Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6553
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6553, 371 aa
1>>>pF1KB6553 371 - 371 aa - 371 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2379+/-0.000652; mu= 17.9477+/- 0.039
mean_var=131.1997+/-43.660, 0's: 0 Z-trim(112.0): 166 B-trim: 1447 in 2/48
Lambda= 0.111972
statistics sampled from 12502 (12814) to 12502 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.73), E-opt: 0.2 (0.394), width: 16
Scan time: 2.480
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14735.1 AVPR2 gene_id:554|Hs108|chrX ( 371) 2516 417.8 7.7e-117
CCDS55539.1 AVPR2 gene_id:554|Hs108|chrX ( 309) 2076 346.6 1.7e-95
CCDS2570.1 OXTR gene_id:5021|Hs108|chr3 ( 389) 915 159.2 5.7e-39
CCDS8965.1 AVPR1A gene_id:552|Hs108|chr12 ( 418) 784 138.1 1.4e-32
CCDS73015.1 AVPR1B gene_id:553|Hs108|chr1 ( 424) 668 119.3 6.1e-27
CCDS75579.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 ( 390) 511 93.9 2.5e-19
CCDS5443.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 ( 377) 507 93.3 3.9e-19
CCDS5444.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 ( 371) 505 92.9 4.8e-19
CCDS75580.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 ( 366) 443 82.9 4.9e-16
CCDS3517.1 GNRHR gene_id:2798|Hs108|chr4 ( 328) 376 72.0 8.3e-13
>>CCDS14735.1 AVPR2 gene_id:554|Hs108|chrX (371 aa)
initn: 2516 init1: 2516 opt: 2516 Z-score: 2211.1 bits: 417.8 E(32554): 7.7e-117
Smith-Waterman score: 2516; 100.0% identity (100.0% similar) in 371 aa overlap (1-371:1-371)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MLMASTTSAVPGHPSLPSLPSNSSQERPLDTRDPLLARAELALLSIVFVAVALSNGLVLA
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CCDS14 MLMASTTSAVPGHPSLPSLPSNSSQERPLDTRDPLLARAELALLSIVFVAVALSNGLVLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 ALARRGRRGHWAPIHVFIGHLCLADLAVALFQVLPQLAWKATDRFRGPDALCRAVKYLQM
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CCDS14 ALARRGRRGHWAPIHVFIGHLCLADLAVALFQVLPQLAWKATDRFRGPDALCRAVKYLQM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 VGMYASSYMILAMTLDRHRAICRPMLAYRHGSGAHWNRPVLVAWAFSLLLSLPQLFIFAQ
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CCDS14 VGMYASSYMILAMTLDRHRAICRPMLAYRHGSGAHWNRPVLVAWAFSLLLSLPQLFIFAQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 RNVEGGSGVTDCWACFAEPWGRRTYVTWIALMVFVAPTLGIAACQVLIFREIHASLVPGP
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CCDS14 RNVEGGSGVTDCWACFAEPWGRRTYVTWIALMVFVAPTLGIAACQVLIFREIHASLVPGP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 SERPGGRRRGRRTGSPGEGAHVSAAVAKTVRMTLVIVVVYVLCWAPFFLVQLWAAWDPEA
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CCDS14 SERPGGRRRGRRTGSPGEGAHVSAAVAKTVRMTLVIVVVYVLCWAPFFLVQLWAAWDPEA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 PLEGAPFVLLMLLASLNSCTNPWIYASFSSSVSSELRSLLCCARGRTPPSLGPQDESCTT
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CCDS14 PLEGAPFVLLMLLASLNSCTNPWIYASFSSSVSSELRSLLCCARGRTPPSLGPQDESCTT
310 320 330 340 350 360
