Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6572
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6572, 400 aa
1>>>pF1KB6572 400 - 400 aa - 400 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7933+/-0.000954; mu= 14.9142+/- 0.057
mean_var=138.9891+/-50.848, 0's: 0 Z-trim(106.8): 235 B-trim: 1119 in 2/48
Lambda= 0.108789
statistics sampled from 8787 (9192) to 8787 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.646), E-opt: 0.2 (0.282), width: 16
Scan time: 2.950
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2978.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3 ( 400) 2660 429.6 2.4e-120
CCDS33829.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3 ( 367) 1910 311.9 6.2e-85
CCDS8361.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 ( 443) 898 153.2 4.6e-37
CCDS8362.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 ( 414) 896 152.8 5.4e-37
CCDS7710.1 DRD4 gene_id:1815|Hs108|chr11 ( 419) 596 105.7 8.2e-23
CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5 ( 422) 487 88.6 1.2e-17
CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 342) 478 87.1 2.7e-17
CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10 ( 465) 468 85.7 9.7e-17
CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 432) 467 85.5 1e-16
CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 445) 467 85.5 1.1e-16
CCDS7408.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 479) 467 85.5 1.1e-16
CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4 ( 462) 455 83.6 4e-16
CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2 ( 450) 453 83.3 4.9e-16
CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6 ( 390) 431 79.8 4.9e-15
CCDS14564.1 HTR2C gene_id:3358|Hs108|chrX ( 458) 431 79.9 5.4e-15
CCDS9405.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13 ( 471) 410 76.6 5.4e-14
CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10 ( 477) 385 72.7 8.2e-13
CCDS5936.1 HTR5A gene_id:3361|Hs108|chr7 ( 357) 382 72.1 9.5e-13
CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5 ( 413) 380 71.8 1.3e-12
CCDS2483.1 HTR2B gene_id:3357|Hs108|chr2 ( 481) 373 70.8 3.1e-12
CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5 ( 446) 372 70.6 3.2e-12
CCDS3405.1 DRD5 gene_id:1816|Hs108|chr4 ( 477) 361 68.9 1.1e-11
CCDS197.1 HTR6 gene_id:3362|Hs108|chr1 ( 440) 357 68.2 1.6e-11
CCDS8040.1 CHRM1 gene_id:1128|Hs108|chr11 ( 460) 344 66.2 7e-11
>>CCDS2978.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3 (400 aa)
initn: 2660 init1: 2660 opt: 2660 Z-score: 2274.0 bits: 429.6 E(32554): 2.4e-120
Smith-Waterman score: 2660; 100.0% identity (100.0% similar) in 400 aa overlap (1-400:1-400)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MASLSQLSGHLNYTCGAENSTGASQARPHAYYALSYCALILAIVFGNGLVCMAVLKERAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 MASLSQLSGHLNYTCGAENSTGASQARPHAYYALSYCALILAIVFGNGLVCMAVLKERAL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 QTTTNYLVVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVTGGVWNFSRICCDVFVTLDVMMCTASILN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 QTTTNYLVVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVTGGVWNFSRICCDVFVTLDVMMCTASILN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 LCAISIDRYTAVVMPVHYQHGTGQSSCRRVALMITAVWVLAFAVSCPLLFGFNTTGDPTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 LCAISIDRYTAVVMPVHYQHGTGQSSCRRVALMITAVWVLAFAVSCPLLFGFNTTGDPTV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 CSISNPDFVIYSSVVSFYLPFGVTVLVYARIYVVLKQRRRKRILTRQNSQCNSVRPGFPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 CSISNPDFVIYSSVVSFYLPFGVTVLVYARIYVVLKQRRRKRILTRQNSQCNSVRPGFPQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 