Result of FASTA (omim) for
pF1KB6586
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6586, 406 aa
1>>>pF1KB6586 406 - 406 aa - 406 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7949+/-0.000436; mu= 14.4344+/- 0.027
mean_var=67.2589+/-13.311, 0's: 0 Z-trim(109.9): 134 B-trim: 277 in 2/50
Lambda= 0.156387
statistics sampled from 18006 (18145) to 18006 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.573), E-opt: 0.2 (0.213), width: 16
Scan time: 8.570
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000615 (OMIM: 601841) plasma serine protease in ( 406) 2610 598.2 1.2e-170
NP_006206 (OMIM: 147935) kallistatin isoform 2 pre ( 427) 1139 266.3 1e-70
NP_001275962 (OMIM: 147935) kallistatin isoform 2 ( 427) 1139 266.3 1e-70
NP_001275961 (OMIM: 147935) kallistatin isoform 1 ( 464) 1139 266.3 1.1e-70
XP_011535017 (OMIM: 615677) PREDICTED: serpin A9 i ( 417) 1122 262.4 1.4e-69
XP_011535016 (OMIM: 615677) PREDICTED: serpin A9 i ( 417) 1122 262.4 1.4e-69
NP_783866 (OMIM: 615677) serpin A9 isoform A [Homo ( 435) 1122 262.4 1.5e-69
NP_001076 (OMIM: 107280) alpha-1-antichymotrypsin ( 423) 1111 260.0 8.2e-69
NP_001271204 (OMIM: 615677) serpin A9 isoform C [H ( 399) 1079 252.7 1.2e-66
NP_001121179 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1053 246.9 7e-65
NP_001002236 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1053 246.9 7e-65
NP_001121176 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1053 246.9 7e-65
NP_000286 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1-ant ( 418) 1053 246.9 7e-65
NP_001121174 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1053 246.9 7e-65
NP_001121178 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1053 246.9 7e-65
XP_016876859 (OMIM: 107400,606963,613490) PREDICTE ( 418) 1053 246.9 7e-65
NP_001121175 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1053 246.9 7e-65
NP_001002235 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1053 246.9 7e-65
NP_001121173 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1053 246.9 7e-65
NP_001121172 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1053 246.9 7e-65
NP_001121177 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1053 246.9 7e-65
NP_001747 (OMIM: 122500,611489) corticosteroid-bin ( 405) 1026 240.8 4.7e-63
XP_011535018 (OMIM: 615677) PREDICTED: serpin A9 i ( 337) 984 231.3 2.8e-60
XP_011535019 (OMIM: 615677) PREDICTED: serpin A9 i ( 337) 984 231.3 2.8e-60
NP_000345 (OMIM: 300932,314200) thyroxine-binding ( 415) 954 224.5 3.7e-58
NP_006211 (OMIM: 107410) putative alpha-1-antitryp ( 421) 927 218.4 2.6e-56
XP_005262237 (OMIM: 300932,314200) PREDICTED: thyr ( 371) 865 204.4 3.7e-52
XP_006724746 (OMIM: 300932,314200) PREDICTED: thyr ( 425) 856 202.4 1.7e-51
NP_001271205 (OMIM: 615677) serpin A9 isoform D [H ( 286) 823 194.9 2.1e-49
NP_001035983 (OMIM: 615677) serpin A9 isoform B [H ( 335) 735 175.1 2.3e-43
XP_005267790 (OMIM: 605271) PREDICTED: protein Z-d ( 444) 668 160.0 1e-38
NP_057270 (OMIM: 605271) protein Z-dependent prote ( 444) 668 160.0 1e-38
NP_001094077 (OMIM: 605271) protein Z-dependent pr ( 444) 668 160.0 1e-38
XP_016876842 (OMIM: 605271) PREDICTED: protein Z-d ( 484) 668 160.0 1.1e-38
XP_011512976 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 376) 663 158.9 2e-38
NP_004559 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isoform ( 376) 663 158.9 2e-38
NP_001258753 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 376) 663 158.9 2e-38
XP_011512975 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 376) 663 158.9 2e-38
NP_001284629 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 376) 663 158.9 2e-38
