Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6567
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6567, 374 aa
1>>>pF1KB6567 374 - 374 aa - 374 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8129+/-0.00112; mu= 13.6147+/- 0.066
mean_var=65.0507+/-13.257, 0's: 0 Z-trim(102.3): 52 B-trim: 260 in 1/49
Lambda= 0.159019
statistics sampled from 6844 (6896) to 6844 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.579), E-opt: 0.2 (0.212), width: 16
Scan time: 2.320
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11991.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 374) 2476 577.2 8.2e-165
CCDS4479.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 376) 1658 389.5 2.5e-108
CCDS75386.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 380) 1658 389.5 2.6e-108
CCDS75387.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 395) 1658 389.5 2.7e-108
CCDS42442.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 242) 1579 371.3 4.8e-103
CCDS4478.1 SERPINB9 gene_id:5272|Hs108|chr6 ( 376) 1561 367.3 1.3e-101
CCDS62460.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 192) 1267 299.7 1.4e-81
CCDS4477.1 SERPINB1 gene_id:1992|Hs108|chr6 ( 379) 1230 291.3 9.3e-79
CCDS11989.1 SERPINB2 gene_id:5055|Hs108|chr18 ( 415) 994 237.2 2e-62
CCDS11986.1 SERPINB4 gene_id:6318|Hs108|chr18 ( 390) 928 222.0 6.8e-58
CCDS11987.1 SERPINB3 gene_id:6317|Hs108|chr18 ( 390) 924 221.1 1.3e-57
CCDS11990.1 SERPINB10 gene_id:5273|Hs108|chr18 ( 397) 904 216.5 3.2e-56
CCDS32839.1 SERPINB5 gene_id:5268|Hs108|chr18 ( 375) 871 209.0 5.7e-54
CCDS77194.1 SERPINB12 gene_id:89777|Hs108|chr18 ( 425) 866 207.8 1.4e-53
CCDS11984.1 SERPINB12 gene_id:89777|Hs108|chr18 ( 405) 857 205.8 5.7e-53
CCDS11985.1 SERPINB13 gene_id:5275|Hs108|chr18 ( 391) 854 205.1 8.8e-53
CCDS77195.1 SERPINB13 gene_id:5275|Hs108|chr18 ( 400) 850 204.2 1.7e-52
CCDS11988.1 SERPINB7 gene_id:8710|Hs108|chr18 ( 380) 844 202.8 4.2e-52
CCDS1313.1 SERPINC1 gene_id:462|Hs108|chr1 ( 464) 811 195.2 9.7e-50
CCDS58633.1 SERPINB7 gene_id:8710|Hs108|chr18 ( 363) 746 180.3 2.4e-45
CCDS3203.1 SERPINI1 gene_id:5274|Hs108|chr3 ( 410) 744 179.8 3.6e-45
CCDS3200.1 SERPINI2 gene_id:5276|Hs108|chr3 ( 405) 717 173.6 2.6e-43
CCDS75047.1 SERPINI2 gene_id:5276|Hs108|chr3 ( 415) 717 173.6 2.7e-43
CCDS9928.1 SERPINA5 gene_id:5104|Hs108|chr14 ( 406) 649 158.0 1.3e-38
CCDS41982.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 435) 640 156.0 5.9e-38
CCDS5711.1 SERPINE1 gene_id:5054|Hs108|chr7 ( 402) 632 154.1 1.9e-37
CCDS9926.1 SERPINA12 gene_id:145264|Hs108|chr14 ( 414) 629 153.5 3.2e-37
CCDS8239.1 SERPINH1 gene_id:871|Hs108|chr11 ( 418) 628 153.2 3.8e-37
CCDS9925.1 SERPINA1 gene_id:5265|Hs108|chr14 ( 418) 618 150.9 1.9e-36
CCDS32150.1 SERPINA3 gene_id:12|Hs108|chr14 ( 423) 616 150.5 2.6e-36
CCDS9924.1 SERPINA6 gene_id:866|Hs108|chr14 ( 405) 609 148.9 7.6e-36
CCDS46526.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 397) 605 147.9 1.4e-35
CCDS46525.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 409) 605 147.9 1.4e-35
CCDS2460.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 398) 599 146.6 3.7e-35
