Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6566
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6566, 400 aa
1>>>pF1KB6566 400 - 400 aa - 400 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6238+/-0.00121; mu= 1.7832+/- 0.072
mean_var=194.6790+/-38.925, 0's: 0 Z-trim(108.3): 91 B-trim: 64 in 1/50
Lambda= 0.091921
statistics sampled from 10010 (10100) to 10010 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.651), E-opt: 0.2 (0.31), width: 16
Scan time: 2.630
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11399.1 KRT19 gene_id:3880|Hs108|chr17 ( 400) 2525 347.6 1.2e-95
CCDS11402.1 KRT17 gene_id:3872|Hs108|chr17 ( 432) 1635 229.6 4.4e-60
CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17 ( 472) 1578 222.0 8.9e-58
CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17 ( 473) 1565 220.3 2.9e-57
CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17 ( 456) 1554 218.8 7.9e-57
CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 458) 1516 213.8 2.6e-55
CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 420) 1515 213.6 2.7e-55
CCDS11378.1 KRT12 gene_id:3859|Hs108|chr17 ( 494) 1421 201.2 1.7e-51
CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17 ( 584) 1414 200.3 3.7e-51
CCDS11372.1 KRT24 gene_id:192666|Hs108|chr17 ( 525) 1322 188.1 1.6e-47
CCDS11395.1 KRT36 gene_id:8689|Hs108|chr17 ( 467) 1301 185.3 1e-46
CCDS11394.2 KRT35 gene_id:3886|Hs108|chr17 ( 455) 1242 177.5 2.2e-44
CCDS32654.1 KRT9 gene_id:3857|Hs108|chr17 ( 623) 1227 175.6 1.1e-43
CCDS11373.1 KRT25 gene_id:147183|Hs108|chr17 ( 450) 1218 174.3 2e-43
CCDS11376.1 KRT28 gene_id:162605|Hs108|chr17 ( 464) 1213 173.6 3.3e-43
CCDS11375.1 KRT27 gene_id:342574|Hs108|chr17 ( 459) 1209 173.1 4.7e-43
CCDS11393.1 KRT32 gene_id:3882|Hs108|chr17 ( 448) 1208 173.0 5e-43
CCDS11388.1 KRT33A gene_id:3883|Hs108|chr17 ( 404) 1174 168.4 1.1e-41
CCDS11391.1 KRT31 gene_id:3881|Hs108|chr17 ( 416) 1174 168.4 1.1e-41
CCDS11389.1 KRT33B gene_id:3884|Hs108|chr17 ( 404) 1173 168.3 1.2e-41
CCDS11379.1 KRT20 gene_id:54474|Hs108|chr17 ( 424) 1168 167.6 1.9e-41
CCDS11390.1 KRT34 gene_id:3885|Hs108|chr17 ( 436) 1157 166.2 5.4e-41
CCDS11374.1 KRT26 gene_id:353288|Hs108|chr17 ( 468) 1157 166.2 5.7e-41
CCDS31809.1 KRT18 gene_id:3875|Hs108|chr12 ( 430) 1108 159.7 4.8e-39
CCDS11380.1 KRT23 gene_id:25984|Hs108|chr17 ( 422) 1061 153.4 3.5e-37
CCDS42320.1 KRT40 gene_id:125115|Hs108|chr17 ( 431) 1054 152.5 6.9e-37
CCDS11382.1 KRT39 gene_id:390792|Hs108|chr17 ( 491) 1027 149.0 9.1e-36
CCDS11392.1 KRT38 gene_id:8687|Hs108|chr17 ( 456) 1022 148.3 1.4e-35
CCDS32653.1 KRT37 gene_id:8688|Hs108|chr17 ( 449) 998 145.1 1.2e-34
CCDS62182.1 KRT23 gene_id:25984|Hs108|chr17 ( 285) 700 105.4 6.7e-23
CCDS33383.1 DES gene_id:1674|Hs108|chr2 ( 470) 645 98.3 1.6e-20
CCDS6046.1 NEFM gene_id:4741|Hs108|chr8 ( 916) 647 98.8 2.2e-20
CCDS7120.1 VIM gene_id:7431|Hs108|chr10 ( 466) 637 97.2 3.2e-20
CCDS45708.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 431) 628 96.0 7e-20
CCDS11491.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 432) 628 96.0 7e-20
CCDS59296.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 438) 628 96.0 7.1e-20
