Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6586
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6586, 406 aa
1>>>pF1KB6586 406 - 406 aa - 406 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6206+/-0.00104; mu= 15.4116+/- 0.062
mean_var=68.4014+/-13.765, 0's: 0 Z-trim(103.2): 50 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.155075
statistics sampled from 7260 (7310) to 7260 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.595), E-opt: 0.2 (0.225), width: 16
Scan time: 2.830
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9928.1 SERPINA5 gene_id:5104|Hs108|chr14 ( 406) 2610 593.2 1.4e-169
CCDS9927.1 SERPINA4 gene_id:5267|Hs108|chr14 ( 427) 1139 264.2 1.7e-70
CCDS41982.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 435) 1122 260.4 2.4e-69
CCDS32150.1 SERPINA3 gene_id:12|Hs108|chr14 ( 423) 1111 257.9 1.3e-68
CCDS9925.1 SERPINA1 gene_id:5265|Hs108|chr14 ( 418) 1053 244.9 1e-64
CCDS32149.1 SERPINA11 gene_id:256394|Hs108|chr14 ( 422) 1040 242.0 7.9e-64
CCDS9924.1 SERPINA6 gene_id:866|Hs108|chr14 ( 405) 1027 239.1 5.7e-63
CCDS14518.1 SERPINA7 gene_id:6906|Hs108|chrX ( 415) 954 222.8 4.8e-58
CCDS9926.1 SERPINA12 gene_id:145264|Hs108|chr14 ( 414) 946 221.0 1.7e-57
CCDS61542.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 286) 823 193.4 2.3e-49
CCDS41983.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 335) 735 173.7 2.2e-43
CCDS9923.1 SERPINA10 gene_id:51156|Hs108|chr14 ( 444) 668 158.8 9.3e-39
CCDS4479.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 376) 663 157.6 1.8e-38
CCDS75386.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 380) 663 157.6 1.8e-38
CCDS75387.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 395) 663 157.6 1.8e-38
CCDS4478.1 SERPINB9 gene_id:5272|Hs108|chr6 ( 376) 661 157.2 2.4e-38
CCDS11991.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 374) 649 154.5 1.5e-37
CCDS11986.1 SERPINB4 gene_id:6318|Hs108|chr18 ( 390) 613 146.5 4.2e-35
CCDS3200.1 SERPINI2 gene_id:5276|Hs108|chr3 ( 405) 612 146.2 5.1e-35
CCDS75047.1 SERPINI2 gene_id:5276|Hs108|chr3 ( 415) 612 146.2 5.2e-35
CCDS11987.1 SERPINB3 gene_id:6317|Hs108|chr18 ( 390) 608 145.3 9.2e-35
CCDS11985.1 SERPINB13 gene_id:5275|Hs108|chr18 ( 391) 586 140.4 2.8e-33
CCDS77195.1 SERPINB13 gene_id:5275|Hs108|chr18 ( 400) 586 140.4 2.8e-33
CCDS13783.1 SERPIND1 gene_id:3053|Hs108|chr22 ( 499) 571 137.1 3.5e-32
CCDS58633.1 SERPINB7 gene_id:8710|Hs108|chr18 ( 363) 569 136.6 3.6e-32
CCDS11990.1 SERPINB10 gene_id:5273|Hs108|chr18 ( 397) 567 136.2 5.4e-32
CCDS5711.1 SERPINE1 gene_id:5054|Hs108|chr7 ( 402) 567 136.2 5.4e-32
CCDS8239.1 SERPINH1 gene_id:871|Hs108|chr11 ( 418) 556 133.7 3.1e-31
CCDS3203.1 SERPINI1 gene_id:5274|Hs108|chr3 ( 410) 529 127.7 2e-29
CCDS11988.1 SERPINB7 gene_id:8710|Hs108|chr18 ( 380) 510 123.4 3.6e-28
CCDS11012.1 SERPINF1 gene_id:5176|Hs108|chr17 ( 418) 501 121.4 1.6e-27
CCDS11989.1 SERPINB2 gene_id:5055|Hs108|chr18 ( 415) 500 121.2 1.8e-27
CCDS1313.1 SERPINC1 gene_id:462|Hs108|chr1 ( 464) 498 120.8 2.7e-27
CCDS4477.1 SERPINB1 gene_id:1992|Hs108|chr6 ( 379) 480 116.7 3.7e-26
CCDS46526.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 397) 441 108.0 1.6e-23
CCDS46525.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 409) 441 108.0 1.7e-23
CCDS2460.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 398) 435 106.6 4.2e-23