CCDS77196.1 SERPINB11 gene_id:89778|Hs108|chr18 ( 305) 588 144.0 1.6e-34
CCDS9927.1 SERPINA4 gene_id:5267|Hs108|chr14 ( 427) 567 139.2 6.3e-33
CCDS32149.1 SERPINA11 gene_id:256394|Hs108|chr14 ( 422) 558 137.2 2.6e-32
CCDS14518.1 SERPINA7 gene_id:6906|Hs108|chrX ( 415) 547 134.6 1.5e-31
CCDS13783.1 SERPIND1 gene_id:3053|Hs108|chr22 ( 499) 548 134.9 1.5e-31
CCDS9923.1 SERPINA10 gene_id:51156|Hs108|chr14 ( 444) 538 132.6 6.6e-31
CCDS42441.1 HMSD gene_id:284293|Hs108|chr18 ( 139) 489 121.2 5.5e-28
CCDS53870.1 SERPINE3 gene_id:647174|Hs108|chr13 ( 424) 487 120.9 2.1e-27
CCDS61542.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 286) 479 119.0 5.2e-27
CCDS41983.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 335) 451 112.6 5.2e-25
CCDS11012.1 SERPINF1 gene_id:5176|Hs108|chr17 ( 418) 366 93.1 4.7e-19
CCDS7962.1 SERPING1 gene_id:710|Hs108|chr11 ( 500) 367 93.4 4.8e-19
CCDS54064.1 SERPINF2 gene_id:5345|Hs108|chr17 ( 427) 352 89.9 4.5e-18
CCDS11011.1 SERPINF2 gene_id:5345|Hs108|chr17 ( 491) 296 77.1 3.7e-14
>>CCDS11991.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 (374 aa)
initn: 2476 init1: 2476 opt: 2476 Z-score: 3072.4 bits: 577.2 E(32554): 8.2e-165
Smith-Waterman score: 2476; 100.0% identity (100.0% similar) in 374 aa overlap (1-374:1-374)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MDDLCEANGTFAISLFKILGEEDNSRNVFFSPMSISSALAMVFMGAKGSTAAQMSQALCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MDDLCEANGTFAISLFKILGEEDNSRNVFFSPMSISSALAMVFMGAKGSTAAQMSQALCL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 YKDGDIHRGFQSLLSEVNRTGTQYLLRTANRLFGEKTCDFLPDFKEYCQKFYQAELEELS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YKDGDIHRGFQSLLSEVNRTGTQYLLRTANRLFGEKTCDFLPDFKEYCQKFYQAELEELS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 FAEDTEECRKHINDWVAEKTEGKISEVLDAGTVDPLTKLVLVNAIYFKGKWNEQFDRKYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FAEDTEECRKHINDWVAEKTEGKISEVLDAGTVDPLTKLVLVNAIYFKGKWNEQFDRKYT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 RGMLFKTNEEKKTVQMMFKEAKFKMGYADEVHTQVLELPYVEEELSMVILLPDDNTDLAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RGMLFKTNEEKKTVQMMFKEAKFKMGYADEVHTQVLELPYVEEELSMVILLPDDNTDLAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 VEKALTYEKFKAWTNSEKLTKSKVQVFLPRLKLEESYDLEPFLRRLGMIDAFDEAKADFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VEKALTYEKFKAWTNSEKLTKSKVQVFLPRLKLEESYDLEPFLRRLGMIDAFDEAKADFS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 GMSTEKNVPLSKVAHKCFVEVNEEGTEAAAATAVVRNSRCSRMEPRFCADHPFLFFIRHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GMSTEKNVPLSKVAHKCFVEVNEEGTEAAAATAVVRNSRCSRMEPRFCADHPFLFFIRHH
310 320 330 340 350 360
370
pF1KB6 KTNCILFCGRFSSP
::::::::::::::
CCDS11 KTNCILFCGRFSSP
370
>>CCDS4479.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 (376 aa)
initn: 1100 init1: 833 opt: 1658 Z-score: 2058.2 bits: 389.5 E(32554): 2.5e-108
Smith-Waterman score: 1658; 66.9% identity (84.7% similar) in 378 aa overlap (1-374:1-376)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MDDLCEANGTFAISLFKILGEEDNSRNVFFSPMSISSALAMVFMGAKGSTAAQMSQALCL
:: : :::::::..:.: ::. :::.::::::::.: :::::.:::::.:::::.: : .
