Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6645
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6645, 419 aa
1>>>pF1KB6645 419 - 419 aa - 419 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4937+/-0.000911; mu= 17.6087+/- 0.055
mean_var=99.7187+/-19.364, 0's: 0 Z-trim(108.9): 134 B-trim: 105 in 3/47
Lambda= 0.128436
statistics sampled from 10367 (10538) to 10367 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.689), E-opt: 0.2 (0.324), width: 16
Scan time: 2.890
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1427.1 SYT2 gene_id:127833|Hs108|chr1 ( 419) 2803 529.9 1.8e-150
CCDS76582.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12 ( 419) 2142 407.4 1.3e-113
CCDS9017.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12 ( 422) 2135 406.1 3.3e-113
CCDS12919.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19 ( 386) 1614 309.5 3.6e-84
CCDS74455.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19 ( 382) 1444 278.0 1.1e-74
CCDS31577.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11 ( 403) 980 192.0 8.5e-49
CCDS73298.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11 ( 447) 980 192.1 9.1e-49
CCDS58139.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11 ( 478) 980 192.1 9.6e-49
CCDS871.1 SYT6 gene_id:148281|Hs108|chr1 ( 425) 979 191.9 1e-48
CCDS12798.1 SYT3 gene_id:84258|Hs108|chr19 ( 590) 954 187.4 3.1e-47
CCDS8732.1 SYT10 gene_id:341359|Hs108|chr12 ( 523) 941 184.9 1.5e-46
CCDS7778.1 SYT9 gene_id:143425|Hs108|chr11 ( 491) 934 183.6 3.6e-46
CCDS7726.2 SYT8 gene_id:90019|Hs108|chr11 ( 401) 919 180.7 2.1e-45
CCDS1122.1 SYT11 gene_id:23208|Hs108|chr1 ( 431) 787 156.3 5.2e-38
CCDS11922.1 SYT4 gene_id:6860|Hs108|chr18 ( 425) 757 150.7 2.4e-36
CCDS81952.1 SYT17 gene_id:51760|Hs108|chr16 ( 413) 755 150.4 3.1e-36
CCDS76835.1 SYT17 gene_id:51760|Hs108|chr16 ( 470) 755 150.4 3.4e-36
CCDS10575.1 SYT17 gene_id:51760|Hs108|chr16 ( 474) 755 150.4 3.4e-36
CCDS73103.1 SYT15 gene_id:83849|Hs108|chr10 ( 421) 580 117.9 1.8e-26
CCDS8154.1 SYT12 gene_id:91683|Hs108|chr11 ( 421) 563 114.8 1.6e-25
CCDS31470.1 SYT13 gene_id:57586|Hs108|chr11 ( 426) 496 102.4 8.8e-22
CCDS73934.1 DOC2B gene_id:8447|Hs108|chr17 ( 412) 484 100.1 4e-21
CCDS73104.1 SYT15 gene_id:83849|Hs108|chr10 ( 390) 472 97.9 1.8e-20
CCDS10666.1 DOC2A gene_id:8448|Hs108|chr16 ( 400) 350 75.3 1.2e-13
CCDS31904.1 RPH3A gene_id:22895|Hs108|chr12 ( 690) 348 75.2 2.2e-13
CCDS44979.1 RPH3A gene_id:22895|Hs108|chr12 ( 694) 348 75.2 2.2e-13
CCDS298.1 SYTL1 gene_id:84958|Hs108|chr1 ( 550) 329 71.5 2.2e-12