CCDS75712.1 NEFL gene_id:4747|Hs108|chr8 ( 543) 625 95.7 1.1e-19
CCDS7545.1 INA gene_id:9118|Hs108|chr10 ( 499) 616 94.5 2.4e-19
CCDS8822.1 KRT7 gene_id:3855|Hs108|chr12 ( 469) 588 90.7 2.9e-18
CCDS33859.1 BFSP2 gene_id:8419|Hs108|chr3 ( 415) 577 89.2 7.3e-18
CCDS8841.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 483) 572 88.6 1.3e-17
CCDS58234.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 511) 572 88.6 1.4e-17
CCDS8838.1 KRT76 gene_id:51350|Hs108|chr12 ( 638) 571 88.6 1.8e-17
CCDS8825.1 KRT84 gene_id:3890|Hs108|chr12 ( 600) 566 87.9 2.7e-17
CCDS8827.1 KRT75 gene_id:9119|Hs108|chr12 ( 551) 564 87.6 3e-17
CCDS13858.1 NEFH gene_id:4744|Hs108|chr22 (1020) 560 87.3 7.1e-17
CCDS41786.1 KRT6A gene_id:3853|Hs108|chr12 ( 564) 550 85.8 1.1e-16
CCDS8823.1 KRT83 gene_id:3889|Hs108|chr12 ( 493) 546 85.2 1.5e-16
CCDS8829.1 KRT6C gene_id:286887|Hs108|chr12 ( 564) 547 85.4 1.5e-16
CCDS8824.1 KRT85 gene_id:3891|Hs108|chr12 ( 507) 546 85.2 1.5e-16
>>CCDS11399.1 KRT19 gene_id:3880|Hs108|chr17 (400 aa)
initn: 2525 init1: 2525 opt: 2525 Z-score: 1830.5 bits: 347.6 E(32554): 1.2e-95
Smith-Waterman score: 2525; 100.0% identity (100.0% similar) in 400 aa overlap (1-400:1-400)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MTSYSYRQSSATSSFGGLGGGSVRFGPGVAFRAPSIHGGSGGRGVSVSSARFVSSSSSGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MTSYSYRQSSATSSFGGLGGGSVRFGPGVAFRAPSIHGGSGGRGVSVSSARFVSSSSSGA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 YGGGYGGVLTASDGLLAGNEKLTMQNLNDRLASYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YGGGYGGVLTASDGLLAGNEKLTMQNLNDRLASYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 PGPSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PGPSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 ADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 PGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 RTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KB6 QEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHYNNLSASKVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHYNNLSASKVL
370 380 390 400
>>CCDS11402.1 KRT17 gene_id:3872|Hs108|chr17 (432 aa)
initn: 1675 init1: 1580 opt: 1635 Z-score: 1192.2 bits: 229.6 E(32554): 4.4e-60
Smith-Waterman score: 1635; 66.4% identity (87.6% similar) in 396 aa overlap (1-390:1-394)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MTSYSYRQSSATSSF---GGLGGGSVRFGPGVA--FRAPSIHGGS-GGRGVSVSSARFVS
::. : :: ...::. .:::::: : . .. . : : . :: :: : ..... . :
CCDS11 MTT-SIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSCRLGSAGGLGSTLGGSSYSS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 SSSSGAYGGGYGGVLTASDGLLAGNEKLTMQNLNDRLASYLDKVRALEAANGELEVKIRD
: :. :::::. . . ::::::.:: :::::::::::::::::::: :: ::::::::
CCDS11 CYSFGS-GGGYGSSFGGVDGLLAGGEKATMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 WYQKQGPGPSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQA
:::.:.:::.::::.:: ::..:..::: ::..:. :.::::::::::::::::::::::
CCDS11 WYQRQAPGPARDYSQYYRTIEELQNKILTATVDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 LRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVS
::.::::::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::...:::::::...