CCDS44 MDVLAEANGTFALNLLKTLGK-DNSKNVFFSPMSMSCALAMVYMGAKGNTAAQMAQILSF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB6 YKDG---DIHRGFQSLLSEVNRTGTQYLLRTANRLFGEKTCDFLPDFKEYCQKFYQAELE
:.: :::.::::::.:::.:::::::: ::::::::.:::: .:.. ::::::::.:
CCDS44 NKSGGGGDIHQGFQSLLTEVNKTGTQYLLRMANRLFGEKSCDFLSSFRDSCQKFYQAEME
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 ELSFAEDTEECRKHINDWVAEKTEGKISEVLDAGTVDPLTKLVLVNAIYFKGKWNEQFDR
::.: .:. ::::: ::::::::::.:.:. :.:::::.::::::.::.:.:.::::.
CCDS44 ELDFISAVEKSRKHINTWVAEKTEGKIAELLSPGSVDPLTRLVLVNAVYFRGNWDEQFDK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 KYTRGMLFKTNE-EKKTVQMMFKEAKFKMGYADEVHTQVLELPYVEEELSMVILLPDDNT
. :. :::... :.: ::::::.. :: : :. ::.: :::: .::.:.:.:::..:
CCDS44 ENTEERLFKVSKNEEKPVQMMFKQSTFKKTYIGEIFTQILVLPYVGKELNMIIMLPDETT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 DLAVVEKALTYEKFKAWTNSEKLTKSKVQVFLPRLKLEESYDLEPFLRRLGMIDAFDEAK
:: .::: :::::: :: . . . .:.: :::.:::::::.: :: ::: :::. .:
CCDS44 DLRTVEKELTYEKFVEWTRLDMMDEEEVEVSLPRFKLEESYDMESVLRNLGMTDAFELGK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 ADFSGMSTEKNVPLSKVAHKCFVEVNEEGTEAAAATAVVRNSRCSRMEPRFCADHPFLFF
::::::: . .. ::::.:: ::::::::::::::::.. ::.:. ::::::::::::
CCDS44 ADFSGMS-QTDLSLSKVVHKSFVEVNEEGTEAAAATAAIMMMRCARFVPRFCADHPFLFF
300 310 320 330 340 350
360 370
pF1KB6 IRHHKTNCILFCGRFSSP
:.: ::: ::::::::::
CCDS44 IQHSKTNGILFCGRFSSP
360 370
>>CCDS75386.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 (380 aa)
initn: 1100 init1: 833 opt: 1658 Z-score: 2058.1 bits: 389.5 E(32554): 2.6e-108
Smith-Waterman score: 1658; 66.9% identity (84.7% similar) in 378 aa overlap (1-374:5-380)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MDDLCEANGTFAISLFKILGEEDNSRNVFFSPMSISSALAMVFMGAKGSTAAQMSQ
:: : :::::::..:.: ::. :::.::::::::.: :::::.:::::.:::::.:
CCDS75 MSAIMDVLAEANGTFALNLLKTLGK-DNSKNVFFSPMSMSCALAMVYMGAKGNTAAQMAQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 ALCLYKDG---DIHRGFQSLLSEVNRTGTQYLLRTANRLFGEKTCDFLPDFKEYCQKFYQ
: . :.: :::.::::::.:::.:::::::: ::::::::.:::: .:.. ::::::
