Result of FASTA (omim) for pF1KB6614
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6614, 432 aa
  1>>>pF1KB6614 432 - 432 aa - 432 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3131+/-0.000536; mu= -0.6575+/- 0.033
 mean_var=291.7641+/-59.722, 0's: 0 Z-trim(116.5): 177  B-trim: 383 in 1/53
 Lambda= 0.075086
 statistics sampled from 27508 (27691) to 27508 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.655), E-opt: 0.2 (0.325), width:  16
 Scan time: 10.020

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_000413 (OMIM: 148069,167210,184500) keratin, ty ( 432) 2737 310.4 5.8e-84
NP_000517 (OMIM: 125595,131760,131800,131900,14806 ( 472) 1949 225.1 3.1e-58
NP_005548 (OMIM: 148067,167200,613000) keratin, ty ( 473) 1843 213.6 8.7e-55
NP_002266 (OMIM: 148030) keratin, type I cytoskele ( 456) 1709 199.1   2e-50
XP_011523086 (OMIM: 148030) PREDICTED: keratin, ty ( 463) 1664 194.2 5.9e-49
XP_016880103 (OMIM: 148030) PREDICTED: keratin, ty ( 437) 1645 192.1 2.4e-48
NP_002267 (OMIM: 148020) keratin, type I cytoskele ( 400) 1635 191.0 4.7e-48
NP_705694 (OMIM: 148065,615785) keratin, type I cy ( 458) 1618 189.2 1.9e-47
NP_002265 (OMIM: 148065,615785) keratin, type I cy ( 420) 1615 188.8 2.2e-47
NP_000412 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) kera ( 584) 1535 180.3 1.1e-44
XP_005257400 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) P ( 624) 1527 179.5 2.1e-44
NP_000214 (OMIM: 122100,601687) keratin, type I cy ( 494) 1466 172.8 1.8e-42
NP_003762 (OMIM: 604540) keratin, type I cuticular ( 467) 1376 163.0 1.5e-39
XP_016879788 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 494) 1368 162.2 2.8e-39
NP_061889 (OMIM: 607742) keratin, type I cytoskele ( 525) 1361 161.4 4.9e-39
NP_853515 (OMIM: 616676) keratin, type I cytoskele ( 459) 1349 160.1 1.1e-38
NP_853513 (OMIM: 616677) keratin, type I cytoskele ( 464) 1327 157.7 5.8e-38
NP_061883 (OMIM: 608218) keratin, type I cytoskele ( 424) 1298 154.5 4.8e-37
NP_002271 (OMIM: 602764) keratin, type I cuticular ( 455) 1290 153.7 9.2e-37
XP_011523096 (OMIM: 602764) PREDICTED: keratin, ty ( 455) 1290 153.7 9.2e-37
XP_011522716 (OMIM: 616646,616760) PREDICTED: kera ( 448) 1264 150.9 6.4e-36
NP_853512 (OMIM: 616646,616760) keratin, type I cy ( 450) 1264 150.9 6.4e-36
NP_000217 (OMIM: 144200,607606) keratin, type I cy ( 623) 1236 148.0 6.6e-35
NP_853517 (OMIM: 616675) keratin, type I cytoskele ( 468) 1223 146.4 1.4e-34
NP_002270 (OMIM: 602762) keratin, type I cuticular ( 404) 1216 145.6 2.2e-34
NP_002268 (OMIM: 601077) keratin, type I cuticular ( 416) 1213 145.3 2.8e-34
XP_006721802 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 427) 1212 145.2 3.1e-34
NP_004129 (OMIM: 602761) keratin, type I cuticular ( 404) 1211 145.1 3.2e-34
XP_011523095 (OMIM: 602763) PREDICTED: keratin, ty ( 412) 1207 144.6 4.4e-34
NP_066293 (OMIM: 602763) keratin, type I cuticular ( 436) 1207 144.7 4.5e-34
NP_002269 (OMIM: 602760) keratin, type I cuticular ( 448) 1201 144.0 7.3e-34
XP_011522762 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 422) 1193 143.1 1.3e-33
NP_872303 (OMIM: 616679) keratin, type I cytoskele ( 431) 1103 133.4 1.1e-30
XP_016879678 (OMIM: 616679) PREDICTED: keratin, ty ( 484) 1103 133.4 1.2e-30
NP_954657 (OMIM: 148070) keratin, type I cytoskele ( 430) 1091 132.1 2.7e-30
NP_000215 (OMIM: 148070) keratin, type I cytoskele ( 430) 1091 132.1 2.7e-30
NP_006762 (OMIM: 604542) keratin, type I cuticular ( 456) 1066 129.4 1.9e-29
NP_003761 (OMIM: 604541) keratin, type I cuticular ( 449) 1060 128.8 2.9e-29
NP_056330 (OMIM: 606194) keratin, type I cytoskele ( 422) 1057 128.4 3.5e-29
NP_998821 (OMIM: 616678) keratin, type I cytoskele ( 491) 1058 128.6 3.6e-29
XP_011522897 (OMIM: 606194) PREDICTED: keratin, ty ( 285)  752 95.2 2.3e-19
NP_001269362 (OMIM: 606194) keratin, type I cytosk ( 285)  752 95.2 2.3e-19
XP_005257257 (OMIM: 606194) PREDICTED: keratin, ty ( 285)  752 95.2 2.3e-19
NP_002046 (OMIM: 137780,203450) glial fibrillary a ( 432)  689 88.6 3.5e-17
NP_001124491 (OMIM: 137780,203450) glial fibrillar ( 431)  680 87.6 6.9e-17
XP_016879940 (OMIM: 137780,203450) PREDICTED: glia ( 472)  680 87.6 7.3e-17
NP_005373 (OMIM: 162250) neurofilament medium poly ( 916)  686 88.6 7.4e-17
NP_001229305 (OMIM: 137780,203450) glial fibrillar ( 438)  679 87.5 7.5e-17
XP_011523088 (OMIM: 602761) PREDICTED: keratin, ty ( 245)  660 85.2 2.1e-16
NP_001918 (OMIM: 125660,181400,601419,602067,60476 ( 470)  651 84.5 6.5e-16