CCDS11 LRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEIN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 VEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRS
::.:.:::.::..::..::.::: :::.:::::: :: :.::::::::: ..: .: ..:
CCDS11 VEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 EVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRA
:...::::.:.:::::::::::::.:: .::::: :. .::..::.::...: ::...:
CCDS11 EISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRC
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KB6 DSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHYNNLSASKVL
. :.:::::. :.:.:.:::::::::: ::::.. :
CCDS11 EMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLTQYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDG
360 370 380 390 400 410
CCDS11 KVISSREQVHQTTR
420 430
>>CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17 (472 aa)
initn: 1685 init1: 1522 opt: 1578 Z-score: 1150.8 bits: 222.0 E(32554): 8.9e-58
Smith-Waterman score: 1584; 61.3% identity (81.2% similar) in 432 aa overlap (7-398:6-430)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MTSYSYRQSSATSSF-------GGLGGGSVRFGP---GVAFRAPSIHGGSGGRGVSVSSA
:: ...::. ::.:::: :.. : . :::: .:: :.::::.
CCDS11 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGG----GLSVSSS
10 20 30 40 50
60 70 80
pF1KB6 RF---------------VSSSSS-------GAYGGG--------YGGVLTASDGLLAGNE
:: ::::: :.:::: .:: ....::::.:.:
CCDS11 RFSSGGACGLGGGYGGGFSSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGLGGGFGGGFAGGDGLLVGSE
60 70 80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 KLTMQNLNDRLASYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQGPGPSRDYSHYYTTIQDLRDK
:.:::::::::::::::::::: ::..::::::::::.: :. .::: :. ::.:::.:
CCDS11 KVTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPAEIKDYSPYFKTIEDLRNK
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 ILGATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDL
:: ::..:. ..::::::::::::::::.::: :::::::::::::::::::::::.::
CCDS11 ILTATVDNANVLLQIDNARLAADDFRTKYETELNLRMSVEADINGLRRVLDELTLARADL
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 EMQIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMA
:::::.:::::::::::::::...:::::::.:.::.:.:::.::..::..::.::: ::
CCDS11 EMQIESLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMA
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 EQNRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAAL
:.:::::: :: ..::::::::: ..: .: ..::...::::.:.:::::::::::::.:
CCDS11 EKNRKDAEEWFFTKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQNLEIELQSQLSMKASL
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 EDTLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATY
:..: ::..:. :::.:: .:...: ::...: . :.:::::. :.:.:.:::::::::
CCDS11 ENSLEETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATY
360 370 380 390 400 410
390 400
pF1KB6 RSLLEGQEDHYNNLSASKVL
: ::::.. : ::.:.
CCDS11 RRLLEGEDAH---LSSSQFSSGSQSSRDVTSSSRQIRTKVMDVHDGKVVSTHEQVLRTKN
420 430 440 450 460 470
>>CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17 (473 aa)
initn: 1575 init1: 1536 opt: 1565 Z-score: 1141.4 bits: 220.3 E(32554): 2.9e-57
Smith-Waterman score: 1587; 60.6% identity (82.1% similar) in 429 aa overlap (7-397:6-434)
10 20 30 40
pF1KB6 MTSYSYRQSSATSSF-------GGLGGGSVRFGP---GVAFRAPSIHGGS----------
:: ...::. ::.:::: :.. : . :::: .::.
CCDS11 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSRFSSG
10 20 30 40 50
50 60 70 80
pF1KB6 ------GGRGVSVSSARFVSSSSSGAYGGG------------YGGVLTASDGLLAGNEKL
:: : . ::. .:. .:.:::: .:: ....::::.:.::.
CCDS11 GACGLGGGYGGGFSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGFGGGLGAGFGGGFAGGDGLLVGSEKV
60 70 80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 TMQNLNDRLASYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQGPGPSRDYSHYYTTIQDLRDKIL
:::::::::::::::::::: ::..::::::::::.: :. .::: :. ::.:::.::.
CCDS11 TMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPSEIKDYSPYFKTIEDLRNKII
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 GATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEM
.:::::.. .::::::::::::::::.: : :::..::::.:::::::::::::::::::
CCDS11 AATIENAQPILQIDNARLAADDFRTKYEHELALRQTVEADVNGLRRVLDELTLARTDLEM
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 QIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQ
::::::::::::.::::::. .::::.::.:.::.:.:::.::..::..::.::: :::.
CCDS11 QIEGLKEELAYLRKNHEEEMLALRGQTGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEQMAEK
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 NRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALED
::.:::.:: :.:::::.:::...: .: ::::::.:::.::::::::::::::::.::.
