Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6582
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6582, 404 aa
1>>>pF1KB6582 404 - 404 aa - 404 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5935+/-0.00084; mu= 13.1046+/- 0.051
mean_var=120.6550+/-24.175, 0's: 0 Z-trim(111.3): 16 B-trim: 396 in 1/51
Lambda= 0.116762
statistics sampled from 12293 (12307) to 12293 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.725), E-opt: 0.2 (0.378), width: 16
Scan time: 3.170
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2778.1 PRKAR2A gene_id:5576|Hs108|chr3 ( 404) 2662 459.1 3.3e-129
CCDS82771.1 PRKAR2A gene_id:5576|Hs108|chr3 ( 382) 1921 334.3 1.2e-91
CCDS5740.1 PRKAR2B gene_id:5577|Hs108|chr7 ( 418) 1601 280.4 2.2e-75
CCDS11678.1 PRKAR1A gene_id:5573|Hs108|chr17 ( 381) 777 141.5 1.2e-33
CCDS34579.1 PRKAR1B gene_id:5575|Hs108|chr7 ( 381) 771 140.5 2.5e-33
CCDS62307.1 PRKAR1A gene_id:5573|Hs108|chr17 ( 337) 589 109.8 3.8e-24
CCDS64005.1 PRKG2 gene_id:5593|Hs108|chr4 ( 733) 468 89.7 9.5e-18
CCDS3589.1 PRKG2 gene_id:5593|Hs108|chr4 ( 762) 468 89.7 9.8e-18
CCDS7244.1 PRKG1 gene_id:5592|Hs108|chr10 ( 686) 456 87.7 3.7e-17
CCDS44399.1 PRKG1 gene_id:5592|Hs108|chr10 ( 671) 445 85.8 1.3e-16
>>CCDS2778.1 PRKAR2A gene_id:5576|Hs108|chr3 (404 aa)
initn: 2662 init1: 2662 opt: 2662 Z-score: 2433.1 bits: 459.1 E(32554): 3.3e-129
Smith-Waterman score: 2662; 100.0% identity (100.0% similar) in 404 aa overlap (1-404:1-404)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSHIQIPPGLTELLQGYTVEVLRQQPPDLVEFAVEYFTRLREARAPASVLPAATPRQSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 MSHIQIPPGLTELLQGYTVEVLRQQPPDLVEFAVEYFTRLREARAPASVLPAATPRQSLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 HPPPEPGPDRVADAKGDSESEEDEDLEVPVPSRFNRRVSVCAETYNPDEEEEDTDPRVIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 HPPPEPGPDRVADAKGDSESEEDEDLEVPVPSRFNRRVSVCAETYNPDEEEEDTDPRVIH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 PKTDEQRCRLQEACKDILLFKNLDQEQLSQVLDAMFERIVKADEHVIDQGDDGDNFYVIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 PKTDEQRCRLQEACKDILLFKNLDQEQLSQVLDAMFERIVKADEHVIDQGDDGDNFYVIE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 RGTYDILVTKDNQTRSVGQYDNRGSFGELALMYNTPRAATIVATSEGSLWGLDRVTFRRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 RGTYDILVTKDNQTRSVGQYDNRGSFGELALMYNTPRAATIVATSEGSLWGLDRVTFRRI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 IVKNNAKKRKMFESFIESVPLLKSLEVSERMKIVDVIGEKIYKDGERIITQGEKADSFYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 IVKNNAKKRKMFESFIESVPLLKSLEVSERMKIVDVIGEKIYKDGERIITQGEKADSFYI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 IESGEVSILIRSRTKSNKDGGNQEVEIARCHKGQYFGELALVTNKPRAASAYAVGDVKCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 IESGEVSILIRSRTKSNKDGGNQEVEIARCHKGQYFGELALVTNKPRAASAYAVGDVKCL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KB6 VMDVQAFERLLGPCMDIMKRNISHYEEQLVKMFGSSVDLGNLGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 VMDVQAFERLLGPCMDIMKRNISHYEEQLVKMFGSSVDLGNLGQ