>>NP_000413 (OMIM: 148069,167210,184500) keratin, type I  (432 aa)
 initn: 2737 init1: 2737 opt: 2737  Z-score: 1628.4  bits: 310.4 E(85289): 5.8e-84
Smith-Waterman score: 2737; 100.0% identity (100.0% similar) in 432 aa overlap (1-432:1-432)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MTTSIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSCRLGSAGGLGSTLGGSSYSSC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MTTSIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSCRLGSAGGLGSTLGGSSYSSC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 YSFGSGGGYGSSFGGVDGLLAGGEKATMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YSFGSGGGYGSSFGGVDGLLAGGEKATMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 QRQAPGPARDYSQYYRTIEELQNKILTATVDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 QRQAPGPARDYSQYYRTIEELQNKILTATVDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 LSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 MDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 SELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEM
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 EQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLTQYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDGKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 EQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLTQYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDGKV
              370       380       390       400       410       420

              430  
pF1KB6 ISSREQVHQTTR
       ::::::::::::
NP_000 ISSREQVHQTTR
              430  

>>NP_000517 (OMIM: 125595,131760,131800,131900,148066,16  (472 aa)
 initn: 2248 init1: 1867 opt: 1949  Z-score: 1166.6  bits: 225.1 E(85289): 3.1e-58
Smith-Waterman score: 2089; 74.5% identity (86.2% similar) in 470 aa overlap (1-430:1-470)

               10            20               30            40     
pF1KB6 MTTSIRQFTSSSSIKGS----SGLGGGSSRTS-------CR----LSGGLGAGSCRLGSA
       :::  ::::::::.:::    .:.:::::: :       ::     .:::...: :..:.
NP_000 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSSRFSSG
               10        20        30        40        50        60