NP_001284628 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 376) 663 158.9 2e-38
NP_001258754 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 376) 663 158.9 2e-38
XP_016866429 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 380) 663 158.9 2e-38
NP_001182220 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 380) 663 158.9 2e-38
NP_001258751 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 390) 663 158.9 2e-38
NP_001258752 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 395) 663 158.9 2.1e-38
XP_011512974 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 454) 663 158.9 2.3e-38
NP_004146 (OMIM: 601799) serpin B9 [Homo sapiens] ( 376) 661 158.4 2.7e-38
XP_005249241 (OMIM: 601799) PREDICTED: serpin B9 i ( 376) 661 158.4 2.7e-38
NP_942130 (OMIM: 601697,617115) serpin B8 isoform ( 374) 649 155.7 1.7e-37
NP_002631 (OMIM: 601697,617115) serpin B8 isoform ( 374) 649 155.7 1.7e-37
>>NP_000615 (OMIM: 601841) plasma serine protease inhibi (406 aa)
initn: 2610 init1: 2610 opt: 2610 Z-score: 3184.5 bits: 598.2 E(85289): 1.2e-170
Smith-Waterman score: 2610; 100.0% identity (100.0% similar) in 406 aa overlap (1-406:1-406)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MQLFLLLCLVLLSPQGASLHRHHPREMKKRVEDLHVGATVAPSSRRDFTFDLYRALASAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MQLFLLLCLVLLSPQGASLHRHHPREMKKRVEDLHVGATVAPSSRRDFTFDLYRALASAA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 PSQSIFFSPVSISMSLAMLSLGAGSSTKMQILEGLGLNLQKSSEKELHRGFQQLLQELNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 PSQSIFFSPVSISMSLAMLSLGAGSSTKMQILEGLGLNLQKSSEKELHRGFQQLLQELNQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 PRDGFQLSLGNALFTDLVVDLQDTFVSAMKTLYLADTFPTNFRDSAGAMKQINDYVAKQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 PRDGFQLSLGNALFTDLVVDLQDTFVSAMKTLYLADTFPTNFRDSAGAMKQINDYVAKQT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 KGKIVDLLKNLDSNAVVIMVNYIFFKAKWETSFNHKGTQEQDFYVTSETVVRVPMMSRED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KGKIVDLLKNLDSNAVVIMVNYIFFKAKWETSFNHKGTQEQDFYVTSETVVRVPMMSRED
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 QYHYLLDRNLSCRVVGVPYQGNATALFILPSEGKMQQVENGLSEKTLRKWLKMFKKRQLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 QYHYLLDRNLSCRVVGVPYQGNATALFILPSEGKMQQVENGLSEKTLRKWLKMFKKRQLE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LYLPKFSIEGSYQLEKVLPSLGISNVFTSHADLSGISNHSNIQVSEMVHKAVVEVDESGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LYLPKFSIEGSYQLEKVLPSLGISNVFTSHADLSGISNHSNIQVSEMVHKAVVEVDESGT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KB6 RAAAATGTIFTFRSARLNSQRLVFNRPFLMFIVDNNILFLGKVNRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RAAAATGTIFTFRSARLNSQRLVFNRPFLMFIVDNNILFLGKVNRP
370 380 390 400
>>NP_006206 (OMIM: 147935) kallistatin isoform 2 precurs (427 aa)
initn: 984 init1: 625 opt: 1139 Z-score: 1390.5 bits: 266.3 E(85289): 1e-70
Smith-Waterman score: 1139; 45.0% identity (74.8% similar) in 420 aa overlap (4-406:6-424)
10 20 30 40
pF1KB6 MQLFLLLCLV-LLSPQGASLHRHHPREM-----KKRVEDLHVGAT---VAPSSRRDFT
.::: :: ::. . ..:: .: : .... . :. .::.. ::.
NP_006 MHLIDYLLLLLVGLLALSHGQLHVEHDGESCSNSSHQQILETGEGSPSLKIAPANA-DFA
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 FDLYRALASAAPSQSIFFSPVSISMSLAMLSLGAGSSTKMQILEGLGLNLQKSSEKELHR
: .: .:: .:...:::::.::: . ::::::: : .. :::::::.:: . ::...::
NP_006 FRFYYLIASETPGKNIFFSPLSISAAYAMLSLGACSHSRSQILEGLGFNLTELSESDVHR
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 GFQQLLQELNQPRDGFQLSLGNALFTDLVVDLQDTFVSAMKTLYLADTFPTNFRDSAGAM
:::.::. :: : :.. .:.::: . . . :.. ..: : : ::: :..:..
