. : ::... : :: :: : :.:. ..
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370 380 390
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]