            50        60                      70        80         
pF1KB6 G--GLGSTLGGSSYSSCYSFGSG--------------GGYGSSFGGVDGLLAGGEKATMQ
       :  :::.  ::.  ::  :::::              ::.:..:.: ::::.:.::.:::
NP_000 GAYGLGGGYGGGFSSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGLGGGFGGGFAGGDGLLVGSEKVTMQ
               70        80        90       100       110       120

      90       100       110       120       130       140         
pF1KB6 NLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQAPGPARDYSQYYRTIEELQNKILTAT
       ::::::::::::::::::::..:::::::::::: :.  .::: :..:::.:.:::::::
NP_000 NLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPAEIKDYSPYFKTIEDLRNKILTAT
              130       140       150       160       170       180

     150       160       170       180       190       200         
pF1KB6 VDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIE
       :::::.:::::::::::::::::.:::  ::.::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VDNANVLLQIDNARLAADDFRTKYETELNLRMSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIE
              190       200       210       220       230       240

     210       220       230       240       250       260         
pF1KB6 NLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRK
       .:::::::::::::::::::::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRK
              250       260       270       280       290       300

     270       280       290       300       310       320         
pF1KB6 DAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLA
       :::.:::.::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::..: 
NP_000 DAEEWFFTKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQNLEIELQSQLSMKASLENSLE
              310       320       330       340       350       360

     330       340       350       360       370       380         
pF1KB6 ETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLE
       ::..:::.::.::: .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLE
              370       380       390       400       410       420

     390         400              410       420       430  
pF1KB6 GEDAHLT--QYKK-----EPVTT--RQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR
       ::::::.  :...     . ::.  ::.:: : .:.::::.:..::: .:  
NP_000 GEDAHLSSSQFSSGSQSSRDVTSSSRQIRTKVMDVHDGKVVSTHEQVLRTKN
              430       440       450       460       470  

>>NP_005548 (OMIM: 148067,167200,613000) keratin, type I  (473 aa)
 initn: 2010 init1: 1803 opt: 1843  Z-score: 1104.5  bits: 213.6 E(85289): 8.7e-55
Smith-Waterman score: 1897; 70.1% identity (84.7% similar) in 445 aa overlap (2-410:2-445)

               10        20        30        40                    
pF1KB6 MTTSIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSCRL----------------GS
        ::  ::::::::.::: :.::: .  : :.:. :..::::                 :.
NP_005 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSRFSSGG
               10        20        30        40        50        60

           50        60          70                        80      
pF1KB6 AGGLGSTLGGSSYSSCYSFGSG--GGYGSSFG----------------GVDGLLAGGEKA
       : :::.  ::. .::  :::::  ::::...:                : ::::.:.::.
NP_005 ACGLGGGYGGG-FSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGFGGGLGAGFGGGFAGGDGLLVGSEKV
               70         80        90       100       110         

         90       100       110       120       130       140      
pF1KB6 TMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQAPGPARDYSQYYRTIEELQNKIL
       :::::::::::::::::::::::..:::::::::::: :.  .::: :..:::.:.:::.
NP_005 TMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPSEIKDYSPYFKTIEDLRNKII
     120       130       140       150       160       170         

        150       160       170       180       190       200      
pF1KB6 TATVDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEM
       .::..::. .::::::::::::::::.: : ::: .::::.::::::::::::::.::::
NP_005 AATIENAQPILQIDNARLAADDFRTKYEHELALRQTVEADVNGLRRVLDELTLARTDLEM
     180       190       200       210       220       230         

        210       220       230       240       250       260      
pF1KB6 QIENLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEK
       :::.::::::::.::::::: :::::.::..::::::::::::::::::::::::.::::
NP_005 QIEGLKEELAYLRKNHEEEMLALRGQTGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEQMAEK
     240       250       260       270       280       290         

        270       280       290       300       310       320      
pF1KB6 NRKDAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEG
       ::.::: ::.:::::::.:::.:::::::..::..::::..:.::::::::::::::::.
NP_005 NRRDAETWFLSKTEELNKEVASNSELVQSSRSEVTELRRVLQGLEIELQSQLSMKASLEN
     300       310       320       330       340       350         

