FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6614, 432 aa
1>>>pF1KB6614 432 - 432 aa - 432 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3131+/-0.000536; mu= -0.6575+/- 0.033
mean_var=291.7641+/-59.722, 0's: 0 Z-trim(116.5): 177 B-trim: 383 in 1/53
Lambda= 0.075086
statistics sampled from 27508 (27691) to 27508 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.655), E-opt: 0.2 (0.325), width: 16
Scan time: 10.020
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000413 (OMIM: 148069,167210,184500) keratin, ty ( 432) 2737 310.4 5.8e-84
NP_000517 (OMIM: 125595,131760,131800,131900,14806 ( 472) 1949 225.1 3.1e-58
NP_005548 (OMIM: 148067,167200,613000) keratin, ty ( 473) 1843 213.6 8.7e-55
NP_002266 (OMIM: 148030) keratin, type I cytoskele ( 456) 1709 199.1 2e-50
XP_011523086 (OMIM: 148030) PREDICTED: keratin, ty ( 463) 1664 194.2 5.9e-49
XP_016880103 (OMIM: 148030) PREDICTED: keratin, ty ( 437) 1645 192.1 2.4e-48
NP_002267 (OMIM: 148020) keratin, type I cytoskele ( 400) 1635 191.0 4.7e-48
NP_705694 (OMIM: 148065,615785) keratin, type I cy ( 458) 1618 189.2 1.9e-47
NP_002265 (OMIM: 148065,615785) keratin, type I cy ( 420) 1615 188.8 2.2e-47
NP_000412 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) kera ( 584) 1535 180.3 1.1e-44
XP_005257400 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) P ( 624) 1527 179.5 2.1e-44
NP_000214 (OMIM: 122100,601687) keratin, type I cy ( 494) 1466 172.8 1.8e-42
NP_003762 (OMIM: 604540) keratin, type I cuticular ( 467) 1376 163.0 1.5e-39
XP_016879788 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 494) 1368 162.2 2.8e-39
NP_061889 (OMIM: 607742) keratin, type I cytoskele ( 525) 1361 161.4 4.9e-39
NP_853515 (OMIM: 616676) keratin, type I cytoskele ( 459) 1349 160.1 1.1e-38
NP_853513 (OMIM: 616677) keratin, type I cytoskele ( 464) 1327 157.7 5.8e-38
NP_061883 (OMIM: 608218) keratin, type I cytoskele ( 424) 1298 154.5 4.8e-37
NP_002271 (OMIM: 602764) keratin, type I cuticular ( 455) 1290 153.7 9.2e-37
XP_011523096 (OMIM: 602764) PREDICTED: keratin, ty ( 455) 1290 153.7 9.2e-37
XP_011522716 (OMIM: 616646,616760) PREDICTED: kera ( 448) 1264 150.9 6.4e-36
NP_853512 (OMIM: 616646,616760) keratin, type I cy ( 450) 1264 150.9 6.4e-36
NP_000217 (OMIM: 144200,607606) keratin, type I cy ( 623) 1236 148.0 6.6e-35
NP_853517 (OMIM: 616675) keratin, type I cytoskele ( 468) 1223 146.4 1.4e-34
NP_002270 (OMIM: 602762) keratin, type I cuticular ( 404) 1216 145.6 2.2e-34
NP_002268 (OMIM: 601077) keratin, type I cuticular ( 416) 1213 145.3 2.8e-34
XP_006721802 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 427) 1212 145.2 3.1e-34
NP_004129 (OMIM: 602761) keratin, type I cuticular ( 404) 1211 145.1 3.2e-34
XP_011523095 (OMIM: 602763) PREDICTED: keratin, ty ( 412) 1207 144.6 4.4e-34
NP_066293 (OMIM: 602763) keratin, type I cuticular ( 436) 1207 144.7 4.5e-34
NP_002269 (OMIM: 602760) keratin, type I cuticular ( 448) 1201 144.0 7.3e-34
XP_011522762 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 422) 1193 143.1 1.3e-33