370 380 390 400
>>CCDS82771.1 PRKAR2A gene_id:5576|Hs108|chr3 (382 aa)
initn: 1921 init1: 1921 opt: 1921 Z-score: 1758.8 bits: 334.3 E(32554): 1.2e-91
Smith-Waterman score: 2475; 94.6% identity (94.6% similar) in 404 aa overlap (1-404:1-382)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSHIQIPPGLTELLQGYTVEVLRQQPPDLVEFAVEYFTRLREARAPASVLPAATPRQSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MSHIQIPPGLTELLQGYTVEVLRQQPPDLVEFAVEYFTRLREARAPASVLPAATPRQSLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 HPPPEPGPDRVADAKGDSESEEDEDLEVPVPSRFNRRVSVCAETYNPDEEEEDTDPRVIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 HPPPEPGPDRVADAKGDSESEEDEDLEVPVPSRFNRRVSVCAETYNPDEEEEDTDPRVIH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 PKTDEQRCRLQEACKDILLFKNLDQEQLSQVLDAMFERIVKADEHVIDQGDDGDNFYVIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PKTDEQRCRLQEACKDILLFKNLDQEQLSQVLDAMFERIVKADEHVIDQGDDGDNFYVIE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 RGTYDILVTKDNQTRSVGQYDNRGSFGELALMYNTPRAATIVATSEGSLWGLDRVTFRRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RGTYDILVTKDNQTRSVGQYDNRGSFGELALMYNTPRAATIVATSEGSLWGLDRVTFRRI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 IVKNNAKKRKMFESFIESVPLLKSLEVSERMKIVDVIGEKIYKDGERIITQGEKADSFYI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 IVKNNAKKRKMFESFIESVPLLKSLEVSERMKIVDVIGEKIYKDGERIITQ---------
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 IESGEVSILIRSRTKSNKDGGNQEVEIARCHKGQYFGELALVTNKPRAASAYAVGDVKCL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 -------------TKSNKDGGNQEVEIARCHKGQYFGELALVTNKPRAASAYAVGDVKCL
300 310 320 330
370 380 390 400
pF1KB6 VMDVQAFERLLGPCMDIMKRNISHYEEQLVKMFGSSVDLGNLGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VMDVQAFERLLGPCMDIMKRNISHYEEQLVKMFGSSVDLGNLGQ
340 350 360 370 380
>>CCDS5740.1 PRKAR2B gene_id:5577|Hs108|chr7 (418 aa)
initn: 1767 init1: 1187 opt: 1601 Z-score: 1467.0 bits: 280.4 E(32554): 2.2e-75
Smith-Waterman score: 1759; 66.7% identity (84.0% similar) in 412 aa overlap (4-399:3-413)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSHIQIPPGLTELLQGYTVEVLRQQPPDLVEFAVEYFTRLR---EARAPASVLPAATPRQ
:.:: ::::::::.::::::.:: ::.:::...::::. : .. : .
CCDS57 MSIEIPAGLTELLQGFTVEVLRHQPADLLEFALQHFTRLQQENERKGTARFGHEGRTWG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KB6 SLGHPP----PEPGPDRVADA-KGDSESEEDED--------LEVPVPSRFNRRVSVCAET
.:: : : . . . ..:::. :.:. ...:: .::.::.:::::.