        330       340       350       360       370       380      
pF1KB6 NLAETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRR
       .: ::..:::.::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::::
NP_005 SLEETKGRYCMQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQSQEYQILLDVKTRLEQEIATYRR
     360       370       380       390       400       410         

        390         400       410       420       430        
pF1KB6 LLEGEDAHLT--QYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR      
       :::::::::.  : . .  ..:.: :                            
NP_005 LLEGEDAHLSSQQASGQSYSSREVFTSSSSSSSRQTRPILKEQSSSSFSQGQSS
     420       430       440       450       460       470   

>>NP_002266 (OMIM: 148030) keratin, type I cytoskeletal   (456 aa)
 initn: 1626 init1: 1307 opt: 1709  Z-score: 1026.3  bits: 199.1 E(85289): 2e-50
Smith-Waterman score: 1721; 62.1% identity (83.7% similar) in 454 aa overlap (1-426:1-454)

               10            20        30             40           
pF1KB6 MTTSIRQFTSSS----SIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLG-----AGSCRL---GSAGGL
       :::.. : .::.    : .:.: :.::..  .  :::: :     :.: :.   ::.:: 
NP_002 MTTTFLQTSSSTFGGGSTRGGSLLAGGGGFGGGSLSGGGGSRSISASSARFVSSGSGGGY
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB6 GSTL--------GGSSYSSCYSFGSGGGYGSSFGGVDG-LLAGGEKATMQNLNDRLASYL
       :. .        .:: ... .. : :::.:..::: :: ::.:.:: :::::::::::::
NP_002 GGGMRVCGFGGGAGSVFGGGFGGGVGGGFGGGFGGGDGGLLSGNEKITMQNLNDRLASYL
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     100       110       120        130       140       150        
pF1KB6 DKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQAP-GPARDYSQYYRTIEELQNKILTATVDNANILLQ
       ::::::::::..:::::.::::.:.: .:  :::::..:::::..::...:.::. ..:.
NP_002 DKVRALEEANADLEVKIHDWYQKQTPTSPECDYSQYFKTIEELRDKIMATTIDNSRVILE
              130       140       150       160       170       180

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pF1KB6 IDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENLKEELAYL
       :::::::::::: :.:.: ::: .:::::::::::::::::::.:::::::.:.::::::
NP_002 IDNARLAADDFRLKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLNEELAYL
              190       200       210       220       230       240

      220       230       240       250       260       270        
pF1KB6 KKNHEEEMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEDWFFSK
       ::::::::. . .:..:..::::::::::::.:.: :::.::: ::::::.:.: :::::
NP_002 KKNHEEEMKEFSSQLAGQVNVEMDAAPGVDLTRVLAEMREQYEAMAEKNRRDVEAWFFSK
              250       260       270       280       290       300

      280       290       300       310       320       330        
pF1KB6 TEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAETENRYCVQ
       :::::.:::.:.:..:..:.::..:::::: :::::::::::::.::..::::: :: .:
NP_002 TEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQSQLSMKAGLENSLAETECRYATQ
              310       320       330       340       350       360

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pF1KB6 LSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLTQY
       :.:::::::..: ::..:::::: ::::::.:::.:::::::::::: ::::.::...  
NP_002 LQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKMAGI
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      400             410       420       430  
pF1KB6 KKEPVTT------RQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR
         . ...       . .  :::  ::.:.::...      
NP_002 GIREASSGGGGSSSNFHINVEESVDGQVVSSHKREI    
              430       440       450          

>>XP_011523086 (OMIM: 148030) PREDICTED: keratin, type I  (463 aa)
 initn: 1614 init1: 834 opt: 1664  Z-score: 999.9  bits: 194.2 E(85289): 5.9e-49
Smith-Waterman score: 1698; 61.2% identity (82.4% similar) in 461 aa overlap (1-426:1-461)

