FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB6614, 432 aa 1>>>pF1KB6614 432 - 432 aa - 432 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3131+/-0.000536; mu= -0.6575+/- 0.033 mean_var=291.7641+/-59.722, 0's: 0 Z-trim(116.5): 177 B-trim: 383 in 1/53 Lambda= 0.075086 statistics sampled from 27508 (27691) to 27508 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.655), E-opt: 0.2 (0.325), width: 16 Scan time: 10.020 The best scores are: opt bits E(85289) NP_000413 (OMIM: 148069,167210,184500) keratin, ty ( 432) 2737 310.4 5.8e-84 NP_000517 (OMIM: 125595,131760,131800,131900,14806 ( 472) 1949 225.1 3.1e-58 NP_005548 (OMIM: 148067,167200,613000) keratin, ty ( 473) 1843 213.6 8.7e-55 NP_002266 (OMIM: 148030) keratin, type I cytoskele ( 456) 1709 199.1 2e-50 XP_011523086 (OMIM: 148030) PREDICTED: keratin, ty ( 463) 1664 194.2 5.9e-49 XP_016880103 (OMIM: 148030) PREDICTED: keratin, ty ( 437) 1645 192.1 2.4e-48 NP_002267 (OMIM: 148020) keratin, type I cytoskele ( 400) 1635 191.0 4.7e-48 NP_705694 (OMIM: 148065,615785) keratin, type I cy ( 458) 1618 189.2 1.9e-47 NP_002265 (OMIM: 148065,615785) keratin, type I cy ( 420) 1615 188.8 2.2e-47 NP_000412 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) kera ( 584) 1535 180.3 1.1e-44 XP_005257400 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) P ( 624) 1527 179.5 2.1e-44 NP_000214 (OMIM: 122100,601687) keratin, type I cy ( 494) 1466 172.8 1.8e-42 NP_003762 (OMIM: 604540) keratin, type I cuticular ( 467) 1376 163.0 1.5e-39 XP_016879788 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 494) 1368 162.2 2.8e-39 NP_061889 (OMIM: 607742) keratin, type I cytoskele ( 525) 1361 161.4 4.9e-39 NP_853515 (OMIM: 616676) keratin, type I cytoskele ( 459) 1349 160.1 1.1e-38 NP_853513 (OMIM: 616677) keratin, type I cytoskele ( 464) 1327 157.7 5.8e-38 NP_061883 (OMIM: 608218) keratin, type I cytoskele ( 424) 1298 154.5 4.8e-37 NP_002271 (OMIM: 602764) keratin, type I cuticular ( 455) 1290 153.7 9.2e-37 XP_011523096 (OMIM: 602764) PREDICTED: keratin, ty ( 455) 1290 153.7 9.2e-37 XP_011522716 (OMIM: 616646,616760) PREDICTED: kera ( 448) 1264 150.9 6.4e-36 NP_853512 (OMIM: 616646,616760) keratin, type I cy ( 450) 1264 150.9 6.4e-36 NP_000217 (OMIM: 144200,607606) keratin, type I cy ( 623) 1236 148.0 6.6e-35 NP_853517 (OMIM: 616675) keratin, type I cytoskele ( 468) 1223 146.4 1.4e-34 NP_002270 (OMIM: 602762) keratin, type I cuticular ( 404) 1216 145.6 2.2e-34 NP_002268 (OMIM: 601077) keratin, type I cuticular ( 416) 1213 145.3 2.8e-34 XP_006721802 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 427) 1212 145.2 3.1e-34 NP_004129 (OMIM: 602761) keratin, type I cuticular ( 404) 1211 145.1 3.2e-34 XP_011523095 (OMIM: 602763) PREDICTED: keratin, ty ( 412) 1207 144.6 4.4e-34 NP_066293 (OMIM: 602763) keratin, type I cuticular ( 436) 1207 144.7 4.5e-34 NP_002269 (OMIM: 602760) keratin, type I cuticular ( 448) 1201 144.0 7.3e-34 XP_011522762 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 422) 1193 143.1 1.3e-33 NP_872303 (OMIM: 616679) keratin, type I cytoskele ( 431) 1103 133.4 1.1e-30 XP_016879678 (OMIM: 616679) PREDICTED: keratin, ty ( 484) 1103 133.4 1.2e-30 NP_954657 (OMIM: 148070) keratin, type I cytoskele ( 430) 1091 132.1 2.7e-30 NP_000215 (OMIM: 148070) keratin, type I cytoskele ( 430) 1091 132.1 2.7e-30 NP_006762 (OMIM: 604542) keratin, type I cuticular ( 456) 1066 129.4 1.9e-29 NP_003761 (OMIM: 604541) keratin, type I cuticular ( 449) 1060 128.8 2.9e-29 NP_056330 (OMIM: 606194) keratin, type I cytoskele ( 422) 1057 128.4 3.5e-29 NP_998821 (OMIM: 616678) keratin, type I cytoskele ( 491) 1058 128.6 3.6e-29 XP_011522897 (OMIM: 606194) PREDICTED: keratin, ty ( 285) 752 95.2 2.3e-19 NP_001269362 (OMIM: 606194) keratin, type