CCDS32839.1 SERPINB5 gene_id:5268|Hs108|chr18 ( 375) 427 104.8 1.4e-22
CCDS7962.1 SERPING1 gene_id:710|Hs108|chr11 ( 500) 419 103.1 6.1e-22
CCDS42442.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 242) 379 94.0 1.6e-19
CCDS54064.1 SERPINF2 gene_id:5345|Hs108|chr17 ( 427) 372 92.6 7.8e-19
CCDS53870.1 SERPINE3 gene_id:647174|Hs108|chr13 ( 424) 365 91.0 2.3e-18
CCDS77196.1 SERPINB11 gene_id:89778|Hs108|chr18 ( 305) 339 85.1 9.7e-17
CCDS62460.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 192) 323 81.4 7.7e-16
CCDS11984.1 SERPINB12 gene_id:89777|Hs108|chr18 ( 405) 320 80.9 2.4e-15
CCDS77194.1 SERPINB12 gene_id:89777|Hs108|chr18 ( 425) 320 80.9 2.5e-15
CCDS1585.1 AGT gene_id:183|Hs108|chr1 ( 485) 270 69.8 6.4e-12
>>CCDS9928.1 SERPINA5 gene_id:5104|Hs108|chr14 (406 aa)
initn: 2610 init1: 2610 opt: 2610 Z-score: 3158.0 bits: 593.2 E(32554): 1.4e-169
Smith-Waterman score: 2610; 100.0% identity (100.0% similar) in 406 aa overlap (1-406:1-406)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MQLFLLLCLVLLSPQGASLHRHHPREMKKRVEDLHVGATVAPSSRRDFTFDLYRALASAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 MQLFLLLCLVLLSPQGASLHRHHPREMKKRVEDLHVGATVAPSSRRDFTFDLYRALASAA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 PSQSIFFSPVSISMSLAMLSLGAGSSTKMQILEGLGLNLQKSSEKELHRGFQQLLQELNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 PSQSIFFSPVSISMSLAMLSLGAGSSTKMQILEGLGLNLQKSSEKELHRGFQQLLQELNQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 PRDGFQLSLGNALFTDLVVDLQDTFVSAMKTLYLADTFPTNFRDSAGAMKQINDYVAKQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 PRDGFQLSLGNALFTDLVVDLQDTFVSAMKTLYLADTFPTNFRDSAGAMKQINDYVAKQT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 KGKIVDLLKNLDSNAVVIMVNYIFFKAKWETSFNHKGTQEQDFYVTSETVVRVPMMSRED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 KGKIVDLLKNLDSNAVVIMVNYIFFKAKWETSFNHKGTQEQDFYVTSETVVRVPMMSRED
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 QYHYLLDRNLSCRVVGVPYQGNATALFILPSEGKMQQVENGLSEKTLRKWLKMFKKRQLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 QYHYLLDRNLSCRVVGVPYQGNATALFILPSEGKMQQVENGLSEKTLRKWLKMFKKRQLE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LYLPKFSIEGSYQLEKVLPSLGISNVFTSHADLSGISNHSNIQVSEMVHKAVVEVDESGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 LYLPKFSIEGSYQLEKVLPSLGISNVFTSHADLSGISNHSNIQVSEMVHKAVVEVDESGT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KB6 RAAAATGTIFTFRSARLNSQRLVFNRPFLMFIVDNNILFLGKVNRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 RAAAATGTIFTFRSARLNSQRLVFNRPFLMFIVDNNILFLGKVNRP
370 380 390 400
>>CCDS9927.1 SERPINA4 gene_id:5267|Hs108|chr14 (427 aa)
initn: 984 init1: 625 opt: 1139 Z-score: 1379.0 bits: 264.2 E(32554): 1.7e-70
Smith-Waterman score: 1139; 45.0% identity (74.8% similar) in 420 aa overlap (4-406:6-424)
10 20 30 40
pF1KB6 MQLFLLLCLV-LLSPQGASLHRHHPREM-----KKRVEDLHVGAT---VAPSSRRDFT
.::: :: ::. . ..:: .: : .... . :. .::.. ::.
CCDS99 MHLIDYLLLLLVGLLALSHGQLHVEHDGESCSNSSHQQILETGEGSPSLKIAPANA-DFA
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 FDLYRALASAAPSQSIFFSPVSISMSLAMLSLGAGSSTKMQILEGLGLNLQKSSEKELHR
: .: .:: .:...:::::.::: . ::::::: : .. :::::::.:: . ::...::
CCDS99 FRFYYLIASETPGKNIFFSPLSISAAYAMLSLGACSHSRSQILEGLGFNLTELSESDVHR
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 GFQQLLQELNQPRDGFQLSLGNALFTDLVVDLQDTFVSAMKTLYLADTFPTNFRDSAGAM
:::.::. :: : :.. .:.::: . . . :.. ..: : : ::: :..:..