               10            20        30             40           
pF1KB6 MTTSIRQFTSSS----SIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLG-----AGSCRL---GSAGGL
       :::.. : .::.    : .:.: :.::..  .  :::: :     :.: :.   ::.:: 
XP_011 MTTTFLQTSSSTFGGGSTRGGSLLAGGGGFGGGSLSGGGGSRSISASSARFVSSGSGGGY
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB6 GSTL--------GGSSYSSCYSFGSGGGYGSSFGGVDG-LLAGGEKATMQNLNDRLASYL
       :. .        .:: ... .. : :::.:..::: :: ::.:.:: :::::::::::::
XP_011 GGGMRVCGFGGGAGSVFGGGFGGGVGGGFGGGFGGGDGGLLSGNEKITMQNLNDRLASYL
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pF1KB6 DKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQAP-GPARDYSQYYRTIEELQNKILTATVDNANILLQ
       ::::::::::..:::::.::::.:.: .:  :::::..:::::..::...:.::. ..:.
XP_011 DKVRALEEANADLEVKIHDWYQKQTPTSPECDYSQYFKTIEELRDKIMATTIDNSRVILE
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pF1KB6 IDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENLKEELAYL
       :::::::::::: :.:.: ::: .:::::::::::::::::::.:::::::.:.::::::
XP_011 IDNARLAADDFRLKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLNEELAYL
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pF1KB6 KKNHEE-------EMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDA
       ::::::       ::. . .:..:..::::::::::::.:.: :::.::: ::::::.:.
XP_011 KKNHEEWVPPILQEMKEFSSQLAGQVNVEMDAAPGVDLTRVLAEMREQYEAMAEKNRRDV
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pF1KB6 EDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAET
       : ::::::::::.:::.:.:..:..:.::..:::::: :::::::::::::.::..::::
XP_011 EAWFFSKTEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQSQLSMKAGLENSLAET
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             340       350       360       370       380       390 
pF1KB6 ENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGE
       : :: .::.:::::::..: ::..:::::: ::::::.:::.:::::::::::: ::::.
XP_011 ECRYATQLQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQ
              370       380       390       400       410       420

             400             410       420       430  
pF1KB6 DAHLTQYKKEPVTT------RQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR
       ::...    . ...       . .  :::  ::.:.::...      
XP_011 DAKMAGIAIREASSGGGGSSSNFHINVEESVDGQVVSSHKREI    
              430       440       450       460       

>>XP_016880103 (OMIM: 148030) PREDICTED: keratin, type I  (437 aa)
 initn: 1614 init1: 834 opt: 1645  Z-score: 989.1  bits: 192.1 E(85289): 2.4e-48
Smith-Waterman score: 1679; 64.6% identity (84.9% similar) in 424 aa overlap (1-395:1-424)

               10            20        30             40           
pF1KB6 MTTSIRQFTSSS----SIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLG-----AGSCRL---GSAGGL
       :::.. : .::.    : .:.: :.::..  .  :::: :     :.: :.   ::.:: 
XP_016 MTTTFLQTSSSTFGGGSTRGGSLLAGGGGFGGGSLSGGGGSRSISASSARFVSSGSGGGY
               10        20        30        40        50        60

       50                60        70         80        90         
pF1KB6 GSTL--------GGSSYSSCYSFGSGGGYGSSFGGVDG-LLAGGEKATMQNLNDRLASYL
       :. .        .:: ... .. : :::.:..::: :: ::.:.:: :::::::::::::
XP_016 GGGMRVCGFGGGAGSVFGGGFGGGVGGGFGGGFGGGDGGLLSGNEKITMQNLNDRLASYL
               70        80        90       100       110       120

     100       110       120        130       140       150        
pF1KB6 DKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQAP-GPARDYSQYYRTIEELQNKILTATVDNANILLQ
       ::::::::::..:::::.::::.:.: .:  :::::..:::::..::...:.::. ..:.
XP_016 DKVRALEEANADLEVKIHDWYQKQTPTSPECDYSQYFKTIEELRDKIMATTIDNSRVILE
              130       140       150       160       170       180