CCDS75 ILSFNKSGGGGDIHQGFQSLLTEVNKTGTQYLLRMANRLFGEKSCDFLSSFRDSCQKFYQ
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 AELEELSFAEDTEECRKHINDWVAEKTEGKISEVLDAGTVDPLTKLVLVNAIYFKGKWNE
::.:::.: .:. ::::: ::::::::::.:.:. :.:::::.::::::.::.:.:.:
CCDS75 AEMEELDFISAVEKSRKHINTWVAEKTEGKIAELLSPGSVDPLTRLVLVNAVYFRGNWDE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 QFDRKYTRGMLFKTNE-EKKTVQMMFKEAKFKMGYADEVHTQVLELPYVEEELSMVILLP
:::.. :. :::... :.: ::::::.. :: : :. ::.: :::: .::.:.:.::
CCDS75 QFDKENTEERLFKVSKNEEKPVQMMFKQSTFKKTYIGEIFTQILVLPYVGKELNMIIMLP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 DDNTDLAVVEKALTYEKFKAWTNSEKLTKSKVQVFLPRLKLEESYDLEPFLRRLGMIDAF
:..::: .::: :::::: :: . . . .:.: :::.:::::::.: :: ::: :::
CCDS75 DETTDLRTVEKELTYEKFVEWTRLDMMDEEEVEVSLPRFKLEESYDMESVLRNLGMTDAF
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 DEAKADFSGMSTEKNVPLSKVAHKCFVEVNEEGTEAAAATAVVRNSRCSRMEPRFCADHP
. .:::::::: . .. ::::.:: ::::::::::::::::.. ::.:. ::::::::
CCDS75 ELGKADFSGMS-QTDLSLSKVVHKSFVEVNEEGTEAAAATAAIMMMRCARFVPRFCADHP
300 310 320 330 340 350
360 370
pF1KB6 FLFFIRHHKTNCILFCGRFSSP
:::::.: ::: ::::::::::
CCDS75 FLFFIQHSKTNGILFCGRFSSP
360 370 380
>>CCDS75387.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 (395 aa)
initn: 1100 init1: 833 opt: 1658 Z-score: 2057.8 bits: 389.5 E(32554): 2.7e-108
Smith-Waterman score: 1658; 66.9% identity (84.7% similar) in 378 aa overlap (1-374:20-395)
10 20 30 40
pF1KB6 MDDLCEANGTFAISLFKILGEEDNSRNVFFSPMSISSALAM
:: : :::::::..:.: ::. :::.::::::::.: ::::
CCDS75 MSSRQRGNFNYKLAFKSAIMDVLAEANGTFALNLLKTLGK-DNSKNVFFSPMSMSCALAM
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90
pF1KB6 VFMGAKGSTAAQMSQALCLYKDG---DIHRGFQSLLSEVNRTGTQYLLRTANRLFGEKTC
:.:::::.:::::.: : . :.: :::.::::::.:::.:::::::: ::::::::.:
CCDS75 VYMGAKGNTAAQMAQILSFNKSGGGGDIHQGFQSLLTEVNKTGTQYLLRMANRLFGEKSC
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 DFLPDFKEYCQKFYQAELEELSFAEDTEECRKHINDWVAEKTEGKISEVLDAGTVDPLTK
::: .:.. ::::::::.:::.: .:. ::::: ::::::::::.:.:. :.:::::.
