Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6560
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6560, 342 aa
1>>>pF1KB6560 342 - 342 aa - 342 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2306+/-0.000819; mu= 7.5347+/- 0.049
mean_var=118.3180+/-23.630, 0's: 0 Z-trim(111.1): 81 B-trim: 2 in 1/50
Lambda= 0.117910
statistics sampled from 12010 (12096) to 12010 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.736), E-opt: 0.2 (0.372), width: 16
Scan time: 2.700
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42619.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 ( 342) 2369 413.6 1.2e-115
CCDS42620.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 ( 273) 1666 294.0 9.6e-80
CCDS12904.1 KIR2DL1 gene_id:3802|Hs108|chr19 ( 348) 911 165.6 5.4e-41
CCDS33107.1 KIR2DL3 gene_id:3804|Hs108|chr19 ( 341) 903 164.2 1.4e-40
CCDS12903.1 KIR3DL3 gene_id:115653|Hs108|chr19 ( 410) 877 159.9 3.4e-39
CCDS58677.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 ( 438) 846 154.6 1.4e-37
CCDS12906.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 ( 455) 845 154.4 1.6e-37
CCDS42621.1 KIR3DL1 gene_id:3811|Hs108|chr19 ( 444) 830 151.9 9.4e-37
CCDS74453.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 454) 503 96.3 5.3e-20
CCDS12900.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 466) 503 96.3 5.4e-20
CCDS46179.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 483) 503 96.3 5.6e-20
CCDS12888.1 LILRA5 gene_id:353514|Hs108|chr19 ( 299) 494 94.6 1.1e-19
CCDS33105.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 ( 631) 496 95.1 1.6e-19
CCDS46175.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 ( 632) 496 95.1 1.6e-19
CCDS12901.1 LILRA1 gene_id:11024|Hs108|chr19 ( 489) 487 93.6 3.7e-19
CCDS42610.1 LILRA6 gene_id:79168|Hs108|chr19 ( 481) 486 93.4 4.1e-19
CCDS42618.1 LILRB4 gene_id:11006|Hs108|chr19 ( 447) 470 90.6 2.6e-18
CCDS12902.1 LILRB4 gene_id:11006|Hs108|chr19 ( 448) 470 90.6 2.6e-18
CCDS62792.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 510) 466 90.0 4.6e-18
CCDS42612.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 597) 466 90.0 5.3e-18
CCDS12886.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 598) 466 90.0 5.3e-18
CCDS12890.1 LILRA4 gene_id:23547|Hs108|chr19 ( 499) 464 89.6 5.7e-18
CCDS62803.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 634) 462 89.4 8.9e-18
CCDS62791.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 482) 460 89.0 8.9e-18
CCDS42617.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 650) 462 89.4 9.1e-18
CCDS42616.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 651) 462 89.4 9.1e-18
CCDS42615.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 651) 462 89.4 9.1e-18
CCDS42614.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 652) 462 89.4 9.1e-18
CCDS62802.1 LILRA1 gene_id:11024|Hs108|chr19 ( 289) 451 87.3 1.7e-17
CCDS12889.1 LILRA5 gene_id:353514|Hs108|chr19 ( 287) 444 86.1 3.8e-17
CCDS42611.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 491) 446 86.6 4.7e-17
CCDS12911.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 304) 428 83.4 2.6e-16
CCDS46182.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 287) 423 82.6 4.5e-16
CCDS46181.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 303) 421 82.2 6e-16
CCDS12885.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 590) 371 73.9 3.8e-13
CCDS46176.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 591) 371 73.9 3.8e-13
CCDS62789.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 271) 351 70.3 2.1e-12
CCDS74444.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 282) 349 70.0 2.7e-12
CCDS12876.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 286) 349 70.0 2.8e-12
CCDS12874.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 252) 336 67.7 1.1e-11
CCDS12875.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 263) 334 67.4 1.5e-11
CCDS42622.1 FCAR gene_id:2204|Hs108|chr19 ( 265) 334 67.4 1.5e-11
CCDS12873.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 267) 334 67.4 1.5e-11
>>CCDS42619.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 (342 aa)
initn: 2369 init1: 2369 opt: 2369 Z-score: 2189.9 bits: 413.6 E(32554): 1.2e-115