      160       170       180       190       200       210        
pF1KB6 IDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENLKEELAYL
       :::::::::::: :.:.: ::: .:::::::::::::::::::.:::::::.:.::::::
XP_016 IDNARLAADDFRLKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLNEELAYL
              190       200       210       220       230       240

      220              230       240       250       260       270 
pF1KB6 KKNHEE-------EMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDA
       ::::::       ::. . .:..:..::::::::::::.:.: :::.::: ::::::.:.
XP_016 KKNHEEWVPPILQEMKEFSSQLAGQVNVEMDAAPGVDLTRVLAEMREQYEAMAEKNRRDV
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pF1KB6 EDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAET
       : ::::::::::.:::.:.:..:..:.::..:::::: :::::::::::::.::..::::
XP_016 EAWFFSKTEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQSQLSMKAGLENSLAET
              310       320       330       340       350       360

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pF1KB6 ENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGE
       : :: .::.:::::::..: ::..:::::: ::::::.:::.:::::::::::: ::::.
XP_016 ECRYATQLQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQ
              370       380       390       400       410       420

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pF1KB6 DAHLTQYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR
       ::..                                     
XP_016 DAKMAGIAIREAYSFSL                        
              430                               

>>NP_002267 (OMIM: 148020) keratin, type I cytoskeletal   (400 aa)
 initn: 1675 init1: 1580 opt: 1635  Z-score: 983.7  bits: 191.0 E(85289): 4.7e-48
Smith-Waterman score: 1635; 65.7% identity (87.7% similar) in 397 aa overlap (1-394:1-390)

                10        20        30        40         50        
pF1KB6 MTT-SIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSCRL-GSAGGLGSTLGGSSYS
       ::. : :: ...::.   .::::::     :.. :..  .  . :..:: : ..... . 
NP_002 MTSYSYRQSSATSSF---GGLGGGS----VRFGPGVAFRAPSIHGGSGGRGVSVSSARFV
               10           20            30        40        50   

       60         70        80        90       100       110       
pF1KB6 SCYSFGS-GGGYGSSFGGVDGLLAGGEKATMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIR
       :  : :. :::::. . . ::::::.:: :::::::::::::::::::: :: :::::::
NP_002 SSSSSGAYGGGYGGVLTASDGLLAGNEKLTMQNLNDRLASYLDKVRALEAANGELEVKIR
            60        70        80        90       100       110   

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB6 DWYQRQAPGPARDYSQYYRTIEELQNKILTATVDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQ
       ::::.:.:::.::::.:: ::..:..::: ::..:. :.:::::::::::::::::::::
NP_002 DWYQKQGPGPSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQ
           120       130       140       150       160       170   

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB6 ALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEI
       :::.::::::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::...:::::::..
NP_002 ALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQV
           180       190       200       210       220       230   

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB6 NVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGK
       .::.:.:::.::..::..::.::: :::.:::::: :: :.::::::::: ..: .: ..
NP_002 SVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSR
           240       250       260       270       280       290   

       300       310       320       330       340       350       
pF1KB6 SEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLR
       ::...::::.:.:::::::::::::.:: .::::: :. .::..::.::...: ::...:
NP_002 SEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVR
           300       310       320       330       340       350   

       360       370       380       390       400       410       
pF1KB6 CEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLTQYKKEPVTTRQVRTIVEEVQD
        . :.:::::. :.:.:.:::::::::: ::::.. :                       
NP_002 ADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHYNNLSASKVL             
           360       370       380       390       400             

       420       430  
pF1KB6 GKVISSREQVHQTTR

>>NP_705694 (OMIM: 148065,615785) keratin, type I cytosk  (458 aa)
 initn: 1546 init1: 1271 opt: 1618  Z-score: 973.0  bits: 189.2 E(85289): 1.9e-47
Smith-Waterman score: 1639; 59.7% identity (81.3% similar) in 449 aa overlap (4-423:2-444)