NP_006 GFQHLLHTLNLPGHGLETRVGSALFLSHNLKFLAKFLNDTMAVYEAKLFHTNFYDTVGTI
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 KQINDYVAKQTKGKIVDLLKNLDSNAVVIMVNYIFFKAKWETSFNHKGTQEQDFYVTSET
. :::.: :.:.::::::...: .......::::.::: :: : . : .:::: .:
NP_006 QLINDHVKKETRGKIVDLVSELKKDVLMVLVNYIYFKALWEKPFISSRTTPKDFYVDENT
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 VVRVPMMSREDQYH-YLLDRNLSCRVVGVPYQGNATALFILPSEGKMQQVENGLSEKTLR
.:::::: .....: :: :: : : :. . :.:.::..::::..:::...:. :. . :
NP_006 TVRVPMMLQDQEHHWYLHDRYLPCSVLRMDYKGDATVFFILPNQGKMREIEEVLTPEMLM
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 KWLKMFKKR----QLELYLPKFSIEGSYQLEKVLPSLGISNVFTSHADLSGISNHSNIQV
.: ....:: .:::.:::::: ::: :...:: ::....:.. ::::::........
NP_006 RWNNLLRKRNFYKKLELHLPKFSISGSYVLDQILPRLGFTDLFSKWADLSGITKQQKLEA
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 SEMVHKAVVEVDESGTRAAAATGTIFTFRSARLNSQRLVFNRPFLMFIVDNN---ILFLG
:. :::...:::.::.:::::. . : ::. : . : ::::::. : ... .::::
NP_006 SKSFHKATLDVDEAGTEAAAATSFAIKFFSAQTNRHILRFNRPFLVVIFSTSTQSVLFLG
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 KVNRP
:: :
NP_006 KVVDPTKP
420
>>NP_001275962 (OMIM: 147935) kallistatin isoform 2 prec (427 aa)
initn: 984 init1: 625 opt: 1139 Z-score: 1390.5 bits: 266.3 E(85289): 1e-70
Smith-Waterman score: 1139; 45.0% identity (74.8% similar) in 420 aa overlap (4-406:6-424)
10 20 30 40
pF1KB6 MQLFLLLCLV-LLSPQGASLHRHHPREM-----KKRVEDLHVGAT---VAPSSRRDFT
.::: :: ::. . ..:: .: : .... . :. .::.. ::.
NP_001 MHLIDYLLLLLVGLLALSHGQLHVEHDGESCSNSSHQQILETGEGSPSLKIAPANA-DFA
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 FDLYRALASAAPSQSIFFSPVSISMSLAMLSLGAGSSTKMQILEGLGLNLQKSSEKELHR
: .: .:: .:...:::::.::: . ::::::: : .. :::::::.:: . ::...::
NP_001 FRFYYLIASETPGKNIFFSPLSISAAYAMLSLGACSHSRSQILEGLGFNLTELSESDVHR
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 GFQQLLQELNQPRDGFQLSLGNALFTDLVVDLQDTFVSAMKTLYLADTFPTNFRDSAGAM
:::.::. :: : :.. .:.::: . . . :.. ..: : : ::: :..:..
NP_001 GFQHLLHTLNLPGHGLETRVGSALFLSHNLKFLAKFLNDTMAVYEAKLFHTNFYDTVGTI
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 KQINDYVAKQTKGKIVDLLKNLDSNAVVIMVNYIFFKAKWETSFNHKGTQEQDFYVTSET
. :::.: :.:.::::::...: .......::::.::: :: : . : .:::: .:
NP_001 QLINDHVKKETRGKIVDLVSELKKDVLMVLVNYIYFKALWEKPFISSRTTPKDFYVDENT
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 VVRVPMMSREDQYH-YLLDRNLSCRVVGVPYQGNATALFILPSEGKMQQVENGLSEKTLR
.:::::: .....: :: :: : : :. . :.:.::..::::..:::...:. :. . :
NP_001 TVRVPMMLQDQEHHWYLHDRYLPCSVLRMDYKGDATVFFILPNQGKMREIEEVLTPEMLM
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 KWLKMFKKR----QLELYLPKFSIEGSYQLEKVLPSLGISNVFTSHADLSGISNHSNIQV
.: ....:: .:::.:::::: ::: :...:: ::....:.. ::::::........