I cytosk ( 285) 752 95.2 2.3e-19 XP_005257257 (OMIM: 606194) PREDICTED: keratin, ty ( 285) 752 95.2 2.3e-19 NP_002046 (OMIM: 137780,203450) glial fibrillary a ( 432) 689 88.6 3.5e-17 NP_001124491 (OMIM: 137780,203450) glial fibrillar ( 431) 680 87.6 6.9e-17 XP_016879940 (OMIM: 137780,203450) PREDICTED: glia ( 472) 680 87.6 7.3e-17 NP_005373 (OMIM: 162250) neurofilament medium poly ( 916) 686 88.6 7.4e-17 NP_001229305 (OMIM: 137780,203450) glial fibrillar ( 438) 679 87.5 7.5e-17 XP_011523088 (OMIM: 602761) PREDICTED: keratin, ty ( 245) 660 85.2 2.1e-16 NP_001918 (OMIM: 125660,181400,601419,602067,60476 ( 470) 651 84.5 6.5e-16 >>NP_000413 (OMIM: 148069,167210,184500) keratin, type I (432 aa) initn: 2737 init1: 2737 opt: 2737 Z-score: 1628.4 bits: 310.4 E(85289): 5.8e-84 Smith-Waterman score: 2737; 100.0% identity (100.0% similar) in 432 aa overlap (1-432:1-432) 10 20 30 40 50 60 pF1KB6 MTTSIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSCRLGSAGGLGSTLGGSSYSSC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_000 MTTSIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSCRLGSAGGLGSTLGGSSYSSC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB6 YSFGSGGGYGSSFGGVDGLLAGGEKATMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_000 YSFGSGGGYGSSFGGVDGLLAGGEKATMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB6 QRQAPGPARDYSQYYRTIEELQNKILTATVDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_000 QRQAPGPARDYSQYYRTIEELQNKILTATVDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALR 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB6 LSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_000 LSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVE 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB6 MDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_000 MDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEI 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB6 SELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_000 SELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEM 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB6 EQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLTQYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDGKV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_000 EQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLTQYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDGKV 370 380 390 400 410 420 430 pF1KB6 ISSREQVHQTTR :::::::::::: NP_000 ISSREQVHQTTR 430 >>NP_000517 (OMIM: 125595,131760,131800,131900,148066,16 (472 aa) initn: 2248 init1: 1867 opt: 1949 Z-score: 1166.6 bits: 225.1 E(85289): 3.1e-58 Smith-Waterman score: 2089; 74.5% identity (86.2% similar) in 470 aa overlap (1-430:1-470) 10 20 30 40 pF1KB6 MTTSIRQFTSSSSIKGS----SGLGGGSSRTS-------CR----LSGGLGAGSCRLGSA ::: ::::::::.::: .:.:::::: : :: .:::...: :..:. NP_000 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSSRFSSG 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 pF1KB6 G--GLGSTLGGSSYSSCYSFGSG--------------GGYGSSFGGVDGLLAGGEKATMQ : :::. ::. :: ::::: ::.:..:.: ::::.:.::.::: NP_000 GAYGLGGGYGGGFSSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGLGGGFGGGFAGGDGLLVGSEKVTMQ 70 80 90 100 110 120 90 100 110 120 130 140 pF1KB6 NLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQAPGPARDYSQYYRTIEELQNKILTAT ::::::::::::::::::::..:::::::::::: :. .::: :..:::.:.::::::: NP_000 NLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPAEIKDYSPYFKTIEDLRNKILTAT 130 140 150 160 170 180 150 160 170 180 190 200 pF1KB6 VDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIE :::::.:::::::::::::::::.::: ::.:::::::::::::::::::::::::::: NP_000 VDNANVLLQIDNARLAADDFRTKYETELNLRMSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIE 190 200 210 220 230 240 210 