CCDS57 DLGAAAGGGTPSKGVNFAEEPMQSDSEDGEEEEAAPADAGAFNAPVINRFTRRASVCAEA
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 YNPDEEEEDTDPRVIHPKTDEQRCRLQEACKDILLFKNLDQEQLSQVLDAMFERIVKADE
:::::::.:.. :.::::::.:: :::::::::::::::: ::.:::::::::..:: :
CCDS57 YNPDEEEDDAESRIIHPKTDDQRNRLQEACKDILLFKNLDPEQMSQVLDAMFEKLVKDGE
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 HVIDQGDDGDNFYVIERGTYDILVTKDNQTRSVGQYDNRGSFGELALMYNTPRAATIVAT
:::::::::::::::.:::.:: : :. : ::.::::::::::::::::::::::.::
CCDS57 HVIDQGDDGDNFYVIDRGTFDIYVKCDGVGRCVGNYDNRGSFGELALMYNTPRAATITAT
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 SEGSLWGLDRVTFRRIIVKNNAKKRKMFESFIESVPLLKSLEVSERMKIVDVIGEKIYKD
: :.:::::::::::::::::::::::.::::::.:.::::: :::.:.::::: :.:.:
CCDS57 SPGALWGLDRVTFRRIIVKNNAKKRKMYESFIESLPFLKSLEFSERLKVVDVIGTKVYND
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 GERIITQGEKADSFYIIESGEVSILIRSRTKSNKDGGNQEVEIARCHKGQYFGELALVTN
::.::.::..::::.:.:::::.: .. . ::. . : :::::: .::::::::::::
CCDS57 GEQIIAQGDSADSFFIVESGEVKITMKRKGKSEVEE-NGAVEIARCSRGQYFGELALVTN
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 KPRAASAYAVGDVKCLVMDVQAFERLLGPCMDIMKRNISHYEEQLVKMFGSSVDLGNLGQ
:::::::.:.: ::::.::::::::::::::.::::::. :::::: .::...:.
CCDS57 KPRAASAHAIGTVKCLAMDVQAFERLLGPCMEIMKRNIATYEEQLVALFGTNMDIVEPTA
360 370 380 390 400 410
>>CCDS11678.1 PRKAR1A gene_id:5573|Hs108|chr17 (381 aa)
initn: 892 init1: 350 opt: 777 Z-score: 717.4 bits: 141.5 E(32554): 1.2e-33
Smith-Waterman score: 790; 39.6% identity (65.2% similar) in 379 aa overlap (13-385:30-373)
10 20 30 40
pF1KB6 MSHIQIPPGLTELLQGYTVEVLRQQPPDLVEFAVEYFTRLR--
::. :.. .: . : ::: ::.
CCDS11 MESGSTAASEEARSLRECELYVQKHNIQALLKDSIVQLCTARPERPMAFLREYFERLEKE
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KB6 EARAPASVLPAAT---PRQSLGHPPPEPGPDRVADAKGDSESEEDEDLEVPVPSRFNRRV
::. .. :.: :.. ::: :.: .:: ::
CCDS11 EAKQIQNLQKAGTRTDSREDEISPPP-PNPV----VKGRR-----------------RRG
70 80 90
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 SVCAETYNPDEEEEDTDPRVIHPKTDEQRCRLQEACKDILLFKNLDQEQLSQVLDAMFER
.. ::.:. ::. . : . :: . : .: . .::..::... :...::::
CCDS11 AISAEVYT--EEDAASYVRKVIPKDYKTMAALAKAIEKNVLFSHLDDNERSDIFDAMFSV
100 110 120 130 140 150
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 IVKADEHVIDQGDDGDNFYVIERGTYDILVTKDNQTRSVGQYDNRGSFGELALMYNTPRA
: : ::.:::.:::::::..: :. :... : :::. ::::::::.:.::::
CCDS11 SFIAGETVIQQGDEGDNFYVIDQGETDVYVNNEWAT-SVGEG---GSFGELALIYGTPRA
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 ATIVATSEGSLWGLDRVTFRRIIVKNNAKKRKMFESFIESVPLLKSLEVSERMKIVDVIG
::. : .. .:::.:: ..:::.. .. .::::.: :. .: .:.::. ::. ..:..