               10        20        30        40             50     
pF1KB6 MTTSIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSCRL-----GSAGGLGSTLG--
          :.:  .::.:  :  :.::::    :.:.:: :...:       ::::: :. ..  
NP_705   MSLRLQSSSASYGG--GFGGGS----CQLGGGRGVSTCSTRFVSGGSAGGYGGGVSCG
                 10          20            30        40        50  

                 60        70                        80        90  
pF1KB6 -----GSSYSSCYSFGSGGGYGSSFGG----------VD------GLLAGGEKATMQNLN
            ::.... :. : :::::...::          ::      :::.:.:: ::::::
NP_705 FGGGAGSGFGGGYGGGLGGGYGGGLGGGFGGGFAGGFVDFGACDGGLLTGNEKITMQNLN
             60        70        80        90       100       110  

            100       110       120        130       140       150 
pF1KB6 DRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQAPG-PARDYSQYYRTIEELQNKILTATVD
       :::::::.:::::::::..::::::::. .:.:. : :::: ::.:::::..::::::..
NP_705 DRLASYLEKVRALEEANADLEVKIRDWHLKQSPASPERDYSPYYKTIEELRDKILTATIE
            120       130       140       150       160       170  

             160       170       180       190       200       210 
pF1KB6 NANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENL
       :  ..:.:::::::::::: :.:.: ::: ::::::::::::::::::...:::::::.:
NP_705 NNRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELTLSKTDLEMQIESL
            180       190       200       210       220       230  

             220       230       240       250       260       270 
pF1KB6 KEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDA
       .:::::.::::::::. . .:: :..::::::.::.::.:.: :::.::: :::.::.::
NP_705 NEELAYMKKNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAMAERNRRDA
            240       250       260       270       280       290  

             280       290       300       310       320       330 
pF1KB6 EDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAET
       :.:: .:. :::.::.::. ..:..:.::.:::::.:.:::::::::::::.::...:::
NP_705 EEWFHAKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAGLENTVAET
            300       310       320       330       340       350  

             340       350       360       370       380       390 
pF1KB6 ENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGE
       : :: .::.::::::.:.: ::..:: ::: ::::::.:::.:::::::::::: ::::.
NP_705 ECRYALQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQ
            360       370       380       390       400       410  

             400       410       420       430       
pF1KB6 DAHLTQYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR     
       ::..  . .   ..    : :  .....: ..              
NP_705 DAKMIGFPSSAGSVSPRSTSVTTTSSASVTTTSNASGRRTSDVRRP
            420       430       440       450        

>>NP_002265 (OMIM: 148065,615785) keratin, type I cytosk  (420 aa)
 initn: 1545 init1: 1270 opt: 1615  Z-score: 971.7  bits: 188.8 E(85289): 2.2e-47
Smith-Waterman score: 1636; 62.9% identity (83.0% similar) in 423 aa overlap (4-397:2-418)

               10        20        30        40             50     
pF1KB6 MTTSIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSCRL-----GSAGGLGSTLG--
          :.:  .::.:  :  :.:::    ::.:.:: :...:       ::::: :. ..  
NP_002   MSLRLQSSSASYGG--GFGGG----SCQLGGGRGVSTCSTRFVSGGSAGGYGGGVSCG
                 10              20        30        40        50  

                 60        70                        80        90  
pF1KB6 -----GSSYSSCYSFGSGGGYGSSFGG----------VD------GLLAGGEKATMQNLN
            ::.... :. : :::::...::          ::      :::.:.:: ::::::
NP_002 FGGGAGSGFGGGYGGGLGGGYGGGLGGGFGGGFAGGFVDFGACDGGLLTGNEKITMQNLN
             60        70        80        90       100       110  

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pF1KB6 DRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQAPG-PARDYSQYYRTIEELQNKILTATVD
       :::::::.:::::::::..::::::::. .:.:. : :::: ::.:::::..::::::..
NP_002 DRLASYLEKVRALEEANADLEVKIRDWHLKQSPASPERDYSPYYKTIEELRDKILTATIE
            120       130       140       150       160       170  

