FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6630, 440 aa
1>>>pF1KB6630 440 - 440 aa - 440 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8046+/-0.000893; mu= 20.0718+/- 0.054
mean_var=69.9718+/-14.356, 0's: 0 Z-trim(106.5): 88 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.153325
statistics sampled from 8933 (9025) to 8933 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.65), E-opt: 0.2 (0.277), width: 16
Scan time: 2.720
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2127.1 SCTR gene_id:6344|Hs108|chr2 ( 440) 3014 676.0 2e-194
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CCDS56481.1 ADCYAP1R1 gene_id:117|Hs108|chr7 ( 447) 1437 327.2 2e-89
CCDS58828.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 ( 416) 1412 321.7 8.9e-88
CCDS58827.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 ( 409) 1405 320.1 2.6e-87
CCDS5950.1 VIPR2 gene_id:7434|Hs108|chr7 ( 438) 1328 303.1 3.6e-82
CCDS5433.1 ADCYAP1R1 gene_id:117|Hs108|chr7 ( 468) 1265 289.2 5.9e-78
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CCDS5429.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs108|chr7 ( 411) 741 173.2 4.2e-43
CCDS56478.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs108|chr7 ( 438) 740 173.0 5.2e-43
CCDS56477.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs108|chr7 ( 397) 739 172.8 5.6e-43
CCDS2747.1 PTH1R gene_id:5745|Hs108|chr3 ( 593) 734 171.8 1.6e-42
CCDS54177.1 GCGR gene_id:2642|Hs108|chr17 ( 477) 718 168.2 1.6e-41
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CCDS4839.1 GLP1R gene_id:2740|Hs108|chr6 ( 463) 705 165.3 1.1e-40
CCDS75576.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs108|chr7 ( 387) 701 164.4 1.9e-40
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CCDS2293.1 CALCRL gene_id:10203|Hs108|chr2 ( 461) 682 160.2 3.9e-39
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CCDS55125.1 CALCR gene_id:799|Hs108|chr7 ( 508) 555 132.2 1.2e-30
CCDS58556.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 240) 513 122.6 4.3e-28
CCDS9272.1 ADGRD1 gene_id:283383|Hs108|chr12 ( 874) 331 82.8 1.5e-15
CCDS81753.1 ADGRD1 gene_id:283383|Hs108|chr12 ( 906) 331 82.8 1.5e-15
CCDS58643.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 709) 321 80.5 5.8e-15
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CCDS12175.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 886) 321 80.6 6.9e-15
CCDS74296.1 ADGRE3 gene_id:84658|Hs108|chr19 ( 526) 305 76.9 5.4e-14
CCDS74297.1 ADGRE3 gene_id:84658|Hs108|chr19 ( 600) 305 76.9 6e-14
CCDS12315.1 ADGRE3 gene_id:84658|Hs108|chr19 ( 652) 305 77.0 6.4e-14
CCDS59361.1 ADGRE2 gene_id:30817|Hs108|chr19 ( 765) 300 75.9 1.5e-13
CCDS32935.1 ADGRE2 gene_id:30817|Hs108|chr19 ( 823) 300 75.9 1.6e-13
CCDS32931.1 ADGRE5 gene_id:976|Hs108|chr19 ( 742) 296 75.0 2.8e-13
CCDS32930.1 ADGRE5 gene_id:976|Hs108|chr19 ( 786) 296 75.0 2.9e-13
CCDS32929.1 ADGRE5 gene_id:976|Hs108|chr19 ( 835) 296 75.1 3e-13
CCDS41352.1 ADGRL4 gene_id:64123|Hs108|chr1 ( 690) 274 70.1 7.7e-12
CCDS58644.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 821) 262 67.5 5.5e-11
CCDS12307.1 ADGRL1 gene_id:22859|Hs108|chr19 (1469) 262 67.8 8.5e-11
>>CCDS2127.1 SCTR gene_id:6344|Hs108|chr2 (440 aa)