QTLSPDPAHLELKRYYSICQDTALGGPGFQERGGELKREEKTRNSLSPTIAPKLSLEVRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 QTLSPDPAHLELKRYYSICQDTALGGPGFQERGGELKREEKTRNSLSPTIAPKLSLEVRK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LSNGRLSTSLKLGPLQPRGVPLREKKATQMVAIVLGAFIVCWLPFFLTHVLNTHCQTCHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 LSNGRLSTSLKLGPLQPRGVPLREKKATQMVAIVLGAFIVCWLPFFLTHVLNTHCQTCHV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KB6 SPELYSATTWLGYVNSALNPVIYTTFNIEFRKAFLKILSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 SPELYSATTWLGYVNSALNPVIYTTFNIEFRKAFLKILSC
370 380 390 400
>>CCDS33829.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3 (367 aa)
initn: 1910 init1: 1910 opt: 1910 Z-score: 1638.3 bits: 311.9 E(32554): 6.2e-85
Smith-Waterman score: 2372; 91.5% identity (91.8% similar) in 400 aa overlap (1-400:1-367)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MASLSQLSGHLNYTCGAENSTGASQARPHAYYALSYCALILAIVFGNGLVCMAVLKERAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MASLSQLSGHLNYTCGAENSTGASQARPHAYYALSYCALILAIVFGNGLVCMAVLKERAL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 QTTTNYLVVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVTGGVWNFSRICCDVFVTLDVMMCTASILN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QTTTNYLVVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVTGGVWNFSRICCDVFVTLDVMMCTASILN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 LCAISIDRYTAVVMPVHYQHGTGQSSCRRVALMITAVWVLAFAVSCPLLFGFNTTGDPTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LCAISIDRYTAVVMPVHYQHGTGQSSCRRVALMITAVWVLAFAVSCPLLFGFNTTGDPTV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 CSISNPDFVIYSSVVSFYLPFGVTVLVYARIYVVLKQRRRKRILTRQNSQCNSVRPGFPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CSISNPDFVIYSSVVSFYLPFGVTVLVYARIYVVLKQRRRKRILTRQNSQCNSVRPGFPQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 QTLSPDPAHLELKRYYSICQDTALGGPGFQERGGELKREEKTRNSLSPTIAPKLSLEVRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QTLSPDPAHLELKRYYSICQDTALGGPGFQERGGELKREEKTRNSL--------------
250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LSNGRLSTSLKLGPLQPRGVPLREKKATQMVAIVLGAFIVCWLPFFLTHVLNTHCQTCHV
.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 -------------------MPLREKKATQMVAIVLGAFIVCWLPFFLTHVLNTHCQTCHV
290 300 310 320
370 380 390 400
pF1KB6 SPELYSATTWLGYVNSALNPVIYTTFNIEFRKAFLKILSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SPELYSATTWLGYVNSALNPVIYTTFNIEFRKAFLKILSC
330 340 350 360
>>CCDS8361.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 (443 aa)
initn: 1091 init1: 303 opt: 898 Z-score: 779.0 bits: 153.2 E(32554): 4.6e-37
Smith-Waterman score: 1245; 53.4% identity (71.1% similar) in 425 aa overlap (19-394:23-437)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MASLSQLSGHLNYTCGAENSTGASQARPH-AYYALSYCALILAIVFGNGLVCMAVL
:.. .. ::: ::: :: .::::: ::::::
CCDS83 MDPLNLSWYDDDLERQNWSRPFNGSDGKADRPHYNYYATLLTLLIAVIVFGNVLVCMAVS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 KERALQTTTNYLVVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVTGGVWNFSRICCDVFVTLDVMMCT
.:.:::::::::.:::::::::::::::::::::::.: :.:::: ::.::::::::::
CCDS83 REKALQTTTNYLIVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVVGE-WKFSRIHCDIFVTLDVMMCT
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 ASILNLCAISIDRYTAVVMPVHYQHGTGQSSCRRVALMITAVWVLAFAVSCPLLFGFNTT
:::::::::::::::::.::. :. : :: :::..::. ::::.:..:::::::.:..
CCDS83 ASILNLCAISIDRYTAVAMPMLYN--TRYSSKRRVTVMISIVWVLSFTISCPLLFGLNNA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 GDPTVCSISNPDFVIYSSVVSFYLPFGVTVLVYARIYVVLKQRRRKRILTRQNSQC----
: . : :.:: ::.:::.::::.:: ::.::: .::.::. :::::. :...:.
