Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6580
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6580, 403 aa
1>>>pF1KB6580 403 - 403 aa - 403 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1453+/-0.000916; mu= 12.8536+/- 0.055
mean_var=88.1687+/-17.938, 0's: 0 Z-trim(106.3): 67 B-trim: 128 in 1/51
Lambda= 0.136589
statistics sampled from 8846 (8908) to 8846 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.648), E-opt: 0.2 (0.274), width: 16
Scan time: 2.420
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31238.1 PTEN gene_id:5728|Hs108|chr10 ( 403) 2776 557.2 9.5e-159
CCDS45013.1 TPTE2 gene_id:93492|Hs108|chr13 ( 411) 657 139.7 4.8e-33
CCDS9285.1 TPTE2 gene_id:93492|Hs108|chr13 ( 445) 657 139.7 5.1e-33
CCDS45014.1 TPTE2 gene_id:93492|Hs108|chr13 ( 522) 657 139.7 5.9e-33
CCDS77617.1 TPTE gene_id:7179|Hs108|chr21 ( 413) 616 131.6 1.3e-30
CCDS74773.1 TPTE gene_id:7179|Hs108|chr21 ( 513) 616 131.7 1.6e-30
CCDS74772.1 TPTE gene_id:7179|Hs108|chr21 ( 533) 616 131.7 1.6e-30
CCDS74771.1 TPTE gene_id:7179|Hs108|chr21 ( 551) 616 131.7 1.7e-30
CCDS5506.2 TNS3 gene_id:64759|Hs108|chr7 (1445) 503 109.6 1.9e-23
CCDS77528.1 TNS1 gene_id:7145|Hs108|chr2 (1714) 493 107.7 8.5e-23
CCDS77529.1 TNS1 gene_id:7145|Hs108|chr2 (1721) 493 107.7 8.6e-23
CCDS2407.1 TNS1 gene_id:7145|Hs108|chr2 (1735) 493 107.7 8.6e-23
CCDS8844.1 TNS2 gene_id:23371|Hs108|chr12 (1285) 456 100.3 1.1e-20
CCDS8843.1 TNS2 gene_id:23371|Hs108|chr12 (1409) 456 100.4 1.1e-20
CCDS8842.1 TNS2 gene_id:23371|Hs108|chr12 (1419) 456 100.4 1.1e-20
CCDS82902.1 GAK gene_id:2580|Hs108|chr4 (1232) 413 91.9 3.6e-18
CCDS3340.1 GAK gene_id:2580|Hs108|chr4 (1311) 413 91.9 3.8e-18
CCDS58005.1 DNAJC6 gene_id:9829|Hs108|chr1 ( 900) 391 87.4 5.6e-17
CCDS30739.1 DNAJC6 gene_id:9829|Hs108|chr1 ( 913) 391 87.5 5.7e-17
CCDS58004.1 DNAJC6 gene_id:9829|Hs108|chr1 ( 970) 391 87.5 5.9e-17
>>CCDS31238.1 PTEN gene_id:5728|Hs108|chr10 (403 aa)
initn: 2776 init1: 2776 opt: 2776 Z-score: 2963.5 bits: 557.2 E(32554): 9.5e-159
Smith-Waterman score: 2776; 100.0% identity (100.0% similar) in 403 aa overlap (1-403:1-403)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MTAIIKEIVSRNKRRYQEDGFDLDLTYIYPNIIAMGFPAERLEGVYRNNIDDVVRFLDSK
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CCDS31 MTAIIKEIVSRNKRRYQEDGFDLDLTYIYPNIIAMGFPAERLEGVYRNNIDDVVRFLDSK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 HKNHYKIYNLCAERHYDTAKFNCRVAQYPFEDHNPPQLELIKPFCEDLDQWLSEDDNHVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HKNHYKIYNLCAERHYDTAKFNCRVAQYPFEDHNPPQLELIKPFCEDLDQWLSEDDNHVA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 AIHCKAGKGRTGVMICAYLLHRGKFLKAQEALDFYGEVRTRDKKGVTIPSQRRYVYYYSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AIHCKAGKGRTGVMICAYLLHRGKFLKAQEALDFYGEVRTRDKKGVTIPSQRRYVYYYSY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LLKNHLDYRPVALLFHKMMFETIPMFSGGTCNPQFVVCQLKVKIYSSNSGPTRREDKFMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LLKNHLDYRPVALLFHKMMFETIPMFSGGTCNPQFVVCQLKVKIYSSNSGPTRREDKFMY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 