370
pF1KB6 ASSSLAKDTSS
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CCDS14 ASSSLAKDTSS
370
>>CCDS55539.1 AVPR2 gene_id:554|Hs108|chrX (309 aa)
initn: 2076 init1: 2076 opt: 2076 Z-score: 1827.8 bits: 346.6 E(32554): 1.7e-95
Smith-Waterman score: 2076; 100.0% identity (100.0% similar) in 304 aa overlap (1-304:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MLMASTTSAVPGHPSLPSLPSNSSQERPLDTRDPLLARAELALLSIVFVAVALSNGLVLA
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CCDS55 MLMASTTSAVPGHPSLPSLPSNSSQERPLDTRDPLLARAELALLSIVFVAVALSNGLVLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 ALARRGRRGHWAPIHVFIGHLCLADLAVALFQVLPQLAWKATDRFRGPDALCRAVKYLQM
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CCDS55 ALARRGRRGHWAPIHVFIGHLCLADLAVALFQVLPQLAWKATDRFRGPDALCRAVKYLQM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 VGMYASSYMILAMTLDRHRAICRPMLAYRHGSGAHWNRPVLVAWAFSLLLSLPQLFIFAQ
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CCDS55 VGMYASSYMILAMTLDRHRAICRPMLAYRHGSGAHWNRPVLVAWAFSLLLSLPQLFIFAQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 RNVEGGSGVTDCWACFAEPWGRRTYVTWIALMVFVAPTLGIAACQVLIFREIHASLVPGP
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CCDS55 RNVEGGSGVTDCWACFAEPWGRRTYVTWIALMVFVAPTLGIAACQVLIFREIHASLVPGP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 SERPGGRRRGRRTGSPGEGAHVSAAVAKTVRMTLVIVVVYVLCWAPFFLVQLWAAWDPEA
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CCDS55 SERPGGRRRGRRTGSPGEGAHVSAAVAKTVRMTLVIVVVYVLCWAPFFLVQLWAAWDPEA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 PLEGAPFVLLMLLASLNSCTNPWIYASFSSSVSSELRSLLCCARGRTPPSLGPQDESCTT
::::
CCDS55 PLEGGCSRG
>>CCDS2570.1 OXTR gene_id:5021|Hs108|chr3 (389 aa)
initn: 807 init1: 331 opt: 915 Z-score: 813.2 bits: 159.2 E(32554): 5.7e-39
Smith-Waterman score: 923; 42.3% identity (67.0% similar) in 388 aa overlap (4-371:13-379)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MLMASTTSAVPGHPSLPSLPSNSSQERPLDTRDPLLARAELALLSIVFVAV
:...::.: :. .: . : :. :::.:.:.: .... .
CCDS25 MEGALAANWSAEAANASAAP-----PGAEGNRTAGPP--RRNEALARVEVAVLCLILLLA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 ALSNGLVLAALARRGRRGHWAPIHVFIGHLCLADLAVALFQVLPQLAWKATDRFRGPDAL
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CCDS25 LSGNACVLLAL-RTTRQKH-SRLFFFMKHLSIADLVVAVFQVLPQLLWDITFRFYGPDLL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 CRAVKYLQMVGMYASSYMILAMTLDRHRAICRPMLAYRHGSGAHWNR-PVLVAWAFSLLL
:: :::::.:::.::.:..: :.::: :::.:. . :. . .: ::..: :.
CCDS25 CRLVKYLQVVGMFASTYLLLLMSLDRCLAICQPLRSLRRRT----DRLAVLATWLGCLVA
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 SLPQLFIFAQRNVEGGSGVTDCWACFAEPWGRRTYVTWIALMVFVAPTLGIAACQVLIFR
: ::. ::. :.: ..:: :::: : .::: ..:.:::.: :...:.. .::: ::
CCDS25 SAPQVHIFSLREV--ADGVFDCWAVFIQPWGPKAYITWITLAVYIVPVIVLAACYGLISF
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270
pF1KB6 EIHASL-----VPGPSERP-------GGRRRGRRTGSPGEGAHVSAAVAKTVRMTLVIVV
.: .: . . .: : ::: :..: .: : .::.::..::.