CCDS75 DFLSSFRDSCQKFYQAEMEELDFISAVEKSRKHINTWVAEKTEGKIAELLSPGSVDPLTR
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 LVLVNAIYFKGKWNEQFDRKYTRGMLFKTNE-EKKTVQMMFKEAKFKMGYADEVHTQVLE
::::::.::.:.:.::::.. :. :::... :.: ::::::.. :: : :. ::.:
CCDS75 LVLVNAVYFRGNWDEQFDKENTEERLFKVSKNEEKPVQMMFKQSTFKKTYIGEIFTQILV
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 LPYVEEELSMVILLPDDNTDLAVVEKALTYEKFKAWTNSEKLTKSKVQVFLPRLKLEESY
:::: .::.:.:.:::..::: .::: :::::: :: . . . .:.: :::.::::::
CCDS75 LPYVGKELNMIIMLPDETTDLRTVEKELTYEKFVEWTRLDMMDEEEVEVSLPRFKLEESY
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 DLEPFLRRLGMIDAFDEAKADFSGMSTEKNVPLSKVAHKCFVEVNEEGTEAAAATAVVRN
:.: :: ::: :::. .:::::::: . .. ::::.:: ::::::::::::::::..
CCDS75 DMESVLRNLGMTDAFELGKADFSGMS-QTDLSLSKVVHKSFVEVNEEGTEAAAATAAIMM
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370
pF1KB6 SRCSRMEPRFCADHPFLFFIRHHKTNCILFCGRFSSP
::.:. :::::::::::::.: ::: ::::::::::
CCDS75 MRCARFVPRFCADHPFLFFIQHSKTNGILFCGRFSSP
360 370 380 390
>>CCDS42442.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 (242 aa)
initn: 1579 init1: 1579 opt: 1579 Z-score: 1963.4 bits: 371.3 E(32554): 4.8e-103
Smith-Waterman score: 1579; 99.6% identity (99.6% similar) in 242 aa overlap (1-242:1-242)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MDDLCEANGTFAISLFKILGEEDNSRNVFFSPMSISSALAMVFMGAKGSTAAQMSQALCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MDDLCEANGTFAISLFKILGEEDNSRNVFFSPMSISSALAMVFMGAKGSTAAQMSQALCL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 YKDGDIHRGFQSLLSEVNRTGTQYLLRTANRLFGEKTCDFLPDFKEYCQKFYQAELEELS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 YKDGDIHRGFQSLLSEVNRTGTQYLLRTANRLFGEKTCDFLPDFKEYCQKFYQAELEELS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 FAEDTEECRKHINDWVAEKTEGKISEVLDAGTVDPLTKLVLVNAIYFKGKWNEQFDRKYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 FAEDTEECRKHINDWVAEKTEGKISEVLDAGTVDPLTKLVLVNAIYFKGKWNEQFDRKYT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 RGMLFKTNEEKKTVQMMFKEAKFKMGYADEVHTQVLELPYVEEELSMVILLPDDNTDLAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RGMLFKTNEEKKTVQMMFKEAKFKMGYADEVHTQVLELPYVEEELSMVILLPDDNTDLAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 VEKALTYEKFKAWTNSEKLTKSKVQVFLPRLKLEESYDLEPFLRRLGMIDAFDEAKADFS
:
CCDS42 KE
>>CCDS4478.1 SERPINB9 gene_id:5272|Hs108|chr6 (376 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MDDLCEANGTFAISLFKILGEEDNSRNVFFSPMSISSALAMVFMGAKGSTAAQMSQALCL
:. : .:.::::: :.::: ... :.::: ::.:::::::::..::::.::.::.::: :
CCDS44 METLSNASGTFAIRLLKILCQDNPSHNVFCSPVSISSALAMVLLGAKGNTATQMAQALSL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 YKDGDIHRGFQSLLSEVNRTGTQYLLRTANRLFGEKTCDFLPDFKEYCQKFYQAELEELS
. ::::.:::::.:::..::::::::::::::::::.:: ::: : .::.:::.:::
CCDS44 NTEEDIHRAFQSLLTEVNKAGTQYLLRTANRLFGEKTCQFLSTFKESCLQFYHAELKELS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 FAEDTEECRKHINDWVAEKTEGKISEVLDAGTVDPLTKLVLVNAIYFKGKWNEQFDRKYT
: . .:: ::::: ::..:::::: :.: ....: :.::::::::::::::: ::. ::
CCDS44 FIRAAEESRKHINTWVSKKTEGKIEELLPGSSIDAETRLVLVNAIYFKGKWNEPFDETYT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KB6 RGMLFKTN-EEKKTVQMMFKEAKFKMGYADEVHTQVLELPYVEEELSMVILLPDDNTDLA
: : :: : ::.. ::::..:: ::.... ::..:.:::::...:::...:::::...:.