Smith-Waterman score: 2369; 99.4% identity (99.7% similar) in 342 aa overlap (1-342:1-342)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSMSPTVIILACLGFFLDQSVWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MSMSPTVIILACLGFFLDQSVWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 TLYKKDGVPVPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPLVIMVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TLYKKDGVPVPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPLVIMVT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 GLYEKPSLTARPGPTVRTGENVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSINGTFQA
:::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GLYEKPSLTARPGPTVRAGENVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSINGTFQA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 DFPLGPATHGETYRCFGSFHGSPYEWSDASDPLPVSVTGNPSSSWPSPTEPSFKTDAAVM
:::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DFPLGPATHGETYRCFGSFHGSPYEWSDPSDPLPVSVTGNPSSSWPSPTEPSFKTDAAVM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 NQEPAGHRTVNREDSDEQDPQEVTYAQLDHCIFTQRKITGPSQRSKRPSTDTSVCIELPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NQEPAGHRTVNREDSDEQDPQEVTYAQLDHCIFTQRKITGPSQRSKRPSTDTSVCIELPN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KB6 AEPRALSPAHEHHSQALMGSSRETTALSQTQLASSNVPAAGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AEPRALSPAHEHHSQALMGSSRETTALSQTQLASSNVPAAGI
310 320 330 340
>>CCDS42620.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 (273 aa)
initn: 1775 init1: 1666 opt: 1666 Z-score: 1545.1 bits: 294.0 E(32554): 9.6e-80
Smith-Waterman score: 1666; 98.3% identity (98.7% similar) in 238 aa overlap (1-238:1-238)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSMSPTVIILACLGFFLDQSVWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MSMSPTVIILACLGFFLDQSVWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 TLYKKDGVPVPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPLVIMVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TLYKKDGVPVPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPLVIMVT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 GLYEKPSLTARPGPTVRTGENVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSINGTFQA
:::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GLYEKPSLTARPGPTVRAGENVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSINGTFQA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 DFPLGPATHGETYRCFGSFHGSPYEWSDASDPLPVSVTGNPSSSWPSPTEPSFKTDAAVM
:::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::: :
CCDS42 DFPLGPATHGETYRCFGSFHGSPYEWSDPSDPLPVSVTGNPSSSWPSPTEPSFKTGIARH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 NQEPAGHRTVNREDSDEQDPQEVTYAQLDHCIFTQRKITGPSQRSKRPSTDTSVCIELPN
CCDS42 LHAVIRYSVAIILFTILPFFLLHRWCSKKKMLL
250 260 270
>>CCDS12904.1 KIR2DL1 gene_id:3802|Hs108|chr19 (348 aa)
initn: 1211 init1: 796 opt: 911 Z-score: 849.4 bits: 165.6 E(32554): 5.4e-41
Smith-Waterman score: 1171; 56.7% identity (69.3% similar) in 342 aa overlap (3-305:1-342)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSMSPTVIILACLGFFLDQSVWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIF
:: :. .::.:::: :..: : : . :: : :. .: . : :.: :. :
CCDS12 MSLLVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGRLVKSEETVILQCWSDVMFEHF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB6 TLYKK----DGVP-VPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPL
:... : . . : .. . .: :: .: :::::: : ::: . ::::.::
CCDS12 LLHREGMFNDTLRLIGEHHDGVSKANFSISRMTQDLAGTYRCYGSVTHSPYQVSAPSDPL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 VIMVTGLYEKPSLTARPGPTVRTGENVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSIN
:.. ::::::::.:. :::: .::::::::::.::.:.::::::::::: :::: :..:
CCDS12 DIVIIGLYEKPSLSAQLGPTVLAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPAGPKVN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 GTFQADFPLGPATHGETYRCFGSFHGSPYEWSDASDPLPVSVTGNPSSSWPSPTEPSFKT
::::::::::::::: ::::::::: :::::: .:::: ::::::::.::::::::: ::
CCDS12 GTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFHDSPYEWSKSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSSKT
180 190 200 210 220 230
240 250 260
pF1KB6 ----------------------------------DAAVMNQEPAGHRTVNREDSDEQDPQ
.::::.:: ::.::.: :::::::::
CCDS12 GNPRHLHILIGTSVVIILFILLFFLLHRWCSNKKNAAVMDQESAGNRTANSEDSDEQDPQ
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 EVTYAQLDHCIFTQRKITGPSQRSKRPSTDTSVCIELPNAEPRALSPAHEHHSQALMGSS
::::.::.::.::::::: :::: : : :: : :::::: :.