CCDS25 KIWQNLRLKTAAAAAAEAPEGAAAGDGGRVALARVSSV---KLISKAKIRTVKMTFIIVL
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 VYVLCWAPFFLVQLWAAWDPEAPLEGAPFVLLMLLASLNSCTNPWIYASFSSSVSSEL-R
....::.:::.::.:..:: .:: :.. :...::::::::: ::::: :.. . :: .
CCDS25 AFIVCWTPFFFVQMWSVWDANAPKEASAFIIVMLLASLNSCCNPWIYMLFTGHLFHELVQ
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370
pF1KB6 SLLCCA----RGRTPPSLGPQDESCTTASSS--LAKDTSS
.:::. .:: :: . : . ::: :.. .::
CCDS25 RFLCCSASYLKGRR---LGETSASKKSNSSSFVLSHRSSSQRSCSQPSTA
350 360 370 380
>>CCDS8965.1 AVPR1A gene_id:552|Hs108|chr12 (418 aa)
initn: 820 init1: 336 opt: 784 Z-score: 698.5 bits: 138.1 E(32554): 1.4e-32
Smith-Waterman score: 882; 42.2% identity (72.6% similar) in 329 aa overlap (28-342:42-366)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MLMASTTSAVPGHPSLPSLPSNSSQERPLDTRDPLLARAELALLSIVFVAVALSNGL
: :.:. ::. :.:.:...:....:.:.
CCDS89 SGNSSPWWPLATGAGNTSREAEALGEGNGPPRDVRNEELAKLEIAVLAVTFAVAVLGNSS
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 VLAALARRGRRGHWAPIHVFIGHLCLADLAVALFQVLPQLAWKATDRFRGPDALCRAVKY
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CCDS89 VLLALHRTPRKT--SRMHLFIRHLSLADLAVAFFQVLPQMCWDITYRFRGPDWLCRVVKH
80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 LQMVGMYASSYMILAMTLDRHRAICRPMLAYRHGSGAHWNRPVLVA-WAFSLLLSLPQLF
::. ::.::.::...:: ::. :.:.:. . .. :. .: ...: :..:..:: :: :
CCDS89 LQVFGMFASAYMLVVMTADRYIAVCHPLKTLQQP--ARRSRLMIAAAWVLSFVLSTPQYF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 IFAQRNVEGGSGVTDCWACFAEPWGRRTYVTWIALMVFVAPTLGIAACQVLIFREIHASL
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CCDS89 VFSMIEVNNVTKARDCWATFIQPWGSRAYVTWMTGGIFVAPVVILGTCYGFICYNIWCNV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280
pF1KB6 VPGPSERP--GGRRRGR--RTG---SPGEGA--HVSAAVAKTVRMTLVIVVVYVLCWAPF
. : :... : . : .: .. .: : .::.::.:::..:..:::::
CCDS89 RGKTASRQSKGAEQAGVAFQKGFLLAPCVSSVKSISRAKIRTVKMTFVIVTAYIVCWAPF
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 FLVQLWAAWDPEA---PLEGAPFVLLMLLASLNSCTNPWIYASFSSSVSSE-LRSLLCCA
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CCDS89 FIIQMWSVWDPMSVWTESENPTITITALLGSLNSCCNPWIYMFFSGHLLQDCVQSFPCCQ
310 320 330 340 350 360
350 360 370
pF1KB6 RGRTPPSLGPQDESCTTASSSLAKDTSS
CCDS89 NMKEKFNKEDTDSMSRRQTFYSNNRSPTNSTGMWKDSPKSSKSIKFIPVST
370 380 390 400 410
>>CCDS73015.1 AVPR1B gene_id:553|Hs108|chr1 (424 aa)
initn: 931 init1: 352 opt: 668 Z-score: 597.1 bits: 119.3 E(32554): 6.1e-27
Smith-Waterman score: 933; 44.4% identity (67.9% similar) in 358 aa overlap (13-348:10-361)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MLMASTTSAVPGHPSLPSLPSNSSQERPLDTRDPLLARAELALLSIVFVAVALSNGLVLA
.:. . : . : :: ::..:...:. :.: .. .: ::
CCDS73 MDSGPLWDANPTPRGTLSAPNATTPWLGRDEELAKVEIGVLATVLVLATGGNLAVLL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 ALARRGRRGHWAPIHVFIGHLCLADLAVALFQVLPQLAWKATDRFRGPDALCRAVKYLQM
.:.. ::. . .:.:. :: :.::::::::::::: : : ::.::: :::::::::.