CCDS44 REMPFKINQEEQRPVQMMYQEATFKLAHVGEVRAQLLELPYARKELSLLVLLPDDGVELS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 VVEKALTYEKFKAWTNSEKLTKSKVQVFLPRLKLEESYDLEPFLRRLGMIDAFDEAKADF
.:::.::.::. :::. . . ...:.:.::..::.:.::.: ::.::..:::...:::.
CCDS44 TVEKSLTFEKLTAWTKPDCMKSTEVEVLLPKFKLQEDYDMESVLRHLGIVDAFQQGKADL
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 SGMSTEKNVPLSKVAHKCFVEVNEEGTEAAAATAVVRNSRCSRME--PRFCADHPFLFFI
:.::.:... ::: .:: ::::::::::::::.. ..: :: :::::::::::::
CCDS44 SAMSAERDLCLSKFVHKSFVEVNEEGTEAAAASSCFVVAECC-MESGPRFCADHPFLFFI
310 320 330 340 350
360 370
pF1KB6 RHHKTNCILFCGRFSSP
::...: ::::::::::
CCDS44 RHNRANSILFCGRFSSP
360 370
>>CCDS62460.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 (192 aa)
initn: 1267 init1: 1267 opt: 1267 Z-score: 1578.2 bits: 299.7 E(32554): 1.4e-81
Smith-Waterman score: 1267; 100.0% identity (100.0% similar) in 192 aa overlap (183-374:1-192)
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 VDPLTKLVLVNAIYFKGKWNEQFDRKYTRGMLFKTNEEKKTVQMMFKEAKFKMGYADEVH
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 MLFKTNEEKKTVQMMFKEAKFKMGYADEVH
10 20 30
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 TQVLELPYVEEELSMVILLPDDNTDLAVVEKALTYEKFKAWTNSEKLTKSKVQVFLPRLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 TQVLELPYVEEELSMVILLPDDNTDLAVVEKALTYEKFKAWTNSEKLTKSKVQVFLPRLK
40 50 60 70 80 90
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 LEESYDLEPFLRRLGMIDAFDEAKADFSGMSTEKNVPLSKVAHKCFVEVNEEGTEAAAAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 LEESYDLEPFLRRLGMIDAFDEAKADFSGMSTEKNVPLSKVAHKCFVEVNEEGTEAAAAT
100 110 120 130 140 150
340 350 360 370
pF1KB6 AVVRNSRCSRMEPRFCADHPFLFFIRHHKTNCILFCGRFSSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 AVVRNSRCSRMEPRFCADHPFLFFIRHHKTNCILFCGRFSSP
160 170 180 190
>>CCDS4477.1 SERPINB1 gene_id:1992|Hs108|chr6 (379 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MDDLCEANGTFAISLFKILGEEDNSRNVFFSPMSISSALAMVFMGAKGSTAAQMSQALCL
:..: :: ::..:: :.:.. . :.:.::.:::::.::::.:..:.::::.:... .
CCDS44 MEQLSSANTRFALDLFLALSENNPAGNIFISPFSISSAMAMVFLGTRGNTAAQLSKTFHF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 YKDGDIHRGFQSLLSEVNRTGTQYLLRTANRLFGEKTCDFLPDFKEYCQKFYQAELEELS
..: :::: ...:. :..:.:. ::::.:::: .:::.: :: : :.: ..