NP_001 RWNNLLRKRNFYKKLELHLPKFSISGSYVLDQILPRLGFTDLFSKWADLSGITKQQKLEA
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 SEMVHKAVVEVDESGTRAAAATGTIFTFRSARLNSQRLVFNRPFLMFIVDNN---ILFLG
:. :::...:::.::.:::::. . : ::. : . : ::::::. : ... .::::
NP_001 SKSFHKATLDVDEAGTEAAAATSFAIKFFSAQTNRHILRFNRPFLVVIFSTSTQSVLFLG
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 KVNRP
:: :
NP_001 KVVDPTKP
420
>>NP_001275961 (OMIM: 147935) kallistatin isoform 1 [Hom (464 aa)
initn: 984 init1: 625 opt: 1139 Z-score: 1389.9 bits: 266.3 E(85289): 1.1e-70
Smith-Waterman score: 1139; 45.0% identity (74.8% similar) in 420 aa overlap (4-406:43-461)
10 20
pF1KB6 MQLFLLLCLV-LLSPQGASLHRHHPREM-----
.::: :: ::. . ..:: .: :
NP_001 HSWYRAALTEGQGLLAANPGLRVQRMHLIDYLLLLLVGLLALSHGQLHVEHDGESCSNSS
20 30 40 50 60 70
30 40 50 60 70 80
pF1KB6 KKRVEDLHVGAT---VAPSSRRDFTFDLYRALASAAPSQSIFFSPVSISMSLAMLSLGAG
.... . :. .::.. ::.: .: .:: .:...:::::.::: . :::::::
NP_001 HQQILETGEGSPSLKIAPANA-DFAFRFYYLIASETPGKNIFFSPLSISAAYAMLSLGAC
80 90 100 110 120 130
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 SSTKMQILEGLGLNLQKSSEKELHRGFQQLLQELNQPRDGFQLSLGNALFTDLVVDLQDT
: .. :::::::.:: . ::...:::::.::. :: : :.. .:.::: . . .
NP_001 SHSRSQILEGLGFNLTELSESDVHRGFQHLLHTLNLPGHGLETRVGSALFLSHNLKFLAK
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 FVSAMKTLYLADTFPTNFRDSAGAMKQINDYVAKQTKGKIVDLLKNLDSNAVVIMVNYIF
:.. ..: : : ::: :..:... :::.: :.:.::::::...: .......::::.
NP_001 FLNDTMAVYEAKLFHTNFYDTVGTIQLINDHVKKETRGKIVDLVSELKKDVLMVLVNYIY
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 FKAKWETSFNHKGTQEQDFYVTSETVVRVPMMSREDQYH-YLLDRNLSCRVVGVPYQGNA
::: :: : . : .:::: .:.:::::: .....: :: :: : : :. . :.:.:
NP_001 FKALWEKPFISSRTTPKDFYVDENTTVRVPMMLQDQEHHWYLHDRYLPCSVLRMDYKGDA
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310
pF1KB6 TALFILPSEGKMQQVENGLSEKTLRKWLKMFKKR----QLELYLPKFSIEGSYQLEKVLP
:..::::..:::...:. :. . : .: ....:: .:::.:::::: ::: :...::
NP_001 TVFFILPNQGKMREIEEVLTPEMLMRWNNLLRKRNFYKKLELHLPKFSISGSYVLDQILP
320 330 340 350 360 370
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 SLGISNVFTSHADLSGISNHSNIQVSEMVHKAVVEVDESGTRAAAATGTIFTFRSARLNS
::....:.. ::::::........:. :::...:::.::.:::::. . : ::. :
NP_001 RLGFTDLFSKWADLSGITKQQKLEASKSFHKATLDVDEAGTEAAAATSFAIKFFSAQTNR
380 390 400 410 420 430
380 390 400
pF1KB6 QRLVFNRPFLMFIVDNN---ILFLGKVNRP
. : ::::::. : ... .:::::: :
NP_001 HILRFNRPFLVVIFSTSTQSVLFLGKVVDPTKP
440 450 460
>>XP_011535017 (OMIM: 615677) PREDICTED: serpin A9 isofo (417 aa)
initn: 1118 init1: 550 opt: 1122 Z-score: 1369.9 bits: 262.4 E(85289): 1.4e-69
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10 20 30 40 50
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XP_011 S
>>XP_011535016 (OMIM: 615677) PREDICTED: serpin A9 isofo (417 aa)
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Smith-Waterman score: 1122; 45.2% identity (75.8% similar) in 405 aa overlap (7-406:14-414)
10 20 30 40 50
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:: . . :. .:: . . . :. . : ::.: ::
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XP_011 SLQKRWIEVFIPRFSISASYNLETILPKMGIQNVFDKNADFSGIAKRDSLQVSKATHKAV
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XP_011 LDVSEEGTEATAATTTKFIVRSKDGPSYFTVSFNRTFLMMITNKATDGILFLGKVENPTK
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XP_011 S
>>NP_783866 (OMIM: 615677) serpin A9 isoform A [Homo sap (435 aa)
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10 20 30
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:: . . :. .:: . . .