CCDS73 TLGQLGRKR--SRMHLFVLHLALTDLAVALFQVLPQLLWDITYRFQGPDLLCRAVKYLQV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB6 VGMYASSYMILAMTLDRHRAICRPMLAYRHGSGAHWNRPVLVA--WAFSLLLSLPQLFIF
..:.::.::.:::::::. :.:.:. . .. . . . .:.: : .. ..::::.:::
CCDS73 LSMFASTYMLLAMTLDRYLAVCHPLRSLQQPGQSTY---LLIAAPWLLAAIFSLPQVFIF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 AQRNVEGGSGVTDCWACFAEPWGRRTYVTWIALMVFVAPTLGIAACQVLIFREIHASL-V
. :.: :::: :::: :. ::: :.:.:: .: .:: :. ..:: :: .:: .: :
CCDS73 SLREVIQGSGVLDCWADFGFPWGPRAYLTWTTLAIFVLPVTMLTACYSLICHEICKNLKV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB6 PGPSERPGG---RRRGRRT---------GSPGEGAHV---SAAVAKTVRMTLVIVVVYVL
. : :: : : . : :.. . . : : .::.::.:::..:.
CCDS73 KTQAWRVGGGGWRTWDRPSPSTLAATTRGLPSRVSSINTISRAKIRTVKMTFVIVLAYIA
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KB6 CWAPFFLVQLWAAWDPEAPLEGAP---FVLLMLLASLNSCTNPWIYASFSSSV-SSELRS
:::::: ::.:..:: .:: : . :.. :::..:::: ::::: .:.: . ::
CCDS73 CWAPFFSVQMWSVWDKNAPDEDSTNVAFTISMLLGNLNSCCNPWIYMGFNSHLLPRPLRH
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370
pF1KB6 LLCCARGRTPPSLGPQDESCTTASSSLAKDTSS
: ::. : :
CCDS73 LACCG-GPQPRMRRRLSDGSLSSRHTTLLTRSSCPATLSLSLSLTLSGRPRPEESPRDLE
360 370 380 390 400 410
>>CCDS75579.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 (390 aa)
initn: 341 init1: 189 opt: 511 Z-score: 460.4 bits: 93.9 E(32554): 2.5e-19
Smith-Waterman score: 511; 28.7% identity (61.7% similar) in 345 aa overlap (40-369:52-380)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 VPGHPSLPSLPSNSSQERPLDTRDPLLARAELALLSIVFVAVALSNGLVLAALARRGRRG
.: : ..:: . ..:..:: . :: ...
CCDS75 SPVACTETVTFTEVVEGKEWGSFYYSFKTEQLITLWVLFVFTIVGNSVVLFSTWRRKKKS
30 40 50 60 70 80
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 HWAPIHVFIGHLCLADLAVALFQVLPQLAWKATDRFRGPDALCRAVKYLQMVGMYASSYM
. . :. .: ..: ..: ..: .. :. : : .:: .::.:.:::.: .:::.:.
CCDS75 R---MTFFVTQLAITDSFTGLVNILTDINWRFTGDFTAPDLVCRVVRYLQVVLLYASTYV
90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 ILAMTLDRHRAICRPMLAYRHGSGAHWNRP-VLVAWAFSLLLSLPQLFIFAQRNVEGGSG
......::..:: :: . .: . : ...::..:.:.:.: :.::..:.. ..:
CCDS75 LVSLSIDRYHAIVYPM---KFLQGEKQARVLIVIAWSLSFLFSIPTLIIFGKRTL--SNG
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 VTDCWACFAEPWGRRTYVTWIALMVFVAPTLGIAACQVLIFREI------HASLVPGPSE
..::: . . :.: .:..:. : :. ...: : . ... . :.