CCDS53286.1 SYTL1 gene_id:84958|Hs108|chr1 ( 562) 329 71.6 2.2e-12
>>CCDS1427.1 SYT2 gene_id:127833|Hs108|chr1 (419 aa)
initn: 2803 init1: 2803 opt: 2803 Z-score: 2814.9 bits: 529.9 E(32554): 1.8e-150
Smith-Waterman score: 2803; 100.0% identity (100.0% similar) in 419 aa overlap (1-419:1-419)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MRNIFKRNQEPIVAPATTTATMPIGPVDNSTESGGAGESQEDMFAKLKEKLFNEINKIPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MRNIFKRNQEPIVAPATTTATMPIGPVDNSTESGGAGESQEDMFAKLKEKLFNEINKIPL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 PPWALIAIAVVAGLLLLTCCFCICKKCCCKKKKNKKEKGKGMKNAMNMKDMKGGQDDDDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PPWALIAIAVVAGLLLLTCCFCICKKCCCKKKKNKKEKGKGMKNAMNMKDMKGGQDDDDA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 ETGLTEGEGEGEEEKEPENLGKLQFSLDYDFQANQLTVGVLQAAELPALDMGGTSDPYVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ETGLTEGEGEGEEEKEPENLGKLQFSLDYDFQANQLTVGVLQAAELPALDMGGTSDPYVK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 VFLLPDKKKKYETKVHRKTLNPAFNETFTFKVPYQELGGKTLVMAIYDFDRFSKHDIIGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VFLLPDKKKKYETKVHRKTLNPAFNETFTFKVPYQELGGKTLVMAIYDFDRFSKHDIIGE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 VKVPMNTVDLGQPIEEWRDLQGGEKEEPEKLGDICTSLRYVPTAGKLTVCILEAKNLKKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VKVPMNTVDLGQPIEEWRDLQGGEKEEPEKLGDICTSLRYVPTAGKLTVCILEAKNLKKM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 DVGGLSDPYVKIHLMQNGKRLKKKKTTVKKKTLNPYFNESFSFEIPFEQIQKVQVVVTVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DVGGLSDPYVKIHLMQNGKRLKKKKTTVKKKTLNPYFNESFSFEIPFEQIQKVQVVVTVL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB6 DYDKLGKNEAIGKIFVGSNATGTELRHWSDMLANPRRPIAQWHSLKPEEEVDALLGKNK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DYDKLGKNEAIGKIFVGSNATGTELRHWSDMLANPRRPIAQWHSLKPEEEVDALLGKNK
370 380 390 400 410
>>CCDS76582.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12 (419 aa)
initn: 2395 init1: 1685 opt: 2142 Z-score: 2153.0 bits: 407.4 E(32554): 1.3e-113
Smith-Waterman score: 2142; 77.4% identity (90.7% similar) in 421 aa overlap (4-419:2-419)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MRNIFKRNQEPIVAPATTTATMPIGPVDNSTESGGAGESQEDMFAKLKEKLFNEINKIPL
. . ..: ..:: .::.. . : .:.:: .. ::..:: :.:::::..::..::::
CCDS76 MVSESHHEALAAPPVTTVAT-VLP-SNATEPASPGEGKEDAFSKLKEKFMNELHKIPL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB6 PPWALIAIAVVAGLLLLTCCFCICKKCCCKKKKNKKEKGKGMKNAMNMKDMKG-GQ----
:::::::::.:: ::.::::::::::: :::..:: : :: :::.::::.: :.