CCDS12 EVTYTQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDIIVYTELPNAESRSKVVSCP
300 310 320 330 340
330 340
pF1KB6 RETTALSQTQLASSNVPAAGI
>>CCDS33107.1 KIR2DL3 gene_id:3804|Hs108|chr19 (341 aa)
initn: 1367 init1: 771 opt: 903 Z-score: 842.2 bits: 164.2 E(32554): 1.4e-40
Smith-Waterman score: 1188; 56.6% identity (70.4% similar) in 341 aa overlap (3-303:1-341)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSMSPTVIILACLGFFLDQSVWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIF
:: :. ..:.:::: :..: : : . :: : :. .: . : :.: :. :
CCDS33 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFQHF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB6 TLYK----KDGVP-VPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPL
:.. :: . . : .. . .: :.:. :::::: : ::: . ::::.::
CCDS33 LLHREGKFKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 VIMVTGLYEKPSLTARPGPTVRTGENVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSIN
:..:::::::::.:.::::: .::.:::::::.::.:.::::::::::: :. : :..:
CCDS33 DIVITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSAGPKVN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 GTFQADFPLGPATHGETYRCFGSFHGSPYEWSDASDPLPVSVTGNPSSSWPSPTEPSFKT
::::::::::::::: ::::::::. ::::::..:::: ::::::::.::::::::: .:
CCDS33 GTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSSET
180 190 200 210 220 230
240 250 260
pF1KB6 -----------------------------------DAAVMNQEPAGHRTVNREDSDEQDP
.:.::.:::::.:::::::::::::
CCDS33 GNPRHLHVLIGTSVVIILFILLLFFLLHRWCCNKKNAVVMDQEPAGNRTVNREDSDEQDP
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 QEVTYAQLDHCIFTQRKITGPSQRSKRPSTDTSVCIELPNAEPRALSPAHEHHSQALMGS
::::::::.::.::::::: :::: : : :: : :::::::
CCDS33 QEVTYAQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDIIVYTELPNAEP
300 310 320 330 340
330 340
pF1KB6 SRETTALSQTQLASSNVPAAGI
>>CCDS12903.1 KIR3DL3 gene_id:115653|Hs108|chr19 (410 aa)
initn: 1174 init1: 751 opt: 877 Z-score: 817.1 bits: 159.9 E(32554): 3.4e-39
Smith-Waterman score: 981; 48.7% identity (58.3% similar) in 372 aa overlap (3-256:1-372)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSMSPTVIILACLGFFLDQSVWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIF
:: :. .::.:::: .. : ::::::::: ::::..:: .: ::::.:. : ::: :
CCDS12 MSLMVVSMACVGFFLLEGPWPHVGGQDKPFLSAWPGTVVSEGQHVTLQCRSRLGFNEF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 TLYKKDGVPVPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPLVIMVT
.: :.::.:::::::::: ::::..:::::::::::: . :::::: :::::::.:::::
CCDS12 SLSKEDGMPVPELYNRIFRNSFLMGPVTPAHAGTYRCCSSHPHSPTGWSAPSNPVVIMVT
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 G-----------------------------------------------------------
:
CCDS12 GVHRKPSLLAHPGPLVKSGETVILQCWSDVRFERFLLHREGITEDPLRLVGQLHDAGSQV
120 130 140 150 160 170
130 140
pF1KB6 -----------------------------------------LYEKPSLTARPGPTVRTGE
:: ::::.:.:::::..::
CCDS12 NYSMGPMTPALAGTYRCFGSVTHLPYELSAPSDPLDIVVVGLYGKPSLSAQPGPTVQAGE
180 190 200 210 220 230
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 NVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSINGTFQADFPLGPATHGETYRCFGSFH
::::::::.: :::::::::.:: :::: :: .::::::.:::::.::: .:::::::.