CCDS75 EVQCWALWPDDSYWTPYMTIVAFLVYFIPLTIISIMYGIVIRTIWIKSKTYETVISNCSD
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 RPGGRRRGRRTGSPGEGAHVSAAVAKTVRMTLVIVVVYVLCWAPFFLVQLWAAWD--PEA
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CCDS75 -------GKLCSSYNRGL-ISKAKIKAIKYSIIIILAFICCWSPYFLFDILDNFNLLPDT
260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB6 PLEGAPFVLLMLLASLNSCTNPWIYASFSSSVSSELRS-----LLCCARGRTPP-SLGPQ
. :... : .::: :: :: ::::.: :. :: : . : .
CCDS75 QERFYASVIIQNLPALNSAINPLIYCVFSSSISFPCRANSSVYLLACDVSVLWALVLTSE
310 320 330 340 350 360
360 370
pF1KB6 DESCTTASSSLAKDTSS
::: . . :: :
CCDS75 KESCESWRRKGAKITGFQNDVPGEN
370 380 390
>>CCDS5443.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 (377 aa)
initn: 352 init1: 189 opt: 507 Z-score: 457.1 bits: 93.3 E(32554): 3.9e-19
Smith-Waterman score: 507; 28.4% identity (63.0% similar) in 327 aa overlap (40-357:52-362)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 VPGHPSLPSLPSNSSQERPLDTRDPLLARAELALLSIVFVAVALSNGLVLAALARRGRRG
.: : ..:: . ..:..:: . :: ...
CCDS54 SPVACTETVTFTEVVEGKEWGSFYYSFKTEQLITLWVLFVFTIVGNSVVLFSTWRRKKKS
30 40 50 60 70 80
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 HWAPIHVFIGHLCLADLAVALFQVLPQLAWKATDRFRGPDALCRAVKYLQMVGMYASSYM
. . :. .: ..: ..: ..: .. :. : : .:: .::.:.:::.: .:::.:.
CCDS54 R---MTFFVTQLAITDSFTGLVNILTDINWRFTGDFTAPDLVCRVVRYLQVVLLYASTYV
90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 ILAMTLDRHRAICRPMLAYRHGSGAHWNRP-VLVAWAFSLLLSLPQLFIFAQRNVEGGSG
......::..:: :: . .: . : ...::..:.:.:.: :.::..:.. ..:
CCDS54 LVSLSIDRYHAIVYPM---KFLQGEKQARVLIVIAWSLSFLFSIPTLIIFGKRTL--SNG
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 VTDCWACFAEPWGRRTYVTWIALMVFVAPTLGIAACQVLIFREI------HASLVPGPSE
..::: . . :.: .:..:. : :. ...: : . ... . :.
CCDS54 EVQCWALWPDDSYWTPYMTIVAFLVYFIPLTIISIMYGIVIRTIWIKSKTYETVISNCSD
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 RPGGRRRGRRTGSPGEGAHVSAAVAKTVRMTLVIVVVYVLCWAPFFLVQLWAAWD--PEA
:. .: ..: .: : :.......:..... ::.:.:: .. .. :..
CCDS54 -------GKLCSSYNRGL-ISKAKIKAIKYSIIIILAFICCWSPYFLFDILDNFNLLPDT
260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 PLEGAPFVLLMLLASLNSCTNPWIYASFSSSVSSELRSLLCCARGRTPPSLGPQDESCTT
. :... : .::: :: :: ::::.: : . .. : :: :.
CCDS54 QERFYASVIIQNLPALNSAINPLIYCVFSSSISFPCRVIRLRQLQEAALMLCPQRENWKG
310 320 330 340 350 360
370
pF1KB6 ASSSLAKDTSS
CCDS54 TWPGVPSWALPR
370
>>CCDS5444.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 (371 aa)
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10 20 30 40 50 60
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.: : ..:: . ..:..:: . :: ...
