Result of FASTA (ccds) for pF1KB6628
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6628, 406 aa
  1>>>pF1KB6628 406 - 406 aa - 406 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3927+/-0.00118; mu= 9.2090+/- 0.071
 mean_var=217.1917+/-44.611, 0's: 0 Z-trim(109.9): 145  B-trim: 690 in 1/51
 Lambda= 0.087027
 statistics sampled from 11041 (11196) to 11041 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.696), E-opt: 0.2 (0.344), width:  16
 Scan time:  2.620

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS41919.1 RBM23 gene_id:55147|Hs108|chr14        ( 405) 2638 344.2 1.3e-94
CCDS41920.1 RBM23 gene_id:55147|Hs108|chr14        ( 423) 1900 251.5 1.1e-66
CCDS41921.1 RBM23 gene_id:55147|Hs108|chr14        ( 439) 1896 251.1 1.5e-66
CCDS76658.1 RBM23 gene_id:55147|Hs108|chr14        ( 269) 1717 228.3 6.5e-60
CCDS56186.1 RBM39 gene_id:9584|Hs108|chr20         ( 508) 1451 195.3 1.1e-49
CCDS13265.1 RBM39 gene_id:9584|Hs108|chr20         ( 524) 1384 186.9 3.9e-47
CCDS13266.1 RBM39 gene_id:9584|Hs108|chr20         ( 530) 1323 179.2 7.9e-45


>>CCDS41919.1 RBM23 gene_id:55147|Hs108|chr14             (405 aa)
 initn: 2377 init1: 2377 opt: 2638  Z-score: 1812.0  bits: 344.2 E(32554): 1.3e-94
Smith-Waterman score: 2638; 99.5% identity (99.8% similar) in 406 aa overlap (1-406:1-405)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MASDDFDIVIEAMLEAPYKKEEDEQQRKEVKKDYPSNTTSSTSNSGNETSGSSTIGETSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MASDDFDIVIEAMLEAPYKKEEDEQQRKEVKKDYPSNTTSSTSNSGNETSGSSTIGETSN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 RSRDRDRYRRRNSRSRSPGRQCRHRSRSWDRRHGSESRSRDHRREDRVHYRSPPLATGEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RSRDRDRYRRRNSRSRSPGRQCRHRSRSWDRRHGSESRSRDHRREDRVHYRSPPLATGEP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 VDNLSPEERDARTVFCMQLAARIRPRDLEDFFSAVGKVRDVRIISDRNSRRSKGIAYVEF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VDNLSPEERDARTVFCMQLAARIRPRDLEDFFSAVGKVRDVRIISDRNSRRSKGIAYVEF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 CEIQSVPLAIGLTGQRLLGVPIIVQASQAEKNRLAAMANNLQKGNGGPMRLYVGSLHFNI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 CEIQSVPLAIGLTGQRLLGVPIIVQASQAEKNRLAAMANNLQKGNGGPMRLYVGSLHFNI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 TEDMLRGIFEPFGKIDNIVLMKDSDTGRSKGYGFITFSDSECARRALEQLNGFELAGRPM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TEDMLRGIFEPFGKIDNIVLMKDSDTGRSKGYGFITFSDSECARRALEQLNGFELAGRPM
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 RVGHVTERLDGGTDITFPDGDQELDLGSAGGRFQLMAKLAEGAGIQLPSTAAAAAAAAAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: 
CCDS41 RVGHVTERLDGGTDITFPDGDQELDLGSAGGRFQLMAKLAEGAGIQLPSTAAAAAAAAA-
              310       320       330       340       350          

              370       380       390       400      
pF1KB6 QAAALQLNGAVPLGALNPAALTALSPALNLASQCLQLSSLFTPQTM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS41 QAAALQLNGAVPLGALNPAALTALSPALNLASQCFQLSSLFTPQTM
     360       370       380       390       400     

>>CCDS41920.1 RBM23 gene_id:55147|Hs108|chr14             (423 aa)
 initn: 2363 init1: 1582 opt: 1900  Z-score: 1311.0  bits: 251.5 E(32554): 1.1e-66
Smith-Waterman score: 2592; 95.3% identity (95.5% similar) in 424 aa overlap (1-406:1-423)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MASDDFDIVIEAMLEAPYKKEEDEQQRKEVKKDYPSNTTSSTSNSGNETSGSSTIGETSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MASDDFDIVIEAMLEAPYKKEEDEQQRKEVKKDYPSNTTSSTSNSGNETSGSSTIGETSN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110          
pF1KB6 RSRDRDRYRRRNSRSRSPGRQCRHRSRSWDRRHGSESRSRDHRREDRVHYRSPPLATG--
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::  
CCDS41 RSRDRDRYRRRNSRSRSPGRQCRHRSRSWDRRHGSESRSRDHRREDRVHYRSPPLATGYR
               70        80        90       100       110       120