CCDS11 ATVKAKTNVKLWGIDRDSYRRILMGSTLRKRKMYEEFLSKVSILESLDKWERLTVADALE
220 230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 EKIYKDGERIITQGEKADSFYIIESGEVSILIRSRTKSNKDGGNQE-VEIARCHKGQYFG
..::..:..::: .: :.:: : ...: : :.. :.: ::..: ..:::
CCDS11 PVQFEDGQKIVVQGEPGDEFFIILEGSAAVLQR-RSE------NEEFVEVGRLGPSDYFG
280 290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 ELALVTNKPRAASAYAVGDVKCLVMDVQAFERLLGPCMDIMKRNISHYEEQLVKMFGSSV
:.::. :.::::.. : : .::. .: :::.:::: ::.::::..:
CCDS11 EIALLMNRPRAATVVARGPLKCVKLDRPRFERVLGPCSDILKRNIQQYNSFVSLSV
330 340 350 360 370 380
400
pF1KB6 DLGNLGQ
>>CCDS34579.1 PRKAR1B gene_id:5575|Hs108|chr7 (381 aa)
initn: 858 init1: 371 opt: 771 Z-score: 711.9 bits: 140.5 E(32554): 2.5e-33
Smith-Waterman score: 776; 37.0% identity (66.4% similar) in 384 aa overlap (3-385:21-373)
10 20 30 40
pF1KB6 MSHIQIPPGLTELLQGYTVEVLRQQPPDLVEFAVEYFTRLRE
..:. :. ..:. :.. ..: ..: :.: .:..
CCDS34 MASPPACPSEEDESLKGCELYVQLH-GIQQVLKDCIVHLCISKPERPMKFLREHFEKLEK
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 ARAPASVLPAATPRQSLGHPPPEPGPDRVADAKGDSESEE-DEDLEVPVPSRFNRRVSVC
. :: :.. .....::..:: . :: . :: .:
CCDS34 EEN----------RQILARQK--------SNSQSDSHDEEVSPTPPNPVVKARRRRGGVS
60 70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 AETYNPDEEEEDTDPRVIHPKTDEQRCRLQEACKDILLFKNLDQEQLSQVLDAMFERIVK
::.:. ::. . : . :: . : .: . .:: .::... :...::::
CCDS34 AEVYT--EEDAVSYVRKVIPKDYKTMTALAKAISKNVLFAHLDDNERSDIFDAMFPVTHI
110 120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 ADEHVIDQGDDGDNFYVIERGTYDILVTKDNQTRSVGQYDNRGSFGELALMYNTPRAATI
: : ::.::..::::::...: :. :. . : . .. ::::::::.:.::::::.
CCDS34 AGETVIQQGNEGDNFYVVDQGEVDVYVNGEW----VTNISEGGSFGELALIYGTPRAATV
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 VATSEGSLWGLDRVTFRRIIVKNNAKKRKMFESFIESVPLLKSLEVSERMKIVDVIGEKI
: .. .:::.:: ..:::.. .. .::::.: :. .: .:.::: ::. ..:..
CCDS34 KAKTDLKLWGIDRDSYRRILMGSTLRKRKMYEEFLSKVSILESLEKWERLTVADALEPVQ
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 YKDGERIITQGEKADSFYIIESGEVSILIRSRTKSNKDGGNQEVEIARCHKGQYFGELAL
..:::.:..::: .:.:::: : .:.: : .. ... ::..: ..::::.::
CCDS34 FEDGEKIVVQGEPGDDFYIITEGTASVLQR------RSPNEEYVEVGRLGPSDYFGEIAL
280 290 300 310 320
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 VTNKPRAASAYAVGDVKCLVMDVQAFERLLGPCMDIMKRNISHYEEQLVKMFGSSVDLGN
. :.::::.. : : .::. .: :::.:::: .:.::::..:
CCDS34 LLNRPRAATVVARGPLKCVKLDRPRFERVLGPCSEILKRNIQRYNSFISLTV
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 LGQ
>>CCDS62307.1 PRKAR1A gene_id:5573|Hs108|chr17 (337 aa)
initn: 692 init1: 350 opt: 589 Z-score: 546.9 bits: 109.8 E(32554): 3.8e-24
Smith-Waterman score: 602; 37.0% identity (63.0% similar) in 335 aa overlap (13-341:30-329)
10 20 30 40
pF1KB6 MSHIQIPPGLTELLQGYTVEVLRQQPPDLVEFAVEYFTRLR--
::. :.. .: . : ::: ::.