CCDS54 SPVACTETVTFTEVVEGKEWGSFYYSFKTEQLITLWVLFVFTIVGNSVVLFSTWRRKKKS
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CCDS54 QERFYASVIIQNLPALNSAINPLIYCVFSSSISFPCREQRSQDSRMTFRERTERHEMQIL
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370
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CCDS54 SKPEFI
370
>>CCDS75580.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 (366 aa)
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10 20 30 40 50 60
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CCDS75 SPVACTETVTFTEVVEGKEWGSFYYSFKTEQLITLWVLFVFTIVGNSVVLFSTWRRKKKS
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CCDS75 R---MTFFVTQLAITDIN-----------WRFTGDFTAPDLVCRVVRYLQVVLLYASTYV
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CCDS75 LVSLSIDRYHAIVYPM---KFLQGEKQARVLIVIAWSLSFLFSIPTLIIFGKRTL--SNG
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CCDS75 EVQCWALWPDDSYWTPYMTIVAFLVYFIPLTIISIMYGIVIRTIWIKSKTYETVISNCSD
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CCDS75 -------GKLCSSYNRGL-ISKAKIKAIKYSIIIILAFICCWSPYFLFDILDNFNLLPDT
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CCDS75 QERFYASVIIQNLPALNSAINPLIYCVFSSSISFPCRVIRLRQLQEAALMLCPQRENWKG
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370
pF1KB6 ASSSLAKDTSS
CCDS75 TWPGVPSWALPR
360
>>CCDS3517.1 GNRHR gene_id:2798|Hs108|chr4 (328 aa)
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20 30 40 50 60 70
pF1KB6 PGHPSLPSLPSNSSQERPLDTRDPLLARAELALLSIVFVAVALSNGLVLAALARRGRRGH
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CCDS35 SAINNSIPLMQGNLPTLTLSGKIRVTVTFFLFLLSATFNASFL---LKLQKWTQKKEKGK
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pF1KB6 -WAPIHVFIGHLCLADLAVALFQVLP-QLAWKATDRFRGPDALCRAVKYLQMVGMYASSY
. ..... :: ::.: .:. :.: . :. : .. . . ::....::.. .::: ..
CCDS35 KLSRMKLLLKHLTLANLLETLI-VMPLDGMWNITVQWYAGELLCKVLSYLKLFSMYAPAF
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:.....::: :: :: :: . .: . . : .:: .: ... :::.:: . .. .::
CCDS35 MMVVISLDRSLAITRP-LALKSNSKVGQSM-VGLAWILSSVFAGPQLYIFRMIHLADSSG
140 150 160 170 180
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pF1KB6 VTDCWA-C-----FAEPWGRRTYVTWIALMVFVAPTLGIAACQVLIFREIHASLVPGPSE
: .. : :.. : . : . .:. : . . :.. :. . : : :
CCDS35 QTKVFSQCVTHCSFSQWWHQAFYNFFTFSCLFIIPLFIMLICNAKIIFTLTRVLHQDPHE
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pF1KB6 RPGGRRRGRRTGSPGEGAHVSAAVAKTVRMTLVIVVVYVLCWAPFFLVQLWAAWDPEAPL
.. .. .. : ::..::..... ...::.:.... .: .:::
CCDS35 LQLNQSKN----------NIPRARLKTLKMTVAFATSFTVCWTPYYVLGIWYWFDPEMLN
250 260 270 280 290
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pF1KB6 EGAPFV--LLMLLASLNSCTNPWIYASFSSSVSSELRSLLCCARGRTPPSLGPQDESCTT
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CCDS35 RLSDPVNHFFFLFAFLNPCFDPLIYGYFSL
300 310 320
371 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 11:27:12 2016 done: Sat Nov 5 11:27:13 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]