CCDS76 PPWALIAIAIVAVLLVLTCCFCICKKCLFKKKNKKKGKEKGGKNAINMKDVKDLGKTMKD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 DDDDAETGLTEGEGEGEEEKEPENLGKLQFSLDYDFQANQLTVGVLQAAELPALDMGGTS
.:::::::::.:: : :: :: :.:::::.::::::: ::: ::..::::::::::::::
CCDS76 QDDDAETGLTDGE-EKEEPKEEEKLGKLQYSLDYDFQNNQLLVGIIQAAELPALDMGGTS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 DPYVKVFLLPDKKKKYETKVHRKTLNPAFNETFTFKVPYQELGGKTLVMAIYDFDRFSKH
:::::::::::::::.:::::::::::.::: :::::::.::::::::::.:::::::::
CCDS76 DPYVKVFLLPDKKKKFETKVHRKTLNPVFNEQFTFKVPYSELGGKTLVMAVYDFDRFSKH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 DIIGEVKVPMNTVDLGQPIEEWRDLQGGEKEEPEKLGDICTSLRYVPTAGKLTVCILEAK
::::: ::::::::.:. :::::::..:::: ::::::: ::::::::::::: :::::
CCDS76 DIIGEFKVPMNTVDFGHVTEEWRDLQSAEKEEQEKLGDICFSLRYVPTAGKLTVVILEAK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 NLKKMDVGGLSDPYVKIHLMQNGKRLKKKKTTVKKKTLNPYFNESFSFEIPFEQIQKVQV
::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::.:::::::.::::::::::
CCDS76 NLKKMDVGGLSDPYVKIHLMQNGKRLKKKKTTIKKNTLNPYYNESFSFEVPFEQIQKVQV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 VVTVLDYDKLGKNEAIGKIFVGSNATGTELRHWSDMLANPRRPIAQWHSLKPEEEVDALL
:::::::::.:::.::::.::: :.::.::::::::::::::::::::.:. ::::::.:
CCDS76 VVTVLDYDKIGKNDAIGKVFVGYNSTGAELRHWSDMLANPRRPIAQWHTLQVEEEVDAML
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 GKNK
. .:
CCDS76 AVKK
>>CCDS9017.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12 (422 aa)
initn: 2388 init1: 1678 opt: 2135 Z-score: 2145.9 bits: 406.1 E(32554): 3.3e-113
Smith-Waterman score: 2135; 76.9% identity (89.9% similar) in 424 aa overlap (4-419:2-422)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MRNIFKRNQEPIVAPATTTATMPIGPVDNSTESGGAGESQEDMFAKLKEKLFNEINKIPL
. . ..: ..:: .::.. . : .:.:: .. ::..:: :.:::::..::..::::
CCDS90 MVSESHHEALAAPPVTTVAT-VLP-SNATEPASPGEGKEDAFSKLKEKFMNELHKIPL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB6 PPWALIAIAVVAGLLLLTCCFCICKKCCCKKKKNKKEKGKGMKNAMNMKDMKG-GQD---
:::::::::.:: ::.::::::::::: :::..:: : :: :::.::::.: :.
CCDS90 PPWALIAIAIVAVLLVLTCCFCICKKCLFKKKNKKKGKEKGGKNAINMKDVKDLGKTMKD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 ----DDDAETGLTEGEGEGEEEKEPENLGKLQFSLDYDFQANQLTVGVLQAAELPALDMG
:::::::::.:: : :: :: :.:::::.::::::: ::: ::..:::::::::::
CCDS90 QALKDDDAETGLTDGE-EKEEPKEEEKLGKLQYSLDYDFQNNQLLVGIIQAAELPALDMG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 GTSDPYVKVFLLPDKKKKYETKVHRKTLNPAFNETFTFKVPYQELGGKTLVMAIYDFDRF
::::::::::::::::::.:::::::::::.::: :::::::.::::::::::.::::::
CCDS90 GTSDPYVKVFLLPDKKKKFETKVHRKTLNPVFNEQFTFKVPYSELGGKTLVMAVYDFDRF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 SKHDIIGEVKVPMNTVDLGQPIEEWRDLQGGEKEEPEKLGDICTSLRYVPTAGKLTVCIL
:::::::: ::::::::.:. :::::::..:::: ::::::: ::::::::::::: ::
CCDS90 SKHDIIGEFKVPMNTVDFGHVTEEWRDLQSAEKEEQEKLGDICFSLRYVPTAGKLTVVIL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 EAKNLKKMDVGGLSDPYVKIHLMQNGKRLKKKKTTVKKKTLNPYFNESFSFEIPFEQIQK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::.:::::::.:::::::
CCDS90 EAKNLKKMDVGGLSDPYVKIHLMQNGKRLKKKKTTIKKNTLNPYYNESFSFEVPFEQIQK
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 VQVVVTVLDYDKLGKNEAIGKIFVGSNATGTELRHWSDMLANPRRPIAQWHSLKPEEEVD
::::::::::::.:::.::::.::: :.::.::::::::::::::::::::.:. :::::
CCDS90 VQVVVTVLDYDKIGKNDAIGKVFVGYNSTGAELRHWSDMLANPRRPIAQWHTLQVEEEVD
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 ALLGKNK
:.:. .:
CCDS90 AMLAVKK
420
>>CCDS12919.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19 (386 aa)
initn: 1843 init1: 1436 opt: 1614 Z-score: 1624.7 bits: 309.5 E(32554): 3.6e-84
Smith-Waterman score: 1614; 62.5% identity (87.2% similar) in 368 aa overlap (53-414:20-383)
30 40 50 60 70 80
pF1KB6 PIGPVDNSTESGGAGESQEDMFAKLKEKLFNEINKIPLPPWALIAIAVVAGLLLLTCCFC
..:.. :.::::: .:..:.:::...::::
CCDS12 MFPEPPTPGPPSPDTPPDSSRISHGPVPPWALATIVLVSGLLIFSCCFC
10 20 30 40
90 100 110 120 130
pF1KB6 ICKKCCCKKKKNKKEKGKGMKNAMNMKDMKG-GQDD-DDAETGLTEGE----GEGEEEKE
. .: : ... .:: ..... ......:: ::. : .. . : : : :.. .