                      120       130       140       150       160  
pF1KB6 ----------------EPVDNLSPEERDARTVFCMQLAARIRPRDLEDFFSAVGKVRDVR
                       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 YGHSKSPHFREKSPVREPVDNLSPEERDARTVFCMQLAARIRPRDLEDFFSAVGKVRDVR
              130       140       150       160       170       180

            170       180       190       200       210       220  
pF1KB6 IISDRNSRRSKGIAYVEFCEIQSVPLAIGLTGQRLLGVPIIVQASQAEKNRLAAMANNLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 IISDRNSRRSKGIAYVEFCEIQSVPLAIGLTGQRLLGVPIIVQASQAEKNRLAAMANNLQ
              190       200       210       220       230       240

            230       240       250       260       270       280  
pF1KB6 KGNGGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGKIDNIVLMKDSDTGRSKGYGFITFSDSEC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KGNGGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGKIDNIVLMKDSDTGRSKGYGFITFSDSEC
              250       260       270       280       290       300

            290       300       310       320       330       340  
pF1KB6 ARRALEQLNGFELAGRPMRVGHVTERLDGGTDITFPDGDQELDLGSAGGRFQLMAKLAEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ARRALEQLNGFELAGRPMRVGHVTERLDGGTDITFPDGDQELDLGSAGGRFQLMAKLAEG
              310       320       330       340       350       360

            350       360       370       380       390       400  
pF1KB6 AGIQLPSTAAAAAAAAAAQAAALQLNGAVPLGALNPAALTALSPALNLASQCLQLSSLFT
       ::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS41 AGIQLPSTAAAAAAAAA-QAAALQLNGAVPLGALNPAALTALSPALNLASQCFQLSSLFT
              370        380       390       400       410         

           
pF1KB6 PQTM
       ::::
CCDS41 PQTM
     420   

>>CCDS41921.1 RBM23 gene_id:55147|Hs108|chr14             (439 aa)
 initn: 2003 init1: 1582 opt: 1896  Z-score: 1308.1  bits: 251.1 E(32554): 1.5e-66
Smith-Waterman score: 2532; 91.6% identity (92.0% similar) in 438 aa overlap (3-406:3-439)

               10        20        30        40        50          
pF1KB6 MASDDFDIVIEAMLEAPYKKEEDEQQRKEVKKDYPSNTTSSTSNSGNETSGSSTIGETS-
         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: 
CCDS41 MASDDFDIVIEAMLEAPYKKEEDEQQRKEVKKDYPSNTTSSTSNSGNETSGSSTIGETSK
               10        20        30        40        50        60

                     60        70        80        90       100    
pF1KB6 ---------------NRSRDRDRYRRRNSRSRSPGRQCRHRSRSWDRRHGSESRSRDHRR
                      .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KKRSRSHNKSRDRKRSRSRDRDRYRRRNSRSRSPGRQCRHRSRSWDRRHGSESRSRDHRR
               70        80        90       100       110       120

          110                         120       130       140      
pF1KB6 EDRVHYRSPPLATG------------------EPVDNLSPEERDARTVFCMQLAARIRPR
       ::::::::::::::                  ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EDRVHYRSPPLATGYRYGHSKSPHFREKSPVREPVDNLSPEERDARTVFCMQLAARIRPR
              130       140       150       160       170       180

        150       160       170       180       190       200      
pF1KB6 DLEDFFSAVGKVRDVRIISDRNSRRSKGIAYVEFCEIQSVPLAIGLTGQRLLGVPIIVQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DLEDFFSAVGKVRDVRIISDRNSRRSKGIAYVEFCEIQSVPLAIGLTGQRLLGVPIIVQA
              190       200       210       220       230       240

        210       220       230       240       250       260      
pF1KB6 SQAEKNRLAAMANNLQKGNGGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGKIDNIVLMKDSDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SQAEKNRLAAMANNLQKGNGGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGKIDNIVLMKDSDT
              250       260       270       280       290       300

        270       280       290       300       310       320      
pF1KB6 GRSKGYGFITFSDSECARRALEQLNGFELAGRPMRVGHVTERLDGGTDITFPDGDQELDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GRSKGYGFITFSDSECARRALEQLNGFELAGRPMRVGHVTERLDGGTDITFPDGDQELDL
              310       320       330       340       350       360