FEFPQPLPVCGDIKVEFFHKQNKMLKKDKMFHFWVNTFFIPGPEETSEKVENGSLCDQEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FEFPQPLPVCGDIKVEFFHKQNKMLKKDKMFHFWVNTFFIPGPEETSEKVENGSLCDQEI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 DSICSIERADNDKEYLVLTLTKNDLDKANKDKANRYFSPNFKVKLYFTKTVEEPSNPEAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DSICSIERADNDKEYLVLTLTKNDLDKANKDKANRYFSPNFKVKLYFTKTVEEPSNPEAS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KB6 SSTSVTPDVSDNEPDHYRYSDTTDSDPENEPFDEDQHTQITKV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SSTSVTPDVSDNEPDHYRYSDTTDSDPENEPFDEDQHTQITKV
370 380 390 400
>>CCDS45013.1 TPTE2 gene_id:93492|Hs108|chr13 (411 aa)
initn: 733 init1: 588 opt: 657 Z-score: 706.7 bits: 139.7 E(32554): 4.8e-33
Smith-Waterman score: 738; 37.1% identity (61.2% similar) in 361 aa overlap (1-347:86-408)
10 20 30
pF1KB6 MTAIIKEIVSRNKRRYQEDGFDLDLTYIYP
. .....::.::::: .:::::::::.
CCDS45 VASYEWTHLVRLLRLIILIRIFHLLHQKRQLEKLMRRLVSENKRRYTRDGFDLDLTYVTE
60 70 80 90 100 110
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 NIIAMGFPAERLEGVYRNNIDDVVRFLDSKHKNHYKIYNLCAERHYDTAKFNCRVAQYPF
::::.::. .. ::: :..::::::.::.:::..::::.:: :: .:. ::.. .
CCDS45 RIIAMSFPSSGRQSFYRNPIEEVVRFLDKKHRNHYRVYNLCSERAYDPKHFHNRVSRIMI
120 130 140 150 160 170
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 EDHNPPQLELIKPFCEDLDQWLSEDDNHVAAIHCKAGKGRTGVMICAYLLHRGKFLKAQE
.::: : :. . : .....:...: ....:::::.::::::.:.:: :. :: :.:
CCDS45 DDHNVPTLHEMVVFTKEVNEWMAQDLENIVAIHCKGGKGRTGTMVCALLIASEIFLTAEE
180 190 200 210 220 230
160 170 180 190 200
pF1KB6 ALDFYGEVRTRDK-----KGVTIPSQRRYVYYYSYLLKNHL---DYRPVALLFHKMMFET
.: ..:: :: .:: ::: ::: :.. . .:: . : .:: : ..
CCDS45 SLYYFGERRTNKTHSNKFQGVETPSQNRYVGYFAQV--KHLYNWNLPPRRILFIKRFI--
240 250 260 270 280 290
210 220 230 240 250
pF1KB6 IPMFSGGTCNPQFVVCQLKVKIYSSNS-GPTR-----REDKFMYFEFPQPLPVCGDIKVE
: . : .:. . : . : ..::.: : . ::.. . : :. :.::.
CCDS45 IYSIRGDVCDLKVQVVMEKKVVFSSTSLGNCSILHDIETDKILINVYDGP-PLYDDVKVQ
300 310 320 330 340 350
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 FFHKQNKMLKKDKMFHFWVNTFFIPGPEETSEKVENGSLCDQEIDSICSIERADNDKEYL
:: .. . : :: :: :: .:. ::
CCDS45 FFSSNLPKYYDNCPFFFWFNTSFI----------QNNRLC--------------------
360 370 380
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 VLTLTKNDLDKANKDKANRYFSPNFKVKLYFTKTVEEPSNPEASSSTSVTPDVSDNEPDH
: .:.::. .:.:: . . :.: :.. :
CCDS45 ---LPRNELDNPHKQKAWKIYPPEFAVEILFGEK
390 400 410
380 390 400
pF1KB6 YRYSDTTDSDPENEPFDEDQHTQITKV
>>CCDS9285.1 TPTE2 gene_id:93492|Hs108|chr13 (445 aa)
initn: 733 init1: 588 opt: 657 Z-score: 706.2 bits: 139.7 E(32554): 5.1e-33
Smith-Waterman score: 738; 37.1% identity (61.2% similar) in 361 aa overlap (1-347:120-442)
10 20 30
pF1KB6 MTAIIKEIVSRNKRRYQEDGFDLDLTYIYP
. .....::.::::: .:::::::::.