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.: :.: . . :. .::..: :.:.::.::....:: .....::.:::::::: :. .
NP_783 VFSTDFSNPSIAQARINSHVKKKTQGKVVDIIQGLDLLTAMVLVNHIFFKAKWEKPFHPE
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:... : : ...:.:::: ...:. . .: .:.: :. . :.:.:.:.:.:::.:::
NP_783 YTRKNFPFLVGEQVTVHVPMMHQKEQFAFGVDTELNCFVLQMDYKGDAVAFFVLPSKGKM
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NP_783 IAKRDSLQVSKATHKAVLDVSEEGTEATAATTTKFIVRSKDGPSYFTVSFNRTFLMMITN
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400
pF1KB6 ---NNILFLGKVNRP
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NP_783 KATDGILFLGKVENPTKS
420 430
>>NP_001076 (OMIM: 107280) alpha-1-antichymotrypsin prec (423 aa)
initn: 1063 init1: 636 opt: 1111 Z-score: 1356.4 bits: 260.0 E(85289): 8.2e-69
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pF1KB6 MQLFLLLCLVLLSPQGASLHRHHPREMKKRVEDLHVGATVAPSSRRDFT
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.::.::. ::: : .:::.:::.:. ..: : :. : :: ...: :.:.:::.:
NP_001 SFQHLLRTLNQSSDELQLSMGNAMFVKEQLSLLDRFTEDAKRLYGSEAFATDFQDSAAAK
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pF1KB6 KQINDYVAKQTKGKIVDLLKNLDSNAVVIMVNYIFFKAKWETSFNHKGTQEQDFYVTSET
: ::::: . :.:::.::.:.:::......::::::::::: :. . :... ::....
NP_001 KLINDYVKNGTRGKITDLIKDLDSQTMMVLVNYIFFKAKWEMPFDPQDTHQSRFYLSKKK
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pF1KB6 VVRVPMMSRED-QYHYLLDRNLSCRVVGVPYQGNATALFILPSEGKMQQVENGLSEKTLR
: ::::: . :. :..::: :: . : :::.::::::.. ::..:: : .::.
NP_001 WVMVPMMSLHHLTIPYFRDEELSCTVVELKYTGNASALFILPDQDKMEEVEAMLLPETLK
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pF1KB6 KWLKMFKKRQL-ELYLPKFSIEGSYQLEKVLPSLGISNVFTSHADLSGISNHSNIQVSEM
.: .. :.. ::::::::: .:.:. .: .::: ..:::.::::::.. :. ::..
NP_001 RWRDSLEFREIGELYLPKFSISRDYNLNDILLQLGIEEAFTSKADLSGITGARNLAVSQV
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pF1KB6 VHKAVVEVDESGTRAAAATGTIFTFRSARLNSQRLV-FNRPFLMFIVDN---NILFLGKV
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NP_001 VHKAVLDVFEEGTEASAATAVKITLLSALVETRTIVRFNRPFLMIIVPTDTQNIFFMSKV
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pF1KB6 NRP
. :
NP_001 TNPKQA
420
>>NP_001271204 (OMIM: 615677) serpin A9 isoform C [Homo (399 aa)
initn: 1077 init1: 511 opt: 1079 Z-score: 1317.8 bits: 252.7 E(85289): 1.2e-66
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pF1KB6 MQLFLLLCLVLLSPQGASLHRHHPREMK--KRVEDLHVGATVAPSSRRDFTFDLYRALAS
::.. :.: : : .. .: .: : :.