220 230 240 250 260 pF1KB6 NLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRK .:::::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::: NP_000 SLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRK 250 260 270 280 290 300 270 280 290 300 310 320 pF1KB6 DAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLA :::.:::.::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::..: NP_000 DAEEWFFTKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQNLEIELQSQLSMKASLENSLE 310 320 330 340 350 360 330 340 350 360 370 380 pF1KB6 ETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLE ::..:::.::.::: .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_000 ETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLE 370 380 390 400 410 420 390 400 410 420 430 pF1KB6 GEDAHLT--QYKK-----EPVTT--RQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR ::::::. :... . ::. ::.:: : .:.::::.:..::: .: NP_000 GEDAHLSSSQFSSGSQSSRDVTSSSRQIRTKVMDVHDGKVVSTHEQVLRTKN 430 440 450 460 470 >>NP_005548 (OMIM: 148067,167200,613000) keratin, type I (473 aa) initn: 2010 init1: 1803 opt: 1843 Z-score: 1104.5 bits: 213.6 E(85289): 8.7e-55 Smith-Waterman score: 1897; 70.1% identity (84.7% similar) in 445 aa overlap (2-410:2-445) 10 20 30 40 pF1KB6 MTTSIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSCRL----------------GS :: ::::::::.::: :.::: . : :.:. :..:::: :. NP_005 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSRFSSGG 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 pF1KB6 AGGLGSTLGGSSYSSCYSFGSG--GGYGSSFG----------------GVDGLLAGGEKA : :::. ::. .:: ::::: ::::...: : ::::.:.::. NP_005 ACGLGGGYGGG-FSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGFGGGLGAGFGGGFAGGDGLLVGSEKV 70 80 90 100 110 90 100 110 120 130 140 pF1KB6 TMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQAPGPARDYSQYYRTIEELQNKIL :::::::::::::::::::::::..:::::::::::: :. .::: :..:::.:.:::. NP_005 TMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPSEIKDYSPYFKTIEDLRNKII 120 130 140 150 160 170 150 160 170 180 190 200 pF1KB6 TATVDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEM .::..::. .::::::::::::::::.: : ::: .::::.::::::::::::::.:::: NP_005 AATIENAQPILQIDNARLAADDFRTKYEHELALRQTVEADVNGLRRVLDELTLARTDLEM 180 190 200 210 220 230 210 220 230 240 250 260 pF1KB6 QIENLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEK :::.::::::::.::::::: :::::.::..::::::::::::::::::::::::.:::: NP_005 QIEGLKEELAYLRKNHEEEMLALRGQTGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEQMAEK 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 pF1KB6 NRKDAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEG ::.::: ::.:::::::.:::.:::::::..::..::::..:.::::::::::::::::. NP_005 NRRDAETWFLSKTEELNKEVASNSELVQSSRSEVTELRRVLQGLEIELQSQLSMKASLEN 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 370 380 pF1KB6 NLAETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRR .: ::..:::.::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::::::::::::::: NP_005 SLEETKGRYCMQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQSQEYQILLDVKTRLEQEIATYRR 360 370 380 390 400 410 390 400 410 420 430 pF1KB6 LLEGEDAHLT--QYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR :::::::::. : . . ..:.: : NP_005 LLEGEDAHLSSQQASGQSYSSREVFTSSSSSSSRQTRPILKEQSSSSFSQGQSS 420 430 440 450 460 470 >>NP_002266 (OMIM: 148030) keratin, type I cytoskeletal (456 aa) initn: 1626 init1: 1307 opt: 1709 Z-score: 1026.3 bits: 199.1 E(85289): 2e-50 Smith-Waterman score: 1721; 62.1% identity (83.7% similar) in 454 aa overlap (1-426:1-454) 10 20 30 40 pF1KB6 MTTSIRQFTSSS----SIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLG-----AGSCRL---GSAGGL :::.. : .::. : .:.: :.::.. . :::: : :.: :. ::.:: NP_002 MTTTFLQTSSSTFGGGSTRGGSLLAGGGGFGGGSLSGGGGSRSISASSARFVSSGSGGGY 