CCDS12 LYRKSC-RRRTGKKSQAQAQ---VHLQEVKGLGQSYIDKVQPEVEELEPAPSGPGQQVAD
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KB6 PENLGKLQFSLDYDFQANQLTVGVLQAAELPALDMGGTSDPYVKVFLLPDKKKKYETKVH
..::.::.:::::::..:: ::.::: : :::.::.:::::.:.:::::...::::::
CCDS12 KHELGRLQYSLDYDFQSGQLLVGILQAMGLAALDLGGSSDPYVRVYLLPDKRRRYETKVH
110 120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KB6 RKTLNPAFNETFTFKVPYQELGGKTLVMAIYDFDRFSKHDIIGEVKVPMNTVDLGQPIEE
:.:::: :.:::.::::: ::::..::::.:::::::..: ::::.:::..::::.:..
CCDS12 RQTLNPHFGETFAFKVPYVELGGRVLVMAVYDFDRFSRNDAIGEVRVPMSSVDLGRPVQA
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 WRDLQGGEKEEPEKLGDICTSLRYVPTAGKLTVCILEAKNLKKMDVGGLSDPYVKIHLMQ
::.::.. .:: ::::::: ::::::::::::: .::::::::::::::::::::.::.:
CCDS12 WRELQAAPREEQEKLGDICFSLRYVPTAGKLTVIVLEAKNLKKMDVGGLSDPYVKVHLLQ
230 240 250 260 270 280
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 NGKRLKKKKTTVKKKTLNPYFNESFSFEIPFEQIQKVQVVVTVLDYDKLGKNEAIGKIFV
.::...:::::.::.:::::.::.::::.: .:.::::: .:::::::::::::::.. :
CCDS12 GGKKVRKKKTTIKKNTLNPYYNEAFSFEVPCDQVQKVQVELTVLDYDKLGKNEAIGRVAV
290 300 310 320 330 340
380 390 400 410
pF1KB6 GSNATGTELRHWSDMLANPRRPIAQWHSLKPEEEVDALLGKNK
:. : :. ::::.::::::::::::::::.: ..: :
CCDS12 GAAAGGAGLRHWADMLANPRRPIAQWHSLRPPDRVRLLPAP
350 360 370 380
>>CCDS74455.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19 (382 aa)
initn: 1439 init1: 782 opt: 1444 Z-score: 1454.5 bits: 278.0 E(32554): 1.1e-74
Smith-Waterman score: 1444; 62.0% identity (83.4% similar) in 337 aa overlap (82-414:44-379)
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 FNEINKIPLPPWALIAIAVVAGLLLLTCCFCICKKCC-CKKKKNKKEKGKGMKNAMNMKD
:.:.: ... . .:.. .