CCDS44 NTVEEVHSRFQSLNADINKRGASYILKLANRLYGEKTYNFLPEFLVSTQKTYGADLASVD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 FAEDTEECRKHINDWVAEKTEGKISEVLDAGTVDPLTKLVLVNAIYFKGKWNEQFDRKYT
: . .:. :: ::.:: .::::: :.: .: :: .:::::::::::::.:...: .. :
CCDS44 FQHASEDARKTINQWVKGQTEGKIPELLASGMVDNMTKLVLVNAIYFKGNWKDKFMKEAT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KB6 RGMLFKTNE-EKKTVQMMFKEAKFKMGYADEVHTQVLELPYVEEELSMVILLPDD----N
. :. :. ..:::.::... :: .:: .... .:::::: :::::::::::: .
CCDS44 TNAPFRLNKKDRKTVKMMYQKKKFAYGYIEDLKCRVLELPYQGEELSMVILLPDDIEDES
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 TDLAVVEKALTYEKFKAWTNSEKLTKSKVQVFLPRLKLEESYDLEPFLRRLGMIDAFDEA
: : .:. :: ::.. ::. :.: .:.: :::.:::::: :. : :::. : :. .
CCDS44 TGLKKIEEQLTLEKLHEWTKPENLDFIEVNVSLPRFKLEESYTLNSDLARLGVQDLFNSS
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 KADFSGMSTEKNVPLSKVAHKCFVEVNEEGTEAAAATAVVRNSRCSRM-EPRFCADHPFL
:::.:::: ... .::..:: :::::::::::::::: . . : : : : ::::::
CCDS44 KADLSGMSGARDIFISKIVHKSFVEVNEEGTEAAAATAGI-ATFCMLMPEENFTADHPFL
310 320 330 340 350
360 370
pF1KB6 FFIRHHKTNCILFCGRFSSP
:::::.... ::: ::::::
CCDS44 FFIRHNSSGSILFLGRFSSP
360 370
>>CCDS11989.1 SERPINB2 gene_id:5055|Hs108|chr18 (415 aa)
initn: 779 init1: 494 opt: 994 Z-score: 1234.2 bits: 237.2 E(32554): 2e-62
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10 20 30 40 50
pF1KB6 MDDLCEANGTFAISLFKILGEEDNSRNVFFSPMSISSALAMVFMGAKGSTAAQMSQAL--
::..::: :.. . ..:.:.:: ::::..:::.::..::: ::...:
CCDS11 MEDLCVANTLFALNLFKHLAKASPTQNLFLSPWSISSTMAMVYMGSRGSTEDQMAKVLQF
10 20 30 40 50 60
60 70 80
pF1KB6 ------------------C---------LYKDG--------DIHRGFQSLLSEVNRTGTQ
: : :. :: .:.:: : .: . .
CCDS11 NEVGANAVTPMTPENFTSCGFMQQIQKGSYPDAILQAQAADKIHSSFRSLSSAINASTGN
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 YLLRTANRLFGEKTCDFLPDFKEYCQKFYQAELEELSFAEDTEECRKHINDWVAEKTEGK
:::...:.:::::. .: .. . :::.:..: . ..: : .:: ::.::.:: .:.::
CCDS11 YLLESVNKLFGEKSASFREEYIRLCQKYYSSEPQAVDFLECAEEARKKINSWVKTQTKGK
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 ISEVLDAGTVDPLTKLVLVNAIYFKGKWNEQFDRKYTRGMLFKTNEEKKT-VQMMFKEAK
: ..: :.:: :..:::::.::::::. :..: . . :..: ..: ::::. . :
CCDS11 IPNLLPEGSVDGDTRMVLVNAVYFKGKWKTPFEKKLNGLYPFRVNSAQRTPVQMMYLREK
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250
pF1KB6 FKMGYADEVHTQVLELPYVEEELSMVILLPDDNTD----LAVVEKALTYEKFKAWTNSEK
...:: .....:.:::::. . .:: .::::. .: : ..:. .::.:.. ::...:
CCDS11 LNIGYIEDLKAQILELPYAGD-VSMFLLLPDEIADVSTGLELLESEITYDKLNKWTSKDK
250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 LTKSKVQVFLPRLKLEESYDLEPFLRRLGMIDAFDEAKADFSGMSTEKNVPLSKVAHKCF
.....:.:..:..:::: :.:. .:: .:: :::....:.::::: .... ::.: :. .