CCDS92 VFVEGWTHLVRLLRLIILIRIFHLLHQKRQLEKLMRRLVSENKRRYTRDGFDLDLTYVTE
90 100 110 120 130 140
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 NIIAMGFPAERLEGVYRNNIDDVVRFLDSKHKNHYKIYNLCAERHYDTAKFNCRVAQYPF
::::.::. .. ::: :..::::::.::.:::..::::.:: :: .:. ::.. .
CCDS92 RIIAMSFPSSGRQSFYRNPIEEVVRFLDKKHRNHYRVYNLCSERAYDPKHFHNRVSRIMI
150 160 170 180 190 200
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 EDHNPPQLELIKPFCEDLDQWLSEDDNHVAAIHCKAGKGRTGVMICAYLLHRGKFLKAQE
.::: : :. . : .....:...: ....:::::.::::::.:.:: :. :: :.:
CCDS92 DDHNVPTLHEMVVFTKEVNEWMAQDLENIVAIHCKGGKGRTGTMVCALLIASEIFLTAEE
210 220 230 240 250 260
160 170 180 190 200
pF1KB6 ALDFYGEVRTRDK-----KGVTIPSQRRYVYYYSYLLKNHL---DYRPVALLFHKMMFET
.: ..:: :: .:: ::: ::: :.. . .:: . : .:: : ..
CCDS92 SLYYFGERRTNKTHSNKFQGVETPSQNRYVGYFAQV--KHLYNWNLPPRRILFIKRFI--
270 280 290 300 310 320
210 220 230 240 250
pF1KB6 IPMFSGGTCNPQFVVCQLKVKIYSSNS-GPTR-----REDKFMYFEFPQPLPVCGDIKVE
: . : .:. . : . : ..::.: : . ::.. . : :. :.::.
CCDS92 IYSIRGDVCDLKVQVVMEKKVVFSSTSLGNCSILHDIETDKILINVYDGP-PLYDDVKVQ
330 340 350 360 370 380
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 FFHKQNKMLKKDKMFHFWVNTFFIPGPEETSEKVENGSLCDQEIDSICSIERADNDKEYL
:: .. . : :: :: :: .:. ::
CCDS92 FFSSNLPKYYDNCPFFFWFNTSFI----------QNNRLC--------------------
390 400 410
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 VLTLTKNDLDKANKDKANRYFSPNFKVKLYFTKTVEEPSNPEASSSTSVTPDVSDNEPDH
: .:.::. .:.:: . . :.: :.. :
CCDS92 ---LPRNELDNPHKQKAWKIYPPEFAVEILFGEK
420 430 440
380 390 400
pF1KB6 YRYSDTTDSDPENEPFDEDQHTQITKV
>>CCDS45014.1 TPTE2 gene_id:93492|Hs108|chr13 (522 aa)
initn: 733 init1: 588 opt: 657 Z-score: 705.2 bits: 139.7 E(32554): 5.9e-33
Smith-Waterman score: 738; 37.1% identity (61.2% similar) in 361 aa overlap (1-347:197-519)
10 20 30
pF1KB6 MTAIIKEIVSRNKRRYQEDGFDLDLTYIYP
. .....::.::::: .:::::::::.
CCDS45 RNIPRWTHLVRLLRLIILIRIFHLLHQKRQLEKLMRRLVSENKRRYTRDGFDLDLTYVTE
170 180 190 200 210 220
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 NIIAMGFPAERLEGVYRNNIDDVVRFLDSKHKNHYKIYNLCAERHYDTAKFNCRVAQYPF
::::.::. .. ::: :..::::::.::.:::..::::.:: :: .:. ::.. .