CCDS62 MESGSTAASEEARSLRECELYVQKHNIQALLKDSIVQLCTARPERPMAFLREYFERLEKE
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KB6 EARAPASVLPAAT---PRQSLGHPPPEPGPDRVADAKGDSESEEDEDLEVPVPSRFNRRV
::. .. :.: :.. ::: :.: .:: ::
CCDS62 EAKQIQNLQKAGTRTDSREDEISPPP-PNPV----VKGR-----------------RRRG
70 80 90
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 SVCAETYNPDEEEEDTDPRVIHPKTDEQRCRLQEACKDILLFKNLDQEQLSQVLDAMFER
.. ::.:. ::. . : . :: . : .: . .::..::... :...::::
CCDS62 AISAEVYT--EEDAASYVRKVIPKDYKTMAALAKAIEKNVLFSHLDDNERSDIFDAMFSV
100 110 120 130 140 150
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 IVKADEHVIDQGDDGDNFYVIERGTYDILVTKDNQTRSVGQYDNRGSFGELALMYNTPRA
: : ::.:::.:::::::..: :. :... : :::. ::::::::.:.::::
CCDS62 SFIAGETVIQQGDEGDNFYVIDQGETDVYVNNEWAT-SVGEG---GSFGELALIYGTPRA
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 ATIVATSEGSLWGLDRVTFRRIIVKNNAKKRKMFESFIESVPLLKSLEVSERMKIVDVIG
::. : .. .:::.:: ..:::.. .. .::::.: :. .: .:.::. ::. ..:..
CCDS62 ATVKAKTNVKLWGIDRDSYRRILMGSTLRKRKMYEEFLSKVSILESLDKWERLTVADALE
220 230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 EKIYKDGERIITQGEKADSFYIIESGEVSILIRSRTKSNKDGGNQE-VEIARCHKGQYFG
..::..:..::: .: :.:: : ...: : :.. :.: ::..: ..:::
CCDS62 PVQFEDGQKIVVQGEPGDEFFIILEGSAAVLQR-RSE------NEEFVEVGRLGPSDYFG
280 290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 ELALVTNKPRAASAYAVGDVKCLVMDVQAFERLLGPCMDIMKRNISHYEEQLVKMFGSSV
.: .
CCDS62 HLIISRRSIPLG
330
>>CCDS64005.1 PRKG2 gene_id:5593|Hs108|chr4 (733 aa)
initn: 392 init1: 248 opt: 468 Z-score: 432.1 bits: 89.7 E(32554): 9.5e-18
Smith-Waterman score: 468; 28.0% identity (62.8% similar) in 325 aa overlap (60-379:90-399)
30 40 50 60 70 80
pF1KB6 VEFAVEYFTRLREARAPASVLPAATPRQSLGHPPPEPGPDRVADAKGDSESEEDEDLEVP
: : . .::.: : .. . :
CCDS64 KQTVAIAELTEELQNKCIQLNKLQDVVHMQGGSPLQASPDKVP-----LEVHRKTSGLVS
60 70 80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 VPSRFNRRVSVCAE----TYNPDEEEEDTDPRVIHPKTDEQRCRLQEACKDILLFKNLDQ
. :: . ...: :: ::. .. : . .. : . .. . .: . ..: ::
CCDS64 LHSRRGAKAGVSAEPTTRTYDLNKPPEFSFEKARVRKDSSEKKLITDALNKNQFLKRLDP
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 EQLSQVLDAMFERIVKADEHVIDQGDDGDNFYVIERGTYDILVTKDNQTRSVGQYDNRGS
.:...... :. : . ..: ::. :....:. .: ... .. :. .. .
CCDS64 QQIKDMVECMYGRNYQQGSYIIKQGEPGNHIFVLAEGRLEVF-QGEKLLSSIPMWT---T
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 FGELALMYNTPRAATIVATSEGSLWGLDRVTFRRIIVKNNAKKRKMFESFIESVPLLKSL
:::::..:: :.:.. : .. . :.::: .:. :. .. . .....:..:: :::.:
CCDS64 FGELAILYNCTRTASVKAITNVKTWALDREVFQNIMRRTAQARDEQYRNFLRSVSLLKNL
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]