        330       340       350       360       370       380      
pF1KB6 GSAGGRFQLMAKLAEGAGIQLPSTAAAAAAAAAAQAAALQLNGAVPLGALNPAALTALSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GSAGGRFQLMAKLAEGAGIQLPSTAAAAAAAAA-QAAALQLNGAVPLGALNPAALTALSP
              370       380       390        400       410         

        390       400      
pF1KB6 ALNLASQCLQLSSLFTPQTM
       ::::::::.:::::::::::
CCDS41 ALNLASQCFQLSSLFTPQTM
     420       430         

>>CCDS76658.1 RBM23 gene_id:55147|Hs108|chr14             (269 aa)
 initn: 1492 init1: 1456 opt: 1717  Z-score: 1189.1  bits: 228.3 E(32554): 6.5e-60
Smith-Waterman score: 1717; 99.3% identity (99.6% similar) in 270 aa overlap (137-406:1-269)

        110       120       130       140       150       160      
pF1KB6 RVHYRSPPLATGEPVDNLSPEERDARTVFCMQLAARIRPRDLEDFFSAVGKVRDVRIISD
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76                               MQLAARIRPRDLEDFFSAVGKVRDVRIISD
                                             10        20        30

        170       180       190       200       210       220      
pF1KB6 RNSRRSKGIAYVEFCEIQSVPLAIGLTGQRLLGVPIIVQASQAEKNRLAAMANNLQKGNG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 RNSRRSKGIAYVEFCEIQSVPLAIGLTGQRLLGVPIIVQASQAEKNRLAAMANNLQKGNG
               40        50        60        70        80        90

        230       240       250       260       270       280      
pF1KB6 GPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGKIDNIVLMKDSDTGRSKGYGFITFSDSECARRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 GPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGKIDNIVLMKDSDTGRSKGYGFITFSDSECARRA
              100       110       120       130       140       150

        290       300       310       320       330       340      
pF1KB6 LEQLNGFELAGRPMRVGHVTERLDGGTDITFPDGDQELDLGSAGGRFQLMAKLAEGAGIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LEQLNGFELAGRPMRVGHVTERLDGGTDITFPDGDQELDLGSAGGRFQLMAKLAEGAGIQ
              160       170       180       190       200       210

        350       360       370       380       390       400      
pF1KB6 LPSTAAAAAAAAAAQAAALQLNGAVPLGALNPAALTALSPALNLASQCLQLSSLFTPQTM
       ::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS76 LPSTAAAAAAAAA-QAAALQLNGAVPLGALNPAALTALSPALNLASQCFQLSSLFTPQTM
              220        230       240       250       260         

>>CCDS56186.1 RBM39 gene_id:9584|Hs108|chr20              (508 aa)
 initn: 1359 init1: 1189 opt: 1451  Z-score: 1005.4  bits: 195.3 E(32554): 1.1e-49
Smith-Waterman score: 1506; 60.3% identity (80.1% similar) in 418 aa overlap (3-405:2-414)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MASDDFDIVIEAMLEAPYKKEEDEQQRKEVKKDYPSNTTSSTSNSGNETSGSSTIGETSN
         .::.::  ::::::::::.:.. .  . ...  ..  .: : : ..    :   : . 
CCDS56  MADDIDI--EAMLEAPYKKDENKLSSANGHEERSKKRKKSKSRSRSHERKRSKSKERK-
                  10        20        30        40        50       

                  70        80        90       100        110      
pF1KB6 RSRDRDRYR---RRNSRSRSPGRQCRHRSRSWDRRHGSESRSRDHRR-EDRVHYRSPPLA
       :::::.: .   :. .::::  :. : :::: :::  .. ::  .:: ...  .:.    
CCDS56 RSRDRERKKSKSRERKRSRSKERR-RSRSRSRDRRFRGRYRSPYRRRSRSKSPFRKDKSP
         60        70        80         90       100       110     

        120       130       140       150       160       170      
pF1KB6 TGEPVDNLSPEERDARTVFCMQLAARIRPRDLEDFFSAVGKVRDVRIISDRNSRRSKGIA
       . ::.:::.::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::.:::::::::::::
CCDS56 VREPIDNLTPEERDARTVFCMQLAARIRPRDLEEFFSTVGKVRDVRMISDRNSRRSKGIA
         120       130       140       150       160       170     