NP_872303 (OMIM: 616679) keratin, type I cytoskele ( 431) 1103 133.4 1.1e-30
XP_016879678 (OMIM: 616679) PREDICTED: keratin, ty ( 484) 1103 133.4 1.2e-30
NP_954657 (OMIM: 148070) keratin, type I cytoskele ( 430) 1091 132.1 2.7e-30
NP_000215 (OMIM: 148070) keratin, type I cytoskele ( 430) 1091 132.1 2.7e-30
NP_006762 (OMIM: 604542) keratin, type I cuticular ( 456) 1066 129.4 1.9e-29
NP_003761 (OMIM: 604541) keratin, type I cuticular ( 449) 1060 128.8 2.9e-29
NP_056330 (OMIM: 606194) keratin, type I cytoskele ( 422) 1057 128.4 3.5e-29
NP_998821 (OMIM: 616678) keratin, type I cytoskele ( 491) 1058 128.6 3.6e-29
XP_011522897 (OMIM: 606194) PREDICTED: keratin, ty ( 285) 752 95.2 2.3e-19
NP_001269362 (OMIM: 606194) keratin, type I cytosk ( 285) 752 95.2 2.3e-19
XP_005257257 (OMIM: 606194) PREDICTED: keratin, ty ( 285) 752 95.2 2.3e-19
NP_002046 (OMIM: 137780,203450) glial fibrillary a ( 432) 689 88.6 3.5e-17
NP_001124491 (OMIM: 137780,203450) glial fibrillar ( 431) 680 87.6 6.9e-17
XP_016879940 (OMIM: 137780,203450) PREDICTED: glia ( 472) 680 87.6 7.3e-17
NP_005373 (OMIM: 162250) neurofilament medium poly ( 916) 686 88.6 7.4e-17
NP_001229305 (OMIM: 137780,203450) glial fibrillar ( 438) 679 87.5 7.5e-17
XP_011523088 (OMIM: 602761) PREDICTED: keratin, ty ( 245) 660 85.2 2.1e-16
NP_001918 (OMIM: 125660,181400,601419,602067,60476 ( 470) 651 84.5 6.5e-16
>>NP_000413 (OMIM: 148069,167210,184500) keratin, type I (432 aa)
initn: 2737 init1: 2737 opt: 2737 Z-score: 1628.4 bits: 310.4 E(85289): 5.8e-84
Smith-Waterman score: 2737; 100.0% identity (100.0% similar) in 432 aa overlap (1-432:1-432)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MTTSIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSCRLGSAGGLGSTLGGSSYSSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MTTSIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSCRLGSAGGLGSTLGGSSYSSC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 YSFGSGGGYGSSFGGVDGLLAGGEKATMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YSFGSGGGYGSSFGGVDGLLAGGEKATMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 QRQAPGPARDYSQYYRTIEELQNKILTATVDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 QRQAPGPARDYSQYYRTIEELQNKILTATVDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 MDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 SELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 EQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLTQYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDGKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 EQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLTQYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDGKV
370 380 390 400 410 420
430
pF1KB6 ISSREQVHQTTR
::::::::::::
NP_000 ISSREQVHQTTR
430
>>NP_000517 (OMIM: 125595,131760,131800,131900,148066,16 (472 aa)
initn: 2248 init1: 1867 opt: 1949 Z-score: 1166.6 bits: 225.1 E(85289): 3.1e-58
Smith-Waterman score: 2089; 74.5% identity (86.2% similar) in 470 aa overlap (1-430:1-470)
10 20 30 40
pF1KB6 MTTSIRQFTSSSSIKGS----SGLGGGSSRTS-------CR----LSGGLGAGSCRLGSA
::: ::::::::.::: .:.:::::: : :: .:::...: :..:.