initn: 3014 init1: 3014 opt: 3014 Z-score: 3604.2 bits: 676.0 E(32554): 2e-194
Smith-Waterman score: 3014; 100.0% identity (100.0% similar) in 440 aa overlap (1-440:1-440)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MRPHLSPPLQQLLLPVLLACAAHSTGALPRLCDVLQVLWEEQDQCLQELSREQTGDLGTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 MRPHLSPPLQQLLLPVLLACAAHSTGALPRLCDVLQVLWEEQDQCLQELSREQTGDLGTE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 QPVPGCEGMWDNISCWPSSVPGRMVEVECPRFLRMLTSRNGSLFRNCTQDGWSETFPRPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 QPVPGCEGMWDNISCWPSSVPGRMVEVECPRFLRMLTSRNGSLFRNCTQDGWSETFPRPN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 LACGVNVNDSSNEKRHSYLLKLKVMYTVGYSSSLVMLLVALGILCAFRRLHCTRNYIHMH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 LACGVNVNDSSNEKRHSYLLKLKVMYTVGYSSSLVMLLVALGILCAFRRLHCTRNYIHMH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LFVSFILRALSNFIKDAVLFSSDDVTYCDAHRAGCKLVMVLFQYCIMANYSWLLVEGLYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 LFVSFILRALSNFIKDAVLFSSDDVTYCDAHRAGCKLVMVLFQYCIMANYSWLLVEGLYL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 HTLLAISFFSERKYLQGFVAFGWGSPAIFVALWAIARHFLEDVGCWDINANASIWWIIRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 HTLLAISFFSERKYLQGFVAFGWGSPAIFVALWAIARHFLEDVGCWDINANASIWWIIRG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 PVILSILINFILFINILRILMRKLRTQETRGNEVSHYKRLARSTLLLIPLFGIHYIVFAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 PVILSILINFILFINILRILMRKLRTQETRGNEVSHYKRLARSTLLLIPLFGIHYIVFAF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 SPEDAMEIQLFFELALGSFQGLVVAVLYCFLNGEVQLEVQKKWQQWHLREFPLHPVASFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 SPEDAMEIQLFFELALGSFQGLVVAVLYCFLNGEVQLEVQKKWQQWHLREFPLHPVASFS
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KB6 NSTKASHLEQSQGTCRTSII
::::::::::::::::::::
CCDS21 NSTKASHLEQSQGTCRTSII
430 440
>>CCDS2698.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 (457 aa)
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Smith-Waterman score: 1449; 49.3% identity (73.8% similar) in 458 aa overlap (1-438:1-448)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MRPHLSPPLQQL-LLPVLLACAAHSTGA----LPRLCDVLQVLWEEQDQCLQELSREQTG
::: : . : .: :: : .:. : . :: .:.. .. :::.: .
CCDS26 MRPPSPLPARWLCVLAGALAWALGPAGGQAARLQEECDYVQMIEVQHKQCLEEAQ-----
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 DLGTEQPVPGCEGMWDNISCWPSSVPGRMVEVECPRFLRMLTSRNG-SLFRNCTQDGWSE
:. . :: ::::..:::.. :..: . :: ......: .: .. :.::..::..
CCDS26 ---LENETIGCSKMWDNLTCWPATPRGQVVVLACPLIFKLFSSIQGRNVSRSCTDEGWTH
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 TFPRPN-LACGVNVNDSS-NEKRHSYLLKLKVMYTVGYSSSLVMLLVALGILCAFRRLHC
: : .:::.. . .: .:.. . ..:. ::.::. ::. :::: .:: ::.:::
CCDS26 LEPGPYPIACGLDDKAASLDEQQTMFYGSVKTGYTIGYGLSLATLLVATAILSLFRKLHC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 TRNYIHMHLFVSFILRALSNFIKDAVLFSSDDVTYCDAHRAGCKLVMVLFQYCIMANYSW
::::::::::.:::::: . :::: .::.: . :. .::: .::.::::.:::. :
CCDS26 TRNYIHMHLFISFILRAAAVFIKDLALFDSGESDQCSEGSVGCKAAMVFFQYCVMANFFW
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 LLVEGLYLHTLLAISFFSERKYLQGFVAFGWGSPAIFVALWAIARHFLEDVGCWDINANA
::::::::.::::.::::::::. :.. .::: :. :. .:.::: .:: :::: . :.