        180       190       200       210       220       230      
pF1KB6 YVEFCEIQSVPLAIGLTGQRLLGVPIIVQASQAEKNRLAAMANNLQKGNGGPMRLYVGSL
       :::: ...::::::::::::.:::::::::::::::: ::::::::::..::::::::::
CCDS56 YVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRAAAMANNLQKGSAGPMRLYVGSL
         180       190       200       210       220       230     

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB6 HFNITEDMLRGIFEPFGKIDNIVLMKDSDTGRSKGYGFITFSDSECARRALEQLNGFELA
       :::::::::::::::::.:..: :: ::.::::::::::::::::::..:::::::::::
CCDS56 HFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGFITFSDSECAKKALEQLNGFELA
         240       250       260       270       280       290     

        300       310       320           330       340       350  
pF1KB6 GRPMRVGHVTERLDGGTDITFPDGDQE----LDLGSAGGRFQLMAKLAEGAGIQLPSTAA
       ::::.::::::: :...  .: :.:.     .:::..: :.::::.::::.:.:.: .: 
CCDS56 GRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTG-RLQLMARLAEGTGLQIPPAAQ
         300       310       320       330        340       350    

            360         370            380       390       400     
pF1KB6 AAAAAAAAQA--AALQLNGAVPLGA-----LNPAALTALSPALNLASQCLQLSSLFTPQT
        :   ... :  :. ... .. : .      . .::.: . .  ::.::.:::..:.:::
CCDS56 QALQMSGSLAFGAVAEFSFVIDLQTRLSQQTEASALAAAASVQPLATQCFQLSNMFNPQT
          360       370       380       390       400       410    

                                                                   
pF1KB6 M                                                           
                                                                   
CCDS56 EEEVGWDTEIKDDVIEECNKHGGVIHIYVDKNSAQGNVYVKCPSIAAAIAAVNALHGRWF
          420       430       440       450       460       470    

>>CCDS13265.1 RBM39 gene_id:9584|Hs108|chr20              (524 aa)
 initn: 1463 init1: 1161 opt: 1384  Z-score: 959.8  bits: 186.9 E(32554): 3.9e-47
Smith-Waterman score: 1468; 57.9% identity (75.5% similar) in 444 aa overlap (3-405:2-430)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MASDDFDIVIEAMLEAPYKKEEDEQQRKEVKKDYPSNTTSSTSNSGNETSGSSTIGETSN
         .::.::  ::::::::::.:.. .  . ...  ..  .: : : ..    :   : . 
CCDS13  MADDIDI--EAMLEAPYKKDENKLSSANGHEERSKKRKKSKSRSRSHERKRSKSKERK-
                  10        20        30        40        50       

                  70        80        90                           
pF1KB6 RSRDRDRYR---RRNSRSRSPGRQCRHRSRSWDRRHGSESRS------------------
       :::::.: .   :. .::::  :. : :::: :::  .. ::                  
CCDS13 RSRDRERKKSKSRERKRSRSKERR-RSRSRSRDRRFRGRYRSPYSGPKFNSAIRGKIGLP
         60        70        80         90       100       110     

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pF1KB6 ---RDHRREDRVH--YRSPPLATGEPVDNLSPEERDARTVFCMQLAARIRPRDLEDFFSA
          .  ::..: .  .:.    . ::.:::.::::::::::::::::::::::::.:::.
CCDS13 HSIKLSRRRSRSKSPFRKDKSPVREPIDNLTPEERDARTVFCMQLAARIRPRDLEEFFST
         120       130       140       150       160       170     

          160       170       180       190       200       210    
pF1KB6 VGKVRDVRIISDRNSRRSKGIAYVEFCEIQSVPLAIGLTGQRLLGVPIIVQASQAEKNRL
       ::::::::.::::::::::::::::: ...::::::::::::.:::::::::::::::: 
CCDS13 VGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRA
         180       190       200       210       220       230     

          220       230       240       250       260       270    
pF1KB6 AAMANNLQKGNGGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGKIDNIVLMKDSDTGRSKGYGF
       ::::::::::..:::::::::::::::::::::::::::.:..: :: ::.:::::::::
CCDS13 AAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGF
         240       250       260       270       280       290     

          280       290       300       310       320           330
pF1KB6 ITFSDSECARRALEQLNGFELAGRPMRVGHVTERLDGGTDITFPDGDQE----LDLGSAG
       :::::::::..:::::::::::::::.::::::: :...  .: :.:.     .:::..:
CCDS13 ITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTG
         300       310       320       330       340       350     