NP_000 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSSRFSSG
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80
pF1KB6 G--GLGSTLGGSSYSSCYSFGSG--------------GGYGSSFGGVDGLLAGGEKATMQ
: :::. ::. :: ::::: ::.:..:.: ::::.:.::.:::
NP_000 GAYGLGGGYGGGFSSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGLGGGFGGGFAGGDGLLVGSEKVTMQ
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 NLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQAPGPARDYSQYYRTIEELQNKILTAT
::::::::::::::::::::..:::::::::::: :. .::: :..:::.:.:::::::
NP_000 NLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPAEIKDYSPYFKTIEDLRNKILTAT
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 VDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIE
:::::.:::::::::::::::::.::: ::.::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VDNANVLLQIDNARLAADDFRTKYETELNLRMSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIE
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 NLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRK
.:::::::::::::::::::::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRK
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 DAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLA
:::.:::.::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::..:
NP_000 DAEEWFFTKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQNLEIELQSQLSMKASLENSLE
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 ETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLE
::..:::.::.::: .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLE
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430
pF1KB6 GEDAHLT--QYKK-----EPVTT--RQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR
::::::. :... . ::. ::.:: : .:.::::.:..::: .:
NP_000 GEDAHLSSSQFSSGSQSSRDVTSSSRQIRTKVMDVHDGKVVSTHEQVLRTKN
430 440 450 460 470
>>NP_005548 (OMIM: 148067,167200,613000) keratin, type I (473 aa)
initn: 2010 init1: 1803 opt: 1843 Z-score: 1104.5 bits: 213.6 E(85289): 8.7e-55
Smith-Waterman score: 1897; 70.1% identity (84.7% similar) in 445 aa overlap (2-410:2-445)
10 20 30 40
pF1KB6 MTTSIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSCRL----------------GS
:: ::::::::.::: :.::: . : :.:. :..:::: :.
NP_005 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSRFSSGG
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80
pF1KB6 AGGLGSTLGGSSYSSCYSFGSG--GGYGSSFG----------------GVDGLLAGGEKA
: :::. ::. .:: ::::: ::::...: : ::::.:.::.
NP_005 ACGLGGGYGGG-FSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGFGGGLGAGFGGGFAGGDGLLVGSEKV
70 80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 TMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQAPGPARDYSQYYRTIEELQNKIL
:::::::::::::::::::::::..:::::::::::: :. .::: :..:::.:.:::.
NP_005 TMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPSEIKDYSPYFKTIEDLRNKII
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150 160 170 180 190 200
pF1KB6 TATVDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEM
.::..::. .::::::::::::::::.: : ::: .::::.::::::::::::::.::::
NP_005 AATIENAQPILQIDNARLAADDFRTKYEHELALRQTVEADVNGLRRVLDELTLARTDLEM
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 QIENLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEK
:::.::::::::.::::::: :::::.::..::::::::::::::::::::::::.::::
NP_005 QIEGLKEELAYLRKNHEEEMLALRGQTGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEQMAEK
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 NRKDAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEG
::.::: ::.:::::::.:::.:::::::..::..::::..:.::::::::::::::::.
NP_005 NRRDAETWFLSKTEELNKEVASNSELVQSSRSEVTELRRVLQGLEIELQSQLSMKASLEN
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 NLAETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRR
.: ::..:::.::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::::
NP_005 SLEETKGRYCMQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQSQEYQILLDVKTRLEQEIATYRR
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430
pF1KB6 LLEGEDAHLT--QYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR
:::::::::. : . . ..:.: :
NP_005 LLEGEDAHLSSQQASGQSYSSREVFTSSSSSSSRQTRPILKEQSSSSFSQGQSS
420 430 440 450 460 470
>>NP_002266 (OMIM: 148030) keratin, type I cytoskeletal (456 aa)
initn: 1626 init1: 1307 opt: 1709 Z-score: 1026.3 bits: 199.1 E(85289): 2e-50
Smith-Waterman score: 1721; 62.1% identity (83.7% similar) in 454 aa overlap (1-426:1-454)
10 20 30 40
pF1KB6 MTTSIRQFTSSS----SIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLG-----AGSCRL---GSAGGL
:::.. : .::. : .:.: :.::.. . :::: : :.: :. ::.::
NP_002 MTTTFLQTSSSTFGGGSTRGGSLLAGGGGFGGGSLSGGGGSRSISASSARFVSSGSGGGY
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KB6 GSTL--------GGSSYSSCYSFGSGGGYGSSFGGVDG-LLAGGEKATMQNLNDRLASYL
:. . .:: ... .. : :::.:..::: :: ::.:.:: :::::::::::::
NP_002 GGGMRVCGFGGGAGSVFGGGFGGGVGGGFGGGFGGGDGGLLSGNEKITMQNLNDRLASYL
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 DKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQAP-GPARDYSQYYRTIEELQNKILTATVDNANILLQ
::::::::::..:::::.::::.:.: .: :::::..:::::..::...:.::. ..:.