CCDS74 AQRPHGSWSSLLCVGLKGRLGWEWGTRVLECLCRKDSRTPPPCSRSPQPRGLHRPTRLPT
20 30 40 50 60 70
120 130 140 150 160
pF1KB6 ---MKGGQDDDDAETGLTEGEGEGEEEKEPENLGKLQFSLDYDFQANQLTVGVLQAAELP
.: . ..: : :.. . ..::.::.:::::::..:: ::.::: :
CCDS74 PVASATAQVQPEVEELEPAPSGPGQQVADKHELGRLQYSLDYDFQSGQLLVGILQAMGLA
80 90 100 110 120 130
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 ALDMGGTSDPYVKVFLLPDKKKKYETKVHRKTLNPAFNETFTFKVPYQELGGKTLVMAIY
:::.::.:::::.:.:::::...:::::::.:::: :.:::.::::: ::::..::::.:
CCDS74 ALDLGGSSDPYVRVYLLPDKRRRYETKVHRQTLNPHFGETFAFKVPYVELGGRVLVMAVY
140 150 160 170 180 190
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 DFDRFSKHDIIGEVKVPMNTVDLGQPIEEWRDLQGGEKEEPEKLGDICTSLRYVPTAGKL
::::::..: ::::.:::..::::.:.. ::.::.. .:: ::::::: :::::::::::
CCDS74 DFDRFSRNDAIGEVRVPMSSVDLGRPVQAWRELQAAPREE-EKLGDICFSLRYVPTAGKL
200 210 220 230 240 250
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 TVCILEAKNLKKMDVGGLSDPYVKIHLMQNGKRLKKKKTTVKKKTLNPYFNESFSFEIPF
:: .::::::::::::::::::::.::.:.::...:::::.::.:::::.::.::::.:
CCDS74 TVIVLEAKNLKKMDVGGLSDPYVKVHLLQGGKKVRKKKTTIKKNTLNPYYNEAFSFEVPC
260 270 280 290 300 310
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 EQIQKVQVVVTVLDYDKLGKNEAIGKIFVGSNATGTELRHWSDMLANPRRPIAQWHSLKP
.:.::::: .:::::::::::::::.. ::. : :. ::::.::::::::::::::::.:
CCDS74 DQVQKVQVELTVLDYDKLGKNEAIGRVAVGAAAGGAGLRHWADMLANPRRPIAQWHSLRP
320 330 340 350 360 370
410
pF1KB6 EEEVDALLGKNK
..: :
CCDS74 PDRVRLLPAP
380
>>CCDS31577.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11 (403 aa)
initn: 733 init1: 733 opt: 980 Z-score: 989.5 bits: 192.0 E(32554): 8.5e-49
Smith-Waterman score: 980; 50.4% identity (78.9% similar) in 280 aa overlap (128-406:124-402)
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 KGKGMKNAMNMKDMKGGQDDDDAETGLTEGEGEGEEEKEPENLGKLQFSLDYDFQANQLT
: :..: ::::..:::. :.:: . ::
CCDS31 SDRRTEPRSSVSDLVNSLTSEMLMLSPGSEEDEAHEGCSRENLGRIQFSVGYNFQESTLT
100 110 120 130 140 150
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 VGVLQAAELPALDMGGTSDPYVKVFLLPDKKKKYETKVHRKTLNPAFNETFTFK-VPYQE
: ...: :::: :..:::::.::..::::::.: ::::.::.::: .:::: :. ::..
CCDS31 VKIMKAQELPAKDFSGTSDPFVKIYLLPDKKHKLETKVKRKNLNPHWNETFLFEGFPYEK
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 LGGKTLVMAIYDFDRFSKHDIIGEVKVPMNTVDLGQPIEEWRDLQGGEKEEPEKLGDICT
. . : . . :.::::..: ::::..:.: ::: : :.::. . :..
CCDS31 VVQRILYLQVLDYDRFSRNDPIGEVSIPLNKVDLTQMQTFWKDLKPCSDGSGSR-GELLL
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CCDS87 FSLCYLPTAGRLTLTVIKCRNLKAMDITGYSDPYVKVSLLCDGRRLKKKKTTIKKNTLNP
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CCDS87 RKPIAHWHSLVEVKKSFKEGNPRL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]