CCDS12 NVTLSCSSRSLFDIYHLSREAEAGELRLTAVLRVNGTFQANFPLGPVTHGGNYRCFGSFR
240 250 260 270 280 290
210 220 230 240
pF1KB6 GSPYEWSDASDPLPVSVTGNP--------SSSWPSPTEPSF----------KTDAAVMNQ
. :. ::: ::::::::::: .: : . : .:.::.:
CCDS12 ALPHAWSDPSDPLPVSVTGNSRNLHVLIGTSVVIIPFAILLFFLLHRWCANKKNAVVMDQ
300 310 320 330 340 350
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 EPAGHRTVNREDSDEQDPQEVTYAQLDHCIFTQRKITGPSQRSKRPSTDTSVCIELPNAE
::::.:::::::::
CCDS12 EPAGNRTVNREDSDEQDPQEVTYAQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDTSV
360 370 380 390 400 410
>>CCDS58677.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 (438 aa)
initn: 1197 init1: 730 opt: 846 Z-score: 788.1 bits: 154.6 E(32554): 1.4e-37
Smith-Waterman score: 953; 48.4% identity (57.8% similar) in 372 aa overlap (3-256:1-372)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSMSPTVIILACLGFFLDQSVWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIF
:: ::. .::.:::: :..: .::::::: :: ::.:::.::::.:.:::::::: :
CCDS58 MSLTVVSMACVGFFLLQGAWPLMGGQDKPFLSARPSTVVPRGGHVALQCHYRRGFNNF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 TLYKKDGVPVPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPLVIMVT
:::.: :: ...::: .::...:::::::::::::: .::: : :::::::::::::
CCDS58 MLYKEDRSHVPIFHGRIFQESFIMGPVTPAHAGTYRCRGSRPHSLTGWSAPSNPLVIMVT
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 G-----------------------------------------------------------
:
CCDS58 GNHRKPSLLAHPGPLLKSGETVILQCWSDVMFEHFFLHREGISEDPSRLVGQIHDGVSKA
120 130 140 150 160 170
130 140
pF1KB6 -----------------------------------------LYEKPSLTARPGPTVRTGE
:::::::.:.:::::..::
CCDS58 NFSIGPLMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSAPSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVQAGE
180 190 200 210 220 230
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 NVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSINGTFQADFPLGPATHGETYRCFGSFH
:::::::: ::.::::::::::::: :: :::..: :::::::::::::: ::::::::.
CCDS58 NVTLSCSSWSSYDIYHLSREGEAHERRLRAVPKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFR
240 250 260 270 280 290
210 220 230 240
pF1KB6 GSPYEWSDASDPLPVSVTG--NPSSSWPSPTEPSF----------------KTDAAVMNQ
. : ::..:::: ::::: . . : : .::::.:
CCDS58 ALPCVWSNSSDPLLVSVTGICRHLHVLIGTSVVIFLFILLLFFLLYRWCSNKKNAAVMDQ
300 310 320 330 340 350
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 EPAGHRTVNREDSDEQDPQEVTYAQLDHCIFTQRKITGPSQRSKRPSTDTSVCIELPNAE
:::: :::::.:::
CCDS58 EPAGDRTVNRQDSDEQDPQEVTYAQLDHCVFIQRKISRPSQRPKTPLTDTSVYTELPNAE
360 370 380 390 400 410
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10 20 30 40 50
pF1KB6 MSMSPTVIILACLGFFLDQSVWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRR
:.. :: : :. .. .: : :.:
CCDS12 HAGTYRCRGSRPHSLTGWSAPSNPLVIMVTGNHRKPSLLAHPGPLLKSGETVILQCWSDV
90 100 110 120 130 140
60 70 80 90 100
pF1KB6 GFNIFTLYKKDGV---P---VPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWS
:. : :.. .:. : : .... . .: :.:. :. :::::: : :::: . :
CCDS12 MFEHFFLHR-EGISEDPSRLVGQIHDGVSKANFSIGPLMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLS
150 160 170 180 190 200
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 APSNPLVIMVTGLYEKPSLTARPGPTVRTGENVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLP
:::.:: :..:::::::::.:.:::::..:::::::::: ::.::::::::::::: ::
CCDS12 APSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSWSSYDIYHLSREGEAHERRLR
210 220 230 240 250 260
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 AVPSINGTFQADFPLGPATHGETYRCFGSFHGSPYEWSDASDPLPVSVTGNPSSSWPSPT
:::..: :::::::::::::: ::::::::.. : ::..:::: :::::::::::::::
CCDS12 AVPKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRALPCVWSNSSDPLLVSVTGNPSSSWPSPT
270 280 290 300 310 320
230 240 250
pF1KB6 EPSFKT-----------------------------------DAAVMNQEPAGHRTVNRED
::: :. .::::.::::: :::::.:
CCDS12 EPSSKSGICRHLHVLIGTSVVIFLFILLLFFLLYRWCSNKKNAAVMDQEPAGDRTVNRQD
330 340 350 360 370 380
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 SDEQDPQEVTYAQLDHCIFTQRKITGPSQRSKRPSTDTSVCIELPNAEPRALSPAHEHHS
:::::::::::::::::.: ::::. :::: : : ::::: ::::::::.