CCDS45 RIIAMSFPSSGRQSFYRNPIEEVVRFLDKKHRNHYRVYNLCSERAYDPKHFHNRVSRIMI
230 240 250 260 270 280
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 EDHNPPQLELIKPFCEDLDQWLSEDDNHVAAIHCKAGKGRTGVMICAYLLHRGKFLKAQE
.::: : :. . : .....:...: ....:::::.::::::.:.:: :. :: :.:
CCDS45 DDHNVPTLHEMVVFTKEVNEWMAQDLENIVAIHCKGGKGRTGTMVCALLIASEIFLTAEE
290 300 310 320 330 340
160 170 180 190 200
pF1KB6 ALDFYGEVRTRDK-----KGVTIPSQRRYVYYYSYLLKNHL---DYRPVALLFHKMMFET
.: ..:: :: .:: ::: ::: :.. . .:: . : .:: : ..
CCDS45 SLYYFGERRTNKTHSNKFQGVETPSQNRYVGYFAQV--KHLYNWNLPPRRILFIKRFI--
350 360 370 380 390 400
210 220 230 240 250
pF1KB6 IPMFSGGTCNPQFVVCQLKVKIYSSNS-GPTR-----REDKFMYFEFPQPLPVCGDIKVE
: . : .:. . : . : ..::.: : . ::.. . : :. :.::.
CCDS45 IYSIRGDVCDLKVQVVMEKKVVFSSTSLGNCSILHDIETDKILINVYDGP-PLYDDVKVQ
410 420 430 440 450 460
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 FFHKQNKMLKKDKMFHFWVNTFFIPGPEETSEKVENGSLCDQEIDSICSIERADNDKEYL
:: .. . : :: :: :: .:. ::
CCDS45 FFSSNLPKYYDNCPFFFWFNTSFI----------QNNRLC--------------------
470 480 490
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 VLTLTKNDLDKANKDKANRYFSPNFKVKLYFTKTVEEPSNPEASSSTSVTPDVSDNEPDH
: .:.::. .:.:: . . :.: :.. :
CCDS45 ---LPRNELDNPHKQKAWKIYPPEFAVEILFGEK
500 510 520
380 390 400
pF1KB6 YRYSDTTDSDPENEPFDEDQHTQITKV
>>CCDS77617.1 TPTE gene_id:7179|Hs108|chr21 (413 aa)
initn: 747 init1: 553 opt: 616 Z-score: 663.0 bits: 131.6 E(32554): 1.3e-30
Smith-Waterman score: 685; 34.9% identity (61.8% similar) in 361 aa overlap (1-347:77-399)
10 20 30
pF1KB6 MTAIIKEIVSRNKRRYQEDGFDLDLTYIYP
. .:.. ::.::::: .:::::::::.
CCDS77 RNIPRWTHLLRLLRLIILLRIFHLFHQKRQLEKLIRRRVSENKRRYTRDGFDLDLTYVTE
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 NIIAMGFPAERLEGVYRNNIDDVVRFLDSKHKNHYKIYNLCAERHYDTAKFNCRVAQYPF
::::.::. .. ::: : .::::::.::.:::..::::.:: :: .:. ::.. .
CCDS77 RIIAMSFPSSGRQSFYRNPIKEVVRFLDKKHRNHYRVYNLCSERAYDPKHFHNRVVRIMI
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 EDHNPPQLELIKPFCEDLDQWLSEDDNHVAAIHCKAGKGRTGVMICAYLLHRGKFLKAQE
.::: : :. . : .....:...: ....:::::.: :::.:.::.:. :.:
CCDS77 DDHNVPTLHQMVVFTKEVNEWMAQDLENIVAIHCKGGTDRTGTMVCAFLIASEICSTAKE
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200
pF1KB6 ALDFYGEVRTRDK------KGVTIPSQRRYVYYYS---YLLKNHLDYRPVALLFHKMMFE
.: ..:: :: :: .:: :::.::: :.. .: . .: : . .. : ...
CCDS77 SLYYFGERRT-DKTHSEKFQGVKTPSQKRYVAYFAQVKHLYNWNLPPRRILFIKHFIIY-
230 240 250 260 270 280
210 220 230 240 250
pF1KB6 TIPMFSGGTCNPQFVVCQLKVKIYSSNS-GPTRREDKF----MYFEFPQPLPVCGDIKVE
.:: . . . .. . . : ..:. : : :.. . .. . ::. :.::.