CCDS83 -DQNECIIANPAFVVYSSIVSFYVPFIVTLLVYIKIYIVLR-RRRKRVNTKRSSRAFRAH
180 190 200 210 220 230
240 250
pF1KB6 -------NSVRP--------------GFPQQTLSPDPAH----LELK-----------RY
: ..: .:: . . :. ::.. ::
CCDS83 LRAPLKGNCTHPEDMKLCTVIMKSNGSFPVNRRRVEAARRAQELEMEMLSSTSPPERTRY
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300
pF1KB6 YSI---CQDTALGGP---GFQERGGELKREEKTRNSLS-PTIAPKLSLEVRKLSNGRLST
: .. .: : :.. . ::. .. . : :: :. .:.. . ::. :
CCDS83 SPIPPSHHQLTLPDPSHHGLHSTPDSPAKPEKNGHAKDHPKIA-KI-FEIQTMPNGKTRT
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 SLKLGPLQPRGVPL-REKKATQMVAIVLGAFIVCWLPFFLTHVLNTHCQTCHVSPELYSA
::: .. : . .:::::::.:::::.::.::::::.::.:: ::. :.. : ::::
CCDS83 SLKT--MSRRKLSQQKEKKATQMLAIVLGVFIICWLPFFITHILNIHCD-CNIPPVLYSA
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400
pF1KB6 TTWLGYVNSALNPVIYTTFNIEFRKAFLKILSC
:::::::::.::.:::::::::::::
CCDS83 FTWLGYVNSAVNPIIYTTFNIEFRKAFLKILHC
420 430 440
>>CCDS8362.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 (414 aa)
initn: 1057 init1: 303 opt: 896 Z-score: 777.6 bits: 152.8 E(32554): 5.4e-37
Smith-Waterman score: 1323; 56.7% identity (75.1% similar) in 402 aa overlap (19-400:23-414)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MASLSQLSGHLNYTCGAENSTGASQARPH-AYYALSYCALILAIVFGNGLVCMAVL
:.. .. ::: ::: :: .::::: ::::::
CCDS83 MDPLNLSWYDDDLERQNWSRPFNGSDGKADRPHYNYYATLLTLLIAVIVFGNVLVCMAVS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 KERALQTTTNYLVVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVTGGVWNFSRICCDVFVTLDVMMCT
.:.:::::::::.:::::::::::::::::::::::.: :.:::: ::.::::::::::
CCDS83 REKALQTTTNYLIVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVVGE-WKFSRIHCDIFVTLDVMMCT
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 ASILNLCAISIDRYTAVVMPVHYQHGTGQSSCRRVALMITAVWVLAFAVSCPLLFGFNTT
:::::::::::::::::.::. : .: :: :::..::. ::::.:..:::::::.:..
CCDS83 ASILNLCAISIDRYTAVAMPMLY--NTRYSSKRRVTVMISIVWVLSFTISCPLLFGLNNA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 GDPTVCSISNPDFVIYSSVVSFYLPFGVTVLVYARIYVVLKQRRRKRILTRQNSQCNSVR
: . : :.:: ::.:::.::::.:: ::.::: .::.::. :::::. :...:. ..
CCDS83 -DQNECIIANPAFVVYSSIVSFYVPFIVTLLVYIKIYIVLR-RRRKRVNTKRSSRAFRAH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270
pF1KB6 PGFPQQTLSPDPAHLELK-----------RYYSI---CQDTALGGP---GFQERGGELKR
: . . .::.. :: : .. .: : :.. .