CCDS12 SDEQDPQEVTYAQLDHCVFIQRKISRPSQRPKTPLTDTSVYTELPNAEPRSKVVSCPRAP
390 400 410 420 430 440
320 330 340
pF1KB6 QALMGSSRETTALSQTQLASSNVPAAGI
CCDS12 QSGLEGVF
450
>--
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10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSMSPTVIILACLGFFLDQSVWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIF
:: ::. .::.:::: :..: .::::::: :: ::.:::.::::.:.:::::::: :
CCDS12 MSLTVVSMACVGFFLLQGAWPLMGGQDKPFLSARPSTVVPRGGHVALQCHYRRGFNNF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 TLYKKDGVPVPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPLVIMVT
:::.: :: ...::: .::...:::::::::::::: .::: : :::::::::::::
CCDS12 MLYKEDRSHVPIFHGRIFQESFIMGPVTPAHAGTYRCRGSRPHSLTGWSAPSNPLVIMVT
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 GLYEKPSLTARPGPTVRTGENVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSINGTFQA
CCDS12 GNHRKPSLLAHPGPLLKSGETVILQCWSDVMFEHFFLHREGISEDPSRLVGQIHDGVSKA
120 130 140 150 160 170
>>CCDS42621.1 KIR3DL1 gene_id:3811|Hs108|chr19 (444 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KB6 MSMSPTVIILACLGFFLDQSVWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRR
:.. :: : :. .: .: .: :.:
CCDS42 HAGNYTCRGSHPHSPTGWSAPSNPVVIMVTGNHRKPSLLAHPGPLVKSGERVILQCWSDI
90 100 110 120 130 140
60 70 80 90 100
pF1KB6 GFNIFTLYKKDGV---P---VPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWS
:. : :.: .:. : : .... . .: :.:. : :::::: : :.: . :
CCDS42 MFEHFFLHK-EGISKDPSRLVGQIHDGVSKANFSIGPMMLALAGTYRCYGSVTHTPYQLS
150 160 170 180 190 200
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 APSNPLVIMVTGLYEKPSLTARPGPTVRTGENVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLP
:::.:: :.::: ::::::.:.::: :..::.:::::::.::.:.::::::: ::: :::
CCDS42 APSDPLDIVVTGPYEKPSLSAQPGPKVQAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGGAHERRLP
210 220 230 240 250 260
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 AVPSINGTFQADFPLGPATHGETYRCFGSFHGSPYEWSDASDPLPVSVTGNPSSSWPSPT
:: ..: :::::::::::::: ::::::::. ::::::: :::: :::::::::::::::
CCDS42 AVRKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRHSPYEWSDPSDPLLVSVTGNPSSSWPSPT
270 280 290 300 310 320
230 240 250
pF1KB6 EPSFKT-----------------------------------DAAVMNQEPAGHRTVNRED
::: :. .::::.:::::.::.: ::
CCDS42 EPSSKSGNPRHLHILIGTSVVIILFILLLFFLLHLWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTANSED
330 340 350 360 370 380
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 SDEQDPQEVTYAQLDHCIFTQRKITGPSQRSKRPSTDTSVCIELPNAEPRALSPAHEHHS
::::::.::::::::::.::::::: :::: : : ::: . :::::.::.
CCDS42 SDEQDPEEVTYAQLDHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDTILYTELPNAKPRSKVVSCP
390 400 410 420 430 440
320 330 340
pF1KB6 QALMGSSRETTALSQTQLASSNVPAAGI
>--
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10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSMSPTVIILACLGFFLDQSVWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIF
:: :. .::.:.:: : . :.::::::: :::::::::.:::::::::::. :: :
CCDS42 MSLMVVSMACVGLFLVQRAGPHMGGQDKPFLSAWPSAVVPRGGHVTLRCHYRHRFNNF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 TLYKKDGVPVPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPLVIMVT
:::.: . .: ...::: .:: .:::: ::::.: ::: :::::: :::::::.:::::
CCDS42 MLYKEDRIHIPIFHGRIFQESFNMSPVTTAHAGNYTCRGSHPHSPTGWSAPSNPVVIMVT
60 70 80 90 100 110
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pF1KB6 GLYEKPSLTARPGPTVRTGENVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSINGTFQA
CCDS42 GNHRKPSLLAHPGPLVKSGERVILQCWSDIMFEHFFLHKEGISKDPSRLVGQIHDGVSKA
120 130 140 150 160 170
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10 20 30 40 50
pF1KB6 MSMSPTVIILACLGFFLDQSVWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRR
:. .:: :: :: :: .::.:::.: .