NP_002 DKVRALEEANADLEVKIHDWYQKQTPTSPECDYSQYFKTIEELRDKIMATTIDNSRVILE
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 IDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENLKEELAYL
:::::::::::: :.:.: ::: .:::::::::::::::::::.:::::::.:.::::::
NP_002 IDNARLAADDFRLKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLNEELAYL
190 200 210 220 230 240
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pF1KB6 KKNHEEEMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEDWFFSK
::::::::. . .:..:..::::::::::::.:.: :::.::: ::::::.:.: :::::
NP_002 KKNHEEEMKEFSSQLAGQVNVEMDAAPGVDLTRVLAEMREQYEAMAEKNRRDVEAWFFSK
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 TEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAETENRYCVQ
:::::.:::.:.:..:..:.::..:::::: :::::::::::::.::..::::: :: .:
NP_002 TEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQSQLSMKAGLENSLAETECRYATQ
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 LSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLTQY
:.:::::::..: ::..:::::: ::::::.:::.:::::::::::: ::::.::...
NP_002 LQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKMAGI
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430
pF1KB6 KKEPVTT------RQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR
. ... . . ::: ::.:.::...
NP_002 GIREASSGGGGSSSNFHINVEESVDGQVVSSHKREI
430 440 450
>>XP_011523086 (OMIM: 148030) PREDICTED: keratin, type I (463 aa)
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10 20 30 40
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50 60 70 80 90
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160 170 180 190 200 210
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:::::::::::: :.:.: ::: .:::::::::::::::::::.:::::::.:.::::::
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:::::: ::. . .:..:..::::::::::::.:.: :::.::: ::::::.:.
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: ::::::::::.:::.:.:..:..:.::..:::::: :::::::::::::.::..::::
XP_011 EAWFFSKTEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQSQLSMKAGLENSLAET
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340 350 360 370 380 390
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: :: .::.:::::::..: ::..:::::: ::::::.:::.:::::::::::: ::::.
XP_011 ECRYATQLQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQ
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::... . ... . . ::: ::.:.::...
XP_011 DAKMAGIAIREASSGGGGSSSNFHINVEESVDGQVVSSHKREI
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10 20 30 40
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:::::: ::. . .:..:..::::::::::::.:.: :::.::: ::::::.:.
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: ::::::::::.:::.:.:..:..:.::..:::::: :::::::::::::.::..::::
XP_016 EAWFFSKTEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQSQLSMKAGLENSLAET
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: :: .::.:::::::..: ::..:::::: ::::::.:::.:::::::::::: ::::.
XP_016 ECRYATQLQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQ
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::..
XP_016 DAKMAGIAIREAYSFSL
430
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10 20 30 40 50
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.::.:.:::.::..::..::.::: :::.:::::: :: :.::::::::: ..: .: ..
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::...::::.:.:::::::::::::.:: .::::: :. .::..::.::...: ::...:
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. :.:::::. :.:.:.:::::::::: ::::.. :
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10 20 30 40 50
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10 20 30 40 50
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:::::::.:::::::::..::::::::. .:.:. : :::: ::.:::::..::::::..
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: ..:.:::::::::::: :.:.: ::: ::::::::::::::::::...:::::::.:
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.:::::.::::::::. . .:: :..::::::.::.::.:.: :::.::: :::.::.::
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:.:: .:. :::.::.::. ..:..:.::.:::::.:.:::::::::::::.::...:::
NP_705 EEWFHAKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAGLENTVAET
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pF1KB6 ENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGE
: :: .::.::::::.:.: ::..:: ::: ::::::.:::.:::::::::::: ::::.
NP_705 ECRYALQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQ
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NP_705 DAKMIGFPSSAGSVSPRSTSVTTTSSASVTTTSNASGRRTSDVRRP
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: ..:.:::::::::::: :.:.: ::: ::::::::::::::::::...:::::::.:
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NP_000 SGGGGRGGGSFGGGYGGGSSGGGSSGGGHGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSS
460 470 480 490 500 510
432 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 11:34:59 2016 done: Sat Nov 5 11:35:00 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]