CCDS11 MAEDEVEVYIPQFKLEEHYELRSILRSMGMEDAFNKGRANFSGMSERNDLFLSEVFHQAM
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 VEVNEEGTEAAAATAVVRNSRCSRMEPRFCADHPFLFFIRHHKTNCILFCGRFSSP
:.::::::::::.:. : ..: .. :.: :::::::.: :. :::::: ::::::
CCDS11 VDVNEEGTEAAAGTGGVMTGRTGHGGPQFVADHPFLFLIMHKITNCILFFGRFSSP
360 370 380 390 400 410
>>CCDS11986.1 SERPINB4 gene_id:6318|Hs108|chr18 (390 aa)
initn: 528 init1: 410 opt: 928 Z-score: 1152.8 bits: 222.0 E(32554): 6.8e-58
Smith-Waterman score: 1049; 44.9% identity (73.0% similar) in 392 aa overlap (1-374:1-390)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MDDLCEANGTFAISLFKILGEEDNSRNVFFSPMSISSALAMVFMGAKGSTAAQMSQALCL
:..: ::: : ..::. . .... :.:.::.::.:::.::..::: .:: :.:..: .
CCDS11 MNSLSEANTKFMFDLFQQF-RKSKENNIFYSPISITSALGMVLLGAKDNTAQQISKVLHF
10 20 30 40 50
70 80 90 100
pF1KB6 -------------Y---KDGDIHRGFQSLLSEVNRTGTQYLLRTANRLFGEKTCDFLPDF
: ..:..:. ::.::.: :.. : :. ::.:::::: .:: ..
CCDS11 DQVTENTTEKAATYHVDRSGNVHHQFQKLLTEFNKSTDAYELKIANKLFGEKTYQFLQEY
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 KEYCQKFYQAELEELSFAEDTEECRKHINDWVAEKTEGKISEVLDAGTVDPLTKLVLVNA
. .::::. .: .::. :: ::.::.:: .:. ::.... ::. : ::::::
CCDS11 LDAIKKFYQTSVESTDFANAPEESRKKINSWVESQTNEKIKNLFPDGTIGNDTTLVLVNA
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 IYFKGKWNEQFDRKYTRGMLFKTNEEK-KTVQMMFKEAKFKMGYADEVHTQVLELPYVEE
:::::.:...: .. :. : :.. :.:::: . .:... ..:...:::.:: .
CCDS11 IYFKGQWENKFKKENTKEEKFWPNKNTYKSVQMMRQYNSFNFALLEDVQAKVLEIPYKGK
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 ELSMVILLPDDNTDLAVVEKALTYEKFKAWTNSEKLTKSKVQVFLPRLKLEESYDLEPFL
.:::..:::.. : .:. :: ::. ::. ... .. :.. :::.:.::::::. :
CCDS11 DLSMIVLLPNEIDGLQKLEEKLTAEKLMEWTSLQNMRETCVDLHLPRFKMEESYDLKDTL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 RRLGMIDAFDEAKADFSGMSTEKNVPLSKVAHKCFVEVNEEGTEAAAATAVVRNSRCS-R
: .::.. :. . ::.:::. ... .::: :: ::::.:::.::::::::: :
CCDS11 RTMGMVNIFN-GDADLSGMTWSHGLSVSKVLHKAFVEVTEEGVEAAAATAVVVVELSSPS
300 310 320 330 340 350
350 360 370
pF1KB6 MEPRFCADHPFLFFIRHHKTNCILFCGRFSSP
. .:: .::::::::..::: ::: ::::::
CCDS11 TNEEFCCNHPFLFFIRQNKTNSILFYGRFSSP
360 370 380 390
374 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 15:52:48 2016 done: Fri Nov 4 15:52:48 2016
Total Scan time: 2.320 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]