CCDS83 LRAPLKEAARRAQELEMEMLSSTSPPERTRYSPIPPSHHQLTLPDPSHHGLHSTPDSPAK
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 EEKTRNSLS-PTIAPKLSLEVRKLSNGRLSTSLKLGPLQPRGVPL-REKKATQMVAIVLG
::. .. . : :: :. .:.. . ::. :::: .. : . .:::::::.:::::
CCDS83 PEKNGHAKDHPKIA-KI-FEIQTMPNGKTRTSLK--TMSRRKLSQQKEKKATQMLAIVLG
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 AFIVCWLPFFLTHVLNTHCQTCHVSPELYSATTWLGYVNSALNPVIYTTFNIEFRKAFLK
.::.::::::.::.:: ::. :.. : :::: :::::::::.::.:::::::::::::::
CCDS83 VFIICWLPFFITHILNIHCD-CNIPPVLYSAFTWLGYVNSAVNPIIYTTFNIEFRKAFLK
360 370 380 390 400 410
400
pF1KB6 ILSC
:: :
CCDS83 ILHC
>>CCDS7710.1 DRD4 gene_id:1815|Hs108|chr11 (419 aa)
initn: 871 init1: 403 opt: 596 Z-score: 523.1 bits: 105.7 E(32554): 8.2e-23
Smith-Waterman score: 884; 40.9% identity (63.7% similar) in 408 aa overlap (16-400:21-418)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MASLSQLSGHLNYTCGAENSTGASQARPHAYYALSYCALILAIVFGNGLVCMAVL
:: ...:. : : .. :: :.. ::.:::..:
CCDS77 MGNRSTADADGLLAGRGPAAGASAGASAGLAGQGAAALVGGVLLIGAVLAGNSLVCVSVA
10 20 30 40 50 60
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pF1KB6 KERALQTTTNYLVVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVTGGVWNFSRICCDVFVTLDVMMCT
:::::: :: ..::::.::::.: ::.: :: :: ::.: .: ::.....:::.::
CCDS77 TERALQTPTNSFIVSLAAADLLLALLVLPLFVYSEVQGGAWLLSPRLCDALMAMDVMLCT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 ASILNLCAISIDRYTAVVMPVHYQHGTGQSSCRRVALMITAVWVLAFAVSCPLLFGFNTT
:::.::::::.::..::..:..:.. :.. :: :.: :.:.:. ::. :.: :.: .
CCDS77 ASIFNLCAISVDRFVAVAVPLRYNR---QGGSRRQLLLIGATWLLSAAVAAPVLCGLNDV
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 -G-DPTVCSISNPDFVIYSSVVSFYLPFGVTVLVYARIYVVLKQ---RRRKRILTRQNSQ
: ::.:: . . :.:.:::: ::.:: . .:.: . :.. :: .. : .
CCDS77 RGRDPAVCRLEDRDYVVYSSVCSFFLPCPLMLLLYWATFRGLQRWEVARRAKLHGRAPRR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB6 CNSVRPGFPQQTLSPDPAHLELKRYYSICQDTALG------GPGFQERGGELKREEKTRN
.. :: :. : : : .: : : : :: . : .. .
CCDS77 PSG--PGPPSPT-PPAP-RLPQDPCGPDCAPPAPGLPRGPCGPDCAPAAPSLPQDPCGPD
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KB6 SLSPTIAPKLSLEVRKLSNGRLSTSLKLGPLQPRGVPL-----------REKKATQMVAI
: :: : . :: ... . : :. : ::.:: ... .
CCDS77 CAPP--APGLPPDPCG-SNCAPPDAVRAAALPPQTPPQTRRRRRAKITGRERKAMRVLPV
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 VLGAFIVCWLPFFLTHVLNTHCQTCHVSPELYSATTWLGYVNSALNPVIYTTFNIEFRKA
:.:::..:: :::..:. .. : .: : :.: ::.::::::::::::::::.:: :::..
CCDS77 VVGAFLLCWTPFFVVHITQALCPACSVPPRLVSAVTWLGYVNSALNPVIYTVFNAEFRNV
360 370 380 390 400 410
400
pF1KB6 FLKIL-SC
: : : .:
CCDS77 FRKALRACC
>>CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5 (422 aa)
initn: 602 init1: 185 opt: 487 Z-score: 430.6 bits: 88.6 E(32554): 1.2e-17
Smith-Waterman score: 734; 32.8% identity (65.7% similar) in 408 aa overlap (19-400:24-417)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MASLSQLSGHLNYTCGAENSTGASQARP--HAYYALSYCALILAIVFGNGLVCMA
:.:: :.. .. .: .::. :.::. : :
CCDS34 MDVLSPGQGNNTTSPPAPFETGGNTTGISDVTVSYQVITSLLLGTLIFCAVLGNACVVAA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 VLKERALQTTTNYLVVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVTGGVWNFSRICCDVFVTLDVMM
. ::.::...:::. ::::.::.:..::.: .. .: . :..... ::.:..:::.