             160       170       180       190       200       210 
pF1KB6 NANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENL
       :  ..:.:::::::::::: :.:.: ::: ::::::::::::::::::...:::::::.:
NP_002 NNRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELTLSKTDLEMQIESL
            180       190       200       210       220       230  

             220       230       240       250       260       270 
pF1KB6 KEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDA
       .:::::.::::::::. . .:: :..::::::.::.::.:.: :::.::: :::.::.::
NP_002 NEELAYMKKNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAMAERNRRDA
            240       250       260       270       280       290  

             280       290       300       310       320       330 
pF1KB6 EDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAET
       :.:: .:. :::.::.::. ..:..:.::.:::::.:.:::::::::::::.::...:::
NP_002 EEWFHAKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAGLENTVAET
            300       310       320       330       340       350  

             340       350       360       370       380       390 
pF1KB6 ENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGE
       : :: .::.::::::.:.: ::..:: ::: ::::::.:::.:::::::::::: ::::.
NP_002 ECRYALQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQ
            360       370       380       390       400       410  

             400       410       420       430  
pF1KB6 DAHLTQYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR
       ::.  :                                   
NP_002 DAKKRQPP                                 
            420                                 

>>NP_000412 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) keratin,  (584 aa)
 initn: 1481 init1: 1183 opt: 1535  Z-score: 923.1  bits: 180.3 E(85289): 1.1e-44
Smith-Waterman score: 1535; 65.5% identity (84.0% similar) in 388 aa overlap (10-391:70-456)

                                    10        20        30         
pF1KB6                      MTTSIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLS--GGLGA
                                     ::..  : .:.:::: : :   :  ::  .
NP_000 KGSLGGGFSSGGFSGGSFSRGSSGGGCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFRGSYGSSSFGGSYG
      40        50        60        70        80        90         

        40        50        60         70        80        90      
pF1KB6 GSCRLGSAGGLGSTLGGSSYSSCYSFGS-GGGYGSSFGGVDGLLAGGEKATMQNLNDRLA
       ::   :: :: ::  :::  .. .. :. :::.:..:::  :::.:.::.::::::::::
NP_000 GSFGGGSFGG-GSFGGGSFGGGGFGGGGFGGGFGGGFGGDGGLLSGNEKVTMQNLNDRLA
     100        110       120       130       140       150        

        100       110       120          130       140       150   
pF1KB6 SYLDKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQA---PGPARDYSQYYRTIEELQNKILTATVDNA
       :::::::::::.: ::: ::..::....    :  ::::.::.::..:.:.::. :.:::
NP_000 SYLDKVRALEESNYELEGKIKEWYEKHGNSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNA
      160       170       180       190       200       210        

           160       170       180       190       200       210   
pF1KB6 NILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENLKE
       ::::::::::::::::: :.:.: ::: ::::::::::::::::::..::::::::.: :
NP_000 NILLQIDNARLAADDFRLKYENEVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTE
      220       230       240       250       260       270        

           220       230       240       250       260       270   
pF1KB6 ELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAED
       :::::::::::::. ::.   :..::::.:::::::...::.::.:::..::.:::::: 
NP_000 ELAYLKKNHEEEMKDLRNVSTGDVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEA
      280       290       300       310       320       330        

           280       290       300       310       320       330   
pF1KB6 WFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAETEN
       ::  :..::. :. .: : ..: ::::.::::..:::::::::::..: :::..:::::.
NP_000 WFNEKSKELTTEIDNNIEQISSYKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEG
      340       350       360       370       380       390        

           340       350       360       370       380       390   
pF1KB6 RYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDA
       ::::::::::. :...:::: :.: : : :: ::. :::.: :::.:: ::: :::::  
NP_000 RYCVQLSQIQAQISALEEQLQQIRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGS
      400       410       420       430       440       450        

           400       410       420       430                       
pF1KB6 HLTQYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR                     
                                                                   
NP_000 SGGGGRGGGSFGGGYGGGSSGGGSSGGGHGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSS
      460       470       480       490       500       510        




432 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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