CCDS74 TWEHAGRYHCQYYSHNHSSEYSDPLELVVTGAYSKPTLSALPSPVVTSGGNVTLQCVSQV
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60 70 80 90 100
pF1KB6 GFNIFTLYKKDGVPVPELYN-----RIF-WNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWS
.:. : : :. :. : : . : : ..::.:.. .::: .. .:: ::
CCDS74 AFDGFILCKEGEDEHPQRLNSHSHARGWSWAIFSVGPVSPSRRWSYRCYAYDSNSPYVWS
140 150 160 170 180 190
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 APSNPLVIMVTGLYEKPSLTARPGPTVRTGENVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLP
::. : ..: :. .::::...::: : ::..::.: :. ..: . : .::: :. :
CCDS74 LPSDLLELLVPGVSKKPSLSVQPGPMVAPGESLTLQCVSDVGYDRFVLYKEGERDFLQRP
200 210 220 230 240 250
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 AVPSINGTFQADFPLGPAT--HGETYRCFGSFHGSPYEWSDASDPLPVSVTGN----PS-
. : ::.: :::.. :: :::. : :. ::: :::: . .::. ::
CCDS74 GWQPQAGLSQANFTLGPVSPSHGGQYRCY-SAHNLSSEWSAPSDPLDILITGQFYDRPSL
260 270 280 290 300 310
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 SSWPSPTEPSFKTDAAVMNQEPAGHRTVNREDSDEQDPQEVTYAQLDHCIFTQRKITGPS
: : ::
CCDS74 SVQPVPTVAPGKNVTLLCQSRGQFHTFLLTKEGAGHPPLHLRSEHQAQQNQAEFRMGPVT
320 330 340 350 360 370
>>CCDS12900.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 (466 aa)
initn: 592 init1: 315 opt: 503 Z-score: 472.4 bits: 96.3 E(32554): 5.4e-20
Smith-Waterman score: 503; 41.0% identity (62.2% similar) in 217 aa overlap (26-229:118-333)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSMSPTVIILACLGFFLDQSVWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRR
:. .:: :: :: :: .::.:::.: .
CCDS12 TWEHAGRYHCQYYSHNHSSEYSDPLELVVTGAYSKPTLSALPSPVVTSGGNVTLQCVSQV
90 100 110 120 130 140
60 70 80 90 100
pF1KB6 GFNIFTLYKKDGVPVPELYN-----RIF-WNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWS
.:. : : :. :. : : . : : ..::.:.. .::: .. .:: ::
CCDS12 AFDGFILCKEGEDEHPQRLNSHSHARGWSWAIFSVGPVSPSRRWSYRCYAYDSNSPYVWS
150 160 170 180 190 200
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 APSNPLVIMVTGLYEKPSLTARPGPTVRTGENVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLP
::. : ..: :. .::::...::: : ::..::.: :. ..: . : .::: :. :
CCDS12 LPSDLLELLVPGVSKKPSLSVQPGPMVAPGESLTLQCVSDVGYDRFVLYKEGERDFLQRP
210 220 230 240 250 260
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 AVPSINGTFQADFPLGPAT--HGETYRCFGSFHGSPYEWSDASDPLPVSVTGN----PS-
. : ::.: :::.. :: :::. : :. ::: :::: . .::. ::
CCDS12 GWQPQAGLSQANFTLGPVSPSHGGQYRCY-SAHNLSSEWSAPSDPLDILITGQFYDRPSL
270 280 290 300 310 320
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 SSWPSPTEPSFKTDAAVMNQEPAGHRTVNREDSDEQDPQEVTYAQLDHCIFTQRKITGPS
: : ::
CCDS12 SVQPVPTVAPGKNVTLLCQSRGQFHTFLLTKEGAGHPPLHLRSEHQAQQNQAEFRMGPVT
330 340 350 360 370 380
342 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]