CCDS11 NRRDAETWFLSKTEELNKEVASNSELVQSSRSEVTELRRVLQGLEIELQSQLSMKASLEN
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 TLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRS
.: ::..:. ::..::.::...: ::...: . :.:.:::: :.:.:.::::::::::
CCDS11 SLEETKGRYCMQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQSQEYQILLDVKTRLEQEIATYRR
360 370 380 390 400 410
390 400
pF1KB6 LLEGQEDHYNNLSASKVL
::::.. : .. .::
CCDS11 LLEGEDAHLSSQQASGQSYSSREVFTSSSSSSSRQTRPILKEQSSSSFSQGQSS
420 430 440 450 460 470
>>CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17 (456 aa)
initn: 1505 init1: 1227 opt: 1554 Z-score: 1133.8 bits: 218.8 E(32554): 7.9e-57
Smith-Waterman score: 1614; 63.3% identity (85.4% similar) in 417 aa overlap (1-388:1-414)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MTSYSYRQSSATSSFGGLG--GGSVRFGPGVAFRAPSIHGGSGGRGVSVSSARFVSSSSS
::. .. :.: .:.::: . :::. : : .: . :. ::.:.:..:.::::::::.:.
CCDS11 MTT-TFLQTS-SSTFGGGSTRGGSLLAGGG-GFGGGSLSGGGGSRSISASSARFVSSGSG
10 20 30 40 50
60 70 80 90
pF1KB6 GAYGGG-------------------------YGGVLTASDG-LLAGNEKLTMQNLNDRLA
:.:::: .:: . ..:: ::.::::.::::::::::
CCDS11 GGYGGGMRVCGFGGGAGSVFGGGFGGGVGGGFGGGFGGGDGGLLSGNEKITMQNLNDRLA
60 70 80 90 100 110
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CCDS11 SYLDKVRALEEANADLEVKIHDWYQKQTPTSPECDYSQYFKTIEELRDKIMATTIDNSRV
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160 170 180 190 200 210
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340 350 360 370 380 390
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..:: .::.::.:.::::...: . : :::::. :.:::.::::::::::::::::.
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.. .:
CCDS11 IGFPSSAGSVSPRSTSVTTTSSASVTTTSNASGRRTSDVRRP
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CCDS11 AYMKKNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAMAERNRRDAEEWF
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CCDS11 HTKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAGLENTVAETECRY
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CCDS11 ALQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKK
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CCDS11 RQPP
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CCDS11 SMFGSSSGFGGGSGSSMAGGLGAGYGRALGGGSFGGLGMGFGGSPGGGSLGILSGNDGGL
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CCDS11 PLIEDLRNKIISASIGNAQLLLQIDNARLAAEDFRMKYENELALRQGVEADINGLRRVLD
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CCDS11 SQLAMKKSLEDSLAEAEGDYCAQLSQVQQLISNLEAQLLQVRADAERQNVDHQRLLNVKA
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CCDS11 RLELEIETYRRLLDGEAQGDGLEESLFVTDSKSQAQSTDSSKDPTKTRKIKTVVQEMVNG
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CCDS11 GGSFSRGSSGGGCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFRGSYGSSSFGGSYGGI--FGGG-SFGGG
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CCDS11 YLDKVRALEESNYELEGKIKEWYEKHGNSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNAN
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CCDS11 ILLQIDNARLAADDFRLKYENEVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEE
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CCDS11 LAYLKKNHEEEMKDLRNVSTGDVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAW
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:. ...::. :. .. ::.. .::.:.:::..:.:::::::::..: .:: .:::::.:
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CCDS11 YCVQLSQIQAQISALEEQLQQIRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSS
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400
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CCDS11 GGGGRGGGSFGGGYGGGSSGGGSSGGGHGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSSS
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CCDS11 GGASSCSLSGGSSGAFGGSFGGGFGSCSVGGGFGGAS---GSGTGFGGGSSFGGVSGFGR
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CCDS11 SEIQTQISALEEEICQIWGETKCQNAEYKQLLDIKTRLEVEIETYRRLLDGEGGGSSFAE
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CCDS11 FGGRNSGSVNMGSRDLVSGDSRSGSCSGQGRDSSKTRVTKTIVEELVDGKVVSSQVSSIS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]