CCDS26 LLVEGLYLYTLLAVSFFSERKYFWGYILIGWGVPSTFTMVWTIARIHFEDYGCWD-TINS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 SIWWIIRGPVILSILINFILFINILRILMRKLRTQETRGNEVSHYKRLARSTLLLIPLFG
:.::::.::.. :::.:::::: :.:::..::: . : .. : :.::::::::::::::
CCDS26 SLWWIIKGPILTSILVNFILFICIIRILLQKLRPPDIRKSDSSPYSRLARSTLLLIPLFG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 IHYIVFAFSPED-AMEIQLFFELALGSFQGLVVAVLYCFLNGEVQLEVQKKWQQWHLREF
.:::.::: :.. :... :::..:::::.:::.:::::::::: :...::..:::.
CCDS26 VHYIMFAFFPDNFKPEVKMVFELVVGSFQGFVVAILYCFLNGEVQAELRRKWRRWHLQGV
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420 430 440
pF1KB6 ----PL--HPVASFSN----STKASHLEQ-SQGTCRTSII
: :: .. :: ::..: : . : :. :.:
CCDS26 LGWNPKYRHPSGG-SNGATCSTQVSMLTRVSPGARRSSSFQAEVSLV
420 430 440 450
>>CCDS56481.1 ADCYAP1R1 gene_id:117|Hs108|chr7 (447 aa)
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Smith-Waterman score: 1450; 49.9% identity (75.4% similar) in 439 aa overlap (12-438:13-438)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MRPHLSPPLQQLLLPVLLACAAHSTGALPRLCDVLQVLWEEQDQCLQELSREQTGDLGT
:::: .: : :: : .. .:: .::....: . .:
CCDS56 MAGVVHVSLAALLLLP--MAPAMHSD------C----IFKKEQAMCLEKIQRANEL-MGF
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 EQPVPGCEGMWDNISCWPSSVPGRMVEVECPRFLRMLTSRN--GSLFRNCTQDGWSETFP
.. ::: ::::::.:: . :.:: : ::...:... . : . ::::.::::: ::
CCDS56 NDSSPGCPGMWDNITCWKPAHVGEMVLVSCPELFRIFNPDQDMGVVSRNCTEDGWSEPFP
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pF1KB6 RPNLACGVNVNDSSNEKRHSYLLKLKVMYTVGYSSSLVMLLVALGILCAFRRLHCTRNYI
. ::: . .: . . : :..:..::::::.::: : .:. ::: ::.::::::.:
CCDS56 HYFDACGFDEYESETGDQDYYYLSVKALYTVGYSTSLVTLTTAMVILCRFRKLHCTRNFI
110 120 130 140 150 160
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pF1KB6 HMHLFVSFILRALSNFIKDAVLFSSDDVTYCDAHRAGCKLVMVLFQYCIMANYSWLLVEG
::.:::::.:::.: :::: .:.. .: ..: . :: :::.:.::...:: ::..::
CCDS56 HMNLFVSFMLRAISVFIKDWILYAEQDSNHCFISTVECKAVMVFFHYCVVSNYFWLFIEG
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 LYLHTLLAISFFSERKYLQGFVAFGWGSPAIFVALWAIARHFLEDVGCWDINANASIWWI
::: :::. .:: ::.:. .. .:::.:.. :..:: : ...:.::::.: ....::.
CCDS56 LYLFTLLVETFFPERRYFYWYTIIGWGTPTVCVTVWATLRLYFDDTGCWDMNDSTALWWV
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 IRGPVILSILINFILFINILRILMRKLRTQETRGNEVSHYKRLARSTLLLIPLFGIHYIV
:.:::. ::..::.:::.:. ::..::.. . ::: : : ::::::::::::::::: :
CCDS56 IKGPVVGSIMVNFVLFIGIIVILVQKLQSPDMGGNESSIYLRLARSTLLLIPLFGIHYTV
290 300 310 320 330 340
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pF1KB6 FAFSPEDAMEIQ-LFFELALGSFQGLVVAVLYCFLNGEVQLEVQKKWQQWHL-REFPL--
::::::.. . . : :::.::::::.:::::::::::::: :...::..:.. : : .