CCDS34 IALERSLQNVANYLIGSLAVTDLMVSVLVLPMAALYQVLNK-WTLGQVTCDLFIALDVLC
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 CTASILNLCAISIDRYTAVVMPVHYQHGTGQSSCRRVALMITAVWVLAFAVSCPLLFGFN
::.:::.::::..::: :.. :. : ... . ::.: .:. .:...: .: : ..:.
CCDS34 CTSSILHLCAIALDRYWAITDPIDY---VNKRTPRRAAALISLTWLIGFLISIPPMLGWR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB6 TT---GDPTVCSIS-NPDFVIYSSVVSFYLPFGVTVLVYARIYVVLKQRRRKRILTRQNS
: .:: .:.:: . ..:::. .::.:. . ...:.::. . . : :: . ...
CCDS34 TPEDRSDPDACTISKDHGYTIYSTFGAFYIPLLLMLVLYGRIFRAARFRIRKTVKKVEKT
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KB6 QCNSVRPGF-----PQQTLSPDPAH------LELKRYYSICQDTAL--GGPGFQERGGEL
.. : : :..... . . .: : ..: . :. : : . :.
CCDS34 GADT-RHGASPAPQPKKSVNGESGSRNWRLGVESKAGGALCANGAVRQGDDGAALEVIEV
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 KREEKTRNSL------SPTIAPKLSLEVRKLSNGRLSTSLKLGPLQPRGVPLREKKATQM
.: .... : .:: :.: .. :.. . .. :. ::.:...
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CCDS34 LGIIMGTFILCWLPFFIVALVLPFCESSCHMPTLLGAIINWLGYSNSLLNPVIYAYFNKD
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390 400
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CCDS34 FQNAFKKIIKCKFCRQ
410 420
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CCDS75 AWCEIYLALDVLFCTSSIVHLCAISLDRYWSITQAIEYNL---KRTPRRIKAIIITVWVI
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CCDS75 SAVISFPPLISIEKKGGGGGPQPAEPRCEINDQKWYVISSCIGSFFAPCLIMILVYVRIY
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220 230 240
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CCDS75 QIAKRRTRVPPSRRGPDAVAAPPGGTERRPNGLGPERSAGPGGAEAEPLPTQLNGAPGEP
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250 260 270 280 290
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CCDS75 APAGPRDTDALDLEESSSSDHAERPPGPRRPERGPRGKG--KARAS---QVKPGDSLPRR
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300 310 320 330 340
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CCDS75 GPGATGIGTP-AAGPGEERVGAAKASRWRGRQNREKRFTFVLAVVIGVFVVCWFPFFFTY
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CCDS75 TLTA--VGCSVPRTLFKFFFWFGYCNSSLNPVIYTIFNHDFRRAFKKILCRGDRKRIV
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..:.:
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CCDS74 NVFIAMDVMCCTASIMTLCVISIDRYLGITRPLTYPVRQNG----KC--MAKMILSVWLL
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CCDS74 SASITLPPLFGWAQNVNDDKVCLISQ-DFGYTIYSTAVAFYIPMSVMLFMYYQIY---KA
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220 230 240 250 260 270
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CCDS74 ARK--------SAAKHKFPGFPR--VEPDSV-------------IALNG-----------
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CCDS74 -------------IVKLQKEVEECAN--LSRLLK-HERKNISIFKREQKAATTLGIIVGA
300 310 320 330
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pF1KB6 FIVCWLPFFLTHVLNTH-CQT-CHVSPELYSAT-TWLGYVNSALNPVIYTTFNIEFRKAF
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CCDS74 FTVCWLPFFLLSTARPFICGTSCSCIPLWVERTFLWLGYANSLINPFIYAFFNRDLRTTY
340 350 360 370 380 390
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pF1KB6 LKILSC
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CCDS74 RSLLQCQYRNINRKLSAAGMHEALKLAERPERPEFVLQNADYCRKKGHDS
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400 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]