              340       350       360       370                    
pF1KB6 GRFQLMAKLAEGAGIQLPSTAAAAAAAAAAQAAALQLNGAVPLGAL-----------NPA
        :.::::.::::.:.:.:         :: ::  ::..:.. .::.           . .
CCDS13 -RLQLMARLAEGTGLQIPP--------AAQQA--LQMSGSLAFGAVADLQTRLSQQTEAS
          360       370                 380       390       400    

     380       390       400                                       
pF1KB6 ALTALSPALNLASQCLQLSSLFTPQTM                                 
       ::.: . .  ::.::.:::..:.:::                                  
CCDS13 ALAAAASVQPLATQCFQLSNMFNPQTEEEVGWDTEIKDDVIEECNKHGGVIHIYVDKNSA
          410       420       430       440       450       460    

>>CCDS13266.1 RBM39 gene_id:9584|Hs108|chr20              (530 aa)
 initn: 1463 init1: 1161 opt: 1323  Z-score: 918.3  bits: 179.2 E(32554): 7.9e-45
Smith-Waterman score: 1462; 57.5% identity (76.4% similar) in 440 aa overlap (3-405:2-436)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MASDDFDIVIEAMLEAPYKKEEDEQQRKEVKKDYPSNTTSSTSNSGNETSGSSTIGETSN
         .::.::  ::::::::::.:.. .  . ...  ..  .: : : ..    :   : . 
CCDS13  MADDIDI--EAMLEAPYKKDENKLSSANGHEERSKKRKKSKSRSRSHERKRSKSKERK-
                  10        20        30        40        50       

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pF1KB6 RSRDRDRYR---RRNSRSRSPGRQCRHRSRSWDRRHGSESRS------------------
       :::::.: .   :. .::::  :. : :::: :::  .. ::                  
CCDS13 RSRDRERKKSKSRERKRSRSKERR-RSRSRSRDRRFRGRYRSPYSGPKFNSAIRGKIGLP
         60        70        80         90       100       110     

        100         110       120       130       140       150    
pF1KB6 ---RDHRREDRVH--YRSPPLATGEPVDNLSPEERDARTVFCMQLAARIRPRDLEDFFSA
          .  ::..: .  .:.    . ::.:::.::::::::::::::::::::::::.:::.
CCDS13 HSIKLSRRRSRSKSPFRKDKSPVREPIDNLTPEERDARTVFCMQLAARIRPRDLEEFFST
         120       130       140       150       160       170     

          160       170       180       190       200       210    
pF1KB6 VGKVRDVRIISDRNSRRSKGIAYVEFCEIQSVPLAIGLTGQRLLGVPIIVQASQAEKNRL
       ::::::::.::::::::::::::::: ...::::::::::::.:::::::::::::::: 
CCDS13 VGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLGVPIIVQASQAEKNRA
         180       190       200       210       220       230     

          220       230       240       250       260       270    
pF1KB6 AAMANNLQKGNGGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGKIDNIVLMKDSDTGRSKGYGF
       ::::::::::..:::::::::::::::::::::::::::.:..: :: ::.:::::::::
CCDS13 AAMANNLQKGSAGPMRLYVGSLHFNITEDMLRGIFEPFGRIESIQLMMDSETGRSKGYGF
         240       250       260       270       280       290     

          280       290       300       310       320           330
pF1KB6 ITFSDSECARRALEQLNGFELAGRPMRVGHVTERLDGGTDITFPDGDQE----LDLGSAG
       :::::::::..:::::::::::::::.::::::: :...  .: :.:.     .:::..:
CCDS13 ITFSDSECAKKALEQLNGFELAGRPMKVGHVTERTDASSASSFLDSDELERTGIDLGTTG
         300       310       320       330       340       350     

              340       350       360         370            380   
pF1KB6 GRFQLMAKLAEGAGIQLPSTAAAAAAAAAAQA--AALQLNGAVPLGA-----LNPAALTA
        :.::::.::::.:.:.: .:  :   ... :  :. ... .. : .      . .::.:
CCDS13 -RLQLMARLAEGTGLQIPPAAQQALQMSGSLAFGAVAEFSFVIDLQTRLSQQTEASALAA
          360       370       380       390       400       410    

           390       400                                           
pF1KB6 LSPALNLASQCLQLSSLFTPQTM                                     
        . .  ::.::.:::..:.:::                                      
CCDS13 AASVQPLATQCFQLSNMFNPQTEEEVGWDTEIKDDVIEECNKHGGVIHIYVDKNSAQGNV
          420       430       440       450       460       470    




406 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 11:10:24 2016 done: Sat Nov  5 11:10:25 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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