CCDS56 FAFSPENVSKRERLVFELGLGSFQGFVVAVLYCFLNGEVQAEIKRKWRSWKVNRYFAVDF
350 360 370 380 390 400
420 430 440
pF1KB6 ---HP-VAS--FSNSTKASHLEQSQGTCRTSII
:: .:: ...:. : : .:.. : :
CCDS56 KHRHPSLASSGVNGGTQLSILSKSSSQIRMSGLPADNLAT
410 420 430 440
>>CCDS58828.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 (416 aa)
initn: 1330 init1: 839 opt: 1412 Z-score: 1689.4 bits: 321.7 E(32554): 8.9e-88
Smith-Waterman score: 1414; 51.3% identity (76.5% similar) in 413 aa overlap (41-438:5-407)
20 30 40 50 60 70
pF1KB6 QLLLPVLLACAAHSTGALPRLCDVLQVLWEEQDQCLQELSREQTGDLGTEQPVPGCEGMW
.. :::.: . :. . :: ::
CCDS58 MIEVQHKQCLEEAQ--------LENETIGCSKMW
10 20
80 90 100 110 120
pF1KB6 DNISCWPSSVPGRMVEVECPRFLRMLTSRNG-SLFRNCTQDGWSETFPRPN-LACGVNVN
::..:::.. :..: . :: ......: .: .. :.::..::.. : : .:::.. .
CCDS58 DNLTCWPATPRGQVVVLACPLIFKLFSSIQGRNVSRSCTDEGWTHLEPGPYPIACGLDDK
30 40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 DSS-NEKRHSYLLKLKVMYTVGYSSSLVMLLVALGILCAFRRLHCTRNYIHMHLFVSFIL
.: .:.. . ..:. ::.::. ::. :::: .:: ::.:::::::::::::.::::
CCDS58 AASLDEQQTMFYGSVKTGYTIGYGLSLATLLVATAILSLFRKLHCTRNYIHMHLFISFIL
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 RALSNFIKDAVLFSSDDVTYCDAHRAGCKLVMVLFQYCIMANYSWLLVEGLYLHTLLAIS
:: . :::: .::.: . :. .::: .::.::::.:::. :::::::::.::::.:
CCDS58 RAAAVFIKDLALFDSGESDQCSEGSVGCKAAMVFFQYCVMANFFWLLVEGLYLYTLLAVS
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
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:::::::. :.. .::: :. :. .:.::: .:: :::: . :.:.::::.::.. :::
CCDS58 FFSERKYFWGYILIGWGVPSTFTMVWTIARIHFEDYGCWD-TINSSLWWIIKGPILTSIL
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 INFILFINILRILMRKLRTQETRGNEVSHYKRLARSTLLLIPLFGIHYIVFAFSPED-AM
.:::::: :.:::..::: . : .. : :.::::::::::::::.:::.::: :..
CCDS58 VNFILFICIIRILLQKLRPPDIRKSDSSPYSRLARSTLLLIPLFGVHYIMFAFFPDNFKP
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 EIQLFFELALGSFQGLVVAVLYCFLNGEVQLEVQKKWQQWHLREF----PL--HPVASFS
:... :::..:::::.:::.:::::::::: :...::..:::. : :: .. :
CCDS58 EVKMVFELVVGSFQGFVVAILYCFLNGEVQAELRRKWRRWHLQGVLGWNPKYRHPSGG-S
330 340 350 360 370 380
430 440
pF1KB6 N----STKASHLEQ-SQGTCRTSII
: ::..: : . : :. :.:
CCDS58 NGATCSTQVSMLTRVSPGARRSSSFQAEVSLV
390 400 410
>>CCDS58827.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 (409 aa)
initn: 1356 init1: 867 opt: 1405 Z-score: 1681.1 bits: 320.1 E(32554): 2.6e-87
Smith-Waterman score: 1407; 53.1% identity (78.4% similar) in 388 aa overlap (65-438:15-400)
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 LQVLWEEQDQCLQELSREQTGDLGTEQPVPGCEGMWDNISCWPSSVPGRMVEVECPRFLR
:: ::::..:::.. :..: . :: ...