NP_001 MRSAGGRGEIKVRRELQPSKQVSGLTNHARTGQEKR-----NLQR-LVL
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pF1KB6 AAPSQSIFFSPVSISMSLAMLSLGAGSSTKMQILEGLGLNLQKSSEKELHRGFQQLLQEL
.:::.:::::::.: ::::::::: : :: :::.:::.:: .. :. .:.:::.:.. :
NP_001 ETPSQNIFFSPVSVSTSLAMLSLGAHSVTKTQILQGLGFNLTHTPESAIHQGFQHLVHSL
50 60 70 80 90 100
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pF1KB6 NQPRDGFQLSLGNALFTDLVVDLQDTFVSAMKTLYLADTFPTNFRDSAGAMKQINDYVAK
. : . :..:.:::. ..:: .:.. .: :: :..: :.: . . :. .::..: :
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pF1KB6 QTKGKIVDLLKNLDSNAVVIMVNYIFFKAKWETSFNHKGTQEQ-DFYVTSETVVRVPMMS
.:.::.::....:: .....::.:::::::: :. . :... : : ...:.::::
NP_001 KTQGKVVDIIQGLDLLTAMVLVNHIFFKAKWEKPFHPEYTRKNFPFLVGEQVTVHVPMMH
170 180 190 200 210 220
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pF1KB6 REDQYHYLLDRNLSCRVVGVPYQGNATALFILPSEGKMQQVENGLSEKTLRKWLKMFKKR
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NP_001 QKEQFAFGVDTELNCFVLQMDYKGDAVAFFVLPSKGKMRQLEQALSARTLRKWSHSLQKR
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pF1KB6 QLELYLPKFSIEGSYQLEKVLPSLGISNVFTSHADLSGISNHSNIQVSEMVHKAVVEVDE
.:...:.::: .::.:: .::..::.::: ..::.:::......:::. .::::..:.:
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::.:.::: : : :: : : ::: :::.:.. ..:::::::. :
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>>NP_001121179 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1-anti (418 aa)
initn: 1027 init1: 988 opt: 1053 Z-score: 1285.8 bits: 246.9 E(85289): 7e-65
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pF1KB6 MQLFLLLCLVLLS----PQGASLHRHHPREMKKRVEDLHVGATVAPSSRRD
: ::: .: ::: . .. . ... .: . ..:. .
NP_001 MPSSVSWGILLLAGLCCLVPVSLAEDPQGDAAQK---TDTSHHDQDHPTFNKITPNLA-E
10 20 30 40 50
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pF1KB6 AMKQINDYVAKQTKGKIVDLLKNLDSNAVVIMVNYIFFKAKWETSFNHKGTQEQDFYVTS
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NP_001 AKKQINDYVEKGTQGKIVDLVKELDRDTVFALVNYIFFKGKWERPFEVKDTEEEDFHVDQ
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pF1KB6 ETVVRVPMMSREDQYHYLLDRNLSCRVVGVPYQGNATALFILPSEGKMQQVENGLSEKTL
:.:.::::.: ... ..:: :. . : :::::.:.::.:::.:..:: :.. .
NP_001 VTTVKVPMMKRLGMFNIQHCKKLSSWVLLMKYLGNATAIFFLPDEGKLQHLENELTHDII
240 250 260 270 280 290
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pF1KB6 RKWLKMFKKRQLELYLPKFSIEGSYQLEKVLPSLGISNVFTSHADLSGISNHSNIQVSEM
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NP_001 TKFLENEDRRSASLHLPKLSITGTYDLKSVLGQLGITKVFSNGADLSGVTEEAPLKLSKA
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:::::. .::.::.:: :..: .. ::.::.......: ::.:::
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360 370 380 390 400 410
pF1KB6 RP
:
NP_001 NPTQK
406 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 01:19:58 2016 done: Sat Nov 5 01:19:59 2016
Total Scan time: 8.570 Total Display time: 0.060
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]