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 pF1KB6 GSTL--------GGSSYSSCYSFGSGGGYGSSFGGVDG-LLAGGEKATMQNLNDRLASYL :. . .:: ... .. : :::.:..::: :: ::.:.:: ::::::::::::: NP_002 GGGMRVCGFGGGAGSVFGGGFGGGVGGGFGGGFGGGDGGLLSGNEKITMQNLNDRLASYL 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KB6 DKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQAP-GPARDYSQYYRTIEELQNKILTATVDNANILLQ ::::::::::..:::::.::::.:.: .: :::::..:::::..::...:.::. ..:. NP_002 DKVRALEEANADLEVKIHDWYQKQTPTSPECDYSQYFKTIEELRDKIMATTIDNSRVILE 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KB6 IDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENLKEELAYL :::::::::::: :.:.: ::: .:::::::::::::::::::.:::::::.:.:::::: NP_002 IDNARLAADDFRLKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLNEELAYL 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KB6 KKNHEEEMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEDWFFSK ::::::::. . .:..:..::::::::::::.:.: :::.::: ::::::.:.: ::::: NP_002 KKNHEEEMKEFSSQLAGQVNVEMDAAPGVDLTRVLAEMREQYEAMAEKNRRDVEAWFFSK 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KB6 TEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAETENRYCVQ :::::.:::.:.:..:..:.::..:::::: :::::::::::::.::..::::: :: .: NP_002 TEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQSQLSMKAGLENSLAETECRYATQ 310 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 390 pF1KB6 LSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLTQY :.:::::::..: ::..:::::: ::::::.:::.:::::::::::: ::::.::... NP_002 LQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKMAGI 370 380 390 400 410 420 400 410 420 430 pF1KB6 KKEPVTT------RQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR . ... . . ::: ::.:.::... NP_002 GIREASSGGGGSSSNFHINVEESVDGQVVSSHKREI 430 440 450 >>XP_011523086 (OMIM: 148030) PREDICTED: keratin, type I (463 aa) initn: 1614 init1: 834 opt: 1664 Z-score: 999.9 bits: 194.2 E(85289): 5.9e-49 Smith-Waterman score: 1698; 61.2% identity (82.4% similar) in 461 aa overlap (1-426:1-461) 10 20 30 40 pF1KB6 MTTSIRQFTSSS----SIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLG-----AGSCRL---GSAGGL :::.. : .::. : .:.: :.::.. . :::: : :.: :. ::.:: XP_011 MTTTFLQTSSSTFGGGSTRGGSLLAGGGGFGGGSLSGGGGSRSISASSARFVSSGSGGGY 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 pF1KB6 GSTL--------GGSSYSSCYSFGSGGGYGSSFGGVDG-LLAGGEKATMQNLNDRLASYL :. . .:: ... .. : :::.:..::: :: ::.:.:: ::::::::::::: XP_011 GGGMRVCGFGGGAGSVFGGGFGGGVGGGFGGGFGGGDGGLLSGNEKITMQNLNDRLASYL 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KB6 DKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQAP-GPARDYSQYYRTIEELQNKILTATVDNANILLQ ::::::::::..:::::.::::.:.: .: :::::..:::::..::...:.::. ..:. XP_011 DKVRALEEANADLEVKIHDWYQKQTPTSPECDYSQYFKTIEELRDKIMATTIDNSRVILE 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KB6 IDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENLKEELAYL :::::::::::: :.:.: ::: .:::::::::::::::::::.:::::::.:.:::::: XP_011 IDNARLAADDFRLKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLNEELAYL 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KB6 KKNHEE-------EMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDA :::::: ::. . .:..:..::::::::::::.:.: :::.::: ::::::.:. XP_011 KKNHEEWVPPILQEMKEFSSQLAGQVNVEMDAAPGVDLTRVLAEMREQYEAMAEKNRRDV 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KB6 EDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAET : ::::::::::.:::.:.:..:..:.::..:::::: :::::::::::::.::..:::: XP_011 EAWFFSKTEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQSQLSMKAGLENSLAET 310 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 390 pF1KB6 ENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGE : :: .::.:::::::..: ::..:::::: ::::::.:::.:::::::::::: ::::. XP_011 ECRYATQLQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQ 370 380 390 400 410 420 400 410 420 430 pF1KB6 DAHLTQYKKEPVTT------RQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR ::... . ... . . ::: ::.:.::... XP_011 DAKMAGIAIREASSGGGGSSSNFHINVEESVDGQVVSSHKREI 430 440 450 460 >>XP_016880103 (OMIM: 148030) PREDICTED: keratin, type I (437 aa) initn: 1614 init1: 834 opt: 1645 Z-score: 989.1 bits: 192.1 E(85289): 2.4e-48 Smith-Waterman score: 1679; 64.6% identity (84.9% similar) in 424 aa overlap (1-395:1-424) 10 20 30 40 pF1KB6 MTTSIRQFTSSS----SIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLG-----AGSCRL---GSAGGL :::.. : .::. : .:.: :.::.. . :::: : :.: :. ::.:: XP_016 MTTTFLQTSSSTFGGGSTRGGSLLAGGGGFGGGSLSGGGGSRSISASSARFVSSGSGGGY 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 pF1KB6 GSTL--------GGSSYSSCYSFGSGGGYGSSFGGVDG-LLAGGEKATMQNLNDRLASYL :. . .:: ... .. : :::.:..::: :: ::.:.:: ::::::::::::: XP_016 GGGMRVCGFGGGAGSVFGGGFGGGVGGGFGGGFGGGDGGLLSGNEKITMQNLNDRLASYL 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KB6 DKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQAP-GPARDYSQYYRTIEELQNKILTATVDNANILLQ ::::::::::..:::::.::::.:.: .: :::::..:::::..::...:.::. ..:. XP_016 DKVRALEEANADLEVKIHDWYQKQTPTSPECDYSQYFKTIEELRDKIMATTIDNSRVILE 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KB6 IDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENLKEELAYL :::::::::::: :.:.: ::: .:::::::::::::::::::.:::::::.:.:::::: XP_016 IDNARLAADDFRLKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLNEELAYL 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KB6 KKNHEE-------EMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDA :::::: ::. . .:..:..::::::::::::.:.: :::.::: ::::::.:. XP_016 KKNHEEWVPPILQEMKEFSSQLAGQVNVEMDAAPGVDLTRVLAEMREQYEAMAEKNRRDV 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KB6 EDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAET : ::::::::::.:::.:.:..:..:.::..:::::: :::::::::::::.::..:::: XP_016 EAWFFSKTEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQSQLSMKAGLENSLAET 310 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 390 pF1KB6 ENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGE : :: .::.:::::::..: ::..:::::: ::::::.:::.:::::::::::: ::::. XP_016 ECRYATQLQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQ 370 380 390 400 410 420 400 410 420 430 pF1KB6 DAHLTQYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR ::.. XP_016 DAKMAGIAIREAYSFSL 430 >>NP_002267 (OMIM: 148020) keratin, type I cytoskeletal (400 aa) initn: 1675 init1: 1580 opt: 1635 Z-score: 983.7 bits: 191.0 E(85289): 4.7e-48 Smith-Waterman score: 1635; 65.7% identity (87.7% similar) in 397 aa overlap (1-394:1-390) 10 20 30 40 50 pF1KB6 MTT-SIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSCRL-GSAGGLGSTLGGSSYS ::. : :: ...::. .:::::: :.. :.. . . :..:: : ..... . NP_002 MTSYSYRQSSATSSF---GGLGGGS----VRFGPGVAFRAPSIHGGSGGRGVSVSSARFV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB6 SCYSFGS-GGGYGSSFGGVDGLLAGGEKATMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIR : : :. :::::. . . ::::::.:: :::::::::::::::::::: :: ::::::: NP_002 SSSSSGAYGGGYGGVLTASDGLLAGNEKLTMQNLNDRLASYLDKVRALEAANGELEVKIR 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB6 DWYQRQAPGPARDYSQYYRTIEELQNKILTATVDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQ ::::.:.:::.::::.:: ::..:..::: ::..:. :.::::::::::::::::::::: NP_002 DWYQKQGPGPSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQ 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB6 ALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEI :::.::::::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::...:::::::.. NP_002 ALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQV 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB6 NVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGK .::.:.:::.::..::..::.::: :::.:::::: :: :.::::::::: ..: .: .. NP_002 SVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSR 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB6 SEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLR ::...::::.:.:::::::::::::.:: .::::: :. .::..::.::...: ::...: NP_002 SEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVR 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB6 CEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLTQYKKEPVTTRQVRTIVEEVQD . :.:::::. :.:.:.:::::::::: ::::.. : NP_002 ADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHYNNLSASKVL 360 370 380 390 400 420 430 pF1KB6 GKVISSREQVHQTTR >>NP_705694 (OMIM: 148065,615785) keratin, type I cytosk (458 aa) initn: 1546 init1: 1271 opt: 1618 Z-score: 973.0 bits: 189.2 E(85289): 1.9e-47 Smith-Waterman score: 1639; 59.7% identity (81.3% similar) in 449 aa overlap (4-423:2-444) 10 20 30 40 50 pF1KB6 MTTSIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSCRL-----GSAGGLGSTLG-- :.: .::.: : :.:::: :.:.:: :...: ::::: :. .. NP_705 MSLRLQSSSASYGG--GFGGGS----CQLGGGRGVSTCSTRFVSGGSAGGYGGGVSCG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 pF1KB6 -----GSSYSSCYSFGSGGGYGSSFGG----------VD------GLLAGGEKATMQNLN ::.... :. : :::::...:: :: :::.:.:: :::::: NP_705 FGGGAGSGFGGGYGGGLGGGYGGGLGGGFGGGFAGGFVDFGACDGGLLTGNEKITMQNLN 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KB6 DRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQAPG-PARDYSQYYRTIEELQNKILTATVD :::::::.:::::::::..::::::::. .:.:. : :::: ::.:::::..::::::.. NP_705 DRLASYLEKVRALEEANADLEVKIRDWHLKQSPASPERDYSPYYKTIEELRDKILTATIE 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KB6 NANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENL : ..:.:::::::::::: :.:.: ::: ::::::::::::::::::...:::::::.: NP_705 NNRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELTLSKTDLEMQIESL 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KB6 KEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDA .:::::.::::::::. . .:: :..::::::.::.::.:.: :::.::: :::.::.:: NP_705 NEELAYMKKNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAMAERNRRDA 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KB6 EDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAET :.:: .:. :::.::.::. ..:..:.::.:::::.:.:::::::::::::.::...::: NP_705 EEWFHAKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAGLENTVAET 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KB6 ENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGE : :: .::.::::::.:.: ::..:: ::: ::::::.:::.:::::::::::: ::::. NP_705 ECRYALQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQ 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 pF1KB6 DAHLTQYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR ::.. . . .. : : .....: .. NP_705 DAKMIGFPSSAGSVSPRSTSVTTTSSASVTTTSNASGRRTSDVRRP 420 430 440 450 >>NP_002265 (OMIM: 148065,615785) keratin, type I cytosk (420 aa) initn: 1545 init1: 1270 opt: 1615 Z-score: 971.7 bits: 188.8 E(85289): 2.2e-47 Smith-Waterman score: 1636; 62.9% identity (83.0% similar) in 423 aa overlap (4-397:2-418) 10 20 30 40 50 pF1KB6 MTTSIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSCRL-----GSAGGLGSTLG-- :.: .::.: : :.::: ::.:.:: :...: ::::: :. .. NP_002 MSLRLQSSSASYGG--GFGGG----SCQLGGGRGVSTCSTRFVSGGSAGGYGGGVSCG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 pF1KB6 -----GSSYSSCYSFGSGGGYGSSFGG----------VD------GLLAGGEKATMQNLN ::.... :. : :::::...:: :: :::.:.:: :::::: NP_002 FGGGAGSGFGGGYGGGLGGGYGGGLGGGFGGGFAGGFVDFGACDGGLLTGNEKITMQNLN 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KB6 DRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQAPG-PARDYSQYYRTIEELQNKILTATVD :::::::.:::::::::..::::::::. .:.:. : :::: ::.:::::..::::::.. NP_002 DRLASYLEKVRALEEANADLEVKIRDWHLKQSPASPERDYSPYYKTIEELRDKILTATIE 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KB6 NANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENL : ..:.:::::::::::: :.:.: ::: ::::::::::::::::::...:::::::.: NP_002 NNRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELTLSKTDLEMQIESL 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KB6 KEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDA .:::::.::::::::. . .:: :..::::::.::.::.:.: :::.::: :::.::.:: NP_002 NEELAYMKKNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAMAERNRRDA 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KB6 EDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAET :.:: .:. :::.::.::. ..:..:.::.:::::.:.:::::::::::::.::...::: NP_002 EEWFHAKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAGLENTVAET 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KB6 ENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGE : :: .::.::::::.:.: ::..:: ::: ::::::.:::.:::::::::::: ::::. NP_002 ECRYALQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQ 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 pF1KB6 DAHLTQYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR ::. : NP_002 DAKKRQPP 420 >>NP_000412 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) keratin, (584 aa) initn: 1481 init1: 1183 opt: 1535 Z-score: 923.1 bits: 180.3 E(85289): 1.1e-44 Smith-Waterman score: 1535; 65.5% identity (84.0% similar) in 388 aa overlap (10-391:70-456) 10 20 30 pF1KB6 MTTSIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLS--GGLGA ::.. : .:.:::: : : : :: . NP_000 KGSLGGGFSSGGFSGGSFSRGSSGGGCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFRGSYGSSSFGGSYG 40 50 60 70 80 90 40 50 60 70 80 90 pF1KB6 GSCRLGSAGGLGSTLGGSSYSSCYSFGS-GGGYGSSFGGVDGLLAGGEKATMQNLNDRLA :: :: :: :: ::: .. .. :. :::.:..::: :::.:.::.:::::::::: NP_000 GSFGGGSFGG-GSFGGGSFGGGGFGGGGFGGGFGGGFGGDGGLLSGNEKVTMQNLNDRLA 100 110 120 130 140 150 100 110 120 130 140 150 pF1KB6 SYLDKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQA---PGPARDYSQYYRTIEELQNKILTATVDNA :::::::::::.: ::: ::..::.... : ::::.::.::..:.:.::. :.::: NP_000 SYLDKVRALEESNYELEGKIKEWYEKHGNSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNA 160 170 180 190 200 210 160 170 180 190 200 210 pF1KB6 NILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENLKE ::::::::::::::::: :.:.: ::: ::::::::::::::::::..::::::::.: : NP_000 NILLQIDNARLAADDFRLKYENEVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTE 220 230 240 250 260 270 220 230 240 250 260 270 pF1KB6 ELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAED :::::::::::::. ::. :..::::.:::::::...::.::.:::..::.:::::: NP_000 ELAYLKKNHEEEMKDLRNVSTGDVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEA 280 290 300 310 320 330 280 290 300 310 320 330 pF1KB6 WFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAETEN :: :..::. :. .: : ..: ::::.::::..:::::::::::..: :::..:::::. NP_000 WFNEKSKELTTEIDNNIEQISSYKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEG 340 350 360 370 380 390 340 350 360 370 380 390 pF1KB6 RYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDA ::::::::::. :...:::: :.: : : :: ::. :::.: :::.:: ::: ::::: NP_000 RYCVQLSQIQAQISALEEQLQQIRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGS 400 410 420 430 440 450 400 410 420 430 pF1KB6 HLTQYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR NP_000 SGGGGRGGGSFGGGYGGGSSGGGSSGGGHGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSS 460 470 480 490 500 510 432 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sat Nov 5 11:34:59 2016 done: Sat Nov 5 11:35:00 2016 Total Scan time: 10.020 Total Display time: 0.070 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]