CCDS58 MRAGRRPRLGPWAGGCSKMWDNLTCWPATPRGQVVVLACPLIFK
10 20 30 40
100 110 120 130 140 150
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...: .: .. :.::..::.. : : .:::.. . .: ... . ..:. ::.::.
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.::: .::.::::.:::. :::::::::.::::.::::::::. :.. .::: :. :. .
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:.::: .:: :::: . :.:.::::.::.. :::.:::::: :.:::..::: . : .
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. : :.::::::::::::::.:::.::: :.. :... :::..:::::.:::.:::::
CCDS58 DSSPYSRLARSTLLLIPLFGVHYIMFAFFPDNFKPEVKMVFELVVGSFQGFVVAILYCFL
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CCDS58 NGEVQAELRRKWRRWHLQGVLGWNPKYRHPSGG-SNGATCSTQVSMLTRVSPGARRSSSF
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CCDS58 QAEVSLV
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CCDS59 YMVFAVFPISISSKYQILFELCLGSFQGLVVAVLYCFLNSEVQCELKRKWRSRCPTPSAS
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CCDS59 RDYRVCGSSFSRNGSEGALQFHRGSRAQSFLQTETSVI
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: .:. ::: ::.::::::.:::.:::::.:::.: :::: .:.. .: ..: . ::
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CCDS54 YLRLARSTLLLIPLFGIHYTVFAFSPENVSKRERLVFELGLGSFQGFVVAVLYCFLNGEV
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CCDS54 QAEIKRKWRSWKVNRYFAVDFKHRHPSLASSGVNGGTQLSILSKSSSQIRMSGLPADNLA
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CCDS54 T
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CCDS54 NCLLASTSPSSRRAFWWLVLAGWGLPVLFTGTWVSCKLAFEDIACWDLDDTSPYWWIIKG
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CCDS54 PIVLSVGVNFGLFLNIIRILVRKLEPAQGSLHTQSQYWRLSKSTLFLIPLFGIHYIIFNF
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CCDS54 LPDNAGLGIRLPLELGLGSFQGFIVAILYCFLNQEVRTEISRKWHGHDPELLPAWRTRAK
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CCDS54 WTTPSRSAAKVLTSMC
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CCDS78 IGAWTAARLYLEDTGCWDTNDHSVPWWVIRIPILISIIVNFVLFISIIRILLQKLTSPDV
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CCDS78 CFLNSEVQCELKRKWRSRCPTPSASRDYRVCGSSFSRNGSEGALQFHRGSRAQSFLQTET
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CCDS12 MTTSPILQLLLRLSL-CGLLLQRAETGSKGQTAGELYQRWERYRRECQE-------T
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CCDS12 LAAAEPPSGLACNGSFDMYVCWDYAAPNATARASCPWYLPWHHHVAAGFVLRQCGSDGQW
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CCDS12 G--LWRDHTQCENPEKNEAFLDQRLILERLQVMYTVGYSLSLATLLLALLILSLFRRLHC
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CCDS12 TRNYIHINLFTSFMLRAAAILSRDRLLPRPGPYLGDQALALWNQALAACRTAQIVTQYCV
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CCDS12 ERNEVKAIWWIIRTPILMTILINFLIFIRILGILLSKLRTRQMRCRD--YRLRLARSTLT
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CCDS12 LVPLLGVHEVVFAPVTEEQARGALRFAKLGFEIFLSSFQGFLVSVLYCFINKEVQSEIRR
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CCDS12 GWHHCRLRRSLGEEQRQLPERAFRALPSGSGPGEVPTSRGLSSGTLPGPGNEASRELESY
410 420 430 440 450 460
440 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 11:37:16 2016 done: Sat Nov 5 11:37:17 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]