CCDS77 SIPRY---VRDLKIQIEMEKKVVFSTISLGKCSVLDNITTDKILIDVFDGLPLYDDVKVQ
290 300 310 320 330 340
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 FFHKQNKMLKKDKMFHFWVNTFFIPGPEETSEKVENGSLCDQEIDSICSIERADNDKEYL
::... . :.::..: :: .:.. :
CCDS77 FFYSNLPTYYDNCSFYFWLHTSFI-----------------------------ENNRLY-
350 360 370
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 VLTLTKNDLDKANKDKANRYFSPNFKVKLYFTKTVEEPSNPEASSSTSVTPDVSDNEPDH
: ::.::. .:.:: : . .: :.. :
CCDS77 ---LPKNELDNLHKQKARRIYPSDFAVEILFGEKMTSSDVVAGSD
380 390 400 410
380 390 400
pF1KB6 YRYSDTTDSDPENEPFDEDQHTQITKV
>>CCDS74773.1 TPTE gene_id:7179|Hs108|chr21 (513 aa)
initn: 747 init1: 553 opt: 616 Z-score: 661.6 bits: 131.7 E(32554): 1.6e-30
Smith-Waterman score: 685; 34.9% identity (61.8% similar) in 361 aa overlap (1-347:177-499)
10 20 30
pF1KB6 MTAIIKEIVSRNKRRYQEDGFDLDLTYIYP
. .:.. ::.::::: .:::::::::.
CCDS74 RNIPRWTHLLRLLRLIILLRIFHLFHQKRQLEKLIRRRVSENKRRYTRDGFDLDLTYVTE
150 160 170 180 190 200
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 NIIAMGFPAERLEGVYRNNIDDVVRFLDSKHKNHYKIYNLCAERHYDTAKFNCRVAQYPF
::::.::. .. ::: : .::::::.::.:::..::::.:: :: .:. ::.. .
CCDS74 RIIAMSFPSSGRQSFYRNPIKEVVRFLDKKHRNHYRVYNLCSERAYDPKHFHNRVVRIMI
210 220 230 240 250 260
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 EDHNPPQLELIKPFCEDLDQWLSEDDNHVAAIHCKAGKGRTGVMICAYLLHRGKFLKAQE
.::: : :. . : .....:...: ....:::::.: :::.:.::.:. :.:
CCDS74 DDHNVPTLHQMVVFTKEVNEWMAQDLENIVAIHCKGGTDRTGTMVCAFLIASEICSTAKE
270 280 290 300 310 320
160 170 180 190 200
pF1KB6 ALDFYGEVRTRDK------KGVTIPSQRRYVYYYS---YLLKNHLDYRPVALLFHKMMFE
.: ..:: :: :: .:: :::.::: :.. .: . .: : . .. : ...
CCDS74 SLYYFGERRT-DKTHSEKFQGVKTPSQKRYVAYFAQVKHLYNWNLPPRRILFIKHFIIY-
330 340 350 360 370 380
210 220 230 240 250
pF1KB6 TIPMFSGGTCNPQFVVCQLKVKIYSSNS-GPTRREDKF----MYFEFPQPLPVCGDIKVE
.:: . . . .. . . : ..:. : : :.. . .. . ::. :.::.
CCDS74 SIPRY---VRDLKIQIEMEKKVVFSTISLGKCSVLDNITTDKILIDVFDGLPLYDDVKVQ
390 400 410 420 430 440
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 FFHKQNKMLKKDKMFHFWVNTFFIPGPEETSEKVENGSLCDQEIDSICSIERADNDKEYL
::... . :.::..: :: .:.. :
CCDS74 FFYSNLPTYYDNCSFYFWLHTSFI-----------------------------ENNRLY-
450 460 470
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 VLTLTKNDLDKANKDKANRYFSPNFKVKLYFTKTVEEPSNPEASSSTSVTPDVSDNEPDH
: ::.::. .:.:: : . .: :.. :
CCDS74 ---LPKNELDNLHKQKARRIYPSDFAVEILFGEKMTSSDVVAGSD
480 490 500 510
380 390 400
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>>CCDS74772.1 TPTE gene_id:7179|Hs108|chr21 (533 aa)
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