CCDS99 GFQHLLHTLNLPGHGLETRVGSALFLSHNLKFLAKFLNDTMAVYEAKLFHTNFYDTVGTI
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 KQINDYVAKQTKGKIVDLLKNLDSNAVVIMVNYIFFKAKWETSFNHKGTQEQDFYVTSET
. :::.: :.:.::::::...: .......::::.::: :: : . : .:::: .:
CCDS99 QLINDHVKKETRGKIVDLVSELKKDVLMVLVNYIYFKALWEKPFISSRTTPKDFYVDENT
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 VVRVPMMSREDQYH-YLLDRNLSCRVVGVPYQGNATALFILPSEGKMQQVENGLSEKTLR
.:::::: .....: :: :: : : :. . :.:.::..::::..:::...:. :. . :
CCDS99 TVRVPMMLQDQEHHWYLHDRYLPCSVLRMDYKGDATVFFILPNQGKMREIEEVLTPEMLM
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 KWLKMFKKR----QLELYLPKFSIEGSYQLEKVLPSLGISNVFTSHADLSGISNHSNIQV
.: ....:: .:::.:::::: ::: :...:: ::....:.. ::::::........
CCDS99 RWNNLLRKRNFYKKLELHLPKFSISGSYVLDQILPRLGFTDLFSKWADLSGITKQQKLEA
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 SEMVHKAVVEVDESGTRAAAATGTIFTFRSARLNSQRLVFNRPFLMFIVDNN---ILFLG
:. :::...:::.::.:::::. . : ::. : . : ::::::. : ... .::::
CCDS99 SKSFHKATLDVDEAGTEAAAATSFAIKFFSAQTNRHILRFNRPFLVVIFSTSTQSVLFLG
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 KVNRP
:: :
CCDS99 KVVDPTKP
420
>>CCDS41982.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 (435 aa)
initn: 1118 init1: 550 opt: 1122 Z-score: 1358.4 bits: 260.4 E(32554): 2.4e-69
Smith-Waterman score: 1122; 45.2% identity (75.8% similar) in 405 aa overlap (7-406:32-432)
10 20 30
pF1KB6 MQLFLLLCLVLLSPQGASLHRHHPREMKKRVEDLHV
:: . . :. .:: . . .
CCDS41 QGQGRRRGTCKDIFCSKMASYLYGVLFAVGLCAPIYCVSPANAPSAYPRPSSTK----ST
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 GATVAPSSRRDFTFDLYRALASAAPSQSIFFSPVSISMSLAMLSLGAGSSTKMQILEGLG
:. . : ::.: ::: :. .:::.:::::::.: ::::::::: : :: :::.:::
CCDS41 PASQVYSLNTDFAFRLYRRLVLETPSQNIFFSPVSVSTSLAMLSLGAHSVTKTQILQGLG
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 LNLQKSSEKELHRGFQQLLQELNQPRDGFQLSLGNALFTDLVVDLQDTFVSAMKTLYLAD
.:: .. :. .:.:::.:.. :. : . :..:.:::. ..:: .:.. .: :: :.
CCDS41 FNLTHTPESAIHQGFQHLVHSLTVPSKDLTLKMGSALFVKKELQLQANFLGNVKRLYEAE
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 TFPTNFRDSAGAMKQINDYVAKQTKGKIVDLLKNLDSNAVVIMVNYIFFKAKWETSFNHK
.: :.: . . :. .::..: :.:.::.::....:: .....::.:::::::: :. .
CCDS41 VFSTDFSNPSIAQARINSHVKKKTQGKVVDIIQGLDLLTAMVLVNHIFFKAKWEKPFHPE
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 GTQEQ-DFYVTSETVVRVPMMSREDQYHYLLDRNLSCRVVGVPYQGNATALFILPSEGKM
:... : : ...:.:::: ...:. . .: .:.: :. . :.:.:.:.:.:::.:::
CCDS41 YTRKNFPFLVGEQVTVHVPMMHQKEQFAFGVDTELNCFVLQMDYKGDAVAFFVLPSKGKM
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 QQVENGLSEKTLRKWLKMFKKRQLELYLPKFSIEGSYQLEKVLPSLGISNVFTSHADLSG
.:.:..:: .::::: . ..:: .:...:.::: .::.:: .::..::.::: ..::.::
CCDS41 RQLEQALSARTLRKWSHSLQKRWIEVFIPRFSISASYNLETILPKMGIQNVFDKNADFSG
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 ISNHSNIQVSEMVHKAVVEVDESGTRAAAATGTIFTFRSARLNSQRLV-FNRPFLMFIVD
:......:::. .::::..:.: ::.:.::: : : :: : : ::: :::.:..
CCDS41 IAKRDSLQVSKATHKAVLDVSEEGTEATAATTTKFIVRSKDGPSYFTVSFNRTFLMMITN
360 370 380 390 400 410
400
pF1KB6 ---NNILFLGKVNRP
..:::::::. :
CCDS41 KATDGILFLGKVENPTKS
420 430
>>CCDS32150.1 SERPINA3 gene_id:12|Hs108|chr14 (423 aa)
initn: 1063 init1: 636 opt: 1111 Z-score: 1345.2 bits: 257.9 E(32554): 1.3e-68
Smith-Waterman score: 1111; 47.4% identity (75.9% similar) in 403 aa overlap (10-406:21-420)
10 20 30 40
pF1KB6 MQLFLLLCLVLLSPQGASLHRHHPREMKKRVEDLHVGATVAPSSRRDFT
:: :.. ... .: . : :: .: :. ::.
CCDS32 MERMLPLLALGLLAAGFCPAVLCHPNSPLDEENLTQENQDR--GTHVDLGLA-SANVDFA
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 FDLYRALASAAPSQSIFFSPVSISMSLAMLSLGAGSSTKMQILEGLGLNLQKSSEKELHR
:.::. :. ::.....:::.::: .::.::::: ..: .::.:: .:: ..:: :.:.
CCDS32 FSLYKQLVLKAPDKNVIFSPLSISTALAFLSLGAHNTTLTEILKGLKFNLTETSEAEIHQ
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 GFQQLLQELNQPRDGFQLSLGNALFTDLVVDLQDTFVSAMKTLYLADTFPTNFRDSAGAM
.::.::. ::: : .:::.:::.:. ..: : :. : :: ...: :.:.:::.:
CCDS32 SFQHLLRTLNQSSDELQLSMGNAMFVKEQLSLLDRFTEDAKRLYGSEAFATDFQDSAAAK
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 KQINDYVAKQTKGKIVDLLKNLDSNAVVIMVNYIFFKAKWETSFNHKGTQEQDFYVTSET
: ::::: . :.:::.::.:.:::......::::::::::: :. . :... ::....
CCDS32 KLINDYVKNGTRGKITDLIKDLDSQTMMVLVNYIFFKAKWEMPFDPQDTHQSRFYLSKKK
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 VVRVPMMSRED-QYHYLLDRNLSCRVVGVPYQGNATALFILPSEGKMQQVENGLSEKTLR
: ::::: . :. :..::: :: . : :::.::::::.. ::..:: : .::.
CCDS32 WVMVPMMSLHHLTIPYFRDEELSCTVVELKYTGNASALFILPDQDKMEEVEAMLLPETLK
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 KWLKMFKKRQL-ELYLPKFSIEGSYQLEKVLPSLGISNVFTSHADLSGISNHSNIQVSEM
.: .. :.. ::::::::: .:.:. .: .::: ..:::.::::::.. :. ::..
CCDS32 RWRDSLEFREIGELYLPKFSISRDYNLNDILLQLGIEEAFTSKADLSGITGARNLAVSQV
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 VHKAVVEVDESGTRAAAATGTIFTFRSARLNSQRLV-FNRPFLMFIVDN---NILFLGKV
:::::..: : ::.:.:::.. .:. :: .... .: :::::::.:: . ::.:..::
CCDS32 VHKAVLDVFEEGTEASAATAVKITLLSALVETRTIVRFNRPFLMIIVPTDTQNIFFMSKV
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 NRP
. :
CCDS32 TNPKQA
420
>>CCDS9925.1 SERPINA1 gene_id:5265|Hs108|chr14 (418 aa)
initn: 1027 init1: 988 opt: 1053 Z-score: 1275.2 bits: 244.9 E(32554): 1e-64
Smith-Waterman score: 1053; 43.9% identity (73.0% similar) in 408 aa overlap (6-406:15-415)
10 20 30 40
pF1KB6 MQLFLLLCLVLLS----PQGASLHRHHPREMKKRVEDLHVGATVAPSSRRD
: ::: .: ::: . .. . ... .: . ..:. .
CCDS99 MPSSVSWGILLLAGLCCLVPVSLAEDPQGDAAQK---TDTSHHDQDHPTFNKITPNLA-E
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 FTFDLYRALASAAPSQSIFFSPVSISMSLAMLSLGAGSSTKMQILEGLGLNLQKSSEKEL
:.:.::: :: . : .::::::::. ..::::::. ..:. .:::::..:: . : ..
CCDS99 FAFSLYRQLAHQSNSTNIFFSPVSIATAFAMLSLGTKADTHDEILEGLNFNLTEIPEAQI
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 HRGFQQLLQELNQPRDGFQLSLGNALFTDLVVDLQDTFVSAMKTLYLADTFPTNFRDSAG
:.:::.::. :::: . .::. ::.:: . . : : :. .: :: ...: .:: :.
CCDS99 HEGFQELLRTLNQPDSQLQLTTGNGLFLSEGLKLVDKFLEDVKKLYHSEAFTVNFGDTEE
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420
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]